USO MALDI TOF-sgc - Esp
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MALDI-TOF
PROCEDIMIENTO OPERATIVO ESTÁNDAR
“Este recurso es el resultado del financiamiento otorgado por el Estado Nacional, por lo
tanto queda sujeto al cumplimiento de la Ley Nº 26.899 y la política de gestión del
conocimiento de la ANLIS”.
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AUTORAS Y AUTORES:
FLORENCIA ROCCA
MÓNICA PRIETO
CLAUDIA MARTÍNEZ
LUCÍA CIPOLLA
RITA ARMITANO
GISELA MARTÍNEZ
GASTÓN D´ANGIOLO
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TABLA DE CONTENIDO O ÍNDICE 4
PROPÓSITO - ALCANCE 5
1-DEFINICIONES Y ABREVIATURAS 5
2-RESPONSABLES 6
3-FUNDAMENTOS TEÓRICOS 6
4-INSTRUCCIONES 6
5-CONSIDERACIONES ESPECIALES 23
6-BIBLIOGRAFÍA 23
7-ANEXOS 24
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PROPÓSITO: Describir la metodología de MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser
Desorption/Ionization- Time of Flight) para la identificación de microorganismos
GRUPO DE RIESGO I: Bajo riesgo individual y comunitario (requieren nivel de contención 1). Este
grupo incluye aquellos microorganismos que no causan enfermedades a
trabajadores de laboratorio y animales.
GRUPO DE RIESGO II: Moderado riesgo individual y riesgo comunitario limitado (requieren nivel de
contención 2). Este grupo incluye patógenos que pueden causar
enfermedades a humanos o animales, pero bajo circunstancias normales, no
producen riesgos serios a trabajadores de laboratorio, la comunidad, los
recursos naturales o el medioambiente. Las exposiciones de laboratorio rara
vez conducen a infecciones que producen enfermedades serias. Existen
tratamientos efectivos, medidas preventivas y el riesgo de dispersión en la
comunidad es bajo.
AN: acetonitrilo
EtOH: etanol
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2.- RESPONSABLES
4.-INSTRUCCIONES
4.2.-CONDICIONES DE SEGURIDAD
Durante el procesamiento de las muestras se debe trabajar en cabinas de seguridad biológica de clase II y
empleando elementos de protección personal.
Al largar una corrida en el equipo, no se requieren medidas de bioseguridad; pero sí se deberán cumplir
ciertas condiciones ambientales constantes de acuerdo a lo indicado en el Manual del equipo:
temperatura ambiente, humedad menor al 70% y limpieza del ambiente (libre de polvo y talco),
manteniendo ventanas cerradas. Respecto de la temperatura, de acuerdo con la experiencia de este
laboratorio, el rango óptimo de trabajo es de 18-22ºC con aire acondicionado.
2. Con el botón verde del equipo “IN/OUT” (con el programa Flex Control maximizado)
Figura 1
• Una vez en modo OUT, se podrá abrir la tapa del equipo. Insertar la placa en el Maldi
Biotyper (Figura 2), cerrar tocando nuevamente la flecha (Figura 1)
• Aguardar que el equipo ingrese a modo “IN”
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Figura 2
Figura 3
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Figura 4
• Aguardar hasta que el punto “Source High” pase de FAIL (rojo), al OK (verde)
(Figuras 4 y 5)
Figura 5
Figura 6
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Figura 7
Calibración manual
• Seleccionar con el botón izquierdo del mouse, una proteína que no tenga tilde. Al
Figura 8
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• Repetir este paso con todas las proteínas no tildadas
• Finalmente seleccionar “FILE” – “SAVE METHODS AS” – “SAVE” – “YES”
• Volver a calibrar, presionando “CALIBRATE”
• Aparecerá la nota de calibración correcta
• Minimizar el programa Flex control (no cerrar NUNCA este programa)
Si la calibración manual no puede ser llevada a cabo debido a que el error para cada
proteína es mayor a 300 ppm, se debe repetir el procedimiento con nueva alícuota de
BTS del mismo tubo
Si aún no pudiese realizarse una calibración correcta, preparar nuevo solvente orgánico
y luego BTS fresco.
Importante: Trabajar rápidamente cuando el tubo de BTS está destapado para evitar su
evaporación.
Se recomienda calibrar el equipo cada vez que se lleve a cabo un ensayo, o en dos
turnos (por la mañana y por la tarde) si el flujo de trabajo es continuo.
Se deberá trabajar con cultivos frescos (18 – 24 horas de incubación). Algunos microorganismos de
crecimiento lento pueden necesitar mayores tiempos de incubación antes de ser testeados.
La metodología acepta cultivos en agar Columbia con sangre de carnero al 5%, agar tripticasa soya, agar
Mac Conkey, agar Chocolate, agar BHI.
No deben utilizarse cultivos refrigerados, debido a que esto puede alterar el espectro y su
reproducibilidad.
Microorganismos esporulados y otros como Levaduras, Micobacterias, Actinomycetales que poseen pared
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celular gruesa, pueden no ser identificados por el método directo y requerir métodos de extracción para
su completa identificación.
4.4.2.- Métodos
Materiales:
• Escarbadientes
• Tips de 10 µl
Reactivos:
• BTS
• Matriz
Procedimiento
• En la planilla de registro (ANEXO FI-BE-19), rotular la posición del BTS, que se utilizará
como control del ensayo, y de cada muestra en estudio, que deberá sembrarse por
duplicado
• En la cabina de seguridad biológica y empleando guantes de látex libres de talco, tomar
con un escarbadientes, una sola colonia aislada y realizar un extendido lo más fino
posible en un pocillo. Realizar el segundo spot sin volver a tocar la colonia
• Agregar 1 µl de BTS en un pocillo de la placa. Este paso debe realizarse luego de
en la Figura 9.
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Figura 9
La metodología es muy sensible y una pequeña cantidad de material biológico suele ser suficiente; excesos
de material biológico pueden llevar a fallas en la clasificación.
Una vez cubiertas las muestras con matriz, la lectura puede ser realizada hasta 3 o 4 horas después de la
siembra. En ese caso, guardar la placa en su soporte y en ambiente fresco y seco, evitando variaciones de
temperatura y humedad.
Si es posible dejar esa placa dentro del equipo en estado de vacío, la corrida puede realizarse hasta 10 o
12 horas luego de la siembra.
Nota: En caso de no lograr una identificación confiable por el método directo, se sugiere realizar el
procedimiento agregando 1 µl de AF 70% al segundo pocillo de cada muestra y luego cubrir con la
matriz.
Materiales:
• Matriz
• Agua ultrapura
• EtOH 100%
• AF 70%
• AN 100%
Preparación:
Procedimiento:
Farland
• Pasar por vortex vigorosamente
• Agregar 900 µl de EtOH (de ser necesario detener el proceso, las muestras pueden ser
• Remover el exceso de líquido con pipeta. Dejar secar a temperatura ambiente hasta
evaporación total
• Agregar 50 µl de AF (si el pellet es pequeño, reducir el volumen de AF a 10 µl).
secar
• Cubrir con 1 µl de matriz. Dejar secar a temperatura ambiente 5 - 10 minutos
Nota: Se recomienda realizar este procedimiento en el día y emplear reactivos químicos de alta pureza para
asegurar la calidad de la extracción y del espectro.
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4.5.- INTERPRETACION DE RESULTADOS
Manejo de hardware y software (Flex Control, Maldi Biotyper RTC, Maldi Biotyper 3.1)
Figura 10
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Figura 11
Figura 12
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Figura 13
- Una vez creado el proyecto, aparecerá la grilla de la placa para asociar las
muestras a las posiciones
- Marcar las posiciones a ensayar y, con el botón derecho del mouse, seleccionar
“ADD ANALYTES” (Figura 14)
- Identificar las muestras en la columna ID. Click en botón “FINISH” (Figura 15)
Figura 14
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Figura 15
Figura 16
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Figura 17 Figura 18
- Seleccionar las páginas a imprimir en “PRINT PREVIEW" para obtener la planilla
de resultados (figura 18)
- Para ver un proyecto anterior, seleccionar “FILE”- “OPEN CLASSIFICATION” y
elegir el proyecto deseado.
Nota: Todos los procedimientos en el equipo Maldi Biotyper deben realizarse SIN EL
USO DE GUANTES
Importante: el software Flex Control debe permanecer abierto, aun cuando no está en
uso.
Se comparan los perfiles proteicos obtenidos de las muestras con la base de datos del equipo (BD 9997
organismos a principios del año 2022), y con las Bases de Datos in house.
Se analizan los valores de score de los 10 primeros pocillos (TOP TEN), verificando una divergencia
mayor al 10% entre el resultado de la primera especie y la distinta siguiente.
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Cuando se obtienen valores de score menores a 1.700, se deberá optimizar la preparación de la muestra,
ya sea, variando la cantidad de inóculo o utilizando protocolo de extracción distinto del método directo.
En caso de obtener varias especies con score mayor a 2.000 y sin 10% de divergencia entre dichos valores,
analizar los resultados, agregar pruebas bioquímicas diferenciales o evaluar derivar el aislamiento al
Laboratorio de Referencia para confirmar la identificación.
Se aceptarán valores de score más bajos para determinados grupos de microorganismos, previamente
validados por Laboratorios de Referencia, para una identificación confiable.
Se recomienda consultar el Manual de interpretación de resultados de MALDI-TOF: Alternativas para la
identificación de microorganismos.
La creación, validación y transferencia de Bases de Datos in house estará a cargo de los Laboratorios de
Referencia pertenecientes a la ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán” y al
Hospital de Clínicas José de San Martín.
• Shigella sp. No está incluido en la base de datos Maldi Biotyper 3.1 y es considerado
como parte de las especies de E. coli, en consecuencia, no arroja un patrón diferente.
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considerarse como Stenotrophomonas grupo maltophilia.
• Género Listeria: sólo Listeria grayi puede ser diferenciada de las otras especies.
El material estudiado se coloca en bolsas rojas para ser descontaminado y posteriormente se realiza el
descarte final.
Trabajar en cabina con guantes de protección cuando se utiliza TFA, ya que el mismo es corrosivo.
Durante el lavado de las placas de acero, evitar la inmersión de la placa dentro de las soluciones de EtOH
o TFA. Sólo se debe cubrir la superficie con los reactivos químicos.
Proteger la superficie de la placa de rayaduras, guardándola en el recipiente de almacenamiento provisto
por Bruker Daltonics.
6.- BIBLIOGRAFÍA
• Interpretive criteria for identification of Bacteria and Fungi by DNA Target Sequencing;
Approved Guideline. MM18-A. Vol 28 No. 12. Clinical and Laboratory Standards Institute
(CLSI).
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7.- ANEXOS
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Planilla de calibración
FECHA /
BTS FECHA
HORA PLACA POCILLO OBSERVACIONES
LOTE HIDRATACIÓN
CALIBRACIÓN
Planilla de registro de muestras
Planilla de registro de preparación de insumos para MALDI TOF
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Debe confirmarse su vigencia antes de hacer uso de esta versión, por si ha sido modificada.
Instructivo para la preparación del Solvente Orgánico (SO)
Materiales:
• Campana para trabajar con reactivos químicos
• Tubos eppendorf de 1,5 ml
• Tips de 10 µl, 100 µl y 1000 µl
• Micropipetas: P10 (0,5-10 µl); P100 (10-100 µl); P1000 (100-1000 µl)
• Recipientes de vidrio para almacenar el reactivo si se preparan volúmenes
mayores
• Guantes
• Guardapolvo
Reactivos:
• Acetonitrilo, AN 100% (HPLC / MS Grade)
• Acido trifluoroacético, TFA 100% (HPLC / MS Grade)
• Agua ultrapura (HPLC / MS Grade)
Preparación:
• Para 1 ml de SO agregar: 475 µl de agua ultrapura + 25 µl 100% TFA + 500 µl
de 100% AN
• Rotular con fecha de preparación
• Almacenar a temperatura ambiente
• Registrar la preparación en la planilla correspondiente (ver FI-BE20)
Materiales:
• Campana para trabajar con reactivos químicos
• Tips de 1000 µl
• Micropipetas: P1000 (100-1000 µl)
• Recipiente para almacenar la matriz al resguardo de la luz
• Vórtex
• Guantes
• Guardapolvo
Reactivos:
• SO (solvente orgánico)
• HCCA liofilizada
Preparación:
• Reconstituir el tubo liofilizado con 250 µl de SO
• Usar vortex durante 1 minuto. Confirmar disolución total
• Rotular el tubo con fecha de preparación
• Registrar la preparación en la planilla correspondiente (Ver FI-BE20)
Almacenamiento:
• Una vez reconstituido, guardar en oscuridad a temperatura ambiente en envase
rotulado.
• Se recomienda usar dentro de la semana de reconstitución.
Nota: Pasar por vortex previo a su uso y revisar que no se hayan formado cristales
en el fondo del tubo.
De ser así, agregar 30 µl de AN y pasar por vortex o centrifugar a 13000 rpm
durante 2 minutos, utilizar el sobrenadante. Si los cristales no se disuelven, se
debe preparar nueva matriz.
BTS es un extracto de proteínas ribosomales de Escherichia coli DH5α, que posee dos proteínas
adicionales (RNAsa y mioglobina), para cubrir el rango de lectura de 2 a 20 KDa.
Materiales:
• Tips de 10 y de 100 µl
• Micropipetas: P10 (1-10 µl); P100 (10-100 µl)
• Microtubo de 0,2 µl o 0,5 µl
• Guantes
• Guardapolvo
Reactivos:
• SO (solvente orgánico)
• BTS liofilizado
Preparación:
Almacenamiento:
• Una vez reconstituido, almacenar a -18 °C
Se recomienda preparar y refrigerar el BTS al menos 48 horas previas a su uso, ya que esto
mejora el rendimiento.
Instructivo para el Lavado de placas
La placa de acero reutilizable debe ser lavada para remover residuos de proteínas y
matriz, una vez que se utilizaron todos los pocillos. No es necesario lavarla
diariamente si no se utilizan todas las posiciones.
Materiales:
• Recipiente para realizar lavados
• Tips de 1000 µl
• Micropipetas: P1000 (100-1000 µl)
• Papel tissue de buena calidad
• Guantes de látex
• Cabina de seguridad biológica
Reactivos:
• Etanol 70% (EtOH)
• Acido trifluoroacético 80% (TFA)
• Agua ultrapura
Procedimiento:
• Transferir la placa a un recipiente y cubrir su superficie con EtOH 70%. No
inundar la totalidad de la placa
• Dejar a temperatura ambiente durante 5 minutos
• Remover la placa y enjuagar con abundante agua ultrapura con una pipeta
• Limpiar con papel tissue embebido en EtOH 70%
• Enjuagar la placa con agua ultrapura y volver a limpiar con papel tissue seco
• Cubrir la placa con una capa de 100 µl de TFA 80% y limpiar intensamente
todas las posiciones de la placa con papel tissue
• Enjuagar la placa con agua ultrapura y limpiar hasta secarla con papel tissue
seco
• Dejar secar completamente, al menos 15 minutos a temperatura ambiente