Tipos de Electroforesis
Tipos de Electroforesis
Tipos de Electroforesis
Tipos de electroforesis
• Electroforesis en gel
Existe una gran variedad de tipos de electroforesis en gel, que se pueden agrupar en dos
categorías:
○ SDS – PAGE
Permite el cálculo de parámetros moleculares, pues los complejos SDS-proteína se separan
estrictamente según su tamaño molecular. El SDS interacciona con las proteínas formando
complejos de características comunes independientemente de las de cada proteína. Las proteínas
unen una molécula de SDS por cada dos aminoácidos, lo que implica que las cargas propias de las
proteínas quedan enmascaradas o anuladas; asimismo, la molécula de SDS proporciona una carga
negativa, por lo que los complejos SDS-proteína están cargados negativamente de forma
uniforme.
Como se comentó, la movilidad electroforética en una PAGE es función del tamaño y de la carga
por unidad de masa; como ésta es constante para todos los complejos SDS-proteína, esta
movilidad es solamente función de la masa molecular, es decir, cuanto menor sea la masa
molecular de la proteína, mayor será la movilidad de la misma y viceversa.
En resumen, la SDS-PAGE es la electroforesis más utilizada para el análisis de proteínas debido a:
1 La gran mayoría de las proteínas son solubles en SDS.
2 Todos los complejos SDS-proteína tienen carga negativa y migran, por lo tanto, en el mismo
sentido.
3 Su densidad de carga es muy elevada, por lo que su velocidad de migración también lo es y las
electroforesis son muy rápidas.
4 La separación depende de un parámetro físico-químico, como es la masa molecular, que se
puede calcular.
5 Los complejos SDS-proteína se tiñen fácilmente.
Figura: Efecto del SDS y del DTT en la movilidad electroforetica de proteinas monomericas. En una
proteina nativa de 25 KDa, carente de puentes disulfuro, el tratamiento con SDS (_____) o con SDS
+ DTT (--------) producen identico resultado. La proteina con un puente disulfuro intracatenario, en
presencia de SDS se desnaturaliza parcialmente, manteniendo sin desplegar la zona que abarca el
disulfuro. El tratamiento con SDS + DTT rompe el puente disulfuro y permite el despliegue total de
la proteina.
○ Isoelectroenfoque
Es un tipo particular de electroforesis en la que los compuestos anfóteros se separan según su
punto isoeléctrico (pI; pH al cual la carga neta de la proteína es nula) en un gradiente continuo de
pH.
En todos los métodos electroforéticos descritos anteriormente, la difusión es un fenómeno con
efectos negativos, que tiende a ensanchar las bandas, disminuyendo la resolución. En el EEF el
efecto de la difusión es mínimo y por ello posee una enorme resolución, pudiendo llegar a separar
proteínas que difieran en 0.001 unidades de pI. Esto se debe a que si una proteína focalizada en
su pI se desplazase por difusión, adquiriría carga (positiva o negativa según hacia el polo que
difundiera) y por efecto del campo eléctrico volvería a la zona de su pI; esto se llama efecto
focalizante del EEF y es el responsable de su enorme resolución. Además, el EEF aumenta su
resolución al disminuir el intervalo de gradiente de pH.
Por todo esto, el disponer de un gradiente estable de pH es lo esencial del EEF; para ello, se
emplean compuestos anfóteros de bajo peso molecular llamados anfolitos portadores, que son
pequeñas poliaminas (alrededor de 750 kDa) con abundantes grupos ácidos y básicos, con un pI
que abarca desde 2.5 hasta 11.0, con gran capacidad de tamponación cerca de su pI y con una
gran solubilidad y conductividad.
Una disolución de una mezcla de estos anfolitos tendrán un pH próximo al promedio de los pI. Si
esta disolución se emplea para la preparación de un gel de poliacrilamida, al aplicar una diferencia
de potencial cada molécula de anfolito migrará hacia uno u otro polo en función de su carga, hasta
alcanzar la zona de su pI. Cuando se alcanza el equilibrio queda formado un gradiente de pH a lo
largo del gel. Si, debido a la difusión, los anfolitos abandonasen la zona de su pI, adquirirían carga
y experimentarían el efecto focalizante mencionado anteriormente.
Una de las aplicaciones más importantes del EEF es el cálculo de pI (figura ..); en el pocillo I se
aplican los marcadores de pI, y en el II la muestra (X) cuyo pI se desea conocer. El carril III
(sombreado) se emplea para determinar el gradiente de pH. Una vez corrido el gel, se trocea el
carril III y cada segmento (de 1-2 mm) se introduce en 1mL de agua, determinándose su pH.
Finalmente, se representa el pH de cada fracción, frente a su posición en gel. La distancia migrada
por la muestra (X) se interpola en la recta obtenida, determinándose así su pH.
Desventajas de la e. en gel:
• El tamaño de los poros y el radio de la molécula van a producir cierta resistencia o friccio al
movimiento de migración de la muestra en el gel.
(1)
Figura: Efecto del SDS y del DTT en la movilidad electroforetica de proteinas monomericas. En una
proteina nativa de 25 KDa, carente de puentes disulfuro, el tratamiento con SDS (_____) o con SDS
+ DTT (--------) producen identico resultado. La proteina con un puente disulfuro intracatenario, en
presencia de SDS se desnaturaliza parcialmente, manteniendo sin desplegar la zona que abarca el
disulfuro. El tratamiento con SDS + DTT rompe el puente disulfuro y permite el despliegue total de
la proteina.
○ Isoelectroenfoque