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2-[(4-Benzhydrylpipérazin-1-yl)méthyl]acrylonitrile

2008, Acta Crystallographica Section E Structure Reports Online

organic compounds Acta Crystallographica Section E b = 6.183 (3) Å c = 17.717 (5) Å = 107.00 (3) V = 1827.4 (12) Å3 Z=4 Structure Reports Online ISSN 1600-5368 Radiation Mo K  = 0.07 mm 1 T = 298 (2) K 0.72  0.58  0.22 mm Collection des données 2-[(4-Benzhydrylpipérazin-1-yl)méthyl]acrylonitrile Fatma Ben Amor,a Mohamed Ould M’hamed,b Hédi Mrabet,b Ahmed Drissa* et Mohamed Lotfi Efritb Diffractomètre Enraf–Nonius CAD-4 Correction d’absorption: scan (North et al., 1968) Tmin = 0.904, Tmax = 0.985 3708 réflexions mesurées 3587 réflexions independantes 1625 réflexions avec I > 2(I) Rint = 0.052 2 réflexions de référence fréquence: 120 min déclin d’intensité: 7% Affinement a Laboratoire de Matériaux et Cristallochimie, Faculté des Sciences de Tunis, Université de Tunis El Manar, 2092 El Manar I Tunis, Tunisie, et bLaboratoire de Synthèse Organique et Hétérocyclique, Faculté des Sciences de Tunis, Université de Tunis El Manar, 2092 El Manar I Tunis, Tunisie Correspondence e-mail: [email protected] R[F 2 > 2(F 2)] = 0.054 wR(F 2) = 0.156 S = 0.97 3587 réflexions 309 paramètres Tous les paramètres des atomes H affinés max = 0.17 e Å 3 min = 0.20 e Å 3 Reçu le 31 juillet 2008; accepté le 6 août 2008 Key indicators: single-crystal X-ray study; T = 298 K; mean (C–C) = 0.004 Å; R factor = 0.055; wR factor = 0.156; data-to-parameter ratio = 11.6. In the title compound, 2-[(4-benzhydrylpiperazin-1-yl)methyl]acrylonitrile, C21H23N3, the substituted piperazine ring adopts a chair conformation and the dihedral angle between the mean planes of the aromatic rings is 71.61 (8) . Littérature associée Pour littérature associée, voir: Mikami et al. (1991); Mrabet & Zantour (2004); Ould M’hamed et al. (2007, 2008); Toumi et al. (2007). Données crystallines o1872 Des documents complémentaires et figures concernant cette structure peuvent être obtenus à partir des archives électroniques de l’UICr (Référence: HB2772). Références Brandenburg, K. (1998). DIAMOND. Université de Bonn, Allemagne. Enraf–Nonius (1994). CAD-4 EXPRESS. Enraf–Nonius, Delft, les Pays-Bas. Harms, K. & Wocadlo, S. (1995). XCAD4. Université de Marburg, Allemagne. Mikami, K., Terada, M., Motoyama, Y. & Nakai, T. (1991). Tetrahedron Asymmetry, 2, 643–646. Mrabet, H. & Zantour, H. (2004). J. Soc. Alger. Chim. 14, 197–204. North, A. C. T., Phillips, D. C. & Mathews, F. S. (1968). Acta Cryst. A24, 351– 359. Ould M’hamed, M., Mrabet, H. & Efrit, M. L. (2007). C. R. Chim. 10, 1147– 1156. Ould M’hamed, M., Mrabet, H. & Efrit, M. L. (2008). J. Soc. Chim. Tunis. 10, 31–37. Sheldrick, G. M. (2008). Acta Cryst. A64, 112–122. Toumi, M., Ben Amor, F., Raouafi, N., Bordeau, M., Driss, A. & Boujlel, K. (2007). Acta Cryst. E63, o2735. Partie expérimentale C21H23N3 Mr = 317.42 Collection des données: CAD-4 EXPRESS (Enraf–Nonius, 1994); affinement des paramètres de la maille: CAD-4 EXPRESS; réduction des données: XCAD4 (Harms & Wocadlo, 1995); programme(s) pour la solution de la structure: SHELXS97 (Sheldrick, 2008); programme(s) pour l’affinement de la structure: SHELXL97 (Sheldrick, 2008); graphisme moléculaire: DIAMOND (Brandenburg, 1998); logiciel utilisé pour préparer le matériel pour publication: SHELXL97. Monoclinique, P21 =c a = 17.443 (5) Å Ben Amor et al. doi:10.1107/S1600536808025403 Acta Cryst. (2008). E64, o1872 supporting information supporting information Acta Cryst. (2008). E64, o1872 [doi:10.1107/S1600536808025403] 2-[(4-Benzhydrylpipérazin-1-yl)méthyl]acrylonitrile Fatma Ben Amor, Mohamed Ould M'hamed, Hédi Mrabet, Ahmed Driss et Mohamed Lotfi Efrit S1. Comment Des travaux récents réalisés dans notre laboratoire ont montré que les dérivés acryliques sont d'excellents agents biélectrophiles-1,3. Ils constituent des précurseurs d'une large gamme d'hétérocycles (Mrabet & Zantour, 2004; Ould M'hamed et al., 2007). Ces synthons sont également de bons diénophiles dans la réaction de Diels–Alder (Ould M'hamed et al., 2008), ce qui permet d'obtenir des composés bicycliques très recherchés en tant qu'analogues de substances naturelles (Mikami et al., 1991). La molécule C21H23N3 est caractérisée par la présence d'un groupement pipérazinyle ayant chaque atome d'azote substitué. L'atome d'azote N3 est lié au carbone C9 qui est lui-même lié à deux noyaux phényles. L'autre atome d'azote N2 est lié au carbone C4 qui porte le groupement 1-cyanovinyle (C1, C2, C3, N1). Le noyau phényle formé par les atomes C10, C11, C12, C13, C14 et C15 (phényle 1) est sur un plan moyen d′équation: 12,26 (1) x - 2,226 (7) y - 14,04 (1) z = 0,493 (8). La déviation moyenne de ses atomes est de 0,002 Å. Les atomes de carbone C16, C17, C18, C19, C20 et C21 du deuxième phényle (phényle 2) définissent un plan moyen d′équation 13,76 (1) x - 1,692 (8) y + 5,23 (2) z = 4,399 (4). Ils dévient en moyenne de ce plan de 0,007 Å. L'atome de carbone C9 qui porte les deux phényles dévie de leurs plans de 0,037 (4) Å et 0,073 (4) Å respectivement. Les deux phényles forment entre eux un angle de 71,61 (8)°. Les atomes N1, C1, C2 et C3 du groupement 1-cyanovinyle forment eux aussi un plan d′équation: -11,20 (4) x + 2,303 (9) y + 14,68 (4) z = 4,062 (6). Leur déviation moyenne est de 0,0006 Å. Ce groupement fait un angle de 4,8(3)° avec le premier phényle et un angle de 76,1(2)° avec le deuxième phényle. La valeur de la distance N1—C1 [1,139 (3) Å] et les valeurs moyennes des distances N—C [1,469 (3) Å] et C—C [1,518 (4) Å] du groupement pipérazinyle sont en accord avec celles rencontrées dans des composés ayant ces types de liaisons (Toumi et al., 2007). S2. Experimental La réaction est effectuée dans un ballon de 250 ml muni d'un barreau aimanté surmonté d'un séparateur à eau et d'un réfrigérant ascendant. Le reflux est réalisé à l'aide d'un bain d'huile. La réaction est terminée lorsqu'il ne se forme plus d'eau (environ 2 heures). A une solution d'acide cyanoacétique (0,3 mol) dans 300 ml de benzène, sont ajoutés 0,72 mol de paraformaldéhyde et 0,3 mol de 1-(diphénylméthyl)pipérazine. Le mélange est chauffé à reflux pendant 4 heures. Après refroidissement, le solvant est évaporé sous sec et le résidu est repris par 80 ml de chloroforme, lavé à l'eau (2 × 20 ml) et séché sur du sulfate de magnésium. Le solvant est évaporé sous sec et le produit obtenu est purifié par chromatographie sur colonne en utilisant l′éther diéthylique comme éluant. S3. Refinement [Please give range of refined C—H distances] Acta Cryst. (2008). E64, o1872 sup-1 supporting information Figure 1 Représentation de la molécule C21H23N3. Les ellipsoïdes d'agitation thermique ont 50% de probabilité de présence. 2-[(4-benzhydrylpiperazin-1-yl)methyl]acrylonitrile Crystal data C21H23N3 Mr = 317.42 Monoclinic, P21/c Hall symbol: -P 2ybc a = 17.443 (5) Å b = 6.183 (3) Å c = 17.717 (5) Å β = 107.00 (3)° V = 1827.4 (12) Å3 Z=4 F(000) = 680 Dx = 1.154 Mg m−3 Mo Kα radiation, λ = 0.71073 Å Cell parameters from 25 reflections θ = 11.6–15.0° µ = 0.07 mm−1 T = 298 K Slab, colourless 0.72 × 0.58 × 0.22 mm Data collection Enraf–Nonius CAD-4 diffractometer Radiation source: fine-focus sealed tube Graphite monochromator Non–profiled ω/2θ scans Absorption correction: ψ scan (North et al., 1968) Tmin = 0.904, Tmax = 0.985 3708 measured reflections Acta Cryst. (2008). E64, o1872 3587 independent reflections 1625 reflections with I > 2σ(I) Rint = 0.052 θmax = 26.0°, θmin = 2.4° h = −21→1 k = 0→7 l = −21→21 2 standard reflections every 120 min intensity decay: 7% sup-2 supporting information Refinement Refinement on F2 Least-squares matrix: full R[F2 > 2σ(F2)] = 0.054 wR(F2) = 0.156 S = 0.98 3587 reflections 309 parameters 0 restraints Primary atom site location: structure-invariant direct methods Secondary atom site location: difference Fourier map Hydrogen site location: inferred from neighbouring sites All H-atom parameters refined w = 1/[σ2(Fo2) + (0.0682P)2] where P = (Fo2 + 2Fc2)/3 (Δ/σ)max < 0.001 Δρmax = 0.17 e Å−3 Δρmin = −0.20 e Å−3 Special details Geometry. All e.s.d.'s (except the e.s.d. in the dihedral angle between two l.s. planes) are estimated using the full covariance matrix. The cell e.s.d.'s are taken into account individually in the estimation of e.s.d.'s in distances, angles and torsion angles; correlations between e.s.d.'s in cell parameters are only used when they are defined by crystal symmetry. An approximate (isotropic) treatment of cell e.s.d.'s is used for estimating e.s.d.'s involving l.s. planes. Refinement. Refinement of F2 against ALL reflections. The weighted R-factor wR and goodness of fit S are based on F2, conventional R-factors R are based on F, with F set to zero for negative F2. The threshold expression of F2 > σ(F2) is used only for calculating R-factors(gt) etc. and is not relevant to the choice of reflections for refinement. R-factors based on F2 are statistically about twice as large as those based on F, and R- factors based on ALL data will be even larger. Fractional atomic coordinates and isotropic or equivalent isotropic displacement parameters (Å2) N1 N2 N3 C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 C10 C11 C12 C13 C14 C15 C16 C17 C18 C19 C20 C21 H13 x y z Uiso*/Ueq −0.13498 (16) 0.08178 (11) 0.22797 (11) −0.09372 (17) −0.04111 (15) −0.0645 (2) 0.03676 (16) 0.15513 (15) 0.20291 (16) 0.10589 (17) 0.15533 (15) 0.27587 (14) 0.35248 (13) 0.40273 (16) 0.47357 (17) 0.4938 (2) 0.4453 (2) 0.37478 (18) 0.29580 (13) 0.32827 (19) 0.3497 (2) 0.33888 (18) 0.30501 (19) 0.28447 (16) −0.0285 (19) 0.4548 (5) 0.5724 (3) 0.3529 (3) 0.6013 (5) 0.7881 (4) 0.9613 (6) 0.7713 (5) 0.5667 (5) 0.3636 (5) 0.5601 (5) 0.3575 (5) 0.1535 (4) 0.1564 (4) 0.3359 (5) 0.3339 (7) 0.1530 (7) −0.0264 (7) −0.0246 (6) 0.1168 (4) 0.2798 (5) 0.2389 (6) 0.0384 (6) −0.1234 (6) −0.0861 (5) 1.088 (5) 0.10237 (17) 0.18358 (11) 0.17780 (11) 0.11096 (15) 0.12169 (16) 0.0767 (2) 0.18724 (18) 0.25155 (16) 0.24995 (15) 0.11123 (16) 0.11019 (15) 0.17883 (14) 0.24803 (14) 0.26327 (17) 0.3254 (2) 0.3721 (2) 0.3578 (2) 0.29607 (17) 0.10145 (14) 0.06644 (17) −0.00144 (19) −0.03670 (18) −0.00327 (19) 0.06555 (18) 0.0898 (18) 0.0949 (9) 0.0514 (5) 0.0484 (5) 0.0625 (7) 0.0564 (7) 0.0792 (9) 0.0616 (7) 0.0558 (7) 0.0535 (7) 0.0560 (7) 0.0545 (7) 0.0492 (6) 0.0504 (6) 0.0642 (8) 0.0781 (10) 0.0842 (11) 0.0816 (10) 0.0660 (8) 0.0495 (6) 0.0685 (8) 0.0807 (10) 0.0738 (9) 0.0746 (9) 0.0623 (7) 0.098 (11)* Acta Cryst. (2008). E64, o1872 sup-3 supporting information H23 H14 H24 H15 H25 H16 H26 H17 H27 H18 H28 H19 H111 H112 H113 H114 H115 H117 H118 H119 H120 H121 −0.1189 (16) 0.0235 (14) 0.0693 (16) 0.1394 (13) 0.1883 (16) 0.1723 (15) 0.2498 (14) 0.0579 (14) 0.1379 (14) 0.1224 (15) 0.1719 (13) 0.2430 (12) 0.3885 (13) 0.5043 (17) 0.5413 (19) 0.4583 (19) 0.3425 (16) 0.3375 (17) 0.3684 (18) 0.3571 (17) 0.2960 (16) 0.2654 (16) 0.972 (4) 0.767 (4) 0.909 (4) 0.573 (4) 0.704 (4) 0.231 (4) 0.361 (3) 0.552 (4) 0.692 (4) 0.228 (4) 0.360 (4) 0.032 (3) 0.460 (4) 0.462 (5) 0.155 (5) −0.147 (5) −0.147 (5) 0.426 (5) 0.350 (5) 0.006 (5) −0.263 (5) −0.199 (4) 0.0391 (16) 0.2404 (16) 0.1835 (15) 0.2995 (14) 0.2488 (15) 0.2543 (14) 0.2972 (13) 0.0641 (15) 0.1039 (13) 0.1109 (14) 0.0624 (14) 0.1842 (11) 0.2327 (14) 0.3322 (17) 0.4162 (18) 0.3893 (18) 0.2845 (15) 0.0924 (18) −0.0223 (17) −0.0838 (19) −0.0260 (17) 0.0925 (15) 0.068 (8)* 0.074 (8)* 0.075 (8)* 0.058 (7)* 0.078 (8)* 0.068 (8)* 0.053 (6)* 0.057 (7)* 0.060 (7)* 0.068 (8)* 0.055 (7)* 0.039 (6)* 0.056 (8)* 0.088 (10)* 0.093 (10)* 0.096 (11)* 0.078 (10)* 0.094 (10)* 0.086 (10)* 0.100 (10)* 0.084 (9)* 0.072 (9)* Atomic displacement parameters (Å2) N1 N2 N3 C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 C10 C11 C12 C13 C14 C15 C16 C17 C18 C19 U11 U22 U33 U12 U13 U23 0.0769 (18) 0.0447 (11) 0.0423 (11) 0.0554 (16) 0.0517 (15) 0.077 (2) 0.0583 (17) 0.0483 (14) 0.0451 (14) 0.0476 (14) 0.0485 (15) 0.0439 (13) 0.0430 (13) 0.0516 (16) 0.0488 (18) 0.0546 (19) 0.074 (2) 0.0605 (18) 0.0382 (13) 0.086 (2) 0.098 (2) 0.0669 (19) 0.088 (2) 0.0591 (14) 0.0535 (13) 0.067 (2) 0.0572 (17) 0.067 (2) 0.0565 (18) 0.0703 (19) 0.0679 (18) 0.0635 (19) 0.0639 (19) 0.0488 (16) 0.0553 (16) 0.066 (2) 0.094 (3) 0.115 (3) 0.092 (3) 0.068 (2) 0.0520 (16) 0.0594 (19) 0.079 (2) 0.098 (3) 0.102 (2) 0.0510 (11) 0.0495 (11) 0.0588 (16) 0.0614 (15) 0.089 (2) 0.0700 (18) 0.0507 (15) 0.0462 (14) 0.0549 (16) 0.0496 (15) 0.0553 (15) 0.0538 (14) 0.0726 (19) 0.089 (2) 0.073 (2) 0.071 (2) 0.0673 (19) 0.0557 (14) 0.0687 (18) 0.078 (2) 0.0570 (18) −0.0164 (16) −0.0024 (10) −0.0019 (10) 0.0055 (16) 0.0058 (14) 0.0144 (19) 0.0005 (15) −0.0033 (14) −0.0038 (14) 0.0044 (14) −0.0018 (15) −0.0116 (13) −0.0007 (13) −0.0047 (15) −0.0114 (19) 0.021 (2) 0.023 (2) 0.0052 (17) −0.0013 (11) −0.0062 (16) 0.002 (2) 0.0194 (18) −0.0001 (16) 0.0149 (9) 0.0135 (9) 0.0067 (14) 0.0182 (13) 0.016 (2) 0.0187 (14) 0.0173 (13) 0.0116 (12) 0.0116 (13) 0.0118 (12) 0.0151 (11) 0.0156 (11) 0.0145 (15) 0.0162 (17) 0.0031 (17) 0.0090 (18) 0.0149 (15) 0.0097 (11) 0.0367 (16) 0.0455 (19) 0.0184 (15) 0.0096 (17) −0.0069 (10) −0.0029 (10) 0.0023 (14) −0.0068 (14) 0.0031 (19) −0.0111 (15) −0.0077 (14) 0.0029 (13) 0.0034 (14) −0.0023 (13) 0.0002 (12) −0.0040 (13) −0.0038 (16) −0.029 (2) −0.019 (2) 0.007 (2) 0.0057 (16) −0.0020 (12) −0.0035 (15) 0.008 (2) −0.0029 (18) Acta Cryst. (2008). E64, o1872 sup-4 supporting information C20 C21 0.0671 (19) 0.0546 (16) 0.075 (2) 0.0583 (19) 0.077 (2) 0.0751 (19) 0.0013 (18) −0.0043 (14) 0.0152 (16) 0.0208 (14) −0.0247 (19) −0.0071 (16) Geometric parameters (Å, º) N1—C1 N2—C7 N2—C4 N2—C5 N3—C8 N3—C6 N3—C9 C1—C2 C2—C3 C2—C4 C3—H13 C3—H23 C4—H14 C4—H24 C5—C6 C5—H15 C5—H25 C6—H16 C6—H26 C7—C8 C7—H17 C7—H27 C8—H18 C8—H28 C9—C16 1.139 (3) 1.463 (3) 1.471 (3) 1.479 (3) 1.467 (3) 1.469 (3) 1.486 (3) 1.453 (4) 1.326 (4) 1.511 (4) 0.99 (3) 0.99 (3) 1.03 (3) 1.03 (3) 1.512 (4) 0.97 (2) 1.03 (3) 0.99 (3) 0.99 (2) 1.524 (4) 1.00 (2) 1.02 (2) 0.99 (3) 0.97 (2) 1.527 (3) C9—C10 C9—H19 C10—C11 C10—C15 C11—C12 C11—H111 C12—C13 C12—H112 C13—C14 C13—H113 C14—C15 C14—H114 C15—H115 C16—C17 C16—C21 C17—C18 C17—H117 C18—C19 C18—H118 C19—C20 C19—H119 C20—C21 C20—H120 C21—H121 1.527 (3) 0.97 (2) 1.391 (4) 1.391 (4) 1.394 (4) 0.93 (2) 1.374 (5) 0.95 (3) 1.373 (5) 0.96 (3) 1.387 (4) 0.92 (3) 0.93 (3) 1.388 (4) 1.394 (3) 1.383 (4) 1.00 (3) 1.376 (4) 0.89 (3) 1.380 (4) 1.00 (3) 1.387 (4) 0.94 (3) 0.96 (3) C7—N2—C4 C7—N2—C5 C4—N2—C5 C8—N3—C6 C8—N3—C9 C6—N3—C9 N1—C1—C2 C3—C2—C1 C3—C2—C4 C1—C2—C4 C2—C3—H13 C2—C3—H23 H13—C3—H23 N2—C4—C2 N2—C4—H14 C2—C4—H14 N2—C4—H24 112.1 (2) 108.08 (19) 109.3 (2) 107.69 (19) 111.96 (19) 109.63 (19) 179.8 (3) 119.4 (3) 124.6 (3) 115.9 (3) 115.8 (18) 121.7 (16) 122 (2) 113.3 (2) 106.4 (14) 108.2 (14) 111.9 (14) N3—C9—C16 N3—C9—C10 C16—C9—C10 N3—C9—H19 C16—C9—H19 C10—C9—H19 C11—C10—C15 C11—C10—C9 C15—C10—C9 C10—C11—C12 C10—C11—H111 C12—C11—H111 C13—C12—C11 C13—C12—H112 C11—C12—H112 C14—C13—C12 C14—C13—H113 112.77 (19) 110.9 (2) 110.31 (19) 107.4 (12) 105.7 (12) 109.6 (12) 118.4 (3) 121.3 (2) 120.3 (2) 120.6 (3) 119.9 (15) 119.5 (15) 119.6 (3) 124.8 (19) 115.6 (19) 120.8 (3) 119.8 (18) Acta Cryst. (2008). E64, o1872 sup-5 supporting information C2—C4—H24 H14—C4—H24 N2—C5—C6 N2—C5—H15 C6—C5—H15 N2—C5—H25 C6—C5—H25 H15—C5—H25 N3—C6—C5 N3—C6—H16 C5—C6—H16 N3—C6—H26 C5—C6—H26 H16—C6—H26 N2—C7—C8 N2—C7—H17 C8—C7—H17 N2—C7—H27 C8—C7—H27 H17—C7—H27 N3—C8—C7 N3—C8—H18 C7—C8—H18 N3—C8—H28 C7—C8—H28 H18—C8—H28 Acta Cryst. (2008). E64, o1872 106.4 (15) 111 (2) 110.8 (2) 108.4 (13) 110.5 (14) 107.7 (15) 111.1 (14) 108.3 (19) 111.1 (2) 109.6 (14) 111.8 (14) 110.7 (12) 109.0 (13) 105 (2) 111.2 (2) 110.6 (13) 106.9 (13) 112.3 (13) 108.8 (13) 106.8 (19) 111.3 (2) 109.9 (15) 109.5 (14) 107.8 (13) 108.2 (13) 110.2 (19) C12—C13—H113 C13—C14—C15 C13—C14—H114 C15—C14—H114 C14—C15—C10 C14—C15—H115 C10—C15—H115 C17—C16—C21 C17—C16—C9 C21—C16—C9 C18—C17—C16 C18—C17—H117 C16—C17—H117 C19—C18—C17 C19—C18—H118 C17—C18—H118 C18—C19—C20 C18—C19—H119 C20—C19—H119 C19—C20—C21 C19—C20—H120 C21—C20—H120 C20—C21—C16 C20—C21—H121 C16—C21—H121 119.4 (18) 119.6 (4) 121 (2) 119 (2) 121.0 (4) 120.4 (17) 118.5 (17) 118.1 (3) 121.5 (2) 120.3 (2) 120.4 (3) 120.9 (17) 118.7 (17) 121.5 (3) 121.9 (19) 116.5 (19) 118.5 (3) 121.8 (18) 119.6 (18) 120.6 (3) 121.2 (17) 118.2 (17) 120.8 (3) 122.3 (16) 116.7 (16) sup-6