Biosíntesis de Aminoácidos

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BIOSINTESIS DE AMINOÁCIDOS

FISIOLOGIA MICROBIANA
2021
Dra. Fabiana María Saguir
AMINOÁCIDOS

• Síntesis del esqueleto carbonado (Familias)

• Incorporación del grupo amino (NH4+)


FIJACIÓN DEL NITRÓGENO
(Bacterias fijadoras de nitrógeno
Géneros claves; Azotobacter y Azomonas)
 Ventaja competitiva a las células
 Algunas formas de fijación de N2 son de gran importancia agrícola
 Bacterias y aequeas de vida libre (suelo) y simbióticas (plantas)
Complejo Enzimático: Nitrogenasa (dinitrogenasa y dinitrogenasa-reductasa)
INCORPORACIÓN DEL GRUPO AMINO

A) Vía glutamina (Sistema Glutamina sintetasa-glutamato sintasa, GS-


GOGAT)

Glutamina sintetasa
1. Glutamato + NH4+ +ATP  Glutamina + ADP + Pi + H+

Glutamato sintetasa
2. -Cetoglutarato + Glutamina + NADPH + H+  2 Glutamato + NADP +

R. -Cetoglurato + NH4++ NADPH + ATP  L-Glutamato + NADP+ +ADP + Pi

Muchas bacterias lo utilizan cuando los niveles de amonio son bajos

B) Vía glutamato (Aminación reductiva)

Glutamato Deshidrogenasa

-Cetoglutarato + NH4++ NADPH + H+  L-Glutamato + NADP+ + H2O

- Bacterias y hongos
- Ocurre cuando la concentración de amonio es elevada
Transferencia de grupo amino: Transaminación

Glutamato Oxalacetato Aspartato -cetoglutaratoA

Aspartato Glutamina Asparagina Glutamato

- Enzimas: Transaminasas o amino transferasas (dependientes de piridoxal 5´fosfato)


- Síntesis de aminoácidos comunes cuando Tranasaminasas deseables están presentes
Reducción asimilativa del nitrato

- Este proceso difiere de la reducción desasimilativa, Nitrato aceptor de electrones en


respiración anaeróbica.
- Este común en bacterias, hongos, protistas fotosintéticos y es un importante paso en el
ciclo del nitrógeno
Familias de aminoácidos (esqueleto carbonado)
En la Biosíntesis de aminoácidos participan los
Cofactores comunes:
pos
• Fosforribosil pirofosfato (grupo aminos)

• Acetil coA (grupo acilo)

• Tetrahidrofolato (fragmentos monocarbonados)

• S-adenosilmetionina (grupos metilo)

- La biosíntesis de aminoácidos es un Procesos


redox

• Pasos reductivos: NADPH dependientes

• Pasos oxidativos: NAD dependientes


Arginina Citrulina

Semialdehído Ornitina
Acetil-S-CoA

2-oxoglutarato

Glutamato Prolina

Glutamina
Familia del glutamato
1. Glutamina sintetasa, 2. γ Glutamil quinasa, 3. Glutamato γ semialdehído deshidrogenasa, 4. Pirrolina-5-
carboxilato reductasa, 5. Carboxilato reductasa, 6. N-acetilglutamato quinasa, 7. N-acetilglutamil-fosfato
reductasa, 8. N-acetil-ornitina carbamilfosfato transferasa, 9. N-acetil ornitina, 10. Ornitina carbamil transferasa,
11. Argininsuccinato sintasa, 12. Argininsuccinato carbamil fosfato
Asparagina Lisina

Oxalacetato

Aspartato

Treonina

Isoleucina
Metionina
Familia del aspartato.
1a,b. Asparagina sintetasa, 2. Aspartato quinasa, 3. Aspartato semialdheído deshidrogenasa, 4. Homoserina
deshidrogenasa, 5. Homoserina quinasa, 6. Treonina sintetasa (piridoxal fosfato), 7. Homoserina succinil
transferasa, 8. Cistationa γ liasa, 9. Cistationa  liasa (piridoxal fosfato), 10. Homocisteína metilasa (vitamina
B12 dependiente).
Vía de interés
- Ácido dipicolínico,
producido durante la
esporulación de Bacillus
sp.
- Ácido diaminopimélico
Piruvato + Aspartato y lisina, presentes en
semialdehído peptidoglican de
procariotas.

Lisina

Síntesis de Lisina vía meso-diaminopimelato


1. Sintasa dihidropicolinato, 2. Dihidropicolinato reductasa, 3. Tetrahidrodipicolinato sucinilasa, 4. Succinil
diaminopimelato, 5. Diaminpimelato epimerasa, 6. Diamino epimerasa, 7. Diamino epimerasa decarxilasa.
En levaduras y hongos,

Biosíntesis de lisina se origina a partir del -cetoglutarato.


Diferencia filogenética principal entre bacterias y hongos.
Transulfuración
Sulfuración directa

Biosíntesis de metionina en Eubacteria.


Dependiendo del microorganismos la
formación de homocisteína puede ocurrir
por transulfuración y/o sulfuración
directa (incorporación de S)
Síntesis de metionina en bacterias por transulfuración y sulfidración directa

Homoserina Homoserina Homoserina

O- Succinil-L-homoserina O-Acetilhomoserina O-Acetilhomoserina

L- Cistationina L- Cistationa

L- Homocisteína L- Homocisteína L- Homocisteína

Metionina Metionina Metionina


2-oxobutirato

Isoleucina

Piruvato

Valina

Acetil-CoA + 2- Leucina
oxoisovalerato
Biosíntesis de valina, isoleucina y leucina
Vía muy eficiente:
8 enzimas

3 aminoácidos

Se ha demostrado que esta vía de AA ramificado (BCAA biosybthetic pathway)


es vital para el crecimiento y supervivencia de bacterias patógenas como
Mycobacterium tubercolisis. Esta características posiciona a estas enzimas como
muy atractivas para el desarrollo de nuevas drogas antibacterianas
3-Fosforo-glicerato

Serina

Cisteína

Glicina

Síntesis de aminoácidos de la familia de la Serina


1. 3, Fosfoglicerato deshidrogenasa, 2. 3, Fosfoserina amino transferasa, 3. Fosfoserina fosfatasa, 4. Serina
hidroximetil transferasa, 5. enzima de clivaje de glicina, 6. Serina transcetilasa, 7. O- acetilserina sulfhidrasa
Síntesis de cisteína por transulfuración (hongos)

H2S

 Cuando metionina es la única fuente de azufre:

Metionina + ATP S-adenosilmetionina S-adenosilhomocisteína

metilo Adenosina

Homocisteína
Fosfoenolpiruvato + D-Eritrosa-4-fosfato

3-Deoxi-D arabinoheptulosonato-7-fosfato sintetasa

5- Dihidro quinato sintetasa

Síntesis de corismato

Corismato precursor común de aminoácidos aromáticos


Corismato

Tirosina Fenilalanina

Triptófano

Síntesis de aminoácidos aromáticos a partir de corismato


Prefenato

Tirosina Fenilalanina

Vía alternativa para la síntesis de fenilalanina y tirosina en Pseudomona sp.


Fosforibosil
pirofosfato Síntesis de histidina
(PRPP)

Histidina

5 pasos
4 pasos
glutamina
cetoglutarato
glutamato
glutamato

Ribonucleótido 5-aminoimidazol-4- Imidazol glicerol fosfato


carboxiamida (AICAR)

Síntesis de nucleótidos
(ATP, GTP)
MECANISMOS DE INHIBICIÓN POR PRODUCTO FINAL o RETROINHIBICIÖN
SIMPLE
- Biosíntesis de Arginina: N-acetilglutamato quinasa
- Biosíntesis de Prolina: -glutamil quinasa
- Biosíntesis de Isoleucina: treonina desaminasa

MULTIPLICIDAD DE ENIMAS (ISOENZIMAS)


-Biosíntesis de lisina, treonina y metionina en E. coli: Aspartato quinasa
-Biosíntesis de aminoácidos aromáticos: 2-ceto-3-desoxi-D-arabinoheptulosanato-7-fosfato
sintaza.

SECUENCIAL
Biosíntesis de aminoácidos aromáticos en Bacillus subtilis

CONCERTADA
Biosíntesis de treonina y lisina en Lactobacillus helveticus y Corynebacterium glutamicum
(treonina + lisina): Aspartato Kinasa

ACUMULATIVA
Regulación de la actividad Glutamina sintetasa en E. coli (Gln, carbamil fosfato, triptófano,
histidina, glucosamina 6-fosfato, AMP y CTP)

COOPERATIVA
Regulación de la actividad Glutamina sintetasa en Bacillus llicheniformes y cereus (hys y AMP)

Ejemplo de aplicación: Producción de aminoácidos en gran escala (Lisina por C.


glutamicum)
Ejemplo de
retroinhibición
por Isoenziomas

Ruta común que conduce a la síntesis de aminoácidos aromáticos: Contiene tres DAHP (3-
desoxi-D-arabino-heptulosonato-7-fosfato). Cada una de ellas es retroinhibida
específicamente por uno de los aminoácidos aromáticos.
MODIFICACIÓN DE ENZIMAS
Las bacterias se regulan por Modificación covalente, generalmente por eliminación
o adición de alguna pequeña molécula orgánica.
En las proteínas alostéricas, la unión covalente de una molécula pequeña, grupo
modificador (por ejemplo AMP) cambia su conformación afectando su actividad
catalítica.

Regulación de la enzima
Glutamina Sintetasa por
modificación covalente
Regulación de la transcripción

Represión de la síntesis de enzimas

Mecanismo de control muy común en la biosíntesis de aminoácidos, purinas y


pirimidinas

Proceso de la represión enzimática


Operón triptófano

Triptófano: reprime la síntesis de las 5 enzimas requeridas en la conversión del ácido


corísmico en triptófano.

Genes regulatorios Genes estructurales

Cuando el sistema deja de estar reprimido y comienza la transcripción se


ajuste mediante un segundo proceso de regulación: Atenuación de la
transcripción
OPERONES CON CENTROS ATENUADOR

- OPERÓN TRIPTÓFANO Péptido guía: 14 residuos, 2 Trp

-Lys – Ala – Ile - Phe - Val – Leu - Lys – Gly- Trp - Trp -Arg – Thr – Ser – Stop

- OPERÓN TREONINA Péptido guía: 21 residuos, 8 Thr y 4 Ile

Met-Lys-Arg-Ile-Ser-Thr-Thr-Ile-Thr-Thr-Thr-Ile-Thr-Ile-Thr-Thr-Gly-Asn-Gly-Ala-Gly

- OPERÓN FENILALANINA Péptido guía: 15 residuos, 7 Phe

Met-Lys-His-Ile-Pro-Phe-Phe-Phe-Ala-Phe-Phe-Phe-Thr-Phe-Pro

- OPERÓN HISTIDINA Péptido guía: 7 residuos de Hys en fila

Met-Thr-Arg-Val-Gln-Phe-Lys-His-His-His-His-His-His-His-Pro-Asp

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