LYRa11病毒

LYRa11病毒
病毒分类
（未分级）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
属：	乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
亚属：	SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种：	SARSr-CoV
毒株：	LYRa11病毒 LYRa11

LYRa11病毒是严重急性呼吸道综合征相关冠状病毒（SARSr-CoV）的一个病毒株，于2011年在中国云南保山中菊头蝠的样本中被发现。此病毒株的基因组长29805nt，与造成SARS事件的SARS-CoV全基因组序列相似度为91%，于2014年发表^[1]。LYRa11病毒和SARS-CoV、SARS-CoV-2一样使用ACE2为感染细胞的受体^[2]

演化树

截至2021年1月 (2021-01)^[update]，SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树：

16BO133 与SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韩国全罗北道（2016年采集、2019年发表）^[3]

	Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中国湖北宜昌（2004年采集、2005年发表）^[4]

	BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中国广东（2004年采集、2005年发表、2010年又发表若干新病毒株）^[5]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中国云南保山（2011年采集、2014年发表）^[1]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中国广西南宁（2004年采集、2005年发表）^[4]

	SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰（2013年采集、2015年发表）^[6]

	SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰（2013年采集、2015年发表）^[6]

	SHC014 95.4 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明（2011年采集、2013年发表）^[7]

	WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明（2012年采集、2013年发表）^[7]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明（2013年采集、2016年发表）^[8]

	果子狸SARS冠状病毒 99.8 % · 果子狸 · 中国广东^[5]

	SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

蝙蝠病毒

果子狸病毒

人类病毒

参考文献

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