ENZIME - Docc Ana
ENZIME - Docc Ana
ENZIME - Docc Ana
Enzimele n procese
metabolice
Enzime
1. Istoric
2. Definiie
3. Caracteristici ale catalizei enzimatice
4. Mecanisme de aciune cinetica reaciilor enzimatice
5. Structur
6. Specificitate
7. Localizare intracelular
ENZIME - Istoric
Sunt cunoscute de secole
Procese enzimatice Procese de fermentaie ACRIREA LAPTELUI
FERMENTAREA MUSTULUI OETIREA VINULUI
FABRICAREA BERII
1640 Medicul olandez VON HELMONTZ introduce termenul de
FERMENTAIE
Apare termenul de FERMENI
lb. latin fervere = a fierbe, a fermenta (bule de gaze care se degaj)
Enzime. Definiie
specificitate
Procesele enzimatice sunt procese autoreglate (enzimele catalizeaz n general reacii care
se petrec n lan)
mbtrnirea enzimelor = proces determinat de natura lor proteic (n organismele vii au
n care:
=
RT2
k=constanta de vitez
Ea=energia de activare
ES
ET
E+P
COMPLEXUL ACTIVAT (ES) rezult prin formarea unor combinaii specific reactive ntre gruprile
catalitice i substrat
Exemplul clasic:
Reacia catalizat de CATALAZ
H2O2 + H2O2 2 H2O + O2
G < 0
S-A DEMONSTRAT C :
k platin
Deci, la 37OC CATALAZA DESCOMPUNE PEROXIDUL DE HIDROGEN DE CIRCA UN MILION DE ORI MAI
REPEDE DECT PLATINA
H2O2 + H2O2
2 H2O + O2
G < 0
Centrul activ al enzimei sau centrul catalitic al enzimei reprezint o parte special
structurat a enzimei care fixeaz substratul asupra cruia acioneaz
STRUCTURA ENZIMELOR
Cu foarte rare excepii enzimele sunt proteine sau heteroproteine
Excepiile, descoperite n ultimii 20 de ani structur de acizi
ribonucleici de tip catalitic = ribozime
Exemple: Ribonucleaza P este un complex protein ARN
EXIST DOU MARI CATEGORII DE ENZIME DIN PUNCT DE VEDERE STRUCTURAL:
I. CU STRUCTUR UNITAR: - PROTEINE SIMPLE - CONSTITUITE NUMAI DIN AMINOACIZI
AI. CU STRUCTUR BINAR: - HETEROPROTEINE PROTEINE CONJUGATE:
PROTEIN + COFACTOR (PARTE NEPROTEIC)
I.
VITAMINE
HORMONI
METALE
STRUCTURA ENZIMELOR
STRUCTURA APOENZIMEI
STRUCTURA PRIMAR
Se refer la scheletul covalent al lanului polipeptidic i la secvena de
aminoacizi componeni.
Se specific:
numrul de aminoacizi
felul aminoacizilor
tipurile de legturi
STRUCTURA SECUNDAR
Desemneaz aranjamentul obinuit ntr-o singur dimensiune n spaiu,
prin dispunerea elicoidal a catenei polipeptidice.
Conformaia unic, n zig-zag, este determinat de starea
de hibridizare a atomilor participani la structura lanului
Exist dou tipuri de lanuri:
-
-helix
Structur secundar de tip -helix (a) i -helix (tip foaie pliat) (b)
STRUCTURA TERIAR
Desemneaz asamblarea n spaiul tridimensional (organizarea spaial) a lanurilor polipeptidice cu
structur primar i secundar bine definite
Determin tipurile de legturi noncovalente stabilite ntre radicalii aminoacizilor care pot
stabiliza conformaia respectiv
Exist dou tipuri diferite de structuri teriare :
1) globular (ghem), Ex: albumina, ribonucleaza, lizozimul
2) fibrilar (fibre), Ex: colagenul
Caracteristicile structurii teriare:
33
STRUCTURA CUATERNAR
Protomerii se leag ntre ei prin legturi de tip noncovalent, realizate prin puncte sau suprafee
complementare.
Caracteristic enzimelor de tip allosteric, cu funcii nalt specifice.
Activitatea catalitic a enzimelor depinde de integritatea conformaiei
proteinei native.
Prin denaturare sau disociere n subunitile componente, activitatea sa catalitic se pierde (de
obicei).
Integritatea structurii primare, secundare, teriare i cuaternare sunt eseniale pentru activitatea catalitic
a enzimelor
oxidoreductaze
transferaze
- Determinat n special de structura chimic a cofactorului (coenzimei sau a gruprii prostetice)
Excepii:
Enzimele dependente de piridoxal-fosfat (PLP) sunt enzime care au n
decarboxilare
transaminare
izomerizare
Specificitatea stereochimic
Configuraia spaial a moleculelor substratului.
Asimetria structural
este o caracteristic
generala a sistemelor
biologice !
Exemple:
enzimele din lanului respirator
enzimele din ciclul Krebs
fosfatazele
Alte enzime nu sunt elaborate dect de ctre anumite celule ale unor organe.
Exemplu:
pepsina
Un caz interesant: existena mai multor izoforme enzimatice sau izoenzime-n organe diferite, n cadrul
aceluiai organism.
Exemplu:
La om exist izoenzime ale lactat dehidrogenazei (LDH) n funcie de organ ( t.muscular,hepatic)
Glande salivare -
amilaza
Pancreas exocrine
-amilaza
Chimotripsina
Tripsina
Intestin subire
Lipaza
Maltoza
Lactoza
ZAHAROZA
LOCALIZAREA INTRACELULARA
A Enzimelor
Tehnici
moderne
de
fracionare
omogenatului celular prin
ultracentrifugare diferenial =>
Repartizarea
enzimelor
pe
diferite
formaiuni subcelulare;
Nucleul
Enzimele necesare biosintezei acizilor nucleici
Exemplu: ADN polimeraza
Mitocondriile
Sediul respiraiei celulare i a fosforilrii oxidative, deci conin enzimele necesare acestui proces
Reticulul endoplasmic rugos (RER)
Asociat cu ribozomii, conine o mare varietate de enzime care asigur att sinteza de proteine i
polizaharide
(glicoproteine)
Reticulul endoplasmic neted (REN)
Enzimele necesare oxidrii i detoxifierii compuilor xenobiotici (medicamente,
pesticide)
Lizozomii
Sunt bogai n enzime hidrolitice, de degradare
1.
2.
3.
4.
5.
efector fizic
afinitatea enzimei pentru diferii activatori i inhibitori: temperatura influeneaz pozitiv viteza de
reacie pn la atingerea unei temperaturi optime, dup care viteza de reacie scade rapid.
Temperatura optim
=
temperatura
corespunztoare
vitezei
maxime
de
aciune a enzimei
(aproximativ 40- 50C)
pH-ul optim al unei enzime: pH-ul mediului de reacie pentru care activitatea enzimei respective ca
i viteza de reacie este maxim.
pH-ul optim poate varia n funcie de: - natura substratului,
- concentraia de substrat,
- originea enzimei,
- temperatur, presiune.
Pentru enzimele din organismul uman pH-ul optim de aciune este chiar pH-ul normal al
mediului n care ele i ndeplinesc funcia catalitic.
La majoritatea enzimelor pH-ul optim este n jurul valorii 7
Influena exercitat de pH-ul mediului se datoreaz:
ionizrii centrilor activi din molecula enzimei;
ionizrii substratului, modificndu-se astfel activitatea
sa pentru centrii activi ai enzimei
Exemplu amilaza salivar acioneaz numai la nivelul cavitii bucale
deoarece este inhibat de pH-ul acid al stomacului.
pentru majoritatea enzimelor, variaia vitezei de reacie n funcie de
pH are aspectul unei curbe n form de clopot (pH = 5,5-8).
Excepii:
pepsina, tripsina, papaina, arginaza, colinesteraza
Viteza unei reacii enzimatice depinde de concentraia enzimei din mediul de reacie.
v = k [E]
unde k constanta caracteristic pentru fiecare reacie enzimatic v viteza
de reacie
[E] concentraia de enzim
Viteza de reacie este proporional cu concentraia enzimei.Dar, cu ct concentraia de enzim este mai
mare cu att cantitatea de substrat necesar desfurrii reaciei va fi mai mare.
n
n
n
n
E+S
ES
E+P
Se consider c reacia global este ireversibil, deci c produsul de reacie nu rmne legat de enzim.
E+S
ES
E+P
Fiecare din cele trei reacii se caracterizeaz printr-o vitez de reacie, respectiv printr-o constant de vitez
specific (k):
E + S
k+1
ES
+2
E + P
-1
Se consider prima parte a reaciei, care este reversibil:
E + S k+1 ES
-1
Se mparte ecuaia cu
factorul k+1[ES]:
k+1[ES]
Se separ constantele de vitez i rezult:
-1
+1
-1
=K
+1
k+1[ES]
= KM
(1)
[E] [S]
ES=
(2)
KM+ [S]
+1
E + S
ES
+2
E + P
-1
[ES]
[ES] =
+2
EP
(3)
+2
v+2 k2[ES]
+2
+2
= [E] [S]
(5)
KM+ [S]
v = k+2 [ES]
[ES] =
(4)
+2
[ES] = [E]
v Vmax
k
v=
+2
[E] [S]
(6)
KM + [S]
(7) unde k+2 = constant catalitic (indic
eficacitatea enzimei)
Vm
(9
[S] )
ax
Ecuaia MichaelisMenten
v=
KM + [S]
58
Ecuaia Michaelis-Menten: expresia matematic ce definete relaia cantitativ dintre viteza unei reacii
enzimatice, concentraia de substrat i valoarea constantei lui Michaelis KM.
Ecuaia permite calcularea KM, n funcie de concentraia substratului
V
v=
max
V
max =
max
[S]
KM + [S]
k+1
+2
ES
E + P
-1
Ecuaia Michaelis-Menten se baza pe o ipotez care nu corespunde realitii:
k-1 >> k+2
k+2 = constanta de vitez a reaciei de descompunere a complexului enzim-substrat, n enzim
i produi de reacie (adic n substrat transformat), este suficient de mic pentru a nu influena
mersul reaciei, care este condiionat exclusiv de k+1 i k-1.
Deci n teoria Michaelis-Menten nu are loc transformarea substratului; se consider k+2 ca fiind foarte
mic, ceea ce nu corespunde realitii.
n mod real se micoreaz [S] i crete [P] !!
Aceast contradicie aparent a teoriei Michaelis-Menten se poate elucida dac cinetica reaciilor
enzimatice este interpretat inndu-se seama de cinetica strii staionare.
TEORIA BRIGGS I HALDANE. CINETICA STRII STAIONARE (I)
G.E. Briggs i J.B.S. Haldane au analizat ecuaia general a reaciilor enzimatice i au elaborat n anul
1925 o teorie mai cuprinztoare
Atunci cnd enzima i substratul se gsesc n contact, are loc o micorare rapid a concentraiei enzimei
libere, deoarece aceasta se combin cu substratul formnd complex [ES].
Acest stadiu al reaciei poart denumirea de faz iniial i precede stabilirea fazei staionare, spun
Briggs i Haldane, n care viteza de transformare a substratului este egal cu viteza de formare a
produsului reaciei, iar concentraia complexului [ES] rmne tot timpul constant
Concentraia total de enzim, [E]T = [E] + [ES]
6
2
Vmax [S]
v=
KM + [S]
KM + [S]
1
=
Vmax [S]
v
Ecuaia Lineweaver-Brk:
1
v
K
=
[S]
max
1
+
(18)
max
Ecuaie de tipul y = ax + b:
unde:
x=
1
[S]
;y=
1
v
(17)
max
1
[S] =
[S]
- V1
max
KM
max
1
1
= - KM
1
= V
max
max
64
E + S
Valorile KM variaz :
n funcie de structura substratului ;
n funcie de pH-ul mediului de reacie ;
independent de concentraia enzimei.
k+1
ES
+2
E + P
-1
k -1 k2
KM
k
1
KM este o constant ce poate fi determinat practic din datele experimentale
Pentru o reacie enzimatic simpl, KM red capacitatea de disociere a lui ES n E i S.
Codul EC
Sursa biologic
Substrat
KM (M)
enzimei
Alcool
dehidrogenaza
1.1.1.1
Drojdie
Etanol
1,3 x 10-2
NAD+
7,4 x 10-5
Lactat
1.1.1.27
dehidrogenaza
izoenzima H
4
Aspartat
2.6.1.1
Acetaldehid
7,8 x 10-4
NADH
1,0 x 10-2
Inim de bou
Lactat
1,7 x 10-2
Bacillus subtilis
NAD+
Piruvat
1,0 x 10-4
1,4 x 10-4
NADH
2,4 x 10-5
Lactat
3,0 x 10-2
NAD+
9,0 x 10-4
Piruvat
8,0 x 10-4
NADH
6,5 x 10-5
L-aspartat
3,9 x 10-3
2-oxoglutarat
4,3 x 10-4
Oxalacetat
8,8 x 10-5
L-glutamat
8,9 x 10-3
Mucoasa
Acetil L-
7,5 x 10-5
stomacal
alanildiiodtirozina
porc
Acetil L-fenilalanil-L-
Inim de porc
aminotransferaza
Pepsina
3.4.23.1.
fenilalanin
4,3 x 10-4
6
6
Substratul
Acetil colin
CO
Anhidraza
carbonic
HC
O
Catalaz
HO
2
-1
K (S )
K (M)
M
cat
9,5 x 10
-5
1,4 x 10
1,2 x 10
-2
2,6 x 10
K /K
cat
1,5 x 10
1,0 x 10
8,3 x 10
-2
4,0 x 10
1,5 x 10
2,5 x 10
-2
1,0 x 10
4,0 x 10
4,4 x 10
-1
5,1 x 10
-2
1,2 x 10
-1
Fumaraz
Fumarat
5,0 x 10
-6
8,0 x 10
1,6 x 10
Ureaz
Uree
2,5 x 10
-2
1,0 x 10
4,0 x 10
Medicamen
tele
influeneaz
viteza
reaciilor
enzimatice
i eficiena
catalitic a
enzimelor
67