Universidade Federal da Bahia

Instituto de Ciências da Saúde

Departamento de Bioquímica e Biofísica

Estudante: Matheus Sales Barbosa

Componente Curricular: ICS071 –
Professor(a): Luzimar Gonzaga
Bioquímica Metabólica para Farmácia
Fernandez

ESTUDO DIRIGIDO I – Introdução ao Estudo

do Metabolismo e Metaboloma

1. Qual o objetivo do estudo da Bioquímica Metabólica?

Através do estudo integrado da bioquímica da digestão e absorção de
biomoléculas e dos metabolismos de carboidratos, lipídeos, proteínas, ácidos
nucleicos e hormonal, pretende-se estabelecer relações entre as reações que
ocorrem com os biocompostos e a realização das funções celulares para o melhor
entendimento dos processos biológicos.

2. Quanto aos termos listados abaixo responda como pode ser definido cada
termo, explique e descreva a importância da para o estudo do Metabolismo.
[Anotações obtidas da transcrição da aula e Wikipedia]
a. Biologia dos Sistemas - é necessário entender como o metabolismo funciona.
E através do entendimento dos sistemas biológicos isso é possível.
b. Ciências Ômicas - com as ciências ômicas podemos estudar os carboidratos.
Podemos avaliar só os lipídios, podemos avaliar fluxos metabólicos. Há uma
série de estudos e a depender do tipo de estudo e analise, é possível identificar
como os processos biológicos ocorrem e entender um pouco mais sobre a
biologia dos sistemas.
c. Genômica funcional - é um ramo da biologia molecular responsável por
descrever as funções de genes e proteínas, através da determinação e
sequenciamento completo do genoma de um organismo. Desse modo,
relaciona o fluxo de informação biológica e regulação da expressão
gênica com aparato fisiológico e bioquímico, aprofundando estudos para
a compreensão da alteração metabólica, transcrição gênica, tradução
proteica e interação proteína-proteína.
d. Metaboloma - existem diversos fatores que influenciam o metabolismo,
estilo de vida, idade, genética, doenças, drogas, hormônios, gênero,
ambiente, idade. O conjunto de metabolitos que são ingeridos,
degradados, produzidos, modificados através do metabolismo. Esse
conjunto de compostos nós chamamos de metaboloma.
e. Metabolômica - é o estudo científico que visa identificar e quantificar o
conjunto de metabólitos - o metaboloma - produzidos e/ou modificados
por um organismo
f. Metabolon - unidade estrutural funcional temporário do metaboloma celular.
Formado entre enzimas sequenciais de uma via metabólica, unidas tanto por
interações não-covalentes e por eelementos estruturais da célula que facilita a
 canalização do substrato. Durante o funcionamento dos metabolons, a
quantidade de agua é muito importante para que os metabolismos ocorram.

3. Quais as funções do metabolismo?

O metabolismo desempenha as seguintes funções nos organismos vivos: a)
obtenção de energia química, seja por captura da energia solar ou pela degradação
de nutrientes energeticamente ricos obtidos do meio ambiente; b) conversão de
moleculas em outrasde acordo com as necessidades específicas de cada tipo
celular, inclusive precursores de macromoléculas; c) produção de
macromoléculas (polimerização).

4. Explique a seguinte frase: “Organismos vivos existem em um estado de

equilíbrio dinâmico, mas nunca em equilíbrio com o ambiente a sua volta”.
Existem questionamentos sobre se os organismos vivos obedecem às leis da
termodinâmica. A resposta curta é SIM, eles obedecem. Organismos vivos não
são sistemas fechados (objeto de estudo estrito da termodinâmica clássica), mas
são sistemas abertos que podem trocar energia e matéria com o ambiente à sua
volta. Pelo fato de serem sistemas abertos, eles não podem ser sistemas em
equilíbrio enquanto viverem. Entretanto são capazes de alcançar um ‘steady
satate’, que é uma condição estável na qual os seres vivos operam em eficiência
termodinâmica máxima.

5. Diferencie Metabolismo primário de metabolismo secundário.

Exemplifique.
Os termos metabolismo primário e secundário são utilizados com frequência para
se referir ao metabolismo de plantas. O primário consiste em vias metabólicas
relacionadas à compostos fundamentais como carboidratos, lipídeos, proteínas,
ácidos nucleicos e reações acopladas como glicólise, ciclo do ácido
tricarboxílico, via das pentoses-fosfato e biossíntese dessas moléculas.
O metabolismo secundário é relacionado à produção de metabólitos não
fundamentais como os compostos fenólicos, terpenos e isoprenóides.

6. Por que para o estudo do metabolismo deve-se entender sobre as leis da

termodinâmica? Explique sobre a energia livre de Gibbs, entropia, entalpia
e correlacione com os processos que ocorrem nos organismos.
As transduções biológicas de energia seguem às mesmas regras físicas e
químicas que regem todos os processos naturais, por isso para o estudo da
bioquímica é importante compreender como essas leis são aplicadas ao fluxo de
energia da biosfera.
Para compreender a espontaneidade das reações químicas é necessário levar em
consideração os seguintes conceitos:
a) Energia Livre de Gibbs (G): expressa a quantidade de energia capaz de realizar
trabalho durante uma reação à temperatura e pressão constantes. Desse modo:
∆G < 0, o sistema libera energia e a reação é denominada exergônica;
∆G > 0, o sistema adquire energia e a reação é denominada endergônica;
b) Entalpia (H): é o conteúdo de calor (energia) do sistema reacional. Reflete o
número e os tipos de ligações químicas, Sendo:
∆H < 0, a reação química é exotérmica e o sistema reacional libera calor;
 ∆H > 0, a reação química é endotérmica e o sistema reacional absorve calor;
c) Entropia (S): representa quantitativamente a aleatoriedade de um sistema, quando
os produtos de uma reação são menos complexos e mais desordenados que os
reagentes, a reação ocorre com ganho de entropia

Sob as condições existentes nos sistemas biológicos, as variações de energia livre,

entalpia e entropia se relacionam quantitativamente através da equação:

∆𝐺 = ∆𝐻 − 𝑇∆𝑆
Sendo:
∆G = variação da energia livre de Gibbs (J/mol ou cal/mol)
∆H = variaçao da entalpia (J/mol ou cal/mol)
∆S = variaçao da entropia (J/mol ∙ K)
T = temperatura absoluta (K)

Por convenção, ∆S possui sinal positivo quando a entropia aumenta e ∆H possui sinal
negativo quando o sistema libera calor para o meio. Qualquer uma dessas condições,
típicas de processos energeticamente favoráveis, tendem a tornar negativo o valor de
∆G, de fato, o valor de um sistema reagente espontâneo é sempre negativo. Essa
propriedade pode ser entendida da seguinte maneira: imagine uma barragem de água no
topo de uma colina. A agua possui energia potencial suficiente para fluir somente colina
abaixo, esse fenômeno ocorre com valor negativo de ∆G. Bombear agua colina acima
possui um valor positivo de ∆G (variação de energia livre), ou seja, encher a barragem
é um processo não espontâneo (isso não é reversível de modo espontâneo). O mesmo
ocorre para reações químicas se a variação de energia livre for de 1 cal/mol em ambos
os sentidos esta reação é considerada livremente reversível e seu controle se dá pela
adição ou retirada de reagentes ou produtos e enzimas! Nas vias metabólicas reversíveis,
podem ser utilizadas para ‘ligar’ ou ‘desligar’ reações irreversíveis ou mesmo invertê-
las.

7. Qual a relação entre ∆G e a possibilidade de uma reação ocorrer

espontaneamente e de forma não espontânea?
(Vide questão anterior)

8. O que significam reações exergônicas e endergônicas? Exemplifique.

Matematicamente as definições de rações endergônicas e exergônicas foram
descritas na questão anterior, para evitar repetições vamos nos ater aos exemplos
que por sua vez serão convenientemente melhor justificados na questão seguinte.
Desse modo, são exemplos de reações endergônicas as de síntese de
macromoléculas a partir de suas unidades monoméricas e exotérmicas podem ser
as reações acopladas que liberam energia necessária para a sua ocorrência.

9. Qual a importância do acoplamento de reações para o metabolismo dos seres

vivos? Quais moléculas são necessárias neste processo? Exemplifique.
Como dito anteriormente, de acordo com a segunda lei da termodinâmica a
natureza tende ao aumento de entropia. Entretanto, para que a espontaneidade das
reações seja garantida, a variação da energia de Gibbs deve possuir sinal
negativo, o que não acontece nos sistemas celulares (os quais possuem
componentes de energia de formação positiva - moléculas menos estáveis e
altamente ordenadas). Para produção de outras moléculas, ou seja, ocorrência de
 reações endergônicas que são termodinamicamente desfavoráveis, é necessário o
acoplamento de reações que liberam energia, como acontece com a hidrólise do
fosfoanidro trifosfato de adenosina (ATP). Para que todas essas reações ocorram
são necessárias enzimas

10. Qual a diferença entre catabolismo e anabolismo? Exemplifique vias

catabólicas e vias anabólicas.
O catabolismo é a fase de degradação do metabolismo, na qual moléculas
nutrientes orgânicas sao convertidas em produtos finais menores e mais simples.
As vias catabólicas liberam energia e parte dessa energia é conservada na forma
de ATP e de transportadores de elétrons reduzidos como o NADH, NADPH e
FADH2.
O anabolismo pode ser denominado de biossíntese, precursores pequenos e
simples formam moléculas maiores e mais complexas, como por exemplo
lipídeos ou polissacarídeos. As reações anabólicas necessitam de fornecimento
de energia, geralmente na forma de potencial de transferência do grupo fosforil
do ATP e do poder redutor de NADH, NADPH e FADH2.

11. Por que se diz que o metabolismo catabólico é convergente e o anabólico

divergente?
O ponto inicial é reconhecer que as vias metabólicas de um sistema, sejam elas
catabólicas ou anabólicas, dependem de regulação entre si para que não ocorram
simultaneamente e desse modo possam desempenhar funções de forma efetiva,
ou seja, quando uma sequência está ativa a outra deve estar suprimida. Em vias
metabólicas que se conectam pelos produtos finais podem existir enzimas que
catalisam ambas reações, mas invariavelmente pelo menos uma das etapas é
catalisada por enzimas diferentes que por sua vez, constituem pontos de
regulação independentes.
Para garantir o sentido (irreversibilidade) dessas reações que compartilham
enzimas é necessário garantir que as reações sejam termodinamicamente
favoráveis e seu retorno desfavorável. A ocorrência de reações em
compartimentos separados permite a regulação independente de vias metabólicas
e facilitam a manutenção e controle dos componentes essenciais.

12. O que é uma via anfibólica? Exemplifique.

Uma via metabólica usada tanto no catabolismo quanto no anabolismo. Ex: Ciclo
de Krebs

13. Como ocorre o fluxo de elétrons no catabolismo e no anabolismo? Quais

moléculas auxiliam a transferência de elétrons? Descreva e estruture cada
uma delas quando oxidadas e quando reduzidas.
O fluxo de elétrons que deriva de reações de oxidação-redução nos sistemas
biológicos é responsável, direta ou indiretamente, por todo o trabalho realizado
por organismos vivos. Ocorre de modo complexo por meio de transportadores
em reações catalisadas por enzimas. Para os “circuitos” biológicos os compostos
reduzidos, por exemplo a glicose, servem como fonte de elétrons. A medida que
são oxidados enzimaticamente, os elétrons liberados fluem de modo espontâneo
 por uma série de intermediários transportadores de elétrons para outras espécies
químicas como o O2. Esse fluxo de elétrons é exergônico, já que o O2 tem maior
afinidade por elétrons que os intermediários transportadores de elétrons.

14. Qual a importância da regulação do metabolismo? Diga de que maneiras

isso pode ser feito. Exemplifique.
15. Explique a diferença entre regulação por modulação alostérica de regulação
por modulação covalente. Exemplifique.
16. O que significa regulação por indução enzimática? Exemplifique.
17. Diferencie uma célula animal de uma vegetal quanto ao metabolismo
intermediário.
18. Explique sobre o ciclo do ATP-ADP e a importância deste ciclo para os seres
vivos.
19. Como os organismos são classificados de acordo com a bioquímica e seu
metabolismo? Exemplifique.
Os organismos vivos podem ser divididos em dois grandes grupos de acordo com
a forma química pela qual obtém carbono do meio ambiente. Os fotoautotróficos
(plantas, algas, cianobactérias) podem usar o dióxido de carbono da atmosfera
como sua única fonte de carbono do qual produzem todas as suas biomoléculas
baseadas em carbono. Os quimiotróficos (Fungos, bactérias não
fotossintetizantes, vertebrados e invertebrados) obtém seu carbono a partir do
ambiente à sua volta na forma de moléculas orgânicas relativamente complexas.

20. Faça um esquema demonstrando como ocorre o ciclo energético nas células.
Evidencie a importância dos transportadores de elétrons, das vias
catabólicas e anabólicas, dos metabólitos intermediários e relacione com o
ciclo do ATP-ADP.

Figura 1 Relação energética entre as vias metabólicas. As vias

catabólicas liberam energia química na forma de ATP, NADH, NADPH e
FADH2. Esses transportadores de energia são usados em vias anabólicas
para converter precursores pequenos em macromoléculas celulares.