PDLIM5

PDLIM5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2UZC, 2DAR
Ідентифікатори
Символи	PDLIM5, ENH, ENH1, LIM, L9, PDZ and LIM domain 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605904 MGI: 1927489 HomoloGene: 21289 GeneCards: PDLIM5
Пов'язані генетичні захворювання
рак простати
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • protein N-terminus binding • actin binding • actinin binding • protein kinase C binding • cadherin binding involved in cell-cell adhesion • muscle alpha-actinin binding Клітинна компонента • цитоплазма • міжклітинні контакти • neuron projection • postsynaptic membrane • клітинна мембрана • синапс • actin cytoskeleton • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • гіалоплазма • stress fiber • Z discdkac • filamentous actin Біологічний процес • regulation of dendritic spine morphogenesis • regulation of synapse assembly • cell-cell adhesion • cell growth involved in cardiac muscle cell development • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10611	56376
Ensembl	ENSG00000163110	ENSMUSG00000028273
UniProt	Q96HC4	Q8CI51
RefSeq (мРНК)	NM_001011513 NM_001011515 NM_001011516 NM_001256425 NM_001256426 NM_001256427 NM_001256428 NM_001256429 NM_006457	NM_001190852 NM_001190853 NM_001190854 NM_001190855 NM_001190856 NM_001190857 NM_019808 NM_019809 NM_022554
RefSeq (білок)	NP_001011513 NP_001011515 NP_001011516 NP_001243354 NP_001243355 NP_001243356 NP_001243357 NP_001243358 NP_006448	NP_001177781 NP_001177782 NP_001177783 NP_001177784 NP_001177785 NP_001177786 NP_062782 NP_062783 NP_072048
Локус (UCSC)	Хр. 4: 94.45 – 94.67 Mb	Хр. 3: 141.95 – 142.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDLIM5 (англ. PDZ and LIM domain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 596 амінокислот, а молекулярна маса — 63 945.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSNYSVSLVG		PAPWGFRLQG		GKDFNMPLTI		SSLKDGGKAA		QANVRIGDVV
LSIDGINAQG		MTHLEAQNKI		KGCTGSLNMT		LQRASAAPKP		EPVPVQKGEP
KEVVKPVPIT		SPAVSKVTST		NNMAYNKAPR		PFGSVSSPKV		TSIPSPSSAF
TPAHATTSSH		ASPSPVAAVT		PPLFAASGLH		ANANLSADQS		PSALSAGKTA
VNVPRQPTVT		SVCSETSQEL		AEGQRRGSQG		DSKQQNGPPR		KHIVERYTEF
YHVPTHSDAS		KKRLIEDTED		WRPRTGTTQS		RSFRILAQIT		GTEHLKESEA
DNTKKANNSQ		EPSPQLASSV		ASTRSMPESL		DSPTSGRPGV		TSLTAAAAFK
PVGSTGVIKS		PSWQRPNQGV		PSTGRISNSA		TYSGSVAPAN		SALGQTQPSD
QDTLVQRAEH		IPAGKRTPMC		AHCNQVIRGP		FLVALGKSWH		PEEFNCAHCK
NTMAYIGFVE		EKGALYCELC		YEKFFAPECG		RCQRKILGEV		ISALKQTWHV
SCFVCVACGK		PIRNNVFHLE		DGEPYCETDY		YALFGTICHG		CEFPIEAGDM
FLEALGYTWH		DTCFVCSVCC		ESLEGQTFFS		KKDKPLCKKH		AHSVNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 4