Examen Bioquímica

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1.

Ilustra esquemáticamente, con tu puño y letra, los complejos respiratorios I, II, III y IV localizados en la membrana interna de la
mitocondria que en su conjunto constituyen la cadena respiratoria. Notas: el complejo II también es parte del ciclo de Krebs.
Inclúyelo como tal en tu esquema; también incluye los COFACTORES (FMN, FAD, Citocromos-hay varios, núcleos de FeS) que
corresponden a cada uno de estos complejos PROTEÍNICOS; no olvides incluir en tu esquema los transportadores de electrones:
CoQ, transporta entre los (complejos [I y II] > complejo III) y el citocromo c transporta los electrones entre (el complejo III > complejo
IV).

Complejo I: NADH hasta ubiquinona.

EL Complejo I cataliza dos procesos simultáneos forzosamente acopla dos: (1) la transferencia exergónica hacia la ubiquinona de un ión hidruro del NADH y un protón de la matriz
expresado por: NADH H- H-" + Q ------▶NAD^ -f QHg (19-1) y (2) la transferencia endergónica de cuatro protones de la matriz hacia el espacio intemiembrana.
Complejo II: Succinato a ubiquinona: es la único enzima del ciclo del ácido cítrico ligado a este proceso. Aunque más
pequeño y más sencillo que el Complejo I, contiene cinco grupos prostéticos de dos tipos y cuatro subunidades proteicas
diferentes.

Complejo III: Ubiquinona a citocromo c: acopla la transferencia de electrones desde el


ubiquinol (QH2) al citocromo c con el transporte vectorial de protones de la matriz al
espacio intermembrana.

Se ha propuesto un modelo razonable para el paso de electrones y protones a través del


Complejo II a partir de su estructura y de detallados estudios bioquímicos de las
reacciones (ETAPA 1: IZQUIERDA, ETAPA 2: DERECHA)
ComplejoIV: En el último paso de la cadena respiratoria, el Compiejo IV,
también llamado citocromo oxidasa, transporta electrones desde el
citocromo c al oxígeno molecular, reduciéndolo a H2O.
2. Los complejos respiratorios (proteína y cofactores) son alimentados por electrones contenidos
en las especies reducidas de NADH (poder reductor catabólico) y FADH generados en el cíclo de
Krebs (3NADH; 1 FADH).
Haciendo referencia al:
-> POTENCIAL REDOX (busca una gráfica que ilustra: 1. el potencial redox de los complejos, 2. la
dirección en que se mueven los electrones en la cadena respiratoria y 3. la energía libre que se
libera en el proceso),
-> a los COFACTORES de los complejos,
-> y los transportadores CoQ y el citocromo C.
Ilustra la manera en que los electrones son transportados en esta cadena hasta finalmente llegar al
O2 para formar H2O.

Movimiento de
electrones:
3. La energía que se libera en el transporte de electrones se consume bombeando protones de la
matriz mitocondrial hacia el espacio intermembranal entre las dos membranas mitocondriales la
externa y la interna, generando un gradiente electroquímico de protones hasta que, en cada uno de
los complejos se acumula la energía suficiente para generar una molécula de ATP. Esto ocurre en
el momento que los protones del gradiente regresan al interior de la mitocondria atravesando el
complejo V, llamado también ATP sintasa. Ilustra todo este evento desde la formación del gradiente
electroquímico de protones hasta la síntesis del ATP. Esta es la base de la llamada TEORÍA
QUIMIOSMÓTICA DE MITCHELL. Incluye en tu imagen detalles estructurales de la ATP sintasa
comenzado primeramente con las estructuras básicas: Fo y F1.
La energía almacenada en este tipo de gradiente,
denominada fuerza protón-motriz, tiene dos
componentes: (1) la energía química potencial
debida a la diferencia en concentración de las
especies químicas (entre las dos regiones
separadas por la membrana, y (2) la energía
eléctrica potencial que se origina con la separación
de cargas cuando un protón atraviesa la
membrana sin un contraión.

Al producirse el gradiente de protones se


F1 sigue un mecanismo de catálisis
rotacional (impulsados por el paso de
protones) en el que los tres sitios activos
situados sobre F1 se alternan para la
catálisis de la síntesis de ATP

F0
Una subunidad BETA determinada empieza en con formación BETA-ADP, que une ADP y PI del
medio. A continuación la subunidad cambia de conformación, adoptando la forma p-ATP y que
une y estabiliza fuertemente el ATP. Finalmente, la subunidad cambia hacia la conformación
BETA-vacía, que tiene una afinidad muy baja por el ATP, por lo que el ATP recién sintetizado se
libera de la superficie del enzima. Cuando esta subunidad vuelve a adoptar la conformación
BETA -ADP se une ADP+P ,con lo que se inicia otra catálisis. Los cambios de conformación,
esenciales en este mecanismo, están impulsados por el paso de protones a través de la porción
Fo de la ATP sintasa
4. ¿Cómo se llama la acción de impedir la entrada de los protones almacenados en el espacio
intermembranal al interior de la mitocondria e inhibir la síntesis de ATP? Ilustra este acoplamiento
entre el transporte de protones a la matriz mitocondrial y la síntesis de ATP.

Existe una diferencia de concentraciones de


protones entre la matriz y el espacio
intermembrana. La energía asociada a esta
gradiente es utilizada para sintetizar el ate a
partir de ADP Y fosfato inorgánico

El protón ingresa a la subunidad Fo activando la


catálisis rotacional, sin embargo se requieren de
3 protones para producir la engría mecánica
suficiente para la síntesis del ATP

La energía es mecánica transferida se almacena


en los enlaces entre el ADP Y fosfato inorgánico,
de esta manera formando la molécula de ATP.

Finalmente por cambios comformacionales en la


subunidad B se libera el ATP sintetizado.

Estos son los agentes químicos que inhiben la síntesis de ATP mediante las
inhibiciones de las funciones de F0 y F1, de tal manera que se detiene el paso de
protones y como consecuencia la “anulación de la fuerza protón- motriz.”
5. Preguntas cortas:
a. Fuerza oxidante que jala a los electrones en su tránsito por la cadena respiratoria: __Los transportes electrónicos con su grupos
prostéticos capaces de aceptar y ceder uno o dos electrones.
b. Potencial redox: ____Positivo al ir avanzando en el transporte de electrones__________
c. Complejo enzimático que comparten el ciclo de Krebs y la cadena respiratoria: ______Complejo II_________
d. Cuál es el nombre del grupo prostético de los citocromos con el que transportan electrones: grupo prostético hemo que contiene
hierro

e. Transportador no proteínico de electrones entre el complejo I y el complejo III:


________Ubiquinol_
f. Transportador proteínico entre el complejo III y el complejo IV: _____Citocromo C_____
g. De qué manera se almacena la energía liberada durante el transporte de electrones a lo largo de la cadena respiratoria:
_______Mediante un gradiente de protones generando un potencial electroquìmico ___ y cómo se aprovecha esta energía potencial
almacenada para sintetizar ATP, transformándola en energía química (in enlace anhidro): _____Mediante una catálisis rotacional
promovida por la fuerza protón motriz__________
FOTOSÍNTESIS
6. Define las fases de la fotosíntesis - la LUMINOSA (que ocurre en 2 etapas: en la primera
se genera ATP y en la segunda NADPH) y la OBSCURA (fase independiente de luz
conocida como el ciclo de Calvin que capta CO2 para formar G3P).

Las reacciones luminosas de la fotosíntesis son las que dependen


directamente de la absorción de la luz; la foto química resultante toma
electrones del H2O y los conduce a través de transportadores unidos a
membrana, produciendo NADPH y ATP.

Las clorofilas están asociadas a


proteínas de unión específicas,
formando los complejos de captación
de la luz (LHC) en los que las
moléculas de clorofila están en
posiciones fijas en relación una con
otra, con otros complejos proteicos y
con la membrana.

Las reacciones de
asimilación de carbono de
la fotosíntesis (Fase
obscura) reducen el
CO2con electrones del
NADPH y energía del ATP
Cuando se excita la clorofila por la luz visible en hojas
intactas ,lo que ocurre es una transferencia directa de
energía desde la clorofila antena excitada a una molécula
de clorofila vecina, que queda excitada al tiempo que la
primera molécula.vuelve a su estado basal. Esta
transferencia de energía, (transferencia de excitones) se
repite hacía un tercer, cuarto o posterior vecino hasta
que se excita un par especial de moléculas de clorofila a
en el centro de reacción . En esta molécula de clorofila
excitada se promueve el paso de un electrón a un orbital
de energía superior. Este electrón pasa a continuación a
un aceptor electrónico vecino que forma parte de la
cadena de transferencia electrónica, dejando la clorofila
del centro de reacción con un electrón menos .El aceptor
electrónico adquiere una carga negativa. El electrón
perdido por la clorofila del centro de reacción es
reemplazado por un electrón de una molécula dadora de
electrones vecina generalmente agua.

8. Ilustra y describe cada uno de los elementos de la segunda etapa de la fase luminosa que resulta en la generación de NADPH, tal y
como se describe a continuación: 

Los electrones en la PLASTOCIANINA, el elemento de más bajo potencial redox del fotosistema II, son transferidos a
la clorofila reductora del fotosistema I (P700). Una vez activada por fotones, la clorofila reductora P700 excitada transfiere a los
electrones a la cadena de transporte de electrones asociada al fotosistema I. El último de los aceptores de electrones de esta cadena es la
FERREDOXINA que finalmente transfiere los electrones al NADP, para formar NADPH en una reacción catalizada por la FERREDOXINA-
NADP REDUCTASA.
.

En el foto- sistemaII (PSII) sucede la excitación de su centro de reacción P680 que impulsa electrones a través del
complejo del citocromo b6f con el movimiento con de protones a través de la membrana del tilacoide hacia el lumen.

Los electrones almacenados temporalmente en el plastoquinol


como resultado de la excitación de P680 del PSIl se transportan a
P700 de PSl mediante el complejo del citocromo b6f y la proteína
soluble plastocianina.

El fotosisterna I (PSI) Tiene un centro de reacción designado P700 y


una elevada proporción de clorofila a respecto a clorofila b. El P700
excitado pasa electrones a la proteína Fe-S ferredoxina y a
continuación al NADP+ produciendo NADPH.
7.ilustra cuidadosamente la primera etapa de la fase luminosa para la síntesis de atp como se describe a continuación.
En la primera etapa de la fase luminosa, la energía luminosa (fotones) es captada por los pigmentos antena que excita a la
clorofila P680,  la clorofila reductora del fotosistema II. Ésta capta electrones del agua y los transfiere al aceptor primario de
electrones de la cadena respiratoria del fotosistema II llamado FEOFITINA (el elemento con el mayor potencial redox de esta cadena),
que a su vez los transfiere a la PLASTOQUINONA, luego al CITOCROMO B6F y finalmente a la PLASTOCIANINA (el elemento
con el menor potencial redox de esta cadena). El fotosistema II y la cadena respiratoria asociada están insertados en
la  membrana tilacoidal. La energía que se libera con el movimiento de los electrones bombea protones hacia el lumen tilacoidal
creando allí un gradiente de protones (energía potencial).  La energía cinética con la que regresan los protones al estroma a través de
la "ATP sintasa" insertada en la membrana tilakoidal, se transforma en energía química- ADP + P-> ADP-P. resulta en la síntesis
de ATP. 

Las moléculas transferidoras de electrones en la


cadena de transportadores que interconecta PSII con
PSI están orientadas de forma asimétrica en la
membrana del tilacoide, por lo que el ñujo de
electrones fotoinducido da lugar a un movimiento neto
de protones a través de la membrana, desde lado del
estroma a la luz del tilacoide.
9. Describe e ilustra, paso a paso, el ciclo de Calvin o sea la fase obscura de la fotosíntesis, explicando
también su vinculación con las 2 etapas de la fase luminosa de la fotosíntesis.

Después de haberse sintetizado el ATP Y EL


NADHP (fase luminosa) los cuales han sido
liberados hacia el estrroma ,estos son utilizados
en la fase oscura de la fotosíntesis, es decir la
fijación del CO2 mediante el ciclo de Calvin
Fase 1:

Se cataliza la incorporación
dcl CO2 por la ribulosa 1,5-
bisfosfato carboxilasa/oxi-
genasa al azúcar de cinco
carbonos ribulosa 1,5-
bisfosfato y el rompimiento
del intermedio inestable de
seis carbonos formando dos
moléculas de 3-
fosfoglicerato.
Fase 2: Conversión del 3-fosfoglicerato en gliceralde hído 3-fosfato .

El 3-fosfogliceratof omiado en la fase1se convierte en gliceraldehído 3-fosfato


en dos pasos que son, básicamente, el inverso de los pasos correspondientes
en la glucólisis, con una excepción: el cofactor nucleotídico para la reducción
del 1,3-bisfosfoglicerato es el NADPH y no el NADH.

En el primer paso de la fase 2,la 3-


fosfoglicerato quinasa del estroma cataliza
la transferencia de un grupo fosforilo
desde el ATP al 3-fosfoglicerato, dando
1,3-bisfosfoglicerato. A continuación el
NADPH dona electrones en una reducción
catalizada por la isozima específico del
cloroplasto de la glicerald e hído 3 -fosfato
deshidrogenasa, produciendogliceraldehído
3-fosfato y Pi. La triosa fosfato isomerasa
interconvierte a continuación el
gliceraldehído 3-fosfato y la
dihidroxiacetona fosfato. La mayor parte
de las triosas fosfato así producidas se
utilizan para regenerar la ribulosa 1,5-
bisfosfato; el resto se convierte en almidón
en el cloroplasto, que es almacenado para
s u u s o p o s t e r i o r, o s e e x p o r t a
inmediatamente al citosol y se con vierte
en sacarosa para su transporte hacia
partes de la planta en crecimiento.
Fase 3: Regeneración de la ribulosa 1,5-bisfosfato a parir de
triosas fosfato. La primera reacción en la asimilación
de CO2para dar triosas fosfato consume ribulosa 1,5-
bisfosfato. Para el flujo conGnuo de CO2hacia los glúcidos se
debe regene rar constantemente la ribulosa 1,5-bisfosfato.
Esto se consigue con una serie de reacciones que, junto conl
as fases 1 y 2, forman la ruta cíclica. El producto de la
primera reacción de asimilación (3-fosfoglicerato)
experimenta una serie de transformaciones que regeneran la
ribulosa 1,5-bisfosfato. Entre los intermediarios de esta ruta
se cuentan azúcares de tres, cuatro, cinco, seis y siete
carbonos.
10. En la cadena respiratoria los electrones que se transportan hacia el O2 provienen del NADH o del FADH2
generados en el ciclo de Krebs. 
En la fase luminosa de la fotosíntesis los electrones que se transportan en la primera etapa de esta fase
provienen del H2O fotolizado y son captados por la clorofila P680 fotoexcitada. Ilustra detalladamente este
evento.

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