Guía Viroides
Guía Viroides
Guía Viroides
Definición. Son organismos con pequeñas moléculas de ácido ribonucleico (RNA) de bajo
peso molecular, capaces de replicarse de forma automática, resistentes a altas
temperaturas, con la capacidad para infectar a células vegetales, producir enfermedad y
transmitirse sólo por vía mecánica (Agrios, 2006).
Diferencias con los virus (Cuadro 1).
Clasificación
Viroides (Oganismos infectivos que pueden causar enfermedades en los
organismos vivos que infectan) (Diener, 1978).
Familia Pospiviroidae: Provoca la enfermedad de la papa fusiforme (PSTVd), con
una estructura de varilla con la región central conservada y se replican en el
núcleo, composición de bases rica en (G+C) y con triple ligadura.
Familia Avsunviroidea: Provocan la enfermedad de la mancha de sol del
aguacatero (ASBVd), carecen de la región central conservada y se replican en
los cloroplastos, composición predominante (A+U)
(https://www.csic.es/es/proyectos/viroides-dominios-estructurales-iniciacion-de-la-
transcripcion-interaccion-con-proteinas).
En la familia Pospiviroidae (PSTVd-like), el ARN de cadena circular se transcribe
por una ARN polimerasa del huésped en hebras minus oligoméricas y luego a
hebras con mayor cantidad de oligómeros. Estas hebras con más oligómeros son
activadas por un anfitrión de RNasa y se ligan por una ligasa de ARN para formar
la cadena monomérica positiva de ARN circular. Esto se denomina la vía asimétrica
(3´ a 5´) de replicación en círculo rodante.
Enfermedades
Diversas son las enfermedades provocadas por los Viroides, antes algunas de éstas eran
consideradas como virosas, ejemplos:
Referencias
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III%29.pdf).
Árbol taxonómico
Domain: Virus
Group: Viroids
Family: Pospiviroidae
Genus: Cocadviroid
Species: Coconut cadang-cadang viroid
Los viroides se incluyen como agentes subvirales dentro del sistema taxonómico
adoptado por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus (Fauquet et al., 2005).
A diferencia de los virus, los viroides tienen un genoma considerablemente más
pequeño, no codifican ninguna proteína, pero se clasifican en familias, géneros y
especies siguiendo algunos de los criterios adoptados para los virus (Flores et al.,
2003). Los viroides solo se han encontrado en las plantas.
Las aproximadamente 25 especies de viroides de la familia Pospiviroidae comparten
tres criterios con la especie tipo, el viroide tubérculo del huso de la patata: una región
central conservada (CCR) en su secuencia de nucleótidos; ausencia de auto escisión
mediada por una ribozima cabeza de martillo; y se replican y acumulan en el núcleo a
través de un mecanismo de círculo rodante asimétrico.
Las tres especies viroides de la familia Avsunviroidae (especie tipo, viroide manchado
de aguacate) carecen de CCR; sus ARN se autoescinden mediante ribozimas de
cabeza de martillo; y se replican y acumulan en el cloroplasto a través de un mecanismo
simétrico de círculo rodante.
Dentro de cada familia, los viroides se agrupan en géneros basados en motivos de
secuencia de nucleótidos. Los cinco géneros en Pospiviroidae se separan en función
de la secuencia de nucleótidos del motivo de la región central conservada (CCR) y la
presencia o ausencia de ciertos motivos conservados (Flores et al., 2003). Los dos
géneros en Avsunviroidae están separados en el contenido de G + C y estructura
secundaria prevista. Los nombres de los géneros son sigla que representan el tipo de
especies viroides. CCCVd es la especie tipo del género Cocadviroid.
Los datos de secuencia son el criterio principal para distinguir especies, con un nivel
arbitrario de identidad de secuencia de nucleótidos del 90% que separa las diferentes
especies de viroides de las variantes de la misma especie de viroides. Por lo tanto,
además del CCCVd, el género Cocadviroid incluye el viroide tinangaja de coco (CTiVd),
el viroide latente de lúpulo y el viroide IV de cítricos. A pesar de que tanto CCCVd como
CTiVd infectan la palma de coco y causan enfermedades similares, son especies
separadas porque comparten solo alrededor del 64% de identidad de secuencia de
nucleótidos.
Las variantes de secuencia están asociadas con fenotipos particulares de la
enfermedad viroidea, como el síntoma de "escoba" asociado con mutaciones puntuales
en uno o dos sitios en CCCVd (Rodríguez y Randles, 1993). Los viroides son
poblaciones complejas de variantes de secuencia estrechamente relacionadas, pero
no idénticas, que se describen como quasiespecies (Domingo et al., 1996; Flores et al.,
2003). Por lo general, predomina una o un número limitado de variantes, pero se
reconoce que la secuenciación de viroides debe incluir una replicación suficiente para
determinar el rango de variación. No existe un sistema formal de nomenclatura para las
variantes de viroides.
Descripción
CCCVd (forma de 246 nucleótidos) es el viroide más pequeño conocido, así como el
patógeno infeccioso más pequeño conocido. Las palmeras de coco afectadas por
Cadang-cadang (Cocos nucifera) contienen moléculas viroides lineales y circulares, y
existen numerosas variantes de la secuencia básica de 246 nt (Imperial et al., 1981;
Mohamed et al., 1982; Haseloff et al., 1982; Genbank Accession Number J02049,
J02050) incluyendo mutantes de estos (Rodríguez, 1993; Rodríguez y Randles, 1993).
Por ejemplo, hay dos formas electroforéticas "rápidas" (CCCVd246 y CCCVd247) y
"lentas" (CCCVd296 y CCCVd297) monoméricas, así como formas diméricas de cada
monómero (Randles, 1985). CCCVd247 difiere de CCCVd246 por la inserción de una
citosina en la posición 197 y CCCVd297 de CCCVd296 son las formas 'lentas'
correspondientes. Los ARN 'lentos' se derivan directamente de las formas 'rápidas'
correspondientes mediante una duplicación parcial del terminal derecho (TR) de la
molécula (Haseloff et al., 1982). Hay formas lentas adicionales debido a la reiteración
de 41, 50 o 55 nt en el TR, produciendo ARN viroides entre 287 y 301 nt (Haseloff et
al., 1982).
Las palmas de coco con un fenotipo de "escoba" contienen mutaciones únicas
(Rodríguez y Randles, 1993). Se han detectado variantes de CCCVd (270, 293 y 297
nt variantes del viroide) en palma aceitera en bajas concentraciones y tenían una alta
similitud de secuencia con CCCVd 296, pero ninguna era idéntica a las formas descritas
anteriormente de CCCVd (Vadamalai et al., 2006 ) Las propiedades físicas y el perfil
de fusión del CCCVd son similares a los del viroide del tubérculo del huso de la papa
(PSTVd) (Randles et al., 1982).
CCCVd es el único viroide conocido que muestra cambios moleculares 'programados'
durante la progresión de la enfermedad. El orden de aparición es normalmente las
formas de nucleótidos 246, 247 en la etapa inicial de la enfermedad y luego cantidades
crecientes de las formas de nucleótidos 296, 297 en las etapas media y tardía a medida
que desaparecen las formas pequeñas (Imperial y Rodriguez, 1983; Randles, 1985,
1987). Las formas diméricas asociadas siguen el mismo patrón.
Distribución
La distribución en la tabla de resumen se basa en toda la información disponible para
la enfermedad de cadang-cadang en coco.
(CCCVd)
La enfermedad de coco cadang-cadang y CCCVd se encuentra en el centro de
Filipinas, y se está extendiendo lentamente, pero continuamente al norte y al sur del
sitio de su primera aparición durante 1914 a 1931 en la provincia de Albay (ver Hanold
y Randles, 1991a; Rodríguez y Randles, 2003 para distribución). Los ensayos de
hibridación también han detectado secuencias relacionadas con CCCVd en palmas de
aceite en Filipinas (en la península de Albay), las Islas Salomón e Indonesia (Hanold y
Randles, 1989, 1998; Hanold y Randles, 1991b).
Más recientemente, se han identificado variantes de CCCVd mediante secuenciación
en palma aceitera africana (Elaeis guineensis) en varios sitios en Malasia (Vadamalai,
2005; Vadamalai et al., 2006). Estas variantes de CCCVd a veces se asocian con una
condición llamada 'Manchado anaranjado genético' en la palma aceitera. El GOS se
considera una enfermedad relativamente menor de la palma aceitera comercial, pero
su epidemiología se conoce poco y se necesita mucha más investigación para
comprender la importancia biológica de estos hallazgos. Los síntomas de manchas
anaranjadas también pueden estar asociados con deficiencias nutricionales.
El ARN relacionado con el CCCVd también se identificó mediante análisis de
hibridación en la palma de buri (Corypha elata), en la palma de Areca y en una serie de
otras monocotiledóneas en Asia y Oceanía, incluyendo pandanas, jengibre, arrurruz y
pastos (Hanold y Randles, 1989, 1991b, 1998). La información de secuencia no se ha
obtenido. Además, se producen varias enfermedades de la palma de coco de etiología
desconocida en Sri Lanka y se detectó ARN relacionado con CCCVd en cocos en Sri
Lanka (Hanold y Randles 1991b, 1998). Más recientemente, Vadamalai (2009),
utilizando otra metodología, a saber, el Ensayo de Protección de Ribonucleasa (RPA)
confirmó la presencia de una secuencia de ARN relacionada con CCCVd en una de las
cuatro palmas de coco que previamente se había demostrado que contenía ARN de
CCCVd usando el ensayo de transferencia de puntos ( Hanold y Randles, 1991). Sin
embargo, se necesita mucha más investigación para comprender el significado
biológico exacto de estos resultados, especialmente dada la distribución generalizada
de secuencias de ARN relacionadas con CCCVd en una variedad de especies de
plantas en Asia y Oceanía (https://www.cabi.org/isc/datasheet/13700).
Fig. 6. Achaparramiento de la palma y defoliación al paso de 6 o 7 meses ((CCCVd)
(https://www.google.com/search?q=cadang+cadang&rlz=1C1NHXL_esMX725MX725&source=lnms&tbm
=isch&sa=X&ved=2ahUKEwjkucnCi4LqAhXIWM0KHboIC9sQ_AUoAXoECBQQAw&biw=1366&bih=657#
imgrc=ENrjaE1q3fhiIM&imgdii=iNbkiTJtkT_ODM).
Referencias
Avocado sunblotch viriod (ASBVd) Viroide del manchado solar del aguacate Taxonomía:
Familia: Avsunviroidae; Género: Avsunviroid. Descripción: RNA monocatenario circular
de 246-251 nucleótidos, con una estructura secundaria de mínima energía libre en forma
de varilla o cuasi-varilla. Es el único viroide con una composición de bases predominante
en A+U (los otros viroides tienen una composición de bases rica en G+C). Las cadenas de
ambas polaridades son capaces de formar ribozimas de cabeza de martillo que tienen un
papel clave en la replicación. Citopatología: Alteraciones del cloroplasto. Huéspedes: El
único hospedante natural del ASBVd es el aguacate, aunque este viroide ha sido
transmitido experimentalmente a otras especies de la familia Lauraceae, a la que pertenece
el aguacate. Sintomatología: Síntomas de ASBVd pueden observarse en distintos
órganos, aunque el viroide también se replica en los llamados portadores asintomáticos.
Los síntomas foliares son esporádicos, expresándose en los casos más llamativos como
intensas áreas cloróticas asociadas al tejido vascular y en otros casos, como un patrón
variegado que afecta a parte o a la totalidad de la superficie de la hoja. Los síntomas en
tallo que frecuentemente son los primeros en aparecer, incluyen estrías con un color que
va desde blanco hasta amarillo o naranja. También se observan grietas en la corteza de los
árboles infectados, que frecuentemente presentan un porte enanizado. Los frutos
sintomáticos muestran depresiones crateriformes amarillentas o rosadas que pueden cubrir
la mayor parte de su superficie, lo que hace disminuir su valor comercial. Ocasionalmente
algunos árboles infectados se recuperan (portadores asintomáticos) y, aunque aparecen
visualmente sanos, suelen tener un menor rendimiento. Transmisión: El viroide se
transmite por injerto, incluyendo injerto natural de raíz, y mecánicamente, por lo que es
recomendable la desinfección regular de los instrumentos de poda. También se transmite
por semilla, sobre todo en el caso de los potadores asintomáticos, y por polen. Distribución
geográfica: Detectado inicialmente en Estados Unidos, el ASBVd se ha descrito también
en otras áreas del mundo donde este cultivo es relevante como América del Sur, Australia,
Suráfrica y la Cuenca Mediterránea (incluyendo España e Israel). Existe una enfermedad
abiótica llamada golpe de sol y que se confunde con los daños provocados por los Viroides
(Fig. 9a). Los daños provocados por Viroides son más severos (Fig. 9b).
Fig. 9a. Este es un ejemplo de una enfermedad abiótica llamada golpe de sol y que se
confunde con los daños provocados por los Viroides.
Fig. 9b. Mancha de sol del aguacate, ocurre un estallamiento de los tejidos (ASBVd).
(https://www.google.com/search?q=mancha+de+sol+del+aguacate+viroide+taxonomia&rlz=1C1NHXL_esMX7
25MX725&source=lnms&tbm=isch&sa=X&ved=2ahUKEwiprcOLvoDqAhXYHc0KHRyUCE4Q_AUoAXoECAw
QAw&biw=1366&bih=657#imgrc=oH27ujvRqV6ISM).
Referencias
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%28ASBVd%29.pdf).
8. Pepino
Viroide que provoca el fruto pálido del pepino (CPFVd) (Fig. 10).
Fig. 10. Fruto pálido del pepino provocado por viroides (CPFVd).
Referencias
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nWRA13zYci3SRM).