Metabolismo

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2019.

CATEDRA:
QUÍMICA CARTILLA DE METABOLISMO CELULAR
BIOLÓGICA

FACULTAD CIENCIAS DE LA SALUD. UNIVERSIDAD NACIONAL


DE SALTA.
VÍAS METABÓLICAS Y DE TRANSFERENCIA DE ENERGÍA

EL METABOLISMO

Es definido brevemente, como la suma total de las reacciones enzimáticas que tienen
lugar en la célula. Cuatro son las funciones específicas del metabolismo
Obtener energía química del entorno de los elementos orgánicos nutritivos o de la
luz solar.
Convertir los elementos nutritivos exógenos en los precursores de los
componentes moleculares de las células.
Reunir los precursores para formar proteínas, ácidos nucleicos, lípidos y otros
componentes celulares.
Formar y degradar aquellas biomoléculas necesarias para las funciones celulares
especializadas.

Catabolismo y anabolismo

El metabolismo se divide en catabolismo y anabolismo:

El catabolismo: Es lo degradación enzimática, mediante reacciones de oxidación,


de moléculas nutritivas relativamente grandes (carbohidratos, lípidos y proteínas)
procedentes del entorno de la célula o de sus propios depósitos de reservas
nutritivas, hasta transformarlas en moléculas simples y menores, por ejemplo, ácido
láctico, ácido acético, CO 2 , amoníaco o urea. El catabolismo va acompañado de
liberación de energía libre, la cual se conserva en el ATP.

El anabolismo: Es la síntesis enzimática de componentes celulares relativamente


grandes de la célula, ejemplo: polisacáridos, ácidos nucleicos, proteínas, lípidos a
partir de moléculas precursoras sencillas. Puesto que los procesos sintéticos
provocan un aumento en el tamaño y la complejidad de las estructuras, se necesita
la energía proporcionada por el enlace fosfato del ATP.

Tanto el catabolismo como el anabolismo son dos procesos simultáneos e


interdependientes, que pueden analizarse por separado. Cada uno de los procesos
abarca la secuencia de reacciones enzimáticas mediante las cuales se degrada o se
sintetiza el esqueleto covalente de una determinada biomolécula.

Los intermediarios químicos de este proceso se denominan metabolitos, y este proceso


metabólico: metabolismo intermediario. Acompañando a cada una de las reacciones
químicas del metabolismo intermediario; tiene efecto un cambio de energía
característico.

En algunas de las etapas de las secuencias catabólicas puede conservarse la energía


química, habitualmente en forma de energía del enlace fosfato y en ciertas etapas de las
secuencias anabólicas puede utilizarse esa energía del enlace fosfato. Esta fase del
metabolismo se denomina acoplamiento energético.

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Transformaciones catabólicas, anabólicas y anfibólicas
La degradación enzimática de cada uno de los principales elementos nutritivos (hidratos
de carbono, lípidos y proteínas) tiene lugar a través de cierto número de reacciones
enzimáticas consecutivas que se desarrollan en tres fases:

Fase I: En esta fase las grandes moléculas de los elementos nutritivos se


degradan hasta los principales componentes. Los polisacáridos son
degradados a pentosas o hexosas, los lípidos a ácidos grasos, glicerina y
otros componentes, y las proteínas a sus veinte aminoácidos constitutivos.

Fase II: Los numerosos productos distintos de la Fase I son recogidos y


convertidos en un número pequeño de moléculas más sencillas. Así, las
hexosas, las pentosas y la glicerina se degradan hasta el gliceraldehído-3-
fosfato y después hasta un compuesto sencillo de dos átomos de carbono, la
acetil-coenzima A. Los aminoácidos diferentes son también degradados a:
acetil-coenzima A, alfa-cetoglutarato, succinato, fumarato y oxalacetato.

Fase III: Los productos formados en la fase II pasan a la fase III que es el
camino común final en el cual se oxidan a CO 2  H2 O .

El anabolismo tiene lugar también en tres fases, comenzando por las pequeñas
moléculas originadas en la tercera fase del catabolismo. Por ejemplo, la síntesis proteica
comienza en La Fase III, a partir de los alfa-cetoácidos que son los precursores de los
aminoácidos. En la Fase II los alfa-cetoácidos son aminados por donadores de grupos
aminos y se forman los alfa-aminoácidos y en la Fase I se reúnen los aminoácidos para
producir cadenas peptídicas.
Aunque los caminos del catabolismo y el anabolismo no son idénticos la Fase III
constituye un camino central accesible a ambos. Esta senda central, que recibe el
nombre de anfibólica, desempeña una doble función (amphi: ambos).

La ruta anfibólica puede utilizarse catabólicamente para lograr la degradación


completa de pequeñas moléculas producidas en la Fase II del catabolismo o puede
utilizarse anabólicamente como precursora de moléculas para la Fase II del
anabolismo.

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Lípidos Polisacáridos Proteínas

Fase I
Ácidos grasos Hexosas
Aminoácidos
glicerina Pentosas

Gliceraldehído
3-fosfato

Fase II
Fosfoenol
piruvato

Piruvato

Acetil - C o A

citrato
oxalacetato

isocitrato
Fase III malato

Fumarato Alfa - cetoglutarato

Ciclo de los succinato


ácidos tricarboxilos
CO 2

LA ENERGÍA EN LA CÉLULA

Las moléculas orgánicas complejas, tales como la glucosa contienen mucha energía
potencial a causa de su elevado grado de ordenación estructural. Cuando la molécula de
glucosa se oxida y forma seis moléculas de CO 2 y seis de H2 O , sus átomos
experimentan un aumento en el desorden. Como resultado de esta transformación, la
molécula de glucosa experimenta una pérdida de energía libre que es energía útil y
capaz de realizar trabajo. La energía libre se conserva, como energía química,
específicamente como ATP. Dado que el ATP formado puede difundirse hacia aquellos
lugares en la célula en que se necesite su energía, constituye una forma de transportar
la energía.

La energía química del ATP se libera después, durante la transferencia de su grupo o


grupos fosfatos terminales, a determinadas moléculas de un aceptor específico, que
adquiere un nivel superior de energía y puede realizar trabajo.

Un segundo camino para transportar la energía química de las reacciones de óxido-

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reducción del catabolismo a las reacciones anabólicas, que necesita de energía, es en
forma de electrones. En las síntesis de algunas biomoléculas ricas en hidrógeno, tales
como los ácidos grasos y el colesterol, se requieren electrones e hidrógeno para la
reducción de los enlaces dobles a simples. En la célula los electrones son transportados
enzimáticamente desde las oxidaciones productoras de electrones tales como los dobles
enlaces carbono-carbono o carbono-oxígeno, mediante coenzimas transportadoras de
electrones, la más importante es la nicotinamida-adenin-dinucleótido fosfato (NADP). El
NADP desempeña de este modo, el panel de transportador de electrones ricos en
energía desde las reacciones catabólicas hasta las reacciones anabólicas que los
necesitan.

Distribución intracelular de las enzimas y de los sistemas enzimáticos

Las diferentes enzimas y sistemas enzimáticos se hallan localizados


característicamente, en una u otra organela o estructura intracelular de las células.
El sistema enzimático glicolítico está localizado en el citoplasma mientras que las
enzimas implicadas en la oxidación del piruvato, de los ácidos grasos y de algunos
aminoácidos están en la mitocondria donde también se hallan las enzimas de la cadena
respiratoria y de la fosforilación del ADP.
La ventaja de la compartimentación la constituye el hecho de que separa reacciones
químicamente incompatibles.
Por ejemplo, una célula puede realizar, a un mismo tiempo, la oxidación de los ácidos
grasos de cadena larga hasta el estado de ácido acético y el proceso inverso de
reducción del ácido acético para formar ácidos grasos de cadena larga.

Regulación celular de las sendas metabólicas

La velocidad del catabolismo de una célula no es controlada por la concentración de los


elementos nutritivos del entorno, sino más bien por sus necesidades energéticas en
forma de ATP.

La regulación de una ruta metabólica puede llevarse a cabo a varios niveles. El tipo de
regulación más sencilla implica los parámetros que afectan a las velocidades de las
reacciones enzimáticas (pH, concentración de enzima, concentración de cada
intermediario, concentración de iones metálicos y coenzimas esenciales, etc.). El
segundo mecanismo general de regulación consiste en la acción de enzimas
reguladoras que se hallan localizadas, habitualmente, en el comienzo o en proximidades
de una secuencia multienzimática. El tercer nivel en que se ejerce la regulación
metabólica es a través del control genético de la velocidad de la síntesis enzimática. En
organismos multicelulares superiores el control se ejerce a través de sistemas
endocrinos. Las hormonas elaboradas por una glándula endocrina son mensajeros
químicos que estimulan o inhiben actividades metabólicas específicas en otros tejidos u
órganos.

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PRINCIPIOS DE BIOENERGETICA Y CICLO DEL ATP

El sistema ATP - ADP actúa como transportador de energía química, ya que el ADP es
capaz de aceptar un grupo fosfato en las reacciones acopladas productoras de energía
del catabolismo, y el ATP así formado puede ceder su grupo fosfato terminal, en otras
reacciones acopladas que requieren energía.
En este capítulo examinaremos los principios químicos y termodinámicos en que se
basa el funcionamiento del sistema ATP - ADP.

Localización y propiedades del ATP y el ADP

El ATP, el ADP y el AMP no son sustancias que existen solo en trazas; la suma de sus
concentraciones en la fase acuosa de los diversos tipos de células intactas oscila entre 2
y 15 mM. La concentración de ATP es por lo común, muy superior a la suma de las otras
dos concentraciones del AMP, habitualmente es la menor de las tres.
Estos nucleótidos están presentes no sólo en el citoplasma, sino también en organelas
tales como mitocondrias y núcleo. La compartimentación intracelular del sistema ATP
constituye una característica importante en la regulación celular del metabolismo.

NH2

N
N ATP

N N
O O O
HO P O P O P OH2 C O
OH OH OH
H H
H
H : hidrógenos que cede en su disociación
OH OH

La elevada concentración de cargas negativas en torno al grupo trifosfato del ATP


constituye un factor importante en su naturaleza de compuesto de alto contenido
energético.
En la célula intacta existen muy pocas cantidades de ATP y de ADP en forma de
aniones libres, se hallan presentes en su mayor parte en forma de complejos Mg ATP y
Mg ADP a causa de la gran afinidad de los grupos pirofosfato para enlazar cationes
divalentes y de la elevada concentración de ión Mg   en el fluido intracelular. La afinidad
del ATP por el Mg   es unas diez veces mayor que la del ADP.

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mg
-
O O O
-
Adenina Ribosa O P O P O P O mg-ATP
O O O
mg
O O
-
Adenina Ribosa O P O P O mg-ADP
O O

En muchas de las reacciones enzimáticas en que participa el ATP como dador de


fosfato, su forma activa es la del complejo mg-ATP.

Principios de termodinámica química

Una descripción de las bases físico-químicas de la función del ATP en el ciclo energético
de la célula, requiere un breve repaso de algunos principios de la termodinámica. El
análisis termodinámico de los intercambios energéticos se inicia por las siguientes
definiciones:
a. Sistema: Es el conjunto de materia que es objeto de nuestro estudio.
b. Entorno: Toda materia del universo, aparte del sistema que se considera.
En el transcurso del proceso en estudio la energía puede pasar del sistema al
entorno, o viceversa.
c. Estado inicial: Es el contenido de energía del sistema y del entorno, al iniciar
el proceso que se analiza.
d. Estado final: Contenido de energía de sistema y entorno una vez que se ha
alcanzado el equilibrio.
El contenido de energía de cada estado es una función de diversas magnitudes
medibles (temperatura, presión, volumen, masa, etc.) que se formulan mediante una
ecuación de estado. A partir de las medidas de los cambios de contenido de energía del
sistema y el entorno, a medida que el sistema evoluciona desde su estado inicial hasta
su estado final, puede realizarse un balance de energía.

(Bloques de cobre)

caliente frio Estado inicial

Estado de equilibrio

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La primera ley de termodinámica es el principio de conservación de la energía. La
energía no se crea ni se destruye, sino que se transforma en una u otra forma (ej.
calorífica, química, mecánica, etc.).
La segunda ley establece algunas limitaciones en los tipos de transformaciones
energéticas que ocurren en los procesos físicos-químicos, y predice la dirección en que
es probable que ocurra un proceso determinado.
Establece que todos los procesos tienden a evolucionar en una dirección tal que la
entropía del sistema más la del entorno, aumenta hasta alcanzar un estado de equilibrio.
Entropía: Se define como el grado de desorden.
Equilibrio: Se define como aquel estado en que no ocurre ningún cambio físico o
químico ulterior, y en el que la temperatura, la presión y la concentración son uniformes
en todo el sistema.

Un sistema de equilibrio

1. Ha agotado su capacidad de realizar trabajo sobre su entorno,


2. El proceso no puede invertirse de modo espontáneo y volver a su estado inicial, lo
cual requerirá una disminución de entropía. Un sistema desordenado al azar no se
reordena por si mismo espontáneamente.
Los procesos que se realizan con aumento de entropía se denominan irreversibles. Los
procesos que tienen lugar sin cambio de entropía son reversibles.

Ejemplo: si tenemos bloques de piedra dispuestos al azar y queremos disponerlos de tal


modo que formen un arco la entropía o sea el grado de organización disminuye y es
reversible porque espontáneamente sin cambio de entropía puede pasar del orden al
desorden (arco a bloques al azar).

entropía (S) elevada (desorden) (S) disminuye

irreversible
reversible
espontáneo
endotérmico
exotérmico

S disminuye (orden) S aumenta


En reacciones químicas los cambios de entropía ( ΔS ) no siempre pueden medirse o
calcularse con facilidad.
Sin embargo, el cambio de entropía durante un proceso está relacionado
cuantitativamente con los cambios de la energía total del sistema por una tercera
función, llamada energía libre, mediante una ecuación que combina la primera y la
segunda ley de termodinámica. Puesto que los cambios de la energía libro de las

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reacciones químicas pueden medirse con relativa facilidad, esta ecuación resulta muy
útil para predecir la dirección y el equilibrio de las reacciones químicas. El cambio de
energía libre ( ΔG ) cuando la temperatura y presión son constantes se define del
siguiente modo:

G  H - T. S (1)

En la que ΔH es la variación de entalpía, T la temperatura absoluta y ΔS variación de


entropía. La variación de entalpía ( ΔH ) que también se denomina cambio calorífico, se
define mediante la ecuación:
H  E  PV (2)
ΔE = variación de le energía total del sistema.
P = presión
V = volumen

Variación de la energía libre estándar en las reacciones químicas

El cambio de energía libre que tiene lugar durante las reacciones químicas se calcula
empleando una ecuación que puede derivarse de la ley de equilibrio químico. Para una
reacción general del tipo:
aA + bB cC + dD (3)

en la que a, b, c y d son el número de moléculas de A, B, C, y D que participan en la


reacción. El cambio de energía libre ( ΔG ) está dado por la ecuación:

La energía libre estándar de un compuesto constituye la medida de la cantidad total de


energía libre que puede proporcionar por descomposición completa.
El valor de ΔG es el que determina si una reacción química ocurrirá en la dirección
escrita, partiendo de unas concentraciones de reaccionantes determinadas.
Recuérdese que una reacción química solamente ocurrirá si ΔG es negativo, es decir, si
la energía libre del sistema disminuye.

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Las reacciones químicas con un ΔGº (variación de energía libre estándar) negativo
reciben el nombre de exergónicas; se realizan espontáneamente en la dirección en que
están escritas. Si recordamos el ejemplo de los bloques:

ordenado

ΔGº disminuye, es negativo


exergónica o exotérmica
espontánea
irreversible

desordenado

Las reacciones con un cambio de energía libre estándar positivo reciben el nombre
de endergónicas o endotérmicas, no se realizan de modo espontáneo en la dirección en
que se escriben. Volviendo al ejemplo:

desordenado

ΔGº aumenta, es postivo


endergónica o endotérmica
no es espontánea
reversible

ordenado

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Compuestos con enlaces fosfato de alto y de bajo nivel energético

En la escala termodinámica de ΔGº , el ATP es el único que posee un valor de ΔGº ,


intermedio.
Daremos el ΔGº de algunos compuestos fosforilados.

ΔGº (kcal)
Fosfoenol piruvato ………………………. - 14.80
1-3 difosfoglicerato ……………………... - 11.80
ΔGº   ATP
Fosfocreatina …………………………….. - 10.30
Acetil-fosfato ……………………………..- 10,10
Fosfoarginina …………………………….. - 7.70

ATP ………………………………. - 7.30

Glucosa-1- fosfato ……………………... - 5.00


Fructosa-6-fosfato ……………………... - 3.80
ΔGº   ATP
Glucosa-6-fosfato ……………………... - 3.30
Glicerol-1-fosfato ………………………… - 2.20

O sea que la función del sistema ATP-ADP, consiste en servir como transportador
obligatorio intermedio de grupos fosfato desde los compuestos con enlaces fosfato de
elevado nivel energético, situados por encima del ATP en la escala termodinámica,
hasta las moléculas aceptoras que forman compuestos con enlaces fosfato de bajo nivel
energético situados en la escala por debajo del ATP.

Compuestos fosfato de alto nivel energético

Hay dos clases de compuestos fosforilados que poseen una ΔGº de hidrólisis más
negativa que la del ATP:
1. Los compuestos fosfato que se forman durante la ruptura enzimática de
moléculas combustibles.
2. Los compuestos fosfato utilizados como almacenadores de la energía del enlace
fosfato.

Los dos miembros más importantes de la primera clase son el 1-3 difosfoglicerato y el
fosfoenol piruvato, los cuales se forman durante la fermentación anaerobia de la glucosa
(glucólisis).

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Los compuestos fosfato de elevado nivel energético, que actúan como reservorio de la
energía de enlaces fosfato, reciben con frecuencia el nombre de fosfágenos. Los dos
fosfágenos principales son la fosfocreatina hallada en muchos vertebrados, y la
fosfoarginina, presente en muchos invertebrados.

Compuestos fosfato de bajo nivel energético

La mayoría de los compuestos fosfato pobres en energía son ésteres fosfóricos de


alcoholes. Se conocen muchas enzimas que catalizan la transferencia de grupos fosfato
desde el ATP a aceptores de fosfato específicos; entre las enzimas mencionadas se
hallan la glicero quinasa y la hexoquinasa, que catalizan la transferencia de fosfato
desde el ATP a la glicerina y desde el ATP a la D-glucosa, respectivamente.

ATP + glicerina ADP + glicerol_3_fosfato ΔGº  -4.5 kcal

ATP + D-glucosa ADP + D.glucosa_6_fosfato ΔGº  -7.3 kcal

Rutas enzimáticas de la transferencia de fosfato

Fosfoenol piruvato
Dadores de P de alta energía
P
Reservorio de fosfocreatina
1-3 difosfoglicerato
P
P
ATP
P
Aceptores de P Glucosa_6_fosfato
de baja energía P

Glicerol_3_fosfato

La figura es un esquema de las reacciones enzimáticas de transferencia de fosfato en la


célula. Constituye un rasgo importante que el sistema ATP-ADP sea el nexo de unión
obligado entre los compuestos fosfato de elevado y de bajo nivel energético.

Los grupos fosfato se transfieren, en primer lugar, mediante la acción de


fosfotransferasas específicas, desde compuestos de alto nivel energético al ADP, como
en el ejemplo:

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piruvato -
fosfoenol piruvato + ADP piruvato + ATP
quinasa

El ATP así formado se transforma entonces en el dador de fosfato específico de una


segunda reacción enzimática, para formar compuestos fosfato de baja energía.
hexoquinasa
ATP + D-glucosa ADP + D-glucosa_6_fosfato

La reacción global es la siguiente:


fosfoenol piruvato + D-glucosa piruvato + D-glucosa_6_fosfato

El resultado final es la transferencia de un grupo fosfato desde un donador de energía


elevado a un aceptor de bajo nivel energético, a través del sistema ATP-ADP, que actúa
como intermediario.

El contenido de energía de la D-glucosa se ha elevado al fosforilarse, la glucosa-6-


fosfato puede considerarse una forma de glucosa que ha recibido energía. En el flujo
principal de reacciones transferidoras de energía de la célula, la transferencia del fosfato
nunca se produce directamente desde un compuesto de elevado nivel energético como
el 1-3 difosfoglicerato a un aceptor de fosfato de bajo nivel energético, como por
ejemplo, la glicerina, no se han encontrado enzimas capaces de catalizar tales transfe-
rencias directas de fosfato. Esencialmente, todas las reacciones de transferencia de
fosfato en la célula tienen que efectuarse a través del sistema ATP-ADP.

La figura también muestra el papel de reservorio desempeñado por la fosfocreatina, que


se forma por transferencia enzimática directa de un grupo fosfato desde el ATP a la
creatina; no existe ningún otro camino para su formación. Además, la única ruta principal
conocida para su desfoforilación es la inversa de la reacción por la que se forma. El
sistema reservorio de la fosfocreatina es muy importante en el músculo esquelético.
También se encuentra en el músculo liso y en las células nerviosas, y en pequeñas
cantidades en el hígado, riñón y otros tejidos de mamíferos.

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Papel del AMP y del pirofosfato

Aunque el ADP constituye el producto de muchas reacciones celulares que emplean el


ATP, y el ADP es el aceptor directo del fosfato en las reacciones productoras de energía
de la glicólisis y de la fosforilación oxidativa de la mitocondria; en muchas de las
reacciones que utilizan el ATP en la célula los dos grupos fosfato terminales de éste se
separan conjuntamente en forma de pirofosfato y se libera AMP como producto.

ATP AMP + PPi

El pirofosfato inorgánico es un compuesto fosfato de nivel energético elevado que posee


un ΔGº de hidrólisis comparable al fosfato terminal del ATP. Para regenerar el ATP a
partir de PPi y AMP intervienen dos enzimas auxiliares: la pirofosfatasa inorgánica y la
adenilato-quinasa. La primera cataliza la hidrólisis del pirofosfato inorgánico (PPi).

PPi + H2O 2 Pi

Esta hidrólisis secundaria del pirofosfato constituye una etapa valiosa de liberación de
energía, la cual se utiliza para asegurar que ciertas reacciones biosintéticas se realicen
por completo.

El Pi formado se utiliza para la regeneración del ATP a partir de ADP. La adenilato-


quinasa cataliza la refosforilación del AMP a ADP.

ATP + AMP ADP + ADP

El ATP, el ADP y el AMP de la célula existen en concentraciones constantes.

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GLUCOLISIS

Vamos a considerar los mecanismos por los que las moléculas combustibles se
degradan y su energía se conserva en forma de energía de enlace fosfato ATP.
Se estudiarán los procesos conocidos como fermentación, mediante el cual muchos
organismos extraen energía química de la glucosa y otros combustibles en ausencia de
oxígeno molecular.
Nos referimos primeramente el proceso de fermentación para luego poder hablar de
respiración y fotosíntesis.

Fermentación y respiración

Los organismos inferiores que viven en condiciones anaerobias (ciertas bacterias,


invertebrados inferiores) obtienen su energía de la fermentación de la glucosa. Los
organismos que viven en condiciones aerobias (hongos, bacterias, mayoría de los
animales y plantas superiores) degradan sus combustibles por la ruta anaerobia pero
después oxidan los productos de la fermentación utilizando el oxígeno molecular.
En los organismos superiores la ruta anaerobia es una primera etapa de la fase aerobia
de la respiración.

Utilización de la glucosa por los organismos inferiores y superiores:

La ruta de la fermentación es común tanto en la utilización anaerobia de la glucosa como


en la aerobia.

Anaerobios Aerobios

glucosa glucosa

sin O2 fermentación sin O2 fermentación

productos de la fermentación productos de la fermentación

sin O2 fermentación

CO2 + H2O

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Entre las clases de fermentación nombraremos la fermentación homoláctica y la
alcohólica.
 La fermentación homoláctica: La molécula de glucosa de 6 átomos de carbono
se degrada a dos moléculas de ácido láctico de tres átomos de carbono. Este
proceso se denomina glucólisis que significa lisis de la glucosa.
 La fermentación alcohólica: La molécula de glucosa de 6 átomos de carbono se
degrada a dos moléculas de etanol de 2 átomos de carbono y 2 de CO 2 .

1. Glucosa 2. Glucosa
C C C C C C C C C C C C

triosas triosas

C C C C C C C C C C C C

ácido ácido etanol etanol


láctico láctico
CH3 CH3
CH3 CH3
CH2 OH CH2 OH
CH OH CH OH
+ +
COOH COOH CO 2 CO 2

En estas reacciones tenemos que hablar de las reacciones de óxido reducción que se
producen en todo organismo donde el agente oxidante recibe los electrones y el agente
reductor entrega electrones.
En este caso de la fermentación alcohólica el etanol es una molécula relativamente
reducida rica en H 2 , pobre en O 2 . La molécula de CO 2 es relativamente oxidada, pobre
en H 2 .
En el caso de la fermentación homoláctica el grupo metilo se halla más reducido que el
grupo carbonilo. Veamos la reacción completa:

1. Glucosa Ácido láctico

O
C
H CH3
HC OH
HOC H + 2 Pi + 2 ADP 2 CH OH + 2 ATP + 2 H2O
HC OH COOH
HC OH
CH2 OH

2. Glucosa + 2 Pi + 2 ADP 2 CH3 + 2 CO2 + 2 ATP + 2 H2O


CH2 OH

ETANOL

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Etapa de la glucólisis

La glucólisis es la ruta degradativa de la glucosa, una de las rutas metabólicas más


importantes del organismo, ya que constituye uno de los primeros pasos en el
procesamiento y aprovechamiento de la glucosa para la obtención de energía por la
célula.

La glucólisis puede considerarse como el proceso oxidativo de la glucosa, bien mediante


su degradación hasta obtener piruvato o bien mediante su fermentación para dar lactato.
Es catalizada por la acción de un grupo de 11 enzimas. Se cree que están localizadas
en la porción soluble del citoplasma. Se pueden considerar dos etapas o fases. En la
primera fase la glucosa se fosforila y se escinde pare formar gliceraldehído 3 P; y en la
segunda fase éste se convierte en lactato.

 LA FASE I: Constituye un proceso preparativo o de congregación en el que cierto


número de hexosas penetran en el esquema, después de fosforilarse a expensas
del ATP, y dan un producto común, el gliceraldehído 3 P.

 LA FASE II: Es la ruta común para todos los azúcares, se produce la fosforilación
del ADP y se llevan a cabo las reacciones de óxido reducción, obteniéndose el
lactato.

En este proceso hay tres tipos de transformaciones interconectadas:

1º.- La ruta de los átomos de carbono: o sea degradación de la glucosa para


formar ácido láctico.
2º.- La ruta del fosfato: o sea que el Pi (fósforo inorgánico) se transforma en P del
ATP.
3º.- La ruta de los electrones: o sea las reacciones de óxido-reducción.

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glucosa almidón
glucogeno
ATP Pi
FASE I glucosa-1-P
galactosa ADP
manosa glucosa-6-P
Congregación de azúcares sencillos y pentosa
su conversión en fosfato de fructosa-6-P
gliceraldehído; entrada de ATP ATP ADP
fructosa-1-6-di P
glicealdehído-3-P (2)
2 NAD+
Pi
1,3 difosfoglicerato (2)
FASE II 2 ADP 2 NADH
2 ATP
3 difosfoglicerato (2)
Oxidación - reducción y formación
acoplada de ATP; salida de lactato
2 difosfoglicerato (2)
fosfoenolpiruvato (2)
2 ADP
2 ATP piruvato (2)
2 NAD+
2 lactato
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PRIMERA FASE

1. Fosforilación de glucosa por el ATP: catalizada por dos enzimas: la hexoquinasa y


glucoquinasa.

Mg++
ATP + glucosa ADP + glucosa-6-P Gº  4 kcal

Es una reacción irreversible.


La hexoquinasa es de mayor afinidad que la glucoquinasa por la glucosa. La
glucoquinasa solo actúa cuando hay alta concentración de glucosa en sangre; las dos
enzimas necesitan del catión Mg   ó Mn   para formar el verdadero sustrato que es
Mg  Mn  ATP . La hexoquinasa actúa también fosforilando otras hexosas. La reacción es
irreversible.

CH2 OH CH2 OPO3=

O O
H H H H
H H
+ ATP ADP + ΔGº  -4 kcal
OH H OH H
OH OH OH OH

H OH H OH

glucosa glucosa-6-fosfato

2. Conversión de glucosa-6-P a fructosa-6-P: Catalizada por la fosfoglucoisomerasa.

CH2 OPO3=
CH2 OPO3=
O O
H H CH2 OH
H

OH H OH H ΔGº  0.4 kcal


OH OH OH OH (reacción reversible)

H OH H OH

glucosa-6-P fructosa-6-P

3. Fosforilación de la fructosa-6-fosfato a fructosa 1-6 difosfato. Interviene una


segunda molécula de ATP. Esta reacción es catalizada por la fosfofructoquinasa.

CH2 OPO3= CH2 OPO3=


O O
CH2 OH CH2 OPO3=
+ ATP ADP + ΔGº  -3.4 kcal
OH H OH H
OH OH OH OH (reacción irreversible)

H OH H OH

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4. Escisión de la fructosa 1 - 6 difosfato por una aldolasa (la fructosa-1-6-difosfato
gliceraldehído 3-liasa) dando fosfato de dihidroxiacetona + gliceraldehído-3-fosfato.

1. CH2 OPO3=

2. C O H
1. CH2 OPO3= 4. C O
3. HO CH
ΔGº   5.73 kcal
2. C O + 5. H COH
4. H COH
3. CH2 OH 6. CH2 OPO3=
5. H COH

6. CH2 OPO3=

fructosa 1-6-di P fosfato de gliceraldehído 3-P


(cadena abierta) dihidroxiacetona

Interconversión de los fosfatos de triosa

Solamente uno de los dos fosfatos de triosa, el gliceraldehído 3-fosfato, puede ser
directamente degradado en las reacciones posteriores de la glucólisis. El otro, el fosfato
de dihidroxiacetona, se convierte reversiblemente en gliceraldehído-3-fosfato por acción
de la enzima triosa fosfato isomerasa.
O

CH2 OPO3= C
H
ΔGº  1.83 kcal
C O H C OH

CH2 OH CH2 OPO3=

Así en la primera fase una molécula de glucosa dá dos moléculas de gliceraldehído 3 P.

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SEGUNDA FASE
1. Oxidación del gliceraldehído 3 P a 1-3 difosfoglicerato.
La enzima que actúa es gliceraldehído 3 fosfato deshidrogenasa.

2 gliceraldehído-3-P + 2 NAD+ + 2 Pi (2) 1,3 di-fosfoglicerato + 2 NADH + 2 H+

El NAD+ y el NADH transportan los electrones.

2. Transferencia de fosfato desde el 1-3 difosfoglicerato al ADP.


El 1-3 difosfoglicerato + ADP da 3-fosfoglicerato + 2 ATP; es catalizada la reacción
por la enzima fosfogliceratoquinasa.

3. Conversión del 3-fosfoglicerato dando 2-fosfoglicerato.


Actúa la fosfogliceratomutasa.

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4. El 2-fosfoglicerato da fosfoenolpiruvato + H20 por medio de una enzima, la
enolasa, en un proceso de deshidratación.

5. Transferencia de fosfato desde el fosfoenolpiruvato al ADP.


El fosfoenolpiruvato da piruvato por una enzima piruvato quinasa en presencia de ADP y
Mg   .

6. Reducción de piruvato a lactato. Piruvato da lactato por medio de lactato


deshidrogenasa.

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En condiciones anaerobias (en ausencia del Oxígeno) el lactato es producto final de la
glucólisis el cual difunde a través de la membrana plasmática de la célula hacia el
entorno como producto de desecho. Cuando las células musculares de los animales
superiores actúan de manera anaerobia durante cortos esfuerzos de actividad vigorosa
(excepcionalmente) el lactato escapa desde las células musculares a la sangre y es
transformado nuevamente en glucosa en el hígado.

ECUACIÓN GLOBAL DE LA GLUCÓLISIS EN CONDICIONES AERÓBICAS Y


ANAERÓBICAS

GLUCÓLISIS ANAEROBIA

GLUCOSA + 2 ADP + 2 Pi 2 LACTATO + 2 ATP + 2 H2O

GLUCÓLISIS AEROBIA

GLUCOSA + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD + 2 PIRUVATO + 2 ATP + 2 NADH2 + 2 H2O

ENTRADA DE LOS OTROS HIDRATOS DE CARBONO

Los polisacáridos de reserva el glucógeno, almidón, azúcares sencillos distintos de la


glucosa penetran en la primera fase de la glucólisis.
El glucógeno y el almidón penetran por la acción de dos enzimas que actúan sobre los
extremos terminales no reductores de la molécula, escindiendo los enlaces alfa (1-4).
Otra enzima actúa sobre las ramificaciones alfa (1-6) dando glucosa-1-fosfato para luego
dar glucosa-6-fosfato. Los azúcares sencillos una vez fosforilados, por ej.: manosa-6-P,
fructosa-6-P recién penetran al ciclo.
manosa + ATP manosa-6-P + ADP

fructosa + ATP fructosa-6-P + ADP

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CICLO DE LOS ACIDOS TRICARBOXILICOS Y VIA DEL FOSFOGLUCONATO

Las células aerobias obtienen la mayor parte de su energía de la respiración, esto es,
gracias a una transferencia de electrones desde les moléculas orgánicas combustibles
hasta el oxígeno molecular. La respiración es mucho más compleja que la glicólisis.
En este tema se esboza el plan general de la respiración y después se considera con
detenimiento el ciclo de los ácidos tricarboxílicos o ciclo de Krebs, que es la ruta
catabólica común por la que finalmente se degradan todas las moléculas combustibles
de la célula (carbohidratos, ácidos grasos y aminoácidos).
También se describe la ruta del fosfogluconato de oxidación de la glucosa, mecanismo
que genera NADPH2 para las reacciones biosintéticas.

Energética de la fermentación y la respiración

En la glicólisis se libera solamente una fracción muy pequeña de la energía química


potencialmente asequible en la estructura de la molécula de glucosa. Se libera más
energía cuando ésta se oxida completamente a CO 2 y H2 O como se pone de manifiesto
al comparar las variaciones de energía libre estándar de la conversión anaerobia de la
glucosa en lactato y de su oxidación a CO 2 y H2 O .

glucosa 2 lactato ΔGº   47 kcal

glucosa + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O ΔGº   686 kcal

Cuando las células fermentan a la glucosa anaerobiamente, los productos que ya no son
susceptibles de ulterior empleo, y por ello abandonan la célula, todavía contienen la
mayor parte de la energía de la molécula de glucosa original. Por esta razón, las células
que viven anaerobiamente, para obtener una misma cantidad de energía utilizable tienen
que consumir mucho más glucosa que cuando viven en condiciones aerobias.

¿Por qué rinde la respiración mucho más energía que la glicólisis?

En primer lugar, el producto de la glicólisis, el lactato, es una molécula casi tan compleja
como la glucosa y sus átomos de carbono todavía se hallan en un mismo estado de
oxidación. El CO 2 , producto de la respiración, es una molécula mucho más sencilla y
pequeña que la glucosa, y su átomo de carbono está completamente oxidado.

En segundo lugar, la cantidad de energía que se libera en la transferencia de un par de


electrones desde una molécula combustible determinada a un aceptor electrónico, varía
con la naturaleza del aceptor. Puede liberarse mucha más energía cuando el aceptor
electrónico es el oxígeno molecular, como ocurre en la respiración, que cuando es el
piruvato el que actúa como aceptor, que es el caso de la glicólisis.

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Organigrama respiratorio

En la figura del diagrama de la respiración verán que los grupos acetilo procedentes de
los carbohidratos, de los lípidos y de los aminoácidos en la fase II del catabolismo, en la
siguiente fase III se incorporan al ciclo de Krebs, que en las aerobias constituye la ruta
común final del catabolismo oxidativo de todas las moléculas combustibles. En este ciclo
los grupos acetilo se desintegran para formar CO 2 y átomos de hidrógeno. Estos últimos
(o sus electrones equivalentes) posteriormente se incorporan a la cadena respiratoria
constituida por una serie de transportadores electrónicos.

El proceso subsiguiente de transporte de electrones hasta el oxígeno molecular se


realiza con un descenso muy grande de energía libre, gran parte de la cual se conserva
en forma de ATP, gracias a la fosforilación oxidativa acoplada del ATP.
La reacción global catalizada por el ciclo de Krebs es la siguiente:

Como puede verse en la ecuación, no participan en el ciclo ni el oxígeno molecular, ni el


fosfato inorgánico, ni el ATP.
Su función primaria consiste en la deshidrogenación del ácido acetil CoA para formar, en
último término, dos moléculas de CO 2 y cuatro pares de átomos de hidrógeno. Este
proceso es catalizado en una serie cíclica de reacciones consecutivas, en contraste con
la secuencia glicolítica, que es lineal.

En cada vuelta del ciclo de Krebs se incorpora una molécula de acetil CoA (dos átomos
de carbono) por condensación con una molécula del compuesto de cuatro carbonos, el
oxalacetato, para formar citrato de seis átomos de carbono.
Posteriormente, citrato se degrada con producción de dos moléculas de CO2 y
succinato, compuesto de cuatro átomos de carbono. Finalmente, este último se oxida a
oxalacetato, con lo que puede iniciarse de nuevo una vuelta del ciclo. En cada una de
las vueltas se incorpora una molécula de acetil CoA y se eliminan dos moléculas de CO 2
en cada giro completo se emplea también una molécula de oxalacetato para formar
citrato, pero aquel se regenera al final del ciclo.

Las reacciones enzimáticas del ciclo de Krebs tienen lugar en el compartimiento interno
de la mitocondria (a diferencia de la glucolisis que tiene lugar en el citoplasma celular).

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DIAGRAMA DE LA RESPIRACIÓN

Carbohidrato

Movilización del Amino-


Piruvato Ácidos
acidos grasos
acetil CoA
2H CO2

Acetil-CoA

oxalacetato citrato

cis-aconitato
Ciclo del ácido malato
isocitrato
tricarboxilo CO2
fumarato -oxoglutarato
CO2
succinato

2H 2H 2H 2H

NAD

flavoproteina
ADP + Pi ATP

coenzima Q

Transporte electrónico
y fosforilación citocromo c
oxidativa ADP + Pi ATP
citocromo b

citocromo a + a3
+
ADP A Pi ATP

2 H+ + 1/2 O2 H2O

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Oxidación del Piruvato a acetil CoA

O
Piruvato
CH3 C COOH
NAD+ NADH2

HS-CoA CO2 O
CH3 C S CoA + CO2
Acetil-CoA

La ecuación global es:

La oxidación de piruvato a acetil-SCoA, catalizada por el sistema piruvato-


deshidrogenasa, en realidad constituye un proceso muy complejo.
A causa del gran descenso de energía libre estándar, la reacción es esencialmente
irreversible. Aunque en si misma no forma parte del ciclo del ácido tricarboxílico,
constituye una etapa obligatoria, mediante la cual los hidratos de carbono se incorporan
al ciclo.
En este proceso participan dos coenzimas importantes: CoA y ácido lipoico.

La decarboxilación oxidante del piruvato a acetil CoA  CO 2 necesita tres enzimas


diferentes y 5 coenzimas que constituyen el sistema de la piruvato-deshidrogenasa:

Piruvato-deshidrogenasa
enzimas dihidrolipoil-transacetilasa
dihidrolipoil-deshidrogenasa

Sistema de la
piruvato-deshidrogenasa Coenzima A
ácido lipoico
coenzimas Pirofosfato de tiamina (TPP)
NAD
FAD

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Reacciones individuales del ciclo del ácido tricarboxílico

El acetil-CoA se encuentra ahora dispuesto para incorporarse al ciclo de Krebs.


1. Se produce la condensación de el acetil-CoA con el oxalacetato, para formar citrato.
La reacción es catalizada por la citrato-sintetasa.

O
CH3 C S CoA CoA SH

COOH

COOH CH2

Acetil-CoA citrato
C O HO C COOH
oxalacetato

CH2 CH2

COOH COOH

En esta reacción el grupo metilo (CH 3 ) de la acetil CoA se condensa con el átomo de
carbono carbonílico del oxalacetato con la hidrólisis del enlace tioéster y formación de la
CoA  SH libre.
O
C

2. Actúa una enzima, la aconitasa que cataliza la formación de isocitrato con formación
de un compuesto intermedio el cis-aconitato. En esta reacción se produce pérdida, y
posterior adición de agua.

OH H2O

COOH CH2 C CH2 COOH COOH CH2 C CH COOH

COOH COOH

citrato cis-aconitato

H2O
COOH CH2 CH CH COOH
COOH OH

isocitrato

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3. Se produce una oxidación del isocitrato y pérdida de CO 2 . La reacción es catalizada
por la isocitrato-deshidrogenasa ligada al NAD  , que requiere Mg  ó Mn   para su
actividad.

CO2 O
COOH CH2 CH CH COOH COOH CH2 CH2 C COOH
COOH OH NAD+
NADH2
isocitrato alfa-cetoglutarato

La reacción transcurre con gran descenso de Gº es una reacción altamente


exergónica.

4. La oxidación de alfa-cetoglutarato a succinato se produce en dos etapas.


a. En la primera el alfa-cetoglutarato experimenta una decarboxilacíón oxidativa para
formar succinil-S-CoA y CO 2 .
CH2 O O
COOH CH2 C COOH + NAD+ + CoA SH COOH CH2 CH2 C S CoA + CO2 + NADH2

alfa-cetoglutarato succinil CoA

Esta reacción es comparable a la de la oxidación del piruvato a CoA y se produce


por el mismo mecanismo con intervención de:
+ +
NAD pirofosfato de tiamina ácido lipoico FAD

que participan como cofactores necesarios ligados a la enzima succinil-CoA-


sintetasa.

b. El producto final de la reacción la succinil-CoA que es un tioéster de elevado


contenido energético, experimenta pérdida de su grupo CoA, pero no por una
simple reacción de hidrólisis sino por una reacción con el GDP y fosfato en el que
se conserva la energía.

succinil-CoA + Pi + GDP succinato + CoA SH + GTP

A continuación el GTP formado en esta reacción cede terminal al ADP para


formar ATP.

GTP + ADP GDP + ATP

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La reacción es catalizada por la nucleósido-difosfoquinasa. Este tipo de
fosforilación se designa como fosforilación a nivel de sustrato, para distinguirla de
las fosforilaciones ligadas a la cadena respiratoria.
5. El succinato es oxidado a fumarato en una reacción catalizada por la succinato-
deshidrogenasa que contiene FAD como coenzima que actúa como aceptor de
hidrógeno.

COOH CH2 CH2 COOH + FAD COOH CH CH COOH + FADH2

succinato fumarato

6. Se produce una hidratación del fumarato dando malato, actuando coma catalizador la
fumarasa.
OH
COOH CH CH COOH + H2O COOH C CH2 COOH
H Malato

Fumarato

7. En la última reacción del ciclo la malato-deshidrogenasa dependiente del NAD


cataliza la oxidación del malato a oxalacetato.

OH O
+
COOH C CH2 COOH + NAD COOH C CH2 COOH + NADH2
H

Malato Oxalacetato

Podemos ahora resumir los productos producidos en una vuelta del ciclo del ácido
tricarboxílico.
Dos átomos de carbono aparecen en forma de CO 2 equivalentes, aunque no idénticos, a
los dos átomos de carbono del grupo acetilo que ingresa en el ciclo. Por
deshidrogenación enzimática se producen cuatro pares de átomos de hidrógeno, tres
pares se utilizan para reducir el NAD y uno para reducir el FAD.
En último término, estos cuatro pares de átomos de hidrógeno y electrones se
combinan con el oxígeno, una vez realizado su transporte a lo largo de la cadena
respiratoria.

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CICLO DE KREBS O CICLO DE LOS ÁCIDOS TRICARBOXÍLICOS
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RUTA DEL FOSFOGLUCONATO O VÍA DE LAS PENTOSAS

En la mayoría de los tejidos el 80% o más de la glucosa sigue la vía de degradación de


la glucólisis, el resto ingresa en una vía alternativa conocida como Vía de las pentosas o
ruta del Fosfogluconato.
Su objetivo primordial, en la mayor parte de las células, es obtener NADP reducido
(NADPH2) en el citoplasma extramitocondrial, el cual será utilizado para diferentes
reacciones biosintéticas.
Una segunda función es la producción de pentosas en especial D-ribosa, que se emplea
en la síntesis de ácidos nucleicos.
Otra función importante consiste en participar en la formación de glucosa, a partir del
CO 2 , en las reacciones de fotosíntesis.

Las diversas etapas de la ruta del fosfogluconato tienen lugar en la porción soluble del
citoplasma extramitocondrial de la célula.

1. La primera reacción de la ruta del fosfogluconato es la deshidrogenación


enzimática de la glucosa-6-fosfato por la glucosa-6-fosfato deshidrogenasa para
formar 6-fosfogluconato.

H C OH C O COOH
H2O
H C OH H C OH H C OH
+ +
O + NADP O + NADP
HO C H HO C H HO C H

H C OH H C OH HC OH

H C H C HC OH

CH 2OPO3= CH 2OPO3= CH2 O PO3=

glucosa-6-fosfato 6-fosfogluconato-lactona 6-fosfogluconato

La enzima es específica para el NADP como aceptor electrónico.


Realiza la deshidrogenación del átomo de carbono 1 de la forma piranosa de la
glucosa-6-fosfato y rinde la 6-fosfogluconato lactona. Esta última es inestable y
experimenta hidrólisis espontánea a ácido libre en presencia de una lactonasa
para dar 6-fosfogluconato.

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2. En la etapa siguiente el 6-fosfogluconato experimenta una descarboxilación
oxidativa por acción de la 6-fosfogluconato-deshidrogenasa y se forma una
pentosa la D-ribulosa-5-fosfato, reacción que produce una segunda molécula de
NADPH2.

CH2 OH

COOH C O
H C OH
H COH
H C OH
+ NADP+ H COH + NADPH2 + CO2
HO C H
CH 2OPO3=
H C OH

CH 2OPO3=

6-fosfogluconato ribulosa-5-fosfato

3. Por acción de la ribulosa 5 P epimerasa la ribulosa-5-fosfato se transforma


reversiblemente en xilulosa-5-fosfato, su epímero en el átomo de carbono 3.
Por acción de la ribulosa 5 P isomerasa, la ribulosa-5-fosfato, puede convertirse,
también reversiblemente, en su isómero aldo, la ribosa-5-fosfato que puede
emplearse en la síntesis de los nucleótidos que contienen pentosa y el ARN.

CH2 OH

C O

HO C H xilulosa-5-fosfato
CH2 OH
HC OH
C O sa
i m era CH 2OPO3=
ep
H C OH
CHO
H C OH
iso HC OH
me
CH 2OPO3= ras
a
H C OH ribosa-5-fosfato
ribulosa-5-fosfato

H C OH

CH 2OPO3=

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En ciertas circunstancias, la ruta del fosfogluconato finaliza en este punto, y entonces su
ecuación global se escribe así:

glucosa-6-fosfato + 2NADP+ + H2O ribosa-5-fosfato + CO2 + 2NADPH2

El resultado neto es la producción del NADPH necesario para las reacciones


biosintéticas de reducción en el citoplasma extramitocondrial, y la formación de ribosa
como precursor para la síntesis de nucleótidos.
En otras circunstancias, sin embargo, la ruta del fosfogluconato continúa más allá, ya
que las pentosas-5-fosfato pueden experimentar otras transformaciones que son
posibles gracias a dos enzimas adicionales: la transcetolasa y la transaldolasa.

La transcetolasa que contiene pirofosfato de tiamina íntimamente unido como


coenzima y Mg   , realiza la transferencia de un grupo glicoaldehído desde la
xilulosa-5-fosfato a la ribosa 5 fosfato. El resultado neto consiste en la formación
de un ceto-azúcar de 7 átomos de carbono, la sedo heptulosa-7-fosfato, y un
azúcar de 3 átomos de carbono, el gliceraldehído-3-fosfato.

CH2 OH CHO CH2 OH

C O HCOH C O

HO C H + H C OH HO C H + CHO

H C OH H C OH HC OH HC OH

CH 2OPO3= CH 2OPO3= HC OH CH2 O PO3=

HC OH

CH2 O PO3=

xilulosa-5-P ribosa-5-P sedoheptulosa-7-P gliceraldehído-3-P

Debe observarse que uno de los productos de la acción de la transcetolasa es el


gliceraldehído-3-P que es un intermediario de la secuencia glicolítica. Su formación
constituye un lazo de conexión entre la vía glicolítica y la del fosfogluconato.

La segunda enzima que participa en transformaciones ulteriores de la vía del


fosfogluconato es la transaldolasa, que actúa sobre los productos de la reacción
catalizada por la transcetolasa para formar un azúcar de 6 átomos de carbono, la
fructosa-6-fosfato, y otro azúcar de 4 átomos de carbono, la eritrosa-4-fosfato.

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CH2 OH CH2 OH

C O C O

HO C H CHO HO C H CHO

H C OH + H C OH H C OH + HC OH

H C OH CH2 O PO3= H C OH HC OH
CH2 O PO3=
H C OH CH2 O PO3=

CH2 O PO3=

Fructuosa 6P Eritrosa 4P

La fructosa-6-fosfato, es también un intermediario de la glicólisis y por lo tanto, el


segundo punto de conexión entra las dos rutas: glicolítica y fosfogluconato.

Otra reacción destacada que cataliza la transcetolasa es:

xilulosa-5-P + eritrosa-4-P fructosa-6-P + gliceraldehído-3-P

Una consecuencia importante de la acción de las dos enzimas, consiste en que hacen
posible, junto con las enzimas de la secuencia glicolítica la interconversión de los
azúcares.
La última parte de la vía del fosfogluconato no es bien definida, no conduce a un único
producto final, sino a una ruta ramificada, capaz de gran flexibilidad metabólica.

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ESQUEMA RUTA DEL FOSFOGLUCONATO O VÍA DE LAS PENTOSAS

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TRANSPORTE DE ELECTRONES Y FOSFORILACION OXIDATIVA

Veremos en este capítulo que los pares de electrones derivados de los intermediarios
del ciclo de Krebs fluyen a lo largo de una cadena de varios eslabones, constituidos por
enzimas de transporte electrónico hasta reducir al oxígeno molecular, que es el último
aceptor electrónico, en la cadena.

Durante este proceso se conserva gran parte de la energía libre de estos electrones en
forma de energía del enlace fosfato del ATP; el proceso se denomina fosforilación
oxidativa.
El transporte electrónico y la fosforilación oxidativa suceden en casi todas las células
aerobias, las enzimas que catalizan estas reacciones se hallan localizadas en la
membrana interna de las mitocondrias.

Reacciones de oxidación-reducción

Antes de referirnos a oxidaciones biológicas, veremos que se entiende por oxidación y


reducción.

1. La pérdida de electrones y/o hidrógenos se denomina oxidación.


2. La ganancia de electrones y/o hidrógenos se denomina reducción.

a. En compuestos orgánicos el proceso de oxidación se acompaña de pérdida de


hidrógeno o ganancia de oxígeno.

H H H H
H2O -2H H2O -2H
H C H H C OH H C O H C O CO 2
-2H -2H
H H
ácido anhídrido
metano metanol metanal carbónico
metanoico

El carbono llega a su grado máximo de oxidación.

O sea que la pérdida de átomos de hidrógeno o deshidrogenación equivale también a


una oxidación y el proceso inverso a una reducción.
ganancía de oxígeno
oxidación pérdida de electrones
pérdida de hidrógeno

pérdida de oxígeno
reducción ganancia de electrones
ganancia de hidrógeno

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Las reacciones de oxidación-reducción son aquellas en que tiene lugar una transferencia
de electrones, desde un dador electrónico (el reductor) hasta un aceptor electrónico (el
agente oxidante u oxidante). Es decir que siempre que hay pérdida de electrones por un
átomo se produce una transferencia de electrones a otro átomo. O sea que la oxidación
y la reducción son simultáneas.
Ared. + Boxid. Aoxid. + Bred.

Al equilibrio entre la forma reducida y oxidada se llama sistema de óxido reducción o


sistema redox.

CADENA RESPIRATORIA O CADENA DE TRANSPORTE DE ELECTRONES

CILO DE KREBS

En el proceso un sustrato que se va a oxidar (Isocitrato, alfacetoglutarato, succinato y


malato) entrega sus electrones y protones (H+) al primer constituyente de la cadena que
es el NAD  y este se reduce. El NADH2 entrega sus protones y respectivos electrones a
FAD+ y este se reduce. Luego FADH2 entrega sus electrones y protones a la coenzima
Q+, (que desempeña el papel de transportador electrónico entre las deshidrogenases
ligadas al NAD  y FAD  y los citocromos) entonces se reduce.
De aquí en adelante lo que se transfieren ya son electrones y los H  irán por fuera de la
cadena de transporte de electrones.
Los electrones son transportados a través del citocromo b, c y a + a3. El último
citocromo se autooxida y entrega los electrones al 1/ 2 O 2 que con los H  formará H2 O .
El ½ mol de O2 es el aceptor final de electrones y protones de la cadena de transporte
de electrones.

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Enzimas de óxido-reducción

Tres son las clases principales de enzimas que participan de la corriente del transporte
electrónico desde los sustratos orgánicos hasta el oxígeno molecular.
De acuerdo al orden en que participan son los siguientes:
1. Deshidrogenasas ligadas a la piridina que requieren NAD o NADP como coen-
zima. Participan en la primera parte del eslabón:

2. Deshidrogenasas ligadas a la flavina que tienen como grupo prostético al FAD o


al FMN. Participan en la segunda parte del eslabón

3. Los citocromos que contienen un sistema nuclear ferroporfirínico. Participan en la


última parte del eslabón

Fe++ Fe+++ Fe++

cit. b c a+ a3

Fe+++ Fe++ Fe+++ 2H+ + 1/2 O2 H2O

A continuación, analizamos cada una de las enzimas con sus respectivas


coenzimas:

Deshidrogenasa ligada a la piridina

Se conocen alrededor de 150 y catalizan la siguiente reacción:


Sustrato reducido + NAD+ Sustrato oxidado + NADH + H+

Las deshidrogenases ligadas a la piridina transfieren reversiblemente dos equivalentes


de reducción desde el sustrato a la forma oxidada del nucleótido piridínico.

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La parte activa de los nucleótidos piridínicos es la nicotinamida, ya que ésta es la
porción de la molécula que va a recibir el hidrógeno del sustrato. Es importante destacar
que la nicotinamida es una vitamina del complejo B.

Deshidrogenases ligadas a la flavina

Esta clase de enzimas contienen flavín-adenín-dinucleótido (FAD) o bien flavín-


mononucleótido (FMN) como grupos prostéticos. En la mayor parte de las flavín-
deshidrogenasas el nucleótido flavínico se halla firmemente unido y no se separa de la
enzima durante el ciclo catalítico.

Coenzima Q o ubiquinona funciona, posiblemente, como una molécula liposoluble que


actúa a modo de nexo de unión entre las flavoproteínas y el sistema de los citocromos.

Citocromos: Los citocromos son un grupo de ferroproteínas transferidoras de


electrones en las células aerobias, que actúan secuencialmente transfiriendo electrones
desde las flavoproteínas al oxígeno molecular.Todas ellas contienen grupos prostéticos
ferroporfirínicos; en este aspecto se parecen a la hemoglobina y a la mioglobina. Los
citocromos experimentan cambios de valencia reversibles, Fe (II) - Fe (III), durante el
ciclo catalítico. El citocromo terminal de la cadena, que puede reaccionar con el oxígeno,
es la citocromo-oxidasa. Las formas reducidas de los demás citocromos no pueden
reoxidarse directamente por el oxígeno molecular.

Los citocromos tienen grupos prostéticos hierro porfirínicos. El anillo porfirínico deriva
del compuesto tetrapirrólico llamado porfina que se designa según sus cadenas laterales
sustituyentes.

Potencial estándar de óxido-reducción en la cadena respiratoria

Los potenciales de reducción de los diferentes transportadores electrónicos, se hacen


más positivos a medida que los electrones pasan desde el sustrato el oxígeno. Es decir,
que el transportador electrónico más próximo el extremo inicial de la cadena, o sea el
NAD es el término más reducido, mientras que los transportadores situados en el
extremo del oxígeno (citocromo a + a3) están casi por completo en la forma oxidada.

Energética del transporte electrónico-Fosforilación oxidativa

Se produce una variación de energía libre muy grande durante el proceso de transporte
electrónico desde el NADH2 hasta el oxígeno molecular, a través de la cadena
respiratoria. Este valor puede compararse con la energía libre estándar de formación de
ATP a partir del ADP y el fosfato.

ADP + FOSFATO ATP + H2O Gº  7.3 kcal

Puede verse que la transferencia de un par de electrones, desde el NADH2 al oxígeno va


acompañada de una disminución de energía libre lo suficientemente grande para que
resulte posible la síntesis de varias moléculas de ATP, a partir de ADP y de fosfato.
Tres de los pasos de la cadena respiratoria muestran Gº relativamente grandes; ellos
son:

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1. Entre NAD y FAD
2. Entre citocromo b y c
3. Entre citocromo a y el oxígeno

Las variaciones de energía libre estándar en otros puntos de la cadena son pequeñas y,
por ello resultan insuficientes para provocar la formación de una molécula de ATP.

Acoplamiento de la fosforilación oxidativa al transporte electrónico

Sólo se formarán 3 moléculas de ATP si el sustrato se oxida a nivel del NAD. Puede
ocurrir que el sustrato entregue sus electrones a la flavoproteina FAD (por ej. succinato)
en este caso se producen 2 moléculas de ATP; y si entrega sus electrones al citocromo
a, (por ej. ácido ascórbico) se forma solamente una molécula de ATP.

Balance energético de un proceso de respiración

Es decir, el Gº , cuando la glucosa se oxida completamente hasta CO 2  H2 O por la


secuencia glicocolítica y el ciclo del ácido tricarboxílico.
1.
a
glucosa 2 piruvato

glucosa + 2 Pi + 2 ADP + 2 NAD+ 2 piruvato + 2 NADH + H+ + 2 ATP + 2 H2O

2.
2 piruvato 2 acetil CoA

2 (piruvato + NAD+ + HS - CoA) 2 acetil CoA + 2NADH + 2H+ + 2CoA2

NADH  H se reoxida en la cadena respiratoria y se producen 3 ATP; como son 2


moleculas de NADH + H+  3 ATP x 2 = 6 ATP

3. Ciclo de Krebs se producen 24 ATP

a. 2 isocitrato  2 alfa-cetoglutarato hay deshidrogenación, los H 2 son captados


por el NAD  que se reoxida en la cadena respiratoria y se producen 6 ATP.
H2O
b. 2 alfa-cetoglutarato 2 succinato, ocurre lo mismo, o sea que tam-
bién se producen 6 ATP.
H2
c. 2 malato 2 oxalacetato 6 ATP.

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H2
d. 2 succinato 2 fumarato. En este caso los hidrógenos son
captados por el FAD. Se producen 4 ATP.
e. 2 succinato CoA 2 succinato, hay una fosforilación a nivel de
sustrato de producen 2 ATP.

Resumiendo:
a ………….. 6 ATP
b ………….. 6 ATP
c ………….. 6 ATP
d ………….. 4 ATP
e ………….. 2 ATP
24 TP
4. El NADH2 que se produce en la glicólisis en el pasaje de gliceraldehído
3 P  3 P glicerato , cuando el proceso es anaerobio se reoxida en el pasaje de
piruvato  lactato .
Cuando el proceso es aerobio el NADH2 se reoxida en la cadena respiratoria, por lo
tanto se producen 2 ATP x 2 (porque son dos moléculas de NADH2) = 4 ATP. O sea que
el balance global será:

1. ………….. 2 ATP
2. .………….. 6 ATP
24 glucosa + 6 O2 + 36 Pi + 36 ADP
3. …………..
ATP
6 CO2 + 36 ATP + 42 H2O
4. ………….. 4 ATP
36
ATP

Si analizamos el componente exergónico


glucosa + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O Gº  680 kcal

componente endergónico
36 Pi + 36 ADP 36 ATP + 36 H2O Gº  263 kcal

La eficacia global de la recuperación de energía resulta ser:


263
 100  39%
680

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SISTEMA DE LANZADERA DEL GLICEROL 3 FOSFATO.

Durante la glucólisis en la etapa de oxidación del Gliceraldehído 3 P, se produce NADH2


(NAD reducido). En anaerobiosis, la reoxidación de este NADH2 tiene lugar cuando el
piruvato se convierte en lactato, reacción en la cual el NADH2 se transforma en NAD+
(NAD oxidado). En cambio en aerobiosis, el piruvato ingresa a la mitocondria para
dirigirse al Ciclo de Krebs, entonces no se produce la reoxidación de NADH 2 por lo cual
se llegaría a un exceso de NADH2 en citoplasma con la consecuente escasez de NAD+.
Si en un momento toda la coenzima NAD estaría en estado reducido, la glucólisis se
frenaría.

El NADH2 citoplasmático producido en la glicólisis es impermeable a la membrana


mitocondrial, por lo tanto si no penetra en la mitocondria no se puede reoxidar a nivel de
la cadena respiratoria. Aunque el NADH2 no puede penetrar, sus electrones pueden
hacerlo por medios indirectos denominados lanzaderas. La mejor conocida es la
lanzadera del glicerolfosfato.

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El sustrato aceptor de los hidrógenos del NADH2 es la dihidroxiacetona 3 P (sustrato que
a su vez proviene de la glucólisis), en una reacción catalizada por la glicerol 3 P
deshidrogenasa para formar Glicerol 3 P (ver la 1° reacción en el esquema), es así que
se logra obtener nuevamente NAD+ disponible para el proceso de glucólisis.

En la cara externa de la membrana interna de la mitocondria existe la enzima glicerol 3 P


deshidrogenasa, ligada a FAD. Gracias a esta localización, el Glicerol 3 P formado en el
citosol, no debe ingresar a la mitocondria para ser oxidado a Dihidroxiacetona 3 P y
transferir sus hidrógenos a FAD+ (ver la 2° reacción).
Finalmente el FADH2 formado por oxidación del Glicerol 3 P, cede hidrógenos y
electrones a la cadena de transporte de electrones a nivel de Coenzima Q, los cuales
rendirán 2 ATP en la cadena.

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OXIDACIÓN DE LOS ÁCIDOS GRASOS

Aunque los hidratos de carbono, a causa de su abundancia constituyen el combustible


principal para la mayor parte de los organismos, los ácidos grasos desempeñan también
un papel muy destacado como fuente energética. La oxidación de los ácidos grasos es
importante en los animales superiores y en las plantas, que pueden almacenar
cantidades grandes de grasa neutra como combustible de reserva. Esta oxidación se
lleva a cabo mediante el Ciclo de la Betaoxidación, llamado así porque las reacciones
que ocurren se dan en el carbono Beta del ácido graso, el cual es el tercer carbono
contando desde el grupo carboxilo.

La grasa neutra posee un valor calorífico elevado (9 Kcal) y puede almacenarse en


forma casi anhidra en las gotitas de grasa intracelulares, mientras que el glucógeno o el
almidón (valor calórico = 4 Kcal) se hallan demasiado hidratados para poder
almacenarse en forma tan concentrada.

Hidrólisis intracelular de los lípidos

Los ácidos grasos que experimentan oxidación en los tejidos de los animales superiores
provienen del fluido extracelular o bien de los lípidos intracelulares endógenos. La
sangre de los vertebrados contiene cantidades considerables de triacilgliceroles y de
fosfoglicéridos, así como cantidades muy pequeñas de ácidos grasos libres unidos a la
proteína seroalbúmina, que actúa transportando los ácidos grasos. Estos últimos son
oxidados en tejidos tales como el corazón y el músculo.
La fuente endógena principal de ácidos grasos combustibles es grasa de depósito, en
foma de gotitas de grasa del citoplasma, constituido, en su mayor parte por
triacilgliceroles.

Resumiendo lo expuesto:

de la sangre que contiene


a. fluido extracelular triacilgliceroles, fosfoglicéridos,
ácidos grasos

Ácidos grasos a
oxidarse provienen 1. grasa de depósito constituida
por triacilgliceroles.
b. fuente endógena
2. fosfoglicéridos de las
membranas

A. Hidrólisis intracelular

Los ácidos grasos deben hallarse en forma libre, es decir, no esterificados para que
puedan experimentar el proceso de activación y oxidación. Para ello, deben en primer
lugar, hidrolizarse por la acción de lipasas intracelulares para rendir ácidos grasos libres
y glicerina.

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Se sabe relativamente poco acerca de la secuencia y detalles de la hidrólisis intracelular
de los lípidos. Sin embargo, en general, no tiene lugar acumulación significativa de
ácidos grasos o de otros productos de hidrólisis que serían tóxicos para la estructura de
la membrana. Evidentemente, la velocidad y la ruta de hidrólisis de los lípidos
intracelulares está ajustada a la velocidad de utilización de los ácidos grasos.

B. Ciclo de los ácidos grasos

Activación y penetración de los ácidos grasos en el interior de la mitocondria


Existen 3 fases en la entrada de los ácidos grasos procedentes del citoplasma
extramitocondrial, en el interior de la mitocondria.
1. Esterificación enzimática del ácido graso libre con la CoA extramitocondrial, a
expensas del ATP, que tiene lugar en la membrana exterior.
2. Transferencia del grupo acilo graso desde la CoA a la molécula transportadora
carnitina, la cual lo conduce a través de la membrana interior.
3. Transferencia del grupo acilo graso desde la carnitina a la CoA intramitocondrial.

Activación de los ácidos grasos

Tres enzimas diferentes catalizan la formación de ésteres acil-CoA graso; cada una de
ellas se específica para un determinado intervalo de longitud de cadena de ácido graso.

Acetato-tioquinasa Activa los ácidos acético, propiónico


y acrílico

Tioquinasa de ácido graso Activa los ácidos grasos desde


de cadena media cuatro hasta doce átomos de
carbono

Tioquinasa de ácido graso Activa los ácidos grasos de 12 a 22


de cadena larga o más; átomos de carbono

Las últimas dos tioquinasas activan tanto los ácidos grasos saturados como los no
saturados. Las tres se encuentran en la membrana exterior de la mitocondria. La
reacción global catalizada por las tioquinasas ligadas al ATP es la siguiente:

R COOH + ATP + CoA SH R CH SCoA + AMP + PPi

A medida que el enlace tioéster se forma entre el grupo carboxilo del ácido graso y el
grupo tiol de la CoA, el ATP experimenta ruptura pirofosfórica y rinde AMP  PPi . A su
vez el PP i formado resulta hidrolizado por la pirofosfatasa inorgánica.

PPi + H2O 2 Pi

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El efecto neto de esta hidrólisis es la utilización de dos enlaces fosfato de elevada
energía para impulsar el equilibrio global de la etapa de activación a la formación de acil
CoA graso.

Transferencia de carnitina

Los ácidos grasos superiores poseen una capacidad limitada para atravesar la
membrana interior de la mitocondria en forma de ésteres de CoA; pero su entrada es
estimulada por la carnitina. En el proceso actúa una enzima la acil-CoA graso: carnitin
transferasa de ácido graso, que cataliza la transferencia del grupo acilo graso desde su
enlace tioéster con la CoA, a un enlace éster con la carnitina que es un enlace de
elevada energía.

CH3 O

+
CH3 N CH2 CH CH2 COOH + R C S CoA

CH3 OH

CH3

+
CH3 N CH2 CH CH2 COOH + CoA SH

CH3 O

C O

El compuesto carnitín-O-acilo graso, así formado, atraviesa con facilidad la membrana


interna de la mitocondria; no se sabe si el paso se realiza por simple difusión o con
intervención de algún mecanismo transportador de la membrana mitocondrial.

Transferencia de la CoA intramitocondrial

En la última etapa del proceso de penetración, el grupo acilo graso es transferido desde
la carnitina a la CoA intramitocondrial por acción de la carnitín-transferasa de ácido
graso intramitocondrial.

acil-graso-carnitina + CoA SH acil-graso-CoA + carnitina

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Este mecanismo de entrada ejerce el efecto de mantener separada la CoA
extramitocondrial de la intramitocondrial. El acil-graso-CoA se emplea entonces como
sustrato para el ciclo de oxidación del ácido graso, que tiene lugar en el compartimiento
interno de la matriz. Las mitocondrias contienen otro tipo de acil-tioquinasas que
participan en la activación del ácido graso. Esta enzima necesita GTP en lugar de ATP y
produce GDP  Pi .

GTP + RCOOH + CoASH R C SCoA + GDP + Pi

C. Primera etapa de deshidrogenación

A continuación de la etapa de activación, las reacciones de oxidación del ácido graso


tienen lugar en el compartimiento interior de la mitocondria. El éster formado
experimenta la deshidrogenación enzimática en los átomos de carbono alfa y beta, es
decir, en los átomos de carbono 2 y 3, para formar un acil-graso-CoA no saturado.

2 3
R CH2 CH2 C SCoA acil-graso CoA

E FADoxi.

H O

R C C C SCoA  2,3 trans-enoil CoA + E FADred.

El enlace no saturado formado entre carbonos alfa y beta en esta reacción es el isómero
geométrico trans. Los electrones del FADH2 son cedidos a la cadena respiratoria.

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D. Etapa de hidratación
La hidratación reversible del doble enlace para formar beta-hidroxiacilgraso-CoA
es catalizada por la enzima enoil-hidratasa.

E. Segunda etapa de deshidrogenación

El compuesto obtenido se deshidrogena para formar un 3-oxoacil-graso-CoA, con


intervención de la  -hidroxiacil-graso-CoA-deshidrogenasa siendo el NAD  el aceptor
electrónico específico.

El NADH2 cede sus electrones a la cadena respiratoria.

Etapa de ruptura tiólica

En la última etapa de la secuencia de la oxidación del ácido graso, que es catalizada


por la tiolasa, el cetoacil-graso-CoA experimenta una escisión por interacción con una
molécula de CoA libre para producir un fragmento de dos carbonos que contiene el
carboxilo terminal en forma de acetil-CoA libre, y el éster del CoA de un ácido graso
cuya cadena se ha acortado en dos átomos de carbono.
O O

R CH2 C CH2 C SCoA + CoA SH

O
O

R CH2 C SCoA + CH3 C SCoA

La reacción es muy exergónica, y el equilibrio favorece por tanto la ruptura.

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ESQUEMA DEL CICLO DE LA BETAOXIDACIÓN

Balance de la oxidación

Con la reacción de tiólisis se ha completado una vuelta de la secuencia de oxidación del


ácido graso, en la que una molécula de acetil-CoA, y dos pares de átomos de hidrógeno
resultan eliminados de un acil-CoA graso de cadena larga.

La ecuación global de una vuelta de la secuencia de oxidación del ácido graso actuando
sobre el palmitoil-CoA es la siguiente:

Ahora podemos escribir la ecuación para las siete vueltas del espiral necesarias a fin de
convertir una molécula de palmitoil-CoA en 8 moléculas de acetil CoA (el ácido palmítico
tiene 16 átomos de carbono). Cada molécula de FADH 2 cede un par de equivalentes
electrónicos a la cadena respiratoria a nivel de la CoA y se generan 2 moléculas de ATP.

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De modo análogo, la oxidación de cada molécula de NADH2 da por resultado la
formación de 3 moléculas de ATP. Por lo tanto, se forman un total de 5 moléculas de
ATP por molécula de acetil-CoA escindido (osea por cada vuelta del ciclo). Podemos
escribir ahora la ecuación que también comprende las fosforilaciones:

(1) pamitoíl CoA + 7 CoA + 7 O2 + 35 Pi + 35 ADP

8 acetil CoA + 35 ATP + 42 H2O

Las 8 moléculas de acetil CoA formadas en el ciclo del ácido graso pueden
incorporarse ahora al ciclo de Krebs

(2) 8 acetil CoA + 16 O2 + 96 Pi + 96 ADP

8 CoA + 96 ATP + 104 H2O + 16 CO2

Combinando la ecuación (1) y (2) obtenemos la ecuación global:

pamitoíl CoA + 23 O2 + 131 Pi + 131 ADP

CoA + 16 CO2 + 131 ATP + 146 H2O

Puesto que se necesita una molécula de ATP (o de GTP) para activar el ácido palmítico
libre al comenzar, podemos suponer que el rendimiento neto de ATP es de 130
moléculas.

Oxidación de los ácidos grasos no saturados

Los ácidos grasos no saturados, son oxidados por las mismas rutas generales que los
ácidos saturados; pero se plantean dos problemas:
1. Los dobles enlaces de los ácidos grasos no saturados existentes en la
naturaleza se hallan en la configuración geométrica cis, mientras que los
ésteres del acil graso CoA que actúan como intermediarios en la oxidación
de los ácidos grasos saturados, son trans.
2. Los dobles enlaces de la mayor parte de los ácidos grasos no saturados
aparecen en posiciones tales que la eliminación sucesiva de fragmentos de
dos átomos de carbono rinde un acil-CoA graso con posición del enlace
entre carbonos 3 y 4 en lugar de 2 y 3.
Se ha resuelto este problema con el descubrimiento de una enzima auxiliar, la 3-4-cis-2-3-trans-enoil CoA-
isomerasa que cataliza el desplazamiento del doble enlace desde la configuración 3-4-cis a la 2-3-trans
que es el sustrato normal de la siguiente enzima de la secuencia de oxidación del ácido-graso.

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Cuerpos cetónicos y su oxidación

En muchos vertebrados el hígado posee la capacidad enzimática adecuada para


desviar algo de acetil-CoA, hacia la formación de acetoacetato y  -hidroxibutirato, los
cuales son transportados por la sangre a los tejidos periféricos, en donde pueden ser
oxidados por el ciclo del ácido tricarboxilico. Estos compuestos reciben el nombre de
cuerpos cetónicos. El acetoacetato proviene de la condensación de dos moléculas de
acetil-CoA catalizado por la tiolasa.

acetil CoA + acetil CoA acetoacetil CoA + HSCoA

La acetoacetil CoA experimenta la pérdida de la CoA para transformarse en


acetoacetato, proceso conocido como desacilación.
La principal ruta para la desacilación es la formación y escisión enzimática del  -hidroxi-
 -metil glutaril CoA.

CH3 O

HOOC CH2 C CH2 C SCoA

OH

acetoacetil CoA + acetil CoA -hidroxi -metil glutaril CoA + CoA

El acetoacetato libre así producido se reduce enzimáticamente a Beta-hidroxibutirato,


por la Beta-hidroxibutirato deshidrogenasa ligada al NAD.
acetoacetato + NADH + H+ Beta-hidroxibutirato + NAD+

La mezcla de acetoacetato y Beta hidroxibutirato resultante de esta reacción pueden


difundir después, fuera de la célula hepática, a la corriente sanguínea y llegar a los
tejidos periféricos. Normalmente la concentración de cuerpos cetónicos en la sangre es
muy baja, pero a causa del ayuno o por la diabetes puede alcanzar niveles elevados.
Esto es debido, a que al no existir glucosa utilizable por la célula, ésta se vale de las
grasas, las cuales al degradarse dan como producto acetil CoA en cantidades elevadas.

Oxidación de ácidos grasos de número impar de carbonos

Estos ácidos grasos raramente se encuentran en la naturaleza. Son oxidados por el


ciclo de oxidación del ácido graso. Se separan sucesivamente restos de acetil CoA hasta
que se llega a un resto terminal de tres átomos de carbono: propionil-CoA.
El propionil CoA experimenta una carboxilación enzimática que lo transforma en metil-
malonil CoA que es isomerizado a succinil CoA, que pierde la CoA para rendir succinato
que se incorpora al ciclo del ácido tricarboxílico.

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DEGRADACIÓN OXIDATIVA DE LOS AMINOÁCIDOS

Aunque la función primordial de los A.A. es la de ser precursores de las proteínas y de


otras biomoléculas, se emplean con frecuencia como fuente energética. Los animales
superiores oxidan activamente los aminoácidos tanto exógenos como endógenos. Aún
cuando no se haya ingerido cantidad alguna de proteínas, los seres humanos pueden
excretar hasta 5 grs. de N 2 cada día, que corresponden a la oxidación neta de casi 30
grs. de proteína endógena.
El ciclo de los ácidos tricarboxílicos es la ruta definitiva para la oxidación de los
esqueletos carbonados de los aminoácidos.

En este capítulo describiremos la degradación oxidativa de los aminoácidos


normalmente presentes como unidades estructurales de las proteínas, lo que constituye
la corriente principal del catabolismo de los aminoácidos.
Aunque las reacciones enzimáticas básicas implicadas en el catabolismo aminoácido
son en su mayor parte semejantes en todos los organismos, el ritmo real de utilización y
la proporción de los diferentes aminoácidos empleados en un organismo determinado
dependen de muchos factores que incluyen:
 La capacidad genética para metabolizar aminoácidos;
 La asequibilidad de aminoácidos del entorno;
 La dependencia nutritiva del organismo respecto de los aminoácidos esenciales;
 La disponibilidad de otros combustibles caloríficos;
 Las necesidades de aminoácidos del organismo para la síntesis proteica;
 La necesidad de aminoácidos específicos como precursores de ciertas
biomoléculas importantes, tales como purinas, pirimidinas, componentes de la
pared celular, hormonas y otras moléculas especializadas.

Proteólisis

Antes que las proteínas puedan incorporarse a las rutas catabólicas deben experimentar
hidrólisis completa hasta transformarse en aminoácidos ya que las moléculas proteicas
intactas y la mayoría de los péptidos no pueden atravesar la membrana celular, mientras
que los aminoácidos libres son absorbidos fácilmente.
Por acción combinada de las enzimas proteolíticas segregadas por el estómago, el
páncreas y el intestino delgado, las proteínas ingeridas se hidrolizan por completo hasta
aminoácidos, los cuales son absorbidos por las células epiteliales del intestino delgado,
mediante un transporte activo que requiere energía. Los aminoácidos son enviados
luego a los tejidos por medio de la sangre. Al entrar en las células individuales también
por transporte activo, se incorporan a los canales metabólicos.

Esquema de la oxidación de los aminoácidos

Para la oxidación de los 20 aminoácidos diferentes existen 20 secuencias


multienzimáticas distintas. En último término todas convergen en unas pocas rutas
terminales que conducen al ciclo de los ácidos tricarboxílicos.

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Los esqueletos hidrocarbonados de diez de los A.A. son convertidos finalmente en
acetil-CoA, ya sea por la vía del piruvato o por la del acetoacil-CoA, cinco se convierten
en  cetoglutarato, tres en succinil-CoA y dos en oxalacetato. La fenilalanina y la
tirosina se degradan de modo que una porción del esqueleto hidrocarbonado se
incorpora como acetil-CoA y lo otra como fumarato. Sin embargo no todos los átomos de
carbono de los 20 A.A. se incorporan al ciclo de los ácidos tricarboxílicos ya que algunos
se pierden por el camino de la descarboxilación.

Alanina
Arginina
Cisteína Glutamato
Piruvato Histidina
Glicocola
Glutamina
Serina
Prolina
Treonina
Oxoglutarato
Isocitrato
Isoleucina
Leucina Isoleucina
Triptófano Succinil-CoA Metionina
Citrato Valina

Acetil-CoA Succinato

Oxalacetato Tirosina
Fumarato
Acetoacetil-CoA
Fenilalamina
Malato

Aspartato
Fenilalanina
Asparagina
Tirosina
Leucina
Lisina
Triptófano

Los grupos  -amino de los aminoácidos comparten un destino común, al menos en los
vertebrados, los cuales excretan el N 2 amínico en forma de Urea, Amoníaco o de Ácido
Úrico, según la especie.

Puesto que la eliminación de los grupos  NH 2 constituye la primera etapa en la


degradación de los A.A., examinaremos ahora los dos procesos principales implicados
en esta reacción, ellos son la Transaminación y la Desaminación Oxidativa.

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Transaminación

Por este proceso el grupo amino de por lo menos 11 aminoácidos es separado


enzimáticamente por transaminación y transferido al carbono  de uno o tres
cetoácidos (piruvato; cetoglutarato o al oxalacetato). Por lo tanto el aminoácido al perder
su grupo NH 2 se transforma en el cetoácido correspondiente y el cetoácido que acepta
el grupo NH 2 se transforma en el aminoácido correspondiente. Este proceso de
transaminación es catalizado por enzimas denominadas transaminasas o
aminotransferasas.

Esquema de transaminación

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Cualquiera sea la ruta de transaminación, el alfacetoglutarato es el aceptor final de los
grupos NH 2 de la mayor parte de los aminoácidos y luego transporta esos grupos NH 2
hasta una secuencia final de reacciones mediante las cuales se forman los productos
nitrogenados finales o de excreción. Por ejemplo en la reacción anterior la alanin-
transaminasa cataliza la formación de alanina a partir de un aminoácido más piruvato,
luego esa alanina le transfiere el grupo NH 2 al alfacetoglutarato por acción de la alanin-
glutamato-transaminasa.

Las transaminasas se encuentran tanto en el citoplasma como en la mitocondria de las


células eucarióticas. Todas las transaminasas emplean una misma coenzima y
comparten un mecanismo de reacción común. La coenzima es el fosfato de piridoxal, un
derivado de la vitamina B 6 , necesario como factor de crecimiento y esencial en la dieta
de muchos microorganismos y animales.

Desaminación oxidativa

Este proceso ocurre en la mitocondria y los grupos NH 2 recogidos de los diferentes


aminoácidos por la acción de las transaminasas, aparecen en el último término en forma
de grupos aminos del glutamato.

Descarga así en forma de iones NH 4 , los grupos aminos recogidos de los demás
aminoácidos. La glutamato deshidrogenasa puede usar también el NADP  como aceptor
de electrones, el NADPH2 así formado, actúa como reductor en las reacciones
biosintéticas. La mayor parte de los organismos tienden a reutilizar el NH 4 formado en el
catabolismo de los A.A. recuperándolo.

  cetoglutar ato  NH 4  NADH  H glutamato  NAD 

Glutamato deshidrogenasa

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RUTAS QUE CONDUCEN AL ACETIL-coa

Treonina

Cistina
Glicocola

Cisteina Serina Alanina

Ácido Pirúvico

Acetil-CoA

El esquema muestra los portales de entrada por los que penetran en el ciclo de los
ácidos carboxílicos, los esqueletos carbonados de los diferentes aminoácidos. Las rutas
de los 20 A.A. dependen del punto de entrada. El punto principal de entrada en el ciclo
es por la vía del acetil-CoA, diez aminoácidos penetran por esta ruta, cinco de ellos se
degradan al acetil-CoA por la vía del piruvato y los restantes por la del acetoacetil-CoA.

NH2

CH3 CH CH COOH

OH

Treonina
O
Glicocola H2N CH2 COOH CH3 C
H acetaldehído
Serin-
hidroximetil
CH OH tranferasa

NH 2 NAD+
ATP
Serina CH2 CH COOH CoA
OH Serina
deshidrasa
O

Ácido Pirúvico NADH + H+


CH3 C COOH
AMP; Pi
Piruvato O
deshidrogenasa
CH3 C S CoA

Acetil CoA

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VIA DEL PIRUVATO

Los cinco aminoácidos que penetran por la vía del piruvato son la alanina, la cisteína, la
glicocola, la serina y la treonina (ejemplo anterior). La alanina rinde directamente
piruvato por transaminación con el  -cetoglutarato. En el ejemplo puede verse como se
degradan hasta piruvato, la treonina, la glicocola y serina.

RUTA DEL -OXOGLUTARATO

Los esqueletos carbonados de cinco aminoácidos (arginina, histidina, ácido glutámico,


glutamina y prolina) entran en el ciclo de los ácidos tricarboxílicos por la vía de  -
cetoglutarato, cuyo precursor inmediato es el ácido glutámico.

Arginina Prolina

Semialdehído
glutámico
Histidina Glutamina

Ácido Glutámico

  cetoglutar ato

El esquema muestra las rutas que conducen hasta el  -cetoglutarato de los distintos
A.A. para poder entrar al ciclo de Krebs.

RUTA DEL SUCCINATO

Los esqueletos carbonados de la metionina, la isoleucina y la valina, se degradan


definitivamente, por la vía del propionil-CoA y del metilmalonil-CoA, a succinil-CoA que
experimenta una desacilación para dar succinato, intermediario del ciclo de Krebs.

METIONINA

Ácido oxobutírico
Isoileucina

Propionil-CoA
Valina

Metilmalonil-CoA

Succil-CoA

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RUTA DEL OXALACETATO

La asparagina y ácido aspártico se incorporan finalmente al ciclo de Krebs en forma de


oxalacetato. La asparagina en primer lugar se hidroliza a ácido aspártico y amoníaco por
la acción de la asparaginasa.

Asparagina + H2O ácido-aspartico + NH3

El aspartato así formado, experimenta transaminación con el ácido  -cetoglutarato para


formar ácido oxalacético.

Ácido aspartico + ácido oxoglutarato ácido oxalacético + ácido glutámico

De esta manera los cuatro átomos de carbono de estos aminoácidos pueden


incorporarse al ciclo de Krebs. En las plantas y en algunos microorganismos el ácido
aspártico experimenta una eliminación directa de NH 3 para dar fumarato, catalizada por
la enzima aspartasa, que no se encuentra presente en los tejidos animales.
Ácido aspartico Ácido fumárico + NH3

Formación de productos de excreción nitrogenados

La mayoría de los vertebrados excretan definitivamente cierta fracción del amoníaco


formado en una de estas tres formas: urea, amoníaco, o ácido úrico. El N 2 amínico es
excretado por la mayor parte de los vertebrados terrestres en forma de urea. Son
organismos designados como ureotélicos. Muchos animales acuáticos, tales como los
peces teleósteos, excretan nitrógeno amínico en forma de NH 3 y se les denomina
amonotélicos.
Los pájaros y los reptiles terrestres, cuyo consumo de agua es limitado, excretan el N 2
amínico en forma de ácido úrico (en forma semisólida) y a estos organismos se los llama
uricotélicos. Los anfibios ocupan una posición intermedia. El renacuajo, cuyos hábitos
son acuáticos, excreta amoníaco, después de la metamorfosis, durante la cual el hígado
adquiere las enzimas necesarias, la rana adulta excreta urea.

CICLO DE LA UREA

La formación de urea tiene lugar casi por completo en el hígado de los organismos
ureotélicos, es catalizada por un mecanismo cíclico denominado ciclo de la urea.
Penetran en este ciclo dos grupos aminos que proceden inicialmente de los  -
aminoácidos por desaminación, junto con una molécula de CO 2 y forman arginina a
partir de la ornitina. Esta parte del ciclo de la urea tiene lugar en casi todos los
organismos capaces de realizar la biosíntesis de la arginina pero solamente los animales

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ureotélicos poseen grandes cantidades de enzima arginasa, que cataliza la hidrólisis
irreversible de la arginina para formar urea regenerando ornitina. La urea molécula
neutra soluble en H2 O se excreta con la orina.

El primer grupo NH 2 que entra al ciclo surge en forma de NH 3 libre como consecuencia
de la desaminación oxidativa ligada al NAD  del glutamato en las mitocondrias.

Entonces el NH 3 libre es utilizado junto con el CO 2 para formar fosfato de carbamilo en


una reacción compleja, catalizada por la carbamil-fosfato sintetasa.

-
O O

-
CO2 + NH3 + 2 ATP + H2O H2N C O P O + ADP + Pi

O
Fosfato de carbamilo

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Se necesitan dos moléculas de ATP para formar cada molécula de fosfato de carbamilo
que interviene en esta reacción, la cual es irreversible. El fosfato de carbamilo es un
compuesto rico en energía. El fosfato de carbamilo originado en esta reacción, cede a
continuación, su grupo carbamilo a la ornitina para formar citrulina y fosfato; la reacción
es catalizada por la ornitin-transcarbamilasa.

El segundo grupo  NH 2 penetra después en el ciclo de la urea, al que llega en forma


de aspartato que a su vez lo adquirió del glutamato por acción de la aspartato-glutamato-
transaminasa.

Ácido glutámico + ácido oxalacético Ácido oxoglutárico + ácido aspártico

A continuación el grupo NH 2 del aspartato se condensa con el átomo de carbono


carbonílico de la citrulina en presencia de ATP para formar argininosuccinato, reacción
catalizada por la arginosuccinato sintetasa.

El arginosuccinato es escindido en forma irreversible por acción de la arginin-succinasa,


con formación de arginina y fumarato libre. Hasta este punto la secuencia de la reacción
es empleada por la mayoría de las células en la biosíntesis de la arginasa.
Los animales ureotélicos sin embargo poseen arginasa, la cual desdobla, la arginina en
urea y ornitina que vuelve al ciclo. La ecuación global del ciclo de la urea es:

2 NH3 + CO2 + 2 ATP + H2O Urea + 2 ADP + 2 Pi + AMP + PPi

Excreción de amoniaco

Se cree que en los organismos amonotélicos los grupos  NH 2 derivados a diversos  -


aminoácidos, se transaminan para formar glutamato, que experimenta después una
desaminación oxidativa mediante la glutamato-deshidrogenasa. El NH 3 así formado se
convierte después en N 2 amídico de la glutamina, que es la forma de transporte del NH 3
en la mayor parte de organismos. La glutamina se forma por acción de la glutamina-
sintetasa, a partir de ácido glutámico.

NH2 O NH2
Mg++
HOOC CH2 CH2 CH COOH + NH3 + ATP H2N C CH2 CH2 CH COOH + ADP + Pi

Acido Glutámico Glutamina

La glutamina rinde NH 3 libre en los túbulos renales de la mayoría de los vertebrados,


pero esta reacción predomina en los organismos amonotélicos. La reacción es:

Glutamina + H2O Glutamato + NH4+

El NH 4 así formado pasa directamente a la orina. Dado que la glutamina no es tóxica


constituye un medio de transporte eficaz del NH 3 .

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Formación de ácido úrico

En los organismos uricotélicos, el ácido úrico es la forma principal de excreción de los


grupos  NH 2 de los  -aminoácidos. Es también el producto principal de excreción del
metabolismo purínico en los primates, los pájaros y los reptiles terrestres. La ruta de
formación de ácido úrico es compleja, puesto que en primer lugar debe formarse el anillo
purínico a partir de precursores sencillos.

OH
C N C N O2
N C C N C
 NH 2
Amino ácidos C H
C C Xantin
C C
N N HO N N oxidasa
H
H

Anillo de Purina Xantina

O H
H C N
N C
C O
C C
O N N
H H
Acido Urico
(forma oxo)

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BIOSINTESIS DE CARBOHIDRATOS

Hemos visto que la transformación de la glucosa en piruvato es la senda principal del


metabolismo de los carbohidratos en la mayoría de las células, tanto en condiciones
aerobias como anaerobias.
El proceso inverso, la conversión del piruvato en glucosa es el camino más importante.
Convergen sobre esta senda central biosintética otras dos sendas las cuales provienen
de dos precursores diferentes que no son carbohidratos. Una de ellas está dada por
productos intermedios del ciclo de Krebs, que se transforman en piruvato. Este proceso
se denomina gluconeogénesis. El otro camino está dado por las reacciones que
provocan la reducción del CO 2 para formar glucosa (es en las células fotosintéticas).
1.- Formación de fosfoenol-piruvato
La conversión del piruvato en fosfoenol-piruvato no puede realizarse en presencia de
la piruvato-quinasa ya que es un proceso irreversible. La fosforilación del piruvato se
consigue tanto en el citoplasma como en la mitocondria mediante una secuencia
reaccional de rodeo que necesita de la intervención de varias enzimas, por lo tanto,
el piruvato ingresa a la mitocondria en una vía alternativa para llegar a formar
fosfoenolpiruvato . La primera reacción es la catalizada por la piruvato-carboxilasa
(de la mitocondria).

H2O

piruvato + CO2 + ATP Acetil CoA + oxalacetato + ADP + Pi

Gº  0.5 kcal

La enzima piruvato carboxilasa que se encuentra en la mitocondria necesita de le


acción de la acetil CoA para actuar.

2.- El oxalacetato es reducido a malato por el NADH 2

NADH2 + oxalacetato NADH+ + malato Gº  6.7 kcal

3.- El malato formado difunde al citoplasma donde es reoxidado por la forma


citoplasmática de la malato-deshidrogenasa ligada al NAD  para formar oxalacetato
extramitocondrial.

malato + NAD+ oxalacetato + NADH2 Gº  6.7 kcal

Esta reacción es muy endergónica, se desplaza hacia la derecha porque los


productos finales se eliminan rápidamente.

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4.- El oxalacetato se transforma en fosfoenol-piruvato por la acción de los fosfoenol-
piruvato-carboxiquinasa. En esta reacción el donador de fósforo es el GTP (o el ITP).

Mg++
oxalacetato + GTP fosfoenol-piruvato + CO2 + GDP

Gº   0.7 kcal

Esta reacción global es reversible.

Conversión en glucosa del fosfoenol-piruvato

El fosfoenol-piruvato se convierte fácilmente en fructosa 1 - 6 difosfato por inversión de


las reacciones de la glicólisis que comienzan con la enolasa y terminan en la aldolasa.

enolasa
fosfoenol-piruvato + H2O 2-fosfoglicerato

(1)
2-fosfoglicerato 3-fosfoglicerato

(2)
ATP + 3-fosfoglicerato ADP + 1,3-difosfoglicerato

(3)
1-3 difosfo-glicerato + NADH2 gliceraldehido-3-fosfato + NAD+ + Pi

(4)
gliceraldehído-3-P dihidroxiacetona-P

(5)
gliceraldehído-3-P + dihidroxiacetona-P fructosa-1-6-di P

(1) fosfoglicerometasa - (2) - fosfoglicerato-quinasa - (3) - gliceraldehído-3 P-

deshidrogenasa - (4) - triosa-fosfato-isomerasa (5) - aldolasa

La reacción siguiente no se realiza en dirección a la síntesis catalizada por la


fosfofructoquinasa. Esta reacción es catalizada por la fructosa difosfatasa.

fructosa-1-6-difosfato + H2O fructosa-6-P + Pi

Gº   0.4 kcal

En la etapa siguiente en camino hacia la glucosa la fructosa 6 P se convierte de modo


reversible en glucosa 6 P por la acción de la fosfoglucoisomerasa.

fructosa 6-P glucosa 6-P

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En la mayoría de las células la glucosa-6-P formada durante la gluconeogénesis se
emplea como precursor en la producción de polímeros de reservas como glucógeno,
almidón, de otros monosacáridos de la glucosa, de disacáridos y polímeros
estructurales. Sin embargo en determinadas células como en el hígado, riñón, epitelio
intestinal de los vertebrados, la glucosa-6-P puede desfosforilarse y libera glucosa. El
hígado constituye la fuente más importante de la glucosa sanguínea. La escisión de la
glucosa-6-P; no puede tener efecto por inversión de la reacción de la hexoquinasa, a
causa del gran cambio de energía libre estándar positiva que hay en la dirección de
formación de la glucosa libre.

glucosa-6-P + ADP glucosa + ATP Gº   4.0 kcal

Sin embargo la producción de glucosa libre es inducida por la glucosa 6 fosfatasa, que
cataliza la siguiente reacción exergónica de hidrólisis.

glucosa-6-P + H2O glucosa + Pi Gº   3.3 kcal

Esta enzima se encuentra de modo característico en el hígado y riñón de los


vertebrados. Su actividad es dependiente de los lípidos y de la estructura de la
membrana. La glucosa-6- fosfatasa no se encuentra en los músculos, ni en el cerebro,
por lo que estos órganos no poseen la capacidad de donar glucosa libre.

Resumiendo:

2 piruvato + 4 ATP + 2 GTP + 2 NADH2 + 6 H2O glucosa + 2 NAD+ + 4 ADP + 2 GDP + 6 Pi

Por cada molécula de glucosa que se forma se consumen seis enlaces fosfato de alto
valor energético y se requiere dos moléculas de NADH2 como reductor.

La reacción global es exergónica.

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ESQUEMA DE LA BIOSINTESIS DE HIDRATOS DE CARBONO

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Gluconeogénesis a partir de los intermediarios del ciclo de los ácidos
tricarboxílicos

Dijimos anteriormente que la síntesis de glucosa podría tener varios precursores. Entre
ellos los principales son los productos intermedios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos
que pueden experimentar oxidación a malato. Entonces el malato puede abandonar las
mitocondrias y experimentar su oxidación a oxalacetato en el citoplasma
extramitocondrial; donde tiene lugar la formación de fosfoenol-piruvato por la acción de
la fosfoenolpiruvato-carboxiquinasa del citoplasma. Tres átomos de carbono de los
distintos intermediarios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos se convierten, finalmente en
tres átomos de carbono del fosfoenol-piruvato. Estos carbonos proceden de los átomos
alfa-carboxílicos (alfa-carboxílicos) y beta del oxalacetato.

Acido oxalacético.
COOH

 CH2

C O

 COOH

Gluconeogénesis a partir de acetil CoA

En los tejidos de los animales superiores no hay formación neta de nueva glucosa a
partir de los dos átomos de carbono del grupo acetilo del acetil CoA. Lo que sí sucede es
que la condensación de la acetil CoA con el oxalacetato de citrato que al oxidarse para
dar fosfoenol-piruvato pierde 3 átomos de C en forma de CO 2 . Se deduce que no puede
formar más glucosa que el oxalacetato. En los tejidos animales la acetil CoA no puede
convertirse directamente en piruvato o en succinato. En los animales superiores no
existe senda metabólica alguna por lo que los átomos de carbono de los ácidos grasos
puedan ser utilizados para producir nueva glucosa.

Gluconeogénesis a partir de los aminoácidos

Como se ha visto, algunos o todos los átomos de carbono de los distintos aminoácidos
derivados de proteínas son finalmente convertibles en acetil CoA o en intermediarios del
ciclo de Krebs. Aquellos aminoácidos que pueden servir de precursores del fosfoenol-
piruvato y por consiguiente de la glucosa son aminoácidos glucogénicos. Ej: alanina,
arginina, glicina, histidina, valina, prolina, etc. Los aminoácidos que por degradación son
capaces de formar acetoacetato se los denomina cetógenos. Ej.: leucina. La fenilalanina
y la tirosina constituyen ejemplos de aminoácidos que a la vez son glucogénicos y
cetogénicos puesto que por degradación se escinden para formar ácido fumárico
(glucogénico) y acetil CoA (cetogénico).

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BIOSÍNTESIS DE LÍPIDOS

La ruta biosintética que conduce desde la glucosa a los ácidos grasos es importante en
la mayoría de los organismos. Puesto que la capacidad de los animales superiores para
almacenar polisacáridos es bastantes limitada la glucosa ingerida en exceso, respecto a
las necesidades calóricas inmediatas y a la capacidad de almacenaje, se convierte en
ácidos grasos, y éstos a su vez, en triacilgliceroles que pueden almacenarse en grandes
cantidades en el tejido adiposo. Constituye otro proceso importante la biosíntesis de
fosfoglicéridos de las membranas, puesto que la mayoría de las células experimentan un
recambio relativamente veloz. También se verá la biosíntesis de colesterol. Aunque
desde el punto de vista cuantitativo se trata de una vía secundaria, el gran número de
esteroles, biológicamente activos, que derivan del colesterol le confiere considerable
importancia.

BIOSINTESIS DE LOS ÁCIDOS GRASOS SATURADOS

La síntesis completa de ácidos grasos saturados de largas cadenas tiene efecto,


solamente en la fracción soluble del citoplasma. Esta catalizada por un complejo de
siete enzimas que se denomina complejo sintetasa de ácidos grasos. Los acil-derivados
intermediarios del proceso no son los tioésteres de la CoA, como en el caso de la
oxidación de los ácidos grasos, sino tioésteres de una proteína de bajo peso molecular
denominado proteína transportadora de ácil os (o ACP). Esta proteína puede formar
complejos con las enzimas sintetasas a manera de un racimo.

Malonil transferasa

Acil transferasa
Palmitil
transferasa
Enzima condensante
( citonil sintetasa)

Deshidrogenasa
(2º reducción) SH (resto fosfopantotenil
con grupo SH terminal que
enlaza los intermediarios
acílicos)

Deshidrogenasa
Deshidratasa (1º reducción)

SH

(resto SH perteneciente a la proteína


transportadora de grupos acilos)

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La malonil CoA es el precursor inmediato de 14 de los 16 átomos de carbono del ácido
palmítico; se forma a partir de la acetil-CoA citoplasmática (que deriva de la acetil-CoA
mitocondrial) y del CO 2 por la acción de la acetil-CoA-carboxilasa.

O O
biotina
CH3 C SCoA + CO2 + ATP HOOC CH2 C S CoA
++
Mn

El CO2 se convierte en el carbono carboxílico libre distal de la malonil CoA. Los grupos
acilos de la acetil-CoA y de la malonil CoA son transferidos al grupo tiol de la ACP por
acción de dos enzimas acil-transferasa y malonil-transferasa.

O O
acil
SH + CH3 C SCoA S C CH3 + HSCoA
transferasa
Acetil CoA
Acetil-S-ACP

SH SH

O O O
malonil
S C CH3 + COOH CH2 C SCoA S C CH3 + HSCoA
transferasa
Malonil CoA

SH S
C O
CH2

COO H

Acetil Malonil-S-ACP

Acetil-S-ACP y malonil-S-ACP reaccionan entre sí de manera que el grupo acetilo del


primero pasa a formar los carbonos 3 y 4 del grupo acetoacetilo, con desplazamiento del
CO 2 .

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SH + CO2

condensante

S
C O
CH2
C O
CH3

Acetoacetil-S-ACP

La acetoacetil-S-ACP se reduce por acción del NADPH.

SH SH SH

NADPH+ + H+ NADP NADPH+ + H+ NADP


deshidratasa
S S S
deshidrogenasa
C O C O C O
H2O
CH2 CH2 CH
C O H C OH CH
CH3 CH3 CH3
Acetoacetil-S-ACP  Hidroxibutiril - S- ACP crotonil-S-ACP

SH S
C O
acil
transferasa CH2
S
CH2
C O
SH CH3
CH2
CH2
CH3

butiril-S-ACP

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La formación de butiril-S-ACP completa el primer ciclo, el cual se repite seis veces más
en el cual una molécula de malonil-S-CoA se incorpora a la ACP para dar malonil-S-ACP
la cual experimenta pérdida de CO 2 y condensación con el acilo graso que se encuentra
en el otro brazo. De ésta manera el producto es el ácido palmítico de 16 átomos de
carbono. Al final del ciclo se libera la ACP por la acción de una desacilasa hidrolítica.

SH + CH3 (CH 2)14 COOH

ácido palmitico

SH

Las reacciones enzimáticas de la síntesis de ácidos grasos difieren de la oxidación en:


 Su localización dentro de la célula.
 En el portador de grupos acilos.
 En la forma en que las unidades de dos átomos de carbono se adicionan o
eliminan.
 El NADPH necesario en la reducción proviene de la vía del fosfogluconato.

Prolongación de los ácidos grasos saturados en las mitocondrias y los


microsomas

El ácido palmítico que es el producto final normal del sistema de la sintetasa de los
ácidos grasos del citoplasma, puede prolongarse mediante dos tipos diferentes de
sistema enzimáticos: el de las mitocondrias y del retículo endoplasmático.
En las mitocondrias los ácidos grasos saturados de 12 a 16 átomos de carbono, en
forma de ésteres de la CoA, se alargan por adiciones sucesivas de acetil-CoA. La ruta
mitocondrial se realiza por inversión de las mismas etapas implicadas en la oxidación,
con excepción de la reducción del doble enlace α β que conduce al ácido graso
saturado, que se verifica a expensas del NADHP como reductor, y no de la
flavoproteína. El sistema mitocondrial es capaz de alargar también los ácidos grasos no
saturados.
En los microsomas tanto los ésteres de ácidos grasos saturados, como los de los no
saturados pueden prolongarse, pero en este caso es la malonil-CoA la fuente de grupos
acetilos.

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Formación de ácidos monoenoicos (con doble enlace)

Los precursores de los ácidos grasos monoenoicos son el:

Acido palmítico (C16) Acido Esteárico (C18)

Acido palmitoleico () Acido oleico ()

Aunque la mayoría de los organismos tienen capacidad para formar ácido palmitoleico y
ácido oleico, la ruta y el mecanismo utilizado dependen si el organismo es anaerobio o
aerobio.
En los organismos aerobios los dobles enlaces son introducidos por una oxigenasa
específica localizada en la fracción microsómica, especialmente del hígado y del tejido
adiposo.
No se conocen detalles completos del mecanismo enzimático, pero se sabe que se
utiliza la molécula de oxígeno como aceptor de dos pares de electrones, uno de los
cuales procede del sustrato acil-CoA y el otro del NADPH, que se requiere en la
reacción.

palmitoíl-CoA + NADPH + H+ + O2 palmitoleíl-CoA + NADP+ + 2 H2O

1 par 1 par

Formación de ácidos polienoicos

Todos los ácidos polienoicos se forman a partir de cuatro precursores:


1.- Ácido palmitoleico
2.- Ácido oleico
3.- Ácido linoleico
4.- Ácido linolénico

Los cuales sufren ulterior alargamiento y/o desaturización. Los ácidos linoleicos y
linolénicos no pueden ser sintetizados por los mamíferos quienes tienen que tomarlos de
fuentes vegetales por esta razón se denominan ácidos grasos esenciales.

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BIOSINTESIS DE TRIACIL GLICEROLES (TAG)

Los TAG, que actúan como lípidos de depósito o de almacenamiento, son activamente
sintetizados por las células hepáticas y adiposas de los mamíferos. Para la síntesis se
requieren dos precursores principales:
1.- Glicerol 3-fosfato
2.- Acil CoA graso

El glicerol 3-fosfato procede de dos fuentes:

1.- Dihidroxiacetona-fosfato que se produce en la glicólisis.

Dihidroxiacetona-fosfato + NADH + H+ glicerol-3-fosfato + NAD+

2.- También puede formarse por la acción de la gliceril-quinasa


ATP + glicerina glicerol-3-fosfato + ADP

Etapas de la biosíntesis

- Primera etapa: Acilación de los grupos oxidrilos libres del glicerol-3-fosfato por dos
moléculas de acil-CoA graso, produciendo un ácido fosfatídico.
O
CH2 O C R
CH2 OH
O O
+ 2 R C S CoA CH O C R' + 2 HSCoA
CH OH
Acil CoA Graso
CH2 O PO3H2
CH2 O PO3H2
Glicerol 3 P Ácido fosfatídico

- Segunda etapa: El ácido fosfatídico experimenta una hidrólisis por acción de una
fosfatasa específica formando diacilglicérido.
O O
CH2 O C R CH2 O C R
O O
CH O C R' + H2O CH O C R' + Pi

CH2 O PO3H2 CH2 OH


Diacilglicérido

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- Tercera etapa: El diacilglicérido reacciona con una molécula de acil-graso CoA
dando triacilglicerol.

O O
CH2 O C R CH2 O C R'
O O O
CH O C R' + R'' C S CoA CH O C R'' + HSCoA
O
CH2 OH CH2 O C R'''
Triacilglicérido o triglicérido

BIOSINTESIS DE FOSFOGLICERIDOS

Los principales fosfoglicéridos que sirven como componentes de las membranas y las
lipoproteínas de transporte se forman por ramificaciones de la ruta biosintética a partir
del ácido fosfatídico. Además intervienen los nucleótidos citidínicos. Todas estas
reacciones tienen lugar en el retículo endoplásmico.
1) El ácido fosfatídico con el CTP se convierte en citidín-difosfato-diacilglicérido que
es el precursor común de todos los fosfoglicéridos formados por ésta ruta.

Acido fosfatídico + CTP citidín-difosfato-diacilglicérido + PPi

Su porción CMP puede considerarse la portadora del ácido fosfatídico. En las reacciones
subsiguientes, cada una de las cuales es catalizada por una enzima específica la
porción CMP es desplazada por los alcoholes: serina, inositol, fosfato de glicerilo.
O
CH2 O C R
O
CH O C R'

CH2

HO P O

HO P O

CH2 O citosina

H H
H

OH OH

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1). CDP - diacilglicérido + serina fosfatidil-serina + CMP
2). CDP - diacilglicérido + inositol fosfatidil inositol + CMP
3). CDP - diacilglicérido + glicerol-fosfato fosfatidil-glicerol-fosfato +
CMP

La descarboxilación enzimática del resto de la serina de la fosfatidilserina conduce a la


formación de la fosfatidil-etanolamina.
La fosfatidil-etanolamina es precursora de la fosfatidil-colina, la cual se forma por
transferencia de tres grupos metilos.
El fosfatidil-gliceril-fosfato es precursor de dos lípidos. Por desfosforilación rinde
fosfatidil-glicerina que es uno de los componentes de la membrana celular de muchas
bacterias. El fosfatidil-gliceril-fosfato con una segunda molécula de CDP - diacilglicérido
rinde cardiolipina.

Acido fosfatídico

CTP

CDP - diacilglicérido Fos


ina fato
Ser glice de
Inositol rilo

Fosfatidil-serina Fosfatidil-inositol Fosfatidil-glicerol-fosfato

CO2 Pi

Fosfatidil-etanolamina Fosfatidil-glicerina

3 CH3- + CDP-diacilglicérido

Cardiolipina
Fosfatidil-colina

BIOSINTESIS DE COLESTEROL

Comprende tres etapas:


1.- Conversión de acetato en ácido mevalónico
2.- Conversión de ácido mevalónico en escualeno
3.- Conversión de escualeno en colesterol.

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1). Conversión de acetato en ácido mevalónico:

El ácido mevalónico tiene seis átomos de carbono por lo que se forma por
condensación de tres moléculas de acetil-CoA.

Acetil CoA + acetoacetil CoA hidroxi -  metil - glutaril CoA + CoA

NADPH2
hidroxi -  metil - glutaril CoA ácido mevalónico + NADP + HSCoA

2). Conversión de ácido mevalónico en escualeno:

El ácido mevalónico es fosforilado por el ATP y se convierte en ácido-3-fosfo-5-


pirofosfomevalónico.
CH3 OH OH
COO H CH2 C CH2 CH2 O P O P OH
O O
O
HO P OH
O

El compuesto es muy inestable pierde H3PO 4 y se descarboxila dando isopentenil-


pirofosfato que se isomeriza y dá el 3-3'-dimetil-alil-pirofosfato.

CH2
OH OH
C CH2 CH2 O P O P OH
O O
CH3

CH3
OH OH
C CH CH2 O P O P OH
O O
CH3

Estos dos compuestos se condensan con pérdida de PP i dando geranil-pirofosfato.

- PPi
geranil-pirofosfato + isopentenil pirofosfato farnesil pirofosfato

El cual experimenta condensaciones reductoras y conducen al escualeno.

3). Conversión de escualeno en colesterol

El escualeno sufre un ataque del oxígeno formando el 2-3 epóxido, el cual sufre una
ciclización a lanosterol en el cual se producen desplazamientos electrónicos con el
cierre de los cuatro anillos y formación de colesterol.-

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BIOSÍNTESIS DE LOS AMINOACIDOS

La biosíntesis de los aminoácidos a partir de precursores sencillos, es vital para todas


las formas de vida, puesto que los aminoácidos son los precursores de las proteínas. Sin
embargo los organismos vivos difieren considerablemente en lo que se refiere a las
formas de N 2 que son capaces de utilizar con dicha finalidad.
Los animales superiores pueden utilizar NH 3 como fuente de N 2 para la síntesis de
aminoácidos no indispensables, pero son incapaces de utilizar, nitritos y nitratos o N 2 .
Los rumiantes pueden utilizar los nitritos y nitratos pero solo después que las bacterias
de su panza los reducen a NH 3 .
Las plantas superiores pueden producir todos los aminoácidos requeridos para la
síntesis de proteínas, a partir tanto de NH 3 como de nitratos, como fuentes de N 2 .
Pueden utilizar el NH 3 como tal o después de su oxidación a nitrato por acción de las
bacterias del suelo. Las leguminosas son capaces de fijar N 2 atmosférico como NH 3 por
acción de las bacterias que se encuentran en sus nódulos radicícolas.
Los microorganismos difieren ampliamente en cuanto a su capacidad de efectuar
síntesis de aminoácidos. Algunos no pueden crecer si no se le suministran algunos
aminoácidos ya formados. Otros como E.Coli pueden obtener todos sus aminoácidos a
partir de NH 3 .
Los veinte aminoácidos se sintetizan gracias a unas secuencias polienzimáticas, algunas
de las cuales son extremadamente complejas como es el caso en las mayoría de las
vías biosintéticas, las sendas de las síntesis aminoácidas son, en su mayor parte,
diferentes a las seguidas en sus degradaciones.
Por una parte los aminoácidos sirven no sólo como bloques de montajes en la síntesis
de proteínas sino también como precursores de muchas biomoléculas que poseen gran
variedad de funciones especializadas. Es frecuente que las rutas de síntesis y
degradaciones aminoácidas incluyan ciertas ramificaciones o extensiones conducentes a
la formación de tales productos especializados.
Ya hemos visto que las formas biológicas de N 2 disponibles son relativamente escasas
en los ambientes inanimados, porque el proceso de fijación de N 2 atmosférico está
circunscrito a unos pocos organismos
Además las propias síntesis de las enzimas que catalizan la formación de los
aminoácidos se hallan también bajo control, tales síntesis pueden resultar reprimidas, si
la célula dispone de un suministro exógeno de aminoácido. Ambas formas de regulación
constituyen el reflejo de una intrínseca economía celular que prevalece en la síntesis y
en la utilización de los aminoácidos.

Biosíntesis de los aminoácidos no esenciales:

Se definen a éstos como aquellos aminoácidos que pueden ser sintetizados por la rata
albina. Conviene considerar en primer lugar este grupo de aminoácidos, porque la
mayoría de los organismos pueden realizar su síntesis. Además este grupo se distingue
porque sus rutas biosintéticas son más bien cortas y muestran variaciones relativamente
pequeñas de unas especies a otras.

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Biosíntesis de ácido glutámico: glutamina y prolina

Las rutas biosintéticas de estos aminoácidos que están íntimamente relacionados son
idénticas en todas las formas de vida. Los tres se degradan por sendas que conducen al
 cetoglutarato, y los mismos caminos que se emplean para su síntesis. El ácido
glutámico se forma desde luego a partir de NH 3 y de ácido  cetoglutárico por acción de
la L-glutamato ~ deshidrogenasa.

NH3 + ácido oxoglutárico + NADPH + H+ ácido L-glutámico + NADP+

Esta reacción es de importancia fundamental en la biosíntesis de cualquier aminoácido


en todas las especies, pues se trata de la ruta primaria sino la única de formación directa
de grupos   amino a partir de NH 3 . La transaminación de los ácidos  -ceto con el
ácido glutámico como donador de grupos NH 2 , constituye la senda principal de
introducción de grupos  -amino en la biosíntesis de la mayoría de los aminoácidos.
La Glutamina se forma a partir del ácido glutámico por la acción de la glutamina ~
sintetasa ya descrita:

NH3 + ácido glutámico + ATP Glutamina + ADP + Pi

Esta reacción es bastante compleja e implica dos o más etapas intermedias. Se ha


observado que el  ~glutamil fosfato actúa como intermediario de alta energía ligado a la
enzima.

O OH

C O P OH

CH2 O

CH2
ácido glutamil-fosfórico
H C NH2

COOH

ATP + Acido glutámico ADP +  glutamil~fosfato

 glutamil~fosfato + NH3 glutamina + Pi

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La prolina se sintetiza a partir de ácido glutámico por inversión de la ruta metabólica,
antes descrita para la oxidación de la prolina.

Los restos de hidroxiprolina que se encuentran en el colágeno y en otras proteínas


fibrosas, se forman a partir de determinados restos de prolina de esas proteínas por
acción de la prolin-hidroxilasa. Esta oxigenasa de función mixta utiliza el cetoglutarato
como correductor y el oxígeno corno aceptor electrónico. En la reacción se requieren
Fe    y ácido ascórbico como cofactores. Sin embargo la prolin-hidroxilasa no
transforma la prolina libre en hidroxiprolina.
Acido Glutámico
NADH

NH2

H C CH2 CH2 CH COOH semialdehído


glutámico

O
H2C CH2
inhibición

H
HC C Acido 1~pirrolín
N COOH 5 carboxílico

H2C CH2
H
H2C C
N COOH

H
Prolina

Biosíntesis de alanina: ácidos aspártico y asparagina:

En muchos organismos la alanina y el ácido aspártico se forman por transaminación de


ácido pirúvico y del ácido oxalacético respectivamente.

ALANINA

O NH2 NH2 O
CH3 C COOH + HOOC CH2 CH2 C COOH CH3 C COOH + HOOC CH2 CH2 C COOH

H H
Acido pirúvico Acido glutámico Alanina Acido oxoglutárico

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ACIDO ASPARTICO

O NH2
HOOC CH2 C COOH + Acido glutámico HOOC CH2 C COOH + Acido -oxoglutámico

Acido oxalacético H
Acido Aspártico
En algunas plantas estos dos compuestos se producen por Aminación reductora. El
ácido Aspártico es el precursor directo de la asparagina. En muchos organismos ésta se
forma por una reacción similar a la catalizada por la glutamin-sintetasa.

NH2 NH2
NH2
HOOC CH2 C COOH + NH3 + ATP C CH2 C COOH + ADP + Pi

H O H
Acido Aspártico Asparagina

TIROSINA

Aunque la Tirosina es un aminoácido no indispensable, su síntesis requiere el


aminoácido esencial feniIalanina, como precursor. La tirosina se forma a partir de la
fenilalanina por una reacción de hidroxilación catalizada por la fenil-alanin-hidroxilasa. La
cual como hemos visto participa de la degradación de la fenilalanina.

Fenilalanina + NADPH + H+ + O2 Tirosina + NADP+ + H2O

Biosíntesis de aminoácidos esenciales

Las sendas de la síntesis de los aminoácidos esenciales se han deducido en gran parte,
de estudios bioquímicos y genéticos practicados con bacterias. En general los caminos
son idénticos en la mayoría de las especies bacterianas y plantas superiores. Sin
embargo en algunos casos se observan diferencias de especie en algunas etapas
individuales. Las sendas que llevan a la biosíntesis de los aminoácidos esenciales son
más largas que las que llevan a la síntesis de los no esenciales. También son más
complejas posiblemente porque varios intermediarios sirven también como precursores
de muchas otras clases de biomoléculas.

Biosíntesis de metionina y treonina

Estos dos aminoácidos esenciales tienen un denominador común: sus esqueletos


carbonados proceden de la homoserina. Análogo de la serina con cuatro átomos de
carbono. A su vez la cadena de carbonos de la homoserina deriva del esqueleto del
ácido aspártico, luego de una serie de reacciones que no tienen lugar en los mamíferos.
El camino metabólico de la reducción del grupo  -carboxílo de ácido aspártico al

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correspondiente aldehído se parece a la reducción de 1-3 difosfoglicerato al 3
gliceraldehído-fosfato de la ruta de la glicólisis.
La homoserina formada en la primera etapa se fosforila a fosfato de homoserina
mediante una reacción que requiere ATP.
El fosfato de homoserina se convierte en Treonina por acción de la Treonín-sintetasa,
enzima que requiere fosfato de Piridoxal.
En esta reacción se elimina ácido fosfórico de los carbonos 3 y 4, se obtiene así un
doble enlace 3,4 que se isomeriza a la posición 2,3 y después se hidrata para formar
Treonina.

SINTESIS DE TREONINA

O OH
H
NAD+ C CH2 OH
COOH ATP ADP C O P OH NADH NADH NAD+
O
CH2 CH2
CH2 CH2 O
apartil H C NH2
H C NH2 quinasa H C NH2 H C NH2
COOH COOH
COOH COOH
Acido aspartil Semialdehído Homoserina
aspártico fosfato aspártico

OH CH2
ATP ADP H+
CH2 O P OH - Pi CH
CH2 O C N CH ENZ.
Complejo enzimático
C N CH ENZ. -homoserin-fosfato COOH
COOH

CH3 CH3 CH3


+
H CH H2O H C OH H2O H C OH + O CH ENZ.

C N CH ENZ. H C N CH ENZ. H C NH2


COOH COOH COOH
Treonina
Se cree que la secuencia completa tiene lugar con el grupo   NH 2 del sustrato unido al
grupo aldehído del fosfato de piridoxal de la enzima como una base de Schiff, en éste
complejo el átomo de H2  es lábil.
El producto final de la secuencia, la treonina, es un inhibidor modulador de la primera
enzima del sistema que es la enzima regulador aspartil-quinasa.

METIONINA

La conversión de la homoserina en metionina comienza con la formación enzimática de


la O~succinil homoserina por transferencia de un grupo succinilo del succinil-CoA. En la
reacción siguiente se forma cistationina a partir de la O succinil-homoserina y de la

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Cisteína la cual, a su vez escinde, para dar homocisteína ácido pirúvico y NH 3 . La
Cisitationina puede experimentar dos tipos de escisión, uno a cada uno de los lados del
átomo de azufre, así puede servir como intermediario de la conversión de Metionina en
Cisteína en los mamíferos y de la transformación de Cisteína en Metionina en las plantas
y bacterias.

O
CH2 OH Succinil CoA CH2 O C CH2 S CH
Cisteína
CH2 CH2 CH2 CH2 H C NH2
H C NH2 H C NH2 CH2 H C NH2 COOH
COOH COOH COOH COOH

Homoserina O succinil - homoserina Cistationina

CH3
SH S
CH2 CH2
Piruvato DA ~ Cobalanina
CH2 CH2
N5 ~ Metil
+ NH2 H C NH2 H C NH2
tetrahidroflorato
COOH COOH
Homocisteina Metionina

La metilación de la Homocisteína a Metionina en E. Coli tiene lugar por transferencia del


N 5 ~ metil tetrahidrofolato grupo Metilo de .

D. A. ~ Co
N5 metil tetrahidrofolato + homocisteína tetrahidrofolato + metionina
balamina

En esta reacción se requiere Desoxiadenosilcobalamina, coenzima que contiene


vitamina B12 , su acción como portador de grupo metilo ( CH 3 ) del N5 metil-
tetrahidrofolato el cual puede provenir originalmente de varios donadores de grupos (
 CH 3 ) metilo, tales como la colina o la 5-adenosil-metionina. A su vez, la homocisteína
es uno de los posibles aceptores de grupos
(  CH 3 ) metilo.

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Funciones Precursoras de los Aminoácidos: Biosíntesis de Porfirinas

Los aminoácidos son precursores de muchas biomoléculas (aparte las proteínas) que
ejercen importantes funciones biológicas, tales como hormonas, vitaminas, coenzimas,
alcaloides, porfirinas, antibióticos, pigmentos y sustancias neurotransmisoras.
Es digno de mención especialmente, el hecho de que los aminoácidos cromáticos, sean
los principales precursores de buen número de alcaloides entre ellos la morfina, la
codeína, y la papaverina, así como de muchas otras sustancias con intensa
actividad biológica, tales como la hormona tiroxina, la hormona de crecimiento vegetal:
ácido indolacético, el poderoso vasocontrictor neurohumoral: serotonina y las hormonas
catecolamínicas: epinefrina y norepinefrina.
Los aminoácidos son precursores de pequeños péptidos, como el glutatión y de las
hormonas péptidas, como la bradiquinina, oxitocina y la vasopresina.
El péptido glutation se sintetiza según las siguientes reacciones:
Mg++
Acido glutámico + Cisteína + ATP Glutamilciateina + ADP + Pi

Glutamilcisteína + Glicina + ATP Glutatión + ADP + Pi

La biosíntesis de las Porfirinas cuyo principal precursor es la Glicina requiere especial


atención por la importancia central del núcleo porfirínico en la función de la hemoglobina,
de los citocromos y de la clorofila. Los tetrapirroles se construyen a partir de cuatro
moléculas del derivado monopirrólico Porfobilinógeno, que a su vez se sintetiza según
las siguientes etapas:

COOH COOH COOH

HSCoA COOH
CH2 CH2 NH2 CH2 CH2
+
CH2 COOH CH2 CH2

C S CoA C O C O
Glicina
O
H C NH2 CH2
Succinil~CoA
COO H NH2
Acido amino
Acido amino levulínico
oxoadípico

En la primera reacción la glicina reacciona con el succinil-CoA para dar ácido  -amino
 oxoadípico quien luego se descarboxila para dar ácido amino-levulínico reacción que
es catalizada por la  amino~levulínico~sintetasa; enzima que requiere fosfato de
piridoxal y se encuentra en el retículo endoplásmico de las células hepáticas.
Luego dos moléculas de amino-levulínico se condensan para formar porfobilinógeno
bajo la acción de la  aminolevulínico deshidrasa.

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COOH COOH
HOOC CH2 COOH
CH2 CH2
2 H2O CH2 CH2
H C H + CH2
C C
C O C O
CH2 C C H
CH2 H C H N
NH2
NH2 N H H
Porfobilinógeno
H

Como precursores de la Protoporfirina actúan cuatro moléculas de porfobilinógeno, a


través de una serie compleja de reacciones, la primera de las cuales la cataliza la
porfobilinógeno~desaminasa. Algunas de las etapas de la serie permanecen aún
oscuras.
El hierro no se incorpora hasta que se ha completado la molécula de la protoporfirina.
Esta incorporación requiere una enzima, la hemo-sintetasa o Ferroquelatasa que está
localizada en las mitocondrias.

CH3 CH CH2

C C
HOOC CH2 COOH
CH C C CH
CH2 CH2
H
CH3 C C C C CH3
C C
N H H N
CH2 C C H
N CH2 C C C C CH CH2
NH2 CH2 H
H HC C C CH
COOH
Porfobilinógeno
C C
CH2 CH3
CH2
COOH

Protoporfirina IX

La degradación de la protoporfirina IX, conduce a la bilirrubina y a biliverdina, que son


pigmentos segregados en la bilis.

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BIOSINTESIS DE LOS MONONUCLEOTIDOS

La biosíntesis de ribonucleótidos y desoxiribonucleótidos es un proceso vital ya que


estos compuestos son precursores directos del ADN y del ARN así como de las
coenzimas nucleotídicas.
Las rutas metabólicas de formación de sus bases (púricas y pirimidínicas) tienen una
importancia central.

Biosíntesis de nucleótidos purínicos: Origen biosintético de los átomos del anillo


purínico.
Proviene de los experimentos realizados por Buchanan quién administró a animales
precursores marcados y luego determinó los sitios del núcleo purínico a los que se
habían incorporado los átomos marcados. Esta experiencia se realizó en aves, que
excretan el N 2 en forma de ácido úrico que es un derivado de las purinas.

Ácido úrico:
CO 2
7 Glicina
C N
6
Aspartato N C
1 5

C Formiato
8

Formiato C C
2 4
N N
3 9

amida de la glutamina

Construcción del núcleo púrico:

N9
NH2 de la glutamina glicina
ATP

amidotransferasa
ADP + P
NH 2
PP ácido glutámico

R P
O fosforibosilamina
P P O CH2 OH

H H
H H

OH OH
fosforibosilpirofosfato (FRPP)

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C4 y C5 N7
C8

NH2 NH
CH "CHO" CH2 glutamina
CHO
CoF ácido glutamínico
C C
NH NH
O O
R P R P

glicinamida ribótido formil - glicinamida ribótido

N3 O C6
N1
N C N
CH CO2 NH2 CH "CHO"
CH CH
C Acido aspártico CoF
NH2 N NH2 N

R P R P

5aminoimidazol ribótido 5aminoimidazol4carboxamida ribótido

C2
O

C N
NH
CH
CH
N N

R P
Inosina 5' - fosfato
Acido Inosínico IMP

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Vías del ácido inosínico hacia los ácidos adenílico y guanílico

H N N
IMP (H+ inosínico)

N N

R P
NAD aspartato
[O]
NADH2 GTP GDP + Pi

O H

HOOC CH2 C COOH


H N N
NH

N N H N N
O

H R P
N N aspartato
AMP
glutamina H+ glutámico H+ Xántico
R P

ATP AMP + PP fumarato

O
NH2
H N N
H N N

N N
NH2
N N
R P
R P

GMP (H+ guanílico) AMP (H+ adenílico)

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Vías de la biosíntesis de nucleótidos purínicos:

ATP AMP base púrica


Ribosa 5 P 5PRibosil PP Nucleótido
Pi

base púrica ATP AMP


Ribosa 1 P Nucleósido Nucleótido
Pi

Biosíntesis de GDP, GTP y ADP, ATP:

GMP + ATP GDP + ADP


GDP + ATP GTP + ADP
AMP + GTP ADP + GDP
ADP + GTP ATP + GDP

Regulación de la síntesis de Nucleótidos Purínicos:

E AMP ADP ATP


+
PRPP 5 fosforibosilamina H inosínico

GMP GDP GTP

En este caso el exceso de ATP, ADP o AMP o de GTP, GDP o GMP producen una
inhibición a nivel de la enzima que cataliza la reacción entre el fosforibosilpirofosfato y la
5 fosforibosilamina, por lo tanto se frena la secuencia metabólica y se inhibe la
biosíntesis. Es un caso de retroalimentación negativa.

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Biosíntesis de Nucleótidos de Pirimidina

Es una ruta similar a la de los nucleótidos purínicos, pues las bases libres no son
productos intermedios.
Esta ruta es más simple y se diferencia en que la D-Ribosa se acopla después que se ha
formado el anillo pirimidínico. El precursor es el ácido Orótico.

C
H N C H

C C COOH
O N

ácido orótico
H2O
carbamil PO4
Acido Aspártico Acido Carbamil Aspártico
PO4 Dihidrotasa

NAD PRPP PP
Acido Dihidrótico Acido Orótico Acido Orotidílico
NADH2 fosforibosil-tr OMP
ansferasa

CO2

Acido Uridílico
OMP
descarboxilasa UMP (uridin monofosfato)

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UMP + ATP UDP + ADP

UDP + ATP UTP + ADP

Biosíntesis de CTP (citidin trifosfato)

O NH2

C C
H N C H ATP ADP + Pi N C H
+ NH3
C C H C C H
O N O N

R P P P R P P P

triofosfato de uridina (UTP) triofosfato de citidina (CTP)

En Escherichia Coli (bacteria) el que dona el grupo NH 2 es el NH 3 libre. En los


mamíferos es el grupo amido de la glutamina.

Regulación de la biosíntesis de nucleótidos de pirimidina

Cuando hay un exceso de UTP y de CTP este exceso determina la inhibición de la


aspartato carbamil transferasa, enzima que inicia la ruta de biosíntesis, por lo tanto se
produce el fenómeno de retroalimentación negativa o feed-back.

Acido Aspártico

aspartato carbamil transferasa

Acido carbamil Aspártico

UMP

UTP

CTP

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Biosíntesis de desoxi-TMP (timidín-monofosfato)

O O

C C
N5; N10.Metilen FH2
H N CH H H N C CH3
Tetrahidrofolato Dihidrofolato

C CH H C C H
O N O N

desoxi RP (dUMP) desoxi RP (d-TUMP)

Reacciones fosfotransferásicas:

ATP + d ADP ADP + d ATP

ATP + d CDP ADP + d CTP

ATP + d TDP ADP + d TTP

ATP + d GDP ADP + d GTP

Los precursores del ADN (ácido desoxiribonucléico) son desoxi-ribonucleótidos. Los


precursores del ARN (ácido ribonucléico) son ribonucléotidos.

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NATURALEZA, ESTRUCTURA Y APLICACION DEL MATERIAL GENETICO

Evidencias de que el ADN es el material genético. Estructura del ADN: Ley de Chargaff,
estudios de difracción con rayos X. Modelo de Watson y Crick. El dogma central de la
Biología Molecular. Replicación del ADN: replicación semiconservativa.

La genética estudia la transmisión hereditaria y la variabilidad de los caracteres de los


organismos).

En este capítulo veremos las bases bioquímicas de algunas cuestiones centrales, que
plantea la continuidad genética y la evolución de los organismos vivos.

¿Cuál es la naturaleza molecular del material genético y de sus unidades


fundamentales, los cromosomas, los genes, los símbolos de código?
¿Cómo se replica la información genética para pasar de una generación a otra?
¿Cómo se transcribe la información en la célula?
¿Cómo se traslada la información genética a la secuencia de aminoácidos de las
moléculas proteicas?

Los extraordinarios avances en el conocimiento de la base molecular de la genética han


provocado una revolución intelectual en biología, que se considera comparable a la que
comenzó con la teoría de Darwin sobre el origen de las especies. Todos los campos de
la biología han resultado profundamente influídas por tales avances, de tal modo que en
la actualidad no se puede estudiar problema bioquímico alguno prescindiendo de su
fondo genético. El conocimiento actual de la base molecular de la genética deriva de los
avances realizadas en tres campos científicos diferentes: la genética, la bioquímica y la
física molecular.

A. En el campo de la genética, ¿qué progresos hubieron?


Al principio el único medio de llevar a cabo análisis genéticos consistía en realizar
experiencias con apareamientos debidamente orientados, es decir ya teniendo un
conocimiento de los resultados de la reproducción sexual. Experiencias de esta clase
presenta grandes limitaciones en cuanto al tiempo de generación que es
relativamente grande y el número de descendientes que es relativamente pequeño.
Supongamos por ejemplo, que se investigan fenómenos genéticos utilizando cobayos
como animales de experimentación. Se eligen progenitores apropiados y se
identifican por anticipado los caracteres de la descendencia. El período de gestación
es de 10 semanas y el número de descendientes es de 2 a 4. Con este número de
descendientes se revela una pequeña parte de los rasgos potenciales capaces de ser
transmitidos por los padres y para estudiar la reproducción de los descendientes hay
que esperar que los cobayos alcancen la madurez sexual.
El desarrollo de la genética microbiana ha aportado un gran avance. Los
microorganismos y particularmente las bacterias se multiplican rápidamente (algunos
a intervalos de 15').

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Otro progreso experimental que es el uso de rayos X y otros agentes mutagénicos,
que incrementan la velocidad de mutaciones espontáneas.

MUTACION: alteración de un gen que puede ser espontánea o inducida (rayos X,


radiación U.V., etc.
Como las propiedades de la célula están controladas por genes los caracteres
pueden cambiar por mutación. De esta manera se pudo conocer la secuencia de los
genes en los cromosomas y saber que los genes poseen un gran número de locus
que pueden experimentar mutación; y que químicamente están constituidos por ácido
desoxiribonucléico.

Pero el desarrollo más importante en el campo de le genética fue:


La enunciación de la hipótesis de "un gen - una enzima", por Beadle y Tatum
que dice que los genes se expresan a través de proteínas, por lo tanto, las
mutaciones darán origen a proteínas alteradas.
El descubrimiento de Avery y Col, que demostraron que el ADN contiene la
información genética.

B. En el campo de la bioquímica, muchos avances experimentales importantes se


hicieron posibles gracias a la mejora de métodos cromatográficos, que hicieron
posible el análisis cuantitativo de la composición aminoácida y de la secuencia de las
proteínas y mostraron que le secuencia varía según función de la proteína. También
se llegó a establecer la composición y estructura covalente de los ácidos
nucleicos.Uno de los desarrollos más significativos consistió en el descubrimiento de
la equivalencia de ciertas bases del ADN que se convirtió en un elemento importante
para deducir su estructura tridimensional.

C. En el campo de la física molecular la aplicación de difracción de rayos X a la


conformación de moléculas de proteínas fibrosas y globulares llevó al concepto de
que cada tipo de molécula proteica posee una conformación específica, que
determina su función biológica. Pero el hecho fundamental fue la aplicación de los
rayos X al análisis de la estructura tridimensional del ADN. En 1953 Watson y Crick
postularon una estructura de doble hélice para el ADN que sugirió un mecanismo
sencillo por medio del cual la información genética puede transferirse de la célula
progenitora a la célula hija.
La hipótesis de Watson y Crick fue pronto ampliada y extendida hasta llegar a lo
que Crick denominó el dogma central de la genética molecular, el cual
establece que la información genética fluye del ADN al ARN y de éste a
las proteínas; relación frecuentemente simbolizada así:

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El dogma central definió tres procesos principales de la preservación y transmisión
de la información genética.
1. Réplica, es decir, la copia del ADN con formación de moléculas hijas idén-
ticas.
2. Transcripción, por el cual el mensaje genético del ADN es transcripto en
forma de ARN para ser llevado a los ribosomas.
3. Traducción, por la cual el mensaje genético es descifrado y convertido en el
alfabeto de 20 letras de la estructura proteica.

Evidencias de que el ADN es el material genético

Aunque el ADN se descubrió en los núcleos celulares en 1.869, no se identificó como


portador directo de la información genética hasta 1.943.
Avery y Col hallaron que una cepa no virulenta de la bacteria Pneumococcus puede
transformarse de modo hereditario, en una cepa virulenta por simple adición de un ADN
extraído de un neumococo virulento. Lo que sucede es que el ADN se incorpora
covalentemente al ADN de la célula receptora donde se replica con la célula huésped.
De especial significación son los experimentos de Hershey y Chase. Marcaron el ADN
de las partículas vírales e incubaron con la célula huésped mientras que la proteína viral
no.
En 1955 Pauling mostró que en la anemia falciforme los glóbulos rojos se presentan en
forma de hoz debido a una alteración de la molécula de hemoglobina. Lo que ocurría es
que en la hemoglobina normal su cadena tiene un ácido glutámico en posición G,
mientras que en la anemia falciforme tiene valina. Este hallazgo deja en claro algo
fundamental: una mutación puntual en el ADN puede determinar el cambio de un
aminoácido de la secuencia polipeptídica de una proteína.

ESTRUCTURA DEL ADN

Se hicieron numerosos estudios tendientes a conocer la Estructura del ADN. En 1.938


Astbury observó que sometiendo al ADN al análisis de difracción de rayos X presentaba
reflexiones que corresponden a un espaciado regular de 3,4 Å a lo lardo del eje de la
fibras. Si bien el significado de ésta observación no estaba bien clara, porque se sabía
que el ADN utilizado era impuro.
Sin embargo, más tarde Franklin y Wilkins obtuvieron datos más precisos operando con
fibras de ADN altamente purificadas y encontraron dos periodicidades de 3,4 Å y de 34
Å. En el periodo 1.949 – 1.953 Chargaff y Col explicaron métodos cromatográficos
cuantitativos para la determinación analítica de las 4 bases del ADN. De dichos estudios
se obtuvieron las siguientes conclusiones:
Las muestras de ADN aisladas de diferentes tejidos de una misma especie poseen igual
composición de bases.
La composición de bases del ADN varía de una especie a otra.
La composición de bases del ADN de una determinada especie no cambia con la edad,
con el estado de nutrición, ni con los cambios ambientales.
En todos los ADN examinados el número de restos de adenina es igual al de restos de
timina (es decir: A = T); el número de restos guanínicos es igual al de los citosínicos (G =
C ).

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La equivalencia de bases observadas en el ADN plantearon la posibilidad de que existe
un nivel de organización estructural de las moléculas del ADN que sea compatible con
ciertas equivalencias de bases, pero incompatibles con otras. Además ya se pensó en
una conformación tridimensional para el ADN. De esta manera el escenario ya estaba
dispuesto para proponer la conformación tridimensional del ADN. Es decir se contaba
con tres elementos.
1. Tamaño de las bases;
2. Periodicidades observadas;
3. Equivalencia de ciertas bases.

El interés en el problema se acrecentó ante la difícil interrogación de como podía


replicarse el ADN con tanta fidelidad.
En 1.953 Watson y Crick postularon un modelo tridimensional preciso para la estructura
del ADN, basado en los datos de rayos X de Franklin y Wilkins y en las equivalencias de
bases observadas por Chargaff. Este modelo no solo explicaba las propiedades físicas y
químicas del ADN, sino que sugería un mecanismo por medio del cual la información
genética podía replicarse con exactitud. El modelo estructural del ADN de Watson y
Crick consiste en dos cadenas polinucleotídicas dextro-helicoidales, arrolladas a un
mismo eje y constituyendo una doble hélice. Las bases púricas y pirimídicas de cada
hebra se encuentran en el interior de la doble hélice.
El aparejamiento de las bases apartadas por ambas hebras es tal que solamente ciertas
bases encajan en el interior de la estructura de manera que puedan unirse unas a otras
por puentes hidrógeno. Las bases son:

A-T y G-C

Que son las parejas que muestran exacta equivalencia:

N N
núcleo de núcleo de
AyG TyC
N N N

Si el par sería A - G serían demasiado grandes para poder encajar dentro de la doble
hélice de estas dimensiones.
Si la pareja fuera G - T las bases se encontrarían muy distanciadas para poder formar
enlaces hidrógeno estables.
A T
A T
G C
A T
T A
C G
A T
G C

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Además los enlaces hidrógeno entre A – G y C – T son más débiles que A – T y G – C,
o sea que la doble hélice implica aquellas parejas que poseen el máximo de estabilidad.
¿Por qué las dos periodicidades observadas con los rayos X?. Se postuló que la
periodicidad de 3,4 Å se debe a que las bases están apretadamente apiladas al eje y
mantienen una distancia de 3,4 Å de centro a centro. En cada espira de la hélice hay 10
nucleótidos y de una espira a otra hay 34 Å.
Las bases hidrófobas están en el interior de la hélice, los restos carbohidratos y los
fosfatos que poseen carga eléctrica están expuestas al H2 O . Así resulta que la doble
hélice está estabilizada no sólo por los puentes hidrógeno entre les bases
complementarias sino también por interacciones hidrofóbicas entre dichas bases
apiladas. Las dos cadenas polinucleótidas de la doble hélice no son idénticas ni en la
composición ni en la secuencia de bases. Ambas cadenas son complementarias una de
la otra. Esta estructura conduce a un mecanismo por medio del cual la información
genética puede replicarse con precisión. Dado que las dos hebras son complementarias
una de la otra, y contienen información genética complementaria, se postuló que durante
la división celular la réplica del ADN podría ocurrir por separación de las dos hebras, con
lo que cada una haría de patrón especificador de la secuencia de bases de una nueva
hebra complementaria sintetizada. EI resultado final de este proceso consistiría en la
formación de dos moléculas hijas de un ADN de doble hélice, cada una de las cuales
contendría una de las hebras del progenitor.

REPLICACION DEL ADN

De acuerdo al dogma central de la genética molecular, quedó establecido que:

ADN ARN proteínas

O sea que éste dogma definió tres procesos fundamentales de los cuales el primero es
el de REPLICA, es decir la "copia" del ADN con formación de moléculas hijas. Veremos
como sucede éste proceso a nivel molecular. La característica más sorprendente de la
hipótesis de Watson y Crick, desde el punto de vista genético, en su postulado de que
las dos hebras del ADN duplohelicoidales son complementarias.

La réplica de cada una de ellas conduce a dos moléculas hijas de ADN; cada una
contiene las hebras del ADN progenitor. Este proceso se denomina réplica
semiconservadora.
Pero ¿Cómo pueden replicarse simultáneamente las dos hebras del ADN de modo que
se formen al mismo tiempo.

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Éste mecanismo requiere tres enzimas:
ADN - polimerasa dependiente del ADN
ADN - ligasa
Endodesoxiribonucleasa

ADN – polimerasa

Cataliza la síntesis de enlaces internucleótidos. Posee los siguientes requerimientos:


1). Presencia da ADN preformado
2). Presencia de los cuatro desoxiribonucleótidos trifosforados, los mono y
difosforados son inactivos.
3). Mg++

¿Qué papel desempeña el ADN preformado? Se han propuesto dos alternativas:

1. Que actúa como cebador, es decir, que al proporcionar un extremo o puntos de


crecimiento, se pueden adicionar nuevos mononucleótidos.

hebra patrón hebra cebadora

2. O bien podría ser utilizado como patrón sobre el cual la enzima podría construir
una hebra complementaria al ADN preformado.

ADN
|
nd ATP
d AMP
nd GTP ADN preformado |
d GMP + 4 PPi
nd CTP Mg++ |
nd TTP d CMP
|
d TMP

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Mecanismo de acción de la ADN – Polimerasa

Si partimos de una hebra cebadora de ADN o sea de un ADN preformado:

OH

HO P H2C
O Base
O
H H
H
O H
O Base
HO P O
H H
H
H2C
OH + PPi
O O H
Base
H H O P OH
H
OH H PPi H2C
OH
O Base
O O P
H H
H
O P O P O P OH
OH H
OH OH OH
H2C
O Base
H H
H OH
OH H

Hay un ataque al átomo de fósforo alfa del nucleótido trifosforado entrante y provoca el
desplazamiento de su grupo pirofosfato, con formación de enlace internucleótido. El PP i
formado es rápidamente hidrolizado por una pirofosfatasa por lo cual la reacción es muy
exergónica. La dirección de la síntesis es por lo tanto 5’ --- 3'.

ADN ligasa
1. Enlaza extremos de moléculas de ADN produciendo formas circulares. Ej.:
bacterias.
2. Cataliza la reparación de roturas de una cadena de ADN.

Requerimientos de la ADN ligasa


1. Presencia de NAD que actúa como fuente de grupos adenilo.
2. Una hebra intacta de ADN.

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Mecanismo de acción de la ADN ligasa

O
NMN
Dinucleótido
Base CH2 O P OH NAD constituído
NMN y AMP
5' AMP
OH
H OH
3'
H
Base O

1. Enzima + NAD --------------- En - AMP + NMN.


Se forma un complejo entre En y AMP y se forma NMN como producto
secundario.
2. El grupo adenilo es transferido por la Enzima al extremo 5’ fosfato.
3. El extremo 3' OH desplaza al grupo adenilo y forma el enlace fosfodiéster.

OH
O O

Base O CH2 O P O P H2C ó Base O CH 2 O

OH OH Adenina HO P O

O
OH

Base O
Base O

Mecanismo de replicación

Antes de hablar de la replicación es importante acotar que la cadena de ADN


recién sintetizada se prolonga en dirección opuesta a la cadena de ADN patrón, es decir,
tiene una polaridad opuesta o antiparalela.

P 3'
T
A T
5' 3' 5'
cebadora 3' P
P 3' 5' 3'
5'
T A
T
3'
P
P

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Kornberg: postuló que la réplica comienza con la producción de una mella o una rotura
en una hebra por acción de una endonucleasa. Unidades de MN adicionadas por la ADN
polimerasa:

5'
5'

3' 3' 5' 3'

La ADN polimerasa se fija a dicha rotura y comienza a prolongar el extremo 3' unidades
de mononucléotidos (MN). (–)ed
El extremo 5' se desplaza de la estructura duplex. Se sugiere que el extremo 5' puede
estar sujeto por adherencia a la membrana celular. La réplica continua durante cierto
trecho mientras que el extremo 5' se va "pelando". La ADN polimerasa se desplaza de
lugar, o salta, desde la hebra patrón intacta a la hebra mellada en el sitio donde se
separan ambas hebras y comienza a adicionar unidades de mononucleótidos utilizando
como patrón la fibra mellada. La replicación continúa hasta que el extremo se ha
replicado por completo y entonces la enzima se retira.
La endonucleasa rompe en la horquilla la hebra formada y el proceso vuelve a repetirse
con la ADN polimerasa, que adiciona nuevas unidades de mononucleótidos. Los dos
nuevos segmentos formados sobre la hebra patrón son unidos por la ADN ligasa y
comienza un nuevo ciclo.

3' 5' 3' 5' 3' 5'

endonucleasa ADN polimerasa ADN ligasa

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LA TRASCRIPCION DE LA INFORMACION GENÉTICA

Evidencias de que el ARN transporta la información genética:

Él ARNm es un buen candidato para transportar la información por una serie de


evidencias:
1. El ARN tiene una estructura semejante a las cadenas del ADN y sus bases
nucleotídicas pueden formar puentes hidrogeno con las bases del ADN siguiendo
las reglas de complementariedad de Watson y Crick.
2. El ARN puede contener y transmitir información genética; ésto lo demuestra el
hecho de que algunos virus no contienen ADN y su ARN puede actuar como
agente infeccioso. Ej., el virus del mosaico del tabaco que causa infecciones
virales en las hojas de las plantas.
3. El ARN se sintetiza en el núcleo, pero los ribosomas que están en el citoplasma,
donde se realiza la síntesis proteica, contienen más del 70% del ARN celular.

PROPIEDADES DEL ARN MENSAJERO

1. Recambio. En bacterias el ARNm tiene un activo metabolismo, se sintetiza y


degrada rápidamente. Esta propiedad fue la clave de su aislamiento e
identificación. Sin embargo existen ARN muy estables Ej.: el ARNm de los
reticulocitos.
2. Relación entre la secuencia de bases del ADN y el ARN celular. El ARN m se
sintetiza sobre una matriz de ADN o sea que el ARNm es el portador de la
información. La enzima que cataliza esta síntesis es la ARN polimerasa
dependiente del ADN.

Mecanismo de acción de la ARN polimerasa

Para obtener esta enzima en forma pura, Richard Burgen realizaron una electroforesis
en gel de poliacrilamida. Así se pudo detectar 4 bandas por tinción de los polipéptidos.
Lo que interesaba saber era si los 4 polipéptidos intervenían en la actividad de la
enzima. Para ello eliminaron uno de los polipéptidos que denominaron factor  (sigma).
La eliminación de este factor cambió las propiedades de la enzima ya que perdió su
capacidad de usar como matriz al ADN. La adición de factor  restauraba la propiedad
de la enzima de usar ADN como matriz.

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Mecanismo de acción de la ARN polimerasa

A. Unión de la ARN polimerasa al ADN:

 

unión reversible unión estable: reconoce al promotor

las hebras del ADN se separan

La ARN polimerasa se une reversiblemente al ADN en varios sitios de éste. Sin embargo
cuando esta unión se hace en una región específica que es el gen promotor el factor 
reconoce la secuencia nucleotídica y estabiliza el complejo ADN-ARN polimerasa.
Esta estabilización permite que la enzima inicie la separación de las hebras de la doble
hélice del ADN permitiendo la iniciación de la trascripción.

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B. Iniciación de la trascripción

A T C T G A G A C T A T C T G A G A C T

T A G A T A G A

G T G T

A A

C T C C T C

G  G A 
3'
P P P OH P P P OH
OH

P
5'

A T C T G A G A C T

T A G A

G T
Se forma el primer enlace
internucleótido A

C T C

G A 

P P P P OH + P P
5'

Una vez unida la enzima a un promotor en el ADN, se inicia la transcripción por unión de
dos nucleótidos trifosforados a la enzima. En general todos los ARN comienzan a
sintetizarse por ATP y GTP. Al tomar posición los dos primeros sustratos, el OH  3' del
nucleótido trifosforado iniciador ataca el enlace fosfodiéster entre los fosfatos alfa y beta
del segundo nucleótido y se forma el primer enlace internucléotido.

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Elongación de las cadenas nucleotídicas:

A T C T G A G A C T

T A G A

G T

A La enzima se desplaza
por la hebra del ADN
C T C

G A G A

P P P P P P OH

Cuando el producto de la elongación llega a un tamaño crítico el factor  se libera.


Las cadenas nucleotídicas crecen por adición secuencial de ribonucleótidos al extremo
3' del dinucleótido iniciador.
La entrada de los diferentes sustratos depende de la complementariedad con las bases
de la hebra del ADN que sirve de matriz.

Terminación de la transcripción:

1.

secuencia terminadora
reconocida por la enzima

2.
factor de terminación

Ro

ADN ARN enzima

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Ocurre por medio de dos mecanismos:
 Terminación codificada por una secuencia de ADN que es reconocido por la
enzima.
 Por medio de un factor proteico adicional el cual tiene la propiedad de causar la
terminación de la trascripción en sitios donde no funciona el primer mecanismo.

Conclusión: la célula resuelve el "problema geográfico" transcribiendo la información


genética contenida en el ADN del núcleo en un ARN que actúa como mensajero, pues
lleva la información a los ribosomas citoplasmáticos donde se realiza la síntesis proteica.

EL CODIGO GENETICO

El codón: unidad de información, primeras ideas sobre la clave genética. Universalidad


de la clave genética.

Vamos a considerar dos cuestiones:


1. ¿Cómo se traslada el lenguaje de cuatro letras de los ácidos nucleicos al de veinte
letras de las proteínas?
2. ¿Cuál es la correspondencia entre la secuencia nucleotídica y la secuencia de
aminoácidos?

Mediante consideraciones matemáticas, parecía probable que cada aminoácido


fuera codificado por un número pequeño de nucleótidos consecutivos de la cadena ADN.
Puesto que el ADN contiene sólo cuatro bases y las proteínas contienen veinte
aminoácidos, es obvio que se requiere más de un nucleótido para codificar cada
aminoácido. Si se disponen los nucleótidos en grupos de dos, rinden 4 2  16 combina-
ciones. Las 4 bases en combinaciones de 3, pueden codificar 4 3  64 aminoácidos
distintos. O sea que un código de tripletes es utilizado para codificar aminoácidos.

Composición de los Tripletes

Los experimentos que se realizaron para conocer la composición de los tripletes


fueron utilizando polirribonucleótidos sintéticos como mensajeros de ribosomas aislados
de E. Coli. Incubaron ácido uridílico (poli - U) en una serie de tubos que contenían
ribosomas de E. Coli privados de mensajero, además de todo lo necesario para la
síntesis proteica, incluyendo todos los aminoácidos. Este estudio demostró que la
cadena polipeptídica recién formada contenía solamente fenilalanina. En consecuencia,
sugirieron que el vocablo del código para la fenilalanina era el triplete UUU.
Por experimentos similares hallaron que el poli C codifica prolina, el poli A lisina,
etc. Posteriormente prepararon polímeros de nucleótidos variando la relación cuantitativa
de los distintos mononucleótidos que permitió identificar la composición de 50 vocablos
del código para los distintos aminoácidos. Estos experimentos no sólo permitieron
establecer como se "deletrea" el vocablo del código de cada aminoácido, sino que
permitieron comprobar que algunos aminoácidos eran codificados por más de un triplete.

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Por ejemplo:
fenilalanina es cofificada por UUU  UUC 

serina es cofificada por UCU  UCC  UCA  UCG 

El triplete de bases nucleotídicas que se encuentran en el ARNm y que codifica un


aminoácido de denomina “codón”.

Características generales del código

El código aminoácido es un código degenerado, es decir que hay más de un


vocablo de codificación para la mayoría de los aminoácidos.
Otra característica del código genético consiste en que no requiere señal
indicadora del final de un codón y comienzo del siguiente.
3 de los 64 tripletes no codifican ninguno de los aminoácidos y son: UAG - UAA -
UGA. Estos tripletes constituyen una señal de terminación de las cadenas
polipeptídicas.

Universalidad del código

Los vocablos del código aminoácido son idénticos en el hombre, en virus y en bacterias,
es decir, es universal. A esta conclusión se llegó luego de una serie de ensayos. Se
comparó 50 aminoacil - ARNt diferentes procedentes de especies muy distantes, y
observaron sus respectivas capacidades para ser reconocidos por los codones
aminoácidos previamente establecidos de E. Coli. Para ello se ensayó la capacidad de
tales aminoacil - ARN t para unirse a ribosomas de E. Coli empleando sintéticos y se
halló que en todos los casos los aminoacil - ARN t respondían perfectamente a los
codones de E. Coli unidos a los ribosomas de este microorganismo. Considerando
conjuntamente este hallazgo sugieren que el lenguaje genético es idéntico en todas las
especies.

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LA TRADUCCION DE LA INFORMACION GENETICA

Vamos a considerar ahora la tercera gran cuestión que plantea la continuidad genética
de los organismos vivos.
¿Cómo se traslada la información genética contenida en la secuencia nucleótida del
ARNm , de tal suerte que los aminoácidos se engarcen formando una cadena
polipeptídica con una secuencia aminoácida específica?
Trataremos los mecanismos enzimáticos por medio de los cuales se constituye la
cadena polipeptídica, es decir, como se realiza la síntesis proteica. Además veremos el
funcionamiento de los ribosomas asegurando la adecuada transferencia de la
información del ARNm , y el papel adaptador del ARN t .

Estructura ribosómica

Los ribosomas sometidos a condiciones especiales se disocian en dos subunidades 50


S y 30 S cada uno de los cuales contiene ARN y varias proteínas.

contiene dos componentes


50 S
ARN y 30 proteinas diferentes

contiene una molécula de ARN


30 S
ribosomático y 20 proteínas diferentes

Estructura del ARN t

El ARN t , posee una conformación tridimensional similar a una hoja de trébol de manera
que presentan sus cadenas el máximo de aparejamiento intracatenario.

A
| Locus de enlace aminoácido
C
|
G C

Anticodón (unión al ARNm)

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Todas las moléculas de ARN t tienen en un extremo la misma secuencia terminal
C  C  A . El último resto, el ácido adenílico, es el locus que se esterifica al resto
aminoácido. Además existe un triplete de bases que es distinto en todos los ARN t y
representa el anticodón es decir, el triplete nucleótido especifico complementario de los
tripletes del codón del ARNm .
La molécula de ARN t contiene otro locus de unión para la enzima activadora. Una
característica de la estructura es la presencia de bases secundarias además de las
normales A – U – G y C. La mayoría son formas metiladas de las bases principales. El
ARN t es solamente un "adaptador" de manera que puede ser adaptado al lenguaje de
tripletes nucleótidos del código genético.

Estadíos de la síntesis proteica

Primer estadio: activación

Los 20 AA se esterifican al ARN t correspondiente. Las enzimas que participan son:


aminoacil- ARN t -sintetasas que tienen:

a. tres locus de unión: b. son específicas:


o para el AA o para cada AA
o para el ARN t o para el correspondiente ARN t
o para el ATP

La reacción tiene lugar en el citoplasma.

Primera fase de activación

Se forma un producto intermedio unido a la enzima:


Mg++
ATP + AA ácido amino acil adenílico + PPi

O
H O
P O P O P O CH2
O
R C C OH +
OH
NH2 Adenina

H O O

R C C O P O CH2 + PPi
O Adenina
NH2 OH

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Segunda fase de activación

Consiste en la transferencia del grupo aminoacilo del AMP al ARN t :


ácido-aminoacil.adenílico + ARNt aminoacil - ARNt + ácido adenílico

O sea que la reacción global sería

AA + ARNt + ATP aminoacil - ARNt + AMP + PPi

Tenemos entonces cada AA con su correspondiente ARN t .

Segundo estadío

En ribosomas. Los ribosomas tienen que captar al ARNm y al ARN t  AA .

30 S

LP LA
50 S

Los ribosomas tienen dos locus de unión.


1. El locus peptidílico: (LP) para ARN
el t que tiene unido el AA iniciador de la
síntesis que es la metionina, la cual tiene su grupo amino bloqueado por un
grupo formilo con el objeto de:
a. que el grupo amino no forme enlace peptídico.
b. que el locus peptidílico sólo acepte alARN t que tiene metionina.

2. El locus aminoacílico: que permite la entrada secuencial de los ARN t  AA .

El ribosoma para que puedan unirse el ARNm y el ARN t  AA debe disociarse en sus dos
subunidades. Participan en este proceso factores proteicos F1 F2 F3 (llamados también
disociasaribosomal) y GTP. Estos factores permiten la disociación de los ribosomas y
además la unión del ARNm en el lugar donde se inicia el mensaje.

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30 S 30 S 30 S

50 S

AA AA

50 S

Tercer Estadío: Elongación

La prolongación de una cadena tiene efecto en tres fases principales:


1.- Los ribosomas con su ARNm , tienen unido en el LP el ARN t  AA iniciador de la
síntesis (metionina). En el estadío de elongación, al locus aminoácido se une
por su anticodón el ARN t  AA de acuerdo al triplete de bases del codón. Este
proceso requiere GTP y un factor T que es una proteína que cataliza este
proceso de elongación.

LP LA

(metionina) AA AA

2.- En la segunda fase se forma el enlace peptídico por reacción entre el grupo
amino del nuevo aminoacil - ARN t captado con el grupo carboxilo del AA ya
existente en el LP.

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NH NH

R CH
R CH
C O LP HO LP descargado
O O C

NH
NH2
R C H
R CH
C O
C O LA LA
O O

ARNm

Para la formación del nuevo enlace peptídico es necesario una enzima


denominada peptidil-transferasa. El ARN t "descargado" que ya no lleva su AA,
continúa unido al LP. El peptidil ARN t recién alargado está unido al LA.

3.- En la tercera fase del ciclo de alargamiento el peptidil - ARN t se desplaza


físicamente desde el LA al LP y desaloja de este último al sitio del ARN t
“descargado”. Esta compleja reacción de translocación se cree que es resultado
de un cambio de conformación en el ribosoma, que tiene lugar a costa de la
hidrólisis del GTP. Para esta fase se requiere una proteína especifica
denominada factor G. Simultáneamente con la translocación del peptidil - ARN t
tiene lugar la del ARNm que desplaza un codón a lo largo del ribosoma.

O CH
NH
R C H
C O LP
O

LA

El proceso se repite, es decir entrando ARN t  AA al LA hasta que el ARNm codifica la


terminación.

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Cuarto Estadío: Terminación de la cadena polipeptídica

La terminación de una cadena polipeptídica completa y su despegue del ribosoma


está señalada en el ARNm por tres codones especiales de terminación. La liberación del
polipeptidil- ARN t del ribosoma, es inducido por un factor de liberación protéico que está
unido al ribosoma y provoca la hidrólisis del enlace éster entre el polipéptido y el ARN t .
El ribosoma 70 S se aparta del ARNm y queda libre. Cuando experimenta disociación en
sus subunidades 50 S y 30 S puede recomenzar un nuevo ciclo.-

REGULACION DE LA SÍNTESIS PROTEICA

Teoría de Jacob y Monod: Regulación transcripcional. Inducción. Represión.

Las células vivas disponen de mecanismos que regulan la cantidad de proteínas que se
sintetizan.
Estos mecanismos de regulación fueron estudiados en células bacterianas y se observó
que la cantidad de enzimas que se acumula en el medio depende de la naturaleza de los
nutrientes. En base a todos estos estudios se distinguió dos tipos de respuestas:
De inducción enzimática
De represión enzimática

INDUCCION

Si estamos en presencia de una inducción a la enzima que se induce a que se sintetice


se denomina enzima inducible. Esta enzima inducible se encuentra en pequeña cantidad
en el medio, pero cuando se agrega un sustrato sobre el cual debe actuar su
concentración aumenta para transformar a ese sustrato en un metabolito que puede ser
utilizado por la célula. Ej.: un tipo de E. coli usa como fuente de carbono a la glucosa. Si
en el medio en lugar de colocar glucosa colocamos lactosa, la célula inmediatamente
comienza a sintetizar β -galactosidasa que desdobla la lactosa en galactosa y glucosa.
Si volvemos a colocar glucosa, la enzima β -galactosidasa deja de sintetizarse y alcanza
un nivel bajo. La mayoría de las enzimas inducibles catalizan las reacciones del
catabolismo. Estas enzimas inducibles son diferentes a las enzimas constitutivas que se
forman a velocidades constantes independientemente de la presencia del sustrato (por
ej. las enzimas de la glicólisis).

REPRESIÓN ENZIMATICA

La célula tiene enzimas requeridas para la síntesis de los 20 aminoácidos. Si agregamos


al medio un aminoácido, por ej. histidina, la enzima que le sintetizaba es reprimida y
desaparece de la célula. Todas las enzimas inducibles están codificadas por genes. En
los genes hay locus que determinan la formación de las enzimas. Un locus se denomina
gen estructural, que es el que determina la secuencia de aminoácidos de la enzima. El
otro locus, llamado gen regulador, es interruptor, es decir, que está determinando si el

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gen estructural se transcribe o no. O sea que el gen estructural codifica una enzima que
se sintetiza normalmente siempre que el gen regulador no reprima su síntesis.

Regulador

Estructural

¿Cómo funciona el gen regulador tanto en la represión como en la inducción?

Jacob y Monod formularon una hipótesis general respecto a la función de los genes
estructural y regulador) en los 2 procesos.
Inducción
El gen regulador transcribe un ARN mensajero que codifica una proteína denominada
represor.
ARNm
regulador

operador

estructural represor

Este represor tiene un locus de unión específico próximo al gen estructural. Este locus
se denomina operador.
¿Qué sucede en una inducción, es decir, cuando se agrega al medio un sustrato que
debe degradarse? El sustrato, que sería el inductor, se combina con el represor
formando un complejo inductor-represor inactivo, que no puede unirse al operador.

represor

inductor

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El gen estructural queda libre y comienza a transcribirse y por lo tanto se sintetiza la
enzima. La unión represor-inductor es reversible, o sea que cuando se elimina el
inductor la síntesis de la enzima que lo degrada es reprimida.

Represión
Si agregamos al medio un aminoácido por ej. histidina, la célula no necesita utilizar las
enzimas que lo sintetizan.

ARNm
regulador

operador

estructural represor

En este caso, la histidina se une al represor y forma un complejo represor-correpresor


que se combina al operador; el gen estructural no se transcribe y por lo tanto no se
sintetiza histidina.

Regulación coordinada

También existe un mecanismo de regulación coordinada por el cual un grupo de


enzimas puede ser reprimida o inducida por un sólo represor o por un sólo inductor. Por
ejemplo, para sintetizar histidina se necesita un grupo de enzimas. Todas se encuentran
codificadas en los genes ocupando locus vecinos.

operador z x a b

codifican las síntesis de histidina

Este grupo de genes relacionados constituyen un operón; o sea que el operón se


encuentra codificando todas las enzimas que participan en la biosíntesis de histidina.

¿Cómo se reprime un operón completo actuando un represor?

Cuando el represor se une al operador no se sintetiza ninguna de las enzimas del


operón. Si se elimina el represar se sintetizan todas las enzimas que codifica el operón.

CATEDRA: QUIMICA BIOLOGICA. FAC. SALUD. UNSA. 113


BIBLIOGRAFIA

1. Blanco, A. y Blanco, G. (2016) Química Biológica. 10 Ed. Editorial El Ateneo.


Buenos Aires.
2. Feduchi, E; Carlos, R,M; Conde, E; Castiñeyra, I y Jimenez, C. (2017).
Bioquímica. Conceptos Esenciales. 2° ed. Editorial Medica Panamericana.
España.

3. Griffihs, A. Miller, J., Suzuki, D., Lewontin, R., y Gelbart, W., (1995) Genética.
5° Ed. Editorial Interamericana. México.

4. Kuchel, P., & Ralston, G., (1994) Bioquímica General. Editorial Mac GrawHill
Interamericana. México.

5. Lehninger, A., (1981) “Bioquímica” Ediciones Omega. Barcelona.

6. Lopez, L y Suarez, M. (2017). Fundamentos de Nutrición Normal. 2° ed.


Editorial El Ateneo. Buenos Aires.

7. MC Keen, T., 2003. Bioquímica. La base molecular de la vida. Mac GrawHill


Editorial Interamericana. España.

8. Murray, R.; Darylk, Granner, Meyer, P, & Rotewell, V., (1994). Bioquímica de
Harper. 22° Ed. Editorial El Manual Moderno. México.

9. Smith, C., & Wood, E., (1998) Biosíntesis. Tercera Edición. Editorial Addison
Wesley Iberoamericana.USA.

10. Strayer, L., (1990) Bioquímica. Tomo I y II. Tercera Edición. Editorial
Reverté. Buenos Aires.

11. Strayer, L.,(1995) Biochemistry. Quinta Edición. Editorial Freedman and


company. USA.

12. Torres, H., Carminatti, H & Cardini, C., (1983) Bioquímica. Editorial El
Ateneo. Buenos Aires.

13. Watson, J., (1978) Biología molecular del gen. Fondo Educativo Inter ame
ricano. España.

Fin del Cursado

CATEDRA: QUIMICA BIOLOGICA. FAC. SALUD. UNSA. 114

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