Scribd Logo
Cargar

¡Te damos la bienvenida a Scribd!

  • 3 vistas

    Primera TareaBioinformática 2021 2022

    Cargado por

    Maikel
    Bioinformatica

    Copyright:

    © All Rights Reserved
    Descargue como DOCX, PDF, TXT o lea en línea desde Scribd

    Primera TareaBioinformática 2021 2022

    Cargado por

    Maikel
    3 vistas1 página
    Bioinformatica

    Título original

    Primera_TareaBioinformática_2021_2022

    Derechos de autor

    © © All Rights Reserved

    Formatos disponibles

    DOCX, PDF, TXT o lea en línea desde Scribd

    ¿Le pareció útil este documento?

    ¿Este contenido es inapropiado?

    Bioinformatica

    Copyright:

    © All Rights Reserved
    Descargue como DOCX, PDF, TXT o lea en línea desde Scribd
    Descargar como docx, pdf o txt
    3 vistas1 página

    Primera TareaBioinformática 2021 2022

    Cargado por

    Maikel
    Bioinformatica

    Copyright:

    © All Rights Reserved
    Descargue como DOCX, PDF, TXT o lea en línea desde Scribd
    Descargar como docx, pdf o txt
    Está en la página 1de 1

    El alumno/a debe realizar un informe con la informació n que pueda obtener con

    las distintas herramientas bioinformá ticas que se han visto durante el curso a
    partir de la secuencia asignada (60 nucleó tidos). En particular, el informe
    contendrá como mínimo la siguiente informació n, en caso de que esté disponible
    en la web:

    1. Nombre del gen al cual dicha secuencia pertenece.


    2. Alineamiento, utilizando BLAST, de las secuencias de las posibles distintas
    variantes de transcripció n con la regió n genó mica del gen.
    3. Secuencias homó logas en otras especies (recomendamos 5 especies
    diferentes, siempre y cuando estén disponibles), tanto de nucleó tidos como
    de proteínas.
    4. Alineamiento de las secuencias de proteínas anteriores, utilizando MEGA.
    5. Estimació n del á rbol filogenético por má xima verosimilitud de las especies
    escogidas utilizando las secuencias anteriores.
    6. Test bootstrap del á rbol anterior (200 réplicas).
    7. Bú squeda de dos marcadores cercanos al gen (principalmente SNPs), con
    informació n sobre sus frecuencias en las distintas poblaciones humanas.
    8. Rutas metabó licas (pathways) en los que el gen está incluido, usando las
    webs de KEGG y ensembl.
    9. Términos GO (Gene Ontology) asociados.

    Explicad los pasos hechos y, a ser posible, comentad un poco los resultados. (la
    presentació n también cuenta!!)

    Cada apartado vale 1 punto. La presentació n será valorada entre 0 y 1 punto.

    El aligo asignado a cada uno de vosotros se encuentra en el archivo Excel que he


    subido a la actividad en el Campus Virtual.

    También podría gustarte