Practica No 4. Informe
Practica No 4. Informe
Practica No 4. Informe
I. INTRODUCCION.-
Sea µ la tasa de mutación del alelo A hacia otro alelo a. Si pt es la frecuencia del alelo A
en la generación t, si qt = 1 – pt es la frecuencia del alelo a y si no hay otras causas que
cambien las frecuencias alélicas, el cambio de la frecuencia alélicas es
Δp = pt - pt-1= µpt-1
Donde pt-1 es la frecuencia de la generación anterior. Esto nos indica que la frecuencia de
A disminuye (y la de a aumenta) proporcionalmente a la tasa de mutación µ y a la
proporción p de todos los alelos que están disponibles para mutar. Por lo tanto, Δp se hace
más pequeño a medida que la frecuencia de p disminuye (cada vez hay menos alelos A
que se convierten en a). Así, después de n generaciones de mutación
pn= poe-nµ
donde e es la base de los logaritmos naturales. Esta es la relación entre las frecuencias
alélicas y el número de generaciones; por ejemplo, para µ = 10-5 y después de 10 000
generaciones mutación recurrente de A→a,
pn= po (1 - µ)n
Cada alelo tiene una tasa de mutación característica en la población. La tasa de mutación
regresiva (retromutación) y la tasa de mutación progresiva no suelen ser equivalentes. Si
la frecuencia inicial del alelo A1 es po y del alelo A2 es qo, la tasa de mutación progresiva
de A1 a A2 es µ y la retromutación de A2 a A1 es v. El cambio de de frecuencia del alelo
A2(Δq) en una generación de presión de mutación es:
Δq = µpo – vqo
µ 𝐯
̂=
𝒒 𝒚 ̂=
𝒑
µ + 𝒗 µ + 𝐯
De manera que:
̂ = {v / (u + v)} / {μ / (μ + v)} = v / μ
̂/𝒒
𝒑
̂ = 0.625 y de
Por ejemplo, si 𝝁 = 0.00005 y v = 0.00003, la frecuencia en el equilibrio de 𝒒
̂
𝒑 = 0.375. La velocidad con la que se alcanza esta frecuencia de equilibrio por medio de
mutaciones es bastante lenta y se puede estimar a partir de Δq:
n = 8,664 generaciones
sq2(1 – q) / (1 – sq2)
sq2 (1 – q) = μ (1 – q)
sq2 = μ
𝝁
q2 = 𝒔
𝝁
q = √𝒔
OBJETIVOS
- Demostrar que las mutaciones son un tipo de fuerzas naturales que cambian las
frecuencias alélicas en una población.
- Demostrar que las mutaciones están sujetas a la selección natural.
- Utilizar las hoja Excel como simulador virtual, para comprender de forma
esquemática el cambio de las frecuencias alélicas por procesos de mutación
selección.
MATERIALES Y METODOS
Utilizar problemas modelos y la hoja exel para realizar las simulaciones predictivas para
el comportamiento de p y q tras eventos de mutación y selección.
Experimento 1.
1. Se investigó una mutación dominante A (Acondroplácia) en humanos que se
expresa al nacer. Los registros mostraron seis casos 40 000 nacimientos. Las
genealogías familiares mostraron que, en dos de los casos las mutaciones ya se
presentaban en uno de los padres.
p0 0.9
q0 0.1
Mutantes
6 -2 = 4
(novo)
Gametos 40000*2 =
AA = Acondroplácia Totales 80000
= 4 / 80000 = 5 x 𝟏𝟎−𝟓
P1 = P0 (1-)
P disminuye en 0.00045
Q incrementa en 0.00045
Si la mutación espontanea se da en cada generación, cuantas generaciones
son necesarias para que A llegue a 0,5:
𝑃𝑛
ln ( ) P0 0.9
𝑃0
N=
ln (1−𝜇) Pn 0.5
0.5
ln ( ) −0.5877866649
0.9
N= = = 11765 𝑔𝑒𝑛𝑒𝑟𝑎𝑐𝑖𝑜𝑛𝑒𝑠
ln (1− 𝟓 𝐱 𝟏𝟎−𝟓 ) −5.000125004 𝑥 10−5
Inicio: G0
p 0.9
q 0.1
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.81 0.18 0.01
GENERACIÓN 1:
Selección (S) 0 0 1
W (1-S) 1 1 0 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.809919 0.180072 0 0.989991
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas
despues de la S (Frec. 0.818107 0.181893 0 1
Después de la S/W
Población 106 818107 181893 0
P1 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.909054
Q1 (1-P1) 0.090946
GENERACIÓN 2:
P1 0.909054
Q1 0.090946
MUTACIÓN
p2 0.909054 (1- 5 x 10−5 ) = 0.909009
q2 0.090991
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.826297 0.165423 0.008279
P disminuye en 0.000045
Q incrementa en 0.000045
GENERACIÓN 2 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.826297 0.165423 0.008279
Selección (S) 0 0 1
W (1-S) 1 1 0 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.826297 0.165423 0 0.99172
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas
despues de la S (Frec. 0.833196 0.166804 0 1
Después de la S/W
Población 106 833196 166804 0
P2 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.916598
Q2 (1-P1) 0.083402
GENERACIÓN 3:
P2 0.916598
Q2 0.083402
MUTACIÓN
p3 0.916598 (1- 5 x 10−5 ) = 0.916552
q3 0.083448
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.840068 0.152969 0.006964
P disminuye en 0.000046
Q disminuye en 0.000046
GENERACIÓN 3 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.840068 0.152969 0.006964
Selección (S) 0 0 1
W (1-S) 1 1 0 W absoluta
Frecuencia despues de la S
0.840068 0.152969 0 0.993037
(W*Frec. Antes de la S)
Frecuencia nuevas
despues de la S (Frec. 0.845958 0.154042 0 1
Después de la S/W
Población 106 845958 154042 0
P3 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.922979
Q3 (1-P1) 0.077021
LASTRE GENÉTICO:
GENERACIÓN 1:
P0 0.9
Q0 0.1
P1 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.902025
Q1 (1-P1) 0.097975
GENERACIÓN 2:
P1 0.902025
Q1 0.097975
MUTACIÓN
p2 0.902025 (1 - 0.0008) = 0.901303
q2 0.098697
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.812347 0.177912 0.009741
P disminuye en 0.000722
Q incrementa en 0.000722
GENERACIÓN 2 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.812347 0.177912 0.009741
GENERACIÓN 3:
P2 0.903945
Q2 0.096055
MUTACIÓN
p3 0.903945 (1 - 0.0008) = 0.903222
q3 0.096778
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.815810 0.174824 0.009366
P disminuye en 0.000721
Q incrementa en 0.000721
GENERACIÓN 3 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.81581 0.174824 0.009366
LASTRE GENÉTICO:
A1 >>>>> A2
0.8 0.2
P1 = P0 – P0 + Q0
1 𝑃0−𝑃𝑒𝑞
N = + ln 𝑃𝑛−𝑃𝑒𝑞
1 0.2−0.25
N = 0.0005+0.0015 ln 0.21−0.25 = 111.57 = 112 generaciones.
P1 (1/2*FA1A2+FA1A1) 0.823009
Q1 (1-P1) 0.176991
GENERACIÓN 2:
P 0.823009
Q 0.176991
MUTACIÓN
p2 0.823009 (1 - 0.0005) = 0.822597
q2 0.177403
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.676666 0.291862 0.031472
P disminuye en 0.000412
Q incrementa en 0.000412
GENERACIÓN 3:
P 0.841127
Q 0.158873
MUTACIÓN
p3 0.841127(1 - 0.0005) = 0.840706
q3 0.159294
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.706787 0.267839 0.025375
P disminuye en 0.000421
Q incrementa en 0.000421
GENERACIÓN 3 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.706787 0.267839 0.025375
GENERACIÓN 4:
P 0.855909
Q 0.144091
MUTACIÓN
p4 0.855909(1 - 0.0005) = 0.855481
q4 0.144519
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.731848 0.247267 0.020886
P disminuye en 0.000428
Q incrementa en 0.000428
P 0.868174
Q 0.131826
MUTACIÓN
p5 0.868174(1 - 0.0005) = 0.867740
q5 0.13226
Genotipos A1A1 A1A2 A2A2
0.752973 0.229535 0.017493
P disminuye en 0.001434
Q incrementa en 0.001434
GENERACIÓN 5 A1A1 A1A2 A2A2
Antes de la selección 0.752973 0.229535 0.017493
PROBLEMAS
Problema 1
En una población la tasa de mutación es D → d es 4 x 10-6. Si hoy p = 0.8, ¿cuál será el
valor de p tras 50 000 generaciones?
p0 0.8
q0 0.2
Pn = P0 (𝟏 − )𝒏
)
P50000 = Escriba
0.8 (1 −aquí
4 𝑥la10
ecuación.
−6 50000
) = 0.65
p50000 0.65
q50000 0.35
Problema 2:
Si un gen muta con una velocidad de mutación 1 x 10-6 durante tan solo una generación
en una población de 10 millones de individuos, ¿cuántos de dichos genes mutantes
pasarán probablemente a la siguiente generación si el tamaño de la población permanece
constante?
Problema 3
Si un gen tiene una velocidad de mutación de A → a de 3 x 10-7 y no existe mutación en
sentido inverso, ¿cuál será la frecuencia de A después de a) 10 b) 100 c) 10,000 d)
1’000,000 generaciones de mutación?
Si p0 es la frecuencia inicial de un alelo A que muta al alelo a con una frecuencia u por
generación, en la siguiente generación la frecuencia de A (p1) será:
p1 = p0 - up0 = p0 (1 - u)
En una generación más, la nueva frecuencia de A será:
p2 = p1 - up1 = p1 (1 - u) = p0 (1 - u) (1 - u) = p0 (1 - u)2
En n generaciones:
Pn = p0 (1 − u)𝑛
b) En 100 generaciones:
p100 = 0.5 (𝟏 − 𝟑𝒙𝟏𝟎−𝟕 )𝟏𝟎𝟎
100 = 0.499985
c) En 100.000 generaciones:
p100.000 = 0.5 (𝟏 − 𝟑𝒙𝟏𝟎−𝟕 )𝟏𝟎𝟎𝟎𝟎𝟎
100.000 = 0.485223
d) En 1000000 generaciones:
P1000000 = 0.5 (𝟏 − 𝟑𝒙𝟏𝟎−𝟕 )𝟏𝟎𝟎𝟎𝟎𝟎𝟎
1000000 = 0.370409
Problema 4
Cierta cepa de Drosophila presenta una velocidad de mutación de ojo normal (w+) a ojo
eosin (we) de 1.3 x 10-4 y una velocidad de mutación en sentido inverso de we → w+
de 4.2 x 10-5
Si la tasa de mutación w+ → we es u y la tasa de mutación we → w+ es v, y siendo las
frecuencias iniciales de w+ y we, p0 y q0, respectivamente
= w+ → we = 1.3 x 10-4
= we → w+ = 4.2 x 10-5
1.3 𝑥 10−4
𝑉𝑞𝑒 = 1.3 𝑥 10−4 + 4.2 𝑥 10−5 = 0.76
(b) ¿cuántas generaciones serán necesarias para que we pase de 0.1 a 0.5?
1 𝑄0−𝑄𝑒𝑞
N = + ln 𝑄𝑛−𝑄𝑒𝑞
1 0.1−0.76
N = 1.3 𝑥 10−4 + 4.2 𝑥 10−5 ln 0.5−0.76 = 5416.036069 = 5416 Generaciones.