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    Proyecto Final

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    El documento proporciona instrucciones para un proyecto de investigación sobre bases de datos de proteínas. Los estudiantes trabajarán en equipos para investigar un gen seleccionado y producir un informe que incluya la metodología, resultados e información sobre la estructura y función de la proteína codificada por el gen. También deben buscar genes relacionados con la hipercolesterolemia y proporcionar una breve descripción. El objetivo es que desarrollen conocimientos sobre bioinformática y el uso de bases de datos para comprender mejor las prote

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    El documento proporciona instrucciones para un proyecto de investigación sobre bases de datos de proteínas. Los estudiantes trabajarán en equipos para investigar un gen seleccionado y producir un informe que incluya la metodología, resultados e información sobre la estructura y función de la proteína codificada por el gen. También deben buscar genes relacionados con la hipercolesterolemia y proporcionar una breve descripción. El objetivo es que desarrollen conocimientos sobre bioinformática y el uso de bases de datos para comprender mejor las prote

    Título original

    Proyecto Final (1)

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    El documento proporciona instrucciones para un proyecto de investigación sobre bases de datos de proteínas. Los estudiantes trabajarán en equipos para investigar un gen seleccionado y producir un informe que incluya la metodología, resultados e información sobre la estructura y función de la proteína codificada por el gen. También deben buscar genes relacionados con la hipercolesterolemia y proporcionar una breve descripción. El objetivo es que desarrollen conocimientos sobre bioinformática y el uso de bases de datos para comprender mejor las prote

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    El documento proporciona instrucciones para un proyecto de investigación sobre bases de datos de proteínas. Los estudiantes trabajarán en equipos para investigar un gen seleccionado y producir un informe que incluya la metodología, resultados e información sobre la estructura y función de la proteína codificada por el gen. También deben buscar genes relacionados con la hipercolesterolemia y proporcionar una breve descripción. El objetivo es que desarrollen conocimientos sobre bioinformática y el uso de bases de datos para comprender mejor las prote

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    Asignatura

    Herramientas computacionales
    Competencia que se desarrolla:
    El alumno investigará e identificará los niveles de organización de una proteína, secuencias
    genéticas y la importancia de las bases de datos. Aprenderá a redactar informes de
    investigación.
    Unidad de competencia, atributo, desempeño o estándar que se evalúa:
    Conocimiento teórico y práctico la importancia de las bases de datos.
    Descripción de la tarea o evidencia integradora que da cuenta de la competencia:
    En equipos de tres realizar un reporte de una investigación cuyos detalles se
    mencionan a continuación.

    Contenido

    Bases de datos (uso del Entrez), seleccionar un gen de los enlistados abajo (tratar de no repetir entre
    los equipos)

    1) SMPD3 6) FOXP2 11) Bax

    2) IL7 7) DMD 12) BCL

    3) FXN 8) BRCA1 13) MMP3

    4) OCA2 9) CFTR 14) LAMB2

    5) UGT8 10) RB1 15) GALNT1

    • Introducción de la bioinformática, usos y su importancia en el área de la salud y ciencias


    biológicas

    Buscar la siguiente información

    • En una sección que llamara metodología, describir a detalle los pasos que va siguiendo en
    las bases de datos para recuperar la información solicitada.
    • En un apartado llamado resultados, realizar un resumen de la información más relevante
    para el gen que seleccionaron para trabajar. Esto debe incluir los siguientes puntos
    o Nombre del gen y alias
    o Función molecular del gen.
    o Consecuencias de las mutaciones de ese gen.

    Escribe la secuencia en formato FASTA solo una proporción de este, (edita el título poniendo una
    descripción diferente a la del GeneBank), secuencias de referencia

    o Del gen (solo secuencia de referencia REFSEQ)


    o Del mRNA representativo (solo secuencia de referencia REFSEQ)
    o De la proteína (solo secuencia de referencia REFSEQ)

    Numero de nucleótidos del gen


    Estructura genómica

    Homólogos en otras especies.

    Estructura de la proteína (dominios, estructura tridimensional, cristal etc)

    • Investigar la estructura primaria de la proteína.


    • Investigar la estructura secundaria de la proteína, indicando que es un motivo, dominio, y
    cuál es su importancia en la proteína que selecciono.
    • Investigar la estructura terciaria de la proteína (si puede incluir el cristal).
    • Investigar la estructura cuaternaria en caso de que la tenga la proteína.
    • Describir que son las modificaciones postraduccionales, cual es la importancia de esta y
    cuáles son las modificaciones que sufre la proteína que está investigando.

    Redactar una conclusión de su trabajo y de la bioinformática

    No olvide incluir sus referencias en formato Vancouver o apa

    Apartado dos

    Buscar genes descritos para la hipercolesterolemia (HYPERCHOLESTEROLEMIA)

    Realizar una breve descripción de la función del gen o genes relacionados

    Enlaces de interés
    http://www.ebi.ac.uk
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov
    http://www.uniprot.org
    http://pfam.xfam.org
    http://www.phosphosite.org
    http://phospho.elm.eu.org
    https://www.genecards.org/
    https://www.rcsb.org/

    Nota: importante colocar nombre completo de las personas que participan en el equipo y su grado
    de participación.

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