GTPaze
Izgled
GTPaze su velika familija enzima hidrolaza koji mogu da se vežu i hidrolizuju guanozin trifosfat (GTP). GTP vezivanje i hidroliza se odvijaju u visoko konzerviranom G domenu zajedničkom za sve GTPaze.[1]
GTPaze imaju važnu ulogu u:
- Prenos signala u intracelularnom domenu transmembranskih receptora, u šta se ubraja prepoznavanje ukusa, mirisa i svetlosti.
- Biosinteza proteina (aka translacija) u ribozomima.
- Kontrola i diferencijacija tokom ćelijska deobe.
- Translokacija proteina kroz membrane.
- Transport Vezikula unutar ćelije. (GTPaze kontrolišu formiranje omotača vezikula).
Hidroliza GTP γ fosfata guanozin-difosfat (GDP) i Pi, neorganski fosfat, se odvija SN2 mehanizmom (nukleofilnom supstitucijom) putem pentavalentnog intermedijarnog stanja, i zavisna je od magnezijumovih jona (Mg2+).
Kod većine GTPaza, specifičnost za bazu guanin je data motivom za prepoznavanje baze, koji ima konsenzus sekvencu [N/T]KXD.[2]
- Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
- Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X.
- Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842.
- ↑ Scheffzek K, Ahmadian MR (December 2005). „GTPase activating proteins: structural and functional insights 18 years after discovery”. Cellular and Molecular Life Sciences : CMLS 62 (24): 3014–38. DOI:10.1007/s00018-005-5136-x. PMID 16314935.
- ↑ Leipe D.D., Wolf Y.I., Koonin E.V., and Aravind, L. (2002). „Classification and evolution of P-loop GTPases and related ATPases”. J Mol Bio 317 (1): 41–72. DOI:10.1006/jmbi.2001.5378. PMID 11916378.