Este documento resume la historia del descubrimiento de la naturaleza del gen y el genoma. Destaca los experimentos pioneros de Mendel que establecieron los conceptos de herencia y alelos. Luego describe el descubrimiento de los cromosomas como portadores físicos de los genes y la propuesta de la doble hélice de ADN de Watson y Crick como la estructura química del gen. Finalmente, resume la complejidad del genoma eucariota y las diferentes clases de secuencias de ADN.
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Este documento resume la historia del descubrimiento de la naturaleza del gen y el genoma. Destaca los experimentos pioneros de Mendel que establecieron los conceptos de herencia y alelos. Luego describe el descubrimiento de los cromosomas como portadores físicos de los genes y la propuesta de la doble hélice de ADN de Watson y Crick como la estructura química del gen. Finalmente, resume la complejidad del genoma eucariota y las diferentes clases de secuencias de ADN.
Este documento resume la historia del descubrimiento de la naturaleza del gen y el genoma. Destaca los experimentos pioneros de Mendel que establecieron los conceptos de herencia y alelos. Luego describe el descubrimiento de los cromosomas como portadores físicos de los genes y la propuesta de la doble hélice de ADN de Watson y Crick como la estructura química del gen. Finalmente, resume la complejidad del genoma eucariota y las diferentes clases de secuencias de ADN.
Este documento resume la historia del descubrimiento de la naturaleza del gen y el genoma. Destaca los experimentos pioneros de Mendel que establecieron los conceptos de herencia y alelos. Luego describe el descubrimiento de los cromosomas como portadores físicos de los genes y la propuesta de la doble hélice de ADN de Watson y Crick como la estructura química del gen. Finalmente, resume la complejidad del genoma eucariota y las diferentes clases de secuencias de ADN.
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NATURALEZA DEL GEN Y
DEL GENOMA
MSC. MARCO ANTONIO GUZMÁN TELLO
CONCEPTO DE GEN COMO UNIDAD DE HERENCIA
Trabajo pionero de Gregor Mendel (1865).
1. Las características de las plantas dependían de factores de herencia, que más tarde llamó genes. 2. Cada célula germinativa generada por una planta sólo tenía una copia del gen correspondiente a cada característica. 3. En cada planta los dos alelos que controlan un rasgo permanecen unidos durante toda la vida, pero se separan durante la formación de los gametos. 4. La separación de los dos alelos correspondientes de un rasgo no tiene efecto sobre la separación de los alelos de otro rasgo, es decir, que son independientes. LAS SIETE CARACTERÍSTICAS DE LOS GUISANTES DE MENDEL CARACTERÍSTICA ALELO DOMINANTE ALELO RECESIVO
ALTURA DE LA PLANTA ALTA BAJA
COLOR DE LA SEMILLA AMARILLA VERDE
FORMA DE LA SEMILLA REDONDA ANGULAR (RUGOSA)
COLOR DE LAS FLORES PÚRPURA BLANCO
POSICIÓN DE LAS FLORES A LO LARGO DEL TALLO EN LOS EXTREMOS DEL TALLO
COLOR DE LA VAINA VERDE AMARILLO
FORMA DE LA VAINA LLENA ARRUGADA
CROMOSOMAS PORTADORES FÍSICOS DE LOS GENES Walther Flemming (1880): Observó células en división: el material del núcleo se organizaba en filamentos visibles: Cromosomas. Proceso de fecundación: Espermatozoide y Ovulo. Theodore Boveri, trabajando en huevos de erizo de mar, concluye que el proceso ordenado del desarrollo normal es dependiente de una combinación particular de cromosomas, indicando que cada cromosoma posee cualidades diferentes. Edouard Van Beneden (1883): Células cuerpo gusano tenían 4 cromosomas grandes. August Weismann (1887): Propuso que la meiosis, incluía una división reducida, durante la cual el número de cromosomas disminuía a la mitad, después de la formación de gametos. CROMOSOMAS COMO PORTADORES DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA Walter Sutton (1903): Cromosomas portadores físicos de los factores genéticos de Mendel. (Saltamontes: 2n=23; observación de bivalentes). Predicción de genes ligados. CROMOSOMAS HOMÓLOGOS Esquema de Sutton de los cromosomas homólogos de saltamontes macho vinculados durante la profase meiótica para formar bivalentes. Se observan 11 pares de cromosomas homólogos (a-k) y un cromosoma X no pareado. ANÁLISIS GENÉTICO EN DROSOPHILA
Tiempo de generación de 10 días con producción de más de
1000 huevecillos. Pequeño, es posible manejar un gran número, de fácil conservación y barato. Thomas Hunt Morgan (1909): Sólo disponía de la cepa de tipo silvestre. Antes de un año obtuvo su primer mutante (ojos blancos). Morgan (1915): 85 diferentes mutantes, que pertenecían a cuatro diferentes grupos ligados. (cuatro pares de cromosomas homólogos). Drosophila melanogaster
w+: ojos normales
w+: «white», ojos blancos w: alas normales m: «miniaturas», alas reducidas ENTRECRUZAMIENTO Y RECOMBINACIÓN
Alelos de dos genes diferentes (alas cortas y cuerpo oscuro)
que estaban presentes en un cromosoma, no siempre permanecieron unidos durante la producción de gametos. Morgan (1911): Formuló una explicación para la “rotura del ligamiento”. F. A. Janssens (1909): Observó que cromosomas homólogos de los bivalentes se entrelazaban en la etapa temprana de la meiosis. Morgan: Entrecruzamiento producía Recombinantes. MUTAGÉNESIS Y CROMOSOMAS GIGANTES
H. J. Muller (1927): Moscas sometidas rayos X producían una
frecuencia 100 veces mayor de mutación. Theophilus Painter (1933): Redescubrió los cromosomas gigantes. Células glándula salival larva Drosophila, contiene cromosomas gigantes (Cromosomas Politénicos). NATURALEZA QUÍMICA DEL GEN La unidad básica del ADN es el nucleótido (azúcar, fosfato y base nitrogenada). Pirimidinas, un solo anillo (timina, citosina) y Purinas, dos anillos (guanina, adenina). Nucleótidos tienen una estructura polarizada: extremo donde se localiza el fosfato (extremo cinco prima terminal), y el otro extremo (extremo tres prima terminal). Erwin Chargaff (1950): Determinó la cantidad relativa de cada base en muestras de ADN. [A] = [T], [G] = [C], [A] + [T] ≠ [G] + [C] Watson y Crick (1953): Modelo de doble hélice (Rosalind Franklin y Maurice Wilkins). PAR DE BASES ADENINA - TIMINA
PAR DE BASES GUANINA -
CITOSINA ESTRUCTURA QUIMICA DE LOS CUATRO NUCLEÓTIDOS LA PROPUESTA DE WATSON Y CRICK 1. La molécula se integra con dos cadenas de nucleótidos. 2. Las dos cadenas, enrolladas en forma de espiral la una sobre de la otra, forman una especie de hélices dextrógiras. 3. Las dos cadenas comprenden una doble hélice que discurre en dirección opuesta, esto es, son antiparalelas. 4. El esqueleto se localiza en el exterior de la molécula con dos grupos de bases que se proyectan hacia el centro. 5. Las bases ocupan planos más o menos perpendiculares al eje longitudinal de la molécula y por lo tanto se colocan una sobre otra como platos apilados. 6. Las dos cadenas se conservan unidas mediante puentes de hidrógeno entre las bases de una cadena y sus correspondientes bases sobre la otra cadena. 7. La distancia del esqueleto del átomo de fosfato al centro del eje es de 1 nm. LA PROPUESTA DE WATSON Y CRICK 8. Una pirimidina en una cadena está siempre apareada con una purina en la cadena complementaria. 9. Los átomos de nitrógeno unidos al carbono cuatro de la citosina y al sexto de la adenina muestran de manera predominante la configuración amino (NH2) y no la forma imino (NH). De manera similar, los átomos de oxígeno unidos al carbono sexto de la guanina y el cuarto de la timina de modo predominante muestran configuración ceto (C=O) en vez de enol (C–OH). 10. Los espacios entre los giros que forman la hélice crean surcos de diferente amplitud (un surco más amplio llamado surco mayor y uno más estrecho denominado surco menor) que rodean en espiral la superficie externa de la doble hélice. 11. La doble hélice realiza una vuelta completa cada 10 residuos de nucleótido (3.4 nm) o 150 vueltas por cada millón de dáltones de masa molecular. 12. Debido a que una A en una cadena está siempre unida a una T en la otra cadena, y una G a una C, la secuencia de nucleótidos de las dos cadenas está siempre fija en relación con la otra. REPRESENTACIÓN ESQUEMÁTICA DE LA DOBLE CADENA DE ADN Naturaleza química del gen
[A] = [T], [G] = [C], [A] + [T] ≠ [G] + [C]
ESTRUCTURA DEL GENOMA Desnaturalización y Renaturalizacion (Julius Marmur, 1960): Hallazgo valioso para la biología molecular: Hibridación de los ácidos nucleicos, clonacion, amplificación. Complejidad de genoma de eucariotas: Los fragmentos se renaturalizan a velocidades distintas: fracción altamente repetida, fracción moderadamente repetida y fracción no repetida. Secuencias de DNA muy repetidas: Secuencias cortas, y se repiten una y otra vez sin interrupcción (tándem).105 copias por genoma, contribuye casi del 1 al 10% del DNA total. Tiene varias categorías: ADN satélite, minisatélite y microsatélite. ADN Satélite: Secuencias cortas (5 a pocos cientos de pb de longitud). ADN Minisatélite: Tienen un tamaño de 12 a 100 pares de bases de longitud y se encuentran en segmentos de unas 3000 repeticiones, los minisatélite suelen ser inestables y el número de copias de una secuencia en particular se incrementa o disminuye a menudo de una generación a la siguiente (polimorfismo). ESTRUCTURA DEL GENOMA ADN Microsatélite: Secuencias cortas (de 1 a 5 pb de longitud) y se hallan casi siempre en pequeños segmentos de unos 10 a 40 pares de bases de longitud. Secuencias de ADN moderadamente repetidas: Se encuentra entre el 20 al 80% del genoma total. Esta fracción incluye secuencias repetidas en cualquier parte del genoma, desde una pocas veces hasta varias docenas de miles. Secuencias Codificantes: Genes que codifican RNAr, proteínas cromosómicas del tipo histonas. Secuencias no Codificantes: La mayor parte no codifican nada. Se pueden agrupar en dos clases: SINE (elementos cortos interpuestos) o LINE (Elementos largos interpuestos). Secuencias de ADN no repetido: Genes con patrones de herencia. Genes que codifican polipéptidos (globinas, actinas, miosinas, colágenas, integrinas) pertenecen a genes de familias. Secuencias trinucleotídicas repetidas y enfermedad humana. La parte superior muestra un gen esquemático que se transcribe en un RNA mensajero con diferentes porciones (cajas de tono púrpura), incluidos una porción 5’ no codificante llamada 5´ no traducida), un exón codifinate que lleva la información para la secuencia aminoacídica de un polipéptido y una porción no codificante 3´ (la región 3´UTR). Los intrones en el DNA no están representados en el RNA maduro. La localización general de los trinucleótidos causantes de cada una de las cuatro diferentes enfermedades (Síndrome de X frágil, ataxia de Friedreich, enfermedad de huntington y distrofia miotónica) se indican por la localización de la pirámide. Se indica también el número de repeticiones causantes de los estados normal (rojo) de portador (naranja) y de enfermedad (amarillo) de cada trastorno en el gen. HUELLAS DE DNA Esta técnica se emplea de forma amplia para determinar la identidad de un individuo a partir de la muestra, el DNA se digiere mediante nucleasas de restricción y los fragmentos de DNA se separan por electroforesis en gel. La localización de fragmentos de DNA se determina con sondas marcadas con secuencias complementarias. Los fragmentos de DNA que se unen a sondas varían de longitud de una persona a otra debido a la presencia de segmentos de repetición de longitud variable en tándem (VNTR). Las huellas de DNA que se muestran en la figura, corresponden a un caso criminal. Las manchas de sangre en los pantalones y la camisa del acusado se compararon con muestras conocidas de sangre de la víctima y el acusado. El DNA de las manchas de sangre encontradas en la ropa del acusado no coincidió con sus propias manchas de sangre , pero sí con los de la víctima. Células S muertas por calor del Células vivas encapsulada Células vivas sin capsula Células (S) muertas Tipo I mezcladas con células R (S del tipo I) (R del tipo II) Por calor del tipo I Vivas del tipo II
Inyección Inyección Inyección Inyección
en el ratón en el ratón en el ratón en el ratón
El ratón muere El ratón vive El ratón vive El ratón muere
Experimento de Grittith: Transformación bacteriana