TCP 7 Genética

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Biología Molecular y Genética

TCP 7
10.09.2020

GENÉTICA NO MENDELIANA: Ligamentos y recombinación

Caracteres independientes
2° Ley de Mendel: en esta ley establece que, durante la formación de los gametos,
cada alelo de un par de cromosomas se separa del otro miembro para determinar la
constitución genética del gameto filial.

Diferentes rasgos son heredados independientemente unos de otros, no existe


relación entre ellos, por lo tanto, el patrón de herencia de un rasgo
no afectará al patrón de herencia de otro.

En este caso, cuando 2 genes como el gen A y el gen B están en


distintos cromosomas (negro y azul), los gametos que se pueden
formar si tienen alelos distintos, son 4 combinaciones: AB, Ab, aB
y ab.

Locus A: color (amarillo, verde)

Locus B: textura (liso, rugoso)

Dato: para saber el número de combinaciones, por ejemplo, si son 3 genes el resultado
sería 23, pero siempre va a depender de si hay algún alelo repetido. Si existe un alelo
que es igual en los 2 genes los gametos disminuyen su proporción.

Repaso: análisis de dos


rasgos
Cuando se realizan cruces de
heterocigotos, se arman tablas
de 4x4 gametos para obtener
los 16 genotipos totales.
Normalmente si 2 genes no
interactúan y están en
cromosomas distintos en el
cruce de 2 heterocigotos se
obtiene en la F2 la proporción de 9:3:3:1.

El doble mutante (aabb) estará en proporción 1/16 y es distinguible de los otros


fenotipos.

1
Cruzamiento de prueba
En este caso, cuando se tiene un
individuo heterocigoto AaBb que
puede generar 4 tipos de gametos
distintos (AB, Ab, Ab, ab) y se realiza
un cruzamiento de prueba con un
homocigoto recesivo aabb que
puede generar 4 gametos iguales
(ab), la proporción que se obtiene
finalmente es 1:1:1:1.

Caracteres en el mismo cromosoma


Esta proporción mencionada anteriormente, no se cumple siempre, sino
que solo cuando los genes A y B están en distintos cromosomas, ya que
por ejemplo cuando A y B están en el mismo cromosoma, los gametos que
genera este individuo por meiosis son AB y ab.

Si se cruza este individuo ABab con uno homocigoto recesivo aabb se


esperan 2 combinaciones fenotípicas: AaBb y aabb.

Genética en el comienzo del siglo XX


Genetistas (Boveri, Sutton y Stevens) descubrieron que la información contenida en
las “partículas” (gametos) estudiadas por Mendel se ubicaban en los cromosomas y,
por lo tanto, estas estructuras eran responsables de transmitir la herencia genética

Morgan (Premio nobel 1933), con sus ayudantes Bridges y Sturtevant; se dedicaron
a estudiar el rol de los cromosomas en la herencia y la localización de los genes
dentro de los cromosomas, sin embargo, asociaban erróneamente al gen con una
característica fenotípica mutante

Datos de Morgan 1900


Drosophila melanogaster

Realizaban cruces y observaban los fenotipos resultantes al microscopio, sin conocer


técnicas de aislamiento de DNA ni nada parecido

Los cruces se realizaban colocando muchas moscas de sexo opuesto en un tubo


especial (basándose en sus fenotipos) hasta que fabriquen huevos. Luego se
retiran las moscas adultas y los huevos se convierten en larvas que escalan por
las paredes del tubo. Al completar su metamorfosis, quedan estancadas en la
pared, lo que favorece su observación 2
Caracteres

1.- Color de ojos

− pr+, rojo, dominante


− pr, violeta, recesivo
2.- Largo de las alas

− vg+, normal, dominante


− vg, vestigial, recesivo

Al realizar el cruce entre un homocigoto


dominante y un homocigoto recesivo, se
obtiene una descendencia de:
100% heterocigoto para ambos alelos.

F1 presentan fenotipo de ojos rojos pr+pr y alas de largo normales vg+vg para todos.

Luego se hace un cruce entre una hembra de F1 pr+pr vg+vg con un homocigoto
recesivo (prpr vgvg). La proporción esperada del cruce, asumiendo que se tienen los
alelos del color y alas en distintos cromosomas, es de 4 fenotipos distintos, siendo
1:1:1:1 la proporción esperada.

Tras realizar el cruzamiento se identifican los siguientes resultados:

Estos resultados en porcentajes equivalen a un 44,5% , 44,5% , 5,5% , 5,5%


respectivamente.No coincidiendo con los resultados esperados. Lo que significa una
probabilidad muy baja en la obtención de resultados.

3
Caracteres Ligados
Cruce esperado
sin crossing over
A partir del experimento se concluyó que los
genes que determinan estos caracteres están
en el mismo cromosoma. A esto se le conoce
como caracteres ligados.

Si es que los genes se encuentran en el mismo


cromosoma sólo se esperarían 2 fenotipos:
ojos rojo alas normales y ojos púrpura-alas
vestigiales, como se muestra en el esquema.

Al estar en el mismo
cromosoma, se entiende que la
proporción de los fenotipos
esperados sea mayor (44,5 en
vez de 50 %).

Aún así no se explica el por qué


existen los fenotipos cruzados.

4
Crossing-over durante la Meiosis
De la interrogante anterior surge la idea del intercambio de segmentos entre
cromosomas, ya que explica los fenotipos cruzados: ojos violetas con alas normales
y ojos rojos con alas vestigiales. Al no suceder esto siempre, su probabilidad es
menor.

Aparecen las 4 combinaciones de gametos, pero los gametos con la configuración


parental (AB o ab) son mayoritarios comparados con las combinaciones
recombinantes (Ab o aB).

Por ejemplo:
• cromosoma amarillo → materno.
• cromosoma naranjo → paterno.

Observar en la imagen que una de las cromátidas se intercambia con la cromátida del
otro cromosoma, quedando cromosomas Ab y aB, aparte de los que no hicieron
crossing over que serían los cromosomas AB y ab. Tras llevar estos resultados a la
matemática, los resultados obtenidos serian:

• AB → 45%
• Ab → 5 % El crossing over no ocurre siempre,
• aB → 5 % por lo que siempre el porcentaje de
• ab → 45% estos será menor.

5
Si un gen está en el brazo p y uno en el
brazo q, ¿es posible que ocurra un crossing
over entre ellos? Si, porque puede haber
uno en todo el segmento achurado, muy
separados entre sí.

• Un gen siempre va a tener un locus, el gen va a seguir en la misma posición


en el cromosoma 1, lo que cambia es el alelo de la cromátida del gen contrario
(de la mamá o papá).
Gen A está en un locus y el gen B en otro (locus distintos porque son genes
distintos), pero nunca cambian de posición los genes si no que cambian los
alelos entre el cromosoma y su homólogo.
• En el crossing over de la imagen se cambia el amarillo por el café, una parte
de la cromátida. El amarillo de una se cambió por el café de la otra en la misma
sección.
• En algunas especies animales se pueden ingresar algunos cromosomas para
forzar algunas recombinaciones.

Observaciones:

• Una permutación en los cromosomas no podría dar los mismos resultados que el
crossing over, pues en una permutación los cromosomas se mantienen independientes
sin intercambio de ADN entre cromosomas.

• Chi cuadrado si pudiese servir para casos con crossing over ya que se puede medir lo
que se espera con lo obtenido realmente. El problema en estos casos es que nunca se
sabe cuánto crossing over ocurrirá, por lo que el porcentaje siempre es variable y no se
podría colocar en la formula el valor esperado.

• 2 genes en un mismo cromosoma que se encuentran lejos entre ellos es probable


que pueda ocurrir crossing over entre ellos y se obtengan gametos con crossing over
y otros sin (mientras más cerca menos probable de que haya).Esto es aplicable en
humanos.

• Los genes no se cambian de lugar en un cromosoma, solo pueden cambiar los alelos.

• Crossing over puede ocurrir en cualquier lugar del cromosoma, se cree que ocurre en 1
o 2 cromosomas por apareamiento de cromosomas homólogos.

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Problema:
Si una mosca es heterocigota para el carácter ala normal y el carácter ojos rojos
(pr+ pr /vg+ vg), ¿Cuál es la configuración de los alelos en sus cromosomas? ¿hay
más de una opción?

Existen dos opciones

¿Porque se preguntan diferentes opciones?

Como son heterocigotos con ojos rojos, una opción es que ambos alelos dominantes
estén en el mismo cromosoma: configuración cis.

La otra opción es que uno tenga el dominante y otro tenga el recesivo configuración
trans.

En cualquiera de los casos si una mosca es cis y la otra trans, no se puede diferenciar
fenotípicamente cual es cis y cual es trans, ya que en ambos casos la mosca tiene
ojos rojos y alas normales.

¿De qué depende la frecuencia de los recombinaantes?

La frecuencia de recombinantes depende de la distancia que hay entre los genes.

El término “recombinantes” se refiere a los fenotipos que aprecen en menor


proporción, menos de 25% y que son producto del crossing over.

• Mientras más cerca estén dos genes, menor es la probabilidad de que suceda
un crossing over entre ellos y por lo tanto tienden a heredarse en la misma
combinación o haplotipo que poseía el cromosoma materno o paterno de cada
individuo que está formando sus gametos. A esto se lo denomina Ligamento
Total

• Si en cambio la distancia que los separa es suficiente para permitir


entrecruzamientos entre ellos el Ligamento Parcial.

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¿Cómo se llama el proceso cuando los genes están en el mismo crossing over
y se observan proporciones distintas en la descendencia?
Ocurre cuando los genes estan ligados, es decir, están en el mismo cromsosma.
Los resultados son: 40% una opción, 40% la otra, 5% y 5%.

Fracción de recombinación

¿Como se calcula la frecuencia de recombinación?

Recombinantes: Son los de menor frecuencia. En este caso Ab y aB.

P: Nº de recombinantes/ Nº total de animales

Ejemplo:
(a1 + a2) / total (a1 + a2 + a3 + a4) = 20/100 = 0,2 o 20%

• La fracción de recombinación es 0,2. Significa que existe un 20% de


recombinantes. La distancia genética entre estos dos loci seria de d = 20cM
(centiMorgan).

• Si se obtiene una frecuencia menor la distancia entre esos dos genes será
menor, es decir, esta más cerca.
La unidad de mapa genético o centiMorgan, en honor a Thomas Hunt Morgan,
se define como la frecuencia de recombinación de 0,01, esto es, 1%. Lo que
quiere decir que uno de cada 100 productos de meiosis es recombinante.

Ejemplo:

Si se tiene las frecuencias:


AB = 0,2
CD = 0,1
EF = 0,3

CD se encuentran más cerca y EF se encuentran más distanciados.

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Cuando los genes están en cromosomas distintos la proporción es 1:1:1:1, es decir
25, 25, 25 y 25. Aplicando la fórmula superior.

P: 25 + 25 / 100 = 0,5 → 50%, esto significa que los genes se encuentran en dos
cromosomas distintos, que no son recombinantes y por lo tanto no hubo crossing
over.
No confundir Mendel con genes recombinantes

Ejercicio

Calcular la frecuencia de recombinación y la distancia entre los genes

Al obtener 0.08, se sabe que la recombinación es de


un 8%, por lo tanto la distancia entre los genes es de
8cM

En este caso se observa que los cromosomas se


encuentran RL y rl, por lo que se denominan cis.

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El ejercicio hubiese resultado en trans, si F2 hubiese sido de esta manera (los
parentales ya no son homocigotos):

• 15 rojas, largas
• 18 blancas, cortas
• 322 rojas, cortas
• 400 blancas, largas

Observación: Cuando se habla sobre CIS o TRANS, se refiere al individuo original


que fue cruzado (F1) en el cruzamiento de prueba. En otras palabras, al genotipo
parental (heterocigoto) que fue cruzado con el doble recesivo (recesivo para ambos
caracteres).

En resumen, para saber si la mosca parental heterocigota es cis o trans se debe


cruzar con un doble recesivo. Este último no puede ser cis o trans, ya que no existe
esa opción para un homocigoto, sino que sólo para heterocigotos.

Por lo tanto, cuando obtenemos F2 a partir de ese cruce de prueba, se puede saber
si la mosca parental heterocigota es cis o trans.

Ejercicio:

Calcule la frecuencia de recombinación y la distancia entre los genes con los


resultados siguientes:

Fenotipo Ab AB ab aB
Observados 140 38 32 50

¿Se puede saber si los genes están en posición cis o trans en el heterocigoto
de la generación parental?

R: 19% recombinantes (19 centiMorgan) y trans.

m.u= centiMorgan= cM= 1% recombinación

Ejercicio de distancia entre genes: ¿Cómo se ordenarían estos 3 genes en un


cromosoma (uno al lado del otro)?

• Gen A está a 1900 m.u de Gen C (A)


• Gen A está a 1200 m.u de Gen V
• Gen C está a 700 m.u de Gen V

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R: Pueden ser dos opciones: CVA o AVC

Ejercicio:

Distancias relativas de los genes:

-eb (cuerpo ébano)


-cu (alas curvadas)
-se (ojos color sepia)

Estas distancias se han establecido en base a la frecuencia de


recombinación entre estos tres genes.

eb-se …. 44% …..44Ᵹ


eb-cu ……20% ….20 Ᵹ nota: 1 Ᵹ(centiMorgan)=1%
cu-se ……24% ….24 Ᵹ

• Todos los genes están en un mismo cromosoma, pero no


se sabe cómo están ordenados.
• Se saben las recombinaciones por lo que se conocen las
distancias.

La respuesta es: eb-cu-se

Análisis de 3 genes en un mismo cromosoma


Gen para el color de los ojos de la mosca:

• Dominante: rojo oscuro: 𝑣 + _


• Mutante: rojo claro: v v
Gen para el tamaño de las alas:

• Dominante: alas normales 𝑐𝑡 + _


• Mutante: alas cortadas: ct ct
Gen para la forma de las alas:

• Dominante: alas normales: 𝑐𝑣 + _


• Mutante: alas sin una vena cruzada: cv cv

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Ejercicio A
• Ojos normales (𝑣 + /𝑣 + ) • Ojos vermilion (v/v)
• Alas “sin vena” (cv /cv) VS • Alas normales con vena
• Alas cortadas (ct/ ct ) (𝑐𝑣 + 𝑐𝑣 + )
• Alas normales sin cortes
(𝑐𝑡 + 𝑐𝑡 + )
Resultado:

F1:
• Ojos normales
• Alas normales con vena
• Alas normales sin cortes

Tiene todos esos fenotipos porque el carácter es dominante. Es heterocigota en los


tres genes.

¿Cómo saber la distancia entre los genes? ¿Cuántos gametos distintos


podría formar un individuo F1 sin crossing over? ¿Cuántos gametos podría
formar un individuo F1 con crossing over “en la vida real”?

Análisis de 3 genes en un mismo cromosoma

P: v+/v+ cv/cv ct/ct x v/v cv+/cv+ ct+/ct+

Gametos:

- v+, cv, ct
- v, cv+, ct+
R: Asumiendo que no hay crossing-over, se podrían formar 2 gametos distintos, ya
que cada cromosoma irá a un gameto diferente.
F1: v/v+ cv/cv+ ct/ct+

Cruce de prueba: v/v+ cv/cv+ ct/ct+ x v/v cv/cv ct/ct

Asumiendo que hay crossing over, podrían formarse 8 gametos


diferentes.

En cada gen pueden obtenerse todas las combinaciones (2n).

Los 2 gametos mayoritarios (con mayor cantidad) son los


parentales. (En este caso, las dos primeras filas de la tabla).

Todos los gametos no parentales ocurrieron por crossing-over.

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Análisis:

La tabla muestra en su primera columna los gametos posibles y en su primera fila los
intervalos entre los genes de los cromosomas.

Comparar cada gameto con el parental


(por ejemplo, gameto de fila 3 con
gameto de fila 1) y verificar uno por
uno, qué alelo es diferente.
Saber el alelo diferente, permite
deducir que hubo crossing-over en un
intervalo del cromosoma anterior a él.

En este caso, los genes no están ordenados, por lo que no se puede asumir el
intervalo en que ocurrió el crossing-over, y se escriben las dos opciones posibles.

Se suma la cantidad de gametos que posiblemente


hicieron crossing-over en cada intervalo, y se calculan
las frecuencias de recombinación por cada intervalo.

Las frecuencias de recombinación son equivalentes a las distancias entre los genes,
lo cual permite ordenar los genes dentro de un mismo cromosoma.

• La suma de la distancia entre cv-ct y v-ct (13,2 + 6,4) da 19,6, lo cual es


mayor a la distancia calculada entre v-ct (18,5), esto nos indica que hubo 2
crossing-over = Entrecruzamiento doble.

Conclusión: La suma de las distancias (19,6) es la real, si tu número


de distancia entre los genes más lejanos es menor al real, quiere
decir que hubo entrecruzamiento doble.

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Ejemplo 1:

Parentales: v ct+ cv+ (amarilla) y v+ ct cv (café)

R: Obtenidos en el 1°
Crossing over:
v ct cv y v+ ct+ cv+

R: Obtenidos en el 2°
Crossing over:
v ct cv+ y v+ ct+ cv

• Dos entrecruzamientos generan los mismos fenotipos parentales v+ cv y v cv+,


esto quiere decir que aparecen individuos con el fenotipo del parental como
resultado de un doble entrecruzamiento.

• Esto lleva a error porque se cuentan como parentales cuando en realidad son
recombinantes.

• Esto Implica que para genes que están a mayor distancia, el cálculo de
recombinación no es igual a la distancia real entre los genes

Entrecruzamientos Dobles
Interferencia y Coeficiente de Coincidencia

¿Un entrecruzamiento afecta la probabilidad de que ocurra otro entrecruzamiento en


el mismo par de cromosomas homólogos? Generalmente si, lo cual se conoce como
interferencia y puede ser estimada a partir de la frecuencia de recombinación y de
entrecruzamientos dobles.

Interferencia: es el efecto que tiene un


entrecruzamiento en la ocurrencia de
otro entrecruzamiento en el mismo par
de cromosomas homólogos.

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Entrecruzamientos dobles esperados = frecuencia observada de X1 x frecuencia
observada de X2.
𝑒𝑛𝑡𝑟𝑒𝑐𝑟𝑢𝑧𝑎𝑚𝑖𝑒𝑛𝑡𝑜𝑠 𝑑𝑜𝑏𝑙𝑒𝑠 𝑜𝑏𝑒𝑟𝑣𝑎𝑑𝑜𝑠
Coeficiente de coincidencia (coc) = 𝑒𝑛𝑡𝑟𝑒𝑐𝑟𝑢𝑧𝑎𝑚𝑖𝑒𝑛𝑡𝑜𝑠 𝑑𝑜𝑏𝑙𝑒𝑠 𝑒𝑠𝑝𝑒𝑟𝑎𝑑𝑜𝑠
Interferencia = 1 – coc

Ejemplo basado en el ejercicio A:


• Entre v y ct: 191/1448 = 13.2%, frecuencia de recombinación = 0,132
• Entre cv y ct: 93/1448 = 6.4%, frecuencia de recombinación = 0,064

Si son eventos independientes, entonces la frecuencia esperada de doble


entrecruzamiento es la multiplicación de ambas probabilidades:

0.132 x 0.064 = 0.008 (0.8%), es decir, 0.008 x 1448 = 12 entrecruzamientos →


Teórico (esperado) → 0,8% es la probabilidad de que ocurran ambos cruzamientos.

Sin embargo, solo ocurrieron 8 entrecruzamientos dobles. Cuando ocurre un crossing


over, disminuye la probabilidad de que ocurra el otro, por lo tanto, se calcula la
probabilidad de que ocurran ambos, por lo tanto:

• Coeficiente de coincidencia (coc): dobles observados/dobles esperados =


8/12 = 2/3 (67%)

• Interferencia: 1- coc = 1 – 2/3 = 1/3 → un crossing over está interfiriendo un


33% con la probabilidad de que ocurra el otro.

En la realidad, no se obtiene un 100% de coincidencia

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Polimorfismo y enfermedades

En algunos casos, genes mutantes que originan enfermedades (d) están cerca de un
marcador genético (polimorfismo) en humanos (y, por lo tanto, es poco probable que
ocurra entrecruzamiento entre el polimorfismo y el gen d).

No implica que el polimorfismo genera la enfermedad, pero se puede usar ese locus
conocido para sacar conclusiones sobre el locus de la enfermedad, debido a que
están muy cerca y probablemente no hay crossing over entre ellos.

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