Hayne debuttò come professionista nel rugby il 19 maggio 2009 all'età di 18 anni con i Parramatta Eels della National Rugby League (NRL). Nel corso della sua carriera fu premiato come All Star e inserito nella formazione ideale della lega e a livello internazionale (Australia e Figi). Fu insignito inoltre della Dally M Medal nel 2009 e nel 2014 come giocatore della NRL dell'anno. Nel 2009 Hayne è stato nominato il miglior giocatore della lega di rugby nel mondo vincendo il Rugby League International Federation International Player of the Year.
Il 3 marzo 2015, i San Francisco 49ers annunciarono di avere fatto firmare ad Hayne un contratto triennale del valore di 1,5 milioni di dollari[1]. Il 5 settembre fu annunciato che sarebbe entrato nei 53 uomini per l'inizio della stagione regolare, completando la transizione verso il nuovo sport.[2] Nella prima gara nella NFL, contro i Minnesota Vikings, Hayne corse 4 volte per 13 yard e perse un fumble dopo essersi lasciato sfuggire il pallone sul ritorno di un punt. Dopo sole 25 yard corse in 6 partite, il 31 ottobre 2015 fu svincolato[3]. Il 2 novembre firmò nuovamente con i 49ers per fare parte della squadra di allenamento[4].