Devoir de Méthodologie Scientifique

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Devoir de méthodologie scientifique

Infos sur l’article

Titre : Impact et efficacité du vaccin à ARNm BNT162b2 contre les infections


par le SRAS-CoV-2 et les cas, hospitalisations et décès liés à la COVID-19 à la
suite d’une campagne de vaccination nationale en Israël

Historique de publication
Date de publication : 05 mai 2021

Identification
DoI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)00947-8

Copyright
© 2021 Elsevier Ltd. Tous droits réservés.

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Introduction

D’après plusieurs études , on montre que la transmission et l’infection du


covid19 diminue de manière significative grâce a la vaccination .
Une étude menée sur Israël et publiée dans la revue THE LANCET menée sur
les quatre premiers de la campagne de vaccination explique que l’importance
et l’efficacité du vaccin contre l’infection insinue que le vaccin réduit la
transmission.
Nous avons choisi cet article parce que les données proviennent ministère de
la santé israélien et cet article a été publié sur THE LANCET qui est une
prestigieuse revue scientifique médicale britannique et un des plus respecté au
monde .

Analyse de l’article
Dans le cadre de cet article , la grande question du domaine de recherche est la
suivante : la transmission et l’infection du covid 19 diminue t’elle grâce à la
vaccination ?
Apres analyse du document on voit très bien que la méthodologie apparait .
dans ce cas présent nous avons une structure standard (participant , collecte de
données , analyses des données ).
- Les participants : 6,5 millions de population israélienne âgées de 16 ans
et plus
- Collecte des données : les données de surveillance nationale fourni par le
ministère de la santé israélien
- Analyses des données : aux vues des résultats obtenues et les graphes
établie on voit bien que les données collectées ont été analysés.
Au travers les graphes et les pourcentages assez claire et très facile à lire nous
pouvons dire que le model statistique est très bien représenté .
Cet article a une structure bien établit et assez visible . il comporte 15 parties
ce qui rend cet article assez facile à lire et à comprendre
Résumé
Ici les auteurs nous donnent le contexte dans lequel a été réalisé cette
étude
«Suite à l’autorisation d’utilisation d’urgence du vaccin à ARNm
BNT162b2 (dénomination commune internationale tozinameran) de
Pfizer-BioNTech en Israël, le ministère de la Santé (MoH) a lancé une
campagne pour vacciner les 6,5 millions de résidents d’Israël âgés de 16
ans et plus. Nous avons estimé l’efficacité réelle de deux doses de
BNT162b2 par rapport à une gamme de résultats du SRAS-CoV-2 et pour
évaluer l’impact national sur la santé publique après l’introduction
généralisée du vaccin. »

1- Introduction
Ici ils nous parlent de manière générale du bilan de décès du covid dans le
monde et plus précisément en Israël puis le contexte de cette étude et
comment elle va être réaliser
2- Méthode
Ici les auteurs nous décrivent clairement la manière dont les études ont
été réalisées.
Dans cette étude observationnelle, ils ont analysé les données de
surveillance nationales du 24 janvier au 3 avril 2021 afin d’évaluer
l’efficacité du vaccin BNT162b2 contre divers critères de jugement du
SRAS-CoV-2. La population étudiée était composée de résidents d’Israël
(c’est-à-dire la population du recensement) âgés de 16 ans et plus. Le
début de la période d’étude correspondait à 14 jours après que les
premiers individus aient reçu leur deuxième dose de BNT162b2.
La surveillance de la COVID-19 et l’adoption de vaccins font partie de la
réponse nationale à la pandémie et sont collectées en vertu de
l’ordonnance sur la santé publique numéro 40. Seules des données
agrégées, sans identificateurs personnels, ont été utilisées dans cette
analyse.
Le ministère de la Santé surveille les infections par le SRAS-CoV-2
confirmées en laboratoire, avec la déclaration quotidienne obligatoire des
résultats de la PCR par tous les laboratoires de diagnostic. Une enquête
épidémiologique, y compris une entrevue sur les symptômes de la COVID-
19, est effectuée pour chaque infection par le SRAS-CoV-2,
habituellement dans les 2 jours suivant le diagnostic. Le ministère de la
Santé surveille également les hospitalisations associées à la COVID-19.
Des mises à jour quotidiennes sont reçues de tous les hôpitaux et reliées
à la base de données nationale à l’aide des numéros d’identification des
patients. Les hospitalisations sont classées comme sévères (si un patient a
une fréquence respiratoire au repos de >30 respirations par minute, une
saturation en oxygène de l’air ambiant de <94% ou un ratio de PaO2 à
FiO2 de <300) ou critique (en cas de ventilation mécanique, de choc ou
d’insuffisance cardiaque, hépatique ou rénale). Conformément aux
directives nationales, les prestataires de soins de santé ont attribué à la
COVID-19 toutes les hospitalisations et décès chez les personnes atteintes
d’une infection par le SARS-CoV-2 confirmée en laboratoire.

Analyse statistique des données :


Les individus ont été définis comme non vaccinés s’ils n’avaient reçu
aucune dose de BNT162b2, et comme complètement vaccinés si au moins
7 jours s’étaient écoulés depuis la réception de la deuxième dose de
BNT162b2. Les taux d’incidence ont été calculés pour les personnes non
vaccinées et complètement vaccinées âgées de 16 ans et plus pour
chaque critère de jugement du SRAS-CoV-2 après avoir exclu les
personnes ayant déjà été infectées par le SRAS-CoV-2 confirmées en
laboratoire. Les données ont été stratifiées par groupe d’âge (16-24, 25-
34, 35-44, 45-54, 55-64, 65-74, 75-84 et ≥85 ans, selon les données du
recensement de 2020), sexe et semaine civile. Dans l’analyse primaire, les
cas ont été classés comme vaccinés si la date de confirmation de
l’infection en laboratoire est survenue au moins 7 jours après la deuxième
dose de BNT162b2. Les cas ont été exclus de l’analyse s’ils n’avaient reçu
qu’une seule dose ou s’ils avaient reçu deux doses de BNT162b2 et moins
de 7 jours s’étaient écoulés depuis la deuxième dose. Les jours-personnes
pour le groupe entièrement vacciné ont été déterminés chaque jour en
multipliant la proportion de personnes qui ont été complètement
vaccinées avec deux doses de BNT162b2 par les estimations du
recensement pour chaque tranche d’âge. Les jours-personnes pour le
groupe non vacciné ont été déterminés chaque jour en soustrayant le
nombre de jours-personnes cotisés par ceux qui ont été vaccinés de la
population totale du recensement pour chaque tranche d’âge; ce
processus a été répété, additionné et agrégé pour chaque jour de la
période d’étude. Les personnes ayant déjà été infectées par le SRAS-CoV-
2 ont été exclues des estimations par jour-personne. En utilisant STATA
(version 15), un modèle de régression binomiale négative (commande
nbreg), qui est mieux adapté à la sur-dispersion de la variance que la
méthode traditionnelle de régression de Poisson,20 a été utilisé pour
calculer les ratios de taux d’incidence (TRI) avec des IC à 95 % pour
chaque critère de jugement ajusté en fonction du groupe d’âge, du sexe
et de la semaine civile. La commande d’exposition a été utilisée pour tenir
compte de la variation des jours-patients d’une strate à l’autre.21 Les
estimations de l’efficacité vaccinale ont été calculées comme (1 – TRI) ×
100. Dans les analyses de sensibilité, les estimations de l’efficacité
vaccinale ont également été calculées avec la même méthode pour les
personnes qui avaient reçu deux doses de BNT162b2 et pour lesquelles
au moins 14 jours s’étaient écoulés après la deuxième dose, ainsi que
pour celles qui avaient reçu une dose et pour lesquelles 14 à 21 jours
s’étaient écoulés après la première dose.

3- Résultat

Du 24 janvier au 3 avril 2021 (la période d’étude), il y a eu 232 268


infections par le SRAS-CoV-2. 213 919 (92,1 %) des personnes infectées
ont été interrogées et 186 109 (87,1 %) ont répondu aux questions sur la
présence ou l’absence de symptômes. Les personnes âgées de 16 ans ou
plus représentaient 154 648 (66,6%) infections, dont 31 548 (20,4%) dans
le secteur arabe, 24 280 (15,7%) dans le secteur ultra-orthodoxe et 98
220 (63,9%) dans le secteur juif général (non ultra-orthodoxe). Au cours
de la période d’étude, 7694 hospitalisations liées à la COVID-19, 4481
hospitalisations graves ou critiques liées à la COVID-19 et 1113 décès liés
à la COVID-19 sont survenus chez des personnes âgées de 16 ans ou plus.
8472 (60%) des tests PCR Leumit ont utilisé TaqPath au cours de la
période d’étude, dont 8006 avaient un SGTF, ce qui donne une
prévalence estimée à 94,5% pour la variante B.1.1.7.
Au 3 avril 2021, BNT162b2 était le seul vaccin contre la COVID-19
disponible en Israël, et plus de 10,0 millions de doses ont été
administrées à plus de 5,2 millions de personnes. Dans l’ensemble, 4 714
932 (72,1 %) des 6 538 911 personnes âgées de 16 ans ou plus et 1 015
620 (90,0 %) de 1 127 965 personnes âgées de 65 ans ou plus ont été
complètement vaccinés avec deux doses (tableau 1). Par secteur, parmi
les personnes âgées de 16 ans et plus, 669 542 (54,6 %) de 1 226 788
dans la population arabe, 228 479 (42,8 %) de 534 146 dans la population
ultra-orthodoxe et 3 816 911 (79,9 %) de 4 777 977 dans la population
juive générale ont été complètement vaccinés avec deux doses. Le suivi
médian pour les personnes ayant reçu deux doses était de 48 jours (IQR
30-60).
Les chiffres et les taux d’incidence des résultats sont indiqués pour les
personnes non vaccinées et entièrement vaccinées. Les estimations de
l’efficacité du vaccin sont en % (IC à 95 %).

4- Discussions

Dans l’analyse primaire des données de surveillance du ministère


israélien de la Santé, nous avons évalué l’efficacité de deux doses de
BNT162b2, compte tenu de l’adhésion d’Israël au calendrier de
vaccination autorisé de deux doses de 21 jours. Dans l’analyse de
sensibilité, nous avons montré une efficacité modérée du vaccin contre
tous les critères de jugement du SRAS-CoV-2 14 à 21 jours après la
première dose. Cette constatation est similaire à celle des études menées
en Israël
Cette étude a montré que deux doses de BNT162b2 étaient très efficaces,
y compris chez les personnes âgées, contre les infections à SARS-CoV-2
confirmées en laboratoire et les hospitalisations covid-19, les maladies
graves et les décès dans une étude observationnelle nationale où la
variante B.1.1.7 était la souche dominante. Des baisses marquées à
l’échelle nationale de l’incidence des infections par le SRAS-CoV-2 et des
résultats de la COVID-19 correspondaient à une augmentation de la
couverture vaccinale, et ces baisses se sont maintenues même après la
réouverture de la société.

5- Partage des données


Les données individuelles utilisées dans cette étude sont sensibles et ne
peuvent pas être partagées publiquement. Les demandes de données
doivent être adressées au ministère de la Santé d’Israël. Les données de
surveillance agrégées sont disponibles gratuitement en ligne à l’adresse
https://data.gov.il/dataset/covid-19.

6- Reference
Ici ils donnent les références utilisées pour la rédaction de l’article
1. Exemple : 1.

o Worldomètre

Pandémie de coronavirus COVID-19.


https://www.worldometers.info/coronavirus
Date d’accès : 8 avril 2021
Voir dans l’article

o Google Scholar

2. 2.

o Ministère israélien de la Santé

Base de données COVID-19 (en hébreu).


https://data.gov.il/dataset/covid-19
Date d’accès : 8 avril 2021

Conclusion
Après analyse de cet article on constate que c’est un excellent article et a
été écrit de la façon la plus claire et compréhensible possible
Cet article est tres bien structuré , les données présentées sont claires et
justes aux vues des sources de provenance marquées plus haut .
L’article renvoie à des documents de références ( bases de données covid
19 provenant du site du ministère de la santé israélien .

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