Amélioration des plantes cultivées

Origine des plantes cultivées

La diversité génétique
La domestication
L'amélioration génétique
Lignées pures et hybrides
Cartes génétiques et marqueurs
Propagation clona le et apomixie
Hybridations interspécifiques
Transgenèse
Protection des variétés et de la diversité

Les organismes génétiquement modifiés

Production de protéines d'interêt industriel ou thérapeutique
dans les plantes
Bioénergies
Bioremédiation

Principales plantes cultivées

Sur plus de 4000 plantes consommées durant le dernier millénaire, seule une
trentaine constituent l'essentiel de l'alimentation humaine actuelle (directement
ou par l'intermédiaire des animaux: maïs, colza).
-Céréales (blé, maïs, riz) 600 millions de tonnes (MT)par an. Orge (140 MT),
millet et sorgho (90 MT).
-Tubercules (pomme de terre: 300 MT, manioc 190 MT, patate douce 130 MT,
igname, taro <100 MT).
-Oléagineux (soja, colza, arachide, etc.) 270 MT moitié vient du soja ; l'arachide,
le colza et les graines de coton comptant chacun pour environ 12 %. -Plantes
sucrières betterave à sucre 230 MT la canne à sucre, cette dernière fournissant
70 % du sucre mondial.
-Tomate >110 MT. (18 % de la valeur de la production de légumes frais en
France, derrière les salades (23 % en comptant les endives) et avant les haricots
verts (6%).
-Cultures non-alimentaires: coton, hévéa (caoutchouc). Fibres de coton 19,5 MT
en 2003.

Sources: http://faostat.fao.org/
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Blé tendre : addition de 3 génomes: hexaploïde

Coton : addition de 2 génomes: tétraploïde

Caractéres sélectionnés par la domestication

Augmentation dominance apicale,

diminution du nombre de tiges
croissance plus détenninée

3
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L' insertion de retroélements chez la vigne et les agrumes

modifie la synthèse des anthocyanes

Cépages de vin blanc (chardonnay)

La diversité génétique
Chez les végétaux, il existe non seulement une abondante diversité des espèces,
sauvages ou cultivées (biodiversité), mais également de très nombreuses variantes
entre les individus au sein dune même espèce (variabilité génétique).

Cest cette diversité génétique, inter et intra-espèces, qui constitue la matière

première du généticien sélectionneur pour créer de nouvelles variétés.

Toutes ces plantes sont des ressources génétiques et représentent un patrimoine

quil est nécessaire de préserver et de mieux connaître afin de mieux lutiliser.
Ainsi, la collecte, la caractérisation et la conservation de ces ressources sont des
activités de recherche indispensables à la création des variétés de demain.

5
 L'amélioration des rendements agricoles est du aux progrès génétiques et a l'utilisation des
phytosanitaires
Evolution du rendement du blé en Frarçq 1

Diminution d e [ ù o s i n o l a t e s du colza

>50% du au progrès génétique

http://www.gnis-pedagogie.org/

Diminution de l 'acide érucique chez le colza

Dans les années soixante, une expérience menée sur des rats a révélé que la forte
consommation dacide érucique entraînait chez ces animaux des lésions cardiaques, des
retards de croissance et des accumulations anormales de graisse.
Cette étude a fortement discrédité le colza, alors que ces effets nont jamais été démontrés
chez IHomme. Les asiatiques consomment des quantités importantes dhuile de colza avec
acide érucique.

Grâce à la mobilisation de toute une filière désireuse de sauver la culture du colza en

France, une variété sans acide érucique Primor, créée à partir dune variété de colza
fourrager canadien Liho, a été inscrite au Catalogue officiel des variétés dès 1973. Depuis,
ce caractère a été rapidement introduit à lensemble des variétés par rétrocroisement.

France: 1,5 Millions Ha cultivés (3 eme mondial) 14

http://www.gnis-pedagogie.org/
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Utilisations non-alimentaires de l'huile de colza

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Propagation et commerce des

semences
s La performance maximale dans un milieu donné
conduit à l'homogénéité génétique
s Pour être commercialisables les semences
doivent satisfaire au critères DHS: Distinction,
Homogénéité, Stabilité
s 3 modes de propagation majoritaires permettent
de remplir ces critères:
s Lignées pures

s Variétés hybrides
s Propagation clonale

Quelques définitions
Une espèce regroupe les plantes ayant de fortes similitudes de formes et de
caractères et pouvant se reproduire entre-elles naturellement.

Les espèces cultivées se composent de variétés sélectionnées par lhomme, qui

sont distinctes, homogènes, stables et reproductibles
Elles peuvent être propagées sous forme de lignées pures, (obtenues par
autofécondation répétées ou croisement systématiques avec les parents, très
homozygotes) ou de clones propagés végétativement, très hétérozygotes

Les espèces sauvages, elles, sont constituées de nombreux écotypes

adaptés aux conditions environnementales auxquelles ils sont exposés
(souvent fortement hétérozygotes donc instables génétiquement).

Afin dintroduire un ou plusieurs caractères nouveaux dans une espèce, on peut

effectuer des croisements avec des espèces voisines. On obtient alors des
hybrides interspécifiques dont les descendances seront exploitées par les
techniques classiques de sélection.

9
 Shull,1909
Variétés homogènes (lignées pures, hybrides)

Lignées pures et variétés hybrides

Les plantes reproduites uniquement par autofécondation (autogames) deviennent

progressivement homozygotes pour (presque) tous les gènes. Il y a donc stabilité des
caractères au fil des générations, puisque tous les gamètes mâles et femelles sont
identiques. Ce sont des lignées pures. Pour les plantes allogames on peut créer des
lignées pures en pratiquant des rétrocroisements successifs des descendants avec leurs
parents.

Lignées pures: blé, orge, colza etc...

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http://www.gnis-pedagogie.org/

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Création de lignées pures par haplodiploidisation

culture de gamétes et doublement chromosomique

Diploidisation
à l'aide de
colchicine
(inhibe la
mitose)

L'haplodiploidisation permet d'accélérer la production de lignées homozygotes à

partir d'un croisement initial par élimination des rétrocroisements

14
 Introduction d'un caractère d'interêt agronomique entre variétés sauvage et
cultivée de la même espèce par rétrocroisements

Processus long: INRA 2003: Ariane nouvelle variété de

pomme,résistante a la tavelure bactérienne, 1er croisement en ..1949

lntrogressions a partir d'espéces sauvages chez la tomate

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16
 Propagation clonale

Espéces concernées: Pomme de terre, vigne, arbres

fruitiers, ail, fraisier, plantes ornementales (orchidées)...

Avantages: homogénéité, facilité de reproduction, fixation

de génotypes hétérozygotes, bonnes performances.
Inconvénients: Organes de multiplication végétative plus
vulnérables et difficiles à conserver que des graines,
Sensibilité à des dégénérescences virales (les virus se
maintiennent dans les tissus propagés).
Coefficient de multiplication souvent faible

Apomixie
Production de graines 2n sans fécondation, de génotype strictement identique à la
plante mère

Combine les avantages de la reproduction par la graine et de la reproduction

clonale

Existe chez quelques espèces sauvages ou cultivées comme fourrage (pissenlit,

Panicum maximum)

Comment transférer l'apomixie aux espéces cultivées?

Combinaison de trois mutations: transformation de la méiose en mitose chez

Arabidopsis->Grainesclonales!!! (Mercieretcoll, INRA2O11)
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18
 Polymorphisme des
fragments de
restriction révélé par
Southern blot

Marqueurs dans un intervalle de

6 cM du chr.4 d'Arabidopsis
(>60000 marqueurs détectables
par PCR)

Les marqueurs moléculaires peuvent être liés à des allèles d'interêt

Sélection sur le génotype et non plus sur le phénotype

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Utilisation de la carte génétique pour la Sélection Assistée par Marqueur (SAM):

Choix des lignes ayant les plus petites zones de recombinaison entourant un gène d'interêt

Interêts des marqueurs moléculaires

- Indépendants de l'environnement (économie des tests phénotypiques ex:

pathogène absent...)

- Permettent de détecter la présence d'allèles récessifs d'interêt à l'état

hétérozygote

 Permettent de suivre et combiner plusieurs allèles à différents loci

simultanément (pyramidage de gènes d'interêt)

 Economiques: pas de test phénotypique, un seul ADN -> multiples marqueurs,

pas de test en champ.

Inconvénients des marqueurs moléculaires

20
 Recombinaison possible entre marqueur et gène -> encadrement du
gène, marqueur= gène

 Accès aux technologies

21
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 19/02/14

Recherche de variabilité génétique au delà de l'espèce:

Croisements interspécifique entre Lycopersicon esculentum et
Lycoparium peruvianum par sauvetage d'embryons

Comment faciliter les croisements interspécifiques: obtention

et fusion de protoplastes

Fusion entt protoplaste

de poireau et de chou
rouge

Fusions nucléaires ou cytoplasmiques

24
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Création de colza mâles stériles par fusion de protoplastes et sauvetage d'embryons

pour la production d'hybrides Fi
La stérilité male
Ogura est due a un
défaut d'un gène
mitochondrial
Pas de production
de pollen

Croisé avec lignée fertile

Colza Ogu-INRA, 5 Millions ha (Europe, Am. du Nord) Les graines récoltées sont automatiquement F i
Les mâles stériles facilitent la production d'hybrides, mais il faut un gène restaurateur de la fertilité apporté
par le pollen, si on veut que les hybrides produisent des graines puisque c'est ce que l'on récolte

http://www.gnis-pedagogie.org/ 45

Augmenter les sources de diversité génétique

génotypes sauvages

Espèces apparentées, croisements interspécifiques, fusion de protoplastes,

sauvetage d'embryon (parfois difficiles)

Mutagenèse induite (chimiques, rayons X, culture in vitro)-> peu de succès car

peu de nouveaux variants fonctionnels, à part en horticulture (fleurs)

Toute séquence naturelle ou artificielle (transgenése)

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Source: rapport ISAAA 2012, http://www.isaaa.org/defau1t.asp

29
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30
19/02/14

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 France: 70 semenciers, ier exportateur mondial, 8700 salariés, CA 2,5 M euros.

Le COV protège les variétés obtenues par sélection a partir de la variabilité naturelle de l'espèce
Le brevet protége des constructions génétiques et donc les variétés qui les contiennent
64

http://www.gnis-pedagogie.org/
19/02/14

36
L'amélioration des plantes c'est l'art et la science de la création des variétés (A. Gallais)

http://www.hautconseildesbiotechnologies.fr/