Trabajo Final Biotecnología (2020)

Trabajo Final
Evaluación de Integración de Saberes

Carrera: Ingeniería en Biotecnología
Curso: Introducción a la Informática
Profesor: Mg. Roberto Ahumada García
Porcentaje del Curso: 40%
Cantidad de estudiantes por trabajo: 1 o 2 estudiantes (No se permitirán más)
Objetivo del Trabajo:
• A modo de verificar la integración de los distintos saberes:

o Utilización de herramientas ofimáticas
o Bases de Datos Bioinformáticas
o Algoritmos y Programación Básica
o Presentación de resultados científicos
Enunciado:
Usted como futuro Ingeniero en Biotecnología participa en un grupo de investigación que

trabaja desarrollando y evaluando tecnologías para secuenciación de ADN. En el grupo,
necesitan analizar resultados de diferentes experimentos y es designado para trabajar con un
informático en el desarrollo de pipelines (flujos de trabajo) que permitan analizar la información
generadas en los experimentos. Usted ayuda desde su experiencia en biología y conocimientos
en herramientas bioinformáticas.
En conjunto al informático, trabajan primero en un programa de transcripción de ADN a ARN y

traducción a proteínas (Figura 1). Luego, comparan sus resultados con programas que existen
en Bases de Datos Bioinformáticas, para esto se ayudan con gráficos.
Figura 1: Dogma de la Biología Molecular1.
1
https://www.blogdebiologia.com/dogma-central-de-la-biologia-molecular.html
En base al enunciado anterior el trabajo del curso es el siguiente:
1.- Descargar una secuencia de ADN desde una base de datos Bioinformática (en formato .fasta).
Los diferentes grupos deben trabajar con distintas secuencias. Considere que debe explicar que
secuencia descargó y a qué articulo científico se relaciona (se sugiere descargar una secuencia
menor a 10.000 bp, para que no tenga problemas en el procesamiento). Ayuda: busque una
secuencia que genere una proteína.
2.- Generar un código en Python que permita caracterizar esta secuencia de ADN, entregando
información como largo, %A, %T, %G, %C. Graficar en Excel o en otro software informático.
3.- Generar un código en Python que permita transcribir una secuencia de ADN a ARN,
guardando el resultado en un nuevo archivo .fasta, ejemplo:
>Sequence ARN …
AUGCUGA ……
4.- Generar un código en Python que permita traducir ARN a aminoácidos, desde el codón de
inicio (AUG) y considerando codones stop. Usted, para esta tarea, debe utilizar la secuencia de
ARN generada en el archivo anterior. También debe generar una archivo .fasta con la secuencia
de aminoácidos en su nomenclatura de una (1) letra.
>Sequence amino …
FYRTTYP……
5.- Generar un código en Python que permita caracterizar esta secuencia de aminoácidos,
entregando información como largo, % en base a alguna clasificación de aminoácidos. Graficar
en Excel o en otro software informático.
6.- Comparar sus resultados con información de Bases de Datos Bioinformáticas. Nota: las
herramientas de alineamiento, dentro de sus resultados muchas veces presentan la secuencia
de ADN y a que aminoácidos correspondería.
7.- Buscar, si su secuencia de aminoácidos corresponde a alguna proteína.
Evaluación: El grupo debe realizar una presentación sobre el trabajo realizado (la ppt al menos
debe tener: Introducción, puntos solicitados en este documento y conclusiones. No olvide
presentar código que crea que necesario) Tiempo: 7 minutos como máximo. Se valorará que
se vean los rostros (en vivo) de los integrantes. Existen preguntas dirigidas a cada integrante
al final de la presentación. Las notas en el grupo no necesariamente serán las mismas. Formato
de entrega: (Presentación en PowerPoint, pueden grabar un vídeo, pero deben responder a
las preguntas de manera obligatoria). Deben entregar sus archivos .fasta, su(s) código(s) en
Python y presentación en Power Point. Deben subir los archivos al lms comprimidos.
Fecha de entrega: miércoles 5 de agosto, hasta las 16:30. En el laboratorio de ese día se
iniciarán las evaluaciones. NO SE RECIBIRÁN TRABAJOS ATRASADOS.LA COPIA TOTAL DE LOS
TRABAJOS SE CALIFICARÁ CON LA NOTA MÍNIMA (1,0). EN EL CASO DE HABER COPIAS
PARCIALES, EL PROFESOR DETERMINARÁ LOS DESCUENTOS, TAMBIÉN PODRÍA LLEGAR A
CALIFICAR CON NOTA MÍNIMA (1,0).

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Porcentaje del Curso: 40%

Cantidad de estudiantes por trabajo: 1 o 2 estudiantes (No se permitirán más)

Objetivo del Trabajo:

• A modo de verificar la integración de los distintos saberes:

Usted como futuro Ingeniero en Biotecnología participa en un grupo de investigación que

En conjunto al informático, trabajan primero en un programa de transcripción de ADN a ARN y

Figura 1: Dogma de la Biología Molecular1.

7.- Buscar, si su secuencia de aminoácidos corresponde a alguna proteína.

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