Reducción de Nitrato
Reducción de Nitrato
Reducción de Nitrato
K-12:
Participación de Formiato Deshidrogenasa Específico
y Citocromo b1, Componentes en
Reducción de Nitrato
MATERIALES Y MÉTODOS
Las cepas de E. coli utilizadas en estos estudios, HfrH y AB2102, y los mutantes NR- derivados
de ellos se describieron previamente (17). Todas las cepas se cultivaron en un medio completo
que contenía una base de sal (20), clorhidrato de tiamina (5, g / ml), 0,4% de caldo nutritivo
(Difco) y 1% de glucosa (esterilizada por separado). Cuando se indicó, el medio se suplementó
con nitrato de potasio al 1% y formiato de sodio al 0,5%.
Para medir las actividades, los cultivos se cultivaron en matraces con brazos laterales de tubo
Klett a 37 ° C en un baño de agua con agitación. Para condiciones aeróbicas, el medio se roció
vigorosamente con aire estéril. Para condiciones anaeróbicas, el medio se roció con una
mezcla estéril de 95% de N2 más 5% de CO2. Los cultivos se inocularon con un inóculo de 2 a
5% a partir de un cultivo nocturno crecido en medio similar y se les permitió crecer hasta la
mitad de la fase exponencial. Las células se recogieron por centrifugación, se lavaron dos
veces con tampón de fosfato de potasio 0,05 M (pH 6,8 o 7,3) y se resuspendieron en el mismo
tampón. Esta suspensión se usó como tal (células enteras) o se congeló durante la noche a -15
° C antes de su uso (células congeladas y descongeladas). Los extractos sin células se
prepararon mediante tres tratamientos de 15 segundos cada uno en un Branson Sonifier de 10
kc, seguido de centrifugación a 3.000 X g durante 10 minutos para eliminar células enteras.
La deshidrogenasa de formiato se midió con diferentes aceptores de electrones utilizando un
radioensayo o un ensayo espectrofotométrico descrito anteriormente (17), o mediante el
siguiente procedimiento manométrico utilizando un aparato Warburg. En el compartimento
principal se colocaron 0,2 ml de células o extracto, 10 umoles de aceptor de electrones y
tampón de fosfato de potasio 0,05 / M (pH 6,8) en un volumen total de 2,7 ml; 30, se colocaron
umoles de formiato en el brazo lateral. Los matraces y los manómetros se enjuagaron con N2 y
se equilibraron a 37 ° C antes de volcar el formiato en el compartimento principal. La actividad
se expresó como microlitros de CO2 desprendido por minuto por miligramo de proteína. No se
produjo CO2 en ausencia de aceptores de electrones añadidos.
En algunos experimentos, se midió la deshidrogenasa de formiato específica de viológeno de
bencilo mediante el siguiente procedimiento cualitativo. En tubos Thunberg, se mezclaron 140
umoles de tampón de fosfato de potasio (pH 6,8), 1,0, smoles de bencil viológeno, 60; umoles
de formato de sodio y células o extracto en un volumen final de 5,0 ml. Los tubos se lavaron
con N2, y la reducción del viológeno de bencilo fue seguida por el uso de un colorímetro Klett
con un filtro de 660 nm. El desarrollo del color no fue lineal y, por lo tanto, los resultados se
expresaron cualitativamente.
La hidrogenilasa fórmica se ensayó manométricamente siguiendo la evolución de hidrógeno a
partir del formiato (15). La producción de gas por cultivos en crecimiento se evaluó observando
la acumulación de gas en viales invertidos sumergidos en tubos del medio de cultivo.
La nitrato reductasa se analizó con formiato o metil viológeno reducido como donadores de
electrones, como se describió anteriormente (17). Con otros donantes de electrones se siguió
el procedimiento utilizado con formiato, sustituyendo el donante de electrones por formiato.
Los espectros de absorción de los citocromos se determinaron con un espectrofotómetro de
grabación de un solo haz construido y amablemente puesto a disposición por Warren Butler en
la Universidad de California en San Diego. La luz monocromática de 1,0 nm de ancho de banda
medio fue proporcionada por un monocromador de rejilla Bausch & Lomb. La salida del
fotómetro y un potenciómetro orientado al tambor de longitud de onda proporcionó las señales
de entrada a un grabador X-Y Moseley 7000 AM. Para la medición de espectros reducidos
absolutos a temperatura de nitrógeno líquido, se colocó una muestra de 1,0 ml en una celda de
absorción de metal, se redujo con ditionito de sodio sólido, se mezcló con 500 mg de Al203 (1,
diámetro um), se congeló en N2 líquido. y se coloca en un matraz Dewar que contiene N2 en el
compartimento celular del instrumento. Para la medición de espectros reducidos absolutos a
temperatura ambiente, se siguió el mismo procedimiento general, omitiendo el líquido N2. Para
determinar los espectros diferenciales, se utilizó un accesorio que proporcionaba un haz
dividido. En este caso, se colocaron muestras idénticas de 3.0 ml en células de absorción de
vidrio (trayectoria de luz de 10 nm). El contenido de una cubeta se oxidó enjuagando con aire
durante 30 segundos, y la otra se redujo con ditionito sódico sólido para obtener el espectro
reducido menos oxidado.
Los niveles de citocromo se calcularon de la siguiente manera. Se dibujó una línea basal entre
540 y 570 nm, y la altura del pico de la banda a se midió a partir de esta línea base. Se
calcularon las unidades de densidad óptica, y el nivel de citocromo se expresa como unidades
de densidad óptica por miligramo de proteína. La cinética de reducción y oxidación del
citocromo b1 se siguió con un espectrofotómetro de doble longitud de onda Aminco-Chance a
35 ° C o temperatura ambiente. La proteína se determinó mediante el procedimiento de Lowry
et al. (12)
RESULTADOS
Las propiedades generales del sistema de reducción de nitrato presente en las cepas de tipo
salvaje utilizadas en estos estudios correspondieron a las reportadas previamente (2, 6, 8). En
las células de cepas HfrH inducidas por nitrato, el formiato fue un donante de electrones más
eficaz para la reducción de nitrato que la glucosa (Tabla 1). En células congeladas y
descongeladas o en extractos celulares, varios reactivos actúan como donadores de electrones
o reducción de nitrato (Tabla 1). El viológeno de metilo reducido, que transfiere electrones
directamente a la nitrato reductasa (21), fue el donante de electrones más efectivo, pero el
formiato fue del 30 al 40% tan activo como el viológeno de metilo reducido en las células
congeladas. La reducción de nitrato con formiato como donante de electrones se inhibió por
completo con 0.01 mM n-heptil hidroxiquinolina-N-óxido (HOQNO), mientras que un aumento
de 100 veces en la concentración del inhibidor no afectó la reducción de nitrato con viológeno o
ascorbato de metilo reducido como el donador de electrones.
La formiato deshidrogenasa presente en las células inducidas por nitrato de la cepa HfrH utilizó
varios aceptores de electrones (Tabla 2). El azul de metileno y el metosulfato de fenazina
fueron los aceptadores más efectivos, mientras que el ferricianuro de potasio, el viológeno de
bencilo y el cloruro de trifeniltetrazolio fueron mucho menos efectivos. Hemos medido
rutinariamente la formiato deshidrogenasa siguiendo la reducción del diclorofenol indofenol
(DCPIP) en presencia de cantidades catalíticas de metosulfato de fenazina (17). Aunque
DCPIP solo se reduce lentamente mediante una mezcla de extracto crudo y formiato, en
presencia de pequeñas cantidades de metosulfato de fenazina se reduce a una velocidad que
corresponde a la velocidad observada con azul de metileno. Este ensayo no implica un flujo
indirecto de electrones a través del citocromo b1, ya que el citocromo bi reducido no es oxidado
por el metosulfato de fenazina en nuestras preparaciones y el deshidrogenasa de formiato
puede analizarse mediante mutantes que carecen de citocromo b1.
TABLA 1. Reducción de nitrato con varios donantes de electrones
● Las células inducidas por nitrato se cultivaron y trataron como se describe. La reducción
de nitrato se analizó como se describe, con los siguientes niveles de donantes de
electrones en un volumen final de 2.5 ml: 48 umoles de glucosa, 48 umoles de formiato,
0.25, umoles de metil viológeno (reducido), 2.8, umoles de ditionito de sodio, 10 umoles
de ascorbato, 6 umoles de formiato.
● Expresado como micromoles de nitrato por minuto por miligramo de proteína.
TABLA 2. Actividad de formiato deshidrogenasa con varios aceptores de electrones.
Fig. 2. Espectros de citocromo de dos mutantes NR- cultivados en diferentes condiciones. Los
espectros se determinaron a temperatura de N2 líquido en suspensiones
congeladas-descongeladas de células cultivadas y preparadas como se describe. Las
concentraciones de proteína fueron 6.25 mg / ml para RB-12 (anaeróbico), 4.32 mg / ml para
RB-12 (aeróbico), 6.82 mg / ml para TW-IS (anaeróbico) y 5.72 mg / ml para TW-1S (aeróbico) .
Los efectos de HOQNO sobre la oxidación del componente citocromo bi proporcionaron
evidencia adicional de que dos citocromos distinguibles se estaban reduciendo y oxidando en
estos experimentos. Cuando se añadió 0,01 mm de HOQNO después de la reducción completa
del citocromo (Fig. 4B), solo una parte del citocromo se reoxidó con nitrato y la oxidación tuvo
lugar inmediatamente en un solo paso. Se obtuvieron resultados idénticos cuando el citocromo
se redujo solo con formiato, es decir, el segundo paso de la cinética bifásica fue completamente
inhibido por HOQNO. Además, HOQNO evitó la reducción nuevamente del citocromo oxidado
por el formiato (Fig. 4B). En contraste, la porción de citocromo b1 que fue reducida por el
ascorbato no fue impedida por el HOQNO de ser oxidada por nitrato (Fig. 4C). La adición de
más nitrato no tuvo más efecto y, en este caso, HOQNO no impidió que el formiato redujera al
menos parte del citocromo.
Para demostrar que estos resultados se debieron específicamente al comportamiento del
citocromo b555, se llevó a cabo un conjunto similar de experimentos en los que los espectros
se determinaron a temperatura ambiente con el accesorio de haz dividido para el
espectrofotómetro (Fig. 5A). El citocromo b reducido en formato mostró una banda ca, a 558
nm a temperatura ambiente, que corresponde al componente b555 (ver Fig. IB). El nitrato
reoxidó completamente el citocromo, pero cuando se agregó HOQNO a la preparación reducida
en formiato, el nitrato causó la oxidación de solo una parte del citocromo, dejando un citocromo
reducido con un máximo de absorción idéntico. Los resultados presentados en la Fig. SB
también confirmaron los resultados obtenidos con ascorbato como donador de electrones y
demostraron que está involucrado un citocromo con una absorción máxima de 558 nm a
temperatura ambiente. Los cambios cinéticos observados, por lo tanto, reflejan cambios que
ocurren específicamente en los componentes del citocromo b555.
Fig. 3. Reducción del citocromo b1 y su reoxidación por nitrato. Los cambios en el estado del
citocromo se siguieron como la diferencia en transmitancia entre λ1 (560 nm) y λ2 (540 nm) a
35 C. La escala de la izquierda muestra la escala de cambio de transmitancia observada. Las
células de HfrH se cultivaron anaeróbicamente en medio completo con nitrato de potasio al 1%,
se lavaron y se resuspendieron como se describe. La suspensión congelada-descongelada
(1,74 mg de proteína) se mezcló con tampón de fosfato de potasio 0,05 M, pH 6,8, en un
volumen final de 2,8 ml. Donde se indicó, se añadieron 3,8 umoles de NADH (0,01 ml) y 10
umoles de nitrato de potasio (0,01 ml).
Fig. 4. Reducción y oxidación del citocromo b1 y efecto del HOQNO. Las células se prepararon
y las condiciones fueron las de la Fig. 3, excepto que la suspensión de células congeladas y
descongeladas se trató con desoxirribonucleasa (2,5 µg / ml) para reducir la viscosidad. Se
añadieron formiato de sodio y ascorbato de sodio (ácido ascórbico ajustado a pH 7,0 con
hidróxido de sodio) como 0,01 ml de soluciones 1,0 M a 4,0 ml de suspensión celular (4,8 mg /
ml).
Fig. 6. Autooxidación del citocromo b1 y efecto de HOQNO. Las células se prepararon como en
la Fig. 4 y se usaron a una concentración de proteína de 2,3 mg / ml. Los espectros de
diferencia se determinaron a temperatura ambiente con el espectrofotómetro de haz dividido.
La suspensión celular de referencia se oxidó burbujeando con aire a través de una pipeta
pasteur. (a) Suspensión celular más 8,3 pmoles de formiato de sodio por ml; (b) suspensión (a)
burbujeó con aire durante 1 min; (c) suspensión (a) más 8.3 X 10-M HOQNO, burbujeado con
aire durante 8 min; (d) suspensión celular más 0,5 umoles de formiato de sodio por ml; (e)
suspensión (d) burbujeada con aire durante 1 min: (f) suspensión (d) más 8.3 X 103 M
HOQNO, burbujeada con aire durante 1 min.
Fig. 7. Esquema sugerido para el complejo de nitrato reductasa de Escherichia coli.
DISCUSIÓN
Varios investigadores han propuesto la participación de formiato deshidrogenasa, citocromo b1
y nitrato reductasa en la reducción de nitrato por E. coli (6, 8, 17, 23). Los resultados
presentados aquí, junto con los resultados de los estudios sobre mutantes NR (17), indican que
distintas formas de estos componentes están involucradas en el sistema de reducción de
nitrato y que existe poca interacción con otras cadenas de transporte de electrones, es decir, se
produce la reducción de nitrato principalmente por la operación secuencial de formiato
deshidrogenasa, citocromo b555 y nitrato reductasa. Los investigadores de Severla han
demostrado que NADH puede servir como donante de electrones para la reducción de nitrato
en extractos de E. coli sin células (2, 5, 6, 13). Sin embargo, los mutantes NR- que carecen de
formiato deshidrogenasa pero poseen nitrato reductasa no forman nitrito ni eliminan nitrato del
medio durante el crecimiento (datos no publicados). Sin embargo, cuando tales mutantes
alcanzan la fase estacionaria, el nitrito comienza a acumularse, lo que sugiere que NADH
puede servir como un donante de electrones para la reducción de nitrato solo en las células de
fase estacionaria. Por el contrario, el progenitor de tipo salvaje acumula grandes cantidades de
nitrito durante el crecimiento en las mismas condiciones, y esta acumulación continúa durante
la fase estacionaria. En ninguno de estos casos, el nitrito se reduce aún más, presumiblemente
porque utilizamos nitrato al 1%, una condición que suprime la formación del sistema de nitrito
reductasa en E. coli (2). El papel específico de la actividad de nitrato reductasa ligada a NADH
y su relación con la actividad de nitrato reductasa asociada con la formiato deshidrogenasa es,
actualmente, desconocida.
La formiato deshidrogenasa involucrada en la reducción de nitrato parece ser distinta de la
formiato deshidrogenasa involucrada en el sistema de formiato deshidrogenasa. Esta distinción
se basa en parte en la especificidad del aceptor de electrones de la formiato deshidrogenasa
asociada con estos dos sistemas (5), pero está más claramente demostrado por la existencia
de un sistema de formiato deshidrogenasa funcional y una formato deshidrogenasa específica
de viológenos bencílicos en mutantes NR que carecen de el formiato deshidrogenasa
específica de metano sulfatos de fenazina asociada con la reducción de nitrato. El hecho de
que algunos mutantes NR- carezcan de estas dos deshidrogenasas de formiato, como se
muestra aquí y por otros (14, 22), sugiere que ambas actividades dependen de un elemento
genético común, quizás el gen estructural de la deshidrogenasa de formiato. Si ambos están
especificados por el mismo gen, las variaciones genéticas y fisiológicas observadas para las
dos deshidrogenasas de formiato deben ser el resultado de una interacción y asociación del
producto génico con distintos componentes de transporte de electrones. Una interpretación
alternativa es que ambas actividades se pierden como resultado de alguna alteración
pleiotrópica que afecta los componentes de la membrana de la célula (1). En cualquier caso,
una comprensión clara de las variaciones genéticas observadas para las formiato
deshidrogenasas requerirá un análisis genético y bioquímico detallado de esta enzima y su
participación en distintas vías.
El esquema de la Fig. 7 se propone para explicar la interacción del citocromo b específico de
nitrato, con los diferentes donantes de electrones, su oxidación por nitrato y los efectos del
inhibidor HOQNO en estos procesos. Varios de los hechos presentados aquí sugieren que dos
componentes distintos del citocromo b555 se oxidan con nitrato. (i) El nitrato provoca una
oxidación bifásica del citocromo b555 reducido en formiato. (ii) El ascorbato, un donante de
electrones de potencial redox moderadamente alto, redujo solo una parte (aproximadamente
50%) del citocromo b555 específico de nitrato que reduce el ditionito o el formiato. (iii) HOQNO
inhibe la oxidación de solo una parte (aproximadamente 50%) del citocromo b555 reducido en
formiato por nitrato, pero no inhibe la oxidación del citocromo b555 reducido por ascorbato por
nitrato. Estas observaciones, junto con el hecho de que HOQNO inhibe completamente la
reducción de nitrato por el formiato, se explican más fácilmente por la propuesta en la Fig. 7 de
que dos componentes del citocromo b555 con diferentes potenciales de oxidación-reducción
funcionan secuencialmente en la transferencia de electrones del formiato a nitrato. Mientras
que el ditionito y el formiato (a través del formiato deshidrogenasa) reducirían ambos
componentes, el ascorbato reduciría solo el segundo componente del citocromo.
Los efectos selectivos de HOQNO resultarían de su inhibición de la transferencia de electrones
entre los dos componentes del citocromo. La cinética bifásica de la oxidación por nitrato se
debería a la capacidad del formato, siempre que esté presente, para mantener el citocromo I
reducido incluso en presencia de citocromo II oxidado.
Tal modelo podría explicar por qué muchos mutantes NR que carecen de nitrato reductasa o
formiato deshidrogenasa también exhiben niveles disminuidos pero intermedios del citocromo
b555 (17); yo. e., uno u otro de los dos componentes del citocromo podrían no formarse.
Además, los informes de que el citocromo b1 está asociado tanto con la formiato
deshidrogenasa (7, 11) como con la nitrato reductasa (9) después de que estas enzimas se
hayan resuelto una de otra pueden explicarse suponiendo que un componente del citocromo b1
permanece asociado con la formiato deshidrogenasa y el otro con nitrato reductasa durante los
procedimientos de purificación.
Está claro que los componentes del citocromo b555 específicos de nitrato son distintos del
componente del citocromo b555 formado en condiciones aeróbicas, ya que los mutantes NR
que carecen del citocromo b555 inducido por nitrato todavía forman componentes normales del
citocromo b1 en condiciones aeróbicas. Estas observaciones no establecen si ese es el mismo
citocromo b1 asociado con diferentes componentes o si E. coli especifica una serie de
componentes distintos del citocromo b1 para varios sistemas de transporte de electrones. En
cualquier caso, la formación de componentes del citocromo debe estar específicamente
regulada por los otros componentes catalíticos con los que están normalmente asociados.
Esa reducción de nitrato es catalizada por un complejo de enzimas físicamente asociado que
solo puede establecerse mediante el aislamiento de la unidad catalítica. Sin embargo, la
asociación de la membrana de los componentes, la existencia de mutaciones pleiotrópicas que
afectan las actividades y la aparente falta de interacción de este sistema con otras cadenas de
transporte de electrones argumentan la existencia de dicho complejo.
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