UNIVERSIDAD JUÁREZ AUTÓNOMA DE TABASCO

“ESTUDIO EN LA DUDA. ACCIÓN EN LA FE”

División Académica Multidisciplinaria de Comalcalco

LICENCIATURA:
En Rehabilitación Física

SEMESTRE Y GRUPO:
4° “O”

INTERESANTES DEL EQUIPO:

Álvarez Martínez Yahaira Gisell
Cortázar Lázaro Yuneri
Cerino Rivera Lizbeth
Guzmán Castro Diana Laura
Hernández de la Cruz Perla Carolina
López Cortázar Ivett Saraí
Madrigal Díaz Berthalila

ASIGNATURA:
Bases de bioquímica y biología molecular

ACTIVIDAD:
Transcripción del ARN
DOCENTE:
Prof. Daniel Cadena Sandoval

29 de Mayo del 2020

 Introducción

A continuación, daremos a conocer la importancia que tiene la

traducción del ARN a proteína, que se debe de tomar en cuenta es
que el ARN de transferencia es importante para la interpretación
genética. Por otro lado, las proteínas son productos de los genes, y los
genes están formados por fracciones de cadenas de ADN.

La traducción es el paso de la información transportada por el ARN-m

a proteína. La especificidad funcional de los polipéptidos reside en su
secuencia lineal de aminoácidos que determina su estructura primaria,
secundaria y terciaria. De manera, que los aminoácidos libres que hay
en el citoplasma tienen que unirse para formar los polipéptidos y la
secuencia lineal de aminoácidos de un polipéptido depende de la
secuencia lineal de ribonucleótidos en el ARN que a su vez está
determinada por la secuencia lineal de bases nitrogenadas en el ADN.

Los elementos que intervienen en el proceso de traducción son

fundamentalmente: los aminoácidos, los ARN-t (ARN transferentes),
los ribosomas, ARN-r (ARN ribosómico y proteínas ribosomales), el
ARN-m (ARN mensajero), enzimas, factores proteicos y nucleótidos
trifosfato (ATP, GTP).
 Traducción del ARN a proteína
Un gen se usa para construir una proteína en un proceso de dos pasos
Paso 1: la transcripción. Aquí la secuencia de ADN de un gen se vuelve a
escribir en forma de ARN, para hacer un producto final llamado ARN
mensajero o ARNm
Paso 2: la traducción. En esta etapa se decodifica para construir una
proteína que contiene una serie de aminoácidos en especifico

El código genético

El código genético contiene palabras o codones con una longitud uniforme de tres
letras. Las palabras de dos letras, formadas por cualquier combinación de cuatro
letras, producen un vocabulario con solo 16 palabras, que no basta para los 20
aminoácidos. En contraste las palabras de cuatro letras producen un vocabulario
de 256 palabras, mucho mayor que lo necesario. Las palabras de tres letras
permiten un vocabulario posible de 64 palabras, más que suficiente, pero no
excesivo, para especificar cada uno de los 20 aminoácidos.
El ARN de transferencia (ARNt)
juega un papel importante en la
interpretación del código genético
y la traducción de una secuencia
de nucleótidos en una secuencia
de aminoácidos. Los ARNt son los
adaptadores entre el ARNm y las
proteínas.
Una región de una molécula de
ARNt interactúa en forma directa
con un codón del ARNm por apareamiento de bases complementarias. Esta unión
sucesiva de los aminoácidos especificados por una plantilla de ARNm es lo que
permite la síntesis precisa de proteína
Un código genético formado por tres letras puede ser superpuesto o no
superpuesto. Si se traslapan los codones, cada letra es parte de más de una
palabra, y al mutar una sola letra se cambian varias palabras al mismo tiempo.
La traducción correcta del mensaje transcrito o escrito en el código genético
depende de establecer el marco de lectura correcto para la traducción.

Código genético
estándar. Formado
por 64 codones
tripletes.

Todas las secuencias de nucleótidos se escriben en dirección 5´→3´asi, UAC

específica para tirosina y CAU es específica para histidina. El termino codón se
suele referir a tripletes de nucleótidos en el ARNm, pero también se puede aplicar
a tripletes de nucleótidos en la secuencia de ADN de un gen.
Los codones siempre se traducen de 5´→3´, comenzando por el extremo cerca del
5´del mensaje y siguiendo hacia el extremo de la región codificadora.
El código genético estándar tiene varias propiedades notables:
El código genético no es impreciso
Hay varios codones para la mayor parte de los aminoácidos
Los dos primeros nucleótidos de un codón bastan
Los codones con secuencia parecida especifican aminoácidos
químicamente similares
Solo 61 de los 64 codones especifican aminoácidos

ARN de transferencia

Las moléculas del ARN de transferencia son los intérpretes del código genético.
Son el eslabón más importante entre la secuencia de nucleótidos en el ARNm y la
secuencia de aminoácidos en un polipéptido. Para que el ARNt cumpla con este
papel, toda célula la debe contener cuando menos 20 especies distintas de ARNt y
cada ARNt debe reconocer al menos un codón.
 A. La estructura tridimensional del ARNt
Esta estructura en trébol
contiene varios brazos
formados por una vuelta, o
una vuelta con tallo unido con
puentes de hidrogeno. La
región de dos hebras en cada
brazo forma una hélice corta,
apilada y derecha, parecida a
la del ADN de doble hebra.
El extremo 5´y la región
cercana al extremo 3´de la
molécula de ARNt tiene
bases apareadas y forman el
tallo aceptor, o tallo
aminoácidos.
El aminoácido se une de
forma covalente al ARNt en el
extremo 3´de este tallo.
Todas las moléculas de ARNt
tienen un nucleótido
fosforilado en el extremo 5´.
El brazo de una hebra
opuesto al tallo aceptor se
llama bucle anticodon.
Contiene el anticodon, la
secuencia de tres bases que
se une a un codón
complementario en el ARNm.
Estructura secundaria del ARNt en forma de trébol.
El diagrama en trébol del ARNt es
una representación La molécula se divide en un tallo aceptor y cuatro
bidimensional. En tres brazos. El tallo aceptor es el sitio de fijación del
dimensiones la molécula de ARNt aminoácido y el brazo de anticodon es la región de la
esta doblada en forma de L. el molécula de ARNt que interactúa con los codones en el
tallo aceptor está en un extremo ARNm
de la molécula en forma de L y el
anticodon está en una vuelta en
el extremo opuesto.
La mayor parte de los nucleótidos en el ARNt son parte de dos hélices
perpendiculares y apiladas, las interacciones de apilamiento entre las bases son
aditivas y aportan una gran contribución a la estabilidad del ARN tasi como lo
hacen en el ADN de doble hebra.
B. Apareamiento de bases de anticodones en ARNt con codones en
ARNm
Las moléculas de ARNt y ARNm interactúan por apareamiento de bases entre
anticodones y codones. En consecuencia, el anticodón de una molécula de ARNt
determina dónde el aminoácido unido a su tallo aceptor se agrega a una cadena
de polipéptido. Durante la síntesis de proteína, la fenilalanina se une en
forma covalente al tallo aceptor de este ARNt. En consecuencia, la molécula se
representa
como ARNtFen.
 Mucho del apareamiento de bases entre el codón y el anticodón obedece a
las reglas de Watson-Crick de apareamiento de bases: A se aparea con U,
G con C y las hebras en la región de bases apareadas son antiparalelas.
Sin embargo, algunas excepciones a estas reglas condujeron a que Francis Crick
propusiera que se requiere apareamiento de bases complementarias según
Watson-Crick sólo para dos de los tres pares de bases formados. El codón debe
formar pares de bases de Watson-Crick con las bases en 3_ e intermedia del
anticodón, pero se permiten otros tipos de pares de bases en la posición 5_ del
anticodón. Este apareamiento alternado sugiere que la posición 5_ tiene
conformación flexible.

La base en la posición de tambaleo de muchos

anticodones se modifica en forma covalente y
permite más flexibilidad en el reconocimiento de un
codón. Por ejemplo, en varias moléculas de ARNt, G
en la posición 5_ de anticodón se desamina en el C-
2 para formar inosinato (I), que puede formar puente
de hidrógeno con A, C o U
El tambaleo permite que algunas moléculas de ARNt
reconozcan más de un codón, pero con frecuencia
se requieren varias moléculas diferentes de ARNt
para reconocer todos los codones sinónimos.
Moléculas diferentes de ARNt que se pueden fijar al mismo aminoácido se llaman
moléculas de ARNt isoaceptores.

AMINOACIL- ARNT SINTETASAS

La síntesis de las proteínas se puede dividir en las etapas de iniciación,

alargamiento y terminación de la cadena. Sin embargo, en la descripción de la
traducción se incluye un paso antes de la iniciación de la polimerización, que es la
aminoacilación del ARNt. La activación de los aminoácidos se considera parte del
proceso total de traducción, por ser un aspecto importante del flujo de información
biológica del ácido nucleico a la proteína. En la aminoacilación, un aminoácido
determinado se une en forma covalente al extremo 3_ de cada molécula de ARNt.
El producto de esta reacción se llama aminoacil- ARNt. Debido a que el
aminoacil-ARNt es una molécula rica en energía, se dice que el aminoácido está
“activado” para la transferencia siguiente a una cadena de polipéptido en
crecimiento. Una molécula determinada de aminoacil-ARNt se identifica con el
nombre del ARNt y el aminoácido unido; por ejemplo, el ARNtAla aminoacilado se
llama alanil-ARNtAla. Las diversas enzimas que catalizan la aminoacilación se
llaman aminoacil-ARNt sintetasas (como alanil-ARNt sintetasa).

A. Reacción de la aminoacil-ARNt sintetasa

La activación de un aminoácido por su aminoacil-ARNt sintetasa requiere ATP. La
reacción total es:

o Aminoácido _ ARNt _ ATP !Aminoacil-ARNt _ AMP _ PPi

El aminoácido se fija a su molécula de ARNt mediante la formación de un enlace

éster entre el grupo carboxilato del aminoácido y un grupo
hidroxilo de la ribosa en el extremo 3_ de la molécula de
ARNt. Como todos los ARNt terminan en ￢CCA, el sitio de
fijación siempre es un residuo de adenilato. La
aminoacilación se efectúa en dos pasos discretos
 En el primero, el aminoácido se activa por la
formación de un intermedio reactivo de aminoacil-
adenilato. El compuesto intermedio permanece
unido fuertemente, pero no en forma covalente, a la
aminoacil-ARNt sintetasa. La hidrólisis siguiente del
pirofosfato hace que la reacción sea esencialmente
irreversible.
 El segundo paso de la formación del aminoacil-
ARNt es la transferencia del grupo aminoacilo del
compuesto intermedio al ARNt. El aminoácido se
une al grupo hidroxilo en 2_ o en 3_ del residuo
terminal de adenilato en el ARNt, dependiendo de la
aminoacil-ARNt sintetasa específica que catalice la
reacción. Si al principio el aminoácido está unido al
grupo 2_-hidroxilo, éste se desplaza al grupo 3_-
hidroxilo en un paso adicional. El aminoácido debe
estar enlazado a la posición 3_ para servir como
sustrato en la síntesis de proteína

B. Especificidad de las aminoacil-ARNt sintetasas

La fijación de un aminoácido específico a su molécula correspondiente de ARNt es
un paso crítico en la traducción del mensaje genético. Si no se hace en forma
exacta, podría incorporarse un aminoácido incorrecto en una proteína. Cada
aminoacil-ARNt sintetasa se une al ATP y selecciona el aminoácido adecuado
basándose en su carga, tamaño e hidrofobicidad. Esta selección inicial elimina la
mayor parte de los demás aminoácidos. Por ejemplo, la tirosil-ARNt sintetasa casi
siempre se une a tirosina, pero rara vez a fenilalanina o a cualquier otro
aminoácido. Entonces la sintetasa se une en forma selectiva a una molécula de
ARNt. El ARNt adecuado se distingue por propiedades únicas de su estructura. En
particular, la parte del tallo aceptor que está en la superficie interna de la molécula
de ARNt en forma de L interviene en la unión del ARNt con la aminoacil-ARNt
sintetasa. En algunos casos, la sintetasa reconoce al anticodón y también al tallo
aceptor del ARNt.

La glutaminil-ARNt sintetasa se pone en

contacto con el tallo aceptor y la región de
anticodón en el ARNtGln. La glutaminil-ARNt
sintetasa no reconoce otros ARNt, asegurando
así que la glutamina se una en forma específica
al ARNt correcto. La estructura muestra también
una molécula de ATP unida en el sitio activo
cerca del extremo 3_ del ARNt.

C. Actividad correctora de las aminoacil-ARNt sintetasas

Debido a su especificidad hacia determinado aminoácido, la frecuencia de errores
en la mayor parte de las aminoacil-ARNt sintetasas es baja. Sin embargo, la
isoleucina y la valina son aminoácidos químicamente semejantes, y ambos caben
en el sitio activo de la isoleucil-ARNt sintetasa.
o La isoleucil-ARNt sintetasa cataliza, en forma errónea, la formación del
compuesto intermedio valil-adenilato más o menos en 1% de los casos.
La sustitución de valina por isoleucina en cadenas de
polipéptido se presenta más o menos una vez por
cada 10 000. Este valor menor de incorporación de
valina parece indicar que la isoleucil-ARNt sintetasa
discrimina también entre los dos aminoácidos
después de la formación del aminoacil-adenilato. La
isoleucil-ARNt sintetasa puede catalizar en forma
errónea la formación de valil-adenilato, en general
cataliza la hidrólisis del valil-adenilato incorrecto para
formar valina y AMP, o la hidrólisis del valil-ARNtIle.
No todas las aminoacil-ARNt sintetasas requieren
actividad de corrección. Por ejemplo, las cadenas laterales en la fenilalanina y la
tirosina difieren en un grupo hidroxilo, pero la tirosil-ARNt sintetasa puede
diferenciar con eficacia entre esos sustratos.
 Ribosoma

En la síntesis de proteína se requieren cuatro componentes discretos que deben

ensamblarse para formar un complejo de traducción elaborado: el ribosoma, que
cataliza la formación de enlaces peptídicos; sus factores accesorios de proteína,
que ayudan al ribosoma en cada paso del proceso; el ARNm, que lleva la
información que especifica la secuencia de la proteína, y los aminoacil-ARNt que
transportan a los aminoácidos activados.

Comparación de los ribosomas

procarióticos y eucarióticos. Ambos tipos
de ribosoma consisten en dos
subunidades, y cada una contiene ARN
ribosómico y proteínas. La subunidad
grande del ribosoma procariótico
contiene dos moléculas de ARNr:

El inicio consiste en ensamblar el complejo de traducción en el primer codón del

ARNm. Durante el alargamiento de la cadena de polipéptido, se mueven o
translocan, el ribosoma y los componentes asociados a lo largo de la plantilla de
ARNm, en dirección 5 - 3. El polipéptido es sintetizado desde su N-terminal hasta
su C-terminal. Por último, cuando se completa la síntesis de la proteína, se
desensambla el complejo de traducción en un paso aparte de terminación. Una
función importante del desensamble es liberar las dos subunidades ribosómicas
del ARNm, para que puedan participar en más rondas de traducción.
A. Los ribosomas están formados por ARN ribosómico y proteína

Todos los ribosomas contienen dos subunidades de tamaño desigual.

  En E. coli, la subunidad pequeña se llama subunidad 30S y la
subunidad grande se llama subunidad 50S. (Los términos 30S y 50S
se refieren a la velocidad de sedimentación de esas subunidades).
 La subunidad 50S también contiene, este túnel va desde el sitio de
formación del enlace peptídico y da cabida a la cadena creciente de
polipéptido durante la síntesis de proteína.

En E. coli, el componente de ARN en la subunidad 30S es un ARNr 16S de 1 542

nucleótidos, este ARNr 16S contiene extensas regiones de estructura secundaria
que se conservan mucho en los ribosomas de todos los organismos vivos. Hay 21
proteínas ribosómicas en la subunidad 30S.
La subunidad 50S del ribosoma de E. coli
contiene dos moléculas de ARN ribosómico: un
ARNr 5S de 120 nucleótidos y un ARNr 23S de 2
904 nucleótidos. Hay 31 proteínas diferentes
asociadas a las moléculas de ARNr 5S y 23S en
la subunidad 50S.

Los ribosomas eucarióticos tienen forma similar

a los bacterianos, pero los de algunos
eucariotas, en forma notable de vertebrados y
plantas de flor, son algo mayores y más
complejos. Los ribosomas intactos de
vertebrados se designan 80S, y están formados
por subunidades 40S y 60S.
 La subunidad 40S pequeña es análoga a la subunidad 30S del ribosoma
procariótico; contiene unas 30 proteínas y una sola molécula de ARNr 18S.
La subunidad grande 60S contiene unas 40 proteínas y tres moléculas de ARN
ribosómico: ARNr 5S, ARNr 28S y ARNr 5.8S.
El ARNr 5.8S tiene unos 160 nucleótidos de longitud, y su secuencia es parecida a
la del extremo 5 del ARNr 23S procariótico. Esta semejanza implica que el ARNr
5.8S y el extremo 5 del ARNr 23S procariótico se derivan de un ancestro común, y
que ha habido una fusión o división de ARNr genético durante su evolución. Este
procesamiento se acopla al ensamble del ribosoma, para la subunidad 30S de E.
coli.
Muchas de las proteínas ribosómicas tocan al ARN y se unen en forma específica
a regiones de estructura secundaria del ARNr 16S.
Otras forman contactos de proteína a proteína, y se ensamblan dentro del
complejo sólo cuando están presentes otras proteínas ribosómicas.

B. Los ribosomas contienen dos sitios de unión con aminoacil-ARNt

Los sustratos para la formación del enlace peptídico no son aminoácidos libres,
sino moléculas de aminoacil-ARNt relativamente grandes. Un ribosoma debe
alinear a dos moléculas adyacentes de aminoacil-ARNt de tal modo que sus
anticodones interactúen con los codones correctos del ARNm. Los extremos
aminoacilados de eso dos ARNt se ubican en el sitio de formación del enlace
peptídico. El ribosoma también tiene que sujetar al ARNm y a la cadena creciente
de polipéptido, y debe dar cabida al enlace de varios factores proteínicos durante
la síntesis de proteína. La capacidad de efectuar esas tareas en forma simultánea
explica, en parte, por qué el ribosoma es tan grande y complejo. La orientación de
las dos moléculas de ARNt durante la síntesis de proteínas.

Sitios de unión del ARNt en ribosomas

procarióticos. Durante la síntesis de
proteína, el sitio P está ocupado por la
molécula de ARNt unida a la cadena de
polipéptido creciente, y el sitio A
sostiene un aminoacilARNt. La cadena
de polipéptido en crecimiento pasa por
el túnel de la subunidad grande.
 La cadena creciente de polipéptido se une en forma covalente al ARNt ubicado en
el sitio peptidilo (sitio P), formando peptidil-ARNt. El segundo aminoacil-ARNt está
unido al sitio aminoacilo (sitio A). Al sintetizarse la cadena de polipéptido, pasa por
el túnel de la subunidad ribosómica grande, y emerge en la superficie externa del
ribosoma.

Iniciación de la traducción

El inicio de la síntesis de proteína consiste en ensamblar un complejo de

traducción al principio de una secuencia de codificación de ARNm. Este complejo
consiste de las dos subunidades ribosómicas, una plantilla de ARNm que se va a
traducir, una molécula de ARNt de inicio y varias proteínas accesorias llamadas
factores de iniciación.

A. ARNt de inicio
El primer codón que se traduce suele ser AUG. Toda
célula contiene al menos dos tipos de moléculas de
metionil-ARNtMet que pueden reconocer codones
AUG. Un tipo se usa en forma exclusiva en codones
de inicio, y se llama ARNt de inicio. El otro tipo sólo
reconoce codones internos de metionina. Aunque
estas dos moléculas de ARNtMet tienen distintas
secuencias primarias y diversas funciones, las dos
están aminoaciladas por la misma metionil-ARNt
sintetasa.

En las bacterias, al ARNt de inicio se le llama

ARNtf Met. El ARNt de inicio concarga (metionil-
ARNtf
Met) es el sustrato para la formiltransferasa que
cataliza la adición de un grupo formilo del 10-
formiltetrahidrofolato al residuo de metionina,
produciendo N-formilmetionil-ARNtfMet (fMet-
ARNtfMet)

B. Complejos de iniciación: sólo se ensamblan en codones de inicio

El ribosoma necesita diferenciar entre el AUG único correcto y todos los demás
AUG incorrectos. Estos otros AUG especifican residuos internos de metionina en
el marco de lectura correcto, o codones irrelevantes de metionina en los otros dos
marcos de lectura incorrectos. Es importante apreciar que el codón de inicio no
sólo es el primero de los tres nucleótidos del ARNm. En los procariotas, la
selección de un sitio de inicio depende de una interacción entre la subunidad
pequeña del ribosoma y la plantilla del ARNm. La subunidad 30S se une a la
plantilla del ARNm en una región rica en purinas, justo antes del codón correcto de
inicio.

C. Los factores de iniciación ayudan a formar el complejo de inicio

Los procariotas contienen tres factores de iniciación, llamados IF-1, IF-2 e IF-3.
Hay al menos ocho factores de iniciación eucarióticos. En los procariotas y en los
eucariotas, los factores de iniciación catalizan el ensamble del complejo de la
síntesis de proteína en el codón de inicio.

Una de las funciones del IF-3 es mantener las subunidades ribosómicas en

su estado disociado, uniéndose a la subunidad pequeña. Las subunidades
ribosómicas se unen por separado al complejo de inicio, y la asociación del
IF-3 con la subunidad 30S evita que las subunidades 30S y 50S formen
prematuramente el complejo 70S. El IF-3 también ayuda a posicionar al
fMet-ARNtfMet y al codón de inicio en el sitio P del ribosoma.
El IF-2 selecciona al ARNt iniciador del conjunto de moléculas
aminoaciladas de ARNt en la célula. Se une a GTP y forma un complejo IF-
2-GTP que reconoce en forma específica al ARNt de inicio y rechaza las
demás moléculas de aminoacil-ARNt.
El tercer factor de iniciación, IF-1, se une a la subunidad 30S y facilita las
acciones de IF-2 e IF-3.
Una vez formado el complejo 30S en el codón de inicio, la subunidad ribosómica
50S se une a la subunidad 30S. A continuación, el GTP unido al IF-2 se hidroliza y
se libera Pi. Cuando se hidroliza el GTP, los factores de iniciación se disocian del
complejo. El IF-2-GTP se regenera cuando el GDP unido se cambia por GTP.

El papel de los factores de iniciación procarióticos consiste en asegurar que

el ARNt de inicio aminoacilado (fMet-ARNtiMet) se halle correctamente
posicionado hacia el codón de inicio. Los factores de iniciación también
D. median
Inicio de la traducción en eucariotas
la formación de un complejo de inicio al reconstituir un ribosoma 70S
defactores
Uno de los tal manera
de que el codón
iniciación de inicio
más se posicione
importantes en loseneucariotas
el sitio P. es el eIF-4. La
Unión del eIF-4 a la estructura de la cubierta lleva a la formación de un complejo
de preinicio, formado por la subunidad ribosómica 40S, ARNt de inicio
aminoacilado y otros factores diferentes de iniciación. Entonces, el complejo de
preinicio busca a lo largo del ARNm en la dirección 5´--- 3´ hasta que encuentra un
codón de inicio. Cuando la búsqueda tiene éxito, la subunidad ribosómica pequeña
se coloca de tal modo que elMet-ARNtMet interactúa con el codón de inicio en el
sitio P. En el paso final se agrega la subunidad ribosómica 60S para completar el
complejo de inicio 80S, y todos los factores de iniciación se disocian. La
disociación del eIF-2, la contraparte eucariótica del IF-2 bacteriano, se acompaña
por hidrólisis de GTP.
 Alargamiento de cadena:
microciclo de tres pasos

Al final del paso de iniciación, el ARNm se coloca de modo que el siguiente codón
pueda ser traducido durante la etapa de alargamiento en la síntesis de proteína. El
ARNt de inicio ocupa el sitio P en el ribosoma, y el sitio A está listo para recibir un
aminoacil-ARNt. Durante el alargamiento de la cadena, cada aminoácido adicional
se agrega a la cadena naciente de polipéptido en un microciclo de tres pasos.
Los tres pasos de este microciclo son los siguientes:
1) posicionamiento del aminoacil-ARNt correcto en el sitio A del ribosoma;
2) formación del enlace peptídico
3) desplazamiento, o translocación del ARNm en un codón en relación con el
ribosoma (los dos ARNt en los sitios P y A del ribosoma también se traslocan).
La tasa aproximada de transcripción en los
procariotas es de 55 nucleótidos por
segundo, lo que corresponde a unos 18
codones por segundo, o la misma
velocidad con que se traduce el ARNm. En
las bacterias, el inicio de la traducción
sucede tan pronto como se sintetiza el
extremo 5de un ARNm, y se acoplan
traducción y transcripción.
Este estrecho acoplamiento no es posible en los eucariotas, porque transcripción y
traducción se efectúan en compartimientos separados de la célula, el núcleo y el
citoplasma, respectivamente.
En el núcleo deben procesarse los precursores eucarióticos del ARNm antes de
ser exportados al citoplasma para la traducción. Las moléculas grandes de ARNm
se pueden traducir en forma simultánea mediante muchos complejos de síntesis
de proteína, formando un polirribosoma o polisoma. La cantidad de ribosomas
unidos a una molécula de ARNm depende de la longitud del ARNm y la eficiencia
de inicio de la síntesis de proteína.

A. Los factores de alargamiento acoplan a un aminoacil-ARNt en el cirio

A
Al inicio del primer microciclo de alargamiento de cadena, el sitio A está vacío y el
sitio P está ocupado por el ARNt de inicio aminoacilado. El primer paso en el
alargamiento de la cadena es la inserción del aminoacil-ARNt correcto en el sitio A
del ribosoma. En las bacterias, este paso es catalizado por un factor de
alargamiento llamado EF-Tu. Es una proteína monomérica que contiene un sitio
de enlace para GTP. Cada célula de E. coli tiene unas 135 000 moléculas de EF-
Tu, por lo que es una de las proteínas más abundantes en ella.
 El EF-Tu-GTP se asocia a una molécula de
aminoacil-ARNt para formar un complejo
ternario que cabe en el sitio A de un ribosoma.
Casi todas las moléculas de aminoacil-ARNt in
vivo se encuentran en esos complejos
ternarios. La estructura del EF-Tu es parecida a
la del IF-2 (que también se une a GTP) y otras
proteínas G.
El complejo EF-Tu-GTP reconoce las
propiedades comunes en la estructura terciaria
de las moléculas del ARNt, y se une con fuerza
a todas las moléculas de aminoacilARNt,
excepto fMet-ARNtfMet.
Esta última molécula se distingue entre todas
las demás de aminoacil-ARNt por la estructura
secundaria diferente de su tallo aceptor.

Un complejo ternario de EF-Tu-GTP-aminoacil-ARNt se puede difundir libremente

al sitio A en el ribosoma. Cuando se forman pares correctos de bases entre el
anticodón del aminoacil-ARNt y el codón de ARNm en el sitio A, el complejo se
estabiliza.

el EF-Tu-GTP puede ponerse en contacto

con sitios del ribosoma y también con el
ARNt en el sitio P.
Estos contactos disparan la hidrólisis de
GTP a GDP y P1, causando un cambio de
conformación en el EF-Tu-GDP, que
suelta al aminoacil-ARNt enlazado.
Entonces, el EF-Tu-GDP se disocia del
complejo de alargamiento de cadena. El
aminoacil-ARNt permanece en el sitio A,
donde se coloca en posición para la
formación del enlace peptídico.
El EF-TU-GDP no puede unirse a otra molécula de aminoacil-ARNt hasta que se
disocie el GDP. Un factor adicional de alargamiento llamado EF-Ts cataliza el
intercambio de GDP con GTP (figura 22.22, página 702). Nótese que se hidroliza
una molécula de GTP por cada aminoacil-ARNt que se inserte bien en el sitio A.
 B. La peptidil transferasa cataliza la formación del enlace peptídico
Al unirse un aminoacil-ARNt correcto al sitio A se alinea el grupo a-amino del
aminoácido activado, que está junto al carbonilo de enlace éster, en el peptidil-
ARNt en el sitio P vecino. El par solitario de electrones en el átomo de nitrógeno
ejecuta un ataque nucleofílico sobre el carbono carbonílico, lo que da como
resultado la formación de un enlace
peptídico mediante una reacción de
desplazamiento. el sitio activo del
ribosoma alinea a esos sustratos, no
se comprende bien cómo es que el
ribosoma aumenta la velocidad de
esta reacción. La cadena peptídica,
que ahora tiene un aminoácido más
a lo largo, se transfiere del ARNt en
el sitio P, al ARNt en el sitio A.
La formación del enlace peptídico
requiere la hidrólisis del enlace
peptidil-ARNt rico en energía. La
cadena de polipéptido en
crecimiento está unida en forma
covalente al ARNt en el sitio A,
formando un peptidil-ARNt.
La actividad enzimática que causa
la formación del enlace peptídico se
llama peptidil transferasa. Esta
actividad está dentro de la
subunidad ribosómica grande.
Tanto la molécula de ARNt 23S
como las proteínas ribosómicas 50S
contribuyen a los sitios de unión con
sustrato, pero la actividad catalítica
está en el componente de ARN.
 C. La traslocación mueve al ribosoma un codón
Luego de que se forma el enlace peptídico, el peptidil-ARNt recién creado está en
parte en el sitio A y en parte en el sitio P. El ARNt desaminoacilado se desplaza
algo respecto del sitio P. Ocupa una
posición en el ribosoma, que se llama
sitio de salida o sitio E (E = salida).
Antes de que se pueda traducir el
siguiente codón, debe separarse el
ARNt desaminoacilado, y el peptidil-
ARNt debe transferirse por completo
del sitio A al sitio P. Durante el mismo
tiempo, el ARNm debe desplazarse
un codón en relación con el
ribosoma. Esta traslocaciónes el
tercerpaso del microciclo de
alargamiento de la cadena. En los
procariotas, el paso de traslocación
requiere un tercer factor de
alargamiento, elEF-G.
El enlazamiento deEF-G-GTP con el
ribosoma completa la traslocación del
peptidil-ARNt del sitio A al sitioP, y
separa al ARNt desaminoacilado del
sitio E. El EF-G mismo se libera del
ribosoma só-lo cuando su GTP
enlazado se hidroliza a GDP y Pi. La
disociación del EF-G-GDP deja li-bre
al ribosoma para iniciar otro
microciclo de alargamiento de la
cadena.
La cadena creciente de polipéptido
se extiende desde el peptidil-ARNt en
el sito P,pasa por un túnel en la subunidad 50S y sale a la superficie exterior del
ribosoma. Cada paso de traslocación impulsa la cadena por el túnel. El polipéptido
re-cién sintetizado no se comienza a doblar en su forma final sino hasta que sale
del túnel.Unas chaperonas, como la HSP70, ayudan a este doblamiento. El
microciclo de alargamiento se repite por cada nuevo codón que se traduce en el
ARNm, y resulta en la síntesis de una cadena de polipéptido que puede tener
varios residuos de longitud. Al final, el complejo de traducción llega al codón final,
al extremo de la región codificada, donde termina la traducción.
 E.

Terminación de la traducción

coli tiene tres factores de liberación (RF-1, RF-2 y RF-3) (RF, release factor) que
participan en la terminación de la síntesis de proteína. Después de la formación
del enlace peptídico final, el peptidil-ARNt se trasloca desde el sitio A hasta el sitio
P, como es lo usual. La traslocación posiciona uno de los tres codones de
terminación (UGA, UAG o UAA) en el sito A. Esos codones de terminación no son
reconocidos por molécula alguna de ARNt, por lo que la síntesis de proteína se
detiene en el codón de terminación. Al final, uno de los factores de liberación se
difunde al sitio A. El RF-1 reconoce UAA y UAG, y el RF-2 reconoce UAA y UGA.
El RF-3 se une a GTP e intensifica los efectos del RF-1 y el RF-2. Cuando los
factores de liberación reconocen a un codón de terminación, causan la hidrólisis
del peptidil-ARNt. Es probable que la liberación del polipéptido terminado se
acompañe de la hidrólisis de GTP y la disociación de los factores de liberación del
ribosoma. En este punto, las subunidades ribosómicas se separan del ARNm y los
factores de iniciación se unen a la subunidad 30S, como preparación para la
siguiente ronda de síntesis de proteína.
 La síntesis de proteínas es costosa en
energía

 La síntesis de proteínas es muy costosa; usa una gran fracción de todos los
equivalentes de ATP disponibles en una célula.

Por cada aminoácido agregado a una

cadena de polipéptido, se rompen cuatro La hidrólisis del GTP se acopla a
enlaces fosfoanhídrido: el ATP se hidroliza cambios de conformación en la
a AMP + 2 Pi durante la activación del maquinaria de traducción. En este
aminoácido, y se hidrolizan dos moléculas sentido, el GTP y el GDP funcionan
de GTP a 2 GDP + 2 Pi durante el como moduladores alostéricos.
alargamiento de la cadena.

La hidrólisis de cuatro enlaces A diferencia de la mayor parte de

fosfoanhídrido representa un cambios de conformación inducidos
gran cambio de energía por moduladores alostéricos, los
libre; mucho más que la que se cambios de conformación que suceden
requiere para formar un solo durante la síntesis de proteínas están
enlace peptídico. asociados a un considerable consumo
de energía.

La mayor parte de la energía “extra”

compensa la pérdida de entropía durante la Además, se pierde entropía
síntesis de proteínas. La disminución de cuando un aminoácido se une
entropía se debe principalmente al a un ARNt en particular, y
ordenamiento específico de 20 clases cuando un aminoacil-ARNt se
distintas de aminoácido para formar una asocia a un codón específico.
cadena de polipéptido.
 Regulación de la síntesis de proteínas

Una forma en que puede regularse la expresión génica es controlando la

traducción del ARNm a una proteína. El control de traducción puede ejercitarse
durante el inicio, el alargamiento o la terminación. En general, el control de la
traducción de la expresión génica se usa para regular la producción de proteínas
que se ensamblan en complejos de varias subunidades, y de proteínas cuya
expresión en la célula debe controlarse en forma estricta y rápida.

En el caso de la transcripción, la velocidad de traducción depende, hasta cierto

grado, de la secuencia en la plantilla. Por ejemplo, un ARNm que contenga
abundancia de codones raros se traduce con menos rapidez (y por lo tanto con
menos frecuencia) que uno que contenga los codones de uso más frecuente.
Además, la velocidad de inicio de la traducción varía con la secuencia de
nucleótidos en el sitio de inicio. Un sitio de unión fuerte con ribosoma en ARNm
bacteriano conduce a una iniciación más eficiente. También hay pruebas de que la
secuencia de nucleótidos que rodea al codón de inicio en ARNm eucariótico
influye sobre la velocidad de iniciación
Una diferencia entre el inicio de la traducción y el inicio de la transcripción es que
la formación de un complejo de traducción puede verse influido por la estructura
secundaria en el mensaje

Comparación de las estructuras secundarias propuestas

De los sitios de enlace S7. a) Sitio de enlace S7 en el ARNr 16S.
b) Sitio de enlace S7 en la molécula de ARNm str.
 Procesamiento postraduccional

A medida que el complejo de traducción se mueve a lo largo de la plantilla de

ARNm en la dirección 5 S 3, se alarga la cadena naciente de polipéptido. Los más
o menos 30 residuos de aminoácido polimerizados más recientemente
permanecen ocultos en el ribosoma, pero los residuos de aminoácido más
cercanos al N-terminal son expulsados del ribosoma.
Estos residuos N-terminales comienzan a doblarse formando la estructura nativa
de la proteína, aun antes de que se haya sintetizado el C-terminal de la proteína. A
medida que se doblan estos residuos, sobre ellos actúan enzimas que modifican la
cadena naciente. Las modificaciones que ocurren antes de que esté completa la
cadena de polipéptido se llaman cotraduccionales, en tanto que las que se
producen después de que está terminada la cadena se llaman postraduccionales.
Algunos ejemplos de las múltiples modificaciones cotraduccionales y
postraduccionales incluyen la desformilación del residuo N-terminal en proteínas
procarióticas, eliminación de la metionina N-terminal en proteínas procarióticas y
eucarióticas, la formación de puentes disulfuro, la división por proteinasas, la
fosforilación, la adición de residuos de carbohidrato y la acetilación a la membrana
plasmática, para secretarlos.

En los eucariotas, las proteínas destinadas a la secreción son transportadas a

través de la membrana del retículo endoplásmico en el interior del lumen, que
equivale topológicamente al exterior de la célula. Una vez transportada la proteína
dentro del retículo endoplásmico, puede ser transportada mediante vesículas, a
través del aparato de Golgi, a la membrana plasmática para liberarla fuera de la
célula.
 Ruta de secreción en células
eucarióticas. Las proteínas cuya síntesis se inicia en el citosol se
transportan al lumen del retículo endoplásmico. Después de más
modificaciones en el aparato de Golgi, las proteínas son secretada

La hipótesis de la señal

Las proteínas secretadas se sintetizan en la superficie del retículo endoplasmático,

y la proteína recién sintetizada atraviesa la membrana y va al lumen. En células
que producen grandes cantidades de proteína secretada, las membranas del
retículo endoplásmico están cubiertas con ribosomas.
La clave para el proceso por el cual muchas proteínas cruzan la membrana del
retículo endoplásmico aparece en los más o menos primeros 20 residuos de la
cadena de polipéptido naciente. En la mayor parte de las proteínas unidas a
membrana y secretadas, esos residuos sólo existen en el polipéptido naciente, y
no en la proteína madura.
La secuencia de residuos N-terminal que se elimina proteolíticamente del
precursor de la proteína se llama péptido señal, porque es la parte del precursor
que da la señal de que la proteína cruce una membrana. Los péptidos de señal
varían en su longitud y composición, pero en forma típica tienen de 16 a 30
residuos de longitud, y contienen 4 a 15 residuos hidrofóbicos.

Péptidos de señal a partir de proteínas secretadas. Los residuos hidrofóbicos

están en gris, y las flechas marcan los sitios donde se separa el péptido señal del
precursor. (OmpA es una proteína de membrana bacteriana).
 Referencias
1. Ángulo Rodríguez, A., Galindo Uriarte, A., Avendaño Palazuelos, R., y
Pérez Ángulo, C. (2011). Bioquímica. Culiacán, Sinaloa, México: UAS-
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2. Horton, H.R., Morán, L.A., Scrimgeour, K.G., Perry, M.D. y Rawn J.D.
(2008). Principios de Bioquímica. México: Pearson Educación.
3. Nelson, D.L. y Cox, M.M. (2019). Lehninger: Principios de Bioquímica.
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4. Pertierra, A. y Rivera, J. (2006). Fundamentos de Bioquímica Metabólica.
España: Tébar.