Questões de Fixação - Replicação Do DNA

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Questões de fixação – Replicação do DNA

Prof. André Passaglia Schuch

Nome: Marcos Jeremias Lopes Data: 17/05/22

1) Cite as 4 regras básicas da replicação do DNA.


1: A replicação se inicia na origem de replicação e pode seguir uma ou duas direções.
2: O crescimento da cadeia de DNA sempre vai no sentido 5’ para 3’.
3: Se relaciona com o fato de as fitas de DNA serem antiparalelas, isso faz com que a
replicação delas ocorram em direções opostas e é necessário que seja ao mesmo tempo,
por isso a replicação do DNA é semidescontínua.
4: a replicação do DNA é semiconservativa, pois sempre conserva uma fita molde parental
que vai servir de molde para síntese da nova fita.

2) Resumidamente, cite as proteínas que atuam na replicação do DNA (replissomo) e


suas principais funções.
DNA-polimerase: são as mais importantes e atuam na replicação e reparo do DNA,
incorporam nucleotídeos na extremidade 3’ e sintetizam a fita no sentido 5’-3’, também são
importantes pela habilidade de edição, atividade exonucleásica da DNA-polimerase.
Helicases: importante para quebrar as pontes de hidrogênio e separar as duas fitas.
Proteínas de ligação à fita simples: importantes para proteger o DNA contra desgradação
por nucleases e também para induzir a conformação ideal para replicação, em procariotos
são chamadas de SSB e em eucariotos de RPA. Topoisomerase: evitam super enrolamento
da dupla hélice a frente da forquilha. Primase: responsável pra fazer os primers de RNA.
Ligase: responsável por unir os fragmentos de Okazaki na fita descontínua.

3) Além da atividade de polimerização, as DNA-polimerases replicativas possuem outra


atividade. Qual é essa atividade e como ela é ativada?
As DNA-polimerases possuem atividade de revisão ou reparo. Caso a DNA-polimerase
coloque uma base errada, ela retorna no seu sentido de movimento para remover o
nucleotídeo que foi colocado erroneamente e coloca o certo. Essa atividade é chamada de
exonuclease.

4) Quais são as principais DNA-polimerases que replicam os genomas procarióticos e


eucarióticos? Resumidamente, descreva a função de cada uma durante a replicação do
DNA.
DNA-polimerase de replicação do genoma procariótico I: responsável pela remoção o RNA
de origem e pelo reparo de DNA; e III: responsável pela replicação cromossômica.
DNA-polimerase de replicação do genoma eucariótico δ: síntese da fita descontínua e
reparo das bases por excisão; e a Ɛ: síntese da fita contínua e reparo de bases também por
excisão.

5) O que é uma origem de replicação?


É o ponto de partida de uma replicação de DNA, sempre em sequências ricas em AT (por
serem menos estáveis e mais fáceis para que ocorra a quebra de fita dupla).

6) Descreva como a origem de replicação de E. coli é reconhecida e como inicia a


replicação do seu DNA.
O reconhecimento da origem de replicação (oriC) é realizada pela proteína DnaA, que inicia
a abertura das fitas recrutando o complexo DnaB e DnaC, que possuem função helicase e
darão continuidade a quebra das pontes de hidrogênio nas bases, permitindo a formação
da bolha com duas forquilhas de replicação.

7) Descreva como a origem de replicação de eucariotos é reconhecida e como inicia a


replicação do seu DNA.
É realizado pelo complexo ORC: Complexo de Reconhecimento da Origem, que reconhece
a origem e recruta as proteínas CDC6 e CDT1 (carreadoras de helicase, fatores de
replicação altamente regulados) e MCMs (helicase). As primeiras posicionam as helicases,
que darão início ao processo de replicação.

8) Descreva os mecanismos que garantem que os cromossomos de eucariotos sejam


replicados apenas uma vez por ciclo?
Logo após a ativação do pré-RC, no início da fase S, é rapidamente desmontado e as
proteínas CDC6 e CDT1 são degradadas, fazendo com que cada origem seja disparada uma
vez, a cada ciclo celular.

9) Descreva o que são os fragmentos de Okazaki e como estes são gerados durante a
replicação do DNA.
São fragmentos que são gerados na replicação da fita descontínua de DNA.

10) Se as fitas de DNA têm polaridades opostas e as polimerases sintetizam apenas no


sentido 5’ para 3’, como o replissomo consegue replicar as duas fitas ao mesmo tempo
em sentidos opostos?
A estratégia é replicar uma fita no sentido contínuo e a outra de forma descontínua. A fita
contínua necessita de apenas um primer, enquanto a fita descontínua necessita de vários
processos e vários fragmentos são gerados.

11) Descreva como os iniciadores de RNA (primers) são removidos durante a replicação
da fita descontínua em procariotos e eucariotos.
Em procariotos, a DNA-polimerase 3 sai e entra a DNA-polimerase 1, que remove o primer e
o substitui por uma sequência de DNA. Nos eucariotos, a DNA-polimerase remove o primer
de RNA, formando um Flap de DNA e vem uma enzima que o cliva, removendo o primer.

12) Cite dois exemplos de proteínas que permitem que o DNA de células eucarióticas seja
replicado no contexto da cromatina? Como estas agem durante a replicação do DNA?
As chaperonas desmontam os nucleossomos que bloqueiam a passagem da forquilha de
replicação e remontam nas fitas recém sintetizadas. Duas principais proteínas são: CAF1 e
Nap1.

13) Como ocorre o término da replicação do cromossomo circular de bactérias?


Ocorre quando as duas forquilhas de replicação se encontram. Uma proteína chamada Tus
é necessária neste processo e bloqueia a forquilha de replicação e as enzimas
Toposoimerase induzem uma quebra em uma das moléculas de DNA e após isso reúne as
fitas.

14) Por que é um problema replicar a extremidade de um cromossomo linear?


Sempre ocorre perda de sequência pela ausência de um primer na fita descontínua.

15) O que são telômeros?


Sequências especiais presentes nas extremidades dos cromossomos eucarióticos e são
formadas por várias repetições consecutivas de sequências curtas.

16) O que é a telomerase? Qual a atividade dessa enzima?


Proteína formada por uma estrutura proteica e uma de RNA. O RNA presente nessa
proteína serve de molde para replicar os telômeros.

17) Descreva o mecanismo da telomerase que permite que as células eucarióticas


consigam replicar a extremidade de seus cromossomos.
A telomerase se liga à extremidade 3’ da fita molde e a estende. Após isso, há espaço para
a síntese do primer e permite que a DNA-polimerase complete a replicação da fita
descontínua.

18) Em 1994, a atividade da telomerase foi descoberta em células humanas cancerosas


em cultura (in vitro). Embora a telomerase não esteja ativa no tecido humano somático e
tendo em vista que a ativação da telomerase pode causar câncer, por que os genes
codificadores dessa enzima foram mantidos no genoma humano ao longo da evolução?
Será que existem tipos de células em que a ativação da telomerase pode ser vantajosa
ou necessária? Explique.
A telomerase é ativa em células troncos e germinativas, e também no tecido embrionário.
Apesar da possibilidade de a telomerase causar câncer, ela é importante para a formação
de um bebê, por esta razão os genes codificadores desta enzima foram mantidos no
genoma humano.

19) Como funciona a replicação do tipo círculo rolante? Onde esse tipo de replicação do
DNA é observado?
É observado em vírus que possuem DNA de fita dupla ou simples, viroides de RNA circular,
pequenos plasmídeos e até no processo de conjugação bacteriana. O mecanismo de
circuito rolante é utilizado por genomas com o objetivo de geração de cópias do seu DNA
(divide-se em 5 etapas). Uma fita de DNA é clivada pela endonuclease e a extremidade 3’ é
alongada, utilizando a outra fita como molde. A extremidade 5’ é clivada e separada,
circulariada e replicada de maneira descontínua (fragmentos de Okazaki) e a DNA ligase
fecha as fitas, formando duas moléculas de DNA circular de dupla fita.

20) O que é o endociclo e qual a sua importância para alguns determinados tipos de
células?
É um ciclo onde todo o genoma é replicado mais de uma vez sem que ocorra a mitose -
ciclo celular apenas nas fases S e G e as origens de replicação são ativadas mais de uma
vez a cada ciclo. Esse ciclo é fundamental para organismos com uma elevada atividade
metabólica, como a larva Drosophila melanogaster, que em sua fase larval precisa se
alimentar muito para sofrer a metamorfose.

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