Practica Final de Bioquimica 1 Carolina Ortega Santiago

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FACULTAD:

CIENCIA DE LA SALUD

ASIGNATURA:
BIOQUIMICA I

SUSTENTADO POR:

CAROLINA ANTONIA ORTEGA SANTIAGO 1-19-1433

TEMA:
PRACTICA FINAL

FACILITADORA:
DR. ALBERTO FRIAS

Fecha de entrega
Agosto 2021

SANTIAGO, REPUBLICA DOMINICANA


Universidad Tecnológica de Santiago
UTESA

PROTOCOLO PARA LA PRACTICA 3 DE BIOQUIMICA 1, CUATRIMESTRE 2 -


21
1- BUSCAR UNA IMAGEN DEL CICLO DE KREBS, PEGARLA Y EXPLICAR
CON SUS PROPIAS PALABRAS CADA REACCION, MENCIONANDO CADA
SUSTRATO, PRODUCTO, ENZIMA ACTUANTE, COFACTORES Y
POTENCIALES REDUCTORES FORMADOS EN CADA REACCION.
BIBLIOGRAFIA A PIE DE PAGINA
2- BUSCAR UNA IMAGEN DE LA CADENA RESPIRATORIA Y EXPLICARLA
CON SUS PROPIAS PALABRAS, MENCIONANDO TODOS LOS PROCESOS
QUE SE PRODUCEN TANTO EN EL TRANSPORTE DE ELECTRONES Y
FOSFORILACION OXIDATIVA. BIBLIOGRAFIA A PIE DE PAGINA
3- HACER UN CUADRO COMPARATIVO DE LAS DIFERENTES VITAMINAS
QUE EN UNA COLUMNA INCLUYA EL NOMBRE DE CADA VITAMINA; EN OTRA
LA COENZIMA QUE DERIVA DE CADA UNA (SI TIENE); FUNCION QUE
REALIZA CADA COENZIMA; ENFERMEDADES QUE PREVIENE CADA
VITAMINA Y EN UNA ULTIMA COLUMNA LA FUENTE BIBLIOGRAFICA DE
CADA INFORMACION.
DIGITADA EN ARIAL, PARA HACER LUEGO DEL EXAMEN Y ENTREGAR EL
SABADO EN LA NOCHE.
1- BUSCAR UNA IMAGEN DEL CICLO DE KREBS, PEGARLA Y EXPLICAR
CON SUS PROPIAS PALABRAS CADA REACCION, MENCIONANDO CADA
SUSTRATO, PRODUCTO, ENZIMA ACTUANTE, COFACTORES Y
POTENCIALES REDUCTORES FORMADOS EN CADA REACCION.
BIBLIOGRAFIA A PIE DE PAGINA

Reacción 1

El grupo acetilo, que hace parte de la molécula de acetil-CoA, se condensa con el


oxalacetato y produce citrato por la enzima citrato sintasa. En la reacción se da la
entrada de agua y la salida de CoA. Es una reacción altamente exergónica, por lo
que es irreversible.

Reacción 2

La presencia del grupo hidroxilo en el mismo carbono de un grupo carboxilo en el


citrato impide la descarboxilación directa. La célula reordena el citrato y produce
un isómero susceptible a la descarboxilación llamado cis-aconitato. La enzima
utilizada es la aconitasa. Se elimina agua. La aconitasa vuelve a incorporar los
elementos de agua y el cis-aconitato se convierte en isocitrato. El isocitrato sí se
puede descarboxilar oxidativamente. Es reversible.

Reacción 3

El isocitrato deshidrogenasa, en presencia de magnesio, oxida al isocitrato y lo


convierte en oxalosuccinato. Se utiliza NAD+ y sale como NADH+H+. Con el
isocitrato deshidrogenasa, se elimina un grupo carboxilo en forma de CO2 y el
oxalosuccinato se convierte en alfacetoglutarato. El grupo carboxilo que se elimina
no pertenece al grupo acetilo, sino al oxalacetato. El isocitrato deshidrogenasa
tiene 2 isoenzimas. Una ligada al NAD y otra ligada al NADP. La del NAD es
intramitocondrial y la del NADP tiene una isoenzima intramitocondrial y una
isoenzima citoplasmática. También es una reacción reversible. Produce CO2 y
equivalentes de reducción.

Reacción 4

El alfacetoglutarato sigue descarboxilando oxidativamente por el alfacetoglutarato


deshidrogenasa. Es altamente exergónica y la reacción es irreversible. El
alfacetoglutarato se convierte en succinil-CoA y se produce más NADH+H+. El
CO2 que sale tampoco pertenece al grupo acetilo original, sino al oxalacetato.

Reacción 5

El succinil-CoA es un sustrato macroenérgico porque es tioéster entre el succinato


y CoA. La tioquinasa succínica o succinil-CoA sintetasa convierte el succinil-CoA
en succinato. La energía que libera la hidrólisis del enlace es usada para sintetizar
GTP a partir de GDP. Para que la reacción se vuelva a dar, se tiene que convertir
el GTP en GDP y para eso se necesita que entre ADP y salga ATP. Es la única
fosforilación a nivel de sustrato.

Reacción 6

Ya finalizando el ciclo, la regeneración del oxalacetato se lleva a cabo mediante la


reorganización de las moléculas a cuatro átomos de carbono. Para que esto
suceda, es necesario que el grupo metilo ubicado en el succinato se convierta en
un carbonilo; para lo que deben atravesar por una oxidación, hidratación y otra
oxidación. Como el succinato es un sustrato que está altamente reducido, se utiliza
FAD+. El succinato se convierte en fumarato por el succinato deshidrogenasa y se
produce FADH.
Reacción 7

En este punto la fumarasa se encarga de catalizar un protón y el grupo OH-


derivados de una molécula de agua. El proceso de hidratación del fumarato
produce el L-malato. El fumarato es hidratado por la fumarasa y se convierte en
malato.

Reacción 8

Como el malato está parcialmente oxidado, se utiliza NAD+ y la malato


deshidrogenasa para volver a producir oxalacetato. Los carbonos de la primera
molécula de acetil-CoA en la primera vuelta del ciclo permanecen en el oxalacetato.
En la segunda vuelta que, del ciclo, los carbonos en la segunda molécula de acetil-
CoA son los que van a salir en forma de CO2.

En manera resumida decimos que, 2 átomos de carbono entran en el ciclo del ácido
cítrico de cada grupo acetilo, representando cuatro de los seis carbonos de una
molécula de glucosa. En cada vuelta del ciclo se sueltan dos moléculas de dióxido
de carbono. De todas maneras, estos no necesariamente contienen los átomos de
carbono añadidos más recientemente.

Recién en las últimas vueltas del ciclo los dos átomos de carbono acetilo se
soltarán. Es así que los seis átomos de carbono de la molécula de glucosa original
finalmente se incorporan al dióxido de carbono. Cada vuelta del ciclo forma tres
moléculas NADH y una FADH 2molécula. Estos portadores se conectarán con la
última porción de la respiración aeróbica para producir moléculas de ATP. Un GTP
o ATP también se hace en cada ciclo. Durante el ciclo hay algunos compuestos
intermedios que se pueden usar para sintetizar aminoácidos no esenciales. Es así
que el ciclo es anfibólico, o sea, que es catabólico y anabólico.1

1
Harper. Bioquímica ilustrada, 29a edición, McGRAW-HILL INTERAMERICANA EDITORES, S.A. de C.V., 2013
2- BUSCAR UNA IMAGEN DE LA CADENA RESPIRATORIA Y EXPLICARLA
CON SUS PROPIAS PALABRAS, MENCIONANDO TODOS LOS PROCESOS
QUE SE PRODUCEN TANTO EN EL TRANSPORTE DE ELECTRONES Y
FOSFORILACION OXIDATIVA. BIBLIOGRAFIA A PIE DE PAGINA.

Cadena Transportadora de Electrones

Las coenzimas reducidas producidas por el ciclo del ácido cítrico y por la beta-
oxidación de ácidos grasos pasan a la cadena respiratoria o cadena transportadora
de electrones.

Se da en la membrana interna de la mitocondria porque ahí se encuentran las


enzimas. La mayoría de las enzimas son deshidrogenasas, con excepción de la
citocromo-oxidasa.

Formada por cuatro


complejos proteicos Transportadores de
Que son
insertos en la membrana Electrones
interna
En resumen, se oxida el NADH a NAD+, pasando los electrones a la cadena de
transporte, donde a medida que los electrones pasan por el complejo proteico se
libera energía que permite que en complejo FoF1 atp-sintasa sintetice ATP. Todo el
proceso de transporte de electrones es una reacción REDOX.

Cada complejo cumple una función que va desde una reducción hasta una oxidación
como se describe a continuación:
Complejo 1: NADH: ubiquinona oxidorreductasa (NADH Deshidrogenasa)

• Formado por varias cadenas polipeptídicas.

• Tiene proteínas hierro-sulfuradas, coenzimas del tipo flabinmononucletido


(grupo redox).

• Tiene asociado NAD (por este complejo se reoxida el NAD).

Complejo 2: succinato deshidrogenasa

• No es una proteína integral (se encuentra asociado solo a la cara interna de


la membrana).

• Es el que permite la oxidación de FADH2 a FAD.

• Tiene asociado FAD (por este complejo se reoxida el FAD).

Complejo 3: ubiquinona: citocromo c oxidorreductasa

• Molécula orgánica.

o Citocromo C.

▪ Proteína libre que se mueve entre los complejos 3 y 4.

Complejo 4: Citocromo oxidasa

• Último paso para los electrones llegue al oxígeno y así formar agua.

Este mecanismo tiene el uso de bombas de electrones, donde a medida que los
electrones pasan por el complejo, sacan protones al espacio intermembrana.

• El 4: entrega 2 protones.

• El 1 y 3: 4 protones cada una.

En general, el paso de dos electrones (a partir de la oxidación del NAD) saca 10


protones hacia el espacio intermembrana.

Debemos saber que la membrana interna es técnicamente impermeable, por lo que


tener protones en el espacio intermembrana es lo mismo que tenerlos en el citosol.

• Complejo 2: solo hay acción de electrones.

Cuando se pasa por la coenzima Q hay acción de protón y electrón.

También saber que cualquier reacción redox orgánica tiene acoplado el cambio de
dos electrones y dos protones.
Fosforilación Oxidativa

Proceso por el cual la energía generada por la CTE se conserva mediante la


fosforilación del ADP para dar ATP.

El primer paso de la fosforilación oxidativa es ionizar los átomos de hidrógeno


extraídos hasta ese momento de los sustratos alimentarios. Se libera el otro átomo
de H unido al NAD y éste último se reutiliza una y otra vez para captar H. Los
electrones extraídos de los átomos de H para su ionización entran inmediatamente
en la CTE. La CTE está formada por 4 complejos proteicos ya presentados.

El siguiente paso en la fosforilación oxidativa consiste en convertir el ADP en ATP,


a lo cual contribuye una gran molécula proteica que sobresale por toda la membrana
mitocondrial interna. Se trata de una ATPasa llamada ATP sintetasa. La elevada
concentración de hidrogeniones con carga positiva creado entre las dos membranas
mitocondriales y la gran diferencia de potencial a través de la membrana interna
provoca que los hidrogeniones fluyan al interior de la matriz mitocondrial a través de
la ATPasa. La energía liberada por este flujo de hidrogeniones es utilizada por la
sintetasa para fosforilar el ADP en ATP que es transferido al citoplasma. Por cada
2 electrones que se introducen en la cadena transportadora, provenientes de la
ionización de 2 átomos de H, se sintetizan 3 moléculas de ATP.2

2
Harper. Bioquímica ilustrada, 29a edición, McGRAW-HILL INTERAMERICANA EDITORES, S.A. de C.V., 2013
3- HACER UN CUADRO COMPARATIVO DE LAS DIFERENTES VITAMINAS
QUE EN UNA COLUMNA INCLUYA EL NOMBRE DE CADA VITAMINA; EN
OTRA LA COENZIMA QUE DERIVA DE CADA UNA (SI TIENE); FUNCION QUE
REALIZA CADA COENZIMA; ENFERMEDADES QUE PREVIENE CADA
VITAMINA Y EN UNA ULTIMA COLUMNA LA FUENTE BIBLIOGRAFICA DE
CADA INFORMACION.

NOMBRE COENZIMA FUNCIÓN QUE REALIZA ENFERMEDADES QUE BIBLIOGRAFÍA


DE LA DE CADA CADA COENZIMA PREVIENE
VITAMINA VITAMINA
Tiamina (B1) Pirofosfato de Descarboxilación, La enfermedad resultante de Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
tiamina (TPP). transferencia de grupos una deficiencia grave de y Nutrición, Dieta
aldehído. tiamina se llama ‘beriberi’, y Equilibrada, clasificación de
este se puede clasificar en: las vitaminas; Ref.:
Seco (daños en los nervios https://www.webconsultas.c
de las piernas y brazos) om/dieta-y-nutricion/dieta-
Húmedo (daños en el equilibrada/clasificacion-de-
corazón) Cerebral (daños las-vitaminas-12611
cerebrales)
Riboflavina Flavín adenín Oxido-reducción enrojecimiento e inflamación Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
(B2) dinucleótido del revestimiento de la boca y Nutrición, Dieta
FAD) y flavín y la garganta, grietas y llagas Equilibrada, clasificación de
mononucleótid en los bordes de los labios y las vitaminas; Ref.:
o (FMN) (1). las comisuras de la boca, https://www.webconsultas.c
inflamación y enrojecimiento om/dieta-y-nutricion/dieta-
de la lengua y una equilibrada/clasificacion-de-
inflamación cutánea húmeda las-vitaminas-12611
y escamosa.
Niacina (B3) Coenzima Oxido-reducción • Es un problema de piel ante Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
NAD exposición a la luz, y Nutrición, Dieta
(nicotinamida inflamación de mucosas, Equilibrada, clasificación de
adenina diarrea y alteraciones las vitaminas; Ref.:
dinucleótido) y psíquicas. • La enfermedad https://www.webconsultas.c
NADP es caracterizada por llagas om/dieta-y-nutricion/dieta-
(nicotinamida escamosas • Cambios en la equilibrada/clasificacion-de-
adenina mucosa y síntomas las-vitaminas-12611
dinucleótido mentales.
fosfato).
Piridoxina Fosfato Esta enzima que actúa Anemia, erupciones con Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
(B6) piridoxal como cofactor Involucra picazón, labios escamosos y Nutrición, Dieta
(PLP). reacciones de inflamación de la lengua. Equilibrada, clasificación de
transaminación que se las vitaminas; Ref.:
requieren para la síntesis https://www.webconsultas.c
y catabolismo de los om/dieta-y-nutricion/dieta-
aminoácidos. equilibrada/clasificacion-de-
Transferencia de grupos las-vitaminas-12611
amino.
Cobalamina Metilcobalamin Transferencias de grupos nenia perniciosa, acidosis Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
(B12) a. Cobamida. de un solo carbono. nenia pérdida de peso; y y Nutrición, Dieta
características específicas Equilibrada, clasificación de
ocasionadas por la las vitaminas; Ref.:
deficiencia de cobalaminas https://www.webconsultas.c
principalmente alteraciones om/dieta-y-nutricion/dieta-
neurológicas, palidez fla equilibrada/clasificacion-de-
vínica, glositis y parestesias, las-vitaminas-12611
es la forma más habitual,
aunque de manera
consistente, de
presentación. Otras formas
de manifestación frecuentes
derivan de la aparición de
trastornos gastrointestinales
o neuropsiquiátricos
Vitamina C ácido a-k- Hidroxilaciones L a carencia subclínica de Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
glutárico (2- vitamina C también puede y Nutrición, Dieta
OG). ocasionar una cicatrización Equilibrada, clasificación de
lenta de las heridas o las vitaminas; Ref.:
úlceras. https://www.webconsultas.c
om/dieta-y-nutricion/dieta-
equilibrada/clasificacion-de-
las-vitaminas-12611
Biotina (B8) Biocitina. Transferencias de grupos Depresión, dermatitis, Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
de un solo carbono. mialgias, alucinaciones, y Nutrición, Dieta
inmunosupresión. Equilibrada, clasificación de
las vitaminas; Ref.:
https://www.webconsultas.c
om/dieta-y-nutricion/dieta-
equilibrada/clasificacion-de-
las-vitaminas-12611
Vitamina B9 La coenzima La adición de mono La deficiencia de ácido fólico Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
de la vitamina carbonados como puede conducir a una forma y Nutrición, Dieta
B9 es el donante de carbonos. particular de anemia llamada Equilibrada, clasificación de
FOLATO Coenzima del anemia megaloblástica las vitaminas; Ref.:
metabolismo en ácidos (células sanguíneas mal https://www.webconsultas.c
nucleicos y aminoácidos formadas). el déficit de ácido om/dieta-y-nutricion/dieta-
fólico puede causar retraso equilibrada/clasificacion-de-
del crecimiento, glositis las-vitaminas-12611
(inflamación de la lengua),
úlceras en la boca, úlceras
pépticas y diarrea.
Acido Coenzima a Transferencia de grupos La carencia fue protagonista Ruiz, Arantza, (2013), Dieta
pantoténico (CoA) acilos. del síndrome de pie y Nutrición, Dieta
(B5) quemante afectando a los Equilibrada, clasificación de
prisioneros de la segunda las vitaminas; Ref.:
guerra mundial en Asia La https://www.webconsultas.c
deficiencia de vitamina 5 es om/dieta-y-nutricion/dieta-
rara, pero se puede equilibrada/clasificacion-de-
presentar en casos extremos las-vitaminas-12611
de desnutrición con pérdida
de apetito neuritis periférica,
insomnio, irritabilidad,
calambres musculares y
alteraciones de la
coordinación motora
Vitamina A Su función principal La ceguera nocturna es un https://www.studocu.com/la
Retinol consiste en la protección síntoma precoz. Con el tam/document/universidad-
del tejido epitelial, en la tiempo puede desarrollarse nacional-autonoma-de-
intervención de los ceguera. Los ojos, la piel y honduras/biologia-
mecanismos que permiten otros tejidos se resecan y se medica/vitaminas-cuadro-
el crecimiento y la dañan, y las infecciones son comparativo-sobre-la-
reproducción y en el ciclo más frecuentes. funcion-problemas-con-la-
bioquímico de la retina carencia-y-fuentes-
(formación del pigmento de/5568099
rodopsina).
Vitamina D Actúa junto con la La carencia de vitamina D https://www.studocu.com/la
Calciferol hormona paratiroidea y la puede conducir a una tam/document/universidad-
calcitonina en la absorción pérdida de densidad ósea, lo nacional-autonoma-de-
de calcio y fósforo. que puede llevar a sufrir honduras/biologia-
osteoporosis y fracturas medica/vitaminas-cuadro-
(huesos rotos). La comparativo-sobre-la-
deficiencia severa de la funcion-problemas-con-la-
vitamina D también puede carencia-y-fuentes-
conducir a otras de/5568099
enfermedades. En niños,
puede causar raquitismo.
Vitamina E Actúa principalmente cono Daño en los nervios https://www.studocu.com/la
Tocoferol antioxidante de los ácidos sensoriales (Neuropatía tam/document/universidad-
grasos y mantenimiento Periférica) -Debilidad nacional-autonoma-de-
de la permeabilidad de las muscular (Miopatía) - honduras/biologia-
membranas celulares, Problemas de visión medica/vitaminas-cuadro-
permitiendo una (Retinopatía) - Sistema comparativo-sobre-la-
regeneración de los inmunitario debilitado funcion-problemas-con-la-
tejidos. carencia-y-fuentes-
de/5568099
Vitamina K Es esencial para la Puede provocar hematomas https://www.studocu.com/la
Filoquinona formación de protrombina y problemas de sangrado, tam/document/universidad-
y para la síntesis hepática también podría reducir la nacional-autonoma-de-
de los factores que fuerza de los huesos y honduras/biologia-
intervienen en el proceso aumentar el riesgo de medica/vitaminas-cuadro-
de coagulación de la osteoporosis y si se tiene comparativo-sobre-la-
sangre. niveles bajos de vitamina K funcion-problemas-con-la-
en la sangre aumentan el carencia-y-fuentes-
riesgo de enfermedad de/5568099
cardíaca.

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