TEMA 7. Biologia Molecular
TEMA 7. Biologia Molecular
TEMA 7. Biologia Molecular
GENÉTICA MOLECULAR
Lo que hoy día conocemos como GENES, inicialmente eran conocidos como FACTORES
HEREDITARIOS, término acuñado por Mendel. Si bien Mendel a finales del Siglo XIX crea el
término FACTORES HEREDITARIOS para explicar los mecanismo de la herencia y pocos años
después se descubre la existencia del ADN, no es hasta el inicio del siglo XX que se relacionan
los FACTORES HEREDITARIOS con los cromosomas. Sin embargo, dada la composición
nucleoproteica de estas estructuras, los ácidos nucleicos y las proteínas eran las sustancias
candidatas a albergar los genes. Las proteínas son moléculas complejas y su actividad biológica
ya estaba probada por aquellos años. Los ácidos nucleicos, por el contrario, se consideraban
como moléculas simples y no se concebía que pudieran almacenar tal cantidad de
información.
No fue hasta la década de los 40 que los experimentos realizados por Avery, McLeod y
McCarthy que pusieron el foco en el ADN, gracias a procesos de purificación molecular. Esto se
confirmó en 1952, gracias a Hersey y Chase cuando demostraron que el ADN es el portador
de la información genética. En 1953 Watson y Crick propusieron el modelo de estructura de
doble hélice del ADN y Crick además formulo lo que se llama el "DOGMA CENTRAL DE LA
BIOLOGÍA MOLECULAR ", que establece el flujo de la información genética en los seres vivos.
Mendel (1866) → crea el termino FACTORES HEREDITARIOS para explicar los mecanismos de
la herencia.
Avery, Mc Leod y Mc. Carthy (1944) → trabajaron en base a los experimentos de Griffith con
Streptococcus pneumonie, donde infectaba a ratones con dos cepas, una letal y otra no letal.
Estos científicos fueron inoculando
distintas partes de las S a las cepas R.
Cuando se inoculaba la cápsula (lípidos
y glúcidos) no se provocaba la muerte
de los ratones, pero cuando se
inoculaba el ADN de las S junto con
cepas R vivas los ratones morían y en su
sangre encontraban cepas S.
Demostraron que solo los extractos de bacterias s muertas que contenían el ADN eran
capaces de producir dicha transformación. Dedujeron entonces que el ADN es la molécula
portadora de la información biológica y no las proteínas.
Chargaff (1949) → Chargaff y sus colaboradores tras analizar unas muestras de ADN
procedentes de diferentes tipos de células y de numerosas especies animales llegaron a las
siguientes conclusiones:
1. Las muestras de ADN aisladas de distintos tejidos de una misma especie, tienen el mismo
porcentaje de A, T, G y C.
2. La composición de bases del ADN varía de una especie a otra ( la de especies
emparentadas es muy parecida )
3. En todos los ADNs, independientemente de la especie, la cantidad de A es igual a la de T y
la de G = C , de lo que se deduce que la cantidad de bases púricas = bases pirimidínicas.
Crick (1970) → estableció el DOGMA CENTRAL de la BIOLOGÍA que nos habla sobre el flujo de
la información en los seres vivos.
1.2.- Concepto y estructura del gen
Los genes son segmentos del ADN capaces de dirigir la síntesis de ARN, ya sea como producto
final, ya sea para obtener proteínas. En la genética mendeliana se usa el termino GEN para
referirse a la secuencia de ADN responsable de un determinado carácter. Denominamos
LOCUS (plural LOCI) al que ocupa un gen en el cromosoma.
La estructura en doble hélice del ADN permite que pueda originar copias de sí mismo, en un
proceso conocido como REPLICACIÓN. La duplicación del ADN se produce al final de la
interfase, antes de comenzar la profase.
Para que sea posible la replicación, la célula necesita: ácido fosfórico, desoxirribosa y las 4
bases nitrogenadas, compuestos que obtiene del metabolismo de los ADNs de las células de
los alimentos tomados. Dentro de la célula se forman los desoxirribonucleótidos para lo que
se necesitan energía y las enzimas adecuadas.
El proceso de replicación se produce de forma SEMICONSERVATIVA, de modo que la molécula
de ADN se separa para duplicarse de manera que cada hebra dirigirá la síntesis de su nueva
complementaria, originándose dos moléculas idénticas con una hebra paterna y otra nueva.
Esta hipótesis fue postulada por Watson y Crick y demostrada experimentalmente por
Meselson y Stahl en 1958. Meselson y Stahl cultivaron bacterias E. Coli ( Escherichia coli ) en
un medio con N pesado (N15 ) en lugar de N14 . Después las pasaron a un medio con N14
durante media hora (tiempo necesario para que se duplique el ADN bacteriano), extrajeron
éste y lo centrifugaron. Luego, mediante rayos UV, observaron que este DNA ocupaba en el
tubo de centrifugación una posición intermedia entre el ADN con N15 y el ADN con N14. Se
trataba pues de un híbrido, lo que permitió descartar las otras dos hipótesis que se postulaban
(Descartada la hipótesis conservativa y la teoría dispersiva)
Si se dejan bacterias en N14 durante 2 divisiones, aparecen dos ADNs , uno híbrido y otro ligero.
Si se dejan durante tres, el ADN híbrido es, en proporción, cada vez menos importante. Esto
descarta la hipótesis dispersiva.
Completaron el experimento con otro ensayo. Aislaron el ADN híbrido, lo sometieron a 80ºCy
consiguieron separar las 2 hebras comprobando que una era ligera y otra densa. Quedó así
comprobada la hipótesis semiconservativa.
La replicación del ADN cumple tres propiedades: semiconservativa, bidireccional y multifocal.
En la secuencia de la replicación “secuencia Kornberg” intervienen las siguientes proteínas:
Helicasa: desenrrolla la doble hélice de ADN rompiendo los puentes de H.
ADN polimerasa: encargada de catalizar la formación de los enlaces fosfodiéster en
sentido 5’-3’.
ADN pol I: función exonucleasa, quita nucleótidos de ARN y añade pequeños
fragmentos de ADN.
ADN pol II: lleva a cabo la reparación, corrigiendo daños.
ADN pol III: fundamental en la síntesis de ADN.
Topoisomerasas: desenrrollan la doble hélice
Proteínas SSB: mantienen abierta la doble hélice
Primasas o ARN-pol: forman el ARN cebador (inicio de la replicación)
ADN ligasa: une dos fragmentos de una misma cadena.
Los procariotas se caracterizan por presentar una única zona para el inicio de la duplicación del
ADN, la cual posee secuencias específicas de nucleótidos, esta zona se denomina ORIGEN DE
REPLICACIÓN y ORI C en el caso concreto de E.coli
Elongación. La replicación del ADN corre a cargo de las ADN polimerasas que a partir de una
cadena molde, por complementariedad, son capaces de duplicar una molécula de ADN de
manera semiconservativa. Para ello precisa de dNTPs, iones Mg++ y de un ácido nucleico que
sirva de primer o cebador. En vivo se emplea moléculas de ARN como cebadores, las cuales
son sintetizadas por una ARN pol denominada PRIMASA.
Después de que actúe la PRIMASA, interviene la ADNpol III que partiendo del extremo 3´ OH
del primer, inicia la síntesis empleando en el proceso la propia energía aportada por los dNTPs,
al formarse enlaces fosfodiéster que liberan pirofosfato que dará lugar a dos fosfatos
inorgánicos.
La DNApol III que actúa sintetizando en la misma dirección que la HORQUILLA avanzada dará
lugar a una HEBRA CONTINUA o HEBRA CONDUCTORA.
En el caso de la DNApol III que actúa en la hebra antiparalela a la anterior, la dirección de
síntesis va a ser contraria a la de avance de la horquilla, por lo que el proceso va a ser
ligeramente distinto. La PRIMASA conforme vaya avanzando la horquilla va a ir sintetizando
primers, separados entre sí por unos 1000nt, siendo empleados por la ADNpol III para
sintetizar una sucesión de polímeros denominados FRAGMENTOS DE OKAZIKI.
Finalmente la DNA pol I retirara los prímer o cebadores sustituyéndolos por nucleótidos de
ADN.
Terminación. El proceso continuará así hasta la duplicación total del ADN y dado que la síntesis
es bidireccional, parte de cada hebra va a ser sintetizada como continua y parte como
discontinua
El proceso es similar aunque cabe destacar dos diferencias básicas y varias menores:
Entre los detalles cabe señalar que los fragmentos de OKAZAKI son más pequeños en
eucariotas y que el proceso de replicación se realiza dentro del llamado PERIODO S de la
INTERFASE.
Las cadenas de ADN de los cromosomas son lineales, (no anulares), lo que plantea un
problema añadido. El extremo 5' de la hebra retrasada no estará completo al eliminarse el ARN
cebador. Como las polimerasas no pueden sintetizar en dirección 3' - 5', las sucesivas
replicaciones llevarían consigo un acortamiento del cromosoma por el extremo que es el
telómero.
Existe un enzima llamado telomerasa que actúa como molde para alargar la hebra del extremo
3'. Esta prolongación catalizada por la telomerasa sirve como cebador para la síntesis del
extremo 5' que quedó incompleto.
Hay estudios que revelan la relación entre el acortamiento telomérico, la ausencia de
telomerasa y el envejecimiento celular. Se han demostrado la presencia de actividad
telomerasa en el 80% de los tumores malignos, actividad que no se presenta en los tejidos que
los rodean.
2.3.- Mutaciones
Las mutaciones son alteraciones del material hereditario a nivel génico, cromosómico o
genómico que pueden tener un origen expontáneo o inducido. Las mutaciones espontaneas
ocurren con una frecuencia de 10-7-10-11 mut/pb durante la replicación debido a errores de la
polimerasa (errores de lectura, cambios de fase, tautomerías), transposiciones, lesiones
fortuitas (despurinización, desaminación, dímeros de timina).
Pese a ser normalmente negativas para los individuos, resultando deletéreas (reducen la
eficiencia biológica) o incluso letales; las mutaciones a nivel de especie resultan ventajosas
aumentando la eficiencia biológica del individuo, siendo la mutación la base de la selección
natural y esta el motor de la evolución. Las únicas mutaciones relevantes para esto son las
germinales ya que las somáticas no llegan a pasar a la descendencia.
3.1- Transcripción
Proceso de síntesis de una cadena de ARN a partir de la información contenida en el ADN,
tratándose de un proceso que tiene lugar en el NUCLEO, MITOCONDRIAS y CLOROPLASTOS en
el caso de EUCARIOTAS y en el NUCLEOIDE en el caso de PROCARIOTAS.
Este proceso consta de 3 ETAPAS:
- EUCARIOTAS: salvo una exceccion (ARNr 5S) todos los genes poseen INTRONES y
todos van a ser modificados post-transcripcionalmente.
o En el caso del ARNhn (heterogéneo nuclear) antes de salir al citoplasma como
ARNm sufre una serie de transformaciones denominados en conjunto
MADURACIÓN. En este proceso el ARNhn para transformarse en ARNm sufre 3
modificaciones:
1. La 1ª modificación afecta al extremo 5' del ARN y tiene lugar antes del
final de la transcripción. Se trata de la adición de la caperuza (CAP) que
es un Gppp ( 7 metil guanosina trifosfato ).
2. Adición de la COLA POLI A. El paso 1 y 2 ocurre en la finalización.
3. El último cambio sólo ocurre en las células eucariontes y consiste en la
eliminación de intrones por un sistema de corte-empalme o SPLICING,
antes de que el ARNm salga del citoplasma. Ocurre en la
MADURACIÓN.
o El pre ARNr se corta en ARNr y se eliminan sus intrones.
o El ARNt sufre modificación en sus bases
El 70% del ADN está en intrones, por lo tanto es ADN " no codificante", sin embargo tienen
una función muy importante como reguladores de los genes en los que están incluidos.
Nota: Algunos virus como el virus del sida, se denominan retrovirus ya que llevan la
información en ARN que será transcrito a ADN, es decir, lo contrario a la transcripción o
reversotranscripción.
3.3.- Traducción
Para poder sintetizar proteínas, la información presente en el ADN ha de ser descodificada.
Esto implica pasar de un sistema codificado por 4 elementos a un código formado por 20
elementos. La tabla de correspondencias entre estos dos lenguajes es lo que se conoce como
CÓDIGO GENETICO y se caracteriza por ser UNIVERSAL.
En esencia el mecanismo se basa en que, por medio de un alfabeto de 4 letras, se formen
palabras con 3 de ellas, pudiendo obtenerse 64 posibles palabras (43=64), llamadas CODONES,
de modo que a cada CODÓN le corresponda un aminoácido.
Puesto que solo hay 20 aa va a haber CODONES SINÓNIMOS, diciéndose que el CÓDIGO
GENETICO está DEGENERADO. Algunos de estos (UAA, UAG, UGA) en realidad codifican para
le el final de la traducción y uno de ellos (AUG), además de para un aa (METIONINA en
procariotas y FORMIL-METIONINA en eucariotas) lo hace para el inicio de la traducción
En la traducción, los codones de un ARNm se leen en orden (del extremo 5' al extremo 3')
mediante moléculas llamadas ARNs de transferencia o ARNt. Cada ARNt tiene un anticodón,
un conjunto de tres nucleótidos que se une a un codón de ARNm correspondiente a través del
apareamiento de bases. El otro extremo del ARNt lleva el AMINOÁCIDO que especifica el
codón.
Imagen que muestra un ARNt que actúa como un adaptador que conecta un codón del ARNm con un aminoácido. En un extremo,
el ARNt tiene un anticodón 3'-UAC-5' y se une a un codón en el ARNm que tiene la secuencia 5'-AUG-3' a través de
complementariedad de bases. El otro extremo del ARNt transporta el aminoácido metionina (Met), que es el aminoácido
codificado por el codón AUG del ARNm.
Los ARNt se unen a los ARNm dentro de una estructura de proteína y ARN llamada ribosoma.
A medida que los ARNt entran a los espacios en el ribosoma y se unen a los codones, sus
aminoácidos se unen a la cadena de polipéptidos creciente en una reacción química. El
resultado final es un polipéptido cuya secuencia de aminoácidos refleja la secuencia de
codones en el ARNm.
Los ribosomas proporcionan el espacio en el que el ARNm puede interactuar con los ARNt que llevan los aminoácidos. Hay tres
lugares o SITIOS en el ribosoma donde se unen los ARNt: el sitio A, el P y el E. El SITIO A acepta un ARNt entrante unido a un
aminoácido. El SITIO P contiene el ARNt que lleva el polipéptido creciente (el primer aminoácido que se agrega es la metionina
(Met)). El SITIO E es donde un ARNt se coloca cuando se ha vaciado, es decir, cuando ha transferido su polipéptido a otro ARNt
(que ahora ocupa el sitio P). En el diagrama, el ARNt vacío ya ha salido del sitio E y por eso no se muestra.
Imagen modificada de "Translation: Figure 3", de OpenStax College, Biología (CC BY 4,0).
Iniciación:
Célula eucarionte:
> El ADN se transcribe para hacer ARN dentro del núcleo. El transcrito inicial de ARN se procesa
en un ARNm maduro antes de ser exportado hacia el citosol.
> El ARNm contiene solo una secuencia codificante (que codifica solo un polipéptido).
Célula bacteriana:
> El ADN se transcribe para hacer un ARNm en el citosol. Los ribosomas pueden empezar a
traducir el ARNm incluso antes de que se transcriba totalmente. No se necesita de
procesamiento post-transcripcional.
> El ARNm contiene tres secuencias codificantes de tres genes distintos, cada uno codifica su
propio polipéptido.
Elongación:
Terminación::
Epilogo:
Ahora nuestro polipéptido tiene todos sus aminoácidos, ¿significa esto que está listo para
realizar su función en la célula?
No necesariamente. Con frecuencia, los polipéptidos necesitan ser "editados". Durante la
traducción y después de ella, los aminoácidos pueden ser alterados químicamente o
eliminados. El nuevo polipéptido también se doblará en una estructura tridimensional
distintiva, y puede unirse con otros polipéptidos para formar una proteína con muchas partes.
Muchas proteínas se doblan espontáneamente, pero algunas necesitan ayudantes
(chaperonas) para evitar que se peguen de forma incorrecta durante el complejo proceso de
plegamiento.
Algunas proteínas también necesitan secuencias de aminoácidos especiales que las dirigen a
ciertas partes de la célula. Estas secuencias, que a menudo se encuentran cerca de un extremo
N- o C-terminal, se pueden considerar como el "boleto" de la proteína hacia su destino final.
Para conocer más sobre cómo funciona esto, consulta el artículo sobre señalización de
proteínas.