La Guia Escencial Del Biohacker
La Guia Escencial Del Biohacker
La Guia Escencial Del Biohacker
LA G U Í A ESENC I A L D E
H AC K E R
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Versió
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2 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide ESPA BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 3
LA GUÍA ESENCIAL DEL
En 2008, DIYbio.org fue lanzado como un canal de
comunicación entre las personas que querían utilizar
esta tecnología y ayudó a la construcción de la comu-
nidad en torno a ella. En 2009 los primeros biohacker
BIOHACKER
Versión
spaces aparecen, en California (BioCurious) y Nueva
1.1
York (GenSpace). Hoy DIYbio.org mantiene una lista de
los espacios DIY-Bio al rededor del mundo: 41 en Améri-
ca del Norte, 28 en Europa, 6 en América Latina, 5 en Este manual es liberado bajo Crea-
Asia y 4 en Oceanía (consultado 05/27/2016). En tan
EMPIEZA EL VIAJE EN EL MUNDO DE DIY-BIO sólo ocho años el movimiento se ha convertido en un
tive Commons copyright license tipo
Attribution-NonCommercial-ShareA-
fenómeno global. like 4.0 International - CC BY-NC-
SA. Esta licencia permite a otros
En 2015 los grupos de Latinoamérica se organizaron mezclar, ajustar y construir con
Introducción base en este trabajo de manera no
con el objetivo de impulsar el movimiento en esta región,
El movimiento DIY-Bio (Do-it-yourself biology/Biología de garaje) nació comercial, siempre y cuando se dé
creando la Red de Biohacker Spaces de Latinoamérica
como respuesta a la necesidad de acceso y democratización de la Ingeniería crédito a los creadores del manual
- SyntechBio. Entre las metas de este grupo está la ex-
Genética. Esta tecnología se conoce con varios nombres como; Biología y las nuevas creaciones sean libe-
pansión del conocimiento y la creación de herramientas
Molecular - Biotecnología - Biología Sintética. Esta tecnología es funda- radas bajo los mismos términos. Los
para DIY-Bio en América Latina. Razón que impulsa la
mental en la producción de biomateriales, biocombustibles, medicinas y links y documentos referenciados
creación del Manual del Biohacker. Este manual busca por este manual no pertenecen a
biosensores, entre otros (Cuadro 1).
dar información puntual y simple que permita la creación los autores del manual, este manual
de nuevos espacios dedicados al DIY-Bio/Biohacking, simplemente los organiza para faci-
La historia del movimiento comienza en 2005 con el artículo de
ayudando así en la democratización de esta tecnología. litar el acceso y uso. Los links selec-
Rob Carlson en Wired, donde se mostró que US$1.000 eran suicientes
Este cocimiento es un compendio de la experiencia de cionados están en lengua inglesa.
para conseguir los equipos necesarios para comenzar a utilizar esta tec-
los grupos pioneros en la implementación de estos es-
nología, así como, que era posible entender los principios básicos con la
pacios en la región de América Latina.
ayuda de recursos en línea (Carlson, 2005).
4 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 5
Dentro de DIY-Bio podemos pensar en cuatro tipos de actividades básicas; Microbiología,
Biología Molecular, Biología Celular y Bioinformática (Cuadro 2). Para cada un de estos
tipos de actividad son necesarios ciertos recursos (Cuadro 3).
CUADRO 2 - ACTIVIDADES
Pleurotus spp Microbiología Alimenticio -Diseño de DNA para incluir modiicaciones a nivel de DNA, RNA o proteína.
Soniicación de hongos Microbiología/Electrónica Bioarte -Análisis de información genética a nivel de Genómica, Transcriptómica y Proteómica y
estudiar evolución y ilogenia usando Genómica comparativa.
Precipitación de oro Biología sintética Reciclaje Bioinformática -Análisis de interacciones en 3D entre moléculas biológicas.
Impresión de imágenes Biología sintética Bioarte -Diseño de blancos farmacéuticos.
-Análisis de vías y lujos metabólicos.
Órganos artiiciales Ingeniería de tejidos Médico/Investigación
6 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 7
CUADRO 3 - RECURSOS
En el refrigerador pueden ser almacenados cultivos de mi-
A- Hardware e Infraestructura croorganismos por periodos cortos (semanas) y solucio- Un refrigerador de bajo costo, que
Refrigerador con nes para prolongar su tiempo de uso (meses). En el con- utiliza arduino y celdas peltier,
Microbiología congelador gelador pueden ser guardadas muestras de DNA, RNA y puede ser construido usando este
proteínas y enzimas para usar en biología molecular. No tutorial.
Equipo Descripción Alternativa DIY-Bio use este refrigerador para almacenar alimentos.
Dependiendo de las actividades a realizar se necesitará de un Se puede consultar este tutorial para
espacio, no necesariamente grande, donde estén solamente Un garaje o un cuarto Sirve para pesar reactivos del laboratorio o distintos ma- montar una balanza con bajo presu-
Área de trabajo los equipos y materiales para los experimentos DIY-Bio. En desocupado puede adaptarse teriales con precisión. Se necesita una con capacidad de puesto. Y este otro tutorial para una
Balanza
algunos casos es necesario dividir el área para evitar conta- fácilmente. pesar gramos, si es posible miligramos. balanza más soisticada, así como
minar algunos materiales al momento de trabajar. este otro.
Es necesaria una mesa de trabajo que permita trabajar con Una mesa de trabajo apropiada Sirve para hacer crecimiento continuo/batch de microor-
sustancias químicas sin ser degradada, que sea fácil de para DIY-Bio puede ser cons- Existen tutoriales como este y este
Bioreactor ganismos como levaduras o algas. Y para obtener pro-
limpiar y con supericie resistente al fuego. Es recomen- truida siguiendo este tutorial para construir biorreactores.
Mesa de trabajo ductos de interés de estos.
dable tener más de una mesa para trabajar con diferentes para la supericie y este otro
organismos. tutorial para la mesa.
Campana de extrac- Sirve para trabajar con químicos que son peligrosos al ser Este tutorial muestra cómo construir
ción para químicos inhalados, como ácidos o bases fuertes, entre otros. una.
Una olla a presión común pue-
Este equipo emplea vapor de agua saturado a una presión de 15
de ser usada para sustituir el Evite construir incubadoras con ma-
libras, lo que permite que la cámara alcance una temperatura de
autoclave, pero necesitará más teriales como madera triplex u otras
121ºC. El tiempo de esterilización usualmente es de 15 minutos. Utilizada para mantener microorganismos en su tempera-
tiempo para esterilizar el mate- maderas porque son muy vulne-
Sirve para esterilizar medios de cultivo, algunas soluciones, tura óptima de crecimiento. Esta incubadora debe tener
rial, más o menos 45 minutos. rables a la humedad. Para incubar
agua y utensilios de vidrio, metal y madera. En el caso de movimiento si se planea hacer cultivos en medio líquido,
Si no se cuenta con una olla a puede usar un sistema de incubar
Autoclave material de plástico y vidrio, veriique si son resistentes a al- Incubadora para el movimiento ayuda a la oxigenación de las células en el
presión, se puede utilizar un mi- huevos.
tas temperaturas antes de autoclavar. Siempre coloque lo que crecimiento medio líquido.
croondas siguiendo este proto- Para dar movimiento a su incuba-
va a ser autoclavado en envases con tapa rosca o envueltos *Escherichia coli (bacteria más usada en biología mole-
colo. Los mismos cuidados que dora puede colocarla en una mesa
en papel aluminio, no deje la tapa de los envases totalmente cular) crece a 37ºC, levadura a 30ºC y Agrobacterium a
se toman para usar un autocla- agitadora, como describe este tuto-
cerrada porque la presión puede forzar el líquido a salir oca- 28ºC.
ve deben ser tomados al usar rial. También puede ser construida
sionando quemaduras.
una olla a presión. siguiendo este tutorial.
8 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 9
Se puede construir un equipo como el que se
Sirve para mezclar pequeñas cantidades de
Vortex muestra en este video. O uno más elaborado Ayuda a mantener estéril el material en cuan-
líquido homogéneamente.
como en este otro. to se trabaja (necesita una fuente de gas), Este video muestra un mechero Bunsen que
Mechero Bunsen también puede ser usada una lámpara de puede ser hecho en casa.
Existen varias alternativas para construir un alcohol como sustituto al mechero.
Permite visualizar microorganismos, células y microscopio usando; papel, impresora 3D,
Microscopio algunas estructuras celulares. usando un smartphone o comprando uno Encontramos este kit y está lista con precios
que pueda ser adaptado a un smartphone. Sirve para medir el pH. Es importante en la razonables.
pH-metro preparación de medios de cultivo y Este equipo también puede ser construido,
Puede ser construido uno con este tutorial. soluciones. como explica esta guía, este tutorial o este
Sirve para agitar soluciones permitiendo que También se puede optar por una versión con tutorial.
Agitador magnético queden homogéneas. función de temperatura, como la de este
tutorial.
-Probetas (100mL y 1L), pipetas (5mL y 20mL), vasos precipitados (500mL y 1L) y erlenmeyers
(500mL y 1L), matraces aforados (100 mL, 500mL y 1L), tubos de ensayo, vidrio de reloj, perlas
Sirve para medir concentraciones de moléculas Este tutorial explica como puede ser construi- de vidrio, asas de vidrio y cámara de Neubauer.
o de microorganismos con referencia a concen- do uno para medir crecimiento de cultivos de -Garrafas de vidrio con tapa rosca para almacenar soluciones, agua y medios de cultivo que
Espectrofotómetro traciones conocidas. Sirve para medir el creci- bacterias, mientras que este segundo tutorial fueron esterilizados.
miento de los microorganismos. También sirve explica como construir uno más adecuado
-Placas de petri: Pueden ser plásticas o de vidrio, si son de vidrio pueden ser esterilizadas
para medir la concentración de DNA o RNA. para medir concentraciones de DNA y RNA. Otros usando la olla a presión o autoclave.
-Asas de cultivo: Un mango de madera o plástico sujeto a un alambre para poder manipular
Este equipo es opcional, un buen uso del Me- microorganismos.
chero de Bunsen puede ser suiciente para man- Este tutorial muestra cómo construir una -Portaobjetos y cubreobjetos para colocar muestras en el microscopio.
Cámara de lujo tener los experimentos sin contaminación. Para campana de lujo laminar. Este muestra
laminar *La mayoría de los materiales plásticos y de vidrio se pueden comprar en websites como
ambientes que además de estériles necesitan cómo construir una Glovebox. amazon o aliexpress.
ser anaerobios es necesario una GloveBox.
10 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 11
Biología Molecular
Equipo Descripción Alternativa DIY-Bio
Biología Celular (con células animales o vegetales)
Existen varios modelos de bajo costo como
Esta máquina hace copias de DNA. También Equipo Descripción Alternativa DIY-Bio
este o este. También tutoriales para cons-
sirve para identiicar si una muestra tiene una
Termociclador truir una como este que fue desarrollado por Para realizar cultivo celular es indispensable, porque estos cul-
región de DNA especiica por medio de
nuestro grupo en colaboración con el Lab de Cámara de flujo tivos son altamente susceptibles a contaminación por hongos Este tutorial muestra como
iniciadores especíicos.
Garagem en Brasil. laminar del medio ambiente. También es necesario tener lo que ya fue construir uno.
descrito para microbiología.
Usada en casi todos los experimentos, desde ex-
tracción de DNA hasta trabajo con proteínas. En ge-
Incubadora de Para tejidos animales puede ser necesario mantener algunas
Centrífuga neral una centrífuga que llegue hasta 11,000rpms Puede ser construida siguiendo este tutorial
CO2 y tanques de condiciones de temperatura y concentración de CO .
es ideal. Sirve para separar rápidamente diferentes o este. 2
CO2
componentes de una solución en base a sus
densidades. Para más información consul-
Materiales de Varían dependiendo del método de extracción a utilizar: destila- tar: Laboratory Handbook for the
Este tutorial o este tutorial explican cómo ción fraccionada, extracción por relujo, percolación, extracción Fractionation of Natural Extracts
Calentador de Útil para realizar reacciones enzimáticas y transfor- vidrio para
construirlo. O puede ser usado el
agua mación de células por heat-shock. destilación Soxhlet, etc. from Houghton Peter J. and
termociclador. Raman Amala.
Sirve para separar DNA, RNA y proteínas por tama-
Existen tutoriales como: tutorial_1, tutorial_2 Utiliza bajas presiones y temperatura para separar las molécu-
Cámara de electro- ño y carga. Así pueden ser visualizados después. y tutorial_3 que explican cómo construir Rotavapor las extraídas de los solventes que son volátiles.
foresis Existen cámaras horizontales (para DNA y RNA) y
una.
verticales (usualmente para proteínas). Existen diferentes métodos como: cromatografía en capa ina
Usado en biología molecular (2uL, 20uL, 200uL y (TLC), cromatografía líquida (HPLC), cromatografía de gases
Micropipetas y Pueden ser compradas o construirlas usan- Equipo de croma- (GC-MS), entre otras. Algunos requieren de un recipiente de Aquí se ve cómo se va armando
puntas descarta- 1000uL) para medir y tomar pequeños volúmenes tografía un equipo de cromatografía DIY.
do este tutorial o este tutorial. vidrio y solventes (TLC) y otras de equipos especializados
bles de líquidos.
(HPLC, GC-MS).
Para visualizar geles de electroforesis. Utiliza luz
Transiluminador Este tutorial explica como construir uno.
UV, manejar con cuidado. Existen sistemas para crecer plantas en condiciones controladas como este. También robots para
Este tutorial muestra como se puede cons- Varios cultivar plantas o realizar protocolos de laboratorio de forma automatizada. Otros grupos están
Sirve para romper la pared celular permitiendo ex- construyendo bioprinters.
Tanque ultrasónico tracción de algunas moléculas de las células. truir uno. También se puede consultar este
otro.
Tubos de microcen- Para realizar reacciones enzimáticas y otros experimentos (0.2mL y 1.5mL)
trífuga (Marca conocida: Eppendorf, existen opciones más baratas en el mercado).
12 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 13
Bioinformática
Equipo Descripción
De preferencia con un emulador de Terminal o sistema operativo o máquina virtual mFold by Michael Zuker - Predice estructuras secundarias de RNA y DNA usando Tm y cálculos de
Computadores y acceso a Internet con Linux o MacOs. RNA energía libre.
Almacenamiento en la nube Dropbox, Google Drive, Amazon server, etc. -DeepView by GlaxoSmithKline & Swiss Institute of Bioinformatics - Visualizador de estructuras
proteicas.
La mayoría de herramientas se pueden utilizar en línea, otras son de descarga,
Software generalmente gratuita (Mega, PDB Viewer, etc.). -Molecular Flipbook by Andrej Sali - Sirve para visualizar estructuras proteicas en 3D.
Proteínas
-VMD/NAMD by James C. Phillips et al. - Visualizador molecular de estructuras proteicas. Simulador
*Para personas que van a comenzar a trabajar en esta área recomendamos leer esta publicación. La cual fue de Dinámica molecular.
desarrollada por el Leukippos Institute con la colaboración de nuestro grupo. -ExPASy Proteomics server by the Swiss Institute of Bioinformatics - Links para calcular parámetros
proteicos.
-Modeller by Sali Lab - Modelador 3D usando homología.
B- Software y Bases de datos
-TinkerCell by Deepak Chandran - Modelos computacionales usando partes, células y módulos.
Software y Bases de Datos -Metabolic Tinker by Kent McClymont and Orkun Soyer - Construye vías metabólicas usando
Sistemas parámetros termodinámicos.
Aplicación Herramientas -Biocompiler by OMIC Tools - Genera redes genéticas regulatorias y ayuda en la automatización del
-Benchling by Benchling, Inc. - Herramienta para DNA design (Plásmidos y CRISPR/Cas) y notas de diseño de construcciones genéticas.
experimentos.
-Cytostudio by Molecula Maxima - Lenguaje de bioprogramación para Biología Sintética basado en la -Registry of Standard Biological Parts by MIT - Repositorio open source de BioBricks.
base de datos del iGEM.
-The public instance of the JBEI Registry - Repositorio de DNA.
-Genome Compiler by Genome Compiler - Herramienta para DNA design (Plásmidos). -GeneBank by National Center for Biotechnology Information - Repositorio de DNA y RNA.
Bases de
-GeneDesigner by DNA2.0 - Herramienta para DNA design (Plásmidos). datos -Protein Data Bank - Repositorio de estructuras tridimensionales de proteínas.
DNA -NEB Cutter by New England Biolabs, Inc. - Sirve para encontrar sitios de restricción. -Recomendamos ver esta publicación que describe todas las bases de dados de ácidos nucleicos que
-ORF Finder by NCBI - Sirve para encontrar Open Reading Frames. existen hasta 2016.
-SnapGene by SnapGene - Herramienta para DNA design (Plásmidos) con una buena interface de
visualización.
-MEGA by MEGA - Análisis de datos genómicos y proteómicos para generar árboles y agrupamientos
de secuencias evolutivamente relacionadas.
14 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 15
C- Substancias químicas y biológicas
Microbiología Es utilizado para conservar cepas de mi-
Se puede conseguir en tiendas de materias
croorganismos durante largos periodos de
Substancia Descripción Formulación primas como glicerina. Antes de usar debe ser
Glicerol tiempo(-80°C). Se usa un stock de 50%
esterilizado usando un iltro, como explicado en
Se utiliza para aislar y crecer bacterias. Se La preparación del medio LB puede obser- para conservar los microorganismos a
este video.
puede consultar esta fuente para más infor- varse en este video, una alternativa al medio 25%.
Medio de cultivo LB
mación sobre su composición. LB puede ser esta.
Se puede conseguir en tiendas de reactivos
Se utiliza para aislar y crecer levaduras. Se Se utiliza para acidiicar los medios de culti-
La preparación del medio PDA casero puede Solución ácida químicos. Preparar la solución stock a 1N como
Medio de cultivo PDA puede consultar esta fuente para más infor- vo, cuando se requiere bajar el pH. Se sue-
observarse en este video. (Ácido Clorhídrico) muestra este video. Guardar la solución etique-
mación sobre su composición. le preparar una solución stock de 1N.
tada en frascos ámbar de vidrio bien tapados.
16 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 17
Biología Molecular Buffer TAE o Permite el lujo uniforme de corriente eléctri-
Se puede preparar en el biohacker space siguiendo
TBE ca en la electroforesis, también se usa en la
esta página para el buffer TAE y esta otra para el
Substancia Descripción Formulación preparación de geles de electroforesis.
buffer TBE. En este artículo es descrita una
Preparar una solución stock 50X,
Enzimas de restric- Se utilizan para cortar el DNA en sitios espe- alternativa económica.
Las enzimas de restricción con mejor relación la solución de uso es 1X.
ción cíicos. Consultar este video para más infor-
costo/funcionalidad son aquellas descritas en
mación y este sitio para optimizar la reacción. Agarosa La agarosa se conserva en polvo hasta que va a
el estándar de ensamblado de los Biobricks: La agarosa es un polímero extraído de algas
Consultar este link y este link para conocer los ser utilizada para preparar los geles de electrofore-
principales problemas cuando la reacción no
EcoRI, XbaI, SpeI, PstI y NotI. También son que tiene la capacidad de geliicar soluciones
útiles: BamHI, XhoI, NheI, BglII y EcoRV. sis, como muestra este video. Se puede consultar
funciona. acuosas. Es utilizado para preparar geles de
más información explicando la preparación un gel de
electroforesis.
electroforesis en esta página y en esta otra.
Marcadores de peso Sirven para identiicar fragmentos de DNA, Necesariamente se tienen que comprar. Otra
molecular RNA o proteínas completas por su tamaño o opción para DNA es preparar una reacción de Poliacrilamida Las soluciones de acrilamida deben de ser prepa-
masa molecular en los geles de electroforesis. digestión con una secuencia de DNA conocida La poliacrilamida es el resultado de una re-
rada con extrema precaución. El uso de la solución
Para más información puedes consultar que produzca un patrón con diferentes tama- acción química que resulta en la polimeriza-
debe de ser manejada con la misma precaución. Este
este sitio. ños de fragmentos y utilizarla como marcador. ción de sus componentes, generando un gel
video explica como preparar un gel de poliacrilamid,
que a diferencia del gel de agarosa no se ve
también se puede consultar esta página.
afectado por la temperatura y con tamaño de
Plásmidos Se utilizan para realizar clonaciones y expre- Para conocer más sobre SDS-PAGE
Pueden ser donados por un laboratorio de bio- poro menor.
sión, tanto en bacterias como en plantas. Esta consulte este video y este otro.
logía molecular o comprados y posteriormente
página es un repositorio de plásmidos donde
producidos y puriicados en el biohacker spa-
puedes obtener más información y ordenarlos. Buffer de corri- Este buffer sirve para correr los geles de po-
ce, como se ve en este video o en este otro.
Para más información consultar este video. da SDS-PAGE liacrilamida en la cámara de electroforesis.
Puede prepararse siguiendo este protocolo.
Suele prepararse una solución stock 10X de
Agua Se utiliza en experimentos de biología mole- la que se preparan soluciones de uso de 1X.
(Ultrapura - MilliQ) cular. Es agua puriicada y desionizada que no Puede ser producida en el biohacker space,
contiene microorganismos, sales ni substan- haciendo pasar agua destilada, por varios sis- Buffer de carga
temas de iltración: osmosis inversa, luz UV y Este buffer sirve para linealizar las muestras Se puede preparar siguiendo este protocolo. También
cias que puedan interferir con los experimen- SDS-PAGE
tos. Se puede consultar este sitio para iltración de microorganismos (20 µm). de proteínas a ser cargadas en los geles pueden observarse los pasos en este video. Conside-
más información. de electroforesis. re preparar varios viales de este buffer.
18 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 19
Trisaminometano y Ácido Clorhídrico. Buffer
Se prepara a partir de HCl puro, diluyendo con
Tris-HCl ácido, se utiliza para disminuir el pH de una
agua destilada y TRIS.
solución.
El Verde de Metilo es un colorante que ha sido utili-
Usualmente se utilizan colorantes comercia- zado ampliamente en histología, pero también es una Trisaminometano e hidróxido de sodio. Bu-
Se prepara a partir de NaOH en polvo, diluyen-
Tinciones para les para ver el DNA en la técnica de electro- excelente alternativa para teñir DNA de doble cadena Tris-NaOH ffer alcalino, se utiliza para aumentar el pH
do en agua destilada y TRIS.
DNA foresis. Sin embargo existen alternativas de como se puede ver en este artículo. También se pue- de una solución.
bajo costo. den usar el Azul de Metileno o el Violeta de Genciana,
siguiendo este protocolo. Enzima Enzima que produce copias de DNA durante
Puede ser producida siguiendo este protocolo.
Taq-Polimerasa la PCR, es resistente a altas temperaturas.
El colorante para proteínas LAWSONA puede ser ex- Ácido etilendiaminotetraacético. Agente quelante que atrapa minerales como el Mg2+ para
Uno de los colorantes más usados para teñir
proteínas es el Azul de Coomassie. Sin em-
traído de las hojas de Henna siguiendo este protoco- EDTA evitar que se activen algunas enzimas que puedan degradar el DNA o RNA.
Tinciones para lo. También existen colorantes alimenticios como el
proteínas bargo existen alternativas más económicas y
Rojo #3 (Azorubina) que puede ser usado siguiendo
rápidas. Se utiliza para unir fragmentos de DNA, usualmente para unir fragmentos de DNA que se
este protocolo. Enzima Ligasa quieren clonar en plásmidos que han sido cortados con enzimas de restricción.
Tetramethylethylenediamine (TEMED). Es Nucleótidos (ATCG) que conforman el DNA, sirven para la síntesis de las copias de DNA
Para hacer el gel de poliacrilamida se puede consul- dNTP’s
usado para polimerizar los geles de poliacrila- durante la PCR.
TEMED tar este protocolo para geles de DNA o este otro para
mida. Se utiliza en conjunto con el Persulfato
realizar electroforesis de proteínas.
de Amonio. Reactivos para Se utiliza para la puriicación de plásmidos.
Miniprep.
Dodecil sulfato sódico (SDS). Rompe enlaces
Se puede consultar este website para ver la prepara-
SDS no covalentes en proteínas, permitiendo rea- Tubos con resina de
ción de geles SDS-PAGE. Tubos con cobertura de sílica tratada para que los ácidos nucleicos queden atrapados en sus
lizar la electroforesis. Es ligeramente irritante. sílica para puriicar paredes mientras los demás componentes celulares pasan a través de estos.
nucleótidos.
20 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 21
Biología Celular (con células vegetales) Biología Celular (con células animales)
Substancia Descripción Formulación
Substancia Descripción
Medio Murashige y Skoog. Contiene nutrientes básicos
Existen recetas en internet, varias mo- Medio DMEM Medio básico para cultivo celular.
Medio MS para cultivo de tejidos vegetales, las recetas pueden va-
diicándolo para un mejor resultado.
riar dependiendo del tipo de vegetal.
Usado para levantar las células (estas crecen usualmente adhiriéndose en las paredes del
Tripsina-EDTA frasco).
Giberelinas, antocianinas, citoquininas, etileno, ácido Se pueden utilizar extractos vegetales
Reguladores abscísico, etc. Promueven el crecimiento y/o diferencia- de banana o de coco, que son ricos
de crecimiento Buffer fosfato Mantiene el pH a 7.2.
ción de las células (en la planta completa o solo en un en reguladores de crecimiento vegetal
vegetal órgano vegetal). y minerales.
Suero fetal bovino Medio de cultivo para células animales.
Algunos extractos vegetales poseen
Antibióticos Evita contaminación de bacterias y hongos/levaduras.
Antibióticos Evitan contaminación por bacterias y hongos/levaduras. propiedades antibacterianas y/o
antimicóticas.
22 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 23
BIOSEGURIDAD Y REGULACIÓN
DE
BIOHACKER SPACES
LA COMUNIDAD DIY-BIO SIGUE CRECIENDO GRACIAS
A LA DEMOCRATIZACIÓN DE TECNOLOGÍAS Y EL LIBRE
Este manual está enfocado en el uso de organismos segu-
ACCESO A LA DOCUMENTACIÓN CIENTÍFICA. ros, nada de lo mencionado en el presente documento puede
o debe ser usado para trabajos con patógenos, toxinas u otro
tipo de organismos que representen riesgos biológicos. Con-
Más personas se siguen sumando a este movimiento, el cual ya viene obteniendo sideramos que si son realizadas estas prácticas de forma
resultados positivos en diferentes países. Sin embargo, la comunidad latinoameri- segura, esto ayudará a una mejor difusión de los trabajos y a
cana aún es joven; por lo tanto, necesita de ciertas guías para manejarse fuera de la democratización de la ciencia en general. En esta sección
un ambiente académico o empresarial, y también para evitar que se genere miedo abordaremos las buenas prácticas dentro de un biohacker
en la población. La comunidad DIY-Bio tiene como prioridad y parte de su ilosofía space, códigos de ética de la comunidad DIY-Bio en el mundo y
el asegurarse que no se desarrolle nada que pueda causar daño. Por este motivo, las regulaciones y entes reguladores en Brasil, México y Perú.
uno de los objetivos de este manual es proveer información básica con respecto a
regulaciones y temas de bioseguridad en la región latinoamericana.
24 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 25
A- LISTA DE BUENAS B- CÓDIGO
PRÁCTICAS DE ÉTICA
-Almacenar los reactivos según
sus características químicas ais-
COMPILAMOS EL CÓDIGO DE ÉTICA Y/O
lando los peligrosos. CONDUCTA UNIVERSAL DE LOS BIOHACKERS,
PARA BIOHACKERS -Los productos tóxicos o inlama- Y/O CONDUCTA USANDO COMO BASE LOS CÓDIGOS USADOS
bles deben ser trabajados dentro
de la campana de extracción de POR LA COMUNIDAD DE NORTE AMÉRICA Y DE
gases. EUROPA LISTADOS EN DIYBIO.ORG:
-Contar con las instalaciones adecuadas, estas -No usar la boca para operar las pi-
instalaciones dependen de la actividad y la regu- petas graduadas.
lación de cada país. -No comer, beber ni fumar en el
-Desechar los materiales y reactivos utilizados área del laboratorio y evitar el uso -Transparencia: Promover la transparencia -Propósitos pacíicos: La biotecnología sólo
según su naturaleza y las normas de Bioseguri- de productos para la piel (maquilla- y compartir ideas, conocimiento, datos y re- debe ser usada para propósitos pacíicos.
dad del cada país. jes, protectores solares, etc.) du- sultados. -Respeto: Respetar a los humanos y a todos
-Tener una comisión de Bioseguridad interna. rante las actividades. -Seguridad: Adoptar prácticas seguras. los sistemas vivos.
-La comisión de Bioseguridad debe entrenar los -Lavarse las manos antes de salir -Democratización: Promover la ciencia ciu- -Responsabilidad: Reconocer la complejidad
nuevos miembros del grupo en el uso apropiado del laboratorio. dadana y descentralizar el acceso a la bio- y dinámica de los sistemas vivos y nuestra
de los equipos y experimentos. -Uso de vestimenta y equipo de pro- tecnología. responsabilidad hacia ellos.
-Marcar todas las sustancias y soluciones indi- tección personal (guantes, mandil, -Educación: Ayudar a educar al público acer- -Rendir cuentas: Rendir cuentas por tus
cando su riesgo biológico o químico. Siempre mascarilla, etc.) según la actividad ca de la biotecnología, sus beneicios y sus acciones y por la defensa de este código.
agregar en la etiqueta la fecha de elaboración y a realizar en el laboratorio. implicaciones. -Medio ambiente: Respetar el ambiente.
quien la elaboró. -Evitar tocar el rostro, ojos, boca o -Humildad: Reconocer que no lo sabes todo. -Experimentar: Experimentar con biología
-Consultar y respetar el riesgo biológico o quími- cabello para evitar contaminación. -Comunidad: Cuidadosamente escuchar lleva al descubrimiento, descubrir lleva a la
co de las sustancias que van a ser usadas. -Para más información consulte cualquier preocupación y pregunta y respon- innovación.
este manual. der honestamente.
26 La Guía Esencial del Biohacker - BioHackGuide BioHackGuide - La Guía Esencial del Biohacker 27
C- REGULACIONES D- REGULACIONES
INTERNACIONALES NACIONALES
Los protocolos y convenciones más importantes a nivel
internacional son:
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-¿Qué áreas serán certiicadas? Ningún experimento que involucre organis-
I. BRASIL
-¿Se tienen equipos de contención? mos modiicados genéticamente se puede
Peril de regulación en Brasil -¿Se tienen equipos para la prevención y hacer sin tener un proyecto aprobado por la
manejo de accidentes?, tales como CIBIO.
duchas para lavar cuerpo y ojos.
La Comisión Técnica Nacional de Bioseguridad -¿Qué tipos de OGM serán usados y la Uno de los puntos claves en los espacios
-La construcción.
(CTNBio) es la entidad responsable clasiicación de riesgo en la que estos es el descarte apropiado de residuos. Este
-El cultivo.
por regular el trabajo en contención con OGM están clasiicados? descarte está regulado por la norma PNRS
-La manipulación.
(Organismos genéticamente modiicados). -¿Que nivel de riesgo será el laboratorio (Política Nacional de Residuos Sólidos), que
-El transporte o transferencia.
Esta comisión emite el Certiicado de Calidad en (I,II,III o IV)? explica las características de estos residuos y
-La importación o exportación.
Bioseguridad (CQB) que regula las instituciones -¿El laboratorio cumple con los requisitos cuales son sus tratamientos o procedimientos
-El almacenamiento, liberación
(públicas o privadas) que deseen en el ámbito mínimos enumerados por la CTNBio? de descarte.
en el medio ambiente
experimental realizar las siguientes -¿Quién será el técnico responsable
o eliminación.
actividades usando OGMs: por el laboratorio?
Después de evaluar la documentación enviada, Para más información consulte:
Los miembros de la CIBIO deben tener los la CTNBio, puede solicitar aclaraciones, nuevos -Resolución Normativa Nº 1: Regula
conocimientos cientíicos y la experiencia documentos y programar una visita al espacio a la CIBIO y a la solicitación del CQB.
Para hacer ingeniería genética es necesaria
para evaluar y supervisar el trabajo con que va a recibir el CQB. Un CQB corresponde a -Resolución Normativa Nº 2: Regula la
obtener el CQB. El primer paso para obtener
organismos modiicados genéticamente. una unidad operativa de la institución, que puede clasiicación de los riesgos de los OGM
el CQB es establecer una Comisión Interna
estar compuesto por uno o más laboratorios. y de los niveles de bioseguridad.
de Bioseguridad (CIBIO). El representante
La CIBIO debe tener al menos 3 miembros, y -Website de la CNTBio.
legal de la institución constituirá y nombrará la Sólo después de la aprobación de el CQB, la
el representante legal de la institución desig- -NBR 10.004: Clasiicación de residuos.
CIBIO, los nombres de las personas que CIBIO puede iniciar la aprobación de proyectos
-NBR 9800: Clasiicación de eluentes.
componen esta comisión deben ir adjuntos nará a uno de los miembros como presidente, que utilicen las instalaciones certiicadas.
es permitido un único miembro externo a la -RDC - 306 y CONAMA 358: Hablan
al pedido de CQB. El presidente de la CIBIO, La CIBIO sólo puede aprobar el desarrollo de
comunidad cientíica. de residuos del área de salud.
así como sus miembros, son responsables proyectos de nivel I de bioseguridad, cualquier
-NR6: Deine los equipos de
legales de el CQB. proyecto que necesite instalaciones u
El segundo paso para solicitar el CQB es protección individual (EPIs).
organismos clasiicados como nivel II deberá
enviar el formulario de pedido a la CTNBio. -NBR 14725-1: Norma para
ser encaminado por la CIBIO de la institución a la
Para llenar este formulario algunos puntos rotular los descartes.
CNTBio para ser evaluado.
deben ser claros y deinidos previamente:
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II. MÉXICO Peril de regulación en México III. PERÚ Peril de regulación en Perú
En México existe una comisión intersecre- La CIBIOGEM fue creada en el año 2006 En Perú, el Organismo de Evaluación y Fis- También existen normativas para regular el
tarial dependiente del gobierno federal, esta como un requisito explícito de la Ley de Bio- calización Ambiental (OEFA) es el ente en- ingreso al país de organismos vivos (no mo-
comisión denominada CIBIOGEM (Comisión seguridad de Organismos Genéticamente cargado de la vigilancia, control, supervisión, diicados), procedentes de sus ambientes na-
Intersecretarial de Bioseguridad de los Orga- Modiicados y es la responsable de publicar la iscalización y sanción del uso y utilización turales, de laboratorios o colecciones cientíi-
nismos Genéticamente Modiicados) está en- normatividad y recibir las solicitudes de regis- de Organismos Vivos Modiicados (OVM) en cas. Esto es regulado en Perú por SENASA.
cargada de la regulación de los organismos tro de OGM, para uso, gestión y producción territorio nacional. La moratoria OVM impide el Por otro lado, para poder acceder a recursos
genéticamente modiicados en el territorio de OGM. ingreso y producción en el territorio nacional genéticos, es necesario revisar las normas
Mexicano. de organismos vivos modiicados (OVM) con que regulan este procedimiento, las cuales
ines de cultivo o crianza, incluidos los acuá- se encuentra en el Reglamento de Acceso a
Además de la CIBIOGEM, otras entidades como SAGARPA y SEMARNAT, que son parte ticos, a ser liberados al ambiente. Para más Recursos Genéticos.
de la mesa directiva de CIBIOGEM, han aplicado la regulación de uso de OGMs. información consulte la Ley N29811
y la tabla de infracciones.
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A. COMUNIDAD
BIOHACKER
Versión
en formar una masa crítica. Este grupo mínimo de personas
1.1 generará un efecto en más personas de tu entorno,
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B. ESPACIO C. EQUIPOS E INSTRUMENTACIÓN
-Tipos de Financiamiento: Financiamiento Fijo - Si no se logra el monto objetivo las Existen otras plataformas que pueden interesar al lector, dependiendo de las necesidades
donaciones son devueltas. Financiamiento Flexible - No requiere de un monto ijo y/o países donde se encuentre ubicado el espacio: Capitall Cell, Futsci, Sciencestarter,
de dinero a alcanzar, si no se logra obtener todo el monto el dinero no se devuelve. Fundly, Rocket Hub, Endeavorist, entre otros.
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II. COMPETENCIAS Y FONDOS III. COMPETENCIAS Y FONDOS
INTERNACIONALES VVVNACIONALES
-Hello Tomorrow.
-Get it the ring. EN BRASIL
-500 StartUps. -BioMinas.
-StartUp Chile.
L
A E
EN MÉXICO:
Í
-Seed Starts.
L D
U ESENC I A
-StartUp Battleield.
LA G
-StartUp México.
-Pitch Competition. -Premio Nacional del Emprendedor.
R
-Premio Santander.
E
-Premio de Innovación UNAM.
H AC K
BIO
EN PERÚ:
n
-StartUp Perú. Versió
-Ideas Audaces.
IV. PRODUCTOS Y SERVICIOS 1.1
D QUE EL ESPACIO PUEDE OFRECER
-Capacitaciones.
-Talleres/Workshops.
-Eventos de difusión.
-Kits básicos para actividades en ciencia.
-Espacio de co-working.
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