Taller Daño, Mutaciones y Reparación

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UNIVERSIDAD DE SANTANDER

FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD


PROGRAMA DE BACTERIOLOGÍA Y LABORATORIO CLÍNICO
BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA
TALLER
DAÑO, MUTACIÓN Y REPARACIÓN DEL ADN

Integrantes:__________________________________________________________________________________________
Fecha: _____________________________

Introducción:
Los mecanismos moleculares de replicación y reparación del genoma aseguran la transmisión de la información genética
con un alto nivel de fidelidad. Sin embargo, aun en condiciones no patológicas, en cada división celular las células hijas
fijan mutaciones, que pueden ser el producto de errores en la replicación del genoma o consecuencias de daños físicos o
químicos no reparados en el ADN.

Objetivos:
Afianzar los conceptos y fundamentos en la generación de mutaciones y los mecanismos de reparación del ADN.

Metodología:
Haciendo uso de los materiales de clase de plataforma resuelvan el taller en grupos de tres estudiantes. Incluir las
referencias de la bibliografía consultada. Se organizarán 11 grupos y esta actividad será cargada en la plataforma en la
semana 7. Fecha entrega: domingo 11 de octubre de 2020.

Preguntas del taller:

1. Expliquen, cuáles son las consecuencias celulares del funcionamiento deficiente de alguno de los mecanismos de
reparación del ADN y su relación con la fijación de mutaciones.

La reparación del ADN es una serie de procesos mediante los cuales las células reconocen y corrigen el daño causado
a las moléculas de ADN que codifican el genoma. Si estas no son reparadas puede llegar a la afectación del genoma
en la replicación de células hijas y causar grandes enfermedades como lo vemos por ejemplo en la reparación por
escisión de nucleótidos.
Reparación por escisión de nucleótidos (NER): Si este tipo de reparación no se da en el ADN, podríamos ver más
que todo, que bajo la exposición frecuente de radiación de rayos UV, causa que, en una de las hebras del ADN, la
citosina y timina, haya reacción con bases vecinas que también sean C y T, y formen un enlace de distorsión de la
doble hélice, causando errores en la replicación, el tipo más común es llamado dímero de timina, en donde dos bases
de timina reaccionan entre si y se unen químicamente, haciendo lo anteriormente dicho; causando mutación en células
hijas en su replicación; Si pasa en alguno de estos Genes importantes que controlan el crecimiento celular, como el
gen Src, las mutaciones de la tirosina quinasa o del "supresor de tumores p53" pueden causar cáncer.

2. ¿Cuáles son los mecanismos de reparación del ADN ante daños que se producen en una de las hebras? Compárelos,
teniendo en cuenta los siguientes criterios:

a. Momento del ciclo celular en el que operan.


b. Tipo de daños en el ADN que pueden reparar.
Sistema de reparación Momento del ciclo celular Tipo de daño
Directo Fase S Dímeros de timina fotoliasa, el cual
modifica el daño o la base
directamente. El ADN puede ser
dañado por varios agentes endógenos
o exógenos por tanto se activan
enzimas para la reparación
directamente en el daño.
Escisión de bases Fase G2 Bases anormales y modificadas,
dímeros de pirimidina (radiación
ultravioleta), se da entre timinas o G y
C, ocurre alquilaciones, oxidaciones.
Ocurre por desaminacion convierte
base de citosina por uracilo.
Escisión de nucleótidos Fase G2 Distorsión de la doble hélice (bases
anormales y modificadas, dímeros de
timina), dos bases de timina
reaccionan entre si y se unen
químicamente; lo saca
completamente. Es eliminada una
sección de nucleótidos.

3. Expliquen brevemente, en qué consiste la reparación de ADN por recombinación homóloga. Compárenlo con el
mecanismo de reparación por unión de extremos no homólogos. ¿Qué consecuencias biológicas tendrán la actuación
de uno u otro mecanismo de reparación ante un daño en la doble cadena de ADN?

Recombinación homologa Recombinación no homologa


El sistema puede detectar y reparar el daño causado por La compostura de quiebres de doble cadena en
reactivos químicos, físicos y radicales libres generados organismos mejores se da por extremos no homólogos,
por DSB, especialmente en la fase G2 del ciclo celular. esta clase de compostura posibilita la alianza de cadenas
Una serie de reacciones y proteínas reparadoras que por sus extremos, y no requiere de sucesión
bloquean el ciclo celular. El mecanismo molecular de la complementaria u homóloga para su alianza. Después, el
recombinación homóloga humana sigue siendo complejo, heterodímero es asociado por acción catalíca a la quinasa
pero se han identificado proteínas como XRCC2, XRCC3, (DNA-Pkcs) que se activa por la relación de la cadena
RAD51B, RAD51C y RAD51. Y las reconocidas por simple con el DSB , la ligasa IV (enzima que junta
DSB como ATR y ATM quinasas; se descubrió que la extremos de ADN) y XRCC4 llevan a cabo la alianza de
pérdida o inactivación de estas últimas era la causa de una las cadenas.
enfermedad genética humana (ataxia-telangiectasia).

En la levadura, el DSB es reconocido por un complejo


proteico llamado MRN (RAD50 / MRE11 / NBS1) (56).
Trabaja con la nucleasa Mre11, que degrada las hebras
simples de ADN. Posteriormente, la proteína RAD52 se
une al final de la cadena para proteger el ADN de la
exonucleasa no específica (proteína o enzima que corta el
ADN).
De esta forma, la proteína RAD51 en presencia de ATP
sintetiza un filamento nucleo proteíco que busca la
sucesión homóloga y cataliza el trueque y apareamiento
de las cadenas con el apoyo de RAD52 en humanos
Rad51 es homóloga a RecA en bacterias. A lo largo de
esta fase, la proteína RAD54 estimula a RAD51 en el
alineamiento de cadenas, así es sintetizada la cadena,
empleando como molde la sucesión homóloga que repara
la información pérdida a lo largo del DSB (61).

Finalmente, se forma una estructura de cadena cruzada


denominada intermedio de Holliday, que corta e incorpora
apropiadamente el proceso de reparación, evitando así el
reordenamiento cromosómico.

4. ¿Cuál es el número mínimo de sustituciones de un solo nucleótido, que serían necesarias para realizar cada uno de los
siguientes reemplazos de aminoácidos? Revisen el código genético e inclúyanlo en la respuesta de esta pregunta.

1. Trp → Asn
 Trp 1 →Asn 2
 UGG → AAU
AAC
b. Tyr → Ala
 Tyr 2 → Ala 4
 UAU → GCA
UAC GCC
GCA
GCG
c. Met → Lys
 Met 1→ Lys 2
 AUG AAA
AAG

d. Ala → Asp
 Ala 4 → Asp 2
 GCC GAU
GCA GAC
GCG

5. ¿Cuántos codones diferentes pueden resultar de la sustitución de una sola base en el ADN que codifica el codón de
cisteína UGC? Clasifiquen cada uno como sinónimo (silencioso), no sinónimo (sin sentido) o terminación de la
cadena. Consulten el código genético.

 Tiene tres diferentes:


1. UGC: silencioso
2. UGA: stop, finalización.
3. UGG: sin sentido.

6. En la siguiente secuencia de ADN, se produce una desaminación de la citosina de la cadena superior:


5´–TTGGGCA–3´
3´–AACCCGT–5´
a. Si no hay reparación antes de la siguiente ronda de replicación del ADN, ¿cuál es la secuencia de la hebra
afectada y su hebra complementaria recién replicada?

b. Si la base dañada es reparada por uracilo ADN glicosilasa antes de la siguiente ronda de replicación del ADN,
¿cuál es la secuencia de la hebra afectada y su hebra complementaria recién replicada?

c. Si el mecanismo de reparación de uracil DNA glicosilasa se inactiva y el proceso de reparación de desajustes,


repara la base dañada antes de la siguiente ronda de replicación del ADN, ¿cuál es la secuencia de la hebra
afectada y su hebra complementaria recién replicada?
7. La hemoglobina C humana, es una variante en la que una lisina en la cadena β de la hemoglobina se sustituye por un
ácido glutámico. ¿Qué sustitución de una sola base puede explicar la mutación de la hemoglobina C?

8. La molécula 2-aminopurina (Ap) es un análogo de la adenina, que se empareja con la timina. También,
ocasionalmente se empareja con la citosina. ¿Qué vías de mutación son posibles y qué tipos de mutaciones se forman?

9. Se comparan cepas mutantes de E. coli. ¿Cuál esperaría que fuera el fenotipo de cada una de las siguientes
mutaciones:
a. Si la mutación está en un gen, cuyo producto desempeña un papel importante en la reparación de errores de
apareamiento.
b. Si la mutación está en el gen de la uracilglicosilasa de ADN, que afectan la reparación del ADN.
Contesten las anteriores preguntas con respecto a la tasa de mutación general y si hay una diferencia marcada en las
tasas de sustitución entre pares de nucleótidos.

10. Comparen los mecanismos de reparación del ADN por escisión (NER, BER) y el de errores de emparejamiento
(MMR) entre procariotas y eucariotas. ¿Existen diferencias? Pueden ayudarse de una figura para comparar los
mecanismos en estos grupos celulares.

11. Se plantea de forma hipotética que una cepa de Escherichia coli presenta una mutación funcional para dam (el gen
que codifica para la Dam metiltransferasa). ¿Cuál sería el fenotipo que se observaría con respecto a la mutagénesis
espontánea? En condiciones normales, ¿Cuál es la función de la enzima Dam metiltransferasa?

12. ¿Qué es la síntesis translesión? ¿Cuál es su mecanismo? ¿Por qué se considera uno de los últimos recursos que la
célula usaría para reparar el ADN?

13. Complementando la pregunta anterior, los procariotas, presentan el sistema SOS de respuesta al daño del ADN.

a. Defina sistema SOS


b. Expliquen su funcionamiento
c. Expliquen su importancia

REFERENCIAS:
 James Dewey Watson. La biología del gen. Panamericana; 2016. Vol 257-312. La replicación del ADN
 Tafurt Y, Marin MA. Principales mecanismos de reparación de daños en la molécula de ADN. Revista
Biosalud 2014; 13(2): 95-110.
 "The genetic code", de OpenStax College, Biología (CC BY 3.0).

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