cidos Nucleicos

Generalidades
cidos Nucleicos
Almost all aspects of life are engineered
at the molecular level, and without
understanding molecules, we can only have a
very sketchy understanding of life itself
Francis Crick
El ADN es el material
gentico de las clulas
Mantenimiento de funciones celulares
Preservacin
Diversidad

Funciones
Transmisores de la informacin
gentica (Genotipo).

Transmisores de la informacin
necesaria para la sntesis de protenas
(Fenotipo).
MACROMOLCULAS DE
INFORMACIN
ACIDOS NUCLEICOS
ADN
ARN

PROTENAS
DOGMA CENTRAL DE LA
BIOLOGIA MOLECULAR
Procariotes

Genoma circular, nico
No membrana nuclear
No intrones ni exones
Eucariotes

Genoma lineal, mltiple.
Si membrana nuclear
Si intrones ni exones
Estructura de los A.N.

MONMERO
Base nitrogenada
Azcar
Grupo fosfato

UNIONES ENTRE MONMEROS

POLMERO
O H
O
O H
O H
deoxyribose
P
O
O H
O H
O H
and
phosphoric acid
N
N
N H
N
N H
2
a base
(this one is adenine)
MONMERO: NUCLETIDO
NUCLEOTIDO
STRUCTURE
nucleotide
Ribose + nitrogen base = nucleoside
NITROGEN BASES
**
*
* Thymine in DNA
**Uracil in RNA
Thymine
BASES NITROGENADAS
PENTOSAS
O H
O
O H
O H
deoxyribose
N
N
N H
N
N H
2
a base
a condensation reaction
N
O
O H
O H
N
N
N
N H
2
O H
2
Base + Azcar
P
O
O H
O H
O H
N
O
O H
O H
N
N
N
N H
2
O H
2
N
O
O
OH
N
N
N
NH
2
P
O
OH
O H
O H
2
O H
2
a condensation reaction
Base + Azcar + Fosfato
POLMERO
Precursores
ATP (adenosin trifosfato)
GTP
CTP
TTP
UTP

Crecimiento del polmero 5' 3'
Backbone of
DNA consists of pentoses
and phosphate groups.
LA DOBLE CADENA DE ADN
ds DNA / cd ADN

Caractersticas:
Complementariedad
Antiparalelismo
Configuracin helicoidal
Surcos
Formas B, A, Z
DNA STUCTURE - HELIX UNWOUND
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
G C
T A
A T
3 hydrogen
bonds link guanine and cytosine
2 hydrogen bonds link adenine and thymine
N
O
O
O
O H
OH
O
P N
N
N
NH
2
N
O
O
O
O H
O
P
NH
O
O
C H
3
N
O
O
OH
O H
O
P N
NH
N
NH
2
O
phosphates
on outside of
spiral
bases on
inside of
spiral
Two helices are held in place by hydrogen-bonding to form DNA
ds DNA / cd ADN


Complementariedad
Antiparalelismo
SURCOS
Alternate deoxyribose and
phosphate molecules (forming uprights).
SUPERENROLLAMIENTO DEL ADN
Problema:
E. coli 4.700.00 pb
Homo sapiens 7.000.000.000 pb
Si 1pb = 3.4*10
-10
m.
E. coli 1.4 mm.
Homo sapiens 2.1m.

Solucin:
Superenrrollamiento
Superenrrollamiento
Enrollamiento:
Positivo: torsin hacia la derecha
Negativo: torsin hacia la izquierda

Eucariotes: Nucleosomas
Procariotes: ADN girasas: Topoisomerasas I: desenrolla
Topoisomerasas II: enrolla -
Girasa invertasa: enrolla +

Estados: Relajado y Enrollado



Desnaturalizacin del ADN

Fusin del ADN
Tm
Proceso reversible
A-T; C-G
Clases de A.N.
ADN

ARN
tARN
rARN
mARN
Diferencias:

Azcar
Bases nitrogenadas
ss/ds
RNA
Almacenamiento y
transferencia
informacin (RNA
viral)
Transporte de
informacin
Sntesis de
protenas (mRNAs,
rRNAs, tRNAs)
Generalidades de la
gentica molecular
Gentica
Es la disciplina que se ocupa de los
mecanismos por los que la herencia pasa
de un organismo a otro y de cmo se
expresan.
Macromolculas: cidos nucleicos y
Protenas.
Gen: Unidad funcional de informacin
gnetica.

GEN
Elemento de la informacin que
codifica la secuencia de aminocidos
de una protena. El gen es una
secuencia de bases.
Vocabulario
Capacidad codificadora: contenido de
informacin de un cido nucleico.
Replicacin : Proceso de duplicacin del DNA
en el que se producen dos dobles helices.
Transcripcin: Transferencia de informacin del
DNA al RNA
Traduccin: Convertir el cdigo gentico en
protenas.
Cdigo gentico: Informacin de los cidos
nucleicos. Cada tres bases codifican un
aminocido.

DNA STUCTURE - HELIX UNWOUND
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
Phosphate
Deoxyribose
G C
T A
A T
3 hydrogen
bonds link guanine and cytosine
2 hydrogen bonds link adenine and thymine
N
O
O
O
O H
OH
O
P N
N
N
NH
2
N
O
O
O
O H
O
P
NH
O
O
C H
3
N
O
O
OH
O H
O
P N
NH
N
NH
2
O
phosphates
on outside of
spiral
bases on
inside of
spiral
Two helices are held in place by hydrogen-bonding to form DNA
SURCOS
Alternate deoxyribose and
phosphate molecules (forming uprights).
ADN-A, ADN-B y ADN-Z
Efecto de la T sobre el DNA
Puentes de hidrogeno son individualmente
dbiles.
En conjunto dan estabilidad a la cadena
A-T(2) C-G (3).
A T amb se mantiene como doble helice.
A elevadas temperaturas, los puentes de
hidrogeno se rompen y se separan las dos
cadenas del DNA: FUSION.
Elementos genticos
Elementos que contienen material gentico:

1. Capacidad para autoreplicar
2. Propiedades para codificar

Elementos genticos
Cromosomas
Plsmidos
Virus
Mitocondrias
Cloroplastos
Elementos transponibles
Cromosoma
Eucariota: mltiples. Lineares. Se puede
visualizar como un conjunto de nucleosomas.
Unido a histonas. Genes interrumpidos por
secuencia no codificadora (intrones).
DNA de copia nica: mayora de protenas.
DNA moderadamente repetitivo: codifican
algunas macromolculas importantes.
DNA altamente repetitivo: se desconoce su
funcin.
No cromosmicos
Plsmidos: la mayora son DNA
bicaterarios.
Virus: elementos genticos de DNA o
RNA que controlan su propia replicacin y
transferencia.
Mitocondrias y cloroplastos: clulas
eucariotas.
Elementos transponibles: fragmentos de
DNA que tienen la capacidad de moverse
de un lado a otro del DNA
Replicacin
Transcripcin
Traduccin
Generalidades

Replicacin del ADN
Replicacin semiconservativa del ADN
Sntesis del DNA
Cuando ocurre?
-divisin celular
-reparacin
-recombinacin
Donde ocurre?
nucleoide, ncleo, mitocondria y
cloroplastos
Quin la lleva a cabo?
-DNA polimerasas
Origen de replicacin
Punto nico donde comienza la sntesis
de DNA.
Aproximadamente 300 bases reconocidas
por protenas especificas.
Sintesis del DNA ocurre desde el fosfato
del extremo 5 al oxidrilo del extremo 3.
5 3
HELICASAS
Enzima

Se mueve a lo largo de la
cadena de DNA
separando las hebras

Utiliza energa por
hidrlisis de ATP
SSBP
Son protenas que se
unen a las hebras lder y
retrasada evitando el
anillamiento de las dos
cadenas.
Molde o templete
Nuclesidos trifosfato
ADN polimerasa
Funcin
Direccin
Grupos OH libres
Clases


Iniciador o primer
Primasa: RNA polimerasa que cataliza la formacion del iniciador de
RNA.
Escherichia coli:

DNA pol I: Remocin de iniciadores y reemplazo con ADN
DNA pol II: Reparacin
DNA pol III: Sntesis de DNA
Actividad correctora exonucleasa 3 5'


DNA Ligasas
La ligasa conecta el extremo 3 -OH de un fragmento con el 5 fosfato del siguiente.
Elongacin
Proceso en el cul ocurre la sntesis de las cadenas
nuevas de ADN, involucra fundamentalmente:

1. Sntesis de hebra Lder o Continua

2. Sntesis de hebra Retrasada o Discontinua


Elongacin
Fragmentos de Okazaki
Cada fragmento de
Okazaki comienza
con un primer y
acaba antes del
prximo fragmento.
Transcripcin
Cuando ocurre?
-constitutivamente
-por induccin
Donde ocurre?
Citoplasma, ncleo, mitocondria y
cloroplastos
Quin la lleva a cabo?
-RNA polimerasas
Cuales son los requerimientos?

1. Molde o templete
2. ATP, CTP, GTP, UTP
3. RNA polimerasa
4. Factores de transcripcin;
generales
especficos
Transcripcin
Procesamiento de ARN
splicing
Traduccin
Cul es el objetivo?
Sntesis de protenas
Cuando ocurre?
-constitutiva
-por induccin
Donde ocurre?
en ribosomas de citoplasma,
mitocondria y cloroplastos
Cuales son los requerimientos?
mARN
tARN
Ribosomas
a.a.

Traduccin
t ARN
ss

Molcula adaptadora

Doble especificidad: codn y aa.

Brazos: anticodn, aceptor (5'),
extremo aceptor (3' CCA: AA)

Presencia de bases diferentes,
metiladas.

Anticodn-codn.

Carga del tARN
Activacin de aa:
a.a. + AT P aminoacil-AMP + P-P

Transferencia de aa:
aminoacil-AMP + tARN aminoacil- tARN + AMP
aminoacil t ARN sintetasa

Especificidad de la enzima: por reconocimiento de la relacin anticodn-aa
Ribosomas
Sntesis de protenas
Dos subunidades
Procariotes, mitocondrias y cloroplastos: 30S y 50 S (70S)
Eucariotes: 40S y 60S (80S)
Subunidad: protenas + rARN
Etapas
1. Iniciacin
2. Elongacin
3. Terminacin-liberacin

Inicio
Complejo de iniciacin:

mARN
Subunidad 30S
Procariotes: Formil metionil-tARN / Eucariotes: metionil-tARN
Subunidad 50S

Reconocimiento del mARN por 30S o 40S:

Procariotes: Secuencia Shine Dalgarno: 3-9 nucleotidos antes del
codon de iniciacion.
Eucariotes: cap
TRADUCCION
Cdigo gentico
Cdigo: sistema de smbolos que
equipara informacin en un lenguaje con
informacin en otro lenguaje

GUU = Val
Caractersticas del Cdigo
Gentico
Universal
Codones:61 codifican para 20 aa, 3 de
terminacin (UAA, UAG, UGA), 1 de
iniciacin (AUG / GUG).
Es degenerado
Codones poco comunes
A partir de la siguiente secuencia de aminocidos deduzca el mARN correspondiente y
la regin coficadora en el ADN.
5-________________________________________________________________________________________ -3
TRANSCRIPCIN
5-_______________________________________________________________________________________ -3

TRADUCCIN
N - E W H P N T V A D F Y L G I S Q R K M U C - C

Glicina G
Alanina A
Valina V
Leucina L
Isoleucina I
Serina S
Treonina T
A. asprtico D
Asparagina N
A. glutmico E
Glutamina Q
Cisteina C
Metionina M
Fenilalanina F
Tirosina Y
Triptofano W
Lisina K
Arginina R
Histidina H
Prolina P
CONJUGACIN
Proceso biolgico
Transferencia de informacin gentica
Donador-Receptor
Contacto directo
1946 J. Lederberg y E. tatum
Plasmidos:

Conjugativos
Mobilizables


Plsmidos conjugativos:
F
+
: Independiente del cromosoma

Hfr : Integrado al cromosoma

F' : Independiente del cromosoma
pero con informacin cromosomal




TRANSFERENCIA DEL ADN
CONJUGATIVO
Cruces:
F
+
X F
-
Hfr X F
-
F' X F
-
F
+
X F
-
Hfr X F
-
F' X F
-
Fimbrias conjugativas