Bioquimica
Bioquimica
Bioquimica
TRABAJO COLABORATIVO
COD. 66992879
CURSO
151030_18
TUTOR
ADMINISTRACIÓN EN SALUD
BIOQUÍMICA
PALMIRA – VALLE
2015
Problema 1
Para las células eucariotas (como las de nosotros), el ADN es el código genético en el núcleo de
las células con toda la información necesaria para construir un organismo un organismo y
controlar los procesos metabólicos; el ARN lleva a cabo las instrucciones presentes en este
"plano" y convierte estas instrucciones en proteínas, uno de los bloques básicos con los que
estamos hechos. El ARN es muy parecido al ADN, pero difiere en importantes detalles: en la
célula el ARN es de una sola "hebra" (mientras que el ADN es de dos hebras), y los nucleótidos
del RNA contienen ribosa, mientras que los del DNA contiene desoxiorribosa (como la ribosa
pero con un átomo menos de oxígeno). Estos se conocen como ácidos nucleídos, pero existe otro
fragmento de ADN que se encuentra en las mitocondrias y mantiene una independencia de la del
ADN del núcleo. La mitocondria fue observada al microscopio a finales del siglo XIX aunque su
caracterización funcional tuvo su primer apogeo a mediados del siglo XX, a finales del cual se
descubre y analiza su genoma y se identifican mutaciones responsables de enfermedades
humanas. La secuencia completa del ADN mitocondrial (mtADN) humano, es una reminiscencia
del antiguo genoma bacteriano, y por tanto tiene un código genético propio, patrón de herencia
materna únicamente, los hijos no heredad ADN mitocondrial del padre, el genoma mitocondrial
es capaz de expresar 13 proteínas. En este estructura se lleva a cabo las principales rutas
metabólicas que ocurren en el interior del orgánulo (oxidación de ácidos grasos, ciclo de Krebs,
síntesis de nucleótidos y fosfolípidos, ciclo de la urea, etc.), destacando la producción de energía
en forma de ATP a partir de la combustión de sustratos metabólicos procedentes de los hidratos
de carbono, ácidos grasos, etc., a través de un proceso denominado cadena transportadora de
electrones y fosforilación oxidativa. Los mecanismos de acción que intervienen en el
almacenamiento, replicación y transferencia de la información genética, así como las reacciones
que forman el metabolismo son prácticamente idénticas, desde las bacterias hasta los organismos
superiores. Igualmente parte de los componentes moleculares de nucleótidos hacen parte de
almacenamiento como energía química, estableciendo una relación bioquímica estrecha entre las
diferentes estructuras.
1. Los integrantes del grupo colaborativo investigarán sobre la composición y
estructura de los ácidos nucleídos, desde sus unidades más sencillas, los nucleótidos,
hasta la organización más compleja dirigida por histonas y otras proteínas.
Los ácidos nucleicos están formados por largas cadenas de nucleótidos, enlazados entre sí por el
grupo fosfato. El grado de polimerización puede llegar a ser altísimo, siendo las moléculas más
grandes que se conocen, con moléculas constituídas por centenares de millones de nucleótidos en
una sola estructura covalente. De la misma manera que las proteínas son polímeros lineales
aperiódicos de aminoácidos, los ácidos nucleicos lo son de nucleótidos. La aperiodicidad de la
secuencia de nucleótidos implica la existencia de información. De hecho, sabemos que los ácidos
nucleicos constituyen el depósito de información de todas las secuencias de aminoácidos de
todas las proteínas de la célula. Existe una correlación entre ambas secuencias, lo que se expresa
diciendo que ácidos nucleicos y proteínas son colineares; la descripción de esta correlación es lo
que llamamos Código Genético, establecido de forma que a una secuencia de tres nucleótidos en
un ácido nucleico corresponde un aminoácido en una proteína. Existen dos tipos de ácidos
nucleicos, ADN y ARN, que se diferencian por el azúcar (Pentosa) que llevan: desoxirribosa y ribosa,
respectivamente. Además se diferencian por las bases nitrogenadas que contienen, Adenina, Guanina,
Citosina y Timina, en el ADN; y Adenina, Guanina, Citosina y Uracilo en el ARN. Una última diferencia
está en la estructura de las cadenas, en el ADN será una cadena doble y en el ARN es una cadena sencilla
Los nucleótidos
Son los ésteres fosfóricos de los nucleósidos. Están formados por la unión de un grupo fosfato al
carbono 5’ de una pentosa. A su vez la pentosa lleva unida al carbono 1’ una base nitrogenada.
Se forman cuando se une ácido fosfórico a un nucleósido en forma de ión fosfato (PO43-)
mediante un enlace éster en alguno de los grupos -OH del monosacárido. El enlace éster se
produce entre el grupo alcohol del carbono 5´ de la pentosa y el ácido fosfórico. Aunque la
ribosa tiene tres posiciones en las que se puede unir el fosfato (2’, 3’ y 5’), y en la desoxirribosa
dos (3’ y 5’), los nucleótidos naturales más abundantes son los que tienen fosfato en la posición
5’. Nucleótidos con fosfato en 3’ aparecen en la degradación de los ácidos nucleicos.
Histonas: Son proteínas simples básicas, tiene un elevado contenido de arginina y lisina (20-
30%), lo que hace fuertemente policatiónicas, no contienen triptófano y relativamente son
aminoácidos azufrados. Presentan un dominio central y no polar, con una estructura globular y
unas regiones N-terminales y C-terminales que contiene la mayor parte de aminoácidos básicos,
son solubles en agua y se coagulan con el calor. Su pero molecular oscila entre 11.000 y 21.000
Da.
En las células eucariotas el ADN está unido fuertemente a las histonas, que constituyen la
mitad de la masa de los cromosomas, mediante interacciones iónicas con el esqueleto
polianiónico de fosfato del ADN, dando lugar a nucleoproteínas neutras. Por lo tanto, el ADN de
los cromosomas eucariótico no está libre, sino unido a las histonas, constituyendo la cromatina.
Las histonas que componen la cromatina son de cinco clases: H1, H2A, H2B, H3 y H4,
(Tabla 1). Algunas de las cadenas laterales de los aminoácidos de estas histonas pueden sufrir
modificaciones post-traduccionales, presentándose acetiladas, metiladas, ADP-ribosiladas y
fosforiladas. Estas modificaciones modulan la carga de las proteínas, así como su estructura y el
patrón de interacciones por puente de hidrógeno que puede establecer, lo cual es decisivo en el
control del empaquetamiento del ADN, y por lo tanto para regular la capacidad para la
replicación y la transcripción
El ADN que constituye el genoma humado puede ser subdividido en pedazos de información
llamados genes. Cada gen contiene información para la producción de una proteína única la cual
realizará una función especializada en la célula. El genoma humano contiene más de 25,000
genes.
¿Cómo usan las células la información codificada en sus genes? Las células realizan un proceso
en dos pasos llamados trascripción y traducción para leer cada gen y producir la cadena de
aminoácidos que forman una proteína.
Trascripción
El primer paso, llamado trascripción, implica copiar la secuencia de ADN en la forma de ARN
mensajero (ARNm) la cual es una molécula muy similar al ADN. Al igual que el ADN, el
ARNm contiene 4 bases nucleotídicas, pero en el ARNm la base uracilo (U) reemplaza a la
timina (T). El ARNm sigue esencialmente las mismas reglas que el ADN para formar los pares
de bases: G forma un par con C y A forma otro par con U.
La molécula de ARNm transporta la información para hacer una proteína desde el núcleo de la
célula, donde se encuentra el ADN, hacia el citoplasma, donde se ubica la maquinaria para hacer
proteínas.
Traducción
El segundo paso en la producción de una proteína es llamado traducción. En el citoplasma, la
información en el ARNm es traducida por la maquinaria celular productora de proteínas, llamada
ribosoma, la cual ensambla las proteínas.
Los ribosomas usan Código Genético Universal (el cual se muestra debajo) para determinar la
secuencia de aminoácidos codificada por el ARNm. Solamente la información contenida entre
las señales de inicio (AUG) y terminación (UAA, UAG o UGA) de una molécula de ARNm es
usada para producir una secuencia de aminoácidos. Después de la señal de inicio (AUG), el
ribosoma lee tres nucleótidos a la vez. Cada grupo de tres nucleótidos, o codón, especifica un
aminoácido en particular.
Nivel de cromatina.
La cromatina está constituida por el DNA enrollado alrededor de una serie de nucleosomas,
empaquetada más relajada en las regiones que contienen genes activos. Además de los cambios
generales que ocurren en las regiones activas o potencialmente activas, ocurren cambios
estructurales en sitios específicos asociados con la iniciación de la transcripción o con
determinadas características estructurales del DNA. Estos cambios se detectaron por primera vez
gracias a los efectos de la digestión con concentraciones muy débiles de la enzima DNAsa I.
Nivel transcripcional.
Nivel postranscripcional.
Splicing diferencial.
Existen varias formas alternas de splicing mediante las cuales, a partir de un mismo gen, se
obtiene una variedad de productos proteicos. Un sitio de splicing puede permanecer constante y
el otro variar.
Nivel traduccional.
Este nivel de regulación es el menos conocido de todos. Parece ser que los mecanismos que lo
rigen juegan un papel importante en el almacenamiento recién estudiado, ya que la traducción
depende de la liberación de los mRNAs, aun cuando el almacenamiento sea breve. Tampoco
todos los mRNAs que llegan al citoplasma se traducen en proteínas. A veces se encuentran
mRNAs que dirigen la síntesis proteica in vitro, aunque sus proteínas correspondientes no se
sintetizan en las células de las cuales se obtuvo el mRNA. La posibilidad de que un mRNA sea
traducido en auténticas proteínas in vitro, demuestra que éste es capaz de funcionar como molde.
De esta manera, su incapacidad de ser traducido in vivo puede tomarse como evidencia del
control traduccional. Debe haber algunos mecanismos in vivo que eviten la traducción.
Nivel postraduccional.
Las proteínas recién sintetizadas pueden sufrir modificaciones postraduccionales que son, a su
vez, una manera de controlar la expresión de los genes en eucariontes. Esta regulación puede ser
cuantitativa o cualitativa. Se trata de glicosilaciones, fosforilaciones, acetilaciones,
ribosilaciones, etc. Se puede dar el caso de poliproteínas que sufren cortes, mecanismo que es
común en la síntesis de hormonas peptídicas como la insulina. La insulina está formada por dos
cadenas polipeptídicas. Primeramente se sintetiza una cadena de 86 aminoácidos que es la
preproinsulina. Se elimina el péptido señal y queda la proinsulina con 62 aminoácidos. Sucede
un plegamiento tridimensional de la proinsulina que está estabilizado por enlaces disulfuros. A
continuación se eliminan 31 aminoácidos por cortes internos dando la insulina activa.
Otra vía de control es la activación de enzimas por cortes proteolíticos. La forma precursora de
muchas enzimas es inactiva. Se activan después de ser cortadas en puntos específicos como por
ejemplo la quimotripsina. La unión de grupos prostéticos a glicoproteínas y lipoproteínas es otra
forma de regulación de la expresión de los genes en eucariontes a nivel postraduccional.
4. Cuarto la relación que hay entre los nucleótidos energéticos.
Un nucleótido puede llevar unidos al ácido fosfórico otros ácidos fosfóricos mediante enlaces de
alta energía. Una molécula de AMP se une a un ácido fosfórico, formándose ADP y se necesita
para ello 7,3Kcal. El ADP se une a un ácido fosfórico formándose ATP necesitándose 7,3 Kcal.
Al mismo tiempo el ATP se hidroliza y se obtiene ADP liberándose 7,3 Kcal.
Las mitocondrias contienen su propio ADN y se piensa que representan organismos similares a
las bacterias incorporados a la célula eucariota hace entre unos 700 Ma y 1,5 Ga.
Funcionan como sitio de liberación de energía (luego de la glicólisis que se realiza en el
citoplasma) y formación de ATP por quimiósmosis. Se encuentran rodeadas por dos membranas,
la interna forma una serie de repliegues: las crestas mitocondriales, la superficie donde se genera
el ATP. El interior se denomina matriz y el espacio entre las dos membranas es el espacio
intermembrana.
Esquema de la endosimbiosis
Con el tiempo esta unión se convirtió en algo tan estrecho (la función regeneradora de ATP se
delegó a los orgánulos celulares) que las células eucariotas heterotróficas no pueden sobrevivir
sin mitocondrias ni los eucariotas fotosintéticos sin cloroplastos (la membrana que rodea al
protoplasto del eucariota no dispone de los componentes de la cadena de transporte de
electrones), y el endosimbiota no puede sobrevivir fuera de la célula huésped.
Garrido A. Teijon J.2006. Madrid. Editorial Tébar. Fundamentos de Bioquímica estructural recuperado
octubre 8 de 2015 URL: http://www.uv.es/tunon/pdf_doc/AcidosNucleicos_veronica.pdf
http://books.google.com.pe/books?
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http://learn.genetics.utah.edu/es/transcribe/
http://timbinortatanonymousbiologist.blogspot.com.co/2012/05/81-niveles-de-regulacion-de-
la.html
http://www.biologia.edu.ar/cel_euca/celula4.htm