APOBEC

Dominio C-terminal tipo APOBEC
Identificadores
Símbolo	APOBEC_C
Pfam	PF05240
InterPro	IPR007904
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Dominio N-terminal tipo APOBEC
Identificadores
Símbolo	APOBEC_N
Pfam	PF08210
InterPro	IPR013158
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Colored dice with checkered background — Ejemplo de un miembro de la familia APOBEC, APOBEC-2, una citidina desaminasa de *Homo sapiens*.^[1]

APOBEC (apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like, enzima editora de la apolipoproteína B mediante ARNm semejante al polipéptido catalítico, por sus siglas en inglés) es una familia de proteínas conservada en la evolución.

Un mecanismo para generar diversidad en las proteínas es la edición de ARN mensajero. Los miembros de esta familia son enzimas del tipo editoras de ARN. Algunos miembros de esta familia son enzimas que editan el ARN sustituyendo citosina por uracilo. El dominio N-terminal de las proteínas tipo APOBEC es el sitio catalítico, mientras que el C-terminal es un dominio pseudocatalítico. Más específicamente, el dominio catalítico es del tipo citidina desaminasa dependiente de cinc y es esencial para la desaminación de la citidina. La edición del ARN mediante APOBEC-1 requiere homodimerización y este complejo interactúa con proteínas de unión a ARN para formar el editosoma.^[2]

Miembros de la familia

Entre algunos genes humanos que codifican miembros de la familia de proteínas APOBEC se encuentran:

APOBEC1
APOBEC2
APOBEC3A
APOBEC3C
APOBEC3D ("APOBEC3E" actualmente está incluida en esta)
APOBEC3F
APOBEC3G
APOBEC3H
APOBEC4
Desaminasa de citidina inducida por activación.

Referencias

↑ Prochnow, C., Bransteitter, R., Klein, M.G., Goodman, M.F., Chen, X.S. (2007). «The APOBEC-2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID.». Nature 445 (7126): 447-451. PMID 17187054. doi:10.1038/nature05492. ; realizada mediante PyMOL.
↑ Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (abril de 2003). «Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business». Trends Genet. 19 (4): 207-16. PMID 12683974. doi:10.1016/S0168-9525(03)00054-4.

Datos: Q4653351

[Prochnow1-1] Prochnow, C., Bransteitter, R., Klein, M.G., Goodman, M.F., Chen, X.S. (2007). «The APOBEC-2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID.». Nature 445 (7126): 447-451. PMID 17187054. doi:10.1038/nature05492. ; realizada mediante PyMOL.

[pmid12683974-2] Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (abril de 2003). «Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business». Trends Genet. 19 (4): 207-16. PMID 12683974. doi:10.1016/S0168-9525(03)00054-4.

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[2]