Prueba 2. ODG

Clase 1 – 28 Abril
Aumento y reducción del genoma
Diferencias entre genomas procariotas y eucariotas

Si hacemos una comparación a nivel de numero de cromosomas por ejemplo, los
procariotas tienen un único cromosoma y plásmidos con información adicional; los
organismos eucarióticos por otra parte, en general tienen múltiples cromosomas
dentro de su genoma. (en eucariontes solo las levaduras pueden tener plásmidos)
En términos de la ploidia, los procariotas con haploides, es decir, que en un gen hay un
solo alelo, por cada gen hay solo una copia. Los eucariontes por su parte generalmente
son diploides, tienen en cada célula somática al menos dos copias de cada gen, una de
origen paterno y otra de origen materno.
Los procariontes tienen el ADN en el citoplasma y es circular, en cambio los
eucariontes tiene AND de forma lineal.
Los procariontes no tienen histonas entorno a su ADN, en cambio los eucariontes si
tienen.
En los procariontes el 90% del genoma codifica para proteínas, el ADN repetido es muy
escaso además no tienen intrones, mientras que en eucariontes es una porción
muchísimo menor, un 3% codifica para proteínas, tienen abundante ADN repetido y
pueden tener o no tener intrones.
Evolución de los genomas

Los genomas son entidades dinámicas (con el tiempo van cambiando) sujetas a
constante evolución. Los cambios ocurren fundamentalmente por:
 Mutaciones
 Duplicaciones
 Recombinaciones
 Transposiciones
 Reorganización cromosómica (deleciones, duplicaciones, etc.)
 Transferencia horizontal de genes
Si nos fijamos en distintos parámetros que caracterizan a los genomas, podemos ver
que hay una variación muy importante en la cantidad de ADN en las distintas especies,
sin embargo es independiente de la complejidad del organismo.
En general, las comparaciones de eucariotas a procariotas, eucariotas multicelulares a

unicelulares, y de vertebrados a invertebrados, muestran una correlación positiva
entre el número de genes y la complejidad morfológica, ya que se necesitan genes
adicionales con una complejidad generalmente mayor. A medida que el organismo es
mas complejo necesita producir proteínas que tengan funciones mas especializadas.
La mayoría de los genes que son exclusivos de los vertebrados están involucrados con
el sistema inmune o nervioso.
En la imagen se muestra como nosotros tenemos una variedad de genes de distinto
tipo que codifican proteínas que son variadas en funcionalidad. Y como algunas de
ellas son compartidas con otras especies y otras únicas de nosotros.
En ese sentido entonces, nuestro genoma comparte un 21% de los genes con todos los
demás organismos procariontes y eucariontes (parte roja). Hay un 32% de nuestro
genoma que es compartido con organismos solo eucariontes (verde), que tienen que
ver con genes que codifican para compartimentalizacion celular y la formación de
estructuras multicelulares.
Un 24% son genes que tienen que ver con el desarrollo únicamente de vertebrados y
animales. (amarillo). Y el 22% son compartidos únicamente con especies vertebradas.
Esto nos muestra que es el numero de genes y la cantidad de proteínas especializadas
que los organismos producen son los que determinan finalmente la complejidad de la
especie.
¿Qué factores pueden expandir un genoma?

La cantidad de cromosomas se muestra habitualmente en organismos eucarióticos
tienen dos divisiones:
Una que son haploides que nosotros encontramos asociados a los gametos. Se tiene la
mitad de los cromosomas que poseen las células somáticas.
Y las diploides que son aquellas que contienen dos copias cromosómicas de cada uno
de los cromosomas que componen un genoma.
Dependiendo de las variaciones que puede haber en el numero total de cromosomas o
en el numero específicos de copias para un cromosoma en particular, la célula y
organismos se clasifican en dos grupos principales:
Se pueden clasificar de acuerdo con el grado de Euploidia; haploides, diploides y
poliploides.
El numero de cromosomas también puede variar respecto de la cantidad de copias

para un cromosoma en especifico, en este sentido hay células que son aneuploides, es
decir que han perdido o ganado una copia en especifico de algún cromosoma. Están
los Hipodiploides en los cuales en algún cromosoma hay una copia menos y los
Hiperdiploides que tienen en al menos un cromosoma una copia adicional.
Meiosis
Dentro de los dos procesos de división células que existen, la meiosis es un evento
fundamental en el desarrollo de diferencias en la cantidad de copias cromosómicas.
En una de sus etapas; en la profase 1 ocurre el Crossing-over: Involucra rotura y unión
de moléculas de ADN.
Un segundo evento es el de la anafase, en la anafase 1 se separa los cromosomas
homólogos y en la anafase 2 se separan las dos cromatinas hermanas que componen
cada cromosoma homologo y eso permite que al cabo de estas dos etapas se generan
finalmente cuatro células distintas a partir de una célula madre inicial. (la célula madre
es diploide y da origen a 4 células haploides)
No disyunción meiótica
Particularmente en la anafase pueden haber errores que pueden conducir a la
separación desigual de las copias cromosómicas.
Puede haber estas no disyunciones o no separaciones en la meiosis 1, se ve en la
imagen como el cromosoma que no se separo da origen a una célula que en la meiosis
dos recibe mas copias cromosómicas que la otra.
Esto también puede ocurrir en la separación de las cromatidas hermanas en la anafase
2 y también genera un desbalance en el numero de copias de las células resultantes.
Entonces, la no disyunción meiótica es el mecanismo que implica la alteración en la
cantidad de copias de cromosomas que reciben los gametos.
Tipos de aneuploidías
Nulisomía (2n-2): pérdida de un par de cromosomas homólogos.
Monosomía (2n-1): es la pérdida de un sólo cromosoma.
Trisomía (2n+1): ganancia de un solo cromosoma.
Tetrasomía (2n+2): ganancia de un par de cromosomas homólogos.
En el caso de los humanos, este tipo de desbalances son importantes, pues hay varios
síndromes que están determinados por cambios en la cantidad de copias normales que
los cromosomas deberían tener, ya sea a nivel de los cromosomas sexuales (síndrome
de Turner) o cromosomas autosómicos (síndrome de Down).
Generalmente embarazos con estos síndromes sufren abortos espontaneaos en un
95%.
1. Poliploidización
La Poliploidía representa la presencia de más de dos conjuntos de cromosomas
homólogos en las celulas somaticas, que generalmente son diploides.
Poliploidización. Aumento del número de copias del conjunto completo de

cromosomas homólogos, a más de dos pares. (hace referencia al aumento del
conjunto completo de cromosomas no necesariamente de un cromosoma en
particular)
La poliploidía es un suceso bastante frecuente en la naturaleza, aunque está más
extendido dentro del reino vegetal que dentro del reino animal.
Consecuencias fenotípicas del aumento del nivel de ploidía, son muy variables.
En general:
 Aumento del tamaño celular
 Ciclos de crecimiento más largos (también mas lentos)
 Aumento del tamaño de órganos
 Menor número de células
 Menor contenido de biomasa (plantas)
 Menor fertilidad
¿Qué pasa en humanos?

Generalmente las condiciones de triploidias o tetraploidias son inviables desde el
punto de vista biologico. Estas situaciones están asociadas a abortos espontáneos.
Autopoliploidía
Corresponde al proceso que da origen a un individuo (autopoliploide) que tiene más de
dos conjuntos de cromosomas provenientes de una misma especie.
En la imagen tenemos una celula parental diploide y debido a un error en la meiosis,
una no disyunción, se generan gametos que son diploides y no no se reduce su numero
a la mitad, y debido a procesos de autofertilizacion después se genera un cigoto que es
poliploide, específicamente tetraploide pero autoplide debido a que las dos gametos
provienen del mismo individuo.
La poliploidización es un mecanismo que permite la especiación (proceso mediante el
cual una especie determinada genera otra u otras especies).
Especiación por autopoliploidía

Una especie tetraploide puede producir descendencia tetraploide fértil, ya sea por
autopolinización o por apareamiento con otros tetraploides. Estas especies
tetraploides están aisladas reproductivamente de la especie diploide original, dado
que los individuos triploides, producidos por el cruce de un tetraploide y un diploide,
son infértiles o tienen reducida fertilidad.
Ejemplo: Solanum tuberosum: Especie autotetraploide (4n=48)
Especiación por alopoliploidía. Se produce cuando el genoma poliploide se origina de

especies distintas. La especie híbrida resultante se denomina alopoliploide.
La especialización que se da y genera nuevas especies implica también procesos de
convinacion de gametos con números cromosómicos distintos y eso da lugar a lo que
se conoce como los alopoliploides.
En la imagen se tiene una célula diploide cono los cromosomas morados (3) y dos
copias de cada uno y la otra célula de otra especie distinta con cromosomas verdes.
Estas celulas producen células haploides que al combinarse van a originar un cigoto
con 5 copias de cromosomas, 2 de provenientes de una especie y 3 de la otra.
Eventualmente esa combinación cigotica puede ser inviable, sin embargo, por ejemplo
en el caso de las plantas donde hay reproducción asexual estas especies pueden
sobrevivir.
El trigo (Triticum aestivum) es una especie alohexaploide. Se cree que la combinación
hexaploide actual proviene de un evento de hibridación que ocurrió miles de años
atrás donde se genero una nueva especie que en su genoma mantenía material de las
dos especies distintas parentales, esto habría generado una especie tetraploide que
pudo reproducirse con otra diplide y entonces generar la especie actual hexaploide
que contiene tres genomas diferentes.
2. Elementos genéticos móviles

Los elementos genéticos móviles (EGM), elementos transponibles, o transposones, son
segmentos discretos de ADN que pueden trasladarse de un lugar a otro dentro del
genoma, y que tienen la capacidad de inducir mutaciones.
Están ampliamente distribuidos desde bacteriofagos hasta humanos, pasando por
bacterias, plantas y animales.
Constituyen la principal fuente de remodelación y flujo de secuencias en el genoma de
un organismo, contribuyendo a la especiación, evolución y adaptación de las especies.
Fueron descubiertos en la década del 50 por Barbara McClintock estudiando maíz.
Los EGM se dividen en dos grupos principales, de acuerdo al tipo de mecanismo de

transposición (movimiento) que involucran:
Transposones de DNA Retrotransposones

Efecto de la transposición en No aumentar su número Produce un aumento en el
el tamaño del genoma de copias, no aumenta el número de copias,
tamaño del genoma aumenta tamaño del
genoma
Tipos de enzima involucradas Transposasa Transcriptasa reversa
en transcripción Integrasa
Abundancia en el genoma Menor abundancia Mayor abundancia
humano
Secuencias típicas en los Repeticiones flaqueantes Tiene secuencias DR y en
extremos terminales DR y repeticiones DNA repetitivo.
invertidas terminales IR
Transposones de DNA (EGM Clase II)

Se transponen a partir de su escisión desde su posición original y su posterior
reinserción en otro lugar. El transposón cambia su posición en el genoma sin aumentar
su número de copias (transposición conservativa). Efecto de “Corte y pegado”.
Retrotransposones (EGM Clase I)

La transposición ocurre a través de un intermediario de RNA. El elemento original
permanece en su lugar, y una copia de él mientras se inserta en nueva posición.
Produce un aumento en el número de copias (transposición replicativa). Efecto de
“Copiado y pegado”.
Se genera una copia de toda la secuencia del transposon y esa copia es de RNA por lo
que es necesario una transcriptasa reversa para transformar esa hebra simpre en una
hebra doble de ADN que finalmente es insertado en otra sección del genoma.
Mecanismo de retrotransposición
Los elementos genéticos móviles tienen una secuencia especifica que se caracteriza
por tener en sus extremos secuencias repetidas múltiples veces. Dentro de la
secuencia del EGM hay información que le permite la movilidad, tiene codificada la
información para producir una transcriptasa reversa que es la que va a facilitar en una
segunda etapa transformar las copias de ARN en hebras dobles de DNA
complementario que se va a insertar gracias a una enzima que también se codifica por
tener su secuencia codificada en el EGM que es la Integrasa, que va a permitir la
permitir la incorporación física de la secuencia del retrotransposon en distintos puntos
del genoma.
Composición del genoma humano

44 %del genoma corresponde a EGM
Regiones del genoma humano ricas en el transposón (SINE) Alu (en verde). Existen más
1.000.000 de copias.
Si embargo a pesar de tener tantas copias de elementos genéricos móviles en nuestro
genoma, en el caso de los humanos están bloqueados, básicamente por marcas
epigenéticas que impiden que sean transcritos, por lo tanto desde el punto de vista
evolutivo no implican un factor que afecte nuestro genoma de manera constante.
¿Cómo contribuyen los elementos genéticos móviles (EGM) a la evolución del

genoma?
Como hay múltiples copias de EGMs similares esto produce:

- Facilitan la recombinación, o el cruce, entre diferentes cromosomas. (a nivel de
crossing over)
También pueden promover la deleción de porciones de genoma.
La Inserción de EGMs puede generar en:

- En una secuencia codificadora. Pueden anular la síntesis de una proteína.
- En una región reguladora. Pueden aumentar o disminuir la producción de proteínas.
- Pueden producir nuevos sitios de splicing.
Al insertarse en regiones reguladores también pueden afectar la composición de
intrones y exones.
Los EGM tambien son una fuente principal de remodelación del genoma de un
organismo, contribuyendo en la especiación, evolución y adaptación de las especies.
3. Otros
Duplicaciones génicas (principalmente en eucariontes)
La región del genoma correspondiente a un gen tiene un proceso de duplicación y ese
copiado puede tener distintos efectos dependiendo de la interaccion que pueda tener
con un organismo, los factores de selección.
Luego de la duplicación puede haber un proceso de presión de selección que favorece
la mantención de esas dos copias, por ejemplo bajo condiciones de estrés ambiental
puede que esta duplicación resulte ventajosa y bajo esa presión de selección eso va a
ser retenido a nivel genético y a lo largo del tiempo se mantienen esas copias.
Pero si bajo presiones selectivas esta duplicación no genera un beneficio los individuos
que tienen esa copia extra son eliminados, no se reproducen entre si y se favorece la
sobrevivencia de aquellos que solo tienen una copia de ese gen.
La recombinación entre fragmentos cromosómicos no homólogos, recombinación no

homóloga o “ilegítima” durante el crossing over puede producir, tanto la duplicación,
como la pérdida de fragmentos de ADN. También se le denomina “crossing over
desigual”.
Es cuando los homologos comienzan a interactuar en sectores que no son los correctos
y eso tiene por efecto el copiado de esos fragmentos o la eliminación de otros
fragmentos.
Cuando hay secuencias repetidas dentro de los brazos cromosómicos ellas pueden
interferir en la interacción normal entre las cromatidas.
Cuando la asociación de las cromatidas no hermanas involucra segmentos que no son
equivalentes, es decir, que están localizados en distintos puntos peor son idénticos o
muy parecidos a la secuencia especifica que ellos contienen pueden favorecer la
interacción física entre estas cromatidas no hermanas y producir intercambio entre
ellas, sin embargo debido a que esta unión ocurre en puntos no equivalentes el
intercambio de material de una cromatida con la otra es anómalo, una puede recibir
un fragmento extra y otra un fragmento menos.
Los genes ortólogos están separados y provienen de un evento de especiación. Los
genes parálogos están separados por un evento de duplicación (dentro de una misma
especie). Los genes homólogos se relacionan entre sí por descendencia de una
secuencia de DNA ancestral común, independientemente del mecanismo de
separación.
Son genes muy parecidos en términos de secuencia que tienen un ancestro en común
y de por medio entre una especie y otra ha habido un proceso de especiación que le
han conferido las diferencias que se observan en sus secuencias.
Los genes paralogos se forman por efecto de duplicación dentro de la misma especie,
son copias de un mismo gen que a lo largo del tiempo han sufrido cambios debido a
mutaciones básicamente, pero entre si conforman lo que se denomina genes
paralogos.
3. Otros
Transferencia horizontal de genes (principalmente en procariontes)

Hay dos mecanismos que hacen que el genoma bacteriano aumente de tamaño, por
una parte esta lo que se denomina transducción bacteriana que implica un aumento
del tamaño genómico a partir de la interacción que las bacterias tienen con los virus,
bacteriófagos principalmente.
Los virus pueden multiplicarse debido a que pueden incorporar su ADN dentro del ADN
de la célula huésped, y así esa célula comienza a producir la maquinaria y proteínas
necesarias para la multiplicación y transmisión del virus que llevara material genético
nuevo a las nuevas células bacterianas que infectara.
La otra manera, es la conjugación bacteriana, donde ocurre un intercambio de
plásmidos, gracias a la interacción física entre dos bacterias.
Ambos mecanismos hacen que la cantidad total de ADN que posee la bacteria
aumente y que los genomas bacterianos también se expandan.
¿Qué factores pueden reducir un genoma?
La recombinación entre fragmentos cromosómicos no homólogos (recombinación no

homóloga o “ilegítima”) durante el crossing over puede producir, tanto la duplicación,
como la pérdida de fragmentos de ADN. También se le denomina “crossing over
desigual”. Este es un mecanismo que también puede explicar porque algunas copias
génicas se pierden.
Otro método de perdida del material genético son los elementos genéticos móviles,
que pueden producir alteraciones en la interacción de fracciones o segmentos dentro
de un mismo cromosoma. Las secuencias repetidas en sus extremos también pueden
interferir en la interacción normal, ya sea entre las cromatidas hermanas o dentro de
una misma cromatida.
Deleciones cromosómicas
Deleción
Alteración estructural en la que se observa la pérdida de una porción del cromosoma.
Por regla general, la pérdida de más de un 2% del genoma (n) tiene efectos letales.
Cromosoma en anillo
Anormalidad estructural provocada por un rompimiento del extremo de ambos brazos
de un cromosoma y su posterior unión. Asociada a pérdida de telómeros o exposición
a radiación.
Síndrome “cri du chat”
Causado por la deleción del una porción (brazo corto) del cromosoma 5 (5p-).
• “Llanto de gato” en los recién nacidos (desarrollo incompleto de la laringe)
• Microcefalia
• Discapacidad intelectual severa
• Tono muscular débil y bajo peso al nacer • Retraso general del desarrollo
•Frecuencia : 1/50.000 de niños recién nacidos
Reducción de genomas en bacterias endosimbiontes

Esto se puede ver cuando bacterias que antes eran libres e independientes pasan a
vivir de manera simbionte.
En la figura se muestran los tamaños genómicos de distintas bacterias.
En general el genoma de las especies simbiontes es mas pequeño de aquellas que
viven libres.
Genes transcripción
Genes biosíntesis de aminoácidos y vitaminas
Genes de rRNA
Otros genes
Espacios vacíos: Regiones no codificante
El proceso que llevó a que bacterias libres evolucionaran a bacterias endosimbiontes
implicó una reducción en el tamaño del genoma, producto del efecto de mutaciones y
deriva genética, propiciado por tamaños poblacionales reducidos y una reproducción
asexual. Los genomas más pequeños conservan genes de proteínas esenciales (y han
perdido aquellos no esenciales), incluyendo los que contribuyen a la interacción
mutualista con el huésped.
En la imagen se vuelve a mostrar lo mismo, las bacterias que viven libres como
Escherichia coli, tienen tamaños genómicos proporcionalmente mas grandes que
bacterias que son 100% simbiontes, que viven en los sistemas de algún organismo.
¿Cuáles son sus efectos evolutivos?

Ganancia y pérdida de DNA en 10 linajes de mamíferos (en los últimos 100 millones de
años)
Ganancia y pérdida de DNA en 10 linajes de mamíferos (en los últimos 100 millones
de años)
“Efecto acordeón” (la pérdida de DNA compensa la expansión por efecto de los
elementos genéticos móviles (TEs).
Esto demuestra y se puede ver en la imagen que la constitución actual de los genomas
en términos de su tamaño es el efecto acumulativo de procesos de perdida de material
genético y de ganancia.
En el caso de los humos podemos ver que somos de las especies que han perdido una
menor cantidad de ADN, en cambio los murciélagos son los que han perdido una
mayor cantidad de DNA.
En esta figura se demuestra como a lo largo de la vida evolutiva de los mamíferos ha
habido una suerte de compensación entre las ganancias de ADN por medio de la
multiplicación de retrotransposones y los eventos de perdida de material genético.
Factores que modifican las frecuencias alélicas en las poblaciones
Las frecuencias alélicas y en el fondo la estructura genética de una población esta
sujeta a efecto de múltiples factores, por una parte, las mutaciones, la deriva génica, la
selección, y los cruzamientos no aleatorios son elementos que operan de manera
importante sobre la frecuencia génica.
El tamaño poblacional efectivo y mutaciones (cuantificado a nivel de Neu) y el tamaño
del genoma están correlacionados.
- A mayor Neu menor es el tamaño del genoma
Tamaños genómicos relativamente mas grandes propios de especies que
evolutivamente son mas complejos tienden a tener tamaños poblacionales
relativamente mas pequeños y tasas de mutaciones también mas bajas.
Clase 2 – 30 Abril
Aumento y reducción del genoma.

Eventos de corto plazo con implicancias para la salud humana
Evolución de los genomas

Los genomas son entidades dinámicas, siempre están sujetas a constante evolución.
Los cambios ocurren fundamentalmente por:
 Mutaciones
 Duplicaciones
 Recombinaciones
 Transposiciones
 Reorganización cromosómica
 Transferencia horizontal de genes
Replicación eucariótica
Este proceso, a pesar de que tiene sistemas de corrección de errores, que van de la
mano con las enzimas que participan en el proceso de copiado ya sea la DNA
polimerasa alfa o epsilon (en humanos) existen errores que no pueden corregirse.
Mutaciones producidas durante la replicación
Deslizamiento (slippage) de la replicación
Se produce por el desplazamiento de la hebra molde respecto de la nueva hebra
sintetizada, habitualmente ocurre en zonas de ADN repetitivo.
Dado el alto numero de repeticiones se producen a veces interacciones indebidas
entre las dos hebras que están participando, la molde y la nueva y eso hace que en
ciertas ocasiones se pueda producir una adición o una eliminación de nucleótidos.
Generación de inserciones y deleciones (Indels) dependiendo de que hebra es la

afectada:
El primer escenario es cuando ocurre un plegamiento del ADN en la hebra nueva, y en
este caso la hebra va a tener un nucleótido adicional a la que tenia la hebra molde
antigua.
Un segundo escenario es cuando el plegamiento ocurre en la hebra molde y en ese
sentido la hebra nueva que se sintetiza va a tener un nucleótido menos que la hebra
original.
Mutaciones de repetición de tripletes

En este caso se pueden adicionar copias extras de tripletes específicos o de varias
copias de esos tripletes simultáneamente.
Hay un pliegue anormal de la hebra nueva o de la hebra molde producto de la
interacción anómala entre los nucleótidos ya que en esa zona son muy parecidos entre
si y eso genera lo que se conoce como trinucleotidos expandidos.
Enfermedad de Huntington
Mutación del gen de la huntingtina (HTT).
▪ Cromosoma 4 (4p16)
▪ Proteína asociada a neuronas. Participaría en señalización y protección contra
apoptosis.
▪ Normal: 10-35 repeticiones CAG (glutamina).
▪ Mutación: >35 repeticiones CAG.
En la imagen se ve como en la parte de arriba el gen tiene una extensión de 35

repeticiones CAG y eso determina una cantidad especifica de aminoácidos y eso esta
asociado a una conformación de neuronas totalmente normal en términos funcionales.
Sin embargo, cuando ocurre este deslizamiento de la replicación y se expande la
cantidad normal de las repeticiones CAG, eso hace que se incremente la cantidad de
glutaminas, aminoácidos que se formaran, su forma, estructura y función y eso
finalmente esta asociado a la degeneración progresiva de las neuronas.
Enfermedad de Huntington (EH)
Árbol genealógico de familia con EH y southern blot para analizar la expansión de las
repeticiones CAG en el gen HTT.
Se ve en la imagen que el padre muerto fue afectado por la enfermedad (cuadrado
azul) donde en el gen CAG tenia 37 repeticiones, y tenemos una madre sana (circulo
blanco) en cuto gen habían 25 repeticiones CAG.
De esa pareja hay cinco hijos, tres de los cuales están afectados; una mujer con 70
repeticiones, y dos hombres que tienen 55 y 103 respectivamente, y se da el caso de
un hombre que esta sano pero que podría llegar a desarrollar la enfermedad pues
tiene 42 repeticiones, que esta por sobre el numero determinado como limite para lo
normal de repeticiones para esa secuencia.
En el análisis inferior, se ve en las figuras sombreadas que todos los individuos tienen
el alelo materno con 25 repeticiones, sin embargo los demás son variables y es ahí
donde radica la variación entre el numero de repeticiones de ACG.
Las aneuploidías ocurren por la no disyunción cromosómica.

Las aneuploidías son alteraciones numéricas en la cantidad de cromosomas que se
observan en un individuo y provienen de dos procesos de no disyunción que pueden
ocurrir durante la meiosis que darán origen a la formación de gametos con mas o
menos cromosomas de los que debieran.
En la figura se tiene una célula inicial diploide a la cual podría ocurrir una no disyunción
a nivel de la anafase 2 y como resultado una célula podría llevarse las dos copias del
par cromosómico y otra célula no recibir la copia correspondiente. Esto lleva a que en
la meiosis II se produzcan 4 células, dos de ellas las cuales van a llevar una copia extra
del cromosoma involucrado y otras dos células que no van a llevar ninguno.
Tipos de aneuploidías
Nulisomía (2n-2): pérdida de un
par de cromosomas homólogos
Monosomía (2n-1): es la pérdida
de un sólo cromosoma.
Trisomía (2n+1): ganancia de un
solo cromosoma.
Tetrasomía (2n+2): ganancia de
un par de cromosomas
homólogos.
Hay una serie de síndromes que están asociados a desbalances o aneuploidías y

podemos ver algunos síndromes asociados a afecciones en cromosomas autosómicos,
y sexuales.
Proporción de pérdidas (abortos espontáneos) debidas a aneuploidías más comunes.
Se puede ver que las tasas de abortos son muy altas, alrededor de 95%.
Síndrome de Down (Trisomía del par 21)

Causado por presencia de 3 copias del cromosoma 21, derivada de una no disyunción
en la meiosis I. ( en la anafase 1 los miembros de un par homologo no se separan y eso
produce un desbalance en los gametos)
• Puede estar asociado a problemas físicos y discapacidades intelectuales
• Enfermedades cardíacas
• Problemas de demencia
• Problemas de audición y vista
• Cerca de la mitad de los adultos desarrollan la enfermedad de Alzheimer
• Frecuencia : 1/700 de recién nacidos
Se ve en la tabla que existe una relación directa entre la enfermedad y la edad en que
la madre tiene hijos.
Las frecuencias de incidencia de la enfermedad son menores a edades tempranas de
embarazo mientras que a medida que aumenta la edad de las madres también
aumenta la incidencia de la enfermedad.
Síndrome de Turner (Monosomía X; X0)
Afecta a mujeres. Causado por la falta de un cromosoma X (o presencia de un
cromosoma X incompleto).
• Baja estatura
• Pérdida de función ovárica (la mayoría de quienes lo padecen son infértiles). Además
no desarrollan caracteres sexuales secundarios.
• Cuello corto con pliegues laterales de piel
• Orejas bajas
• Manos y pies hinchados
• Posibles problemas de salud (ej. hipertensión arterial)
• Inteligencia normal • Frecuencia : 1/5000
Síndrome XYY (47, XYY; síndrome de Jacob)

Causado por presencia de 2 copias del cromosoma Y.
• Hombres más altos que el promedio
• No causa características físicas inusuales
• Desarrollo sexual y fertilidad normal
• Mayor riesgo de problemas de aprendizaje y un retraso en el desarrollo de las
habilidades motoras
• Eventuales temblores en las manos u otros movimientos involuntarios
• Frecuencia : 1/10000 de niños recién nacidos
Deleciones, duplicaciones, cromosomas anillo e isocromosomas
Isocromosoma
Uno de los brazos de un cromosoma particular es duplicado debido a una división
transversal (y no longitudinal) de centrómero. Los dos brazos de un isocromosoma son
iguales en largo y contenido de genes.
Se genera un cromosoma de dos brazos pero que en fondo representan a dos copias
de un mismo cromosoma, producto de que hay una separación de las cromatidas
anómalas.
15 % casos Síndrome de Turner son explicados por presencia de isocromosomas mas
que por la ausencia de un cromosoma X en particular.
Cromosoma anillo
Anormalidad estructural provocada por un rompimiento del extremo de ambos brazos
de un cromosoma y su posterior unión. Esto ocurre nuevamente a nivel de la meiosis
en el crossing over específicamente.
Síndrome del cromosoma 14 en anillo.
Esto incluye perdida de información genética.
Afección rara.
Pueden presentar convulsiones y discapacidad intelectual, algún grado de discapacidad
intelectual.
Retrasos en el desarrollo.
Microcefalia.
En el grafico se muestra la incidencia que tienen las distintas condiciones que hemos
visto en recién nacidos, afortunadamente el porcentaje de recién nacidos que tiene
aneuploidías o anormalidades estructurales es relativamente bajo.
El total de anormalidades cromosómicas (numéricas o estructurales) que presentan los
recién nacidos es de un 0.75.
(Clase 3) 05/05 Duplicación génica y pseudogenes
Evolución de los genomas
Los genomas son entidades dinámicas sujetas a constante evolución. Los cambios
ocurren fundamentalmente por:
 Mutaciones  Transposiciones
 Duplicaciones  Reorganización cromosómica
 Recombinaciones  Transferencia horizontal de
genes
Los genomas son entidades dinámicas en cuanto a su estructura, por lo tanto a lo largo
de la evolución de las especies ellos cambian sustancialmente. Detrás de la
diversificación de las especies ha habido cambios importantes que van de la mano con
mecanismo como mutaciones, recombinaciones, etc. Esta clase se centrará en las
duplicaciones.
Duplicaciones
1) Duplicación del genoma completo: A lo largo del tiempo ocurren procesos de

duplicación genómica mayores, completo, que involucran un copiado de todo el
conjunto de cromosoma del genoma de una especie particular tiene. Procesos de
poliploidización llevan a un copiado general de todo el genoma a diferentes copias
dependiendo de las especies involucradas de los organismos, pero eso produce al nivel
de estructura de un genoma la aparición de copias cromosómicas adicionales, una
expansión del genoma total, y si se analiza la composición de cada cromosoma se
tendrá también a través de los duplicación genómica también la aparición de múltiples
copias de un mismo gen.
También hay duplicaciones a escala menor:
2) Duplicación cromosómica: Una alteración (aberración) estructural que implica la
generación de una copia adicional de una porción de un cromosoma.
-por ej. Como producto de alteraciones durante los procesos de interacción
cromosómica de meiosis I, hay en algunos casos interacciones físicas entre las
cromáticas no hermanas anómalas pudiendo producir duplicaciones importantes de un
cromosoma. Implicando una adición de todo el conjunto de genes localizados en ese
fragmentos duplicados.
3) Duplicación génica: Un evento que produce la repetición (habitualmente en
tándem) de un gen durante la replicación. (En tándem es que los genes se copian de
manera localizada y forma un grupo de genes estructuralmente similares entre sí,
localizados también en secciones cromosómicas específicas).
- También puede haber eventos que genera una repetición de un gen específico
dentro del mismo cromosoma o eventualmente en cromosomas adyacentes, por lo
tanto también se puede observar una duplicación génica.
La duplicación de genes ha desempeñado un papel importante en el desarrollo de vida

en la tierra, proporcionando material para la evolución de nuevas funciones genéticas.
Un gen duplicado entrega una posibilidad mayor y menos restringida para que la
selección natural de forma de una nueva función biológica. Como nuevas proteínas
por ej, que adquieran una estructura distinta haciendo que varié un tejido en un
organismo multicelular, lo que a su vez impacta en el desarrollo de nuevas funciones o
estructuras. Esto a lo largo del tiempo va a permitir el paso de la diversificación de las
especies, apareciendo variación biológica amplia sobre la cual la selección natural
generara distintos efecto, permitiendo la generación de especies adaptadas a ciertas
condiciones porque desempeñan procesos fisiológicos o funciones que otras no tienen
bajo esas condiciones. Bajo esa perspectiva, la historia de la vida se ha sostenido en
gran parte en estos procesos de duplicación génica y el desarrollo de nuevas funciones
a partir de esos nuevos genes.
Mecanismo de duplicación génica
1. Durante la meiosis
 Crossing over desigual
 Intercambio desigual de cromátidas hermanas
2. Recombinación desigual durante la replicación
3. Retroposición (= retroduplicación)
4. Poliploidización
*Crossing over desigual, intercambio desigual de cromáticas hermanas y

recombinación desigual durante la replicación producen repeticiones de genes en
tándem. (Generan duplicaciones en un espacio reducido donde encontramos una
repetición tras de otra – en tándem)
1. Durante la meiosis
A) Crossing over desigual
Un cromosoma gana un fragmento y el otro cromosoma involucrado en el crossing
pierda un fragmento. A escala local, este crossing over desigual cuando produce estos
desbalances en la cantidad de material genético en cada cromosoma, también conlleva
la duplicación de los genes que están en ese segmento que se intercambio
erróneamente, o su deleción.
Estas interacciones anómalas están dadas habitualmente por la presencia de ADN
repetitivo, ya sea el que esta de manera natural en el ADN o el que está asociado a
fracciones de los elementos genéticos móviles (EGM).
Estos EGM se caracterizan por tener en sus extremos repeticiones extensas (en
algunos casos) de nucleótidos que son idénticos entre porciones distintas dentro de un
mismo cromosoma, y eso considerado a una escala de dos cromosoma en el apareo de
los cromosomas homólogos puede alterar la interacción. Son puntos idénticos en
cuanto a secuencia pero no equivalente en cuanto a posiciones.
B) Intercambio desigual de cromátidas hermanas

Durante la meiosis, la interacción anómala que se observa entre los pares de
cromosomas homólogos se puede dar entre las cromáticas de un mismo cromosoma.
La causa de eso es la presencia de zonas dentro del genoma donde hay DNA repetitivo,
eso produce una complementariedad entre las secuencias de DNA repetitivo que son
idénticas entre las dos cromáticas del mismo cromosoma pero localizadas en puntos
no equivalentes, haciendo que producto de la interacción ocurra un movimiento de
ADN de una cromátida a otra, y eso produce un copiado de estos genes. (1er caso)
Pero también la duplicación puede ocurrir en otros procesos del ciclo celular, como la
replicación. Acá producto de la presencia de zonas de DNA repetitivo en las hebras de
DNA, cuando se forma la horquilla de replicación, a medida que la batería enzimática
de la DNA polimerasa de proteínas asociadas van abriendo y leyendo puede haber una
interacción entre ellas producto de estas zonas repetitiva que produce un movimiento
anómalo entre fragmentos de estas hebras de DNA, posicionando en una zona dos
copias de un mismo gen en una única hebra y en la otra, producto del movimiento se
pierde (deleción) el representante del gen en esa ubicación.
3. Retroposición (o retroduplicación)
Se produce por presencia de una transcriptasa reversa de virus.

Retrogen:
- Falta de intrones y secuencias reguladoras de un gen.
- Presencia de una secuencia poli-A.
- Difiere del gen original respecto de los intrones.
- No está vinculado físicamente con el gen original, porque la inserción del cDNA
es aleatoria dentro del genoma.
- Un 1% del genoma humano está retroduplicado.
Este tipo de proceso en una escala de tiempo extensa puede ocurrir frecuentemente,
en una escala de millones de años.
Se produce a partir de la inserción de una copia de RNA mensajero en el ADN de ese
mismo individuo, mediado por transcripción reversa. Este proceso es posible porque
dentro de una célula existe transcriptasa reversa, que es la enzima que permite
transformar un mRNA de hebra simple en un DNA de doble hebra. Ese transcriptasa
reversa es parte de los mecanismos de los virus que utilizan para incorporar su
material genético en el DNA de la célula huésped (virus de RNA tiene esta
transcriptasa).
Cuando existe transcriptasa reversa proveniente por una infección viral, esa
transcriptasa por accidente o azar transforma un mRNA especifico en una estructura
de doble hebra, que se inserta en un fragmento del ADN. Esa copia es lo que
constituye un retrogen, que tiene una secuencia nucleotídica idéntica es idéntica a la
del RNA que se retroduplicó, conservando una zona de poli-A (característico de los
mRNA).
Destino de los genes duplicados
La duplicación de genes, seguida por la divergencia de las copias génicas, debido a la

acumulación de mutaciones, es una fuente de nuevos genes en los genomas.
Ocurrencia de mutaciones:
Una cosa es que se produzca una copia y otra cosa es que esa nueva copia cambie para
que se diferencie de la copia original y eventualmente de origen a una proteína
distinta.
Solo para recordar, las mutaciones son de dos tipos principales: cromosómicas y
puntuales.
Las puntuales involucran cambios en nucleótidos específicos o en secuencia de ADN
acotadas.
a) Sustitución de base (altera un codón)
b) Inserción de base Alteran el marco de lectura y pueden
c) Deleción de base cambiar varios codones.
Clasificación según el efecto en la traducción

Las mutaciones pueden clasificarse en dos grandes grupos: sinónimas y no sinónimas.
1) No sinónimas:
a) Mutaciones de sentido erróneo: el nuevo codón codifica para un aminoácido
distinto.
b) Mutaciones sin sentido: el nuevo codón es un codón de stop o término; hay
una terminación prematura de la translación.
2) Sinónima: mutación silenciosa (no hay cambio en la secuencia aminoacídica).
No funcionalización (desfuncionalización o pseudogenización de genes)
En general, no es ventajoso para las especies llevar dos genes idénticos. La duplicación
de un gen produce redundancia funcional. En ese caso ocurre una desfuncionalización.
La desfuncionalización es el proceso por el cual un gen funcional es convertido en un
pseudogen. Generalmente ocurre en los primeros millones de años después de la
duplicación si el gen duplicado no está bajo ninguna selección.
 Pseudogen: Una secuencia de DNA que no es funcional, debido a una o más
mutaciones, pero que tiene una contraparte funcional (versión funcional, que
tiene la región promotora) en el mismo organismo.
Tipos de pseudogenes:
1) Pseudogen convencional (clásico): Un gen duplicado que se ha inactivado

(desfuncionalizado) debido a la acumulación de mutaciones. (se impide que sea
transcrito, es incapaz de producir un mRNA ).
2) Pseudogen procesado: Un pseudogen que resulta de la integración de un

retrogen en el genoma, o de un gen original que ha acumulado mutaciones
hasta volverse no funcional. (Los retrogenes proviene de un mRNA por lo tanto
no tiene región promotora, solo codificadora)
Pseudogenización y pérdida de genes

Las dos fuerzas principales de la pseudogenización son las mutaciones y
deleciones. Los cambios ocurren por mutaciones en la región promotora,
mutaciones sin sentido o de sentido erróneo en la región codificadora, o la
pérdida de los sitios de splicing.
Las mutaciones que alteran la estructura y la función de uno de los dos genes
duplicados no son perjudiciales y no se eliminan por selección. Poco a poco, la
copia del gen acumula mutaciones hasta que es eliminado del genoma o se
diferencia tanto del gen que no es identificable.
Ejemplos de familias génicas humanas
Se estima que el genoma humano posee alrededor de 20.000 pseudogenes.

Y forman parte algunas familias génicas que son importantes para nuestra biología.
Por ejemplo, los genes que codifican para el alfa-globina y la beta-globina, que son dos
proteínas fundamentales para la estructuración de la hemoglobina (proteína principal
de los glóbulos rojos). Los genes que la codifican constituyen una familia génica que
son un grupo de genes que provienen de un gen ancestral común, y en términos
estructurales también tiene secuencias similares, produciendo proteínas levemente
distintas entre sí.
Dentro del cluster que codifican las alfaglobina tenemos un grupo de pseudogenes (en
rosado los genes son expresados) que no producen proteínas. Lo mismo ocurre con los
genes de las betaglobinas que están ubicados en el cromosoma 11, también hay un
grupo de genes que son transcritos habitualmente, pero dentro hay un pseudogene
que ha sido retenido.
Subfuncionalización
Corresponde a la pérdida parcial de funciones de genes duplicados, producto de su

especialización. Este efecto puede ser ventajoso debido a que cada gen especializado
puede evolucionar hacia una función óptima en el dominio (ej. un tejido específico) en
el cual es expresado.
En la imagen se ve un gen con la región codificadora en rosado y la región promotora

con diferentes elementos potenciadores de la transcripción (enhancers). Seguido el
evento de duplicación que genera dos copias, vendrá una seguidilla de rondas de
mutaciones que tendrán lugar en las regiones promotoras y van a afectar los
reguladores de la transcripción (enhancers). Eso al cabo de millones de años producirá
que el gen codificado por el gen original sea activo y transcrito, produciendo las
proteínas en un tejido. Y la copia de ese gen original que fue duplicada en algún
momento producto de las mutaciones que también sufrirá en la región promotora,
hará que la proteína de ese mismo gen se produzca por ejemplo en un tipo de tejido
diferente al anterior. Gracias a esta duplicación mutaciones en las regiones
promotoras de un gen se va a producir una proteína en células y tejidos diferentes.
Expresión gen engrailed (eng) en el pez cebra (Danio rerio)
En este estudio se muestra la expresión de un gen relacionado con el desarrollo del
sistema nervioso de este pez, que se llama eng1, y su versión duplicada es eng1b. Y
estos genes han acumulado cambios en la región promotora de dichos genes, lo que
ha llevado que la expresión de ambos sea específica físicamente.
Con tinción tejido especifico, procesos de tinción que identifican las proteínas
codificadas por estos genes y localizadas en un punto físico específico del pez. Arriba
se ve la yema apéndice pectoral (el pez esta visto de abajo) y se ven dos puntos en la
foto izquierda pero no en la derecha. Eso habla que el gen se expresa en las yemas del
apéndice pectoral cuando está en la versión eng1 pero no en la versión del gen eng1b.
En la vista de las neuronas médula espinal, y se ve que la copia del gen eng1 que ha
sufrido mutaciones en la región promotora (eng1b), la proteína codificada por el gen
mutado está presente únicamente en las neuronas medula espinal, que se ve en negro
en la imagen abajo a la derecha, que no se ve notoriamente a la izquierda. Esto habla
de una especialización, una subfuncionalización de la proteína codificada por este gen
derivada de las mutaciones en la región promotora. Eso hace que la proteína de la
versión génica eng1 se produzca en un lugar y la proteína de la versión génica eng1b se
produzca en otro.
Conservación de función génica (efecto de dosis génica)
Es un mecanismo que mantiene la copia duplicada de un gen. Implica un aumento en

el número de genes que codifican una proteína funcional. Ambos loci mantienen las
funciones originales.
La duplicación del gen es mantenida a lo largo del tiempo, y eso implica que los
organismos produzcan el doble de proteína. Hacer eso probablemente tiene una
ventaja adaptativa y por eso se mantiene, no se desfuncionaliza esta copia del gen
original.
Ejemplo de conservación de copia: DNA ribosomal (rDNA) en el cromosoma XII de
levadura.
Aquí se ve que para esos genes hay múltiples copias de las secuencias de proteínas
ribosomales, hay aprox 150 copias. Dentro de las copias van a estar localizados los
diferentes fragmentos génicos que codifican para las subunidades ribosomales (25S y
18S). ¿Por qué es importante tener múltiples copias del DNA que codifica para las
proteínas ribosomales? Los ribosomas son fundamentales en el proceso de traducción,
la velocidad con que un organismo produce proteínas depende por una parte de tener
muchas copias de mRNA y por otra tener una batería que permita la traducción de
esos RNA mensajeros. Y eso se ha logrado evolutivamente acumulando múltiples
copias de los genes que producen las proteínas que conforman los rna ribosomales.
En la mayor parte de las especies se observan múltiples copias que se han mantenido
dentro del genoma, justamente para hacer más eficiente el proceso de traducción.
Neofuncionalización
Ocurre cuando el gen duplicado produce una proteína con una función distinta a la
proteína codificada por el gen original (depende de que las mutaciones no sea
deletéreas para el gen).
Especialización
Es una divergencia en la secuencia de genes duplicados que tiene por efecto la síntesis
de proteínas con funciones distintas (especializadas).
El gen de la lisozima fue duplicado y evolucionó hacia el gen que codifica la α-
lactoalbúmina en mamíferos. La lisozima es una enzima que ayuda a proteger contra
infecciones bacterianas.
La α-lactoalbúmina es una proteína necesaria para la producción de la lactosa de la
leche. Ambos genes se encuentran en mamíferos, mientras que solo el gen de la
lisozima está presente en las aves.
Al revisar las estructuras de estas dos proteínas en términos tridimensionales son
bastante parecidas. Al analizar los residuos aminoacídicos dentro de las secuencias
proteicas de estas dos enzimas, vemos que hay residuos (aminoácidos) bastantes
conservados entre una proteína y otra. Sin embargo, a pesar de este grado de
identidad de ambas, obviamente porque provienen de un gen original, a lo largo de la
evolución cambios han hecho que estas 2 proteínas tengan funciones totalmente
distintas en los organismos actuales. Y de hecho hay una versión que esta conservada
de manera transversal a todos lo organismos y otra que es propia de mamíferos (la
alfa-lactoalbumina).
Importancia evolutiva
La duplicación génica es quizás el mecanismo más importante para generar nuevos
genes a partir de otros preexistentes.
Prevalencia de la duplicación de genes
La duplicación ha tenido un impacto importante como mecanismo de diversificación y

eso se refleja en el porcentaje de genes duplicados que se identifican en genomas de
distinta naturaleza (como especies bacterianas, arqueas y eucariotas). En el Homo
sapiens un 38% corresponde a genes duplicados. Pero se ve que en la tabla aparece
que el número de genes totales es de 40.580, ese dato es de bastantes años atrás, hoy
se sabe que poseemos alrededor 21.000 genes codificantes de proteína dentro de
nuestro genoma. Aunque sin duda el porcentaje de genes duplicados es relativamente
parecido.
Desde el punto de vista de la evolución, la eliminación de de las copias que se
obtienen por eventos de duplicación siguen su destino respondiendo a factores
evolutivos. Nuevamente la selección natural es un factor determinante de la
sobrevivencia de ciertos individuos que tienen características ventajosas o no bajo
condiciones ambientales especificas, y esto a su vez produce que esos individuos
sobrevivan o no, se reproduzcan o no y transfieran a la descendencia estas
configuraciones génicas.
a) Presión selectiva en ambos genes: Por ejemplo, las dos copias de un gen son
favorables para los organismos que las poseen. Si la selección natural favorece la
presencia de esas dos copias, porque a lo mejor son genes que codifican para
proteínas de defensa frente a un factor de estrés, conviene en el genoma varias copias
de esos genes, entonces la selección natural favorecerá la retención de ambas copias.
b) Presión selectiva en solo uno de los genes. Pero tal vez si esas 2das copias no
representan un efecto adaptativo favorable, la misma presión de selección va a
eliminar los individuos que si las tienen y favorecerá a quienes tienen una única copia.
Y desde ese punto de vista hay distintos efectos:
 Puede que en el transcurso de la evolución los individuos que tiene una
segunda copia en su genoma sean eliminados producto de los procesos de
selección, y sobrevivan solo ellos que mantiene la copia original.
 O la segunda copia de estos genes puede acumular mutaciones, dando origen a
una nueva función y producto de la selección natural se favorece la
sobrevivencia de los individuos que tienen estas dos copias ahora diferentes
entre sí (que producen proteínas distintas probablemente con un efecto
adaptativo positivo) y de esa manera se mantiene las dos copias pero
incluyendo la original mas la otra modificada con un efecto favorable.
Ejemplo: Evolución genético y
fenotípico de este efecto. Aquí se
tiene un pez ancestral con un gen
denominando A. Producto de un
evento de duplicación, ese gen
tendrá una nueva copia, al estar
duplicado se producen el doble de
proteínas asociadas a ese gen y las
características fenotipicas y
adaptativas de esa especie pueden
modificarse de manera leve. A nivel
evolutivo esas dos copias pueden
acumular mutaciones, pueden
producirse cambio a distintos tipos
de funciones génicas haciendo que
al cabo de miles de años esa
conformación nucleotídica distinta.
Al ser un gen diferente vamos a
tener también un efecto fenotípico
distinto en esa especie. A partir de
una especie original y dependiendo
de las condiciones ambientales y el
desarrollo o no de características
adaptativas diferenciales, a partir
de una especie ancestral se pueden
producir dos especies diferentes
(evento de especiación).
Al comparar los genomas, el gen A1 con A2 y el gen B1 con B2 son parálogos. A1 y
B1 van a ser ortólogos porque entre ellos hay un proceso de especiación. Entre los
genes parálogos siempre hay un proceso de duplicación que ha dado origen a esa
configuración.
ELEMENTOS GENÉTICOS MÓVILES

Los elementos genéticos móviles (EGM), elementos transponibles, o transposones, son
segmentos discretos de ADN que pueden trasladarse de un lugar a otro dentro del
genoma, y que tienen la capacidad de inducir mutaciones.
Están ampliamente distribuidos desde bacteriófagos hasta humanos, pasando por
bacterias, plantas y animales.
Constituyen la principal fuente de remodelación y flujo de secuencias en el genoma de un
organismo, contribuyendo a la especiación, evolución y adaptación de las especies.
-Fueron descubiertos en los 50s por Bárbara McClintock en sus estudios en maíz.
Los elementos transponibles o elementos genéticos móviles son los responsables de

muchas variaciones fenotípicas que observamos en la naturaleza. Por ejemplo son EGM
los responsables de que existan arvejas de forma lisa o rugosa, los maíces ancestrales son
morados y producto de la transposición de los EGM observamos el color amarillos en el
maíz.
También la coloración de los pétalos de petunia es el efecto de EGM.
Relación entre el tamaño del genoma y el porcentaje de transposones en organismos

cordados.
Hay una relación directa entre el tamaño de los genomas y el porcentaje de EGM. Hay una
relación directa entre los tamaños genómicos más grandes y la presencia de una mayor
cantidad relativa de EGM.
Elementos genéticos móviles en el genoma humano
 LINEs: Long interspersed nuclear elements. Elementos nucleares intercalados

largos.
 SINEs: Short interspersed nuclear elements Elementos nucleares intercalados
cortos.
 HERV: Human endogenous retroviruses. Retrovirus endógenos humanos.
El 44% de toda nuestra secuencia corresponde a EGM. Un 3% a transposones de ADN y el
41% restante correspondiente a retrotransposones.
A diferencia de otras especies que también tienen un tamaño importante de EGM, en el
caso de los humanos la mayor parte de ellos está bloqueado desde el punto de vista de su
movilidad por mecanismos epigenéticos que impiden que se transpongan.
¿Cómo se clasifican los EGM?

transposición (movimiento) que involucran.
1) Transposones (EGM clase II): Se transponen a partir de su escisión desde su posición
original y su posterior reinserción en otro lugar. El transposón cambia su posición en el
genoma sin aumentar su número de copias (transposición conservativa). Efecto de “Corte
y pegado”.
2) Retrotransposones (EGM clase I): La transposición ocurre a través de un intermediario
de ARN. El elemento original permanece en su lugar, y una copia de él mientras se inserta
en nueva posición. Produce un aumento en el número de copias (transposición
replicativa). Efecto de “Copiado y pegado”.
Componentes estructurales comunes en la mayoría de los EGM

Una de sus características es que poseen en sus extremos secuencias de ADN repetitivo y
eso desde el punto de vista bioinformática facilita su detección en una secuencia
genómica.
a) Los transposones codifican dentro de la secuencia una transposasa (enzima encargada

de hacer el corte y después la inserción en otro punto del genoma) y la flaquean
secuencias de ADN repetitivo:
-Repeticiones invertidas terminales (IR): tienen una orientación puesta al ver el lado 5’-3’.
-Repeticiones directas flanqueantes (DR): secuencias idénticas por la izquierda y derecha
(por el lado 5’ y 3’ respecto a su orientación.
b) Los retrotransposones codifican una transcriptasa reversa codifican también una

integrasa, que son las enzimas que permiten hacer el copiado y pegado en otro punto de
su genoma. Tienen en sus extremos también ADN repetitivo, tienen secuencias DR. Hay
dos clases de retrotransposones:
 Retrotransposones LTR: y tienen un nuevo grupo denominado LTR. (Repeticiones
terminales largas (LTR) son secuencias que tiene repeticiones variables).
 Retrotransposones no-LTR: no tiene LTR y solo tiene una secuencia DR.
Retrotransposones
Retrotransposición: Proceso de transposición que involucra un intermediario de ARN.
 Comienza con la síntesis de una copia de ARN del transposón mediante

transcripción.
 Luego, el transcrito es copiado en un ADN de doble hebra, mediante transcripción
reversa, el que inicialmente existe como una molécula independiente fuera del
genoma.
 Finalmente, la copia de ADN del transposón se integra en el genoma, en el mismo
cromosoma ocupado por la unidad original, o en un cromosoma diferente.
 Transposición siempre es replicativa.
Los retrotransposones son similares a los retrovirus
El mecanismo de copiado y pegado deriva de la secuencia de eventos que están asociados

al ciclo infectivo que tienen los virus. Los retrotransposones derivan de virus y a lo largo
de la evolución han perdido varios mecanismos que implican que los retrotransposones
actuales si bien mirando su secuencia se parecen mucho a los virus funcionalmente son
distintos pero están presentes en los genomas.
 La estructura de los retrovirus implica RNA donde esta codificada una transcriptasa
reversa. Hay una cápside y una envoltura viral que permite la interacción con las
células que infectan y la incorporación física de la cápside al citoplasma de esas
células.
 Bajo la acción de la RNA polimerasa el material genético es transcrito, se genera la
transcriptasa reversa que transformará el RNA viral en una estructura de doble
hebra que es integrada por una integrasa (enzima codificada en el genoma viral) en
el DNA de la célula huésped.
 Y a medida que el DNA de la célula huésped es transcrito nuevamente se
producirán RNA virales que darán origen a proteínas virales usando la maquinaria
ribosomal de la célula huésped.
 Esas proteínas virales van a permitir el ensamblado de nuevos virus, lo que lleva a
la muerte de la célula huésped y la liberación de los virus, repitiéndose el proceso
de infección.
Los retrotransposones son similares a los retrovirus

Los retrotransposones retrovirales se parecen a los retrovirus, pero carecen de genes para
la envoltura proteica que recubre la cápside. Esto implica que han perdido la capacidad de
abandonar la célula y están limitados a copiarse dentro del genoma.
Mecanismo de retrotransposición
Dentro del proceso de transposición implican un proceso de transcripción reversa.

1. Se tiene un retrotransposon en alguna parte del genoma y dentro de la secuencia de
este EGM tenemos secuencias repetitivas en los extremos, pero en la parte central de
este retrotransposon está un segmento que codifica dos enzimas que son claves para la
transposición; la transcriptasa reversa y la integrasa.
2. Cuando los mecanismos epigenéticos que controlan habitualmente los fragmentos del
genoma donde están localizados estos transposones para evitar que se retrotranspongan
de manera aleatoria, una vez que se sacan esos controles la RNA polimerasa de las células
transcribe también esa sección del retrotransposon, eso produce mRNA provenientes del
retrotransposon. Esos mRNA son traducidos por los ribosomas de la célula generando
proteínas correspondientes a la transcriptasa reversa y a la integrasa.
3. Una vez producidas las copias de doble hebra hechas por la transcriptasa reversa, opera
la integrasa que hace los cortes en el DNA donde se insertara este segmento del
retrotransposon en los puntos de destino y la unión de todos los espacios que quedan en
los extremos es realizado por ligasas.
Los retrotransposones habitualmente están presentes en el genoma de eucariotas y son
más escasos en el genoma de procariotas.
En eucariotas, los retrotransposones se clasifican en:
1. Retrotransposones con repeticiones terminales largas o LTRs (long terminal repeats).
Los LTRs son fundamentales para la transcripción reversa. Los LTRs tienen una extensión
desde 100 pb hasta varios kb.
2. Retrotransposones sin terminaciones LTRs (retrotransposones no LTRs o no retrovirales)
1. Retrotransposones LTR:
Aquí hay un ejemplo de unos elementos correspondientes a retrotransposones presentes

en la mosca de la fruta o los elementos ERV que están presentes en humanos. Los cuales
en términos estructurales se parecen bastante a los retrovirus, inclusive en términos de
extensión (7kb). La diferencia principal es que carecen del segmento que codifica para las
proteínas de la envoltura (env), a pesar de que en algunos casos como en
retrotransposones de clase Ty y Gypsy tenemos un fragmento similar al de al de la
envoltura pero en termino funcionales no logra tener una equivalencia con los genes que
están en el retrotransposon y por tanto no codifican a cabalidad las proteínas que
conforman la envolutura, dejándolos inactivos.
2. Retrotransposones no LTRs (o no retrovirales)

- Elementos nucleares intercalados largos. Long interspersed nuclear elements (LINEs).
Largo 6.1 kb (los LINES se denomina autónomos por tener codificada los genes de la
transcriptasa reversa y de la integrasa)
- Elementos nucleares intercalados cortos. Short interspersed nuclear elements (SINEs).
Más cortos que los LINES (100- 400 b) y no poseen genes. (SINES se denominan no
autónomos)
Dentro del genoma de especies eucarioticas están presentes estosgrupos básicos, y en el
caso de los humanos tenemos retrotransposones no-LTR (LINES y SINES principalmente)
El movimientos de los EGM en el caso de los humanos cuando ocurre (en una escala de
tiempo corto) que es raro, pueden producir una serie de enfermedades y se han asociado
a la retrotransposicion varias enfermedades.
Retrotransposicion de SINES Y LINES producen mutaciones en genes que están asociadas a
Hemofilias, algunos tipos de cáncer, entre otras.
Elemento L1 (LINE 1)
La inserción de L1 en el gen que codifica una proteína de coagulación (Factor VIII) puede
estar asociado a la ocurrencia de hemofilia A, enfermedad caracterizada por una
capacidad alterada de coagulación de la sangre.
Dentro del genoma esta codificado el retrotransposon que es retrotranscrito, formando
una estructura de RNA de hebra simple que se inserta a través de la transcirptasa reversa
y la integrasa que permite unir el RNA mensajero en el punto del genoma que codifica
para el factor VIII de coagulación y un el mismo set de enzimas del retrotransposon
empiezan a copiar la secuencia del RNA de hebra simple produciendo una doble hebra
que en una etapa final es integrado al ADN de la zona donde se inserta. Pudiendo afectar
al gen que codifica al factor de coagulación.
Mecanismo de transposición de transposones

1. Dentro de la secuencia del transposon tenemos un gen de importancia funcional que
codifica una enzima transposasa. Y cuando se desactivan los mecanismo de control
epigenético que existen en el ADN, la RNA polimerasa II trancribe este transposon,
produciendo la enzima tranposasa que tiene la capacidad de cortar este segmento y
dirigirlo hacia otro punto dentro del genoma.
2. Esta misma enzima que se mantiene unida a la secuenica nucleotídica de doble hebra
del transposon, corta el ADN en la zona objetivo y hace una integración de esta secuencia.
3. Los cortes que hace son escalondos y es aquí donde actua la polimerasa y la DNA ligasa
que permiten espacios vacios.
4. Asi se integra el fragmento de EGM en otro punto del genoma, se corta de un lado y se
inserta en otro.
Transposones procariotas
A) Secuencia de inserción (IS)

B) Transposon compuesto
C) Transposon tipo Tn3 (incluye un gen que se denomina resolvasa, enzima que permite
insertar eficientemente)
D) Fago transponibles
Transposón Activador / Dissociation (Ac/Ds) de maíz
Barbara McClintock identifico un transposon denominado Ac/Ds que está conformado por
dos subelementos, por una parte está el elemento Ac que codifica una transposasa dentro
de su estructura y está el elemento Ds que no es autónomo (no tiene codificada una
transposasa). Operando de manera sincronizada, que permite que cada vez que se
transpone el elemento Ac también se transponga el elemento Ds.
¿Cómo se produce esta diversidad de colores en el maíz cuando el transposon de

moviliza?
A) Por defecto los granos del maíz son morados. Esa coloración está determinada por el
gen C que puede ser modificado por el movimiento de los transposones y cuando ocurre
ese movimiento de los transposones.
B) Cuando se producen los granos no coloreados o amarillos es porque el elemento Ac se
transpone, lo que conlleva la transposición del elemento Ds y este elemento Ds se inserta
dentro del gen C, produciendo una versión mutada del gen , llamada c.
C) Hay situaciones cuando se tienen granos con coloraciones intermedias, en esos casos se
mantienen células que tienen la transposición, tiene el elemento Ds insertado en el gen,
conviviendo con otras células en las cuales ese elemento se ha transpuesto y dejo al gen C
libre. Cuando células con el gen mutado y con el gen normal coexisten se tienen estas
coloraciones intermedias.
¿Cuáles son los mecanismos de control de los EGM?
Dentro de las consecuencias de la transposición hay varias de carácter grave en el corto

plazo. La transposición puede alterar la estructura de los cromosomas, puede producir
rompimientos de cromosomas cuando un transposon sale de un punto y se mueve a otro,
pueden inducir rearreglos cromosómicos, pueden producir crossing over desiguales.
Y también alterna la expresión génica, pueden producir mutaciones en la región
promotora, codificadora, mutaciones que pueden ser no sinónimas impactando las
proteínas codificadas, pueden producir la inactivación génica (producto de la inserción en
región codificadora, pueden alterar la regulación de los genes (cuando se insertan en el
promotor) y pueden modificar la estructura de los exones y por tanto los distintos
dominios proteicos que tiene asociado a un gen en su correspondiente proteína.
Las modificaciones epigenéticas puede modular la acción de los EGM.

Cuando se establecen marcas epigenéticas, como metilaciones de nucleótidos en las islas
CPG por ej, la transcripción de los EGM está bloqueada. Si por algún motivo esas marcas
epigenéticas son removidas esos EGM se transcriben.
07/05 (clase 4)
Duplicación génica y pseudogenes
Explorando algunas herramientas de análisis genómico
El primer genoma secuenciado completamente fue bacteriano (Hemophilus influenzae)

en 1995. Tenía 1,83014 Mb (genoma relativamente pequeño). 1789 genes. 1657
proteínas. 81 RNAs, 84% sec codificantes.
La “era genómica”
Posterior a eso ha habido muchos esfuerzos de secuenciación. Otro hito fue la obtención
del primer borrador del genoma humano (1999) y de ahí en adelante comenzó un
desarrollo de secuenciación que han estado enfocadas en especies modelo, espíes de
interés económico como el arroz, etc.
El costo asociado a la tecnología de secuenciación a experimentado una baja drástica, por
alrededor de 1000 dólares se puede obtener la secuenciación completa de un organismo.
Hace unos años atrás se debía contar con millones de dólares.
Los pasos para obtener la secuencia de un genoma
Protocolos que permiten extraer genoma: implica el rompimiento de células, la aplicación

de alcoholes, algunas sales, etc, que permiten la purificación del ADN.
El ADN tiene una constitución física muy similar en todos los organismos, y desde ese
punto de vista el trabajo que va después de la aislación del ADN es prácticamente el
mismo.
El proceso que nos lleva a conocer la secuencia de un genoma implica: tecnología de
secuenciación que toma los fragmentos de ADN que se aíslan. Habitualmente hay un
proceso de fraccionamiento para obtener pedazos pequeños y una serie de tecnologías
que permiten secuenciar esos fragmentos.
Hay controles de calidad, procesos de bioinformática que permite ensamblar todas esas
secuencias y dale una estructuración física consistentes. Posteriormente a todas las
secuencias armadas, ensambladas, son analizadas contra secuencias de genomas
secuenciados previamente y así se les asigna una función biológica a cada porción. Se
identifican los genes y sabe que tal secuencia corresponde a un gen específico.
Los que se obtiene es una configuración nucleotídica de todo el genoma. Para cada
cromosoma conocemos exactamente la secuencia de una de las hebras, como 5’-3’ por
ejemplo, y podemos en ella distinguir diferentes elementos sobre la base de análisis
genómico.
¿Cuál es la importancia de conocer la secuencia de un genoma?

-En este curso nos interesa desde la perspectiva de la evolución molecular de los
genomas.
Permite:
• Analizar los elementos estructurales/funcionales del DNA que regulan la expresión
génica.
• Conocer los diferentes tipos de proteínas codificadas en el DNA de una especie.
• Comparar genomas de distintas especies (genómica comparativa).
• Comparar genomas de distintas especies (genómica comparativa).
- Identificar genes en una especie, a partir de genomas ya conocidos. Conocer la
función de un gen en un organismo permite predecir la función, de ese mismo gen
(ortólogo), en otro organismo.
- Entender las relaciones evolucionarias entre distintas especies, o la variación
genética entre diferentes poblaciones de una misma especie.
• Vincular secuencias genómicas (genotipo y sus polimorfísmos) con características

fenotípicas (características físicas, perfiles bioquímicos, desarrollo/herencia de
enfermedades, etc).
A continuación se mostraran plataformas donde se puede obtener información genómica
con utilidades amplias. La idea no es describirlas en detalle sino revisar las características
generales de estos sitios.
 1era plataforma de información genómica : “Ensembl” de Inglaterra. Nos lleva a
información genómica de especies vertebradas, como el genoma humano.
Ensembl tiene una contraparte vegetal llamada “EnsemlPlants”, en la cual se encuentran

genomas de distintos tipos de plantas.
Tmabien se pueden acceder a mas versiones de Ensembl que están asociadas a genomas
bacterianos, de protistas, de hongos, entre otros. Por ejemplo EnsemblFungi.
 2da plataforma: Phytozome que es de Estados Unidos, y dentro de ella se

encuentra alrededor de 40-50 genomas distintos, vegetales principalmente, de
espíes modelo inicialmente y también de muchas especies de importancia
comercial.
 3ra plataforma: NCBI, centro de información biotecnológica nacional de estados

unidos, donde hay una cantidad de información muy diversa.
Entre las muchas cosas que se pueden hacer en NCBI está por ejemplo explorar las
secuencias genómicas. Aquí también esta la secuencia del genoma humano.
Dentro de NCBI encontramos secuencias de genomas virales y también se puede

explorar alternativas de información que existen para todas las secuencias de las
diferentes variantes del covid-19.
En Esembl hay varias opciones de trabajo, uno puede ingresar el nombre de un gen
y obtener todos los recursos de la plataforma. Hay alternativas, como BLAST/BLAT
que permiten comprar una secuencia especifica con secuencias génicas de otras
especies.
Se sabe que la glucolisis es un proceso clave para la obtención de energía en todas

las especies que requieren producir ATP. Una enzima importante de ese proceso es
la hexokinasa, en el caso de los humanos el gen que codifica esa enzima es HK1. En
el buscador de Ensemble podemos ingresar a HK1 y se obtienen distintas fuentes
de información relacionadas a este concepto.
Al clickear la primera opción se entrega una ficha con información variada, como la
localización en el cromosoma, transcritos asociados. CCDS es la secuencia de la
región codificadora y es una secuencia consenso, que ha sido obtenida a partir de
muchas secuencias similares.
Y en la pagina, en la izquierda se puede obtener información adicional para el gen
buscado, entre las opciones esta ver el árbol filogenético (para ver el grado de
identidad por ejemplo).
Se pueden ver ortólogos y parálogos de la secuencia.
También hay información de sitios en donde los cuales las versiones génicas se
expresan. Esa información proviene de análisis de transcritos. Si bien en cada una
de nuestras células tenemos el mismo ADN, las proteínas que se producen en los
distintos tipos celulares que tenemos son totalmente distintas, tanto las proteínas
estructurales como funcionales. Lo que varía entre célula y célula son los RNA
mensajeros (mRNA) y las proteínas. Entonces se pueden estudiar las diferencias en
la expresión génica a partir de la comparación de RNA mensajero obtenidos de un
tipo de tejido versus otro tipo de tejido.
En la versión vegetal de Ensambl, al ver el trigo se entrega información

filogenética, de genes y información del cariotipo.
Hay opciones para hacer búsquedas para palabras claves.
Lo interesante de Ensambl es que tiene genomas secuenciados para
representantes de todos los reinos.
Phytozome tiene genomas vegetales. El genoma de eucaliptus grandis es una de

las especies más cultivadas en el mundo y está en esta plataforma. Hay genomas
de especies forestales, cítricos, durazno, tomaste, maíz.
Aquí también se pueden explorar secuencias.
Estas son todas opciones en las cuales se puede obtener información genómica y
se puede integrar esa información de manera de poder comprar entre distintas
especies, poder establecer relaciones filogenéticas, poder identificar eventos de
cambios genómicos importantes como eventos de duplicaciones, eventos de
especiación, etc.
Clase 2.5
Elementos genéticos móviles (continuación)

transposición (movimiento) que involucran.
Transposones EGM clase II: Se transponen a partir de su escisión desde su posición
original y su posterior reinserción en otro lugar. El transposón cambia su posición en el
genoma sin aumentar su número de copias (transposición conservativa). Efecto de “Corte
y pegado”.
Retrotransposones EGM clase I: La transposición ocurre a través de un intermediario de

ARN. El elemento original permanece en su lugar, y una copia de él mientras se inserta en
nueva posición. Produce un aumento en el número de copias (transposición replicativa).
Efecto de “Copiado y pegado”.
Componentes estructurales comunes en la mayoría de los EGM
Tienen secuencias repetitivas de nucleótidos específicos en los extremos, hay una porción
de enzimas que permiten la transposición y a los lados hay distintas configuraciones de
secuencias repetitivas y la clasificación de actos transposones pueden llevarse a cabo
viendo la extensión, la direccionalidad que tienen esas secuencias y clasificarlas en el caso
de los retrotransposones está lo que se denominan transposones LTR vs los No LTR.
Mecanismos de control de Los EGM

Es fundamental para generar adaptabilidad en un tiempo corto, como por ejemplo las
plantas que están sujetas a variaciones ambientales, los EGM son un mecanismo que
permite producir variabilidad y de esta forma generar dentro de su descendencia
individuos que tienen características fenotípicas diferentes y de ese modo aumentar la
variabilidad qué van a dar lugar a un individuo que pueda sobrevivir y reproducirse bajo
esas condiciones
Los EGM son un factor importante de mutaciones por eso muchas veces están siendo
bloqueados para evitar la ocurrencia de mutaciones
Consecuencias de la transposición
Pueden haber efectos importantes en la estructura cromosómica puede producir un
rompimiento de los cromosomas o un rearreglo, debido a que interfieren a través de su
transposición o interfieren a través de los elementos repetitivos de ADN que están en los
extremos con la interacción cromosómica que se da durante la meiosis y de ese modo
pueden alterar la manera en que se distribuyen los fragmentos cromosómicos durante la
profase 1 y de ese modo un cromosoma gane o pierda un fragmento con muchos genes.
Por otro lado también puede afectar la expresión génica ya que se puede insertar en la
región codificadora de un gen o en la región promotora, esto altera el tipo de proteína que
se está codificando o la tasa de transcripción, se pueden producir mutaciones o generar
una inactivación génica, cuando éstos elementos se unen a la región codificadora o a los
promotores. También puede ocurrir una alteración en La regulación génica ya sea porque
rompen los elementos en cis qué sirven de señal para la Unión de la RNA polimerasa más
los factores de transcripción o pueden también alterar las regiones que están río arriba
potenciando o reprimiendo la expresión de un gen. También pueden alterar la
información que está dentro de los exones O la información que están los límites de los
intrones y exones esto tiene un efecto negativo en la manera en que se ensamblan los
RNA mensajeros y por lo tanto la proteína que se origina.
Las modificaciones epigenéticas pueden modular la acción de los EGM

Por ejemplo la metilación del ADN en las Islas cpg son un mecanismo que altera la
transcripción de genes pero cuando están posicionados sobre elementos genéticos
móviles, la transcripción de estos transposones también se bloquea, la generación de los
RNA mensajeros propios de los retrotransposones es mediada por la RNA pol II, que es la
misma que hace la retrotranscripción de los genes humanos, luego cuando estas marcas
epigenéticas son removidas hay un proceso de desmetilación en el cual la RNA pol es la
que lee las secuencias y genera un rna mensajero, entonces un primer mecanismo de
control de la transcripción de los retrotransposones es la adición de las marcas metiladas,
en caso de que estas marcas sean removidas va a operar la RNA polimerasa y va a generar
un RNA mensajero que posteriormente es retrotranscrito y va a generar una copia en el
genoma de estos elementos
Otro mecanismo que opera en organismos eucarióticos que incluye algunos animales y
algunos insectos es lo que se denomina complejo de vigilancia del genoma que puede
tener un rol de control sobre la transposición de los retrotransposones o transposiciones.
La transposición de los EGM es inactivada a través del silenciamiento mediante el
complejo de vigilancia del genoma. Este complejo se activa cuando un EGM se inserta en
loci denominados “cluster pi” que tiene elementos funcionales que permiten interferir en
los RNA, y de esta forma bloquean la expresión génica y está mediado por la acción de
piRNA (Piwi-interacting RNAs) que es un tipo de RNA no codificante
En la imagen se puede observar un segmento de cromosoma en donde está inserto el
clúster pi, tiene múltiples genes que producen proteínas o RNA interferentes, cuando en
este cluster génico se inserta un elemento genético móvil que está simbolizado en color
rosado es una inserción aleatoria, inmediatamente se genera uno de los componentes
necesarios para producir el silenciamiento génico en el cual se puede observar el
transcrito en color rojo, este se produce en paralelo con el RNA pi, qué va a interactuar
con él fragmento de transposon y en una segunda etapa va a producir el silenciamiento
del retrotransposon.
Aparte de los que se insertan en el cluster pi, también van a existir copias de estos mismos
elementos en distintas partes del genoma y también van a existir copias de elementos
genéticos móviles que no son controlados por este sistema, lo que se observa en color
amarillo, éste va a ser procesado y va a generar una estructura de RNA simple que es
traducido y transformado en las enzimas que permiten su inserción en otro punto del
genoma y que puede producir un efecto negativo. Pero aquellos elementos genéticos
móviles que tienen un representante en los cluster pi, y que están insertos en otro punto
del genoma van a generar un RNA mensajero en el caso de los retrotransposones Qué es
interferido por todo el cluster pi, impidiendo su traducción,por ejemplo impidiendo que
llegue a formar una transposasa y que de esa forma pueda permitir el copiado del
elemento genético móvil, por lo que pueden interactuar el pRNA más el mRna e
interactuar con otras proteínas, un sistema que se denomina argonauta-piwi que
finalmente permite la unión de los elementos controladores y el mRNA y este complejo
enzimático y proteico hace la degradación del mRNA evitando su traducción.
Importancia de adaptativa de los elementos genéticos móviles

Los EGM son una principal fuente de remodelación del genoma de un organismo,
contribuyendo en la especiación, evolución y adaptación de las especies.
En la imagen se resume el rol importante que tiene los elementos transponibles en la

modulación de la variación genética en el corto plazo y también La regulación a largo
plazo, dentro de la respuesta de las plantas es esencial su capacidad de responder a
factores ambientales de distinto tipo que pueden ser variaciones en el tipo de suelo, en la
disponibilidad de agua, disponibilidad de nutrientes, cambio de la temperatura, la
presencia de patógenos, etc. Todos estos factores ambientales influyen de manera directa
a las plantas, el fenotipo de un vegetal aparte de estar determinada por la información
genética también está determinada por la respuesta a factores externos y de ese punto de
vista se activan genes, mecanismos de remodelamiento de la cromatina que hacen que se
expresen genes de distinto tipo,por ejemplo frente a una condición de estrés hídrico las
plantas van a producir osmolitos protectores que son proteínas especializadas que a nivel
de citoplasma van a producir un balance hídrico que evita que el agua se vaya de la célula,
además mantienen la funcionalidad de las enzimas, por un periodo de tiempo no tan
largo.
Los elementos genéticos móviles producen variaciones que en el corto plazo generan
genotipos más adaptados que se reproducen entre sí , y transfieren esas características
adaptativas a su progenie.
Las condiciones de estrés abiótico inducen la transposición y/o regulan los genes
cercanos a los transposones, favoreciendo una respuesta defensiva y adaptativa
Se observan dos cromosomas, en uno de ellos hay un elemento transponible y en otro
punto del genoma hay genes que producen una proteína de defensa por ejemplo, bajo
condiciones normales y la ocurrencia de una situación de estrés como la falta de agua, por
lo tanto bajo condiciones de estrés hay elementos genéticos móviles que son activados
por una cascada de señalización a nivel celular, que deriva en la remodelación de la
cromatina, por ejm las acetilasas, deacetilasas, metilasas,todas estas operan en aquellos
segmentos del genoma donde los elementos transponibles bloqueados y al haber un
remodelamiento de la cromatina o al haber una desmetilación de los retrotransposones,
ellos se activan produciendo múltiples copias dentro del genoma, que remodela el
genoma al corto plazo. Los elementos genéticos móviles en el cromosoma puede tener
múltiples copias en otros cromosomas y esas múltiples copias que se insertan al azar se
pueden insertar en la zona del promotor del gen, promoviendo su transcripción
aumentando la traducción de proteínas y las plantas van a producir más proteínas de
defensa que responderán de mejor manera a la escasez de agua, también pueden
transferir la información a su descendencia con mecanismos de defensa que van a estar
activos en condiciones de estrés y no estrés para que se mantengan en el tiempo.
Los EGM pueden modificar la expresión génica

en la imagen se observa una región codificadora con tres exones,hay una región
promotora y un potenciador o enhancer, la transcripción normal va producir un RNA con 3
segmentos con cada uno de los exones,y una proteína con 3 dominios particulares.
Los EGM pueden insertarse en la región codificadora de un gen, pueden insertarse
específicamente en los exones produciendo el truncamiento del RNA mensajero o de la
proteína codificado puede producir un efecto de exonización, y genera un exón en un
punto que antes no existía y puede alterar también el splicing alternativo
También se pueden insertar en una región intrónica de un gen que pueden producir un
exón que antes no estaba o constituir un exón artificial qué va a estar dado por la
secuencia nucleotídica del elemento genético móvil,puede producir exonización y
truncado y puede alterar el splicing alternativo.
Cuando se insertan los EGM en las regiones dobladora o elementos que están río arriba
los efectos son variados Por ejemplo si se une en la región promotora de un gen puede
ocurrir un bloqueo de la transcripción,Un aumento o una disminución la transcripción o
puede cambiar la especificidad del promotor Ya que en estas zonas están Todo lo que
hace que un transcrito Se ha producido en una taza de traducción en específico, por lo
que si agrega un EGM se alteran lo elementos en cis que provoca una pérdida de
especificidad en la traducción
también está la disrupción de los enhancers que tiene los mismos efectos anteriormente
mencionado
Puede constituir un nuevo enhancers, un potenciador que antes no se transcribió
Puede producir el silenciamiento de un gen debido a que actúan procesos de metilación
del DNA por ejemplo, que silencian la zona promotora.
También pueden producir el silenciamiento de los enhancers debido a que la metilación
que pueden sufrir a modo de control, puede bloquear la capacidad potenciadora que
tenía ese segmento del ADN, respecto de la transcripción de ese gen.
Los EGM son componentes del genoma fundamentales para producir variación genética y
se clasifican en dos tipos los retrotransposones y los transposones de ADN, los primeros
tienen un mecanismo de copiado y pegado y el segundo de corte y pegado debido al
efecto que tienen al aumento del genoma, si bien en el largo plazo son claves para
producir variación genética y adaptabilidad, hay mecanismo de control ya que pueden
tener efectos negativos y generar mutaciones deletéreos para un organismo, hay
mecanismos epigenéticos como la metilación del ADN y el silenciamiento génico. La
importancia es que produce cambios fenotípicos, en las planta por ejemplo que son
bastante limitadas en cuanto a la respuesta al medio ambiente que generan variación
genotípica y aumentan las probabilidades de producir adaptación en las generaciones
siguientes.
Familias génicas
Evolución de los genomas

Los genomas son entidades dinámicas sujetas a constante evolución. Los cambios ocurren
fundamentalmente por:
❑ Mutaciones
❑ Duplicaciones
❑ Recombinaciones
❑ Transposiciones
❑ Reorganización cromosómica (deleciones, duplicaciones, etc.)
❑ Transferencia horizontal de genes
Mecanismos que producen duplicación génica

1. Se producen por diversas causas algunas ocurren en la meiosis
-Crossing over desigual
-intercambio desigual de cromátidas hermanas
2. Recombinación desigual durante la replicación
● Estas producen repeticiones de genes en tándem
3. Retroposición (= retroduplicación)
4. Poliploidización 5. Duplicaciones sub genómicas a gran escala
La duplicación de genes, seguida por la divergencia de las copias génicas, debido a la

acumulación de mutaciones, es una fuente de nuevos genes en los genomas.
Duplicación segmental en el cromosoma 16 humano

Es uno de los cromosomas de tamaño pequeño que refleja la coincidencia física o los
eventos de duplicación que han habido en él
En verde está la zona de heterocromatina que es poco activa, en negro se observan los
cromosomas Humanos del 1 al 7 y abajo del 10 al 22, en azul se observan evento de
duplicaciones génicas que han ocurrido en el cromosoma, en cada extremo hay un evento
de duplicación, dentro de un mismo cromosoma por lo tanto hay eventos de duplicación
génica muy frecuente, en rojo se observan las secuencias homólogas entre cromosomas
que también vienen de efectos de duplicación, Eso quiere decir que una copia génica en el
cromosoma 16 y hay una segunda copia en otro cromosoma en el otro extremo de las
líneas rojas.
Familias génicas
Grupos de genes que se caracterizan por tener secuencias idénticas o similares entre sí, y
por codificar proteínas con iguales /similares funciones
Provienen de un ancestro común. Son producidos por evento de duplicación génica
Los genes de una familia pueden localizarse en un mismo cromosoma o estar dispuestos
dentro de un genoma, en algunos casos pueden estar agrupadas en tándem.
Las familias génicas son bastante frecuentes en procariontes

ejm bacteria del suelo Bacillus Subtilis, tiende vivir en suelos con escasos nutrientes, el
53% no son genes de una familia,pero también hay proporciones variables de genes que
son de la misma familia.
Genoma Humano
Genes Únicos: 25 a 50% de los genes presentes en el genoma humano (haploide)
Familias génicas: 50 a 75% de los genes presentes en el genoma humano (haploide)
En la tabla se observa en algunos ejemplos de los genes que están dispuestos en familia
génicas, estas familias génicas pueden estar dentro de un mismo cromosoma, pueden
existir como grupos ubicados en distintos cromosomas o también pueden estar
organizados en copias que están presentes en cromosomas diferentes.
Una familia génica corresponde a los que codifican a los antígenos leucocitarios humanos
clase 1 que son fundamentales en el sistema inmune humano, están ubicados en el
cromosoma 6.
Un ejemplo de los que están dispuestos en distintos cromosomas son los genes que
codifican a las globinas que son las proteínas fundamentales de la hemoglobina que es
parte estructural de los eritrocitos, hay genes asociados a procesos a procesos de
desarrollo embrionario Cómo los genes HOX que estan localizados en el cromosoma 2, 7,
12 y 17, también los genes que codifican para los receptores olfativos.
Ejemplo de los que tienen las familias génicas en distintos cromosomas, no agrupados en
cromosomas específicos sino que dispersos, son los que codifican para la ferritina qué
tiene que ver con el transporte de fierro y algunos genes asociados a factores de
transcripción del desarrollo embrionario como los genes PAX o los genes NF1 que tienen
que ver con el desarrollo del sistema nervioso.
Genes Homeoticos
● un grupo de genes homeóticos es el conocido como el complejo homeóticos
(HOM-C), codifican factores de transcripción, son muy conservados que hace que
el genoma sea bastante similar en distintos organismos por ejemplo en humanos y
moscas
● estos genes regulan el desarrollo de la estructura anterior (complejo
Antennapedia) y posterior de la mosca
● el grupo de genes HOX, es equivalente a los genes HOM-C de la mosca y está
presente en humanos, ratones y otros animales
Estos genes se caracterizan porque tiene una región altamente conservada de 180 pares
de bases, que se denomina el homebox que da origen a los dominios de la proteína que
tiene la capacidad de unirse al ADN y puede regular la expresión de genes, participan de la
activación de genes fundamentales para la estructuración de un embrión.
Son fundamentales para la coordinación de estructuras cuando el embrión se va

formando
Cada color indica el lugar donde actúan, en el caso de la mosca hay dos grupos de este
tipo de genes distribuido en dos cromosomas distintos que se observa en colores
distintos, por ejemplo en color naranja se observan los genes que actuarán en la
estructura de el abdomen, en el caso de los humanos estos genes homeóticos están
agrupados en 4 cromosomas, agrupados en un cluster génico
● cromosoma 7 HOX-Tipo A
● cromosoma 2 HOX- Tipo D
La cantidad específica de miembros varía entre cada clúster génico, se observan los
efectos de los factores de transcripción que tiene en el desarrollo embrionario humano.
Hay una suerte de analogía con los efectos de estos genes en las moscas, por ejemplo en
ratones es muy similar a la distribución de estos genes en humanos.
Evolución de las familias génicas
La especiación de los genes duplicados ocurre gradualmente, a medida que mutaciones se

acumulan en los descendientes de la célula original en la cual la duplicación ocurrió.
Son rondas sucesivas en el proceso de duplicación y divergencia durante muchos millones
de años, que puede permitir que un gen origina una familia génica dentro del cual cada
miembro tiene una función especializada
Variedad de genes que codifican para las globinas

En algún momento se generó un gen ancestral que codificó para globinas, Se generó la
mioglobina y la citoglobina la primera asociada a los músculos y la segunda con un
carácter general más amplio, en que en algún organismo en el cual se realizó la
duplicación dieron origen a estos genes que son paralogos que en términos de secuencia
están relacionados entre sí, han acumulado mutaciones pero que son diferentes en
cuanto a la proteína se codifica, con el correr de los miles de años y con los procesos de
mutaciones se dio lugar a la permanencia de estos genes paralogos en distintas especies
dando origen a los genes ortologos. Por ejemplo hay genes de mioglobina y hemoglobina
en humanos y en ratones.
● Parálogos en la misma especie
● Ortólogos en distintas especies
Se pueden reconocer diferentes clases de familias génicas según el grado de similaridad

de secuencias nucleotídicas y aminoacídicas
Si dos genes diferentes producen proteína muy similares, es muy probable que se hayan
originado por una duplicación génica evolutivamente muy reciente muy probablemente a
través de algún evento de duplicación en tándem, este tipo de genes tienden a agruparse
en una ubicación su cromosómica específica cluster génico
Si dos genes diferente producen proteína menos relacionados en términos de secuencia

aminoacídica lo más probable es que se hayan originado por una duplicación de genes
más antigua originalmente pueden haber estado agrupados pero a lo largo de la evolución
los genes pudieron haber sido separados por translocaciones o inversiones tendiendo
ubicarse En diferentes localizaciones cromosómica
Familia génica con miembros estrechamente relacionados, los genes tienen un alto grado
de homología de secuencias a lo largo de todo el gen ejemplo de familia génica de las
histonas y familia de las Alfa y Beta globina
Se observa un alineamiento de la distinta familias génicas, Se observa que hay porciones
dentro de la secuencia de aminoácidos que son conservadas que se ven en color azul
oscuro que hablan de residuos que están localizados en la misma posición a lo largo de las
diferentes versiones, entre más divergencia y entre mayor tiempo qué ha pasado desde la
duplicación menor parecido a ver entre los nucleótidos o entre los aminoácidos asociados
a los genes o proteínas.
En familias génicas definidas por un dominio proteico común los miembros podrían tener
una homología de secuencias muy baja pero posee motivos que especifican 1 + dominio
proteico particulares altamente conservados
Ejemplo de genes PAX ( factores de transcripción de tejido específico) y familia de genes
SOX ( factores de transcripción asociados a la determinación del sexo)
Los genes HOX pueden variar dentro de una misma especie pero también podrían diferir
de los genes ortologos de otras especies sin embargo hay familias que caracterizan estas
proteínas y que le confiere la capacidad de unirse al ADN, Hay dominios conservados
independiente del organismo , ejemplo de estos genes, son los genes TBX que son
factores de transcripción vinculado al desarrollo del sistema nervioso,lo mismo que los
genes de dominio Forkhead que son genes que codifican a la estructura y funcionamiento
del sistema nervioso que se unen a los otros genes SOX.
Expansión y contracción de las familias génicas
● Las familias génicas se pueden expandir en número. en el caso de genes de
importancia fenotípica la selección natural favorece la presencia de copias
adicionales, permitiendo la presencia de una mayor dosis de genes de importancia
o ampliando la batería de genes asociados con características adaptativas
● La familia génica también se puede contraer, el número se asocia a posibles
cambios en el ambiente que causan que cierto tipo de genes no sea esencial para
la adaptación de una especie
Diversidad de copias de los genes

Se observa el efecto de la expansión o contracción de las familias génicas
En color gris se observan genes Qué son partes de familia en el cual no ha habido cambios
en la familias, en color negro se observa las contracciones, familias genicas en las cual los
miembros se ha reducido, y en blanco están las familias genicas en el cual ha ocurrido una
expansión de la cantidad de genes están presentes en una familia. La diversidad genética
por lo tanto ha dado origen a los organismos que están en la actualidad, por ejemplo en
humanos han habido más eventos de expansión qué de contracción pero la mayoría no ha
cambiado, en el caso de los chimpancés han experimentado mayor eventos de
contracción.
La contracción o la expansión de familia génica entre distintas especies da cuenta la

adaptación a factores ambientales
Hay proteínas que reflejan la interacción de ciertas especies con el ambiente, en la tabla
se observa la cantidad de copias de genes asociados a familias que codifican para
receptores olfativos, hay cuatro tipos de familias génicas, en el caso de los humanos no
hay mucha diversidad de receptores y la mayor cantidad son receptores más generales
(OR), en el caso de los ratones o las ratas tienen una gran diversidad de receptores incluso
mayor que los perros, incluso las vacas es mayor que los perros, también algunos
organismos acuáticos tienen una cantidad de receptores muy variados. En humanos se
compensa la falta de receptores olfativos por otros sentidos
Evolución de las familias génicas

Genes de globinas
Estas moléculas son claves para el transporte de oxígeno, en su membrana o estructura
externa tiene hemoglobina que es una estructura conformada por subunidades proteicas,
tiene interacción física con iones de fierro, confirmando lo que se denominan los grupos
hemo, que es la que tiene la capacidad de interacción con el oxígeno o con el co2 y de ese
modo lo puede transportar, tiene 4 subunidades que la conforman:
● 2 Alfa globina
● 2 beta globina
Codificada por 2 familias génicas, el de las alfa globina en el cromosoma 16 y beta globinas
del cromosoma 11, si se analizan los genes difieren en su expresión, por ejemplo la epsilon
globina tiene especificidad durante el desarrollo embrionario, la Alfa 1 y Alfa 2 se
producen mayoritariamente en el feto y en los individuos adultos. En el caso de la Beta
globina también se expresan diferencialmente en distinta etapa de nuestro desarrollo y
eso es porque los requerimientos de oxígeno son diferentes cuando somos embriones a
cuando somos adultos, todas estas variantes están codificadas por familias génicas.
La superfamilia de las globinas e invertebrados ilustra la divergencia en La regulación de

genes y función después de proceso de duplicación de genes
En la figura se observa como se genero la diversidad de globinas que los humanos

poseemos en la actualidad, todos provienen de un gen que codifica a una globina
ancestral que se produjo alrededor de 800 millones de años atrás, hubo una divergencia
que produjo por un lado la neuroglobina que son globinas asociados al sistema nervioso y
que se comparten con otros organismos eucarióticos multicelulares y se generó otro gran
grupo con globinas con funciones más especializadas una de ellas corresponde a las
mioglobina y citoglobinas, Las mioglobinas también surgieron en paralelo a la citoglobina
que transportan oxígeno en las células musculares, las más recientes son las Alfa y Beta
globina que están presentes en la hemoglobina de los eritrocitos, surgieron alrededor de
450 millones de años atrás que a través de procesos de mutaciones y divergencia han ido
apareciendo lo que codifican para la Beta globina y los que codifican para las Alfa globina.
Dentro de esta familia génica tenemos pseudogenes, que son muy parecidos a los genes
pero que carecen de función promotora
Evolución de los genes codificantes de globinas humanas

● Los genes que codifican las globinas evolucionaron de un gen ancestral común, el
cual se duplicó y dirigió alrededor de 450 a 500 millones de años atrás
● Luego de evento de duplicación, las diferencias entre los genes de la familia de las
globinas surgió de la acumulación de mutaciones
Clase 2.6
Evolución de intrones y exones
Variación en el número y tamaño de intrones y exones
En la tabla se observa varios tipos de genes que codifican para proteínas con distinta
función, como la insulina, Beta globina, factores de coagulación, proteínas relacionadas
con la conformación del tejido muscular, entre otras. Se observa el largo de los genes,
también varían en el número de intrones que posee y en relación al tamaño que estos
intrones ocupan, pueden ocupar hasta 98% del tamaño génico.
Por ejemplo el Gen que codifica para la Beta globina Se observa entre 6 exones y genes
que codifican a proteínas , también hay genes bastante grande respecto de su tamaño
como el que codifica para el factor 8 de coagulación sanguínea, que tiene 6 exones
diferentes con tamaños variables tiene 25 intrones que ocupan una proporción
importante del gen
Diferencias en eucariotas y procariotas
En el caso de las células eucarióticas el proceso de transcripción es más complejo ya que

aparte de producirse un RNA mensajero hay un proceso que implica la remoción de los
intrones y la unión de los exones para formar un RNA mensajero maduro que es
transportado desde el núcleo y finalmente traducido para formar la proteína.
En las células procariotas no está este proceso de remoción de los intrones
La región codificadora de algunos genes eucarióticos se encuentra interrumpida por

intrones. La transcripción de tales genes genera un pre-mRNA (o transcrito primario) que
contiene secuencias provenientes, tanto de los exones (región codificadora), como de los
intrones. Este precursor es sometido a un proceso denominado splicing (“corte y
empalme”), en el cual se eliminan las secuencias provenientes de los intrones, generando
el mRNA maduro.
El splicing alternativo es el proceso que permite generar diferentes combinaciones de

exones a partir de un mismo pre-mRNA y por consiguiente sintetizar más de una proteína
a partir de la información genética contenida en un mismo gen.
Más del 70 % de los genes humanos experimentan splicing alternativo. Esto explica cómo
a partir de los ~ 21.000 genes se producen ~100.000 proteínas diferentes.
Importancia de la estructura génica en exones e intrones

La frecuencia de intrones (número de intrones por gen) presentes en los distintos
genomas eucariotas varía ampliamente.
Hay una relación directa entre el número de intrones y la complejidad biológica que
poseen, Cómo se puede ver en la figura hay una relación entre la cantidad de neutrones
que tiene las especies y la complejidad evolutiva, especies que son simples como por
ejemplo las levaduras tienen una cantidad de interno relativamente menor Qué especies
más compleja desde el punto de vista estructural y funcional, en el caso de los roedores
presentan más número de intrones
Importancia evolutiva
Para los eucariotas, el desarrollo del splicing alternativo representó un paso evolutivo muy
importante hacia una mayor “eficiencia genómica”. Varias proteínas pueden ser
codificadas por un sólo gen, en lugar de requerir un gen separado para cada una.
También, dichas proteínas pueden ser producidas en órganos diferentes
Se observa el Gen que codifica para la Alfa tropomiosina asociada con la contracción
muscular con una gran variedad de exones e intrones en la región codificadora, permite
producir una gran cantidad de RNA mensajero que pueden ser producidos en células de
distinta naturaleza, por ejemplo el primer transcrito que tiene 10 exones se producen
células del músculo estriado, las tres siguientes se producen en el músculo liso luego en el
fibroblasto inclusive se produce en el cerebro. Todos estos organismos que tienen esta
conformación compleja tienen la capacidad de producir transcritos de manera diferencial
entre distintos tipos de células y producir proteínas que pueden ser diferente del punto de
vista funcional.
Estudios comparativos indican que el splicing alternativo precedió el desarrollo de

pluricelularidad en el contexto evolutivo, y sugieren que este mecanismo podría haber
sido necesario para el desarrollo de los organismos multicelulares.
Procesamiento del RNA

La producción de los transcritos que son procesados que salen del núcleo y que se unen a
los ribosomas dónde son traducidos, esta etapa ocurre en el citoplasma y requiere un
procesamiento de los extremos de manera de asegurar que efectivamente lleguen a los
ribosomas sin ser degradados por el sistema enzimático defensivo que tienen las células
como las endonucleasas
El procesamiento de los RNA mensajeros, tienen modificaciones estructurales en los
extremos generando una metilguanosina y en el extremo 3' ocurre la adición de un
segmento de adeninas, una cola poli A, permite la acción de diversas enzimas que
permiten este proceso, le confiere una estructura que va a salir del núcleo y que va a salir
a las ribosomas.
Existen secuencias de nucleótidos especiales que “señalizan” el inicio y término de un

intrón.
Dentro de la región codificadora hay una serie de nucleótidos que marcan los límites o
señales a los límites de los intrones y de los exones, por ejem AG es el final del exón y GU
indica el inicio del intrón.
En la zona media de los intrones hay una zona que es relativamente conservador Qué es la
secuencia YURAC, donde la R indica qué puede ser una adenina o guanina y la Y indica que
es una citosina o un uracilo, sin embargo esta secuencia es relativamente conservada.
todas estas secuencias sirven como posicionadores para los elementos que
posteriormente van a remover estos intrones y van a unir los exones.
Tipos de intrones
Clasificación de los cinturones de acuerdo a los elementos señalizadores
En células eucarióticas la mayor parte de los intrones tienen en sus extremos nucleótidos
que son conservados y que se clasifican como los intrones GU-AG o los intrones AU y AC,
hay otras intrones que tienen sus características propias y que son propios de genes con
intrones presentes en organelos que pueden estar presentes en cloroplastos y
mitocondrias.
Splicing es realizado por un complejo especializado: el “spliceosoma”
Complejo proteico encargado del splicing

-Small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs)
- 5 small nuclear RNAs (snRNA):
● U1, U2, U4, U5, y U6
● Moléculas cortas (106 -185 nucleotidos)
- Factores proteicos (splicing factors) (~200): Le entregó en la funcionalidad total al
complejo proteico
Hay secuencias nucleotídicas que limitan lo que es el término de un exón o el inicio de un
intrón. Según en diferente componente del spliceosoma, qué parte con la unión de la
proteína snRNP U1, en el límite del exón 1 y el primer intrón, otra proteína snRNP U2
reconoce a la secuencia YURAC y cuando ya se han Unido se agregan otros elementos del
spliceosoma, como la unidad 4 y 6 que permiten el corte del intrón por el extremo 5', y
unen el extremo cortado con la zona donde está la secuencia YURAC específicamente
donde está la adenina, se forma un lazo y este complejo corta en el extremo 3' del intrón y
posteriormente los separa de los exones y se degrada este fragmento de nucleótidos que
corresponden al intrón.
Exones alternativos vs constitutivos
Los exones constitutivos están siempre presentes en cualquier tipo de mRNA que se
produzca a partir del Gen inicial, estos exones codifican a dominios proteicos que son
característicos al grupo de proteínas producidas a partir del mismo gen y que son
importantes para que las proteínas cumplan su rol, en el caso del Alfa tropomiosina donde
hay 14 exones diferentes y una porción de ellos son constitutivos y otras son alternativas.
Los exámenes alternativos pueden ser incluidos en los mRNA que se produce en las
células del músculo liso que están los exones 2,8 y 14 y en las células del músculo estriado
están los 3, 8, 11 y 12. Por lo que a partir de un gen se producen varios mRNA distintos.
Características evolutivas de exones e intrones

Los genes que comparten un ancestro común tienen organizaciones similares, con la
conservación de las posiciones (de al menos algunos) de los intrones.
Genes de la dihidrofolato reductasa (DHFR) en mamíferos (requerida para la síntesis de
purinas)
En la imagen Se observa el mismo gen pero en 3 especies de mamíferos distintas, si se

analiza la secuencia específica de estos genes y se comparan con las diferencias que hay
en nivel de intrones y exones, se observa que los exones y los intrones se mantienen en
las mismas posiciones en una especie respecto de la otra, los intrones que están en color
rosa varían ampliamente, si bien se mantiene en su posición relativa pueden variar entre
especies en relación a sus tamaños.
Comparaciones de genes relacionados, en diferentes especies, muestran que las

secuencias de los exones se conservan normalmente, pero las secuencias de los intrones
son mucho menos similares. Sólo sus posiciones tienden a ser conservadas.
Se observa que en la familia de las Beta globina de ratón cuando hay nucleótidos idénticos
en un gen y otro hay un punto rojo, se puede ver que en el caso de los exones hay una
coincidencia relativamente alta entre el exón de un gen versus el exón de otro gen, pero
en el caso del exón 2 Se observa que el nivel de coincidencia es mucho más bajo ya que se
observan espacios vacíos,también esas coincidencias son menores en las regiones UTR,
Los intrones evolucionan mucho más rápidamente que los exones. Ello debido a la falta de
presión de selección (positiva) sobre los intrones, a diferencia de los exones, para producir
un polipéptido con una secuencia útil.
Los genes muestran una amplia distribución de tamaños.
En el caso de los mamíferos hay genes que van hasta los 500 pares de base y hasta genes
de hasta 100 kb
La mayoría de los genes no están interrumpidos por la presencia de intrones en eucariotas

unicelulares (ej., Saccharomyces cerevisiae), pero sí lo están en eucariotas multicelulares
Los exones generalmente son cortos. Habitualmente codifican menos de 100 aminoácidos
En especies eucarióticas de distinta naturaleza tienen un rango de exones que se amplía y
se distribuye con distinta amplitud, en humanos tiene hasta 100 nucleótidos de extensión
en cambio las levaduras se distribuyen en tamaños que van desde un nucleótido hasta
cerca de 900 nucleótidos
Los intrones son cortos en eucariotas unicelulares/oligocelulares pero pueden tener

muchos kb en eucariotas multicelulares. La longitud total de un gen está determinada en
gran parte por sus intrones.
Ganancia y pérdida de exones e intrones

● El número de exones e intrones en un genoma está determinado por sus tasas
relativas de ganancia y pérdida a lo largo de un período evolutivo.
● Algunos genes comparten con otros genes sólo algunos de sus exones, lo que
sugiere que a lo largo de la evolución se han ensamblado mediante la adición de
exones que representan "unidades modulares" funcionales para la conformación
de proteínas. Tales exones modulares podrían haberse incorporado en una
variedad de proteínas diferentes y algunas veces corresponden a dominios
funcionales de esas proteínas.
● Podemos explicar algunas de las relaciones entre genes homólogos por la pérdida
de intrones en genes ancestrales, con diferentes intrones que se pierden en
diferentes líneas de descendencia
Pérdida o ganancia de exones

Pueden ocurrir pérdida de exones particulares de un gen o ganancias, mediante procesos
que operan en la duplicación de genes.
intercambio de exones
Hay exones o intrones que se intercambian en el proceso de interacción de las cromátidas

no hermanas, se intercambian entre un cromosoma y otro y pueden generar un cambio a
nivel de un gen entre zonas e intrones en el cual se observan en los genes cuyos exones se
observan en color negro, verde y azul y en el otro gen en verde, morado y amarillo. Puede
ocurrir un Crossing over entre esos dos cromosomas qué va a involucrar un intercambio
de material genético entre dos genes y puede haber una movilización a nivel de los genes
individuales de los exones, se puede tener la ganancia de un intro y la pérdida de una
exon. Puede tener efectos en cuanto a las proteínas que codifican, específicamente los
dominios que conforman la proteína y pueden haber cambios a nivel de la funcionalidad
de un organismo y su adaptación a condiciones ambientales específicas este intercambio
de exones o intrones pueden dar lugar a proteínas que son disfuncionales y desde el
punto de vista evolutivo está asociado a una característica desventajas de un factor de
selección y los individuos que sufrieron ese cambio a nivel de su ADN son eliminados. Por
otro lado la ganancia de un dominio extra podría dar lugar a un fenotipo con
características ventajosas frente a una condición Ambiental de selección, que tiene un
efecto positivo a nivel del individuo ya que son más adaptados a las condiciones
ambientales y pueden transferir esas características a su descendencia.
Exonizacion mediante EGM
El desplazamiento de un elemento genético móvil produce un exón de manera accidental,

este proceso se denomina exonización, un elemento genetico como Alu se transpone en la
región intronica de un gen, pueden ir acumulando mutaciones y eso deriva en la aparición
de un exon que antes no estaba presente y que deriva del elemento genético móvil que se
insertó en ese punto.
Perdida o ganancia de intrones
Por ejemplo se observa el gen de la actina en distintas especies con distintas

características estructurales, en levaduras,nematodos y distintos mamíferos. Se
representan los intrones en los cuadrados grises en el caso de los eucarióticos unicelulares
sus genes tienen pocos intrones y las especies multicelulares se caracterizan por una
mayor presencia de intrones.
Pérdida de intrones
Se observan genes de pollo y rata que codifican a la insulina, en el caso de los pollos están
conformado por tres exones y 2 intrones , el mismo gen comparado en ratas tiene sólo un
intron, Y esto es porque la evolución de aves han producido pérdidas de intrones.
Ganancia de intrones
Hay cuatro mecanismos básicos que indican Cómo se pueden generar estos intrones, a la
izquierda está el efecto que puede tener la transposición de un intron, durante el proceso
de splicing y las secuencias que elimina pueden ser retrotranscritas, que pueden ser
transformadas a un fragmento de DNA dan origen a un intron que anteriormente no tenía
ese intron.
También pueden tener un efecto en la generación de intrones, en el cual un transposon es
insertado en la región codificadora de un gen Qué puede adquirir una funcionalidad
intronica, es probable que coincidan en ese elemento genético móvil y que se transforme
en una región intrónica
Cada vez que se duplican genes también se replican secuencias nucleotídicas particulares
Y si están asociadas a los puntos de diferenciación entre exones e intrones se puede
producir lo que se denomina un sitio de splicing críptico.
también puede haber una transferencia en los segmentos de intrones en el proceso de
recombinación, producto de interacciones anómalas puede transferirse un segmento de
un parálogo a otro, haciendo que uno de esos genes que no tenía el intrón lo tenga.
Modelo de evolución de la estructura de intrones en genes de catalasa en gramíneas.
La evolución de algunas familias génicas puede ser explicado por la pérdida o ganancia de
intrones, se observa la catalasa que transforma el peróxido de H en oxígeno y agua, la
presencia de los tres miembros de los genes que codifican para la catalasa, su
diversificación y presencia en las especies actuales ha estado mediada por eventos de
pérdida de intrones Como por ejemplo la pérdida de los intrones 2,3,5, 6 y 7 llevó a la
generación de los miembros de la familia génica 3, 1 y 2 y la ganancia del intron 4 que
separa a O.sativa y H vulgare del resto de las especies
Tanto las células eucarióticas animales y vegetales existe la similitud de que el ADN está
en el núcleo, hay un genoma extranuclear que se encuentra en organelos específicos
dentro de la célula, las mitocondrias y en caso de las células vegetales también poseen los
cloroplastos donde se encuentra una porción de genoma adicional a las mitocondria.
Genomas extranucleares
Los productos que provienen de la fotosíntesis están basados en el funcionamiento de los

cloroplastos y la utilización de las moléculas energéticas para la producción de energía, y
sustentar el funcionamiento de las células en el cual las mitocondrias tienen un rol en la
utilización de moléculas Como por ejemplo la glucosa que se deriva de manera directa de
procesos fotosintéticos.
Mitocondrias
Número de mitocondrias en células humanas:

● Células nerviosas, musculares y hepáticas poseen > 1.000
● Ovocitos ~ 100.000
Las mitocondrias no son estructuras estáticas. Dentro de una célula, éstas pueden crecer,
fusionarse entre sí o dividirse.
En las mitocondrias ocurren distintos procesos como el ciclo del ácido cítrico, que permite
que ocurra el proceso de la fosforilación oxidativa
Genomas mitocondriales en distintas especies
• El número de copias genómicas varía entre 2 y 10 por mitocondria.

• Diferencias en el tamaño del mtDNA no reflejan necesariamente diferencias en el
contenido de genes. En levaduras por ejemplo, existen genes con intrones y regiones
intergénicas amplias.
• La forma del mtDNA varía considerablemente. En humanos y otros animales es circular.
Sin embargo, en la mayoría de los hongos y plantas es lineal.
Contenido de los genomas mitocondriales en distintas especies
Codifican para distintos tipos de proteínas y RNA no codificantes, especies como los
humanos tenemos un total de 37 genes y un tamaño de 17 kb de extensión.
DNA mitocondrial (mtDNAo ADNmt)

• DNA circular
• 37 genes
• Genoma compacto
• Genes contiguos (en algunos casos levemente superpuestos)
• Genes sin intrones
Se observan donde están codificadas proteínas como la citocromo oxidasa, la ATP sintasa.
Las mitocondrias tienen su propio sistema de traducción.

Al igual que en las bacterias, la traducción es iniciada con una N-formil-metionina (a
través de un tRNAfMet).
En humanos cinco tipos de tripletes del mtDNA se usan de manera diferente que en el
DNA genómico.
El triplete UGA asociado a un codon de termino en humanos en el DNA mitocondrial

codifica a un triptofano.
Ningún código genético mitocondrial funciona en todos los organismos por igual. Las
mitocondrias de las plantas superiores usan el código universal.
Cloroplastos
Los cloroplastos existen en plantas y algas.
En maíz cada célula de hoja contiene de 40 a 50 cloroplastos (500,000 /mm2 ).
Una función propia de los cloroplastos es la que permite transformar el co2 en moléculas
azucaradas mediante la presencia de luz.
Genomas cloroplásticos (cpDNA)
Los cloroplastos contienen de 15 a 20 copias de su genoma.

• Genomas relativamente más uniformes en tamaño que el de las mitocondrias.
• El cpDNA contiene muchos más genes que el mtDNA.
• Genes con relativamente poco espaciamiento entre ellos.
• Contienen intrones.
• Aunque algunos son circulares, muchos cpDNA existen en formas lineales y ramificadas.
Se observa cómo está conformado el genoma cloroplástico de Marchantia Polymorpha

que es una planta hepática, es una especie de las más antiguas no tienen un sistema
vascular como plantas superiores, en los espacios se observan los intrones, hay algunos
genes que codifican para proteínas ribosomales o que codifican para enzimas relacionadas
con la fotosíntesis como la rubisco, fundamental para la fijación del carbono gaseoso.
Patrones de herencia
La herencia de los genes de mitocondrias y cloroplastos sigue reglas diferentes a las de los
genes nucleares.
• La segregación meiótica no está involucrada.
• Es uniparental (y a menudo materna, en caso de humanos).
• La herencia materna de los organelos es a menudo una consecuencia del mayor tamaño
de los gametos femeninos respecto de los masculinos.
• Los genes extranucleares no tienen una relación física (de posición) con el DNA nuclear.
En el caso de los humanos, durante la fecundación, sólo el núcleo de los espermatozoides

entra al óvulo. Debido a ello, todas las mitocondrias de una persona provienen de su
madre. Si bien los espermatozoides tienen mitocondrias, son los ovocitos lo que aportan
una mayor cantidad de mitocondrias y son estas las que se mantienen en etapas
posteriores a la fecundación debido a que en el momento de la fecundación las
mitocondrias que están en el espermatozoide quedan fuera del cigoto, y es el genoma
nuclear y el que se fusiona con el genoma nuclear del ovocito. Se puede hacer un
seguimiento de las generaciones anteriores a una generación particular humana con
bastante precisión porque prácticamente ese ADN no tiene cambios, al igual que se
transmiten muchas enfermedades de la madre.
Evolución
teoría endosimbionte (simbiogénesis)
Sostiene que los organelos que distinguen a las células eucariotas evolucionaron a partir
de la simbiosis de procariotas individuales unicelulares
Las células primitivas que incorporaron una célula bacteriana, similar a las mitocondrias o
cloroplastos, habrían adquirido una ventaja tremenda en la competencia por la
producción de energía, permitiendo la evolución hacia los eucariotas complejos.
Evidencia molecular que apoya la teoría endosimbionte:

1. Mitocondrias y cloroplastos tienen su propio DNA, el cual se replica
independientemente del genoma nuclear.
2. Al igual que el DNA bacteriano, el mtDNA y el cpDNA no están organizados en
nucleosomas.
3. La expresión génica mitocondrial utiliza N-formil metionina en la traducción, que las
hace similar a las bacterias.
4. La semejanza entre los genes y rRNA bacterianos y el de mitocondrias y cloroplastos.
Hay una célula a central procariótica que en algún momento produjo una cierta
diferenciación de estructuras celulares que dio origen a un núcleo separado del resto del
citoplasma, posteriormente en algún momento de la evolución esa célula ancestral
introdujo por endosimbiosis a bacterias que eran independientes y al momento de
integrarlas a su citoplasma incorporó las características funcionales de esas bacterias y
confirió una ventaja adaptativa desde el punto de vista de generación de energía, luego
estas células ancestrales incorporaron células procarióticas con la capacidad de hacer
fotosíntesis que con el paso de los años dieron origen a los cloroplastos.
Los análisis de secuencias sugieren que los genomas mitocondriales derivan de un

ancestro común de las actuales bacterias púrpura no sulfurosas (Gram negativas),
mientras que los genomas de cloroplastos se derivan de cianobacterias.
Se estima que el (los) evento(s) endosimbiótico(s) que originaron las mitocondrias y
cloroplastos ocurrieron alrededor de 2.000 y 1.500 millones de años atrás,
respectivamente.
En todos los organismos, los genes nucleares codifican la mayoría de las proteínas
necesarias para la expresión de genes en mitocondrias y cloroplastos.
Mitocondrias y cloroplastos no contienen genes para todas las proteínas que necesitan
para funcionar y reproducirse, por lo que deben importar moléculas desde el citoplasma.
Por lo tanto, no pueden existir independientemente de las células en las que se
encuentran.

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Clase 1 – 28 Abril

Aumento y reducción del genoma

Diferencias entre genomas procariotas y eucariotas

Evolución de los genomas

En general, las comparaciones de eucariotas a procariotas, eucariotas multicelulares a

¿Qué factores pueden expandir un genoma?

El numero de cromosomas también puede variar respecto de la cantidad de copias

Poliploidización. Aumento del número de copias del conjunto completo de

¿Qué pasa en humanos?

Especiación por autopoliploidía

Especiación por alopoliploidía. Se produce cuando el genoma poliploide se origina de

2. Elementos genéticos móviles

Fueron descubiertos en la década del 50 por Barbara McClintock estudiando maíz.

Los EGM se dividen en dos grupos principales, de acuerdo al tipo de mecanismo de

Transposones de DNA Retrotransposones

Transposones de DNA (EGM Clase II)

Retrotransposones (EGM Clase I)

Composición del genoma humano

¿Cómo contribuyen los elementos genéticos móviles (EGM) a la evolución del

Como hay múltiples copias de EGMs similares esto produce:

La Inserción de EGMs puede generar en:

La recombinación entre fragmentos cromosómicos no homólogos, recombinación no

Transferencia horizontal de genes (principalmente en procariontes)

¿Qué factores pueden reducir un genoma?

La recombinación entre fragmentos cromosómicos no homólogos (recombinación no

Reducción de genomas en bacterias endosimbiontes

¿Cuáles son sus efectos evolutivos?

Aumento y reducción del genoma.

Evolución de los genomas

Generación de inserciones y deleciones (Indels) dependiendo de que hebra es la

Mutaciones de repetición de tripletes

En la imagen se ve como en la parte de arriba el gen tiene una extensión de 35

Las aneuploidías ocurren por la no disyunción cromosómica.

Hay una serie de síndromes que están asociados a desbalances o aneuploidías y

Síndrome de Down (Trisomía del par 21)

Síndrome XYY (47, XYY; síndrome de Jacob)

Deleciones, duplicaciones, cromosomas anillo e isocromosomas

1) Duplicación del genoma completo: A lo largo del tiempo ocurren procesos de

La duplicación de genes ha desempeñado un papel importante en el desarrollo de vida

Mecanismo de duplicación génica

*Crossing over desigual, intercambio desigual de cromáticas hermanas y

B) Intercambio desigual de cromátidas hermanas

Se produce por presencia de una transcriptasa reversa de virus.

Destino de los genes duplicados

La duplicación de genes, seguida por la divergencia de las copias génicas, debido a la

Clasificación según el efecto en la traducción

2) Sinónima: mutación silenciosa (no hay cambio en la secuencia aminoacídica).

No funcionalización (desfuncionalización o pseudogenización de genes)

1) Pseudogen convencional (clásico): Un gen duplicado que se ha inactivado

2) Pseudogen procesado: Un pseudogen que resulta de la integración de un

Pseudogenización y pérdida de genes

Ejemplos de familias génicas humanas

Se estima que el genoma humano posee alrededor de 20.000 pseudogenes.

Corresponde a la pérdida parcial de funciones de genes duplicados, producto de su

En la imagen se ve un gen con la región codificadora en rosado y la región promotora

Es un mecanismo que mantiene la copia duplicada de un gen. Implica un aumento en

La duplicación ha tenido un impacto importante como mecanismo de diversificación y

ELEMENTOS GENÉTICOS MÓVILES

Los elementos transponibles o elementos genéticos móviles son los responsables de