Tema 2 Las Proteínas
Tema 2 Las Proteínas
Tema 2 Las Proteínas
Cadena lateral apolar (10 aa): Alamina, Valina, Leucina, Isoleucina, Prolina,
Metionina, Fenilalanina, Triptófano, Cisteína, Glicina.
Cadena lateral polar sin carga (5 aa):
Aspargina,Glutamina,Serina,Treonina,Triosina.
Cadena lateral con carga negativa (2 aa): Aspartato y Glutamato (COO-)
Cadena lateral con carga positiva (3 aa): Arguinina, Histidina y Lisina
(H+)
b)PROPIEDADES ACIDO-BASICAS:
Todos los aa presentan al menos dos grupos ionizables (grupo carboxilo y grupo
amino), y muchos de ellos pueden estar en su forma zwitterión. EL zwitterión es un
compuesto químico que es eléctricamente neutro pero que tiene carga positivas y
negativas sobre átomos diferentes.El grupo amina capta H+ por eso está cargados
positivamente y el grupo carboxilo cede H+ por eso está cargado negativamente, es
por eso que tienen cargas pero se contrarrestan y dan lugar a una molécula neutra.
El grupo Carboxilo (-COOH) de los aminoácidos tiene un pKa o pK1 entre 1,8 y 2,5
El grupo Amina (-NH3) de los aminoácidos tiene un pKb o pK2 entre 9 y 9,8
Los aminoácidos que no son ácidos ni básicos poseen dos valores de pk, el mas bajo del
grupo carboxilo y el mas alto del grupo amino, puesto que el valor de pH fisiológico es
7,4, el grupo carboxilo se encuentra desprotonado -COO- y el grupo amino protonado
NH3+
PUNTO ISOELECTRICO: (PI)
Es el valor de pH el cual el aminoácido presenta carga neta igual a 0, es el punto en el
que el aminoácido presenta menos solubilidad(precipita). Se calcula a partir de los
valores de pk de los diferentes grupos ionizables de los aminoácidos (ósea hay que
tener en cuenta para calcularlo el grupo amino NH2, el Carboxilo COOH y algunos la
cadena R) es la semisuma de los dos pk, anterior y posterior a la formación de la
especie neutra.
Pk1: Carboxilo
Pk2: Amino
PkR: cadena lateral
TRUCO: cuando tengamos tres,se suman los valores mas parecidos y se divide entre
dos.
-PROPIEDADES OPTICAS:
Todos los aminoácidos menos la glicina poseen un átomo de carbono asimétrico
denominado átomo o centro quiral. (Que se encuentra unido a cuatro sustituyentes
diferentes)
La glicina no es quiral porque necesita que el carbono Alpha este unido a cuatro grupos
diferentes.
Cuando un átomo de carbono tiene cuatro sustituyentes diferentes pueden ordenarse
de dos maneras que representen imágenes especulares que no pueden superponerse,
tienen dos formas isomerices diferentes que son idénticas en todas las propiedades
físicos-químicas excepto en la dirección que provocan el giro de plano de luz
polarizada, las dos formas que pueden adoptarse se denominan isómeros ópticos o
enantiómeros.
Estereoisómeros: misma fórmula molecular con diferente orientación espacial
Enantiómeros= isómeros ópticos: son imágenes especulares no superponibles tienen
un carbono quiral
L y D dependiendo donde está el grupo mas voluminoso, en este caso Nh2 el grupo
amino, se dan las L en las proteínas.
Son dos moléculas idénticas que metiéndole luz no son iguales
3.ENLACE PEPTÍDICO:
A) DIMENSIONES ANGULOS DIEDRICOS Y RESONANCIA DEL ENLACE PEPTIDICO:
Dos aminoácidos se unen mediante enlace covalente, tipo amida llamado enlace
peptídico.
El enlace peptídico se forma entre el grupo Carboxilo (-COOH) de un aminoácido y el
grupo Amino (-NH2) de otro aminoácido, y eliminando un a molécula de H2O.
Presentan dos extremos grupo amino N-terminal y grupo carboxilo C-terminal.
Tiene estructura resonante ya que tiene carácter planar y de doble enlace (estructura
resonante: no es el enlace ni simple ni doble, es resonante porque hay e- libres)
ESTRUCTURA PRIMARIA:
Es la secuencia lineal de aa que componen la proteína (proteína nativa), la secuencia
de aa en la proteína se da en dirección N-terminal a C-terminal, es la estructura mas
importante ya que determina el resto de estructuras, indica el número, tipo y orden de
los aa. SE MANTIENEN UNIDOS POR ENLACES PEPTIDOS COVALENTES
La estructura de los grupos R influyen en la estructura tridimensional de la proteína.
(buscamos la cadena lateral y vemos que interacción puede tener)
GLICINA:
No tiene cadena lateral, incrementa la flexibilidad de la cadena proteína (se puede
mover mejor) y permite el plegamiento de ésta sobre si misma
-CADENA LATERAL ALIFÁTICA: (hidrocarbonada):
ALANINA, VALINA, LEUCINA E ISOLEUCINA
Su cadena lateral no tiene un grupo reactivo ,su cadena lateral es hidrocarburo, No
reacciona con el H2O pero si con los grupos apolares lo que le permite estabilizar la
estructura de la proteína.
-IMINOÁCIDO CÍCLICO: PROLINA
Es un iminoácido cíclico, la cadena lateral se encuentra enlazada al carbono alfa y al
grupo amino, es el aa que mas limitaciones tiene (ese ángulo no puede girar igual
porque está atado).
-CADENA LATERAL CON GRUPOS HIDROXILO (-OH):
SERINA Y TREONINA Presentan un grupo OH lo que les permite formar puentes de H
con este grupo
-CADENA LATERAL ÁCIDA (COO-):
ÁCIDO ASPÁRTICO Y ÁCIDO GLUTÁMICO
En su cadena lateral presentan un grupo carboxilo (-COOH), que a pH fisiológico se
encuentra cargado negativamente y ayuda a que la proteína a la solubilidad.
-CADENA LATERAL BASICA:
LISINA, ARGININA E HISTADINA
Estos tres aa en condiciones de pH fisiológico tienen carga positiva y se encuentran en
la superficie de la proteína contribuyendo a su solubilidad en medio acuoso
-CADENA LATERAL AMIDA:
ASPARGINA Y GLUTAMINA
Son las amidas del ácido aspártico y glutámico porque tienen grupo amina pueden
formar enlaces de H
-CADENA LATERAL AROMÁTICA:
FENILANINA,TRIPTÓFANO Y TIROSINA
Dan menos problemas para plegar la cadena por los metilos (tienen figura de anillos).
La tirosina es importante porque puede formar puentes de hidrogeno con su grupo
hidroxilo OH de su cadena lateral
-AMINOÁCIDOS SULFURADOS:
METIONINA Y CISTEÍNA
La Cisteína es el único aa que posee un grupo tíol (SH) es capaz de formal enlaces
disulfuro, esta cualidad no la presenta la metionina que tiene un átomo de S en la
cadena lateral.
ACODAMIENTOS O GIROS:
Permite a las estructuras secundarias a alternarse, estos cambios de sentidos se logran
con los acodamientos o giros que se realizan gracias a la formación de puentes de
hidrógenos entre los componentes del enlace peptídico de un aa con el de otro aa.
Permiten a las hélices alfas y laminas betas alternarse (globulares)
Solo son hélices alfas o laminas betas (fibrosas)
ESTRUCTURA SUPERSECUNDARIA:
Es superior a la secundaria , son agregados físicos preferenciales de hélice alfa y
laminas beta y otras estructuras secundarias que se combinan de muchas formas
cuando la cadena polipeptídica se pliega sobre si misma
ESTRUCTURA TERCIARIA
Se va plegando la estructura secundaria y se enrollan mas todavía, la estructura
terciaria corresponde a la estructura tridimensional resultante del plegamiento y dan
lugar a las proteínas globulares y fibrosas (filamentosas).
La estructura terciaria se forma por ENLACES DE LA CADENA LATERAL R DE LOS
AMINOACIDOS.
-Proteínas fibrosas(filamentosas): presentan cadenas dispuestas en largas hebras u
hojas y están formadas mayoritariamente por un único tipo de estructura secundaria o
hélice alfa o lamina beta.
- Proteínas globulares: presentan las cadenas polipeptídicas plegadas en forma esférica
y presenta varios tipos de estructura secundaria (alfa y betas).
Cinco tipos de interacciones cooperan para mantener la conformación apropiada de la
cadena polipeptídica de las proteínas globulares en las condiciones fisiológicas de
temperatura, pH y concentración iónica. TODO ESTO HACE QUE LA PROTEINA TENGA
MENOS ENERGIA
-Enlaces de hidrógenos: entre las cadenas laterales R .
-Enlaces iónicos: (puentes salinos) entre las cadenas R con cargas opuesta
-Interacciones hidrofóbicas: Las cadenas laterales R hidrofóbicas repelen el entorno
acuoso y se asocia dentro de la estructura globular separadas del agua.
-Enlaces covalentes transversales: Enlaces disulfuros entre cisteínas (Cys-S-S-Cys)
-Fuerzas de Van de Waals: los átomos se atraen
Así en el plegamiento de las proteínas globulares y solubles en agua se cumplen dos
reglas
-Los residuos hidrofóbicos quedan en el interior de la proteína , lejos del agua.
-En el plegamiento de la proteína se establece el máximo numero posible de enlaces
por puentes de hidrogeno en el interior de la molécula.
5.ESTABILIDAD DE LA PROTEÍNA:
La desnaturalización es el proceso por el cual la estructura tridimensional de la
proteína (en la cual es funcional) puede perderse, NO INCLUYE LA RUPTURA DE LOS
ENLACES PEPTIDCOS ya que son covalentes.
En algunos casos el proceso de desnaturalización es reversible y en otros irreversibles.
La proteína naturalizada se llama nativa y la proteína desnaturalizada se le llama
proteína enrollada al azar o desordenada.
La energía libre media de desnaturalización es tan solo de 5-12Kcal/mol equivalente a
la ruptura de 3 o 4 enlaces de hidrogeno, por eso las proteínas se caracterizan por
tener un intervalo muy pequeño de estabilidad termodinámica. (con muy poca
energía se pueden romper las proteínas y ya no funcionarían).
AGENTES DESNATURALIZANTES: Cambio en el pH, Temperatura, Agentes
desnaturalizantes caotrópicos, Detergentes