Biochimie: Dosage Des Protéines Du Lactosérum
Biochimie: Dosage Des Protéines Du Lactosérum
Biochimie: Dosage Des Protéines Du Lactosérum
Gamir Rania
1ère année du second cycle
Spécialité Biologie moléculaire
Groupe 01
Conclusion ..............................................................................................................12
Bibliographie ..........................................................................................................13
Annexe .....................................................................................................................14
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Matériel et méthodes :
3
2. Dosage des protéines totales par spectrophotométrie :
L’objectif et de quantifier les protéines contenues dans le lyophilisat du lactosérum extrait par
différentes méthodes colorimétriques.
Protocole :
1) Préparer 100ml du réactif de Bradford en mélangeant 5ml de méthanol, 10ml d’acide
phosphorique (H3PO4) et 50ml d’eau distillé. Filtrer la solution puis compléter avec 35ml d’eau
distillé.
2) Préparer les échantillons en mélangeant 1V de la solution de lyophilisat de lactosérum à 1mg/ml
avec 50V du réactif puis incuber pendant 10min à température ambiante.
3) Préparer la gamme étalon en mélangeant 1V de la solution de BSA (Sérum albumine bovine) à
différentes concentrations (2 mg/ml | 1,5 mg/ml | 1 mg/ml | 0,75 mg/ml | 0,5 mg/ml | 0,25 mg/ml
| 0,125 mg/ml | 0 mg/ml) avec 50V du réactif puis incuber pendant 10min à température ambiante.
4) Lire l’absorbance des échantillons ainsi que de la gamme étalon à 595nm contre un blanc
contenant le réactif seul.
4
Protocole :
1) Préparer les solutions B1, B2 et A comme suit :
• Solution A (alcaline) : 2% Na2CO3 dissout dans du NaOH à 0,1M
• Solution B1 : 5% CuSO4 dissout dans du H2O distillé
• Solution B2 : 10% de Tartrate de K+ et Na- dissout dans du H2O distillé.
2) Préparer la solution B en mélangeant 1V de la solution B1, 1V de la solution B2 et 8V d’eau
distillée.
3) Préparer le réactif de Biuret en mélangeant 1V de la solution B avec 50V de la solution A.
4) Préparer les échantillons en mélangeant 1ml de la solution de lyophilisat de lactosérum à 1mg/ml
avec 5ml du réactif de Biuret puis incuber pendant 10min à température ambiante.
5) Préparer la gamme étalon en mélangeant 1ml de la solution de BSA (Sérum albumine bovine) à
différentes concentrations (100 µg/ml | 80 µg/ml | 60 µg/ml | 40 µg/ml | 20 µg/ml | 10 µg/ml | 0
µg/ml) avec 5ml du réactif puis incuber pendant 10min à température ambiante.
6) Ajouter 500µl de Folin 1M à tous les tubes d’échantillons et de la gamme étalon puis incuber
pendant 30min à température ambiante.
7) Lire l’absorbance des échantillons ainsi que de la gamme étalon à 750nm contre un blanc
contenant le réactif seul.
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Protocole :
1) Préparer la solution protéique ayant une concentration en protéines de 2mg/ml en faisant dissoudre
le lyophilisat de lactosérum dans 9ml de PBS 50 mM.
2) Préparer la solution enzymatique de trypsine dans du PBS 50 mM.
3) Ajouter la solution enzymatique à la solution protéique à un ratio E/S de 1% (pour une solution
enzymatique ayant une concentration initiale de 4mg/ml, prendre 45µl soit 0,18mg d’enzyme pour
18mg de protéine).
4) Mettre le mélange réactionnel au bain marie à une température de 37°C pour induire la catalyse.
5) Aliquoter 1,8ml du mélange 5 fois dans des tubes séparés à différents moments d’incubation (0 min,
5 min, 10 min, 15 min, 20 min) et stopper la réaction tout de suite en ajoutant 5µl de HCl à chaque
aliquot (la baisse brusque du pH stoppe la réaction).
6) Réserver les aliquots dans de la glace jusqu’à prochaine utilisation.
Protocole :
1) Préparer les échantillons en mélangeant 500 µl de chaque aliquot d’hydrolysat avec 1ml de solution
de ninhydrine puis incuber à 84°C pendant 10 min.
2) Préparer la gamme étalon en mélangeant 500 µl de solution de leucine à différentes concentrations
(100 µg/ml, 75 µg/ml, 50 µg/ml, 25 µg/ml, 12,5 µg/ml, 0 µg/ml) avec 1ml de solution de ninhydrine
puis incuber à 84°C pendant 10 min.
3) Lire l’absorbance des échantillons ainsi que de la gamme étalon à 585nm contre un blanc contenant
de l’eau distillée.
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La manipulation nécessite :
• Une cuve à électrophorèse + un générateur électrique,
• Un gel de polyacrylamide (précoulé en cassette ou à préparer) contenant des puits pour dépôt,
• Des solutions tampons adaptées au gel.
Dans la SDS-PAGE, la séparation est réalisée en conditions dénaturantes en raison de l’ajout de SDS
qui est un détergent fort possédant une longue queue hydrocarbonée hydrophobe et une extrémité chargée
négativement. Il intéragit avec les protéines par sa portion hydrocarbonée en liant leurs régions
hydrophobes. En se liant à la protéine, le SDS empêche son repliement et lui confère une charge nette
négative.
En présence de SDS, les protéines auront donc toutes une charge apparente négative, elles migreront
donc toutes vers l’anode. Cela signifie que seul le poids moléculaire des protéines sera le facteur de leur
séparation. Les protéines ayant un petit poids moléculaire, seront moins retenues dans les pores du gel de
polyacrylamide et migreront donc plus loin que les grosses.
Protocole :
1) Préparer le gel de séparation à 12% en mélangeant :
• 1,33 ml de Tris 2M (pH 8,8)
• 2,4 ml de 40% acrylamide : bis-acrylamide (38:2)
• 100 µl de SDS 10%
• 4,27 ml d’eau distillée
• 80 µl de persulfate d’ammonium 10%
• 16 µl de TEMED
2) Préparer le gel de concentration à 5% en mélangeant :
• 0,6 ml de Tris 0,5M (pH 6,8)
• 0,4 ml de 40% acrylamide : bis-acrylamide (38:2)
• 50 µl de SDS 10%
• 4 ml d’eau distillée
• 40 µl de persulfate d’ammonium 10%
• 16 µl de TEMED
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(Le persulfate d’ammonium et le TEMED doivent être ajoutés juste avant de couler le gel car c’est eux
qui induisent la polymérisation).
3) Préparer la cuve a électrophorèse et s’assurer de son étanchéité.
4) Couler le gel de séparation entre les deux plaques en verre et ajouter de l’éthanol par-dessus pour
éliminer les bulles et égaliser la surface du gel.
5) Après solidification du gel de séparation, éliminer l’éthanol et couler le gel de concentration puis
placer le peigne pour créer les puits et laisser le gel se polymériser.
6) Préparer le tampon de migration (pH 8,3) qui contient 12g de Tris-HCL, 57,6g de Glycine et 2g de
SDS dissouts dans 2000 ml d’eau distillée.
7) Remplir le compartiment intérieur (entre la cassette de gel et la plaque de barrage) et le compartiment
principal de la cuve avec le tampon de migration sans atteindre la limite de remplissage.
8) Préparer le tampon de charge composé de Tris pH 6,8 + Glycérol 20% + SDS 4% + Bleu de
Bromophénol 0,03g + β-Mercaptoéthanol 3%.
9) Mélanger 25µl de chaque échantillon (lactosérum à 2mg/ml et hydrolysats T5, T10, T15, T20) avec
25µl du tampon de charge, les échantillons auront une couleur jaune (acide) due au HCl.
10) Neutraliser les échantillons en ajoutant 5µl de Tris à chacun, leur couleur deviendra bleue.
11) Incuber les échantillons dans un cristallisoir à 95°C pendant 5 minutes.
12) A l’aide d’une seringue Hamilton, déposer 10µl du marqueur de taille dans le premier puis du gel puis
déposer 10µl de chaque échantillon dans les puits suivants.
13) Fermer la cuve à électrophorèse avec le couvercle porte-électrodes, accorder les électrodes au
générateur, puis régler les conditions de migrations (130 V, 100 mA, durée 100 minutes) et
commencer la migration.
14) Préparer 100ml de solution de coloration composée de Bleu de Coomassie R-250 0,2% + Ethanol 30%
+ Acide acétique 5%.
15) Préparer 1000ml de solution de décoloration composée d’Ethanol 30% + Acide acétique 5% + Eau
distillée 65%.
16) Après la fin de la migration, ouvrir le couvercle, sortir le bloc support + gel d’électrophorèse.
17) Eliminer le tampon de migration (ce dernier peut être récupéré et réutilisé).
18) Démonter les différentes fixations pour récupérer délicatement la cassette de gel se trouvant entre les
deux plaques en verre.
19) Transférer le gel dans un bac rempli de la solution de coloration et laisser colorer pendant 45 minutes.
20) Après 45 minutes, transférer le gel dans un bac rempli de la solution de décoloration et laisser
décolorer jusqu’à transparisation complète du fond du gel.
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Résultats et discussion :
Seuls les résultats d’une seule méthode ont été présentés. Cependant, les méthodes de Lowry ainsi que de
Bradford devraient fournir des résultats très proches voir identiques suite au dosage.
Après lecture de l’absorbance de la gamme étalon BSA et de l’échantillon de lactosérum dilué x4, les
résultats (tableau 1 et tableau 2, voir annexe) ont été utilisés pour tracer la droite d’étalonnage suivante :
0,25
0,2
DO (750 nm)
0,15
0,1
y = 0,0023x + 0,0178
0,05 R² = 0,9695
0
0 20 40 60 80 100 120
Concentrations (µg/ml)
Le volume initial du lactosérum étant inconnu, la concentration de protéines obtenue est en fait
équivalente à 342,08 µg/mg de poudre de lyophilisat de lactosérum soit 0,342%.
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Il est donc difficile de de déduire la masse protéique contenue dans le volume initial de lactosérum
extrait. Néanmoins, les résultats obtenus semblent très loin de la marge de 7 à 10 mg/ml reportée par ALAIS
(1981). La différence des résultats doit être due à la méthode utilisée pour obtenir le lactosérum.
Après lecture de l’absorbance de la gamme étalon Tyrosine et de l’échantillon de caséine dilué x4, les
résultats (tableau 3 et tableau 4, voir annexe) ont été utilisés pour tracer la droite d’étalonnage suivante :
0,5
0,4
0,3
y = 0,003x + 0,0137
0,2
R² = 0,9947
0,1
0
0 50 100 150 200 250 300
Concentrations (µmol)
L’activité enzymatique trouvée est plus basse que le nombre inscrit sur la boite (1500 u/ml). Cette baisse
de l’activité enzymatique de la trypsine doit être du à des conditions de stockage non-adaptés.
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5. Etude qualitative des protéines par SDS-PAGE :
Le résultat de la migration du lactosérum à 2mg/ml et des aliquots d’hydrolyse T5, T10, T15, T20 par
SDS-PAGE est affiché sur la figure 3 :
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Nombre des résidus d'acides
Protéine Poids moléculaire (kDa)
aminés
β-Lactoglobuline (monomère) 18,277 162
Conclusion :
Le lactosérum a longtemps été considéré comme un sous-produit encombrant, généré en grandes
quantités par l'industrie fromagère et polluant, mais de nouvelles techniques ont permis d'en séparer les
principaux constituants afin d'en tirer des ingrédients très élaborés, comme les concentrés de protéines de
lactosérum. Ceux-ci sont incorporés dans des transformations agroalimentaires.
12
Bibliographie :
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Annexe :
Tableau 1 : Résultats de la lecture de la gamme étalon BSA au spectrophotomètre :
Standards (BSA) Blanc Std1 Std2 Std3 Std4 Std5 Std6
Concentrations (µg/ml) 0 10 20 40 60 80 100
DO (750 nm) 0 0,036 0,074 0,12 0,162 0,213 0,222
𝑦𝑦 − 0,0178
𝑥𝑥 =
0,0023
0,2145 − 0,0178
𝑥𝑥 =
0,0023
𝑥𝑥 ≃ 85,52 µ𝑔𝑔/𝑚𝑚𝑚𝑚
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Calcule de la concentration de tyrosine libérée par l’échantillon :
L’équation du graphe 2 : y = 0,003x – 0,0137
DO de l’échantillon (660nm) = 0,059
𝑦𝑦 + 0,0137
𝑥𝑥 =
0,003
0,059 + 0,0137
𝑥𝑥 =
0,003
𝑥𝑥 = 15,1 µ𝑚𝑚𝑚𝑚𝑚𝑚
15,1 µmol × 11 ml
L′ activité enzymatique = = 8,305 𝑢𝑢/𝑚𝑚𝑚𝑚
10 min × 1 ml × 2 ml
Nbr d′ unité / ml
L′ activité enzymatique =
[C d′ enzyme en mg] / ml
8,305 u / ml
L′ activité enzymatique = = 519,062 𝑢𝑢/𝑚𝑚𝑚𝑚
0,016 mg / ml
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