Bioquimica Jimena
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en la secuencia de aminoácidos
---Proteínas fibrosas
Las proteínas fibrosas contienen por lo general proporciones elevadas de estructuras
secundarias regulares, como hélices a y láminas plegadas B. Como consecuencia de
sus formas de varilla o de lámina, muchas proteínas fibrosas tienen funciones estruc-
rurales en vez de dinámicas.
--Chaperones moleculares
Los chaperones molecu lares se unen de forma transitoria a las
proteínas nacientes y a las proteínas desplegadas (desnatu ralizadas
por condic iones agresivas). Los miembros de la familia hsp70
estabilizan las proteínas nac ie ntes y reactivan algunas proteínas
desnaturalizadas. Muchas proteínas requieren también las proteínas
hsp60 para alcanzar sus conformaciones fin ales. Si una proteína no
puede salvarse, los chaperones molec ul ares ay udan a destruirl a.
---Plegamiento proteínico
(a) En muchas proteínas pequeñas, el
plegamiento es cooperativo y no se forman
(b) En algunas proteínas más
intermediarios.
grandes, el plegamiento requiere la formación
inicial de un glóbulo fundido y luego un
reordenamiento en la conformación nativa.
(e) Las proteínas grandes con varios dominios
siguen un a vía más compleja en la que cada
uno de los dominios se pliega de forma
separada antes de que la molécula llegue a su
conformación nativa
--------En muchas de estas moléculas o en los dominios dentro de una molécula, la forma colapsada
de manera hidrófoba del intermediario se denomina glóbulo fundido . El término
'glóbulo fundido se refiere a un estado globular en parte organizado de un polipéptido
en proceso de plegamiento y que se asemeja al estado nativo de la molécula.
Dentro de un glóbulo fundido las interacciones terciarias entre las cadenas laterales
de los aminoácidos son fluctuantes, es decir, aún no se han estabilizado.
Concentración salina
,,,,,,, . Cuando la concentración de sal aumenta en una solución
acuosa de proteína, algunas de las moléculas de agua que interactúan con
los grupos ionizables de la proteína son atraídas hacia los iones de la sal. A
medida que disminuye el número de moléculas de solvente disponibles para
interactuar con estos grupos, las interacciones proteína-proteína aumentan. Si
la concentración de sal es suficientemente elevada, quedan tan pocas moléculas
de agua disponibles para interactuar con grupos ionizables que las esferas
de solvatación alrededor de los grupos ionizados de la proteína desaparecen.
Las moléculas proteínicas se agregan y luego se precipitan. Este proceso se
denomina precipitación de proteínas por medio de sales. Debido a que dicho procedimiento es
reversible, suele emplearse como un primer paso en la purificación
de proteínas
---- A
continuación se describen las funciones de algunos péptidos en cada
uno de estos procesos:
La presión sanguínea, la fuerza que ejerce la sangre contra las paredes de los
vasos sanguíneos, es influida por varios factores, como el volumen sanguíneo y la
viscosidad. Dos péptidos que afectan al volumen sanguíneo son la vasopresina y
el factor natriurético auricular. La vasopresina, que también se denomina hormona
antidiurética (ADH), contiene nueve residuos de aminoácidos. Se sintetiza en
el hipotálamo, una pequeña estructura del cerebro que regula una gran variedad de
funciones, entre las que se encuentran el equilibrio hídrico, el apetito, la temperatura
corporal y el sueño. En respuesta a una baja presión arterial (hipotensión) o a una
alta concentración sanguínea de Na+ (hipernatriemia), los osmoneceptores del hipotálamo
inducen la secreción de vasopresina. Esta hormona estimula la reabsorción de
agua en los riñones iniciando un mecanismo de transducción de señales que inserta
acuaporinos (conductos de agua) en la membrana de los túbulos renales. Entonces
el agua fluye a favor de su gradiente de concentración por las células de los túbulos
y de regreso a la sangre. La estructura de la vasopresina es notablemente similar a la
de otro péptido producido en el hipotálamo llamado oxitocina, la molécula de señal
que estimula la secreción de leche por las glándulas mamarias durante la lactación.
La oxitocina que se produce en el útero estimula la contracción del músculo uterino
durante el parto. Dado que la ADH y la oxitocina tienen estructuras semejantes, no
es sorprendente que las funciones de las dos moléculas se solapen. La oxitocina tiene
una actividad antidiurética ligera y la vasopresina tiene cierta actividad del tipo de la
oxitocina. El factor natriurético auricular (ANF) es un péptido producido por células
especializadas del corazón, como respuesta al estiramiento, y del sistema nervioso
que estimula la dilución de la orina, un efecto opuesto al de la vasopresina. El ANF
ejerce su efecto, en parte, aumentando la eliminación de Na+, un proceso que incrementa
la eliminación de agua, e inhibiendo la secreción de renina por el riñón. (La
renina es una enzima que cataliza la formación de angiotensina, una hormona que
contrae los vasos sanguíneos).
---Moléculas como los aminoácidos que poseen grupos amino primarios pueden reaccionar de forma reversible con
grupos
Las moléculas de imina producidas por esta reacción a menudo reciben el
carbonilo.
Las basesde Schiff, denominadas aldiminas, que se forman por la reacción reversible de un
grupo amino con un grupo aldehído, son intermediarios (especies formadas durante
una reacción) en las reacciones de transaminación
-----FORMACiÓN DE ENLACES PEPTíDICOS Los polipéptidos son polímeros lineales
formados por aminoácidos unidos por enlaces peptídicos. Los enlaces peptídicos
son enlaces amida que se forman cuando el par de electrones sin
compartir del átomo de nitrógeno amino a de un aminoácido ataca al carbono carboxilo
a de otro en una reacción de sustitución de acilo nuc!eófila. A continuación se
muestra una reacción general de sustitución de acilo:
o o
11 11
R-C-X + Y- -------------- R-C-Y + X-
Dado que esta reacción es una deshidratación (i.e., se elimina una molécula de agua),
los aminoácidos unidos se denominan residuos de aminoácidos. Cuando dos aminoácidos
se unen, el producto se llama dipéptido. Por ejemplo, la glicina y la serina
pueden formar los dipéptidos glicilserina y serilglicina. Al añadirse los aminoácidos
y alargarse la cadena, el prefijo refleja el número de residuos: un tripéptido contiene
tres residuos de aminoácidos, un tetrapéptido cuatro, y así sucesivamente. Por convención,
el residuo de aminoácido con el grupo amino libre se denomina residuo
terminal N y se escribe a la izquierda. El grupo carboxilo libre en el residuo terminal
C aparece a la derecha. Los péptidos se nombran utilizando su secuencia de aminoácidos,
empezando por su residuo terminal N. Por ejemplo,
H2N-Tyr-Ala-Cys-Gly-COOH
----OXIDACiÓN DE LA CISTEíNA
La reacción más común de este grupo es una oxidación reversible que forma un
disulfuro. La oxidación de dos moléculas de cisteína forma cistina, una molécula que
contiene un enlace disulfuro. Cuando dos residuos de cisteína forman uno
de estos enlaces, éste se denomina puente disulfuro. Este enlace puede producirse
en una cadena individual para formar un anillo o entre dos cadenas separadas para
formar un puente intermolecular. Los puentes disulfuro ayudan a estabilizar muchos
polipéptidos y proteínas.
ojojojojojojojojojojojojoj
----A los valores de pH por debajo del pI, el aminoácido está cargado positivamente y
se mueve hacia el cátodo (electrodo negativo). A los valores de pH por encima del
pI, el aminoácido tiene carga negativa y se mueve hacia el ánodo (electrodo positivo).
En el punto isoeléctrico el aminoácido no tiene carga neta y por lo tanto no se
desplaza en el campo isoeléctrico.
----ojoojojojojojojoj
---Dos aminoácidos unidos forman un dipéptido, tres reciben el nombre tripéptido y una
cadena más larga de aminoácidos recibe el nombre de polipéptido. Cuando la cadena
polipeptidica tiene más de 100 aminoácidos se denomina proteína.
---La síntesis de proteína a partir de aminoácidos se lleva a cabo-
al unirse los aminoácidos individuales hasta formar cadenas largas. La unión de un
aminoácido con otro se denomina un enlace peptídico. Para llevarse a cabo este tipo de
enlace el extremo amino de uno de los aminoácidos (el cual pierde un hidrógeno) se
combina con el extremo carboxílico del otro aminoácido (quien pierde un grupo hidroxilo)
creándose un enlace covalente entre ellos y formándose al mismo tiempo una molécula
de agua. El compuesto formado recibe el nombre de péptido.
------Cromoproteínas
Las cromoproteínas poseen como grupo prostético una sustancia coloreada,
por lo que reciben también el nombre de pigmentos. Según la naturaleza del grupo
prostético, pueden ser pigmentos porfirínicos como la hemoglobina encargada de
transportar el oxígeno en la sangre o no porfirínicos como la hemocianina, un
pigmento respiratorio que contiene cobre y aparece en crustáceos y moluscos por
ejemplo. También los citocromos, que transportan electrone
----Propiedades de
Especificidad DE LAS PROTEINAS
La especificidad se refiere a su función; cada una lleva a cabo una determinada
función y lo realiza porque posee una determinada estructura primaria y una
conformación espacial propia; por lo que un cambio en la estructura de la proteína
puede significar una pérdida de la función.
Además, no todas las
individuo posee proteínas específicas suyas que se ponen de manifiesto en los
procesos de rechazo de órganos
grado de parentesco entre individuos, por lo que sirve para la construcción de
filogenéticos
----Clasificación de proteínas
Las proteínas se pueden clasificar atendiendo a diversos criterios: su
composición química, su estructura y sensibilidad, su solubilidad… una clasificación
que engloba dichos criterios es:
---Fibrosas
Las proteínas fibrosas presentan cadenas polipeptídicas largas y una
estructura secundaria atípica. Son insolubles en agua y en disoluciones acuosas.
Algunas proteínas fibrosas son:
Colágenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos
Queratinas: en formaciones epidérmicas: pelos, uñas, plumas,
cuernos.
Elastinas: en tendones y vasos sanguíneos
Fibroínas: en hilos de seda, (arañas, insectos)
7.2. Heteroproteínas o proteínas conjugadas
Las heteroproteínas están formadas por una fracción proteínica y por un grupo
no proteínico, que se denomina grupo prostético. Dependiendo del grupo prosteico
existen varios tipos:
7.2.1. Glucoproteínas
Son moléculas formadas por una fracción glucídica (del 5 al 40%) y una
fracción proteica unidas por enlaces covalentes. Las principales son las mucinas de
secreción como las salivales, Glucoproteinas de la sangre, y Glucoproteinas de las
membranas celulares. Algunas de ellas son:
Ribonucleasa
Mucoproteínas
Anticuerpos
Hormona luteinizante
---Lipoproteínas
Son complejos macromoleculares esféricos formados por un núcleo que
contiene lípidos apolares (colesterol esterificado y triglicéridos) y una capa externa
polar formada por fosfolípidos, colesterol libre y proteínas (apolipoproteínas).
Su función principal es el transporte de triglicéridos, colesterol y otros lípidos
entre los tejidos a través de la sangre.
Las lipoproteínas se clasifican según su densidad:
Lipoproteínas de alta densidad
Lipoproteínas de baja densidad
Lipoproteínas de muy baja densidad
---Nucleoproteínas
Son proteínas estructuralmente asociadas con un ácido nucleico (que puede
ser ARN o ADN). El ejemplo prototípico sería cualquiera de las histonas, que son
identificables en las hebras de cromatina. Otros ejemplos serían la Telomerasa, una
ribonucleoproteína (complejo de ARN/proteína) y la Protamina. Su característica
fundamental es que forman complejos estables con los ácidos nucleicos, a diferencia
de otras proteínas que sólo se unen a éstos de manera transitoria, como las que
intervienen en la regulación, síntesis y degradación del ADN.
---Cromoproteínas
Las cromoproteínas poseen como grupo prostético una sustancia coloreada,
por lo que reciben también el nombre de pigmentos. Según la naturaleza del grupo
prostético, pueden ser pigmentos porfirínicos como la hemoglobina encargada de
transportar el oxígeno en la sangre o no porfirínicos como la hemocianina, un
pigmento respiratorio que contiene cobre y aparece en crustáceos y moluscos por
ejemplo. También los citocromos, que transportan electrones.
---Aminoácidos: Las unidades básicas para la
construcción de las proteínas
La unión de varios de aminoácidos mediante enlaces peptídicos, da lugar a la formación
de cadenas de diferentes tamaños llamadas péptidos. De acuerdo con algunos autores,
si el número de aminoácidos que forma la molécula está en el rango de 2 a 10, se
denominan oligopéptidos, si es superior a 10 se llaman polipéptidos y si el número es
superior a 50 aminoácidos, se designan como proteínas. Las proteínas son polímeros de
aminoácidos, por lo tanto son moléculas de relativamente grandes, pertenecen a la
categoría de macromoléculas. Cientos o miles de aminoácidos forman una proteína.
Aunque, generalmente la mayoría caen en el rango de 80 a 300 aminoácidos por
subunidad proteica.
----El enlace peptídico-----ojo ojojojojojojojojojojojojojo
Los aminoácidos se pueden unir para formar diferentes tipos de péptido (polipéptidos y
proteínas). Los péptidos están formados por la unión de aminoácidos mediante un enlace
covalente que se establece entre el grupo α-carboxilo de un primer aminoácido y el grupo α-
amino del siguiente, dando lugar al desprendimiento de una molécula de agua. Este es el
denominado enlace peptídico. Al unirse dos o más aminoácidos, siempre queda un
extremo
amino terminal y un grupo carboxilo terminal, independientemente de la longitud de la
cadena
Estructura Terciaria: Las cadenas polipeptídicas presentan un plegamiento que origina una
configuración tridimensional compleja. Este plegamiento se debe a las interacciones químicas
que existen entre aminoácidos concretos localizados en diferentes regiones de la cadena
polipeptídica. La estabilización de estas estructuras se debe en su mayoría a enlaces débiles,
como puentes de hidrógeno, que se establecen entre aminoácidos muy separados,
interacciones electrostáticas entre grupos laterales cargados y fuerzas de van der Waals
(atracción débiles entre moléculas y átomos cercanos con propiedades hidrofóbicas). Algunas
otras proteínas son estabilizadas por enlaces covalentes disulfuro de aminoácidos de cisterna.
Estructura Cuaternaria: Está constituida por varias cadenas polipeptídicas unidas entre si de
manera covalente. La hemoglobina y la insulina son ejemplo de este tipo de estructura. En el
caso de la hemoglobina está constituida por cuatro cadenas polipeptídicas diferentes,
mientras que la insulina esta formada por dos.
Entre los ejemplos más destacados se encuentran los puentes di sulfuro de las
inmunoglobulinas Y los enlaces de desmosina y de lisinonorleucina en determinadas
proteínas del tejido conjuntivo
Ojojojojojojo
Para resolver la secuencia de aminoácidos de cualquier proteína se requieren
varios pasos.
1. Rotura de todos los enlaces disulfuro. Se utiliza habitualmente
la oxidación con ácido perfórmico.
2. Determinación de los aminoácidos terminales N y terminales
C. Se dispone de varios métodos para determinar
cuál es el aminoácido terminal N. En el método de
Sanger, la cadena polipeptídica reacciona con l-fluoro-
2,4-dinitrobenceno. El derivado dinitrofenilo (DNP)
del aminoácido terminal N puede entonces aislarse. De
manera alternativa, se emplea cloruro de dabsilo para
determinar los residuos terminales N. La dabsilación es
una técnica muy sensible porque el grupo dabsilo, un
marcador fluorescente, se detecta con facilidad incluso en
pequeñas cantidades. Los derivados terminales N de ambos
reactivos pueden identificarse entonces por análísis
por HPLC. Se emplea un grupo de enzimas denominadas
carboxipeptidasas, para identificar el residuo terminal e .
Debido a que estas enzimas escinden enlaces peptídicos
de forma secuencial comenzando en el residuo terminal
C , éste será el primer aminoácido liberado.
3. Escisión del polipéptido en fragmentos. El polipéptido
se rompe en péptidos más pequeños porque algunos
problemas técnicos impiden la secuenciación directa de
polipéptidos largos. El uso de varios reactivos, cada uno
de los cuales corta la cadena en lugares diferentes, crea
conjuntos de fragmentos solapantes. Tras determinar la
secuencia de aminoácidos de cada fragmento, el investigador
utiliza esta información para determinar la secuencia
completa del polipéptido. De todas las enzimas que se
utilizan de forma habitual, la enzima pancreática tripsina
es la más fiable. Rompe los enlaces peptídicos en el lado
carboxilo de residuos de Iisina o arginina. Los fragmentos
peptídicos, que se denominan péptidos tripticos, poseen
residuos terminal C de lisina o arginina. También suele
utilizarse la quimiotripsina, otra enzima pancreática.
Rompe los enlaces peptídicos en el lado carboxilo de la
fenilalanina, de la tirosina, de la leucina, de la metionina
o del triptófano. El tratamiento del polipéptido con el
reactivo bromuro de cianógeno genera también fragmentos
peptídicos. Este agente rompe específicamente los enlaces
peptídicos en el lado carboxilo de los residuos de
metionina.
4. Determinación de las secuencias de los fragmentos
peptídicos. cada fragmento se secuencia mediante ciclos
repetidos de un procedimiento denominado degradación
de Edman. Én este método, el isotiocianato de
fenilo (PITC), que suele denominarse reactivo de Edman,
reacciona con el residuo terminal N de cada fragmento. El
tratamiento del producto de esta reacción con ácido rompe
el residuo terminal N en forma de derivado de feniltiohidantoína.
Éste se identifica posteriormente comparándolo
con patrones conocidos, al utilizar electroforesis o
diversos métodos cromatográficos. (La HPLC es la que se
utiliza con mayor frecuencia.) Debido al gran número de
pasos de la secuenciación de fragmentos peptídicos, la degradación
de Edman en general se lleva a cabo utilizando
una máquina computarizada denominada secuenciador.
5. Ordenamiento de los fragmentos peptídicos. Se analiza
la información de la secuencia de aminoácidos obtenida
de dos o más conjuntos de fragmentos polipeptídicos
para descubrir los fragmentos solapantes. Estos segmentos
permiten ordenar las piezas de la secuencia global.
A.1 .- Por su forma (según su morfología): Como su nombre sugiere, las proteínas
fibrosas son moléculas largas con forma de varilla que son insolubles en agua y
físicamente correosas. Lasproteínas fibrosas, como las queratinas de la piel, del pelo y de
las uñas, tienen funciones estructurales y protectoras. Las proteínas globulares son
moléculas esféricas
compactas y en general hidrosolubles. De forma característica, las proteínas globulares
tienen funciones dinámicas. Por ejemplo, casi todas las enzimas tienen estructuras
globulares. Otros ejemplos son las inmunoglobulinas y las proteínas de transporte
hemoglobina y albúmina (un transportador de ácidos grasos en la sangre).
----drepanocítico------
----Electroforesis-----
son residuos que se han modificado de forma química después de haberse incorporado a un
polipéptido o los aminoácidos que se encuentran en los seres vivos pero que no se encuentran en
las proteínas.
1. Numerosos aminoácidos Alfa o sus derivados actúan como mensajeros químicos. Por ejemplo,
la glicina, el glutamato, el ácido y-aminobutírico (GABA, un derivado de la glutamina) y la
serotonina y la melatonina (derivados del triptófano) son neurotransmisores, sustancias
liberadas por una célula nerviosa que influyen sobre la función de una segunda célula nerviosa o
sobre una célula muscular. La tiroxina (un derivado de la tirosina que se produce en la glándula
tiroides de los animales) y el ácido indolacético (un derivado del triptófano que se encuentra en
las plantas) son hormonas, moléculas de señalización producidas en una célula que regulan la
función de otras células.
2. Los aminoácidos son precursores de diversas moléculas complejas que contienen nitrógeno.
Entre los ejemplos se encuentran las bases nitrogenadas que componen los nucleótidos y los
ácidos nucleicos, el hem (el grupo orgánico que contiene el hierro necesario para la actividad
biológica de varias proteínas importantes) y la clorofila (un pigmento de importancia crucial en
la fotosíntesis).
3. Numerosos aminoácidos estándar y no estándar actúan como intermediarios metabólicos. Por
ejemplo, la arginina, la citrulina y la ornitina, son componentes del ciclo de la urea. La síntesis de
urea, una molécula que se forma en el hígado de los vertebrados, es el principal mecanismo para
eliminar los desechos nitrogenados.
son residuos que se han modificado de forma química después de haberse incorporado a un
polipéptido o los aminoácidos que se encuentran en los seres vivos pero que no se encuentran en
las proteínas.
Hemoglobina
Desoxirribonucleasa
Calmodulina
Insulina
Catalasa
Citocromo c
Quimiotripsina
Deshidrogenasa alcohólica
Lisozima
Mioglobina
Porina
Colágeno
Aspartato transcarbamilasa
El término anfótero:
Las moléculas neutras que llevan de forma simultánea un número igual de cargas positivas y de
cargas negativas se denominan zwitteriones.
Ojo, OJO,
Los aminoácidos no estándar ?
Los Aminoaxidos,
propiedades estructurales y funcionales siempre ha sido una prioridad de los bioquímicos. Las
proteínas pueden distinguirse con base en su número de
aminoácidos (a veces llamados residuos de aminoácidos), en su
composición global de grupos aminoacilo, y en la secuencia de
éstos. Los polímeros de aminoácidos se diferencian según sus pesos moleculares o con el
número de residuos que contienen. Las moléculas con pesos moleculares que
van desde varios miles hasta varios millones de daltones (D) se
denominan polipéptidos. Aquellas con pesos moleculares bajos,
que constan de menos de 50 aminoácidos, se denominan péptidos.
El término proteína describe específicamente las moléculas con un contenido de más de 50
aminoácidos. Cada proteína consta de una o de varias cadenas polipeptídicas. En este libro se
utilizarán los términos péptido y proteína justo como se definió con antelioridad. Sin embargo, en
la literatura la distinción entre proteínas y péptidos a menudo es imprecisa. Por ejemplo,
AMINOÁCIDOS
CAPíTULO CINCO
AMINOÁCIDOS NO POLARES
Dado que los aminoácidos polares poseen grupos funcionales capaces de formar enlaces de
hidrógeno, interactúan de forma sencilla con el agua (los aminoácidos polares se describen como
"hidrófilos" o "afines al agua"). Pertenecen a esta categoría, la serina, la treonina, la tirosina, la
asparagina y la glutamina. La serina, la treonina y la tirosina contienen un grupo hidroxilo polar,
que les permite participar en la formación de enlaces de hidrógeno, un factor importante en la
estructura proteínica. Los grupos hidroxilo tienen otras funciones en las proteínas. Por ejemplo, la
formación del éster fosfato de la tirosina es un mecanismo de regulación habitual. Además, los
grupos -OH de la serina y de la t:reonina son sitios a los que se unen los hidratos de carbono. La
asparagina y la glutamina son derivados amida de los aminoácidos ácidos: del ácido aspártico y del
ácido glutámico, respectivamente. Dado que el grupo funcional amida es muy polar, la capacidad
de formar enlaces de hidrógeno de la asparagina y de la glutamina posee un efecto significativo en
la estabilidad proteínica. AMINOÁCIDOS ÁCIDOS Dos aminoácidos estándar poseen cadenas
laterales con grupos carboxilato. Las cadenas laterales del ácido aspártico y del ácido glutá- mico
tienen carga negativa a pH fisiológico, por lo que suele llamárseles aspartato y glutamato.
AMINOACIDOS BASICOS:
Los aminoácidos que son básicos a PH fisiológico, llevan carga positiva. Por lo tanto, pueden
formar enlaces iónicos con los aminoácidos ácidos. La lisina, que tiene un grupo ami no en la
cadena lateral, acepta un protón del agua para formar el ácido conjugado (-NH!). Cuando se
oxidan y después se condensan las cadenas laterales de las moléculas de lisina en las fibras de
colágeno, un vital componente estructural de los ligamentos y de los tendones, se forman fuertes
enlaces cruzados intramoleculares e intermoleculares. Debido a que el grupo guanido de la
arginina tiene un intervalo de pKa de 11.5 a 12.5 en las proteínas, siempre está protonado a pH
fisiológico y, en consecuencia, no actúa en las reacciones ácido-base. Por otro lado, la histidina es
una base débil, puesto que sólo está ionizada parcialmente a pH 7. Por consiguiente, los residuos
de histidina actúan como amortiguadores. Asimismo, desempeñan un papel importante en la
actividad catalítica de numerosas enzimas.
AMINOÁCIDOS ÁCIDOS:
Dos aminoácidos estándar poseen cadenas laterales con grupos carboxilato. Las cadenas laterales
del ácido aspártico y del ácido glutámico tienen carga negativa a pH fisiológico, por lo que suele
llamárseles aspartato y glutamato.
Además de su función principal como componentes de las proteínas, los aminoácidos poseen
muchas otras funciones biológicas.
1. Numerosos aminoácidos o sus derivados actúan como mensajeros químicos. Por ejemplo, la
glicina, el glutamato, el ácido y-aminobutírico (GABA, un derivado de la glutamina) y la serotonina
y la melatonina (derivados del triptófano) son neurotransmisores, sustancias liberadas por una
célula nerviosa que influyen sobre la función de una segunda célula nerviosa o sobre una célula
muscular. La tiroxina (un derivado de la tirosina que se produce en la glándula tiroides de los
animales) y el ácido indolacético (un derivado del triptófano que se encuentra en las plantas) son
hormonas, moléculas de señalización producidas en una célula que regulan la función de: otras
células.
2. Los aminoácidos son precursores de diversas moléculas complejas que contienen nitrógeno.
Entre los ejemplos se encuentran las bases nitrogenadas que componen los nucleótidos y los
ácidos nucleicos, el hem (el grupo orgánico que contiene el hierro necesario para la actividad
biológica de varias proteínas importantes) y la clorofila (un pigmento de importancia crucial en la
fotosíntesis).
A los 19 carbonos Alfa de los 20 aminoácidos estándar que están unidos a cuatro grupos
diferentes (a un hidrógeno, a un grupo carboxilo, a un grupo amino y a un grupo R),
Estereoisómeros,
Son las moléculas con carbonos quirales que sólo se diferencian en la disposición espacial de
sus átomos..
Debido a que los carbonos Alfa, 19 de los 20 aminoácidos estándar están unidos a cuatro grupos
los enantiómeros
Son moléculas idénticas, que no pueden superponerse una sobre otra, y tiene propiedades
físicas idénticas, excepto que desvían la luz polarizada en un plano en direcciones opuestas. Se
denominan pues, las imágenes especulares de sí mismas de una molécula ( imágenes
especulares significa imágenes en el espejo )
isómeros ópticos.
Debido a que los carbonos Alfa, 19 de los 20 aminoácidos estándar están unidos a cuatro grupos
es una herramienta útil para determinar la reactividad de las cadenas laterales de los aminoácidos.
Debido a que los aminoácidos contienen grupos ionizables, la forma iónica predominante de estas
moléculas en solución depende del pH. La titulación de un aminoácido ilustra el efecto del pH
sobre su estructura. La titulación también es una herramienta útil para determinar la reactividad
de las cadenas laterales de los aminoácidos. Considérese la alanina, un aminoácido sencillo que
tiene dos grupos titulables. Durante la titulación con una base fuerte como el NaOH, la alanina
pierde dos protones de forma escalonada. En una solución muy ácida (p. ej., a pH O), casi todas las
moléculas de alanina se encuentran en la forma en la que el grupo carboxilo no está cargado. En
estas circunstancias la carga neta de la molécula es + 1, debido a que el grupo amonio está
protonado. Si se reduce la concentración de H+, el grupo carboxilo pierde su protón y se
transforma en un grupo carboxilato con carga negativa. (En un ácido poliprótico, los primeros
protones que se pierden son los del grupo con el pKa menor.) Una vez que el grupo carboxilo ha
perdido su protón, la alanina no tiene carga neta y es eléctricamente neutra!. El pH al que se
produce esto se denomina punto isoeléctrico (pI). El punto isoeléctrico de la alanina puede
calcularse de la siguiente manera:
pK1 + PK2
PI = --------------------
Los valores de pKI y de pK2 de la alanina son, respectivamente, 2.34 y 9.7 (véase el Cuadro 5.2). El
valor de pI de la alanina es por lo tanto
2.34 + 9.67
PI = -------------------- = 6.02
Al continuar la titulación, el grupo amonio pierde su protón, dejando el grupo amino sin carga.
Entonces la molécula tiene una carga neta negativa debida al grupo carboxilato. Los aminoácidos
con cadenas laterales ionizables tienen curvas de titulación más complejas. Por ejemplo, el ácido
glutámico tiene un grupo carboxilo en la cadena lateral. A pH bajo, el ácido glutámico tiene una
carga neta de + l. Al añadir la base, el grupo carboxilo a pierde un protón para transformarse en un
grupo carboxilato. El glutamato ahora no tiene carga neta.
Conforme se añade más base, el segundo grupo carboxilo pierde un protón y la molécula tiene una
carga de -l. La adición de más base hace que el ion amonio pierda su protón. En este punto, el
glutamato tiene una carga neta de -2. El valor de pI del glutamato es el del pH que se encuentra
entre los valores de pK" de los dos grupos carboxilo ( los valores a ambos lados de los
zwitteriones):
2.19 + 4.25
PI = -------------------- = 3.22
El punto isoeléctrico de la histidina es el valor de pH que se encuentra entre los valores de pKa de
los dos grupos que contienen nitrógeno. El siguiente es un ejemplo de un problema de titulación.
Cuando los aminoácidos se incorporan en polipéptidos, los grupos amino ex y carboxilo ex pierden
sus cargas. En consecuencia, excepto los residuos terminal N y terminal C (los aminoácidos que se
encuentran al principio y al final, respectivamente, de una cadena polipeptídica), todos los grupos
ionizables de las proteínas son los grupos de las cadenas laterales de siete aminoácidos: histidina,
lisina, arginina, aspartato, glutamato, cisteína y tirosina. Es importante resaltar que los valores de
pKa de estos grupos difieren de los correspondientes a aminoácidos libres. Los valores de pKa de
grupos R individuales son afectados por sus posiciones dentro de los microambientes proteínicos.
Por ejemplo, cuando los grupos R de dos residuos aspartato están en estrecha cercanía, el pKa de
uno de los grupos carboxilato se eleva. La importancia de este fenómeno se hará evidente cuando
se expongan los mecanismos catalíticos de las enzimas (sección 6.4). Reacciones de los
aminoácidos
polímeros lineales formados por aminoácidos unidos por enlaces peptídicos. Los enlaces
peptídicos son enlaces amida que se forman cuando el par de electrones sin compartir del
átomo de nitrógeno amino a de un aminoácido ataca al carbono carboxilo Alfa de otro en una
reacción de sustitución de acilo nuc!eófila. A continuación se presenta un ejemplo de una
reacción general de sustitución de acilo:
Dado que esta reacción es una deshidratación ( se elimina una molécula de agua), los aminoácidos
unidos se denominan residuos de aminoácidos. Cuando dos aminoácidos se unen, el producto se
llama dipéptido. Por ejemplo, la glicina y la serina pueden formar los dipéptidos glicilserina y
serilglicina. Al añadirse los aminoácidos y alargarse la cadena, el prefijo refleja el número de
residuos: un tripéptido contiene tres residuos de aminoácidos, un tetrapéptido cuatro, y así
sucesivamente. Por convención, el residuo de aminoácido con el grupo amino libre se denomina
residuo terminal N y se escribe a la izquierda. El grupo carboxilo libre en el residuo terminal e
aparece a la derecha. Los péptidos se nombran utilizando su secuencia de amino- ácidos,
empezando por su residuo terminal N. Por ejemplo, es un tetrapéptido denominado
tirosilalanilcisteinilglicina. Los polipéptidos grandes tienen estructuras tridimensionales bien
definidas. Esta estructura, que se denomina conformación nativa de la molécula, es una
consecuencia directa de su secuencia de aminoácidos (el orden en el que éstos están unidos).
Dado que todos los enlaces que conectan a los residuos de aminoácidos constan de enlaces
sencillos, puede esperarse que cada polipéptido experimente cambios de conformación
constantes producidos por la rotación alrededor de los enlaces sencillos. Sin embargo, la mayoría
de los polipéptidos se pliega de manera espontánea en una forma única biológicamente activa. A
principios de la década de 1950, Linus Pauling (1901-1994, premio Nobel de química en 1954) y
sus colegas propusieron una explicación. Con estudios de difracción de rayos X, determinaron que
el enlace peptídico es rígido y plano. Una vez que descubrió que los enlaces C-N que se unen cada
dos aminoácidos son más cortos que otros tipos de enlaces C-N, Pauling dedujo que los enlaces
peptídicos tienen un carácter parcial de doble enlace. (Esto indica que los enlaces peptídicos son
híbridos de resonancia.) La rigidez del enlace peptídico tiene múltiples consecuencias. Dado que
por lo menos un tercio de los enlaces del esqueleto polipeptídico no puede girar con libertad,
existen límites en el número de posibilidades conformacionales.
OXIDACIÓN DE LA CISTEÍNA
El grupo sulfhidrilo de la cisteína es muy reactivo. La reacción más común de este grupo es una
oxidación reversible que forma un disulfuro. La oxidación de dos moléculas de cisteína forma
cistina, una molécula que contiene un enlace disulfuro. Cuando dos residuos de cisteína forman
uno de estos enlaces, éste se denomina puente disulfuro. Este enlace puede producirse en una
cadena individual para formar un anillo o entre dos cadenas separadas para formar un puente
intermolecular. Los puentes disulfuro ayudan a estabilizar muchos polipéptidos y proteínas.
Las Moléculas como los aminoácidos que poseen grupos amino primario pueden reaccionar de
forma reversible con grupos carbonilo. Las moléculas de imina producidas por esta reacción a
menudo reciben el nombre de bases de Schiff. En una reacción de adición nucleófila, un nitrógeno
de un grupo amino ataca al carbono electrófilo de un grupo carbonilo para formar un producto
alcóxido. La transferencia de un protón del grupo amino al oxígeno para formar una molécula de
carbinolamina, seguida de la transferencia de otro protón de un catalizador ácido, convierte al
oxígeno en un buen grupo saliente (OH2 +). La eliminación subsiguiente de una molécula de agua,
seguida de la pérdida de un protón del nitrógeno produce imina. Los ejemplos más importantes de
formación de bases de Schiff en bioquímica se presentan en el metabolismo de los aminoácidos.
Aunque sus estructuras son menos complejas que las de las moléculas proteínicas más grandes,
los péptidos poseen actividades biológicas significativas. Se consideran ahora la estructura y la
función de varios ejemplos interesantes. El tripéptido glutatión (y-glutamil-L-cisteinilglicina)
contiene un enlace amida y poco habitual. (El enlace peptídico contribuye al grupo carboxilo y al
residuo de ácido glutámico y no el grupo carboxilo Alfa.) El glutatión se encuentra en casi todos los
organismos y participa en la síntesis de proteínas y de DNA, en el metabolismo de fármacos y de
toxinas ambientales, en el transporte de aminoácidos y en otros procesos biológicos importantes.
Un grupo de las funciones del glutatión explota su efectividad como agente reductor. El glutatión
protege a las células de los efectos destructores de la oxidación al reaccionar con sustancias como
los peróxidos, R-O-O-R, productos derivados del metabolismo del O2 Por ejemplo, en los
eritrocitos, el peróxido de hidrógeno (H2O2) oxida el hiena de la hemoglobina a su forma férrica
(Fe+). La metahemoglobina, el producto de esta reacción, es incapaz de unirse al O2. El glutatión
evita la formación de metahemoglobina al reducir el H2O2 en una reacción catalizada por la
enzima peroxidasa de glutatión. En el producto-o¡idado GSSG, se unen dos tripéptidos por medio
de un enlace disulfuro:
Debido a la elevada proporción GSH: GSSG que se presenta de forma habitual en las células, el
glutatión es un antioxidante intracelular importante. Se utiliza la abreviatura GSH porque el
componente reductor de la molécula es el grupo -SH del residuo de cisteína. Los péptidos son una
clase de moléculas señalizadoras que utilizan los organismos multicelulares para regular sus
complejas actividades. La interrelación dinámica entre los procesos opuestos, denominada
homeostasis, mantiene un ambiente interno estable. En la actualidad se conocen moléculas
peptídicas con funciones antagónicas que afectan la regulación de numerosos procesos (p. ej. la
regulación de la presión sanguínea). A continuación se describen las funciones de algunos péptidos
en cada uno de estos procesos. La presión sanguínea, la fuerza que ejerce la sangre contra las
paredes de los vasos sanguíneos, es influida por varios factores, como el volumen sanguíneo y la
viscosidad. Dos péptidos que afectan al volumen sanguíneo son la vasopresina y el factor
natriurético auricular. La vasopresina, que también se denomina hormona antidiurética (ADH),
contiene nueve residuos de aminoácidos. Se sintetiza en el hipotálamo, una pequeña estructura
del cerebro que regula una gran variedad de funciones, entre las que se encuentran el equilibrio
hídrico, el apetito, la temperatura corporal y el sueño. En respuesta a una baja presión arterial
(hipotensión) o a una alta concentración sanguínea de Na+ (hipernatriemia), los osmoneceptores
del hipotálamo inducen la secreción de vasopresina. Esta hormona estimula la reabsorción de
agua en los riñones iniciando un mecanismo de transducción de señales que inserta acuaporinos
(conductos de agua) en la membrana de los túbulos renales. Entonces el agua fluye a favor de su
gradiente de concentración por las células de los túbulos y de regreso a la sangre. La estructura de
la vasopresina es notablemente similar a la de otro péptido producido en el hipotálamo llamado
oxitocina, la molécula de señal que estimula la secreción de leche por las glándulas mamarias
durante la lactación. La oxitocina que se produce en el útero estimula la contracción del músculo
uterino durante el parto. Dado que la ADH y la oxitocina tienen estructuras semejantes, no es
sorprendente que las funciones de las dos moléculas se solapen. La oxitocina tiene una actividad
antidiurética ligera y la vasopresina tiene cierta actividad del tipo de la oxitocina. El factor
natriurético auricular (ANF) es un péptido producido por células especializadas del corazón, como
respuesta al estiramiento, y del sistema nervioso que estimula la dilución de la orina, un efecto
opuesto al de la vasopresina. El ANF ejerce su efecto, en parte, aumentando la eliminación de Na+,
un proceso que incrementa la eliminación de agua, e inhibiendo la secreción de renina por el
riñón. (La renina es una enzima que cataliza la formación de angiotensina, una hormona que
contrae los vasos sanguíneos.)
OJO OJO OJO OJO REALICE UN CUADRO OJO OJO OJO OJO
De todas las moléculas que se encuentran en los seres vivos, las proteínas son las que tienen las
3. Movimiento. Las proteínas participan en todos los movimientos celulares. Por ejemplo, la
actina, la tubulina y otras proteínas forman el citoesqueleto. Las proteínas de esta estructura son
activas en la división celular, en la endocitosis, en la exocitosis y en el desplazamiento ameboide
de los leucocitos.
4. Defensa. Una extensa variedad de proteínas son protectoras. En los vertebrados, por
ejemplo, la queratina, una proteína que se encuentra en las células de la piel, ayuda a proteger al
organismo contra los daños mecánicos y químicos. Las proteínas implicadas en la coagulación
hemática, el fibrinógeno y la trombina, impiden la pérdida de sangre cuando los vasos sanguíneos
se lesionan. Los linfocitos producen las inmunoglobulinas (o anticuerpos) cuando organismos
ajenos, como las bacterias, invaden a un organismo. La unión de los anticuerpos a un organismo
invasor es el primer paso para su destrucción. Muchos organismos se protegen produciendo
proteínas tóxicas que matan o disuaden a depredadores o competidores, Algunos ejemplos son la
neurotoxina bungarotoxina a, producida por algunas serpientes venenosas, y la ricina, un
inhibidor de la síntesis de proteínas presente en las semillas del ricino.
En años recientes, ciertas investigaciones han revelado que numerosas proteínas tienen múltiples
funciones, en ocasiones no relacionadas entre sí. Alguna vez consideradas un fenómeno raro, las
proteínas multifuncionales constituyen una clase diversa de moléculas. Son ejemplos notables la
deshidrogenasa de gliceraldehído-3- fosfato (GAPD) y las cristalinas. Como el nombre sugiere, la
GAPD. Es una enzima que cataliza la oxidación del gliceraldehído-3-fosfato, un intermediario en el
catabolismo de la glucosa. Ahora se sabe que la proteína GAPD interviene en procesos tan diversos
como la duplicación y la reparación del DNA, la endocitosis y los eventos de la fusión de
membranas. Las cristalinas son los principales componentes proteínicos hidrosolubles de las
células transparentes de los cristalinos de los ojos de los vertebrados. Para ejercer su función
estructural, las cristalinas deben ser solubles en el citoplasma cristalino líquido, ser
excepcionalmente estables y, lo que es más importante, deben impedir la dispersión de la luz
visible, lo cual logran a menudo al unirse a pequeñas cantidades de cromó foros, sustancias que
absorben la energía lumínica. Al parecer las cristalinas fueron "reclutadas" genéticamente entre
una variedad de enzimas metabólicas y chaperones moleculares. Han conservado algunas de sus
funciones originales, aunque a menudo con cierta pérdida de actividad o de especificidad, o de
ambas. Por ejemplo, las cristalinas ex son proteínas de choque térmico que protegen a las células
contra el estrés fisiológico. Otra cristalina (la cristalina E), hallada en el cristalino de los patos, es
una deshidrogenasa de lactato. (La cristalina 1), presente en musarañas de trompa estriada
(Rhynchocyon cirnei), es también una deshidrogenasa de retinal, enzima crítica en el metabolismo
del retinol (vitamina A). Además de sus clasificaciones funcionales, las proteínas se categorizan con
base en semejanzas en las secuencias de aminoácidos y en su forma tridimensional global. Las
familias de proteínas están formadas por moléculas relacionadas por su similitud en la secuencia
de aminoácidos. Tales proteínas comparten un ancestro común evidente. Dos familias de
proteínas clásicas son la de las hemoglobinas (proteínas de transporte de oxígeno en la sangre) y la
de las inmunoglobulinas, anticuerpos producidos por el sistema inmunitario en respuesta a
antígenos (sustancias extrañas). Algunas veces las proteínas con relación más distante se
clasifican en superfamilias. Por ejemplo, la superfamilia de las globinas incluye diversas proteínas
que contienen al grupo hem, las cuales participan en la unión o en el transporte de oxígeno (o en
ambos eventos). Además de las hemoglobinas y las mioglobinas (proteínas de unión a oxígeno
presentes en células musculares), la supeIfamilia de las globinas incluye a la neuroglobina y a la
citoglobina (proteínas de unión al oxígeno presentes en el encéfalo y en otros tejidos,
respectivamente) y las leghemoglobinas (proteínas secuestradoras de oxígeno presentes en los
nódulos radiculares de las leguminosas). Dada su diversidad, las proteínas suelen clasificarse de
otras dos maneras: por su forma y por su composición. Las proteínas se clasifican en dos grupos
principales según su morfología. Como su nombre sugiere, las proteínas fibrosas son moléculas
largas con forma de varilla que son insolubles en agua y físicamente correosas. Las proteínas
fibrosas, como las queratinas de la piel, del pelo y de las uñas, tienen funciones estructurales y
protectoras. Las proteínas globulares son moléculas esféricas compactas y en general
hidrosolubles. De forma característica, las proteínas globulares tienen funciones dinámicas. Por
ejemplo, casi todas las enzimas tienen estructuras globulares. Otros ejemplos son las
inmunoglobulinas y las proteínas de transporte hemoglobina y albúmina (un transportador de
ácidos grasos en la sangre). Según su composición, las proteínas se clasifican en simples o
conjugadas. Las proteínas simples, como la albúmina sérica y la queratina, contienen sólo
aminoácidos. Por el contrario, cada proteína conjugada consta de una proteína simple combinada
con un componente no proteico, que se denomina grupo protésico. (Una proteína sin su grupo
protésico se denomina apoproteína. Una molécula proteínica combinada con su grupo protésico
se denomina holoproteína.) Los grupos protésicos desempeñan una tarea importante, a veces
crucial, en el funcionamiento de las proteínas. Las proteínas conjugadas se clasifican según la
naturaleza de su grupo protésico. Por ejemplo, las glucoproteínas contienen carbohidratos, las
lipoproteínas contienen moléculas de lípidos y las metaloproteínas portan iones metálicos. De
manera semejante, las fosfoproteínas poseen grupos fosfato y las hemoproteínas poseen grupos
hem.
Las proteínas son moléculas extraordinariamente complejas. Los modelos completos que ilustran
incluso las más pequeñas de las cadenas polipeptídicas son casi imposibles de comprender. Las
imágenes más simples que resaltan las características específicas de una molécula resultan útiles.
Se muestran dos métodos para presentar la información estructural de las proteínas. Más
adelante se ilustra otra representación estructural, que se denomina modelo de barras y esferas.
Los bioquímicos han diferenciado varios niveles en la organización estructural de las proteínas. La
estructura primaria, la secuencia de aminoácidos, es especificada por la información genética. Al
plegarse la cadena polipeptídica se forman determinadas disposiciones localizadas de aminoácidos
adyacentes que constituyen la estructura secundaria. La forma tridimensional global que asume
un polipéptido se denomina estructura terciaria. Se dice que las proteínas que constan de dos o
más cadenas polipeptídicas (o subunidades) tienen estructura cuaternaria.
ESTRUCTURA PRIMARIA
Cada polipéptido tiene una secuencia de aminoácidos específica. Las interacciones entre los
residuos de aminoácidos determinan la estructura tridimensional de la proteína, su función y sus
relaciones con otras proteínas. Los polipéptidos que tienen secuencias de aminoácidos y funciones
semejantes se dice que son homólogos. Se han utilizado comparaciones de secuencias de
polipéptidos homólogos para detectar las relaciones genéticas entre distintas especies. Por
ejemplo, en el estudio de la evolución se han utilizado con mucha frecuencia las homologías de
secuencia de la proteína redox mÍtocondrial citocromo c. Las comparaciones de la secuencia del
citocromo c, una molécula esencial para la producción de energía, de numerosas especies, han
revelado una gran conservación secuencial. Se presume que los residuos de aminoácidos que son
idénticos en las proteínas homólogas, que se denominan invariables, son esenciales para la
función de una proteí- na. (En el citoctromo c los residuos invariables interactúan con el hem, un
grupo protésico, o con determinadas proteínas que participan en la generación de energía.)
Cada tipo de polipéptido se pliega en su propia conformación funcional única. Sin embargo, como
resultado de procesos evolutivos, con el tiempo las secuencias de aminoácidos de los polipéptidos
cambian debido a alteraciones aleatorias y espontáneas de las secuencias de DNA, las cuales se
denominan mutaciones. Una cantidad significativa de cambios en la secuencia primaria no afecta
la función de un polipéptido. Se dice que algunas de estas sustituciones son conservadoras, puesto
que se sustituye un aminoácido con una cadena lateral con características químicas semejantes.
Por ejemplo, en determinadas posiciones de la secuencia la leucina y la isoleucina, que contienen
ambas cadenas laterales hidrófobas, pueden sustituirse una por la otra sin que se afecte la
función. Algunas posiciones de la secuencia son significativamente menos estrictas. Estos residuos,
a los que se les denomina variables, al parecer tienen funciones inespecíficas en el desempeño del
polipéptido. Se han hecho sustituciones en lugares conservadores y variables para trazar las
relaciones evolutivas. Estos estudios suponen que cuanto mayor es el tiempo desde que dos
especies se han separado, mayor es el número de diferencias en la estructura primaria de un
determinado polipéptido. Por ejemplo, se cree que el ser humano y el chimpancé se separaron
hace relativamente poco tiempo (quizá hace sólo cuatro millones de años). Esta suposición, que se
fundamenta principalmente en evidencias fósiles y anatómicas, la respaldan los datos de la
secuencia primaria del citocromo c que indican que la proteína es idéntica en ambas especies. Se
cree que los canguros, las ballenas y las ovejas, cuyas moléculas de citocromo c se diferencian por
10 residuos de la proteína humana, evolucionaron a partir de un antecesor común que vivió hace
más de 50 millones de años. Resulta interesante el hecho de que, muy a menudo, la estructura
tridimensional global no se modifica a pesar de numerosos cambios en la secuencia de
aminoácidos. Las proteínas codificadas por genes que divergieron hace millones de años suelen
presentar una forma muy similar. Sin embargo, las mutaciones también pueden ser perjudiciales.
Los efectos de tales cambios al azar en la secuencia génica van de moderados a graves. Por
ejemplo, los organismos individuales con sustituciones no conservadoras de aminoácidos en los
residuos invariables del citocromo c no son viables. Las mutaciones también pueden tener un
profundo efecto sin ser letales de inmediato. La drepanocitosis, que es provocada por una
hemoglobina mutante, es un ejemplo clásico de un grupo de enfermedades a las que Linus Pauling
y sus colaboradores denominaron enfermedades moleculares. (El Dr. Pauling fue el primero que
demostró utilizando la electroforesis que los pacientes con drepanocitosis tienen una
hemoglobina mutante.) La hemoglobina del ser humano adulto (HbA) está formada por dos
cadenas a idénticas y dos cadenas f3 iguales. La drepanocitosis es consecuencia de la sustitución
de un solo aminoácido en la cadena f3 de la HbA. El análisis de las moléculas de hemoglobina de
los pacientes con drepanocitosis revela que la única diferencia entre la HbA y la hemoglobina
drepanocítica (HbS) se encuentra en el residuo del aminoácido 6 de la cadena f3. Debido a la
sustitución de una valina hidrófoba por un ácido glutámico con carga negativa, las moléculas de
HbS se agregan para formar estructuras rígidas en forma de varilla en el estado desoxigenado. Los
eritrocitos del paciente adquieren forma de hoz y son susceptibles a la hemólisis, lo que produce
una anemia grave. La capacidad de unión al oxígeno de estos eritrocitos está reducida. La
obstrucción intermitente de los capilares por las células con forma de hoz contribuye con la
hipoxia de los tejidos. La drepanocitosis se caracteriza por dolor extremo, el consiguiente daño
orgánico y la muerte prematura. Hasta hace poco tiempo, debido a la naturaleza debilitante de la
drepanocitosis, las personas afectadas no solían sobrevivir más allá de la infancia. Por lo tanto
podría predecirse que la mutación peljudicial que produce esta enfermedad sería eliminada
rápidamente de las poblaciones humanas. Sin embargo, el gen de la drepanocitosis no es tan poco
frecuente como se esperaría. La drepanocitosis se produce sólo en las personas que han heredado
dos copias de! gen drepanocítico. Estas personas, llamadas homocigotas, heredan una copia del
gen defectuoso de cada progenitor. Se dice que cada uno de los padres, denominados
heterocigotos porque tienen un gen HbA normal y un gen HbS defectuoso, tienen el rasgo
drepanocítico. Estas personas llevan vidas normales a pesar de que un 40% de su hemoglobina es
HbS. La incidencia del rasgo drepanocítico es muy elevada en algunas regiones de África. En estas
regiones el paludismo, producido por el parásito Plasmodium del mosquito Anopheles, es un
problema de salud grave. Las personas que portan el rasgo drepanocítico son menos vulnerables al
paludismo debido a que sus eritrocitos ofrecen un ambiente menos favorable para el crecimiento
del parásito que las células normales. Debido a que los portadores del rasgo drepanocítico
sobreviven al paludismo con mayor probabilidad que las personas normales, la incidencia del gen
drepanocítico ha permanecido elevada. (En algunas zonas, hasta el 40% de la población nativa
tiene el rasgo drepanocítico.)
ESTRUCTURA SECUNDARIA
La estructura secundaria de los polipéptidos consta de varios patrones repetitivos. Los tipos
de estructura secundaria que se observan con mayor frecuencia son la hélice a y la lámina
plegada (3. Estas dos últimas estructuras están estabilizadas por enlaces de hidrógeno entre
los grupos carbonilo y N-H del esqueleto polipeptídico. Estos patrones se producen cuando
todos los ángulos
El grupo carbonilo del aminoácido que se encuentra cuatro residuos más adelante. Existen 3.6
residuos de aminoácidos por cada vuelta de la hélice, y la distancia entre los puntos
correspondientes de cada vuelta es 0.54 nm. Los grupos R de los aminoácidos se extienden hacia
afuera de la hélice. Debido a varias restricciones estructurales (Le., la rigidez de los enlaces
peptídicos y los límites permitidos de los valores de los ángulos cp Y o/), determinados
aminoácidos no estimulan la formación de la hélice a. por ejemplo, el grupo R de la glicina (un
átomo de hidrógeno) es tan pequeño que la cadena polipeptídica puede ser demasiado flexible.
Por otro lado, la prolina tiene un anillo rígido que impide que gire el enlace N-C". Además, la
prolina no tiene grupO N-H disponible para formar los enlaces de hidrógeno dentro de la cadena,
los -cuales son cruciales en la estructura de la hélice a. Las secuencias de aminoácidos con grandes
cantidades de aminoácidos cargados (p. ej. el glutamato y el aspartato) y grupoS R voluminosos (p.
ej. el triptófano) son también incompatibles con las estructuras de la hélice a. Las láminas plegadas
f3 se forman cuando se alinean dos o más segmentos de la cadena polipeptídica uno al lado del
otro. Cada segmento individual se denomina cadena f3. En lugar de estar enrollada, cada cadena l
está extendida por completo. Las láminas plegadas f3 son estabilizadas por enlaces de hidrógeno
que se forman entre los grupos N-H y carbonilo del esqueleto polipeptídico de cadenas
adyacentes. Las láminas plegadas f3 son paralelas o antiparalelas. En las estructuras de láminas
plegadas f3 paralelas, los enlaces de hidrógeno de las cadenas polipeptídicas están dispuestos en
la misma dirección; en las cadenas antiparalelas dichos enlaces se encuentran en direcciones
opuestas. En ocasiones se observan láminas f3 paralelas y antiparalelas mezcladas. Muchas
proteínas globulares contienen combinaciones de las estructuras secundarias hélice a y lámina
plegada f3 (Fig. 5.20). Estos patrones se denominan estructuras supersecundarias o motivos. En la
unidad f3af3, dos láminas plegadas f3 paralelas están conectadas mediante un segmento de hélice
a. La estructura de las unidades f3af3 es estabilizada por interacciones hidrófobas entre cadenas
laterales polares que se proyectan desde las superficies de interacción de las cadenas f3 y de la
hélice a. Es frecuente hallar residuos de glicina y de prolina en los giros f3. La ausencia de un grupo
lateral orgánico en la glicina permite que una prolina contigua asuma una orientación cis (en el
mismo lado del plano del péptido), y puede formarse un giro cen'ado en una cadena polipeptídica.
La prolina es un residuo de rompimiento de la hélice, el cual cambia la dirección de la cadena
polipeptídica. El giro f3 es común en proteínas con abundantes segmentos de hélice a . En el
patrón meandro f3 están conectadas dos láminas f3 antiparalelas mediante aminoácidos polares y
glicinas para realizar un cambio más abrupto de la dirección de la cadena polipeptídica
denominado reversa o giro de horquilla. En las unidades aa (o hélice-lazo-hélice), dos regiones de
hélice a sucesivas separadas por un lazo no helicoidal se alinean de una forma determinada debido
a la compatibilidad de las cadenas laterales. Se forman numerosas disposiciones de baniles f3
cuando varias configuraciones de lámina f3 se repliegan sobre sí mismas. Cuando una lámina f3
antiparalela se dobla sobre sí misma en un patrón que se asemeja a un diseño de alfarería griega,
el motivo se denomina llave griega.
ESTRUCTURA TERCIARIA
POLARES NO POLARES
NO CARGADOS ALIFATICOS
ASPARGINA ALANINA
CISTEINA ISOLEUCINA
GLUTAMINA GLICINA
SERINA LEUCINA
TREONINA METIONINA
PROLINA
VALINA
BASICOS (POSITIVOS) AROMATICOS
ARGININA FENILALANINA
HISTIDINA TIROSINA
LISINA TRIPTOFANO
ÁCIDOS (NEGATIVOS)
ASPARTATO
GLUTAMATO
OJO OJO OJO OJO OJO OJO OJO OJO OJO OJO OJO OJO
Algunos de los aminoácidos proteicos no pueden ser sintetizados en los tejidos animales en
cantidades suficientes para llenar las necesidades metabólicas de estos, por lo cual se les da los
nombres de aminoácido esenciales o indispensables.
Dos aminoácidos unidos forman un dipéptido, tres reciben el nombre tripéptido y una cadena más
larga de aminoácidos recibe el nombre de polipéptido. Cuando la cadena polipeptidica tiene más
de 100 aminoácidos se denomina proteína.
PROTEÍNAS:
Las proteínas son las moléculas orgánicas más complejas y abundantes de la célula viva y
constituyen más del 50% del peso seco. Estas moléculas tienen una estructura básica similar, están
conformadas por cadenas de aminoácidos, sin embargo tienen una amplia gama de funciones en
los organismos. Dentro de estas funciones se encuentran algunas como las de actividad enzimático
(tripsina: hidroliza ciertos péptidos), reguladoras (calmodulina: modulador intracelular unido al
calcio), reserva (ferritina: almacén de hierro en el bazo), transporte (hemoglobina: transporte de
O2 en la sangre de los vertebrados), contráctiles (actina: filamentos móviles de las miofibrillas),
protección (anticuerpos: forman complejos con las proteínas extrañas), hormonas (insulina: regula
el metabolismo de la glucosa), estructurales (alfa-queratina: piel, plumas, uñas y pesuñas), etc.
Estructura primaria:
Estructura Terciaria:
Las cadenas polipeptídicas presentan un plegamiento que origina una configuración tridimensional
compleja. Este plegamiento se debe a las interacciones químicas que existen entre aminoácidos
concretos localizados en diferentes regiones de la cadena polipeptídica. La estabilización de estas
estructuras se debe en su mayoría a enlaces débiles, como puentes de hidrógeno, que se
establecen entre aminoácidos muy separados, interacciones electrostáticas entre grupos laterales
cargados y fuerzas de van der Waals (atracción débiles entre moléculas y átomos cercanos con
propiedades hidrofóbicas). Algunas otras proteínas son estabilizadas por enlaces covalentes
disulfuro de aminoácidos de cisterna.
Estructura Cuaternaria:
Está constituida por varias cadenas polipeptídicas unidas entre si de manera covalente. La
hemoglobina y la insulina son ejemplo de este tipo de estructura. En el caso de la hemoglobina
está constituida por cuatro cadenas polipeptídicas diferentes, mientras que la insulina esta
formada por dos.
PROTEÍNAS:
Las proteínas son las moléculas orgánicas más complejas y abundantes de la célula viva y
constituyen más del 50% del peso seco. Estas moléculas tienen una estructura básica similar, están
conformadas por cadenas de aminoácidos, sin embargo tienen una amplia gama de funciones en
los organismos. Dentro de estas funciones se encuentran algunas como las de actividad enzimático
(tripsina: hidroliza ciertos péptidos), reguladoras (calmodulina: modulador intracelular unido al
calcio), reserva (ferritina: almacén de hierro en el bazo), transporte (hemoglobina: transporte de
O2 en la sangre de los vertebrados), contráctiles (actina: filamentos móviles de las miofibrillas),
protección (anticuerpos: forman complejos con las proteínas extrañas), hormonas (insulina: regula
el metabolismo de la glucosa), estructurales (alfa-queratina: piel, plumas, uñas y pesuñas), etc.
Estructura primaria:
Estructura secundaria:
Estructura Terciaria:
Las cadenas polipeptídicas presentan un plegamiento que origina una configuración tridimensional
compleja. Este plegamiento se debe a las interacciones químicas que existen entre aminoácidos
concretos localizados en diferentes regiones de la cadena polipeptídica. La estabilización de estas
estructuras se debe en su mayoría a enlaces débiles, como puentes de hidrógeno, que se
establecen entre aminoácidos muy separados, interacciones electrostáticas entre grupos laterales
cargados y fuerzas de van der Waals (atracción débiles entre moléculas y átomos cercanos con
propiedades hidrofóbicas). Algunas otras proteínas son estabilizadas por enlaces covalentes
disulfuro de aminoácidos de cisterna.
Estructura Cuaternaria:
Está constituida por varias cadenas polipeptídicas unidas entre si de manera covalente. La
hemoglobina y la insulina son ejemplo de este tipo de estructura. En el caso de la hemoglobina
está constituida por cuatro cadenas polipeptídicas diferentes, mientras que la insulina esta
formada por dos.
las proteínas se clasifican en dos grupos, holoproteínas, formadas solamente por aminoácidos, y
heteroproteínas, que están formadas por una fracción proteica y un componente no proteico que
se denomina grupo prostético, el cual puede ser un azúcar, un lípido, un ácido nucleico, un grupo
heme o simplemente un ión inorgánico. En ausencia del grupo prostético, la proteína no es
funcional y se llama apoproteína.
Por su función:
Pueden ser estructurales, las cuales dan apoyo estructural a las células y tejidos (como las
glicoproteínas que forman parte de las membranas, o las histonas que forman parte de los
cromosomas);
De defensa; que protegen al organismo contra posibles ataques de agentes extraños (como las
proteínas relacionadas con la patogénesis);
Hormonales; enzimáticas, que de hecho son las más numerosas y especializadas, las cuales
aumentan la velocidad de las reacciones químicas,
Proteínas estructurales:
Proteínas reguladoras:
Actina, miosina.
Proteínas de transporte:
Anticuerpos, complemento.
Sacarasa, pepsina.
CUADRO DE Aminoácido
Ciertas investigaciones han revelado que numerosas proteínas tienen múltiples funciones, en
ocasiones no relacionadas entre sÍ. Alguna vez consideradas un fenómeno raro, las proteínas
Como su nombre sugiere, las proteínas fibrosas son moléculas largas con forma de varilla que son
insolubles en agua y físicamente correosas. Las proteínas fibrosas, como las queratinas de la piel,
del pelo y de las uñas, tienen funciones estructurales y protectoras.
b.- Las proteínas globulares.
Otros ejemplos son las inmunoglobulinas y las proteínas de transporte hemoglobina y albúmina
(un transportador de ácidos grasos en la sangre).
proteína conjugada consta de una proteína simple combinada con un componente no proteico,
que se denomina grupo protésico. ( Una proteína sin su grupo protésico se denomina
denomina holoproteína.)
Los grupos protésicos desempeñan una tarea importante, a veces crucial, en el funcionamiento de
las proteínas.
Las proteínas conjugadas se clasifican según la naturaleza de su grupo protésico. Por ejemplo,
De manera semejante, las fosfoproteínas poseen grupos fosfato y las hemoproteínas poseen
grupos hem.
----Diferencias entre los varios niveles en la organización
estructural de las proteínas. En relación de su formación.
En la estructura primaria:
Estructura secundaria:
Estructura terciaria:
Estructura cuaternaria:
Se dice que las proteínas que constan de dos o más cadenas polipeptídicas (o subunidades) tienen
estructura cuaternaria.
Tipos de aminoácidos
Los aminoácidos se pueden clasificar en dos grandes grupos: los esenciales y los no
esenciales.
En este sentido, las proteínas que se obtienen de la carne animal son las que más
calidad tienen porque contienen todos los aminoácidos esenciales. En las que son
de origen vegetal, por su parte, se observa una diversidad menor de aminoácidos.
Por eso, es necesario combinar distintos alimentos, como legumbres y semillas,
para que el aporte de proteínas sea completo. Cada gramo de proteína supone 4
calorías al consumidor y se recomienda consumir al día entre 40 y 60 gramos.
La gelatina
A pesar de que la gelatina no es carne, sí que procede de ciertos animales. Según
explica Miguel Ángel Lurueña, doctor en Ciencia y Tecnología de los Alimentos, en
su blog Gominolas de petróleo, el principal componente de la gelatina es el
colágeno. Se trata de una proteína ubicada en el tejido conjuntivo de los animales
y que se obtiene tras hervir algunas piezas como la piel, los tendones y los
huesos.
Por esta razón, la gelatina es el alimento que más proteínas contiene. En
concreto, el contenido en este tipo de moléculas supera el 80% de su composición
total. La proporción de proteínas de la gelatina utilizada en la repostería y en las
chucherías puede ser menor al añadirse agua, azúcares y otros componentes.
El queso parmesano
Los nutrientes del queso son, prácticamente, los mismos que los de la leche. Sin
embargo, en este producto la cantidad de agua es menor y, por tanto, los están
más concentrados. Por esta razón, los quesos contienen una proporción alta de
proteínas. Muchos de ellos tienen un 30% o más de este tipo de moléculas. Es el
caso del queso de bola, el emmental o el manchego curado.
Los altramuces
Conocidos también como chochos o lupines, los altramuces son una de las
legumbres más conocidas por su presencia en las barras de los bares. Se trata de
una buena alternativa a los aperitivos más ultraprocesados por sus valores
nutricionales. Destaca su contenido en minerales tales como el hierro, el potasio,
el fósforo y el calcio.
El 36,2% de los altramuces son pura proteína. Estas semillas suponen más de 370
calorías al consumidor por cada 100 gramos, por lo que se tratan de un bocado
especialmente energético.
La soja
Icono de la gastronomía oriental y, ahora, también de la alimentación vegetariana
y vegana. La soja destaca por sus valores nutricionales, pero también por las
distintas maneras de consumirla: desde las vainas conocidas como edamame y
leche de soja, hasta la típica salsa de soja. 100 gramos de soja, en estado sólido
de legumbre, suponen más de 400 calorías.
Las pipas
Las semillas del girasol o de la calabaza son alimentos con una gran cantidad de
nutrientes y que, además, gustan a muchas personas. Se trata de un tipo de
alimentos que producen un consumo compulsivo y, sin embargo, puede resultar
saludable por su contenido en ácidos grasos poliinsaturados.
Sin embargo, al ser alimentos muy calóricos -584 calorías por 100 gramos de
pipas de girasol y 446 por 100 gramos de pipas de calabaza- conviene no abusar
de ellos. Las pipas de girasol y de calabaza contienen cerca de un 30% de
proteínas en su composición total.
¿Dónde se consiguen?
-Cerdo.
-Pollo.
-Ternera.
-Salmón.
-Mero.
-Atún.
-Sardina.
Origen vegetal
“Si te han dicho que las proteínas completas solo las adquieres en los
alimentos de origen animal, esto es un mito que debemos dejar atrás,
porque no todas las proteínas de origen vegetal son incompletas”.
Algunos de los principales alimentos de origen vegetal que contienen los
aminoácidos esenciales son:
-Garbanzo.
-Soja.
-Algunas alubias.
-Trigo sarraceno.
-Quinoa.
-Amaranto.
-Semillas de cáñamo.
-Pistachos.
CLASIFICACION DE LOS
Semillas de calabaza, Semillas de girasol, Lisina: Suele ser más abundante en las
proteínas animales que en las vegetales. Los cereales contienen muy poca lisina, pero la
carne, el pescado, el huevo y las leguminosas son fuente importante de esta sustancia.
Algunos estudios avalan la efectividad de la lisina en el tratamiento contra el herpes, debido a
que reduce el crecimiento viral; también asegura la adecuada absorción del calcio. Su
deficiencia provoca náusea, vómito, mareos, anemia y retraso en el crecimiento de los niños.
Existe un trastorno causado por la deficiencia de una enzima necesaria para utilizar la lisina
-lo que origina altas concentraciones en la sangre- provocando náusea y vómito; su
consecuencia más grave es el retraso mental. Alimentos que contienen lisina: De Origen
animal: Carnes rojas, Cerdo, Aves, Pescados (bacalao y sardinas), Queso, en especial el
Parmesano Huevos, y de Origen vegetal: Alcaravea, Algarroba, Altramuz, Arroz integral,
Berros, Cereales integrales, Espárragos, Espinaca, Frijol, Legumbres, Lentejas, Levadura de
frijoles
huevos
trigo sarraceno
maíz
coliflor
champiñones
papas (patatas)
brotes de bambú
plátanos
melón
cítricos (limón, naranja, pomelo, mandarina)
semillas de girasol
ajonjolí
cacahuates (maní)
semillas de calabaza
Fríjol
Lentejas
Garbanzos
cacahuates
semillas de girasol
nueces
lentejas cocidas
frijoles negros
chícharos (arvejas, guisantes verdes)
Ajonjolí
Nueces de Brasil
Espinacas
Nabo
Brócoli
Calabazas
Avena cocida
Pimiento rojo fresco
Coles de Bruselas
Brócoli
Cebolla
Nueces
Almendras
Cacahuates tostados
Frijoles
Garbanzos
Lentejas
Aguacates
Almendras
Lentejas
Caupí
Cacahuates
Linaza
Ajonjolí
Garbanzos
Almendras
Aminoácido Triptófano (aminoácido esencial)
Semillas de calabaza
Semillas de girasol
Nueces de cajú
Almendras
Nueces
Frijoles
Guisantes
Maní
Lentejas
Frijoles
Garbanzos
Cacahuate
------Aunque
los humanos estamos hechos de alrededor de
250.000 proteínas distintas, estas están compuestas de sólo
20 aminoácidos.
Nuestro cuerpo puede fabricar 11 de ellos.
Los otros nueve son los llamados aminoácidos esenciales. No pueden ser
sintetizados en nuestro organismo, por lo que tenemos que conseguirlos en los
alimentos.
Por el contrario, si sólo tiene pequeñas cantidades de uno de ellos (aminoácido limitante),
esta será de menor calidad.
Las proteínas de los alimentos de origen animal (carnes, pescados, huevos, lácteos, etc.)
tienen un valor biológico mayor que las de origen vegetal (cereales, legumbres, frutos
secos, etc.),
Para alcanzar una calidad óptima para la proteína de origen vegetal se hace necesaria la
“complementación proteica”,
dando como resultado una proteína de mejor calidad. En una dieta equilibrada, la proteína
debe aportar del 10 a 15% de la energía total consumida.
Los productos del mar de Pescanova son fuente de proteína de pescado de elevado valor
biológico.
CO,..PANION OH W f:. S I T E