Klubben grundades 1925 som en utbrytare från Altay SK. Deras klubbfärger är röd och gul. 1937 slogs de samman med İzmirspor och döptes då om till Doğanspor. Vissa anhängare av İzmirspor motsatte sig fusionen och grundade Ateşspor 1938. Doğanspor döptes om igen till Göztepe 1939. Ateşspor döptes också om till İzmirspor samma år.
Klubbens största framgång var vinsten av det tidigare turkiska fotbollsmästerskapet 1950, där man vann finalgruppen i sin egen stad, Izmir. Med den segern blev de den första och enda fotbollsklubben från Izmir som blivit turkiska fotbollsmästare. Göztepe kom sedermera att ha en framgångsrik period mellan åren 1963 och 1971 under ledning av tränaren Adnan Süvari.