La UEFA Women's Cup 2003-2004 è stata la terza edizione del torneo europeo femminile di calcio per club UEFA Women's Cup, destinato alle formazioni vincitrici dei massimi campionati nazionali d'Europa. Il torneo è stato vinto per il secondo anno consecutivo dalle svedesi dell'Umeå IK nella doppia finale contro le tedesche del 1. FFC Francoforte[1].
Partecipano al torneo 2003-2004 un totale di 41 squadre provenienti da 40 diverse federazioni affiliate alla UEFA. L'Umeå IK ha partecipato come squadra campione in carica. Essendo l'Umeå IK anche campione di Svezia in carica, il posto per la federazione svedese è stato assegnato al Malmö FF Dam, secondo classificato in Damallsvenskan 2002.
Il torneo si compone di tre fasi: qualificazioni, fase a gironi, fase ad eliminazione diretta. Alle qualificazioni partecipano le squadre appartenenti alle dodici federazioni con il ranking UEFA più basso. Le squadre vincenti i tre gironi di qualificazione accedono alla fase a gironi, dove le 32 squadre sono state raggruppate in 8 gruppi da 4 squadre ciascuno. In ogni gruppo le squadre giocano una contro l'altra in un mini-torneo all'italiana, ospitato da una delle quattro squadre. Le otto vincitrici dei gironi acquisiscono il diritto di accedere alla fase ad eliminazione diretta. I quarti di finale e le semifinali si giocano con partite di andata e ritorno.
Rispetto all'edizione 2002-2003 le federazioni calcistiche dell'Ucraina e della Slovacchia sono tornate a iscrivere la squadra campione del rispettivo campionato nazionale. La Bosnia-Erzegovina e il Kazakistan hanno iscritto la squadra campione del proprio campionato nazionale per la prima volta.
Le partite dei tre gironi di qualificazione sono state ospitate da una delle quattro squadre, indicata in corsivo. A seguito del ritiro dalla competizione delle belghe del Lebeke-Aalst, le romene del Clujana sono state ammesse alla fase a gironi, liberando un posto nelle qualificazioni. In particolare, il Girone A rimane composto da tre squadre anziché quattro.