PTBP2

PTBP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CQ1, 2MJU, 4CQ1
Ідентифікатори
Символи	PTBP2, PTBLP, brPTB, nPTB, polypyrimidine tract binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608449 MGI: 1860489 HomoloGene: 23162 GeneCards: PTBP2
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA binding • pre-mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • growth cone • spliceosomal complex • soma • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splice site selection • cerebellum development • mRNA processing • Сплайсинг РНК • spinal cord development • regulation of neural precursor cell proliferation • negative regulation of RNA splicing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58155	56195
Ensembl	ENSG00000117569	ENSMUSG00000028134
UniProt	Q9UKA9	Q91Z31
RefSeq (мРНК)	NM_001300985 NM_001300986 NM_001300987 NM_001300988 NM_001300989 NM_001300990 NM_021190	NM_019550 NM_001310711
RefSeq (білок)	NP_001287914 NP_001287915 NP_001287916 NP_001287917 NP_001287918 NP_001287919 NP_067013	NP_001297640 NP_062423
Локус (UCSC)	Хр. 1: 96.72 – 96.82 Mb	Хр. 3: 119.51 – 119.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTBP2 (англ. Polypyrimidine tract binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 57 491.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDGIVTEVAV		GVKRGSDELL		SGSVLSSPNS		NMSSMVVTAN		GNDSKKFKGE
DKMDGAPSRV		LHIRKLPGEV		TETEVIALGL		PFGKVTNILM		LKGKNQAFLE
LATEEAAITM		VNYYSAVTPH		LRNQPIYIQY		SNHKELKTDN		TLNQRAQAVL
QAVTAVQTAN		TPLSGTTVSE		SAVTPAQSPV		LRIIIDNMYY		PVTLDVLHQI
FSKFGAVLKI		ITFTKNNQFQ		ALLQYGDPVN		AQQAKLALDG		QNIYNACCTL
RIDFSKLVNL		NVKYNNDKSR		DYTRPDLPSG		DGQPALDPAI		AAAFAKETSL
LAVPGALSPL		AIPNAAAAAA		AAAAGRVGMP		GVSAGGNTVL		LVSNLNEEMV
TPQSLFTLFG		VYGDVQRVKI		LYNKKDSALI		QMADGNQSQL		AMNHLNGQKM
YGKIIRVTLS		KHQTVQLPRE		GLDDQGLTKD		FGNSPLHRFK		KPGSKNFQNI
FPPSATLHLS		NIPPSVAEED		LRTLFANTGG		TVKAFKFFQD		HKMALLQMAT
VEEAIQALID		LHNYNLGENH		HLRVSFSKST		I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Tateiwa H., Gotoh N., Ichikawa M., Kikuchi T., Yoshimura N. (2001). Molecular cloning and characterization of human PTB-like protein: a possible retinal autoantigen of cancer-associated retinopathy. J. Neuroimmunol. 120: 161—169. PMID 11694331 DOI:10.1016/S0165-5728(01)00427-1
• Rahman L., Bliskovski V., Reinhold W., Zajac-Kaye M. (2002). Alternative splicing of brain-specific PTB defines a tissue-specific isoform pattern that predicts distinct functional roles. Genomics. 80: 245—249. PMID 12213192 DOI:10.1006/geno.2002.6826
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mitchell S.A., Spriggs K.A., Coldwell M.J., Jackson R.J., Willis A.E. (2003). The Apaf-1 internal ribosome entry segment attains the correct structural conformation for function via interactions with PTB and unr. Mol. Cell. 11: 757—771. PMID 12667457 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00093-5

Див. також

• Хромосома 1