Acidos Nucleicos Completo
Acidos Nucleicos Completo
Acidos Nucleicos Completo
VIII
PARTE 1
Las células eucariotas son de un nivel de especialización mayor que las células procariotas, el hecho de que las
procariotas tengan el material genético disperso hace que cuando ellas se dividan puedan tener más errores en
su transcripción, replicación en la formación de nuevas células, mientras que las eucariotas son más precisas y
exactas en su proceso debido a su alto nivel de especialización que las hace de mejor estructura es relación con
las procariotas.
Ácidos nucleicos:
Los ácidos nucleicos contienen la información genética de una célula, cada especie tiene una formación
genética, sin embargo el ADN de un individuo u organismo es el mismo en todas las células que lo forman.
( es
decir si tomamos una neurona, glóbulo blanco, rojo.. todos van a contener el mismo ADN) Las modificaciones
ocurren en las especies.
ADN: Presente principalmente en el núcleo de la célula. También se localiza en las mitocondrias (recordar que
la mitocondria se encuentra en el citoplasma), siendo este de origen materno.
ARN: La mayor cantidad se encuentra en el citoplasma y una pequeña parte en el núcleo. (ARNm tiene una
información que la toma del núcleo y la lleva al citoplasma)
NUCLEOTIDOS:
Conforman los AN
Está formado por 3 cosas:
1. 1. Azúcar: que es una ribosa, pentosa de 5 atomos de
carbono.
2. 1 Bases nitrogenadas que son de dos tipos Puricas
y Pirimidinicas. En total son 5 BN.
3. 1. Grupo fosfato
AZUCAR:
Lo que ocurre es que la ribosa en el carbono 2 cuando esta mantiene el grupo hidroxilo (oh) es ribosa. Pero
cuando el grupo OH pierde el oxígeno y queda el hidrogeno va a ser desoxirribosa.
El ADN SOLO tendrá un hidrogeno en el carbono 2
Mientras el ARN va a tener un grupo OH en el carbono
2
Abreviatura A G U T C
Base Adenina Guanina Uracilo Timidina Citosina
Nucleosido Adenosina Guanosina Uridina Timidina Citidina
Nucleótido Adenilato Guanilato Uridilato Timidilato Citidilato
(Nucleosido Adenosina 5 Guanisina 5 Uridina 5 Timidina 5 Citidina 5
monofosfato, monofosfato monofosfato(GMP) monofofato monofosfato(TMP) monofosfato
NMP) (AMP) (UMP) (CMP)
FORMACION DE UN POLINUCLEOTIDO:
Estructura Primaria:
Una hebra de ADN es un polímero lineal con direccionalidad de
un extremo a otro.
Por convenio se leen las moléculas en dirección 5 3
“secuencia de nucleótidos”.
UNIDAD VIII A.N PARTE 2
El ADN está conformada por 2 hebras.
(01:28) ADN: Depositario de la información Genética
En 1868 se hicieron los Primeros estudios químicos sistemáticos del
núcleo celular, por parte de Friedrich Miescher.
-Se realizo el Aislamiento de una sustancia que contenia fosforo,
llamada nucleina, a partir del pus de vendajes quirurgicos. La
nucleina tenia una porcion acidica (actualmene ADN) y una
proteica.
-Se observo nucleina presente en las cabezas de los espermatozoides
de salmon.
-Se sospechaba que lo que estaba adentro de esa parte proteica de la nucleina estaba asociada con la herencia
celular.
(02:16) Luego en 1949, se describieron postulados por Erwin Chargaff:
1. La composicion de las bases nitrogenadas de ADN varia de una especie a otra.
2. El ADN de tejidos dieferentes de un mismo organismo tiene la misma composicion de bases.
3. La composicion de las bases no varia con la edad, estado nutricional ni el ambiente.
4. Independientemente de la especie, siemprela cantidad de denina y guanina (Purinas) va a ser igual a la
cantidad de Timina y Citosina (Pirimidinas)
5. El % de Adeninas es igual al de Timina. Asi como el % de Guanina es igual al % de Citosina.
(03:22) En 1950, Rosalin Franklin y Maurice Wilkins, haciendo
investigaciones para tratar de indentificar que habia dentro del nucleo,
estudiaban la estructura del ADN con difraccion de rayos X.
Obtuvieron una imagen clave para dilucidar la estructura del ADN, la cual
tenia 4 astas similar a una imagen en X, lo que les hizo pensar que la
molecula de ADN podia tener una estructura helicoidal. (Dieron las primeras
ideas de que la estructura podia ser helicoidal)
Finalmente, hacia 1953, James Watson y Francis Crick postulan el modelo
tridimensional para la estructura del ADN, el cual se mantiene hasta la actualidad. Recibieron el premio Nobel
de Medicina en 1962, junto a Wilkins, por dilucidar la estructura 2daria del ADN (Pinches hombres excluyeron
a la Rosalin,ojala le haya jalado las patas a esos bichos).
MODELO DE WATSON Y CRICK (05:17)
Watson y Crick concluyen que:
-La molecula de ADN es de 2 hebras de disposicion espacial helicoidal.
-Estan estabilizadas por puentes de H (A-T-C-G) entre las bases que se apilan una sobre la otra
perpendicular al eje de las helices (Interaccion de Van der Waals) con una rotacion de 36°.
Las hebras quedan hacia el lado externo, y cuando se disponen las 2 hebras para enrrollarse, las
BN se orientan hacia el interior de la cadena (Recordar que las BN son hidrofobicas, son
anillos), mientras que los fosfatos se van a disponer hacia el exterior y entran en contacto con el
medio acuoso en el que estan. Ademas de los puentes de H, al momento del enrollamiento hay
una estabilidad por las interacciones electrostaicas de las interacciones de Van de Waals que
ayuden a mantener la estabilidad.
-La distancia de repeticiones es de aprox. 3,4 nm, es decir, la distancia entre una base y la siguiente es de aprox.
0,34nm
-Existen 10 residuos de bases por vuelta
Estructura Secundaria del ADN (08:03)
Se debe tener en cuenta que se tiene una hebra donde con un exremo
5’ y otro extremo 3’.
En la imagen, la porcion transparente es la ribosa, y las rayitas azules
son los puentes, estos ueden romperse, y ciando eso sucede la
molecula se separa (se que es obvio pero igual lo anoto xD).
(NOTA: Ubiquense en la primera linea, a la profe no se le veia el cursor)
De la hebra ubicada a la izquierda, hacia el interior (de izq a der),
enlazada al C1, esta la base nitrogenada (En la imagen corresponde a
una citosina).
A la derecha esta la 2da hebra, se observa una base nitrogenada que tienen 2 anillos (G= Guanina)
Los grupos fosfato estan hacia la parte externa, y las BN hacia el interior. Para que esas 2 hebras se enlacen, se
forman puentes entre las bases nitrogenadas: SIEMPRE, Citosina y Guanina se van a enlazar con 3 puentes de
H, mientras que Adenina y Timina se van a enlazar con 2 puentes, por lo tanto los enlaces C-G van a ser algo
mas fuertes que los de A-T.
Caracteristicas:
-Hebras antiparalelas
-Bases Internas (Recordar que son anillos, y siemrpre donde hay anillos son estructuras hirdrofobicas)
-Azucar en el centro
-Fosfato externo
(10:16) A la estructura secundaria del ADN se le describe complementariedad. La complementariedad es
fundamental en la molecula como portadora de la informacion genetica. Las hebras son complementarias
porque SIEMPRE citosina se va a enlazar con guanina (o viceversa, y
siempre adenina con timina, y esto siempre se va a dar de la
misma manera.
Antiparalelismo: Otro aspecto a tener en cuenta es que una
hebra esta en sentido 5’ – 3’, pero la otra hebra esta en sentido
3’ – 5’. Las hebras a pesar de estar ubicadas paralelas una respecto
a la otra, tienen direcciones opuestas, por lo que se describen de
forma ANTIPARALELA.
Por lo tanto, la estructura 2daria del ADN es complementaria
pero antiparalela.
Aunque las moleculas esten formadas por las 2 hebras unidas, en
algun momento, ellas se pueden separar y para ello se deben roper
los enlaces de hidrogeno que une una hebra con la otra.
Coplanariedad, apilamiento de las bases y carácter hidrofobico. (15:58)
-Las bases se encuentran dirgidas hacia el interior de la doble helice, superpuestas (Se giran a la derecha y
comienzan a apretarse, similar a lo que ocurre con un cordon de zapato)
-Forman un apilamiento similar a un monton de monedas (Parte central de las bases). Como consecuencia de
las proximidades y paralelismo de los anillos aromaticos, se originan entre ellas fuerzas de atraccion de tipo
Van der Waals (Fuerzas hidrofobicas), contribuyendo a la estabilidad de la molecula y la proteccion de la
informacion genetica.
Superficie de la Molecula: Surcos en el ADN (17:18), se describen 2: un surco
mayor y otro menor.
Variacion de la Estructura Secundaria (17:51)
Aun cuando la estructura secundaria matiene sus fosforos en la parte externa, las
BN apiladas en el centro de la molecula, tiene disposiciones diferentes:
FORMA A: Predomina en soluciones deshidratadas. En este caso la molecula es
dextrogira, es mas ancha y corta que la forma B y tiene 11 pares de base por
vuelta (Acepta 1 par de bases mas).
FORMA B: Estructura de Watson y Crick. ES la mas estable que adopta el ADN
en condiciones fisiologicas. Se le describe surco mayor y surco menor.
FORMA Z: La rotacion de la helice es levogira ( a la izq). Contiene 12 pares de
base por vuelta y la estructura es las mas estrecha y larga. (Recordar la iZquierda
tiene Z, la forma Z gira a la izquierda).
NOTA: NO SE HAN ENCONTRADO LA FORMA A A NIVEL CELULAR, PERO SI LA FORMA Z
VARIANTES LOCALES DE LA ESTRUCTURA SECUNDRIA B-
ADN (19:55)
Palíndromo: Es toda frase que puede deletrearse igual de izquierda a
derecha y de derecha a izquierda. (Ej: radar).
Secuencia Palindromica: En biologia molecular una secuencia es
palindromica cuando la secuencia de una hebra, leida de izq a derecha,
es igual que la de la otra hebra leida de derecha a izquierda. Por lo que
se puede observar en las 2 cadenas cojuntamente.
Se conserva el paralelismo y la complementariedad.
La secuencia palindromica puede encontrarse en las cadenas complementarias (la secuencia presente en las 2
hebras), o peuden encontrarse en la misma hebra (con secuencias repetidas).
22:18
Como siempre se va a dar el enlace de Timina con adenina, y citosina
con Guanina, en algun momento dado dichos palindromos pueden
generar modificaciones en la estructura.
ES decir, una hebra que esta plana puede hacer un bucle, porque las
bases se pueden unir. Por lo tanto una hebra que es larga en algun
momento puede tener esas formas o estucturas de Bucle. Se conoce
como Palindromos Interrumpidos de Hebra Sencilla.
Basado en eso, se tienen los Palindromes interrumpidos de doble hebra, donde se tienen las hebras normales
y luego se generan los bucles en ambas hebras, y adopta una forma Cruciforme.
ESTRUCTURA TERCIARIA O DE ORDEN SUPERIOR
La estrcutura Terciaria es lo suficientemente compacta para acomodar el ADN dentro del nucleo.
LA ESTRUCTURA TERCIARIA adopta una CONFIGURACION DE ORDEN SUPERIOR dando lugar
a los cromosomas.
25:22
La capacidad del ADN de poder alojarse en el nucleo,
se debe al superenrollamiento
En la imagen se observan un circulos verdes muy
pequeños, que corresponden a las Histonas, estas
permiten que la hebra se enrrolle (se enrollan sobre las
histonas) y forman el nucleosoma.
Los nucleosomas se van compactando, superenrollando
y organizando perfectamente hasta qu queden
compactos formando la Cromatina y el cromosoma.
Si en un organismo diploide todo el ADN de un
cromosoma se extiende, se obtendria una longitud de
2m.
27:01 Recordar que la estructura terciaria es una estructura de orden superior, y que tiene que ver con el
enrollamiento y superenrollamiento (similar al cordon de zapato). El superenrollamiento genera una fuerza, si se
quiere separar se debe generar una fuerza importante para lograr separarlo y que se quede estable, eso ocurre
por una accion de una serie de enzimas que van ayudar a desenrollar la molecula eliminandola fuerza de torsion
que e genera dentro de la molecula para que ella se qeude abierta y de manera estable.
¿Cómo se alivia la tension que se produce in vivo cuando se desenrolla una parte del ADN y se incrementa el
superenrollamiento?
Mediante Enzimas denoinadas TOPOISOMERASAS.
Estas eliminan la fuerza de torsion de algun lugar del ADN para que ella pueda abrirse o separarse
Parte 3 AN
Recordar que el ADN está dentro del núcleo y este último contiene la información Genética. Al comenzar a
extender los cromosomas se observa en su estructura las Histonas, sobre las cuales se enrolla la molécula de
ADN para que pueda disponerse de manera perfecta. Existen proteínas Histonas y proteínas No Histonas, y la
unión de esta con el ADN forma el Nucleosoma.
Nucleosoma Contiene: Parte de la hebra de ADN con una proteína central.
GEN: Fracción de la cadena de ADN.
CONDENSACION DEL ADN (Nucleoproteínas) 02:53
También se le llama nucleoproteína por la composición (Ácidos Nucleicos + Proteínas). Esto permite que al
ADN se le describan distintos niveles de condensación.
Cromatina: Complejo de ADN, Histonas y proteínas no histonas a partir de las cuales se forman los cromosomas.
Las Histonas son proteínas que estabilizan la estructura del ADN, contienen un elevado contenido de AAs básicos
(Arginina y Lisina)
Tipos de Histonas: H1, H2A, H2B, H3, H4
En relación a los niveles de condensación.
1. La forma más simple es la Doble Hélice
2. Luego, se dispone como un collar de Cromatina, donde
comienza a unirse con las proteínas y comienza a formar
una especie de collar.
3. Luego, las proteínas se acomodan y condensan en una
estructura mayor y formar los Nucleosomas. (Estas
proteínas se agregan entre ellas para dar la estructura
mayor)
Pueden formarse los Bucles.
4. Se describen los espirales condensados. Siguen teniendo un
superenrollamiento y superdisposición uno sobre otro, y se
mantienen perfectamente alineados.
5. Cromosoma
PRIMER NIVEL DE CONDENSACION DE LA CROMATINA
(06:46)
EL NUCLEOSOMA CONSTITUYE LA UNIDAD
ESTRUCTURAL DE LA CROMATINA. (Por
favor, no lo olviden, soñare con esto: Nucleosoma=
Proteínas MAS hebra de ADN). Los nucleosomas
unidos forman una estructura mayor.
ESTÁ FORMADO POR UN NÚCLEO PROTÉICO (DE 9 HISTONAS)
RODEADO POR ADN (146 pb)
Lo primero que se forma es el Nucleosoma, luego en otro nivel de condensación esta la cromatina, y en otro
nivel de condensación está el cromosoma.
A medida que se van enrollando, adoptan una secuencia similar a un rosario.
Una vez formados los nucleosomas, comienzan a agruparse formando una estructura
mayor, más gruesa, se le llama fibra, y se le observa con un grosor mayor (30nm).
GENES (09:55)
GEN: Es la secuencia de ADN necesaria para la síntesis de un producto génico funcional (Proteína o
ARN). Recuerden la PRIMERA unidad Niñas: Las enzimas, el colágeno, las IgG son proteínas.
La información Genética que está dentro del Gen, va a ser la secuencia de las bases nitrogenadas que conforman
el nucleótido y es lo que permite generar una información para sintetizar una proteína, pudiendo ser insulina,
enzimas necesarias para el metabolismo. Por lo tanto la información genética va a ser la información que estará
a disposición para posterior generar la síntesis de una molécula de ARN o de una proteína (acuérdense que el
ARN es codificado en el ribosoma para sintetizar las proteínas muchachonas).
Composición de un gen: Conformado por 2 partes:
• Intrones: Segmentos de ADN no traducidos (no codificantes). No generan
ninguna información. (Es el Intruso que no tiene código =no codifica)
• Exones: Segmentos codificantes de la cadena de ADN, si generan
información que va a generar la producción de un elemento funcional.
Radiación (20:48)
La radiación UV produce la condensación de 2 grupos Formación de dímeros de
etileno para formar un anillo de ciclobutano. pirimidina inducida por la luz
Los Ácidos Débiles respetan los enlaces fosfodiester pero rompe los N-glicosidicos. En este caso se
mantiene la estructura lineal de la hebra de ADN pero sin las bases nitrogenadas porque este rompe los
enlaces N-glucosidicos.
Recuerden que el ADN contiene desoxirribosa, lo que la hace más estable ante un álcalis o base,
mientras que si va a ser susceptible la Ribosa porque tiene un OH, de allí a que se rompan los enlaces
fosfodiester del ARN, mientras que mantiene estable a la molécula de ADN.
De igual manera va a permitir conocer la secuencia porque esta hidrolisis no rompe los enlaces N-
glucosidicos.
Sintesis de Novo: Síntesis de nucleótidos de purinas y pirimidinas a partir de precursores de bajo peso
molecular (sencillos) (aminoácidos, ribosa-5-fosfato, CO2 y NH3).
OJO: Ni los nucleótidos ni las bases son necesarios para satisfacer los requerimientos nutricionales
Esto estaba en las diapos que me pasaron: A diferencias de las demás clases de metabolitos que hemos
encontrado, ni los nucleótidos ni las bases son necesarios para satisfacer los requerimientos
nutricionales. La mayoría de los organismos puede sintetizar nucleótidos de purina y pirimidina a partir
de precursores de bajo peso molecular, en cantidades suficientes para satisfacer sus necesidades. Estas
son las rutas conocida como de novo y son prácticamente idénticas en todo el mundo biológico. O
también puede provenir de la ruta de salvamento que ensambla los nucleótidos a partir de sus
constituyentes provenientes de la dieta o degradación enzimática de los A.N.
BQ AN PARTE 4
METABOLISMO DE LOS NUCLEOTIDOS
Existen 2 rutas metabólicas de los Nucleotidos: RUTA DE NOVO Y DE SALVAMENTO
1. Síntesis de Novo: Síntesis de nucleótidos de purinas y pirimidinas a partir de precursores de bajo peso
molecular (más sencillos) (aminoácidos, ribosa-5-fosfato, CO2 y NH3). ES UNA NUEVA SINTESIS
2. Rutas de Recuperación o de Salvamento: Síntesis de nucleótidos a partir de bases o nucleósidos que
se dispone por haberlos obtenidos tras la digestión extracelular de A.N ingeridos en el alimento o por
degradación de A.N. por muerte celular. Hay una degradación de nucleótidos que se van a reutilizar para
volver a sintetizar nucleótidos.
(Cuando ingerimos un trozo de carne, o vegetales, estamos consumiendo células. Al ingerir la carne
tenemos las fibras musculares y tenemos el miocito. Todas las células en su interior contienen ácidos
nucleicos. Una vez que ocurre el proceso de digestión, ocurre la degradación celular y vamos a tener
disponibles esos ácidos nucleicos que están en el interior del núcleo)
También tiene lugar la muerte celular, no todos los tejidos son de recambio rápidos, pero tenemos
tejidos que tienen un mayor recambio celular y el organismo tiene que terminar de eliminar esas células
muertas y degradar esos detritos celulares. Cuando ocurre esa muerte celular, esa célula contiene en el
interior de su núcleo ácidos nucleicos que van a estar disponibles para hacer una nueva síntesis o
terminar de ser degradados, todo dependerá de las necesidades orgánicas del organismo.
OJO: Ni los nucleótidos ni las bases son necesarios para satisfacer los requerimientos nutricionales o
energéticas del organismo, aun cuando es un metabolismo y generan un producto final, energéticamente no
aportan ningún tipo de energía al organismo.
En ninguna de las 2 formas los nucleótidos satisfacen las necesidades energéticas
Esto estaba en las diapos que me pasaron:.La mayoría de los organismos puede sintetizar nucleótidos de
purina y pirimidina a partir de precursores de bajo peso molecular, en cantidades suficientes para satisfacer sus
necesidades. Estas son las rutas conocida como de novo y son prácticamente idénticas en todo el mundo
biológico. O también puede provenir de la ruta de salvamento que ensambla los nucleótidos a partir de sus
constituyentes provenientes de la dieta o degradación enzimática de los A.N.
DEGRADACION DE LOS ACIDOS NUCLEICOS E
IMPORTANCIA DEL SALVAMENTO DE NUCLEOTIDOS
(03:43)
Esta degradacion puede producirse intracelularmente, bien sea un
recambio de ARNm o una reparación del ADN que puede ocurrir
por muerte celular o por ingestión.
En el caso de los animales, proviene principalmente de la
ingestión, y la degradación es muy similar a la digestión proteica,
donde ocurre al inicio una fragmentación.
La fragmentación se inicia en los enlaces internos (fosfodiéster)
por endonucleasas pancreáticas (son ribonucleasas y/o
desoxiribonucleasas) que actúan en el intestino delgado, y van a
generar oligonucleotidos.
Los oligonucleotidos resultantes se degradan por sus extremo por enzimas inespecíficas llamadas
fosfodiesterasas; que originan como producto mononucleotidos (pueden ser nucleósidos 5 fosfato o 3
monofosfato dependiendo de donde la enzima haya cortado el enlace fosfodiester).
Los nucleótidos pueden luego fragmentarse por nucleotidasa para dar ortofosfato y dejar el correspondiente
nucleósidos. Este nucleósido va a ser fragmentado luego por una fosforilasa (que al igual que la glucógeno
fosforilasa) la nucleótido fosforilasa, que puede romper el enlace glucosídico mediante la adicción de un Pi
originando la base nitrogenada correspondiente (nucleobase) y la ribosa1Pi.
Si las nucleobases no se llegan a utilizar a través de la ruta de salvamento continúan degradándose hasta generar
2 elementos: ácido úrico (en el caso de las purinas) y ureidopropionato (pirimidina).
En el caso de que las nucleobases vayan a ser utilizadas para sintetizar estructuras más complejas, se utiliza un
compuesto que se denomina PRPP, con intervención de la enzima fosforibosil transferasa.
PRPP: Metabolito Central en las Rutas de NOVO de los anillos de purinas y pirimidinas (07:12)
Clase 5
(00:22) Las primeras enzimas en actuar serán las nucleotidasas donde en el AMP le van a quitar su
grupo fosfato y va a quedar Adenosina. En el caso de GMP, actúa esta misma enzima
(nucleotidasa), quita el fosforo y queda guanosina.
Para efectos del AMP, luego que dijimos que quedaba una adesonina. Va a aparecer la adenosina
deshidratasa que va a liberar un grupo amino y quedará como inosina
Tenemos también otra opción donde en el caso del AMP pierde a su grupo amino por una
desaminasa y forma igualmente el IMP
Luego de quedar como Inosina, mediante una nucleosido fosforilasa libera la ribosa 1 fosfato
y queda entonces HIPOXANTINA
En caso del GMP, cuando queda en guanosina mediante una fosforilasa va a liberar el grupo ribosa
con el fosfato y sale Ribosa 1 fosfato y queda como GUANINA
Luego esta guanina por una guanina desaminasa pierde otro grupo amino y queda finalmente
XANTINA
La HIPOXANTINA por medio de una xantina oxidasa se transforma en xantina y esta nuevamente
por la xantina oxidasa que utiliza oxígeno y forma peróxido y se va a formar ácido úrico
¿Qué sucede? Si no tenemos la enzima xantina oxidasa por alguna razón se acumulan los
productos previos a él
Etiología de la gota
o Una actividad elevada de la PRPP sintetasa, pérdida de la sensibilidad a la retroinhibición
ejercida por los nucleótidos de purina por lo tanto tendré un aumento de la degradación de
ellos y aumenta la excreción o como producto final la concentración de ácido úrico.
o Pueden haber mutaciones de la PRPP aminotransferasa, pérdida del control por
retroalimentación
o Puede haber también disminución de la enzima hipoxantina guanina fosforribosiltransferasa
(HGPRT)
o Deterioro en la excreción renal de ácido úrico
o La gota puede ser una consecuencia de quimioterapia del cáncer o terapias oncológicas.
Toda situación donde se produzca lisis celular, habrá un aumento de productos de desechos
y todas las células tienen núcleo y tienen nucleoproteínas.
o Pues toda esa cantidad de ácidos nucleicos contenidos en esas células que están malas o
muertas tienen que degradarse. Un paciente oncológico presenta un aumento o
elevación del ácido úrico
Tratamiento para la gota: Alopurinol. Que es un análogo estructural de la hipoxantina que inhibe a
la xantina oxidasa para que no produzca ácido úrico y se quede como xantina.
Esto hace que se acumule xantina y por ser soluble puede excretarse por riñon.
Esto comienza por la unión de una molécula de amoniaco y CO2 en esta primera
reacción que estará a cargo por la enzima Carbamoilfosfato sintetasa II y se formará el
carmaboil fostato, esta reacción utiliza dos moléculas de ATP
Al Carbamoil fosfato se le va a unir una molécula de aspartato, donde actuará la
enzima aspartato transcarbamoilasa y formará el compuesto carbamoil fosfato
Del carbamoil fosfato va a ocurrir una deshidratación, se le conoce como la tercera reacción
y se libera una molécula de agua y la enzima que interviene en este caso es la
dihidrooratasa y forma el dihidrooratato
Luego ocurre una reducción que va a utilizar una deshidrogenación que va a utilizar el
NAD+ como transportador de los equivalentes, la enzima que actúa en este proceso es la
dihidroorotato deshidrogenasa y formará orotato
(09:56) Del orotato vemos un anillo pero aquí no tenemos la ribosa ni el fosforo. Por lo que una de
las diferencias de la síntesis de purinas ya comenzábamos con el PRPP y allí en su base teníamos
la ribosa y el fosfato mientras que la síntesis de la pirimidinas estamos sintetizando de inicio el
anillo y todavía no tenemos a la ribosa
- Carbamoilfosfato sintetasa II
Estas enzimas conforman un sistema
- aspartato transcarbamoilasa
multienzimático, es decir, una mega
- dihidroorotato deshidrogenasa
enzima que tiene esas 3 enzimas asociadas
Más tarde, el UTP se va a convertir en CTP mediante la enzima CTP sintetasa (cintocina fosfato),
tiene 3 fosfatos.
En esta última reacción podemos ver la glutamina que va a aportar un grupo nitrogenado y sale
como glutamato y se utilizó una molécula de ATP
Ya tenemos sintetizado la CTP que es una de las bases nitrogenadas del tipo de pirimidinas.
Los intermediarios del catabolismo de pirimidinas son hidrosolubles por lo que existen pocas
alteraciones conocidas
Acidurias oróticas
1. Tipo I: deficiencia de orotato fosforribosiltransferasa y orotidilato descarboxilasa
2. Tipo II: deficiencia de orotidilato descarboxilasa
3. OTRO TIPO: se observa en el Síndrome de Reyes, disfunción mitocondrial en la utilización
del carbamoil fosfato, aumentando su disponibilidad en citosol para producir ácido úrico.
Deficiencia de transcarbamoilasa de ornitina (ciclo de la urea)
o ATP Adenina
o GTP Guanina
o UTP Uridina
o CTP Citosina
Esta faltando TTP y esta faltando convertirlos a la forma DESOXI, para que puedan formar parte de
la cadena de ADN
(15:51) Esquema
Aquí vemos como teníamos los 4 ribonucleotidos que luego por la acción de la rNP
reductasa ya salieron todos como desoxirribonucleotidos porque tienen solamente dos
fosfatos que luego se van a fosforilar y van a generar entonces el desoxiribonucleotido con
sus tres fosfatos
Igual con el Uracilo, la citosina, la guanina y la adenina seguimos pendiente con la
timina…
La síntesis de dTMP a partir de dUMP permite mantener bajas las concentraciones de dUTP, el cual
podrías ser incorporado erróneamente en ADN por la ADN polimerasa.
(19:07) aquí tenemos la acción de la timidilato sintasa que va a formar timidina pero utiliza el
tetrahidrofolato
THF: tetrahidrofolato, derivado del ácido fólico, transfiere un grupo metilo al dUMP
(20:42) en la parte de replicación vemos la molécula original de ADN, que sabemos forma parte
del cromosoma, la hebra en cualquier momento se va a replicar y se va a separar en dos hebras y da
origen a dos nuevas hebras donde la que se ve en rojo es la nueva, y se mantiene la hebra madre que
es la azul
Luego en la transcripción fíjense como tenemos esta hebra de ADN, vemos el ARN
polimerasa, una súper gran enzima que rueda como un cierre en la cadena de ADN y en su
proceso de desplazamiento sale una cuerdita que representa el ARN, continúa
desplazándose y va a soltar finalmente una hebra de ARN, la enzima ARNm polimerasa
está suelta y quedó indemne la molécula de ADN pero esta molécula de ARN como se
copio de manera fiel a una de las hebras, esta molécula de ARN tiene información
genética que es exacta a la que está adentro la molécula de ADN
Luego ese ARN va a servir para el proceso de traducción, donde se va a leer lo que
estaba dentro de esa hebra y se va a sintetizar por fin una proteína, en la imagen se ven
unos aminoácidos, ellos se van uniendo para formar un péptido.
Iniciacion de la replicación
El origen es reconocidos por varias proteínas (Dna A, DnaB, Dna C, Hu) las cuales se
unen al ADN formando un complejo de reconocimiento del origen. Utiliza ATP,
proteínas DNA A intervienen en el origen y HU intervienen en la iniciación. Y se
observa la helicasa en cada hebra para mantenerla abierta.
Suele haber una secuencia especifica que se repite como origen, puede variar pero se
repite con bastante frecuencia.
Elongación
Es llevada a cabo por un complejo multiprotéico que promueve la síntesis de ADN en
la horquilla de replicación, denominado REPLISOMA. Proteínas que componen al
replisoma:
DNA polimerasa:
o Procariotas (DNA polimerasa I, II y II) E.Coli.
o Eucariotas (DNA polimerasa α, δ, ε)
Helicasas; junto con la Primasa conforma el primosoma.
Primasas
Topoisomerasas
Proteínas de unión al ADN de cadena sencilla (SSB)
DNA ligasas
ADN polimerasa:
Requiere la presencia de una
hebra molde.
Un extremo 3’ OH libre de una
base. complementaria a una
hebra molde para que pueda
unir otro nucleótido.
Sustrato: dNTPs
Mg+2
Todas las DNA polimerasas sólo
pueden añadir nucleótidos a una
cadena preexistente
NO ES AUTOINICIADORA.
En la imagen se observa la hebra molde en sentido 5´-3´, una desoxirribosa y un primer que va a dar
origen a la unión de otros nucleótidos, el extremo 3´OH libre, vemos que viene una adenina y su comlemntario
será una timina, una vez que se una como dNTP queda unido liberando un pirofosfato y mediante un enlace
fosfodiester, asi se van agregando y agregando por acción de la ADN polimerasa. Deben estar en forma desoxi,
porque en replicación se esta sintetizando mas ADN, una nueva hebra de ADN que debe quedar igual a la
original.
Tipos de ADN polimerasa:
ARN ADN Polimerasa de ARN dirigida por ADN ARN polimerasa, primasa
Existen 3 polimerasas, pero la que es realmente activa es la polimerasa III y se dice que la polimerasa I y
II son auxiliares en el proceso de polimerización, la polimerasa III tiene capacidad de reparación, ella tiene
actividad exonucleasa 3 y cuando se incorpora un nucleótido que no corresponde porque no es complementario
a la hebra materna, ella misma puede hidrolizar el enlace porque tiene capacidad de identificar el error, puede
hidrolizar el enlace en el extremo 3´OH donde se está agregando y sacarlo para esperar al nucleótido
correspondiente.
La fidelidad de la replicación esta dada
por la adn polimerasa ya que tiene actividad
exonucleasa 3´-5´. Esta enzima en su estructura
tiene 2 sitios activos, el de la derecha es el que
tiene actividad exonucleasa, se observa que viene
una adenina hacia la citosina, ella identifica que la
adenina no corresponde y el extremo 3´OH
bloquea la elongación y la adn polimerasa se
desliza hacia atrás para colocar la base incorrecta
en el sitio de exonucleasa, donde rompe el enlace y el nucleótido apareado de manera incorrecta es eliminado,
una vez que ocurre ella sigue y se posa sobre la siguiente base para buscar el nucleótido que le corresponde.
ADN polimerasa I
Alto grado de fidelidad (error cada 109 o 1010 nucleótidos
incorporados) Está formada por dos fragmentos:
Fragmento grande (Fragmento de Klenow) → posee la actividad
polimerasa y 3’exonucleasa (CORRECCIÓN DE PRUEBA)
Fragmento pequeño: posee la actividad 5’ exonucleasa. Escisión de
cebadores y elimina nucleótidos dañados y los sustituye por nuevos.
El error retarda la actividad polimerasa, dejando el nucleotido mal apareado
en el extremo 3’. El retardo permite la fusión espontánea y libera el extremo
3’ para que contacte el lugar de la exonucleasa que elimina el mal
apareamiento
Actividad 5`exonucleasa permite eliminar los cebadores de ARN
(están en los fragmentos de Okasaki) y sintetizar ADN.
Proceso que permite madurar los fragmentos de Okazaki, por acción
de la ADN ligasa se unen para formar una sola hebra y la polierasa
quita los cebadores de ARN mediante la incorporación del dNTP.
Pinzas y cargadores de pinzas que favorecen la procesividad
Si las hebras están bien fijas la polimerasa puede actuar con mas precisión y puede ser mas rápido la prosecución.
Para que se complete un ciclo de replicación la DNA polimerasa III debe permanecer unida a su molde, es decir,
debe actuar con procesividad. Se han identificado proteínas que actúan como pinza (complejo B) y cargadores
de pinza (complejo Y), como proteína accesoria de la polimerasa, las cuales son directamente responsables de
potenciar la procesividad.
Helicasa
Son hexámeros de proteínas que se unen al ADN en el origen separando sus dos hebras, proceso que requiere
ATP. Se crean asi dos horquillas de replicación comienzan a avanzar en sentido opuesto alejándose del origen.
Proteínas de unión a hebra sencilla (SSB)
Se unen en su forma simple a una sola hebra. Una vez separadas las hebras por las helicasas intervienen estas
proteínas que evitan el apareamiento de las bases y mantiene despegadas las hebra.
Topoisomerasas
Son enzimas que modifican el estado de superenrollamiento, de la molécula de ADN tras la apertura
de las horquillas.
Crea topoisomeros modificando el número de enlace del ADN.
Hay de tipo 1 (corta una sola hebra) y de tipo 2 (corta las 2 hebras).
Primasas (ARN pol dirigida por ADN)
Ya que las ADN pol no son capaces de sintetizar ADN desde novo, es decir, unir los primeros nucleótidos, sino
solo elongar una cadena preexistente, se requiere un cebador al inicio de la síntesis de una hebra nueva.
ADN ligasa
Va a unir los fragmentos de Okasaki para que se genere una sola hebra. Se una una molecula ATP hasta AMP,
se requiere de energía.
Terminación de la replicación
Existe una región terminl d aproximadamente 20 pares de bases denominadas Ter.
Las secuencias Ter son sitios de unión de proteínas Tus.
El complejo Tus.Ter detiene la horquilla de replicación desde una sola dirección.
Cuando una horquilla de replicación se encuentra un complejo Tus-Ter, se detiene.
La otra horquilla se detiene cuando encuentra la primera horquilla que se detuvo.
Parte 8: Tema de transcripción
No hacer caso a la numeración que está en la imagen, pero va a explicar
que la en la imagen hay una gran célula que tiene un núcleo, dentro de
este núcleo está el ADN, nosotros ya aprendimos la replicación. Con la
replicación sabemos que una cadena de ADN, en algún momento se
identifica un origen y se va a replicar hacía los dos sentidos y se van a
generar dos orquídeas de replicación y se generaron dos nuevas hebras
que tienen la misma información genética que la original, porque la
hebra que se conformó pues, se hizo de manera complementaria, por lo
tanto, cada
una de estas dos quedaron con una información exactamente igual a la original. Tenemos la molécula de ADN, que tiene
información genética exactamente igual a la original.
El siguiente proceso que vamos a ver es el de la transcripción, sobre esta hebra que estamos hablando (mi cadena de
ADN) se va a sintetizar una sola hebra (la rojita) Esa hebra nueva se llama ARN.
Si seguimos acá, vemos que tenemos nuestra hebra de ARN, que no es lineal ya que puede tener torsiones o bucles en su
disposición espacial y esta se llama Pre-MRNA (Pre-ARN mensajero) mensajero porque ella se formó copiada
exactamente de una de las hebras del ADN original, pero en este caso el ARN tiene una sola hebra pero ya sabemos que
su secuencia de nucleótidos que la conformó es exactamente complementaria a una de las hebras madres.
Este ARN mensajero tiene que sufrir transformaciones pro-transcripcionales. Una de ellas es que tienen que sufrir
cambios en la caperuza o en la cola, se hace una cola de poli AAAA porque se agrega varios nucleótidos de adenina, esto
es por dos razones:
1) La cola de poli AAAA le permite movilidad y este ARN sale del núcleo y sale al citoplasma parte las modificaciones
pro-transcripcionales es para que ese ARN cuando esté en citoplasma, él no sea degradado por enzimas citoplasmáticas
entonces ese capuchón y esa cola lo van a proteger de esas enzimas en el citoplasma.
Ya una vez que tengo esa molécula de ARN en el citoplasma. En el citoplasma están los ribosomas, ellos tienen dos
subunidades, una grande y una pequeña y en el citoplasma hay aminoácidos libres, también hay ARN de tranferencia. Un
codón es una secuencia de 3 bases nitrogenadas y a un codón se le describen el anticodón. El anticodón es una secuencia
de 3 bases nitrogenadas que va ser complementario al codón.
Entonces el ARN mensajero tiene dos codones y tiene la secuencia nucleotídica que es exactamente igual a la que estaba
adentro en el ADN ya estamos en el citoplasma.
Resumen: Se ubica el ribosoma y se adosa al ARN mensajero y entonces el ARN de transferencia que tiene el anticodón
y en unos de estos dos brazos EL ARN de transferencia va a unir a su aminoácido, eso va a ocurrir de manera consecutiva
y a medida que va rodando el ribosoma, va creciendo la cadena peptídica para finalmente hacer la síntesis proteica,
finalmente que se fue codificando la información de este ARN mensajero, ya cuando se termina la info de esa proteína
pues se disocia las dos subunidades del ribosoma y queda libre la proteína. A partir de la información genética que está
contenida
en la hebra madre del ADN ocurre la replicación para generar una nueva molécula de ADN, luego ocurre la transcripción
y generar una molécula de ARN, hay modificaciones pro-transcripcionales que debe sufrir ese ARN mensajero, él va a
salir al citoplasma y luego se dará la síntesis de proteínas, también ese proceso de síntesis de proteínas va a ser el proceso
de traducción porque la info que estaba en el ribosoma fue traducida en una proteína.
Pero esta proteína aún no es funcional, la proteína debe presentar modificaciones pro-traduccionales para que se dé una
proteína que sea funcional. Vamos a partir de la información del ADN hasta sintetizar proteínas (las proteínas son
enzimas, tejido de sostén, transportadores que cualquier cantidad de productos o de elementos son proteicos dentro del
organismo.
Transcripción
Proceso enzimático a través del cual la información genética contenida en una hebra de
ADN se utiliza para especificar una secuencia de bases complementaria en una cadena de
ARN.
Recordemos que un gen estaba conformado por intrones y exones, donde una parte eran no codificables y otro sí
Nemotecnias: Intrones son los intrusos y por tanto esos eran los que no se codificaban y los exones son los que si
se codifican.
En la imagen tenemos la unidad de transcripción en el caso de procariotas que es donde son estudiados. Tenemos:
Si la transcripción va en sentido 5-3 pues nuestra hebra molde va a ser en este caso la de azul oscuro que es la hebra 3-5
porque recordemos que siempre esa polimerización es de manera complementaria y antiparalela, sobre esta secuencia de
bases nucleotídicas sobre nuestra hebra 3-5 se van agregando los nucleótidos de manera complementaria según lo que se
vaya consiguiendo en la secuencia de nucleótidos de la hebra de ADN. Estas hebras van a tener su nombre, la hebra que
va en el mismo sentido de la transcripción es la que no vamos a utilizar que es la hebra 5-3 es la hebra no molde,
mientras que la hebra 3-5 que es la hebra que si se va a codificar va servir de molde para sintetizar la hebra de ARN que
va naciendo, esa va a ser nuestra hebra molde.
Característisticas:
ETAPAS DE LA TRANSCRIPCIÓN
Ubicamos un promotor ADN (está en negro), la que actúa es la ARN polimerasa y
tenemos un gen que es la parte que será transcrita y tenemos secuencia de
terminación.
PROMOTOR
♥ Secuencias Basales: ubicada en posición adyacente al origen. Eucariota: Lo
más típico es la Caja TATA Timina Adenina, Timina, Adenina (regiones la
cadena -15 a -25) y secuencia iniciadora Inr (-3 a +5)
♥ Secuencias proximales: Ayudan a que se de el inicio a ese lugar promotor. Ubicado entre -30 y -200. No
especifican la posición de inicio sino la frecuencia de la transcripción. Caja CAAT (-60 y - 80) y la Caja GC
con cualquiera orientación a ambos lado de la caja CAAT.
♥ Secuencias Distales: Señales de regulación. Ubicadas a gran distancia del punto de inicio. Pueden ser de
tipo activadoras o inhibidoras. Regulan la expresión de genes que son ampliamente regulados por señales
(Ej. Genes de Hormonas).
Se necesitan proteínas adicionales que se fijen a ese espacio para que se dé en definitiva el inicio de
la transcripción.
ETAPAS DEL PROCESO
♥ Iniciación:
Reconocimiento del promotor:
♥ Reconocimiento del promotor por la subunidad σ .
♥ Unión de la polimerasa (formando complejo cerrado).
♥ Contacto con la caja TATAAT (-10),
Esta cadena que se forma es exactamente igual a la habra no molde y la llaman codificante porque esta
es la que realmente tiene la información, el ADN que se está formando es exactamente igual a la hebra
no molde, ella es codificante.
INICIACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN
1) Formación del complejo de iniciación: Esto involucra la unión de varios
factores de transcripción a la región promotora del ADN y la incorporación de la
enzima.
Luego que se incorporó la enzima participa la formación del dominio CTD que es
no fosforilado en el caso de las eucariotas y en el caso de las procariotas la
subunidad σ que se disociaba luego del complejo.
♥ Es procesiva
♥ Fidelidad media: 10-4 errores (adecuado para transcriptos de menos de
1000 nt) Velocidad: 20-50 bases/seg (más lento en zonas ricas en G/C)
♥ La transcripción debe tener muy pocos errores.
♥ A medida que avanza, se desenrrolla pero en la parte posterior, vuelve a haber un enrrollamiento de la hebra y
finalmente la hebra queda exactamente igual como estaba.
Inhibidores de la transcripción
Si tenemos alguna infección por bacterias por ejemplo la
Escherichia coli ella se va a multiplicar y forma más
Escherichia coli y produce más número de bacterias. ¿Qué
hacemos? Damos antibióticos.
♥ Α-Amanitina
♥ Rifampicina
♥ Actinomicina D
Estos son inhibidores de transcripción y al inhibirse este proceso de transcripción, regulamos la multiplicación
bacteriana y podemos entonces regular la infección.
INHIBIDORES DE LA TRANSCRIPCIÓN
(subunidad b RNApol
bacteriana) Daunomicina(quimiotera
MODIFICACIONES POSTRANSCRICIONALES
La maduración del ARN confiere estabilidad a la molécula, básicamente por una
mayor resistencia frente a nucleasas y por un plegamiento tridimensional.
Igualmente, facilita su reconocimiento por otros componentes celulares, que mejora
la funcionalidad para la traducción.
Recordemos que este transcrito primario tiene que salir al citoplasma y ocurren dos
modificaciones:
Como aquí hay un enlace peculiar que es el enlace 5-5 PPi (trifosfato) pues esa
identificación no se da y es suceptible a exonucleasas, además esta caperuza sirve
como punto de unión posteriormente al ribosoma para marcar ese lugar o sitio de
unión para que se dé el proceso de TRANSDUCCIÓN.
Lo otro que ocurre en este transcrito es la cola poli AAAA, se agregan una
secuencia de nucleótidos de Adenina y esta cola de poli AAAA jaja, le permite
movilidad a este transcrito para que salga al citoplasma.
Síntesis de Proteínas
Es el proceso por el cual la secuencia de nucleótidos de un ARNm es utilizada para ordenar los
aminoácidos de una cadena polipeptídica.
Tenemos la molécula de ADN que sufre replicación y se forma mas ADN, luego este ADN se
abría y por transcripción se sintetiza un ARNm, este llega al citoplasma hasta el ribosoma y estos
juntos van a sintetizar una cadena polipeptídica que es una proteína.
El código Genético
Cada aminoácido posee su
secuencia de bases nitrogenadas
que lo codificara (serian cada 3
bases nitrogenadas y esto se le
llama codón)
Cada codón va a codificar
específicamente a un AA, a
medida que avanza se formara una
cadena de AA que formara un
péptido.
Se dice que es:
Degenerado por poseer codones sinónimos, más de un codón codifica a un mismo AA, pero
siempre será específico para cada AA.
Codón de inicio AUG (algo que tiene auge es algo que inicia según Brett) y este codifica
metionina, toda cadena de Aas comenzara con una metionina
Codones de parada UAA, UAG y UGA.
SOLO PREGUNTAN SOBRE EL DE INICIO.
Hay 3 marcos de lectura, esto serian la parte
intermedia que es codificable ya que tanto el
inicio como el final no solo son.
Los tripletes no se solapan.
Es casi universal.
ARN ribosómico
El Ribosoma
Iniciación
Las subunidades del ribosoma se separan por
factores de iniciación, a la subunidad menor se
la van a unir otros factores de iniciación, un
GTP y un ARNt con su metionina formando el
primer complejo, complejo pre-iniciación.
Se van a seguir agregando factores de
iniciación, todos estos factores se van a unir a
la caperuza del ARNm que seria el extremo 5,
este extremo hace que el ribosoma reconozca
el sitio de inicio y la unión de todos los
factores de iniciación, se formara el complejo
de iniciación y comenzar la traducción en
sentido 5-3.
Polisoma
Agrupamientos de ribosomas (10-100), muy activos en el proceso de síntesis proteica, que
traducen simultáneamente un ARNm.
Cada ribosoma codificara una parte del ARNm para la síntesis de la proteína.
Inhibidores de la Síntesis de Proteína
Ejemplo la insulina: