FAQ - Human - Microbiome Es PDF
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UN INFORME DE
LA ACADEMIA AMERICANA Más información disponible en www.DeepL.com/pro.
DE MICROBIOLOGÍA
HUMAN
MICROBIOME
ACERCA DE ASM FAQs
La Academia Americana de Microbiología
es la rama honorífica de la Sociedad
Americana de Microbiología, una
sociedad científica sin ánimo de lucro con
casi 40.000 miembros. Los miembros de
la AAM han sido elegidos por sus pares
en reconocimiento de
sus destacadas contribuciones al campo
de la microbiología. A través de su COMITÉ DIRECTIVO: PARTICIPANTES:
programa de coloquios, la AAM aprovecha
la experiencia de estos becarios para Lita Proctor, Doctora Doctor Brett Finlay
abordar cuestiones críticas en Instituto Nacional de Universidad de Columbia Británica
microbiología. Investigación del Genoma
Humano/NIH Dra. Wendy Garrett
Universidad de Harvard
Los informes FAQ se basan en las Dr. Jacques Ravel
deliberaciones de entre 15 y 20 Facultad de Medicina de Doctor Gary Huffnagle
científicos expertos que se reúnen la Universidad de Universidad de Michigan
durante un día para elaborar Maryland
respuestas con base científica a las Doctor Curtis Huttenhower
preguntas que el público pueda tener Doctor Peter Turnbaugh Universidad de Harvard
sobre temas de microbiología. Los Universidad de Harvard
Dra. Janet Jansson
informes se revisan
Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley
por todos los participantes y por expertos
externos, y se hace todo lo posible para PERSONAL DE LA ASSM Doctor Rob Knight
garantizar que la información sea exacta y Universidad de Colorado en Boulder
completa. Sin embargo, el informe no Leah Gibbons
pretende defender ninguna posición o Asistente del Programa de Doctor Sarkis Mazmanian
acción en particular, ni sustituir el consejo Coloquios y Divulgación Instituto Tecnológico de California
del proveedor de atención sanitaria de Pública
una persona. Doctor David A. Mills
Dra. Shannon E. Greene Universidad de California, Davis
Becario del Coloquio
La AAM no ofrece asesoramiento médico Dr. Dave Relman
y anima a los consumidores a formarse e Ann Reid Universidad de Stanford
informarse a la hora de tomar decisiones Director
médicas. Doctor Vincent Young
Universidad de Michigan
El contenido del informe puede
distribuirse posteriormente siempre que
se reconozca la autoría de la AAM y se
incluya esta cláusula de exención de
responsabilidad.
FAQ: MICROBIOME 1
Un momento, ¿qué es un microbio?
El término "microbio" se utiliza para describir
organismos demasiado pequeños para ser
observados a simple vista. Los microbios son
bacterias, arqueas, hongos, protistas y virus. Las
bacterias y las arqueas son organismos unicelulares
que no encierran su material genético en un núcleo.
Aunque de aspecto similar, a nivel genético las
bacterias y las arqueas están muy poco relacionadas.
Juntas, estas dos formas de vida representan una
enorme proporción de la diversidad de
vida en la Tierra, cada una de las cuales constituye
una rama principal, o dominio, del árbol de la vida.
La tercera rama principal, la Eukarya, incluye todas
las plantas y animales que puedes ver (incluidos los
humanos). También hay muchos microbios en la
rama eucariota del árbol de la vida, incluidos
algunos hongos (como la levadura), algunas algas,
amebas, mohos limosos y protozoos. Por último, los
virus también se consideran microbios. Dado que
los virus sólo pueden reproducirse infectando
células y secuestrando la propia maquinaria de la
célula para crear nuevos virus, se discute si pueden
considerarse vivos o no. Lo que casi seguro que no sabía es que el cuerpo
y no están incluidos en el árbol universal de la vida. humano también contiene billones de células que no
Sin embargo, es indudable que los virus desempeñan son humanas, sino microbianas, cada una de las cuales
muchas funciones importantes, incluso esenciales, tiene su propio complemento único de genes. Juntos,
en los sistemas biológicos, por lo que hay que estos microbios constituyen el microbioma humano y
tenerlos en cuenta como participantes importantes los científicos están descubriendo que desempeñan un
en las comunidades microbianas. papel importante en la salud humana. Si necesita
refrescar un poco la definición de microbio, eche un
vistazo al recuadro titulado "¡Un momento! ¿Qué es un
microbio?"
BACTERIAS
ARCHAEA
FAQ: MICROBIOME 3
2) ¿De dónde procede nuestro microbioma?
Puede que el mundo microbiano sea en gran Miles de millones de años antes de la aparición de los
organismos multicelulares, los microbios ocupaban
medida invisible para el ojo humano, pero es
todos los nichos ecológicos posibles.
inmenso, casi más allá de lo imaginable. Hay Los tipos de asociaciones entre animales y plantas y sus
microbios apenas están empezando a explorarse, pero
cientos de
lo importante es reconocer que estas asociaciones no
de miles de tipos diferentes de bacterias son aleatorias. Cada organismo ha evolucionado para
asociarse íntimamente con determinados tipos de
(dejando de lado por el momento los demás
microbios, quizá no exactamente con la misma especie
tipos de microbios: arqueas, virus, hongos y en todos los casos, pero sí con tipos característicos. El
ser humano no es una excepción: de los cientos de
protistas), que viven en todos los lugares
miles de tipos de microbios que hay en la Tierra, sólo
imaginables unos 1.000 se han asociado con el ser humano.
de los fondos marinos, en lo alto de las nubes,
Así que hay cientos de miles de tipos diferentes de
en las fuentes termales casi hirvientes del microbios en el mundo, y varios cientos de diferentes
Parque Nacional de Yellowstone, y
en el drenaje altamente ácido de antiguas
minas.
FAQ: MICROBIOME 5
3) ¿Qué tamaño El microbioma es grande se mida como se mida:
tiene
número de organismos, volumen total, diversidad de
especies y diversidad genética.
¿el microbioma?
NÚMERO DE ORGANISMOS: ¿Cuál es el secreto de esa alta densidad en el tracto
El microbioma incluye aproximadamente 100 billones de intestinal? La superficie. Las superficies internas del
células bacterianas. Es decir, ¡100.000.000.000.000! Es intestino y el colon humanos son muy enrevesadas. Si
posible que haya oído que hay 10 veces más células se aplanara toda la superficie interna del intestino,
microbianas que células humanas en el cuerpo humano, ¡tendría el tamaño de una pista de tenis! Las densas
pero esa proporción comúnmente citada se basa en una comunidades microbianas recubren toda esa superficie
estimación de 10 billones de células. y también llenan los espacios interiores de los intestinos,
en el cuerpo humano. Estimaciones más recientes dando lugar a una comunidad muy densa.
sugieren que el cuerpo humano se compone en
realidad de unos 37
trillones de células humanas. Por lo tanto, en un DIVERSIDAD DE ESPECIES:
momento dado, el cuerpo humano medio contiene El microbioma también es diverso: un microbioma
alrededor de 3 veces más células bacterianas que normal incluye unas mil especies diferentes. Si
humanas. Pero el microbioma no se limita a las recordamos nuestras clases de biología en el instituto,
bacterias. Recuerde que también incluye muchos virus, quizá nos acordemos de los tres tipos básicos de
hongos, arqueas y eucariotas unicelulares. Hay acuerdo bacterias: bastoncillos, esferas y espirales.
general en que los virus superan en número a las células Ciertamente, los bacteriólogos desarrollaron y
bacterianas, quizá hasta en una proporción de 5 a 1. Se utilizaron un sistema de clasificación mucho más
cree que hay unas 10 veces menos células fúngicas que detallado que tenía en cuenta la fisiología y el
bacterianas. Todas estas cifras son estimaciones y, dado metabolismo bacterianos, pero hasta hace muy poco,
que el microbioma es una comunidad dinámica, pueden la diversidad bacteriana conocida se limitaba a las
variar en función de las circunstancias. aproximadamente 5.000 especies bacterianas que
Sin embargo, se mida como se mida, ¡el microbioma es podían cultivarse en el laboratorio. Los avances
grande! tecnológicos, especialmente la capacidad de secuenciar
material genético de muestras ambientales, han
permitido a los científicos explorar el mundo
VOLUMEN TOTAL: bacteriano con mucha mayor profundidad y resolución.
El microbioma también es bastante grande en cuanto En la actualidad, los científicos estiman que existen al
al espacio que ocupa y su peso total. Aunque cada uno menos un millón de especies de bacterias, y es posible
de sus miembros es microscópico, todos ellos suman. que sean muchas más. Dado que las bacterias son tan
Según la mayoría de las estimaciones, el peso de un pequeñas y se parecen tanto al microscopio, puede
microbioma humano medio es de un kilo y medio. En resultar difícil
volumen, si se consolidara, el microbioma ocuparía para comprender lo diferentes que son estas
unos 3 kg. especies bacterianas entre sí. Sin embargo, a nivel
pintas. Sin embargo, hay que tener en cuenta que el genético, incluso bacterias de aspecto muy similar
microbioma no está consolidado en un solo lugar, y que pueden ser tan diferentes entre sí como los humanos
la densidad de las distintas comunidades microbianas lo somos de las lombrices intestinales (véase "Las
varía mucho de un lugar a otro del cuerpo. apariencias engañan").
al lugar del cuerpo. La sangre y los fluidos linfáticos son
prácticamente estériles, mientras que los intestinos y el La extraordinaria diversidad de las bacterias se debe a
colon contienen una de las comunidades microbianas que llevan evolucionando más de 3.500 millones de
más densas que se conocen en la Tierra. Qué años, durante los cuales han desarrollado la capacidad
de
para vivir en entornos muy diferentes. Del mismo
modo que los osos polares están adaptados al frío y
los cactus al desierto, los distintos tipos de bacterias
han evolucionado para prosperar...
en prácticamente todos los entornos de la Tierra,
incluidos lugares sin luz, prácticamente sin agua y con
temperaturas desde muy por debajo de cero hasta diferentes que son estos entornos, empieza a tener
BACTERIANO
casi el punto de ebullición. Teniendo en cuenta lo sentido que estas bacterias sean muy distintas entre sí.
FÚNGICO
FAQ: MICROBIOME 7
4) ¿Dónde se encuentra el
microbioma y qué hace?
Dondequiera que el cuerpo humano esté expuesto al mundo exterior, hay una
comunidad microbiana. Eso significa que toda la superficie de la piel y los
revestimientos de las fosas nasales, los pulmones y los tractos digestivo y
urogenital albergan comunidades microbianas. Algunas de estas comunidades
son extremadamente densas y otras más dispersas. Y como las condiciones de
vida son muy diferentes en estos distintos lugares, no es de extrañar que cada
uno tenga su propio conjunto característico de microbios. Lo que hace el
microbioma también varía de un lugar a otro y muchas de sus funciones aún
no se han averiguado. He aquí algunos ejemplos de comunidades del
microbioma humano:
PIEL:
Los microbios viven en todas las superficies de la piel,
así como en el interior de los poros y las glándulas
sudoríparas, y a lo largo de los tallos del pelo. La
composición del microbioma de la piel varía de un
lugar a otro: las zonas secas, como los brazos y las
piernas, tienen menos microbios y más diferentes que
las zonas húmedas o grasas, como las axilas o los
pliegues nasales. Hay indicios de que algunos
microbios cutáneos comunes pueden ayudar a
mantener alejados a los patógenos. Por ejemplo, se ha
demostrado que el Staphylococcus epidermidis, muy
frecuente, produce compuestos que inhiben al
Staphylococcus aureus, afín pero patógeno.
BOCA:
Se han encontrado unas 1.000 especies microbianas en
la boca humana, y cada persona suele albergar entre
100 y 200 especies. Al igual que la piel, la boca contiene
muchos microhábitats diferentes, como las superficies
de los dientes, la lengua, las mejillas y las encías. La
mayoría de estos hábitats están expuestos al aire, pero
las bolsas que se forman donde los dientes emergen de
las encías pueden ser anaeróbicas y permitir la
proliferación de microbios que pueden crecer sin
oxígeno. En lo que se perfila como un tema común
cuando
En lo que respecta al microbioma humano, la línea
que separa la salud bucodental de enfermedades
como la caries dental y la enfermedad periodontal
parece depender del buen funcionamiento de una
comunidad de microbios en armonía con el sistema
inmunitario. Cuando
Si se rompe este equilibrio, los patógenos pueden afianzarse.
FAQ: MICROBIOME
5) ¿Es el microbioma de todos igual?
Sí y no.
El microbioma de cada individuo desempeña muchas desempeñan esas funciones en cada ciudad. En el
funciones similares, pero las tareas no las realizan microbioma humano siempre se encuentran ciertas
necesariamente las mismas especies microbianas en capacidades funcionales amplias, pero no siempre las
cada persona. Además, las especies que desempeñan llevan a cabo las mismas especies microbianas. Algunas
las distintas funciones en un individuo determinado funciones son bastante específicas -por ejemplo, la
pueden cambiar con el tiempo. La situación es análoga a capacidad de metabolizar un fármaco concreto o
cualquier otro tipo de ecosistema: si comparásemos digerir un compuesto dietético específico- y estas
bosques de todo el mundo, encontraríamos árboles, funciones no se encuentran en todo el mundo, ni en
cubierta vegetal, aves, insectos y animales en todos todo momento.
ellos. En algunos predominan los robles, en otros los
abetos, pero todos los nichos ecológicos de un bosque En los cinco primeros años del Proyecto del
están cubiertos. Otra analogía útil es la de una ciudad: Microbioma Humano, un programa de investigación
toda ciudad tiene bomberos, policías, financiado por los Institutos Nacionales de la Salud, se
conductores de autobús y basureros, pero personas examinaron los microbiomas de 242 individuos sanos
diferentes en 15 (hombres) a 18 (mujeres) localizaciones
corporales y se descubrió que eran muy diversos,
tanto de un individuo a otro como de una localización
corporal a otra. ¿Qué descubrieron?
¿Llegará pronto el momento en que los forenses ■ Cuando los microbiomas se clasifican por las
especies bacterianas que contienen, su
puedan identificar a un sospechoso cotejando las
aspecto varía mucho de una persona a otra.
pruebas de la escena del crimen con su microbioma? Si son
¿O clasificados por la presencia de diversas
¿Sería posible saber por dónde ha viajado una capacidades funcionales - la capacidad de
persona analizando sus microbios característicos? digerir diferentes tipos de hidratos de carbono,
Por el momento, estos escenarios son puramente sintetizar vitaminas,
hipotéticos. No sabemos o descomponer toxinas, por ejemplo- se
Todavía no sabemos lo suficiente sobre la variación parecen más de una persona a otra.
que existe entre los microbiomas de los individuos, ni
sabemos cuánto o con qué rapidez cambian los El Proyecto del Microbioma Humano se centró en
microbiomas. individuos sanos con el objetivo de establecer una
con el tiempo, para utilizar esos datos en un descripción de referencia de un microbioma "normal".
entorno forense. Así que probablemente pasará Los estudios en curso están empezando a analizar si
bastante tiempo antes de que el microbioma determinadas composiciones del microbioma se
aunque un estudio que emparejaba a oficinistas con correlacionan con enfermedades concretas, riesgos de
sus teclados de ordenador analizando los microbios enfermedad y respuestas a fármacos u otros
transferidos de su piel a las teclas llegó a aparecer en tratamientos.
una serie de televisión. El uso válido de la información Además, los estudios sobre el microbioma están yendo
sobre el microbioma con fines forenses requerirá una más allá de la identificación de "quién está ahí" -es
base de datos de referencia mucho mayor de la que decir, la composición de especies microbianas del
existe en la actualidad. microbioma- para pasar a "qué están haciendo". - es
decir, comprender sus funciones.
Cabe señalar que esta sucesión natural de especies El microbioma puede cambiar de diferentes maneras:
puede proceder de forma diferente en una zona donde algunas especies se encontrarán siempre, mientras que
ha habido mucha actividad humana. En tal situación, las otras aparecerán y desaparecerán. Ciertamente, la
malas hierbas, plagas u otras especies invasoras pueden proporción de diferentes especies o grupos de especies
llegar primero y cambiará. Las distribuciones características de ciertos
superan a las plantas autóctonas. Es posible que la zona grupos de bacterias intestinales se correlacionan
nunca recupere la mezcla de especies autóctonas. estrechamente con la obesidad y los microbiomas de los
individuos que pierden peso llegarán gradualmente a
Durante los dos primeros años de vida, los bebés parecerse a los microbiomas más característicos de las
adquieren gradualmente un microbioma que se personas delgadas. Lo que es más difícil de medir, pero
asemeja al microbioma típico de los adultos. Poco sin duda también cierto, es que la función del
después del nacimiento es un momento único en el microbioma puede cambiar aunque su composición
que, por ejemplo, pueden establecerse microbios poco no lo hace. Esto se debe a que los microbios que componen el
comunes, que más tarde se verían superados en microbioma son organismos complejos con diversas
competencia.El reconocimiento de que estos primeros capacidades genéticas. Cuando cambian las condiciones,
años son un momento crucial para el establecimiento del activan diferentes vías metabólicas que, a su vez, afectan a los
La investigación sobre el microbioma ha llamado la microbios que los rodean y al huésped humano.
atención sobre prácticas humanas de reciente
introducción: el parto por cesárea, la alimentación con Para entender cómo puede cambiar el microbioma con
leche artificial y, sobre todo, el uso de antibióticos en el paso del tiempo hay que adoptar la mentalidad de un
los primeros años de vida. ecólogo. El huésped humano y su microbioma forman
sobre el microbioma es desconocida. De hecho, parece un ecosistema, en realidad muchos ecosistemas que
que el proceso de adquisición de un microbioma interactúan entre sí. Los cambios en cualquiera de sus
funcional es bastante sólido, ya que la gran mayoría de miembros, o en el entorno externo, se propagan por
los bebés, hayan nacido por vía vaginal o por cesárea, toda la comunidad de un modo que los científicos sólo
amamantados o no, lo hacen muy bien. están empezando a desentrañar. El objetivo final es
No obstante, serán necesarios estudios detallados y a entender qué constituye un ecosistema humano-
largo plazo para determinar si estas recientes prácticas microbioma sano y desarrollar los medios para
sanitarias y nutricionales tienen consecuencias mantenerlo sano y repararlo cuando sea necesario.
imprevistas previsibles y posiblemente evitables.
Postulado nº 3 de Koch:
El microorganismo cultivado debe causar una
enfermedad cuando se introduce en un organismo
sano.
Postulado nº 4 de Koch:
El microorganismo debe volver a aislarse del huésped
experimental enfermo inoculado e identificarse como
idéntico al agente causal específico original.
FAQ: MICROBIOME 15
9) ¿Cómo puedo cuidar
de mis socios microbianos?
Ahora que conoce los billones de microbios carbohidratos, que "alimentan" a los microbios
deseables. Estos compuestos se llaman
que viven en su casa y que desempeñan un "prebióticos". Por lo tanto, una de las formas en que
papel tan importante en la salud, quizá se una dieta rica en fibra, frutas y verduras contribuye a
la buena salud es que también fomenta un
pregunte qué puede hacer para mantenerlos microbioma saludable. En segundo lugar, el consumo
contentos. La respuesta, por el momento, es de microbios puede modificar la microbiota
gastrointestinal. Los alimentos fermentados como el
que aún no sabemos qué caracteriza a un yogur, el queso y el chucrut contienen microbios
microbioma sano, ni cómo nuestro similares a los del tracto gastrointestinal. También
hay suplementos compuestos únicamente por
comportamiento... microbios, llamados "probióticos". Hay muchas
lo afecta. Sin embargo, podemos decir algunas pruebas de que los probióticos pueden contribuir a la
salud, pero hay que tener precaución. Los
cosas. Los antibióticos de amplio espectro probióticos no están regulados como los
pueden tener un efecto profundo y a menudo medicamentos, por lo que las etiquetas pueden no
reflejar con exactitud qué microbios están presentes,
duradero en el microbioma. También pueden si son viables o cuántos hay en una ración. En el caso
salvar vidas. La clave es usar antibióticos sólo de muchos prebióticos y probióticos, el tipo de
pruebas clínicas rigurosas que establecen si un
cuando sea necesario. medicamento es eficaz, cuánta
y con qué frecuencia debe tomarse. Medir la salud y
También sabemos con certeza que su dieta puede comprobar las declaraciones de propiedades
afectar a su microbioma de dos maneras. En primer saludables puede ser un reto, dado que los
lugar, así como decimos que conocimientos médicos sobre lo que define lo
una mujer embarazada está comiendo por dos, es "saludable" palidecen en
absolutamente cierto que estás comiendo por ti comparación con lo que se sabe sobre las
misma y por billones de microbios. Los alimentos que enfermedades. A veces, los probióticos se
consumes también están alimentando a tus microbios. comercializan como "curas" indiferenciadas, como si
Algunos alimentos favorecen el crecimiento de cualquier microbio o mezcla de microbios fuera útil
microbios relacionados con la buena salud. para cualquier enfermedad. Pero los probióticos son
probablemente más análogos a cualquier otro tipo de
terapéutica, como los medicamentos. Al fin y al cabo,
no se toma un fármaco al azar si se está enfermo, sino
que se busca el fármaco adecuado para esa
enfermedad o síntoma. Con el tiempo, las pruebas
clínicas revelarán qué probióticos son eficaces para
cada enfermedad,
en según qué pacientes. De hecho, algunas mezclas
específicas de microbios ya han demostrado su eficacia
en el tratamiento del síndrome del intestino irritable y
la colitis ulcerosa en ensayos clínicos aleatorizados.