Metabolismo
Metabolismo
Metabolismo
CATEDRA:
QUÍMICA CARTILLA DE METABOLISMO CELULAR
BIOLÓGICA
EL METABOLISMO
Es definido brevemente, como la suma total de las reacciones enzimáticas que tienen
lugar en la célula. Cuatro son las funciones específicas del metabolismo
Obtener energía química del entorno de los elementos orgánicos nutritivos o de la
luz solar.
Convertir los elementos nutritivos exógenos en los precursores de los
componentes moleculares de las células.
Reunir los precursores para formar proteínas, ácidos nucleicos, lípidos y otros
componentes celulares.
Formar y degradar aquellas biomoléculas necesarias para las funciones celulares
especializadas.
Catabolismo y anabolismo
Fase III: Los productos formados en la fase II pasan a la fase III que es el
camino común final en el cual se oxidan a CO 2 H2 O .
El anabolismo tiene lugar también en tres fases, comenzando por las pequeñas
moléculas originadas en la tercera fase del catabolismo. Por ejemplo, la síntesis proteica
comienza en La Fase III, a partir de los alfa-cetoácidos que son los precursores de los
aminoácidos. En la Fase II los alfa-cetoácidos son aminados por donadores de grupos
aminos y se forman los alfa-aminoácidos y en la Fase I se reúnen los aminoácidos para
producir cadenas peptídicas.
Aunque los caminos del catabolismo y el anabolismo no son idénticos la Fase III
constituye un camino central accesible a ambos. Esta senda central, que recibe el
nombre de anfibólica, desempeña una doble función (amphi: ambos).
Fase I
Ácidos grasos Hexosas
Aminoácidos
glicerina Pentosas
Gliceraldehído
3-fosfato
Fase II
Fosfoenol
piruvato
Piruvato
Acetil - C o A
citrato
oxalacetato
isocitrato
Fase III malato
LA ENERGÍA EN LA CÉLULA
Las moléculas orgánicas complejas, tales como la glucosa contienen mucha energía
potencial a causa de su elevado grado de ordenación estructural. Cuando la molécula de
glucosa se oxida y forma seis moléculas de CO 2 y seis de H2 O , sus átomos
experimentan un aumento en el desorden. Como resultado de esta transformación, la
molécula de glucosa experimenta una pérdida de energía libre que es energía útil y
capaz de realizar trabajo. La energía libre se conserva, como energía química,
específicamente como ATP. Dado que el ATP formado puede difundirse hacia aquellos
lugares en la célula en que se necesite su energía, constituye una forma de transportar
la energía.
La regulación de una ruta metabólica puede llevarse a cabo a varios niveles. El tipo de
regulación más sencilla implica los parámetros que afectan a las velocidades de las
reacciones enzimáticas (pH, concentración de enzima, concentración de cada
intermediario, concentración de iones metálicos y coenzimas esenciales, etc.). El
segundo mecanismo general de regulación consiste en la acción de enzimas
reguladoras que se hallan localizadas, habitualmente, en el comienzo o en proximidades
de una secuencia multienzimática. El tercer nivel en que se ejerce la regulación
metabólica es a través del control genético de la velocidad de la síntesis enzimática. En
organismos multicelulares superiores el control se ejerce a través de sistemas
endocrinos. Las hormonas elaboradas por una glándula endocrina son mensajeros
químicos que estimulan o inhiben actividades metabólicas específicas en otros tejidos u
órganos.
El sistema ATP - ADP actúa como transportador de energía química, ya que el ADP es
capaz de aceptar un grupo fosfato en las reacciones acopladas productoras de energía
del catabolismo, y el ATP así formado puede ceder su grupo fosfato terminal, en otras
reacciones acopladas que requieren energía.
En este capítulo examinaremos los principios químicos y termodinámicos en que se
basa el funcionamiento del sistema ATP - ADP.
El ATP, el ADP y el AMP no son sustancias que existen solo en trazas; la suma de sus
concentraciones en la fase acuosa de los diversos tipos de células intactas oscila entre 2
y 15 mM. La concentración de ATP es por lo común, muy superior a la suma de las otras
dos concentraciones del AMP, habitualmente es la menor de las tres.
Estos nucleótidos están presentes no sólo en el citoplasma, sino también en organelas
tales como mitocondrias y núcleo. La compartimentación intracelular del sistema ATP
constituye una característica importante en la regulación celular del metabolismo.
NH2
N
N ATP
N N
O O O
HO P O P O P OH2 C O
OH OH OH
H H
H
H : hidrógenos que cede en su disociación
OH OH
Una descripción de las bases físico-químicas de la función del ATP en el ciclo energético
de la célula, requiere un breve repaso de algunos principios de la termodinámica. El
análisis termodinámico de los intercambios energéticos se inicia por las siguientes
definiciones:
a. Sistema: Es el conjunto de materia que es objeto de nuestro estudio.
b. Entorno: Toda materia del universo, aparte del sistema que se considera.
En el transcurso del proceso en estudio la energía puede pasar del sistema al
entorno, o viceversa.
c. Estado inicial: Es el contenido de energía del sistema y del entorno, al iniciar
el proceso que se analiza.
d. Estado final: Contenido de energía de sistema y entorno una vez que se ha
alcanzado el equilibrio.
El contenido de energía de cada estado es una función de diversas magnitudes
medibles (temperatura, presión, volumen, masa, etc.) que se formulan mediante una
ecuación de estado. A partir de las medidas de los cambios de contenido de energía del
sistema y el entorno, a medida que el sistema evoluciona desde su estado inicial hasta
su estado final, puede realizarse un balance de energía.
(Bloques de cobre)
Estado de equilibrio
Un sistema de equilibrio
irreversible
reversible
espontáneo
endotérmico
exotérmico
G H - T. S (1)
El cambio de energía libre que tiene lugar durante las reacciones químicas se calcula
empleando una ecuación que puede derivarse de la ley de equilibrio químico. Para una
reacción general del tipo:
aA + bB cC + dD (3)
ordenado
desordenado
Las reacciones con un cambio de energía libre estándar positivo reciben el nombre
de endergónicas o endotérmicas, no se realizan de modo espontáneo en la dirección en
que se escriben. Volviendo al ejemplo:
desordenado
ordenado
ΔGº (kcal)
Fosfoenol piruvato ………………………. - 14.80
1-3 difosfoglicerato ……………………... - 11.80
ΔGº ATP
Fosfocreatina …………………………….. - 10.30
Acetil-fosfato ……………………………..- 10,10
Fosfoarginina …………………………….. - 7.70
O sea que la función del sistema ATP-ADP, consiste en servir como transportador
obligatorio intermedio de grupos fosfato desde los compuestos con enlaces fosfato de
elevado nivel energético, situados por encima del ATP en la escala termodinámica,
hasta las moléculas aceptoras que forman compuestos con enlaces fosfato de bajo nivel
energético situados en la escala por debajo del ATP.
Hay dos clases de compuestos fosforilados que poseen una ΔGº de hidrólisis más
negativa que la del ATP:
1. Los compuestos fosfato que se forman durante la ruptura enzimática de
moléculas combustibles.
2. Los compuestos fosfato utilizados como almacenadores de la energía del enlace
fosfato.
Los dos miembros más importantes de la primera clase son el 1-3 difosfoglicerato y el
fosfoenol piruvato, los cuales se forman durante la fermentación anaerobia de la glucosa
(glucólisis).
Fosfoenol piruvato
Dadores de P de alta energía
P
Reservorio de fosfocreatina
1-3 difosfoglicerato
P
P
ATP
P
Aceptores de P Glucosa_6_fosfato
de baja energía P
Glicerol_3_fosfato
PPi + H2O 2 Pi
Esta hidrólisis secundaria del pirofosfato constituye una etapa valiosa de liberación de
energía, la cual se utiliza para asegurar que ciertas reacciones biosintéticas se realicen
por completo.
Vamos a considerar los mecanismos por los que las moléculas combustibles se
degradan y su energía se conserva en forma de energía de enlace fosfato ATP.
Se estudiarán los procesos conocidos como fermentación, mediante el cual muchos
organismos extraen energía química de la glucosa y otros combustibles en ausencia de
oxígeno molecular.
Nos referimos primeramente el proceso de fermentación para luego poder hablar de
respiración y fotosíntesis.
Fermentación y respiración
Anaerobios Aerobios
glucosa glucosa
sin O2 fermentación
CO2 + H2O
1. Glucosa 2. Glucosa
C C C C C C C C C C C C
triosas triosas
C C C C C C C C C C C C
En estas reacciones tenemos que hablar de las reacciones de óxido reducción que se
producen en todo organismo donde el agente oxidante recibe los electrones y el agente
reductor entrega electrones.
En este caso de la fermentación alcohólica el etanol es una molécula relativamente
reducida rica en H 2 , pobre en O 2 . La molécula de CO 2 es relativamente oxidada, pobre
en H 2 .
En el caso de la fermentación homoláctica el grupo metilo se halla más reducido que el
grupo carbonilo. Veamos la reacción completa:
O
C
H CH3
HC OH
HOC H + 2 Pi + 2 ADP 2 CH OH + 2 ATP + 2 H2O
HC OH COOH
HC OH
CH2 OH
ETANOL
LA FASE II: Es la ruta común para todos los azúcares, se produce la fosforilación
del ADP y se llevan a cabo las reacciones de óxido reducción, obteniéndose el
lactato.
Mg++
ATP + glucosa ADP + glucosa-6-P Gº 4 kcal
O O
H H H H
H H
+ ATP ADP + ΔGº -4 kcal
OH H OH H
OH OH OH OH
H OH H OH
glucosa glucosa-6-fosfato
CH2 OPO3=
CH2 OPO3=
O O
H H CH2 OH
H
H OH H OH
glucosa-6-P fructosa-6-P
H OH H OH
1. CH2 OPO3=
2. C O H
1. CH2 OPO3= 4. C O
3. HO CH
ΔGº 5.73 kcal
2. C O + 5. H COH
4. H COH
3. CH2 OH 6. CH2 OPO3=
5. H COH
6. CH2 OPO3=
Solamente uno de los dos fosfatos de triosa, el gliceraldehído 3-fosfato, puede ser
directamente degradado en las reacciones posteriores de la glucólisis. El otro, el fosfato
de dihidroxiacetona, se convierte reversiblemente en gliceraldehído-3-fosfato por acción
de la enzima triosa fosfato isomerasa.
O
CH2 OPO3= C
H
ΔGº 1.83 kcal
C O H C OH
GLUCÓLISIS ANAEROBIA
GLUCÓLISIS AEROBIA
Las células aerobias obtienen la mayor parte de su energía de la respiración, esto es,
gracias a una transferencia de electrones desde les moléculas orgánicas combustibles
hasta el oxígeno molecular. La respiración es mucho más compleja que la glicólisis.
En este tema se esboza el plan general de la respiración y después se considera con
detenimiento el ciclo de los ácidos tricarboxílicos o ciclo de Krebs, que es la ruta
catabólica común por la que finalmente se degradan todas las moléculas combustibles
de la célula (carbohidratos, ácidos grasos y aminoácidos).
También se describe la ruta del fosfogluconato de oxidación de la glucosa, mecanismo
que genera NADPH2 para las reacciones biosintéticas.
Cuando las células fermentan a la glucosa anaerobiamente, los productos que ya no son
susceptibles de ulterior empleo, y por ello abandonan la célula, todavía contienen la
mayor parte de la energía de la molécula de glucosa original. Por esta razón, las células
que viven anaerobiamente, para obtener una misma cantidad de energía utilizable tienen
que consumir mucho más glucosa que cuando viven en condiciones aerobias.
En primer lugar, el producto de la glicólisis, el lactato, es una molécula casi tan compleja
como la glucosa y sus átomos de carbono todavía se hallan en un mismo estado de
oxidación. El CO 2 , producto de la respiración, es una molécula mucho más sencilla y
pequeña que la glucosa, y su átomo de carbono está completamente oxidado.
En la figura del diagrama de la respiración verán que los grupos acetilo procedentes de
los carbohidratos, de los lípidos y de los aminoácidos en la fase II del catabolismo, en la
siguiente fase III se incorporan al ciclo de Krebs, que en las aerobias constituye la ruta
común final del catabolismo oxidativo de todas las moléculas combustibles. En este ciclo
los grupos acetilo se desintegran para formar CO 2 y átomos de hidrógeno. Estos últimos
(o sus electrones equivalentes) posteriormente se incorporan a la cadena respiratoria
constituida por una serie de transportadores electrónicos.
En cada vuelta del ciclo de Krebs se incorpora una molécula de acetil CoA (dos átomos
de carbono) por condensación con una molécula del compuesto de cuatro carbonos, el
oxalacetato, para formar citrato de seis átomos de carbono.
Posteriormente, citrato se degrada con producción de dos moléculas de CO2 y
succinato, compuesto de cuatro átomos de carbono. Finalmente, este último se oxida a
oxalacetato, con lo que puede iniciarse de nuevo una vuelta del ciclo. En cada una de
las vueltas se incorpora una molécula de acetil CoA y se eliminan dos moléculas de CO 2
en cada giro completo se emplea también una molécula de oxalacetato para formar
citrato, pero aquel se regenera al final del ciclo.
Las reacciones enzimáticas del ciclo de Krebs tienen lugar en el compartimiento interno
de la mitocondria (a diferencia de la glucolisis que tiene lugar en el citoplasma celular).
Carbohidrato
Acetil-CoA
oxalacetato citrato
cis-aconitato
Ciclo del ácido malato
isocitrato
tricarboxilo CO2
fumarato -oxoglutarato
CO2
succinato
2H 2H 2H 2H
NAD
flavoproteina
ADP + Pi ATP
coenzima Q
Transporte electrónico
y fosforilación citocromo c
oxidativa ADP + Pi ATP
citocromo b
citocromo a + a3
+
ADP A Pi ATP
2 H+ + 1/2 O2 H2O
O
Piruvato
CH3 C COOH
NAD+ NADH2
HS-CoA CO2 O
CH3 C S CoA + CO2
Acetil-CoA
Piruvato-deshidrogenasa
enzimas dihidrolipoil-transacetilasa
dihidrolipoil-deshidrogenasa
Sistema de la
piruvato-deshidrogenasa Coenzima A
ácido lipoico
coenzimas Pirofosfato de tiamina (TPP)
NAD
FAD
O
CH3 C S CoA CoA SH
COOH
COOH CH2
Acetil-CoA citrato
C O HO C COOH
oxalacetato
CH2 CH2
COOH COOH
En esta reacción el grupo metilo (CH 3 ) de la acetil CoA se condensa con el átomo de
carbono carbonílico del oxalacetato con la hidrólisis del enlace tioéster y formación de la
CoA SH libre.
O
C
2. Actúa una enzima, la aconitasa que cataliza la formación de isocitrato con formación
de un compuesto intermedio el cis-aconitato. En esta reacción se produce pérdida, y
posterior adición de agua.
OH H2O
COOH COOH
citrato cis-aconitato
H2O
COOH CH2 CH CH COOH
COOH OH
isocitrato
CO2 O
COOH CH2 CH CH COOH COOH CH2 CH2 C COOH
COOH OH NAD+
NADH2
isocitrato alfa-cetoglutarato
succinato fumarato
6. Se produce una hidratación del fumarato dando malato, actuando coma catalizador la
fumarasa.
OH
COOH CH CH COOH + H2O COOH C CH2 COOH
H Malato
Fumarato
OH O
+
COOH C CH2 COOH + NAD COOH C CH2 COOH + NADH2
H
Malato Oxalacetato
Podemos ahora resumir los productos producidos en una vuelta del ciclo del ácido
tricarboxílico.
Dos átomos de carbono aparecen en forma de CO 2 equivalentes, aunque no idénticos, a
los dos átomos de carbono del grupo acetilo que ingresa en el ciclo. Por
deshidrogenación enzimática se producen cuatro pares de átomos de hidrógeno, tres
pares se utilizan para reducir el NAD y uno para reducir el FAD.
En último término, estos cuatro pares de átomos de hidrógeno y electrones se
combinan con el oxígeno, una vez realizado su transporte a lo largo de la cadena
respiratoria.
Las diversas etapas de la ruta del fosfogluconato tienen lugar en la porción soluble del
citoplasma extramitocondrial de la célula.
H C OH C O COOH
H2O
H C OH H C OH H C OH
+ +
O + NADP O + NADP
HO C H HO C H HO C H
H C OH H C OH HC OH
H C H C HC OH
CH2 OH
COOH C O
H C OH
H COH
H C OH
+ NADP+ H COH + NADPH2 + CO2
HO C H
CH 2OPO3=
H C OH
CH 2OPO3=
6-fosfogluconato ribulosa-5-fosfato
CH2 OH
C O
HO C H xilulosa-5-fosfato
CH2 OH
HC OH
C O sa
i m era CH 2OPO3=
ep
H C OH
CHO
H C OH
iso HC OH
me
CH 2OPO3= ras
a
H C OH ribosa-5-fosfato
ribulosa-5-fosfato
H C OH
CH 2OPO3=
C O HCOH C O
HO C H + H C OH HO C H + CHO
H C OH H C OH HC OH HC OH
HC OH
CH2 O PO3=
C O C O
HO C H CHO HO C H CHO
H C OH + H C OH H C OH + HC OH
H C OH CH2 O PO3= H C OH HC OH
CH2 O PO3=
H C OH CH2 O PO3=
CH2 O PO3=
Fructuosa 6P Eritrosa 4P
Una consecuencia importante de la acción de las dos enzimas, consiste en que hacen
posible, junto con las enzimas de la secuencia glicolítica la interconversión de los
azúcares.
La última parte de la vía del fosfogluconato no es bien definida, no conduce a un único
producto final, sino a una ruta ramificada, capaz de gran flexibilidad metabólica.
Veremos en este capítulo que los pares de electrones derivados de los intermediarios
del ciclo de Krebs fluyen a lo largo de una cadena de varios eslabones, constituidos por
enzimas de transporte electrónico hasta reducir al oxígeno molecular, que es el último
aceptor electrónico, en la cadena.
Durante este proceso se conserva gran parte de la energía libre de estos electrones en
forma de energía del enlace fosfato del ATP; el proceso se denomina fosforilación
oxidativa.
El transporte electrónico y la fosforilación oxidativa suceden en casi todas las células
aerobias, las enzimas que catalizan estas reacciones se hallan localizadas en la
membrana interna de las mitocondrias.
Reacciones de oxidación-reducción
H H H H
H2O -2H H2O -2H
H C H H C OH H C O H C O CO 2
-2H -2H
H H
ácido anhídrido
metano metanol metanal carbónico
metanoico
pérdida de oxígeno
reducción ganancia de electrones
ganancia de hidrógeno
CILO DE KREBS
Tres son las clases principales de enzimas que participan de la corriente del transporte
electrónico desde los sustratos orgánicos hasta el oxígeno molecular.
De acuerdo al orden en que participan son los siguientes:
1. Deshidrogenasas ligadas a la piridina que requieren NAD o NADP como coen-
zima. Participan en la primera parte del eslabón:
cit. b c a+ a3
Los citocromos tienen grupos prostéticos hierro porfirínicos. El anillo porfirínico deriva
del compuesto tetrapirrólico llamado porfina que se designa según sus cadenas laterales
sustituyentes.
Se produce una variación de energía libre muy grande durante el proceso de transporte
electrónico desde el NADH2 hasta el oxígeno molecular, a través de la cadena
respiratoria. Este valor puede compararse con la energía libre estándar de formación de
ATP a partir del ADP y el fosfato.
Las variaciones de energía libre estándar en otros puntos de la cadena son pequeñas y,
por ello resultan insuficientes para provocar la formación de una molécula de ATP.
Sólo se formarán 3 moléculas de ATP si el sustrato se oxida a nivel del NAD. Puede
ocurrir que el sustrato entregue sus electrones a la flavoproteina FAD (por ej. succinato)
en este caso se producen 2 moléculas de ATP; y si entrega sus electrones al citocromo
a, (por ej. ácido ascórbico) se forma solamente una molécula de ATP.
2.
2 piruvato 2 acetil CoA
Resumiendo:
a ………….. 6 ATP
b ………….. 6 ATP
c ………….. 6 ATP
d ………….. 4 ATP
e ………….. 2 ATP
24 TP
4. El NADH2 que se produce en la glicólisis en el pasaje de gliceraldehído
3 P 3 P glicerato , cuando el proceso es anaerobio se reoxida en el pasaje de
piruvato lactato .
Cuando el proceso es aerobio el NADH2 se reoxida en la cadena respiratoria, por lo
tanto se producen 2 ATP x 2 (porque son dos moléculas de NADH2) = 4 ATP. O sea que
el balance global será:
1. ………….. 2 ATP
2. .………….. 6 ATP
24 glucosa + 6 O2 + 36 Pi + 36 ADP
3. …………..
ATP
6 CO2 + 36 ATP + 42 H2O
4. ………….. 4 ATP
36
ATP
componente endergónico
36 Pi + 36 ADP 36 ATP + 36 H2O Gº 263 kcal
Los ácidos grasos que experimentan oxidación en los tejidos de los animales superiores
provienen del fluido extracelular o bien de los lípidos intracelulares endógenos. La
sangre de los vertebrados contiene cantidades considerables de triacilgliceroles y de
fosfoglicéridos, así como cantidades muy pequeñas de ácidos grasos libres unidos a la
proteína seroalbúmina, que actúa transportando los ácidos grasos. Estos últimos son
oxidados en tejidos tales como el corazón y el músculo.
La fuente endógena principal de ácidos grasos combustibles es grasa de depósito, en
foma de gotitas de grasa del citoplasma, constituido, en su mayor parte por
triacilgliceroles.
Resumiendo lo expuesto:
Ácidos grasos a
oxidarse provienen 1. grasa de depósito constituida
por triacilgliceroles.
b. fuente endógena
2. fosfoglicéridos de las
membranas
A. Hidrólisis intracelular
Los ácidos grasos deben hallarse en forma libre, es decir, no esterificados para que
puedan experimentar el proceso de activación y oxidación. Para ello, deben en primer
lugar, hidrolizarse por la acción de lipasas intracelulares para rendir ácidos grasos libres
y glicerina.
Tres enzimas diferentes catalizan la formación de ésteres acil-CoA graso; cada una de
ellas se específica para un determinado intervalo de longitud de cadena de ácido graso.
Las últimas dos tioquinasas activan tanto los ácidos grasos saturados como los no
saturados. Las tres se encuentran en la membrana exterior de la mitocondria. La
reacción global catalizada por las tioquinasas ligadas al ATP es la siguiente:
A medida que el enlace tioéster se forma entre el grupo carboxilo del ácido graso y el
grupo tiol de la CoA, el ATP experimenta ruptura pirofosfórica y rinde AMP PPi . A su
vez el PP i formado resulta hidrolizado por la pirofosfatasa inorgánica.
PPi + H2O 2 Pi
Transferencia de carnitina
Los ácidos grasos superiores poseen una capacidad limitada para atravesar la
membrana interior de la mitocondria en forma de ésteres de CoA; pero su entrada es
estimulada por la carnitina. En el proceso actúa una enzima la acil-CoA graso: carnitin
transferasa de ácido graso, que cataliza la transferencia del grupo acilo graso desde su
enlace tioéster con la CoA, a un enlace éster con la carnitina que es un enlace de
elevada energía.
CH3 O
+
CH3 N CH2 CH CH2 COOH + R C S CoA
CH3 OH
CH3
+
CH3 N CH2 CH CH2 COOH + CoA SH
CH3 O
C O
En la última etapa del proceso de penetración, el grupo acilo graso es transferido desde
la carnitina a la CoA intramitocondrial por acción de la carnitín-transferasa de ácido
graso intramitocondrial.
2 3
R CH2 CH2 C SCoA acil-graso CoA
E FADoxi.
H O
El enlace no saturado formado entre carbonos alfa y beta en esta reacción es el isómero
geométrico trans. Los electrones del FADH2 son cedidos a la cadena respiratoria.
O
O
Balance de la oxidación
La ecuación global de una vuelta de la secuencia de oxidación del ácido graso actuando
sobre el palmitoil-CoA es la siguiente:
Ahora podemos escribir la ecuación para las siete vueltas del espiral necesarias a fin de
convertir una molécula de palmitoil-CoA en 8 moléculas de acetil CoA (el ácido palmítico
tiene 16 átomos de carbono). Cada molécula de FADH 2 cede un par de equivalentes
electrónicos a la cadena respiratoria a nivel de la CoA y se generan 2 moléculas de ATP.
Las 8 moléculas de acetil CoA formadas en el ciclo del ácido graso pueden
incorporarse ahora al ciclo de Krebs
Puesto que se necesita una molécula de ATP (o de GTP) para activar el ácido palmítico
libre al comenzar, podemos suponer que el rendimiento neto de ATP es de 130
moléculas.
Los ácidos grasos no saturados, son oxidados por las mismas rutas generales que los
ácidos saturados; pero se plantean dos problemas:
1. Los dobles enlaces de los ácidos grasos no saturados existentes en la
naturaleza se hallan en la configuración geométrica cis, mientras que los
ésteres del acil graso CoA que actúan como intermediarios en la oxidación
de los ácidos grasos saturados, son trans.
2. Los dobles enlaces de la mayor parte de los ácidos grasos no saturados
aparecen en posiciones tales que la eliminación sucesiva de fragmentos de
dos átomos de carbono rinde un acil-CoA graso con posición del enlace
entre carbonos 3 y 4 en lugar de 2 y 3.
Se ha resuelto este problema con el descubrimiento de una enzima auxiliar, la 3-4-cis-2-3-trans-enoil CoA-
isomerasa que cataliza el desplazamiento del doble enlace desde la configuración 3-4-cis a la 2-3-trans
que es el sustrato normal de la siguiente enzima de la secuencia de oxidación del ácido-graso.
CH3 O
OH
Proteólisis
Antes que las proteínas puedan incorporarse a las rutas catabólicas deben experimentar
hidrólisis completa hasta transformarse en aminoácidos ya que las moléculas proteicas
intactas y la mayoría de los péptidos no pueden atravesar la membrana celular, mientras
que los aminoácidos libres son absorbidos fácilmente.
Por acción combinada de las enzimas proteolíticas segregadas por el estómago, el
páncreas y el intestino delgado, las proteínas ingeridas se hidrolizan por completo hasta
aminoácidos, los cuales son absorbidos por las células epiteliales del intestino delgado,
mediante un transporte activo que requiere energía. Los aminoácidos son enviados
luego a los tejidos por medio de la sangre. Al entrar en las células individuales también
por transporte activo, se incorporan a los canales metabólicos.
Alanina
Arginina
Cisteína Glutamato
Piruvato Histidina
Glicocola
Glutamina
Serina
Prolina
Treonina
Oxoglutarato
Isocitrato
Isoleucina
Leucina Isoleucina
Triptófano Succinil-CoA Metionina
Citrato Valina
Acetil-CoA Succinato
Oxalacetato Tirosina
Fumarato
Acetoacetil-CoA
Fenilalamina
Malato
Aspartato
Fenilalanina
Asparagina
Tirosina
Leucina
Lisina
Triptófano
Los grupos -amino de los aminoácidos comparten un destino común, al menos en los
vertebrados, los cuales excretan el N 2 amínico en forma de Urea, Amoníaco o de Ácido
Úrico, según la especie.
Esquema de transaminación
Desaminación oxidativa
Descarga así en forma de iones NH 4 , los grupos aminos recogidos de los demás
aminoácidos. La glutamato deshidrogenasa puede usar también el NADP como aceptor
de electrones, el NADPH2 así formado, actúa como reductor en las reacciones
biosintéticas. La mayor parte de los organismos tienden a reutilizar el NH 4 formado en el
catabolismo de los A.A. recuperándolo.
Glutamato deshidrogenasa
Treonina
Cistina
Glicocola
Ácido Pirúvico
Acetil-CoA
El esquema muestra los portales de entrada por los que penetran en el ciclo de los
ácidos carboxílicos, los esqueletos carbonados de los diferentes aminoácidos. Las rutas
de los 20 A.A. dependen del punto de entrada. El punto principal de entrada en el ciclo
es por la vía del acetil-CoA, diez aminoácidos penetran por esta ruta, cinco de ellos se
degradan al acetil-CoA por la vía del piruvato y los restantes por la del acetoacetil-CoA.
NH2
CH3 CH CH COOH
OH
Treonina
O
Glicocola H2N CH2 COOH CH3 C
H acetaldehído
Serin-
hidroximetil
CH OH tranferasa
NH 2 NAD+
ATP
Serina CH2 CH COOH CoA
OH Serina
deshidrasa
O
Acetil CoA
Los cinco aminoácidos que penetran por la vía del piruvato son la alanina, la cisteína, la
glicocola, la serina y la treonina (ejemplo anterior). La alanina rinde directamente
piruvato por transaminación con el -cetoglutarato. En el ejemplo puede verse como se
degradan hasta piruvato, la treonina, la glicocola y serina.
Arginina Prolina
Semialdehído
glutámico
Histidina Glutamina
Ácido Glutámico
cetoglutar ato
El esquema muestra las rutas que conducen hasta el -cetoglutarato de los distintos
A.A. para poder entrar al ciclo de Krebs.
METIONINA
Ácido oxobutírico
Isoileucina
Propionil-CoA
Valina
Metilmalonil-CoA
Succil-CoA
CICLO DE LA UREA
La formación de urea tiene lugar casi por completo en el hígado de los organismos
ureotélicos, es catalizada por un mecanismo cíclico denominado ciclo de la urea.
Penetran en este ciclo dos grupos aminos que proceden inicialmente de los -
aminoácidos por desaminación, junto con una molécula de CO 2 y forman arginina a
partir de la ornitina. Esta parte del ciclo de la urea tiene lugar en casi todos los
organismos capaces de realizar la biosíntesis de la arginina pero solamente los animales
El primer grupo NH 2 que entra al ciclo surge en forma de NH 3 libre como consecuencia
de la desaminación oxidativa ligada al NAD del glutamato en las mitocondrias.
-
O O
-
CO2 + NH3 + 2 ATP + H2O H2N C O P O + ADP + Pi
O
Fosfato de carbamilo
Excreción de amoniaco
NH2 O NH2
Mg++
HOOC CH2 CH2 CH COOH + NH3 + ATP H2N C CH2 CH2 CH COOH + ADP + Pi
OH
C N C N O2
N C C N C
NH 2
Amino ácidos C H
C C Xantin
C C
N N HO N N oxidasa
H
H
O H
H C N
N C
C O
C C
O N N
H H
Acido Urico
(forma oxo)
H2O
Mg++
oxalacetato + GTP fosfoenol-piruvato + CO2 + GDP
enolasa
fosfoenol-piruvato + H2O 2-fosfoglicerato
(1)
2-fosfoglicerato 3-fosfoglicerato
(2)
ATP + 3-fosfoglicerato ADP + 1,3-difosfoglicerato
(3)
1-3 difosfo-glicerato + NADH2 gliceraldehido-3-fosfato + NAD+ + Pi
(4)
gliceraldehído-3-P dihidroxiacetona-P
(5)
gliceraldehído-3-P + dihidroxiacetona-P fructosa-1-6-di P
Sin embargo la producción de glucosa libre es inducida por la glucosa 6 fosfatasa, que
cataliza la siguiente reacción exergónica de hidrólisis.
Resumiendo:
Por cada molécula de glucosa que se forma se consumen seis enlaces fosfato de alto
valor energético y se requiere dos moléculas de NADH2 como reductor.
Dijimos anteriormente que la síntesis de glucosa podría tener varios precursores. Entre
ellos los principales son los productos intermedios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos
que pueden experimentar oxidación a malato. Entonces el malato puede abandonar las
mitocondrias y experimentar su oxidación a oxalacetato en el citoplasma
extramitocondrial; donde tiene lugar la formación de fosfoenol-piruvato por la acción de
la fosfoenolpiruvato-carboxiquinasa del citoplasma. Tres átomos de carbono de los
distintos intermediarios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos se convierten, finalmente en
tres átomos de carbono del fosfoenol-piruvato. Estos carbonos proceden de los átomos
alfa-carboxílicos (alfa-carboxílicos) y beta del oxalacetato.
Acido oxalacético.
COOH
CH2
C O
COOH
En los tejidos de los animales superiores no hay formación neta de nueva glucosa a
partir de los dos átomos de carbono del grupo acetilo del acetil CoA. Lo que sí sucede es
que la condensación de la acetil CoA con el oxalacetato de citrato que al oxidarse para
dar fosfoenol-piruvato pierde 3 átomos de C en forma de CO 2 . Se deduce que no puede
formar más glucosa que el oxalacetato. En los tejidos animales la acetil CoA no puede
convertirse directamente en piruvato o en succinato. En los animales superiores no
existe senda metabólica alguna por lo que los átomos de carbono de los ácidos grasos
puedan ser utilizados para producir nueva glucosa.
Como se ha visto, algunos o todos los átomos de carbono de los distintos aminoácidos
derivados de proteínas son finalmente convertibles en acetil CoA o en intermediarios del
ciclo de Krebs. Aquellos aminoácidos que pueden servir de precursores del fosfoenol-
piruvato y por consiguiente de la glucosa son aminoácidos glucogénicos. Ej: alanina,
arginina, glicina, histidina, valina, prolina, etc. Los aminoácidos que por degradación son
capaces de formar acetoacetato se los denomina cetógenos. Ej.: leucina. La fenilalanina
y la tirosina constituyen ejemplos de aminoácidos que a la vez son glucogénicos y
cetogénicos puesto que por degradación se escinden para formar ácido fumárico
(glucogénico) y acetil CoA (cetogénico).
La ruta biosintética que conduce desde la glucosa a los ácidos grasos es importante en
la mayoría de los organismos. Puesto que la capacidad de los animales superiores para
almacenar polisacáridos es bastantes limitada la glucosa ingerida en exceso, respecto a
las necesidades calóricas inmediatas y a la capacidad de almacenaje, se convierte en
ácidos grasos, y éstos a su vez, en triacilgliceroles que pueden almacenarse en grandes
cantidades en el tejido adiposo. Constituye otro proceso importante la biosíntesis de
fosfoglicéridos de las membranas, puesto que la mayoría de las células experimentan un
recambio relativamente veloz. También se verá la biosíntesis de colesterol. Aunque
desde el punto de vista cuantitativo se trata de una vía secundaria, el gran número de
esteroles, biológicamente activos, que derivan del colesterol le confiere considerable
importancia.
Malonil transferasa
Acil transferasa
Palmitil
transferasa
Enzima condensante
( citonil sintetasa)
Deshidrogenasa
(2º reducción) SH (resto fosfopantotenil
con grupo SH terminal que
enlaza los intermediarios
acílicos)
Deshidrogenasa
Deshidratasa (1º reducción)
SH
O O
biotina
CH3 C SCoA + CO2 + ATP HOOC CH2 C S CoA
++
Mn
El CO2 se convierte en el carbono carboxílico libre distal de la malonil CoA. Los grupos
acilos de la acetil-CoA y de la malonil CoA son transferidos al grupo tiol de la ACP por
acción de dos enzimas acil-transferasa y malonil-transferasa.
O O
acil
SH + CH3 C SCoA S C CH3 + HSCoA
transferasa
Acetil CoA
Acetil-S-ACP
SH SH
O O O
malonil
S C CH3 + COOH CH2 C SCoA S C CH3 + HSCoA
transferasa
Malonil CoA
SH S
C O
CH2
COO H
Acetil Malonil-S-ACP
condensante
S
C O
CH2
C O
CH3
Acetoacetil-S-ACP
SH SH SH
SH S
C O
acil
transferasa CH2
S
CH2
C O
SH CH3
CH2
CH2
CH3
butiril-S-ACP
ácido palmitico
SH
El ácido palmítico que es el producto final normal del sistema de la sintetasa de los
ácidos grasos del citoplasma, puede prolongarse mediante dos tipos diferentes de
sistema enzimáticos: el de las mitocondrias y del retículo endoplasmático.
En las mitocondrias los ácidos grasos saturados de 12 a 16 átomos de carbono, en
forma de ésteres de la CoA, se alargan por adiciones sucesivas de acetil-CoA. La ruta
mitocondrial se realiza por inversión de las mismas etapas implicadas en la oxidación,
con excepción de la reducción del doble enlace α β que conduce al ácido graso
saturado, que se verifica a expensas del NADHP como reductor, y no de la
flavoproteína. El sistema mitocondrial es capaz de alargar también los ácidos grasos no
saturados.
En los microsomas tanto los ésteres de ácidos grasos saturados, como los de los no
saturados pueden prolongarse, pero en este caso es la malonil-CoA la fuente de grupos
acetilos.
Aunque la mayoría de los organismos tienen capacidad para formar ácido palmitoleico y
ácido oleico, la ruta y el mecanismo utilizado dependen si el organismo es anaerobio o
aerobio.
En los organismos aerobios los dobles enlaces son introducidos por una oxigenasa
específica localizada en la fracción microsómica, especialmente del hígado y del tejido
adiposo.
No se conocen detalles completos del mecanismo enzimático, pero se sabe que se
utiliza la molécula de oxígeno como aceptor de dos pares de electrones, uno de los
cuales procede del sustrato acil-CoA y el otro del NADPH, que se requiere en la
reacción.
1 par 1 par
Los cuales sufren ulterior alargamiento y/o desaturización. Los ácidos linoleicos y
linolénicos no pueden ser sintetizados por los mamíferos quienes tienen que tomarlos de
fuentes vegetales por esta razón se denominan ácidos grasos esenciales.
Los TAG, que actúan como lípidos de depósito o de almacenamiento, son activamente
sintetizados por las células hepáticas y adiposas de los mamíferos. Para la síntesis se
requieren dos precursores principales:
1.- Glicerol 3-fosfato
2.- Acil CoA graso
Etapas de la biosíntesis
- Primera etapa: Acilación de los grupos oxidrilos libres del glicerol-3-fosfato por dos
moléculas de acil-CoA graso, produciendo un ácido fosfatídico.
O
CH2 O C R
CH2 OH
O O
+ 2 R C S CoA CH O C R' + 2 HSCoA
CH OH
Acil CoA Graso
CH2 O PO3H2
CH2 O PO3H2
Glicerol 3 P Ácido fosfatídico
- Segunda etapa: El ácido fosfatídico experimenta una hidrólisis por acción de una
fosfatasa específica formando diacilglicérido.
O O
CH2 O C R CH2 O C R
O O
CH O C R' + H2O CH O C R' + Pi
O O
CH2 O C R CH2 O C R'
O O O
CH O C R' + R'' C S CoA CH O C R'' + HSCoA
O
CH2 OH CH2 O C R'''
Triacilglicérido o triglicérido
BIOSINTESIS DE FOSFOGLICERIDOS
Los principales fosfoglicéridos que sirven como componentes de las membranas y las
lipoproteínas de transporte se forman por ramificaciones de la ruta biosintética a partir
del ácido fosfatídico. Además intervienen los nucleótidos citidínicos. Todas estas
reacciones tienen lugar en el retículo endoplásmico.
1) El ácido fosfatídico con el CTP se convierte en citidín-difosfato-diacilglicérido que
es el precursor común de todos los fosfoglicéridos formados por ésta ruta.
Su porción CMP puede considerarse la portadora del ácido fosfatídico. En las reacciones
subsiguientes, cada una de las cuales es catalizada por una enzima específica la
porción CMP es desplazada por los alcoholes: serina, inositol, fosfato de glicerilo.
O
CH2 O C R
O
CH O C R'
CH2
HO P O
HO P O
CH2 O citosina
H H
H
OH OH
Acido fosfatídico
CTP
CO2 Pi
Fosfatidil-etanolamina Fosfatidil-glicerina
3 CH3- + CDP-diacilglicérido
Cardiolipina
Fosfatidil-colina
BIOSINTESIS DE COLESTEROL
El ácido mevalónico tiene seis átomos de carbono por lo que se forma por
condensación de tres moléculas de acetil-CoA.
NADPH2
hidroxi - metil - glutaril CoA ácido mevalónico + NADP + HSCoA
CH2
OH OH
C CH2 CH2 O P O P OH
O O
CH3
CH3
OH OH
C CH CH2 O P O P OH
O O
CH3
- PPi
geranil-pirofosfato + isopentenil pirofosfato farnesil pirofosfato
El escualeno sufre un ataque del oxígeno formando el 2-3 epóxido, el cual sufre una
ciclización a lanosterol en el cual se producen desplazamientos electrónicos con el
cierre de los cuatro anillos y formación de colesterol.-
Se definen a éstos como aquellos aminoácidos que pueden ser sintetizados por la rata
albina. Conviene considerar en primer lugar este grupo de aminoácidos, porque la
mayoría de los organismos pueden realizar su síntesis. Además este grupo se distingue
porque sus rutas biosintéticas son más bien cortas y muestran variaciones relativamente
pequeñas de unas especies a otras.
Las rutas biosintéticas de estos aminoácidos que están íntimamente relacionados son
idénticas en todas las formas de vida. Los tres se degradan por sendas que conducen al
cetoglutarato, y los mismos caminos que se emplean para su síntesis. El ácido
glutámico se forma desde luego a partir de NH 3 y de ácido cetoglutárico por acción de
la L-glutamato ~ deshidrogenasa.
O OH
C O P OH
CH2 O
CH2
ácido glutamil-fosfórico
H C NH2
COOH
NH2
O
H2C CH2
inhibición
H
HC C Acido 1~pirrolín
N COOH 5 carboxílico
H2C CH2
H
H2C C
N COOH
H
Prolina
ALANINA
O NH2 NH2 O
CH3 C COOH + HOOC CH2 CH2 C COOH CH3 C COOH + HOOC CH2 CH2 C COOH
H H
Acido pirúvico Acido glutámico Alanina Acido oxoglutárico
O NH2
HOOC CH2 C COOH + Acido glutámico HOOC CH2 C COOH + Acido -oxoglutámico
Acido oxalacético H
Acido Aspártico
En algunas plantas estos dos compuestos se producen por Aminación reductora. El
ácido Aspártico es el precursor directo de la asparagina. En muchos organismos ésta se
forma por una reacción similar a la catalizada por la glutamin-sintetasa.
NH2 NH2
NH2
HOOC CH2 C COOH + NH3 + ATP C CH2 C COOH + ADP + Pi
H O H
Acido Aspártico Asparagina
TIROSINA
Las sendas de la síntesis de los aminoácidos esenciales se han deducido en gran parte,
de estudios bioquímicos y genéticos practicados con bacterias. En general los caminos
son idénticos en la mayoría de las especies bacterianas y plantas superiores. Sin
embargo en algunos casos se observan diferencias de especie en algunas etapas
individuales. Las sendas que llevan a la biosíntesis de los aminoácidos esenciales son
más largas que las que llevan a la síntesis de los no esenciales. También son más
complejas posiblemente porque varios intermediarios sirven también como precursores
de muchas otras clases de biomoléculas.
SINTESIS DE TREONINA
O OH
H
NAD+ C CH2 OH
COOH ATP ADP C O P OH NADH NADH NAD+
O
CH2 CH2
CH2 CH2 O
apartil H C NH2
H C NH2 quinasa H C NH2 H C NH2
COOH COOH
COOH COOH
Acido aspartil Semialdehído Homoserina
aspártico fosfato aspártico
OH CH2
ATP ADP H+
CH2 O P OH - Pi CH
CH2 O C N CH ENZ.
Complejo enzimático
C N CH ENZ. -homoserin-fosfato COOH
COOH
METIONINA
O
CH2 OH Succinil CoA CH2 O C CH2 S CH
Cisteína
CH2 CH2 CH2 CH2 H C NH2
H C NH2 H C NH2 CH2 H C NH2 COOH
COOH COOH COOH COOH
CH3
SH S
CH2 CH2
Piruvato DA ~ Cobalanina
CH2 CH2
N5 ~ Metil
+ NH2 H C NH2 H C NH2
tetrahidroflorato
COOH COOH
Homocisteina Metionina
D. A. ~ Co
N5 metil tetrahidrofolato + homocisteína tetrahidrofolato + metionina
balamina
Los aminoácidos son precursores de muchas biomoléculas (aparte las proteínas) que
ejercen importantes funciones biológicas, tales como hormonas, vitaminas, coenzimas,
alcaloides, porfirinas, antibióticos, pigmentos y sustancias neurotransmisoras.
Es digno de mención especialmente, el hecho de que los aminoácidos cromáticos, sean
los principales precursores de buen número de alcaloides entre ellos la morfina, la
codeína, y la papaverina, así como de muchas otras sustancias con intensa
actividad biológica, tales como la hormona tiroxina, la hormona de crecimiento vegetal:
ácido indolacético, el poderoso vasocontrictor neurohumoral: serotonina y las hormonas
catecolamínicas: epinefrina y norepinefrina.
Los aminoácidos son precursores de pequeños péptidos, como el glutatión y de las
hormonas péptidas, como la bradiquinina, oxitocina y la vasopresina.
El péptido glutation se sintetiza según las siguientes reacciones:
Mg++
Acido glutámico + Cisteína + ATP Glutamilciateina + ADP + Pi
HSCoA COOH
CH2 CH2 NH2 CH2 CH2
+
CH2 COOH CH2 CH2
C S CoA C O C O
Glicina
O
H C NH2 CH2
Succinil~CoA
COO H NH2
Acido amino
Acido amino levulínico
oxoadípico
En la primera reacción la glicina reacciona con el succinil-CoA para dar ácido -amino
oxoadípico quien luego se descarboxila para dar ácido amino-levulínico reacción que
es catalizada por la amino~levulínico~sintetasa; enzima que requiere fosfato de
piridoxal y se encuentra en el retículo endoplásmico de las células hepáticas.
Luego dos moléculas de amino-levulínico se condensan para formar porfobilinógeno
bajo la acción de la aminolevulínico deshidrasa.
CH3 CH CH2
C C
HOOC CH2 COOH
CH C C CH
CH2 CH2
H
CH3 C C C C CH3
C C
N H H N
CH2 C C H
N CH2 C C C C CH CH2
NH2 CH2 H
H HC C C CH
COOH
Porfobilinógeno
C C
CH2 CH3
CH2
COOH
Protoporfirina IX
Ácido úrico:
CO 2
7 Glicina
C N
6
Aspartato N C
1 5
C Formiato
8
Formiato C C
2 4
N N
3 9
amida de la glutamina
N9
NH2 de la glutamina glicina
ATP
amidotransferasa
ADP + P
NH 2
PP ácido glutámico
R P
O fosforibosilamina
P P O CH2 OH
H H
H H
OH OH
fosforibosilpirofosfato (FRPP)
NH2 NH
CH "CHO" CH2 glutamina
CHO
CoF ácido glutamínico
C C
NH NH
O O
R P R P
N3 O C6
N1
N C N
CH CO2 NH2 CH "CHO"
CH CH
C Acido aspártico CoF
NH2 N NH2 N
R P R P
C2
O
C N
NH
CH
CH
N N
R P
Inosina 5' - fosfato
Acido Inosínico IMP
H N N
IMP (H+ inosínico)
N N
R P
NAD aspartato
[O]
NADH2 GTP GDP + Pi
O H
N N H N N
O
H R P
N N aspartato
AMP
glutamina H+ glutámico H+ Xántico
R P
O
NH2
H N N
H N N
N N
NH2
N N
R P
R P
En este caso el exceso de ATP, ADP o AMP o de GTP, GDP o GMP producen una
inhibición a nivel de la enzima que cataliza la reacción entre el fosforibosilpirofosfato y la
5 fosforibosilamina, por lo tanto se frena la secuencia metabólica y se inhibe la
biosíntesis. Es un caso de retroalimentación negativa.
Es una ruta similar a la de los nucleótidos purínicos, pues las bases libres no son
productos intermedios.
Esta ruta es más simple y se diferencia en que la D-Ribosa se acopla después que se ha
formado el anillo pirimidínico. El precursor es el ácido Orótico.
C
H N C H
C C COOH
O N
ácido orótico
H2O
carbamil PO4
Acido Aspártico Acido Carbamil Aspártico
PO4 Dihidrotasa
NAD PRPP PP
Acido Dihidrótico Acido Orótico Acido Orotidílico
NADH2 fosforibosil-tr OMP
ansferasa
CO2
Acido Uridílico
OMP
descarboxilasa UMP (uridin monofosfato)
O NH2
C C
H N C H ATP ADP + Pi N C H
+ NH3
C C H C C H
O N O N
R P P P R P P P
Acido Aspártico
UMP
UTP
CTP
O O
C C
N5; N10.Metilen FH2
H N CH H H N C CH3
Tetrahidrofolato Dihidrofolato
C CH H C C H
O N O N
Reacciones fosfotransferásicas:
Evidencias de que el ADN es el material genético. Estructura del ADN: Ley de Chargaff,
estudios de difracción con rayos X. Modelo de Watson y Crick. El dogma central de la
Biología Molecular. Replicación del ADN: replicación semiconservativa.
En este capítulo veremos las bases bioquímicas de algunas cuestiones centrales, que
plantea la continuidad genética y la evolución de los organismos vivos.
A-T y G-C
N N
núcleo de núcleo de
AyG TyC
N N N
Si el par sería A - G serían demasiado grandes para poder encajar dentro de la doble
hélice de estas dimensiones.
Si la pareja fuera G - T las bases se encontrarían muy distanciadas para poder formar
enlaces hidrógeno estables.
A T
A T
G C
A T
T A
C G
A T
G C
O sea que éste dogma definió tres procesos fundamentales de los cuales el primero es
el de REPLICA, es decir la "copia" del ADN con formación de moléculas hijas. Veremos
como sucede éste proceso a nivel molecular. La característica más sorprendente de la
hipótesis de Watson y Crick, desde el punto de vista genético, en su postulado de que
las dos hebras del ADN duplohelicoidales son complementarias.
La réplica de cada una de ellas conduce a dos moléculas hijas de ADN; cada una
contiene las hebras del ADN progenitor. Este proceso se denomina réplica
semiconservadora.
Pero ¿Cómo pueden replicarse simultáneamente las dos hebras del ADN de modo que
se formen al mismo tiempo.
ADN – polimerasa
2. O bien podría ser utilizado como patrón sobre el cual la enzima podría construir
una hebra complementaria al ADN preformado.
ADN
|
nd ATP
d AMP
nd GTP ADN preformado |
d GMP + 4 PPi
nd CTP Mg++ |
nd TTP d CMP
|
d TMP
OH
HO P H2C
O Base
O
H H
H
O H
O Base
HO P O
H H
H
H2C
OH + PPi
O O H
Base
H H O P OH
H
OH H PPi H2C
OH
O Base
O O P
H H
H
O P O P O P OH
OH H
OH OH OH
H2C
O Base
H H
H OH
OH H
Hay un ataque al átomo de fósforo alfa del nucleótido trifosforado entrante y provoca el
desplazamiento de su grupo pirofosfato, con formación de enlace internucleótido. El PP i
formado es rápidamente hidrolizado por una pirofosfatasa por lo cual la reacción es muy
exergónica. La dirección de la síntesis es por lo tanto 5’ --- 3'.
ADN ligasa
1. Enlaza extremos de moléculas de ADN produciendo formas circulares. Ej.:
bacterias.
2. Cataliza la reparación de roturas de una cadena de ADN.
O
NMN
Dinucleótido
Base CH2 O P OH NAD constituído
NMN y AMP
5' AMP
OH
H OH
3'
H
Base O
OH
O O
OH OH Adenina HO P O
O
OH
Base O
Base O
Mecanismo de replicación
P 3'
T
A T
5' 3' 5'
cebadora 3' P
P 3' 5' 3'
5'
T A
T
3'
P
P
5'
5'
La ADN polimerasa se fija a dicha rotura y comienza a prolongar el extremo 3' unidades
de mononucléotidos (MN). (–)ed
El extremo 5' se desplaza de la estructura duplex. Se sugiere que el extremo 5' puede
estar sujeto por adherencia a la membrana celular. La réplica continua durante cierto
trecho mientras que el extremo 5' se va "pelando". La ADN polimerasa se desplaza de
lugar, o salta, desde la hebra patrón intacta a la hebra mellada en el sitio donde se
separan ambas hebras y comienza a adicionar unidades de mononucleótidos utilizando
como patrón la fibra mellada. La replicación continúa hasta que el extremo se ha
replicado por completo y entonces la enzima se retira.
La endonucleasa rompe en la horquilla la hebra formada y el proceso vuelve a repetirse
con la ADN polimerasa, que adiciona nuevas unidades de mononucleótidos. Los dos
nuevos segmentos formados sobre la hebra patrón son unidos por la ADN ligasa y
comienza un nuevo ciclo.
Para obtener esta enzima en forma pura, Richard Burgen realizaron una electroforesis
en gel de poliacrilamida. Así se pudo detectar 4 bandas por tinción de los polipéptidos.
Lo que interesaba saber era si los 4 polipéptidos intervenían en la actividad de la
enzima. Para ello eliminaron uno de los polipéptidos que denominaron factor (sigma).
La eliminación de este factor cambió las propiedades de la enzima ya que perdió su
capacidad de usar como matriz al ADN. La adición de factor restauraba la propiedad
de la enzima de usar ADN como matriz.
La ARN polimerasa se une reversiblemente al ADN en varios sitios de éste. Sin embargo
cuando esta unión se hace en una región específica que es el gen promotor el factor
reconoce la secuencia nucleotídica y estabiliza el complejo ADN-ARN polimerasa.
Esta estabilización permite que la enzima inicie la separación de las hebras de la doble
hélice del ADN permitiendo la iniciación de la trascripción.
A T C T G A G A C T A T C T G A G A C T
T A G A T A G A
G T G T
A A
C T C C T C
G G A
3'
P P P OH P P P OH
OH
P
5'
A T C T G A G A C T
T A G A
G T
Se forma el primer enlace
internucleótido A
C T C
G A
P P P P OH + P P
5'
Una vez unida la enzima a un promotor en el ADN, se inicia la transcripción por unión de
dos nucleótidos trifosforados a la enzima. En general todos los ARN comienzan a
sintetizarse por ATP y GTP. Al tomar posición los dos primeros sustratos, el OH 3' del
nucleótido trifosforado iniciador ataca el enlace fosfodiéster entre los fosfatos alfa y beta
del segundo nucleótido y se forma el primer enlace internucléotido.
A T C T G A G A C T
T A G A
G T
A La enzima se desplaza
por la hebra del ADN
C T C
G A G A
P P P P P P OH
Terminación de la transcripción:
1.
secuencia terminadora
reconocida por la enzima
2.
factor de terminación
Ro
EL CODIGO GENETICO
Los vocablos del código aminoácido son idénticos en el hombre, en virus y en bacterias,
es decir, es universal. A esta conclusión se llegó luego de una serie de ensayos. Se
comparó 50 aminoacil - ARNt diferentes procedentes de especies muy distantes, y
observaron sus respectivas capacidades para ser reconocidos por los codones
aminoácidos previamente establecidos de E. Coli. Para ello se ensayó la capacidad de
tales aminoacil - ARN t para unirse a ribosomas de E. Coli empleando sintéticos y se
halló que en todos los casos los aminoacil - ARN t respondían perfectamente a los
codones de E. Coli unidos a los ribosomas de este microorganismo. Considerando
conjuntamente este hallazgo sugieren que el lenguaje genético es idéntico en todas las
especies.
Vamos a considerar ahora la tercera gran cuestión que plantea la continuidad genética
de los organismos vivos.
¿Cómo se traslada la información genética contenida en la secuencia nucleótida del
ARNm , de tal suerte que los aminoácidos se engarcen formando una cadena
polipeptídica con una secuencia aminoácida específica?
Trataremos los mecanismos enzimáticos por medio de los cuales se constituye la
cadena polipeptídica, es decir, como se realiza la síntesis proteica. Además veremos el
funcionamiento de los ribosomas asegurando la adecuada transferencia de la
información del ARNm , y el papel adaptador del ARN t .
Estructura ribosómica
El ARN t , posee una conformación tridimensional similar a una hoja de trébol de manera
que presentan sus cadenas el máximo de aparejamiento intracatenario.
A
| Locus de enlace aminoácido
C
|
G C
O
H O
P O P O P O CH2
O
R C C OH +
OH
NH2 Adenina
H O O
R C C O P O CH2 + PPi
O Adenina
NH2 OH
Segundo estadío
30 S
LP LA
50 S
El ribosoma para que puedan unirse el ARNm y el ARN t AA debe disociarse en sus dos
subunidades. Participan en este proceso factores proteicos F1 F2 F3 (llamados también
disociasaribosomal) y GTP. Estos factores permiten la disociación de los ribosomas y
además la unión del ARNm en el lugar donde se inicia el mensaje.
50 S
AA AA
50 S
LP LA
(metionina) AA AA
2.- En la segunda fase se forma el enlace peptídico por reacción entre el grupo
amino del nuevo aminoacil - ARN t captado con el grupo carboxilo del AA ya
existente en el LP.
R CH
R CH
C O LP HO LP descargado
O O C
NH
NH2
R C H
R CH
C O
C O LA LA
O O
ARNm
O CH
NH
R C H
C O LP
O
LA
Las células vivas disponen de mecanismos que regulan la cantidad de proteínas que se
sintetizan.
Estos mecanismos de regulación fueron estudiados en células bacterianas y se observó
que la cantidad de enzimas que se acumula en el medio depende de la naturaleza de los
nutrientes. En base a todos estos estudios se distinguió dos tipos de respuestas:
De inducción enzimática
De represión enzimática
INDUCCION
REPRESIÓN ENZIMATICA
Regulador
Estructural
Jacob y Monod formularon una hipótesis general respecto a la función de los genes
estructural y regulador) en los 2 procesos.
Inducción
El gen regulador transcribe un ARN mensajero que codifica una proteína denominada
represor.
ARNm
regulador
operador
estructural represor
Este represor tiene un locus de unión específico próximo al gen estructural. Este locus
se denomina operador.
¿Qué sucede en una inducción, es decir, cuando se agrega al medio un sustrato que
debe degradarse? El sustrato, que sería el inductor, se combina con el represor
formando un complejo inductor-represor inactivo, que no puede unirse al operador.
represor
inductor
Represión
Si agregamos al medio un aminoácido por ej. histidina, la célula no necesita utilizar las
enzimas que lo sintetizan.
ARNm
regulador
operador
estructural represor
Regulación coordinada
operador z x a b
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