Publicacion Tirbas 2013 PDF
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AGRICULTURA SUSTENTABLE
ISBN 978-987-26716-1-7
3
4
RIZOSFERA, BIODIVERSIDAD Y
AGRICULTURA SUSTENTABLE
ISBN 978-987-26716-1-7
2013
5
Rizosfera, biodiversidad y agricultura sustentable / Ins Garca de Salamone
... [et.al.]; edicin literaria a cargo de Ins Garca de Salamone.
1a ed.Buenos Aires: Asoc. Argentina de Microbiologa; Ins Eugenia Garca
de Salamone, Susana Vzquez, Claudio Penna, Fabricio Daro Cassn, 2012.
E-Book.
ISBN 978-987-26716-1-7
Queda prohibida la reproduccin total o parcial del texto de la presente obra en cualquiera
de sus formas, electrnica o mecnica, sin el consentimiento previo y escrito de la Editorial.
6
http://www.aam.org.ar/
7
8
ndice de Contenidos
Prlogo............................................................................................ 13
Ins Eugenia Garca de Salamone
Captulo 1
Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas
rizosfricas y endoftas ................................................................... 15
Effect of agronomic practices on deleterious rhizosphere and endophytic bacteria
Marleny Burkett-Cadena, Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
Captulo 2
Interacciones entre fitopatgenos y microorganismos benficos
en la rizosfera ................................................................................. 33
Interactions among plant pathogens and beneficial rhizosphere microorganisms
Marta C. Rivera, Eduardo R. Wright
Captulo 3
Hongos formadores de micorrizas arbusculares: Influencia de las prcticas
agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin ....... 47
Arbuscular mycorrhizal fungi: Influence of agronomic practices on diversity
and dynamics of colonization
Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
Captulo 4
Huellas de la simbiosis pasto-endofito en el agroecosistema ....... 73
Footprints of grass-endophyte symbiosis in agroecosystems
Marina Omacini, Pedro E. Gundel, Mara Semmartin
Captulo 5
Bacillus thuringiensis y su utilidad en el control de insectos
asociados a la rizosfera ................................................................... 89
Bacillus thuringiensis and their utility in the control of insects associated
to the rhizosphere
Diego H. Sauka; Rodrigo H. Monella, Graciela B. Benintende
Captulo 6
Nematodos como indicadores de la calidad del suelo:
Efectos de la fertilizacin nitrogenada ......................................... 109
Nematodes as indicadors of soil quality:Effects of nitrogen fertilization
Claudia Viviana Azpilicueta, Mara Cristina Aruani
9
Ins Eugenia Garca de Salamone, Susana Vzquez, Claudio Penna, Fabricio Cassn
Captulo 7
Perfil Fisiolgico de Comunidades de Suelo Basado en el Consumo
de Oxgeno .............................................................................................. 123
Community-Level Physiological Profiling of Soil Communities Based on
Oxygen Consumption
Jay L. Garland, M. Celina Zabaloy
Captulo 8
Bacterias solubilizadoras de fsforo como biofertilizantes:
aislamiento, caracterizacin, diversidad y promocin del crecimiento vegetal .... 137
Phosphate solubilizing bacteria as biofertilizers: isolation, characterization,
diversity and growth vegetable promotion
Leticia A. Fernndez, Marcelo A. Sagardoy
Captulo 9
Investigacin aplicada en Azotobacter sp. dirigida a la promocin de
crecimiento en cultivos de inters econmico en Colombia .................... 151
Azotobacter sp. applied research aimed to growth promotion of crops with
economics interest in Colombia
Ruth Rebeca Bonilla, Ren Novo, Belisario Roncallo, Mauricio Camelo,
Paola Criollo, Germn Andrs Estrada, Mara Fernanda Garrido, Mnica Lpez,
Andrs Eduardo Moreno, Melissa Obando, Lorena Parra, Diego Mauricio Rivera,
Daniel Fernando Rojas, Mario Van Strahlen, Corina Zambrano
Captulo 10
El gnero Pseudomonas en suelos agrcolas y en rizosfera. De molculas
a comunidades ......................................................................................... 173
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere. From molecules to
communities
Betina Agaras, Claudio Valverde
Captulo 11
Asociacin entre Azospirillum brasilense y plantas de frutilla
(Fragaria ananassa): quimiotxis y colonizacin radicular ............................... 195
Association between Azospirillum brasilense and strawberry plants
(Fragaria ananassa): chemotaxis and root colonization
Ral O. Pedraza, Mara F. Guerrero-Molina, Beatriz C. Winik,
Mara L. Tortora, Alicia L. Ragout, Katia R. Teixeira, Beatriz E. Baca
Captulo 12
Etileno como mediador de los mecanismos directos e indirectos de la
promocin del crecimiento vegetal ejercido por rizobacterias ................... 215
Ethylene as a mediator of direct and indirect mechanisms carried out by
plant growth promoting rhizobacteria
Claudia M. Ribaudo, Daniela S. Riva, Jos A. Cur, Clara Ponds,
Antonio Granell-Richart, Mara L. Cantore
10
ndice de Contenidos
Captulo 13
Ms all del tratamiento a las semillas: Evolucin de productos basados
en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas ............................. 241
Beyond seed treatments: evolution of PGPR products containing complex
microbial communities
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena, Katheryn S. Lawrence
Captulo 14
Bacterias promotoras de crecimiento vegetal como componentes
en el mejoramiento ambiental .......................................................................... 261
Plant growth-promoting bacteria as a component for environmental improvement
Luz E. de-Bashan, M.C. Juan-Pablo Hernndez, Yoav Bashan
Captulo 15
Diversidad funcional de comunidades microbianas rizosfricas
en suelos expuestos a sustancias contaminantes ............................................... 287
Functional diversity of rhizosphere microbial communities in soils
exposed to contaminants
Jhovana S. Escobar Ortega, Agr. Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria,
Sebastian M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
Captulo 16
Acumulacin y tolerancia al metal pesado cadmio en rizobios de
vida libre y en simbiosis con leguminosas ........................................................... 307
Accumulation and tolerance to heavy metal cadmium in free-living rhizobia
and in symbiosis with legumes
Stella Castro, Eliana Bianucci, Jsica Rivadeneira, Mara del Carmen Tordable,
Adriana Fabra, Juan Sobrino-Plata, Luis Hernndez, Ramn Carpena-Ruiz
Captulo 17
Micorrizorremediacin como alternativa para la recuperacin de
suelos contaminados por actividades mineras ............................................................ 325
Myco-rhizoremediation as alternative for recovering soils polluted
by mining activities
Pablo Cornejo, Sebastin Meier, Csar Arriagada, Fernando Borie
11
12
Prlogo
13
Ins Eugenia Garca de Salamone
14
Captulo 1
Efecto de las prcticas agronmicas sobre
las bacterias deletreas rizosfricas y
endoftas
Effect of agronomic practices on deleterious rhizosphere
and endophytic bacteria
Marleny Burkett-Cadena a,1, Camilo A. Ramirez b, Mark R. Lilesc, Joseph W. Kloeppera
a
Department of Entomology and Plant Pathology, Auburn University, Auburn, AL 36849 USA.
b
Instituto de Biologa, Universidad de Antioquia, Medelln, Colombia. c Department of
Biological Sciences, Auburn University, Auburn, AL 36849 USA. 1Corresponding author.
E-mail: [email protected]
Introduction
Agronomic practices are well known to affect soil microorganisms (Lupwayi et al.
1998). The effects of tillage (Ceja-Navaro et al. 2010), cover crops (Carrera et al. 2007),
crop rotation (Buyer et al. 2010), and applications of pesticides (Allison et al. 2007),
fertilizers (Jangid et al. 2008), and soil disinfectants (Roux-Michollet et al. 2008) on
soil microorganisms have been documented on many crops. For example, positive
effects have been shown in agricultural systems with reduced tillage, cover crops or
crop rotation, indicating that these practices increased soil microbial diversity and
activity (Ceja-Navarro et al. 2010; Yin et al. 2010; Lupwayi et al. 1998). Likewise, green
manures and crop rotations can enhance soil bacterial population density and reduce
plant disease incidence through stimulation of antagonists (Wiggins, Kinkel, 2005).
Soil amended with poultry litter has higher bacterial diversity than inorganically
fertilized soils (Carrera et al. 2007). The effect of some agronomic practices on soil
microorganisms can also have negative consequences for plant growth. Deleterious
rhizobacteria (DRB), for instance, have been linked with reduced plant growth in
systems with continuous pesticide use and for monoculture crops (Schippers et al.
1987; Stroo et al. 1988). Rhizosphere and root-colonizing microorganisms represent
a highly diverse microbial assemblage that metabolizes the nutrients exuded by roots
and interacts closely with plants (Kluepfel, 1993). Only a minority of rhizosphere
microbes have been examined thoroughly for their relative importance in mediating
beneficial plant-microbial interactions (Compant et al. 2010). Several rhizobacterial
isolates are used as biological control agents or plant growth promoters (Raaijmakers
et al. 2009). However, the plant-rhizobacteria interaction does not always result in
enhanced plant growth or health, as some rhizobacteria cause deleterious effects on
plant growth (Kremer, 2007).
15
Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
Given the importance of soil microorganisms for soil health, quality, and
nutrient cycling, it is important to determine the effect of agronomic practices
on soil microbial ecology. This manuscript reviews literature and presents new
data on the response of the rhizosphere and endophytic bacteria to two
common agronomic practices used to manage pathogens: the application of
systemic fungicides and soil steaming.
16
Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
17
Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
Table 1.
Incidence and severity of fern deformation at KHD and Floricrops.
18
Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
Table 2.
Bacterial populations from Floricrops and KHD ferneries, September, 2005*.
Rhizosphere Intra-rhizome Intra-petiole
Sample no. Total Fl. Total Fl. Total Fl.
bacteria Pseudo. bacteria Pseudo. bacteria Pseudo.
(log cfu/g) (log cfu/g) (log cfu/g) (logcfu/g) (logcfu/g) (log cfu/g)
1. Floricrops 6.16 B 5.25 B,c 4.15 b 0.14 B 4.58 b 0.00 b
asymptomatic
2. KHD 6.66 A 5.75 A,b 4.50 a 2.25 A 5.45 a 0.91 a
asymptomatic
3. KHD 6.93 A 6.03 A,a 4.27 ab 2.02 A 4.43 b 1.32 a
deformed
LSD0.01 0.45 0.32 0.31 0.37 1.06 0.93
LSD0.05 0.33 0.24 0.23 0.27 0.79 0.69
Table 3.
Bacterial populations from Floricrops and KHD ferneries, October, 2005*.
Rhizosphere Surface of rhizomes
Sample no. Total bacteria Fl. Pseudo. Totalbacteria Fl. Pseudo.
(log cfu/g) (log cfu/g) (log cfu/g) (log cfu/g)
1. Floricrops asymptomatic 6.31 B* 5.12 B 2.81 B 1.35 B
2. KHD asymptomatic 6.64 A 6.08 A 3.33 A 2.33 A
3. KHD deformed 6.72 A 6.19 A 3.36 A 2.53 A
LSD0.01 0.45 0.32 0.31 0.37
* Means followed by different letters are significantly different at P < 0.01.
19
Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
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Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
Table 4.
Rhizome and Root effects in Florida Ferns sampled October, 2005.
21
Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
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Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
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Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
Table 6.
IAA production frequency of Pseudomonas isolates from rhizospheres of
deformed ferns at KHD and asymptomatic ferns at Floricrops*.
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Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
Table 7.
Effect of foliar sprays of Benlate on the frequency of IAA production by
endophytic fluorescent pseudomonads within rhizomes.
Table 8.
Effect of rhizome dips in Benlate on the frequency of IAA production by
fluorescent pseudomonads in the rhizosphere.
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Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Lile, Joseph W. Kloepper
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Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
Table 9.
Phytotoxic potential of fluorescent pseudomonads from rhizospheres of
ferns at KHD and Floricrops.*
% of strains exhibiting indicated effect
Effect in cucumber bioassay Fernery and Whole-cell Cell-free
appearance of ferns bioassay metabolite
bioassay
Reduced overall growth of KHD, deformed 44 22
cucumber roots compared
to controla Floricrops, 7 7
asymptomatic
27
Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
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Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
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Efecto de las prcticas agronmicas sobre las bacterias deletreas rizosfricas y endftas
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Marleny Burkett-Cadena , Camilo A. Ramirez, Mark R. Liles, Joseph W. Kloepper
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Captulo 2
Interacciones entre fitopatgenos y
microorganismos benficos en la rizosfera
Interactions among plant pathogens and beneficial
rhizosphere microorganisms
Marta C. Rivera1, Eduardo R. Wright2
1,2
Facultad de Agronoma. UBA. Av. San Martn 4453 (1417). Ciudad de Buenos Aires. Argentina.
E-mail: [email protected]
Introduccin
El trmino rizosfera fue introducido por Hiltner en 1904 (Hartman 2005),
quien lo defini como la parte del suelo que es influenciada por el sistema
radical. Es un sitio de interacciones nicas entre microorganismos benficos
y patgenos, que son atrados por los exudados de las races, que pueden
tener un altsimo impacto sobre la nutricin y salud de las plantas. Constituye
un nicho rico en nutrientes como resultado de tales secreciones orgnicas
constituidos por monmeros como glucosa y aminocidos, polmeros como
polisacridos y protenas, y restos de races (Hawes et al. 2003) y excreciones
(Uren 2007). Como consecuencia, se pueden detectar niveles elevados de
poblaciones de caros, nematodes y microorganismos (Bazin et al. 1990).
Protozoos (Darbyshire Greaves 1973; Griffiths et al. 2007) y algas (Shran
Nehra, 2011) tambin forman parte de la biota de la rizosfera, que presenta
actividad muy variada. El acceso continuo de la poblacin microbiana de la
rizosfera al flujo de sustratos de alto y bajo peso molecular derivados de las
races, junto con factores fsicos, qumicos y biolgicos especficos, pueden
afectar en forma marcada la actividad y estructura de la comunidad
microbiana (Srensen 1997; Brimecombe et al. 2001). Esta puede resultar
perjudicial o mortal para la vida vegetal debido a la manifestacin de diversas
patologas, as como beneficiosa, mediante actividades de promocin del
crecimiento de las plantas y prevencin de las enfermedades parasitarias o
no parasitarias que las afectan. Desde que se acu el trmino rizosfera, se
han logrando importantsimos avances que permiten una mejor comprensin
de los numerosos procesos biticos y abiticos que ocurren all. El estudio
de las interacciones raz-suelo-microorganismo se considera actualmente
central en numerosas ciencias relacionadas con la nutricin y salud vegetal
(Hinsinger Marshner 2006). En este captulo se describen aspectos generales
de microorganismos benficos y patgenos que pueden estar presentes en
33
Marta C. Rivera, Eduardo R. Wright
Desarrollo
La rizosfera como nicho microbiano
Se conoce que el suelo, y en especial la rizosfera, son los ambientes donde
existe la mayor biodiversidad, debido a que es una regin altamente favorable
para la proliferacin y actividad metablica de numerosos microorganismos
(Nannipieri et al. 2003). Alrededor del 15% del rea de las races se considera
cubierta por microorganismos especficos (Sylvia et al. 2005). La composicin
y los roles de las comunidades microbianas rizosfricas no estn totalmente
comprendidos an. El estudio de componentes individuales ha dado lugar a
la identificacin de numerosos organismos, que presentan un rango de
interacciones desde simbiticas hasta patognicas. En la biota benfica se
encuentran microorganismos que solubilizan y fijan nutrientes, producen
sustancias promotoras del crecimiento vegetal, inducen la resistencia de las
plantas a enfermedades o se comportan como antagnicos de agentes
fitopatgenos. En un sentido amplio, los micorganismos benficos de la
rizosfera incluyen simbiontes (ciertos Actinomycetes y hongos micorrticos)
y saprfitos de vida libre (Schippers et al. 1987).
Las bacterias constituyen el grupo microbiano ms numeroso, con un
promedio de 106 a 109 unidades formadoras de colonias por gramo de suelo
rizosfrico (Jurkevitch et al. 1992). Sin embargo, participan de una pequea
proporcin de la biomasa del suelo debido a su tamao. Bacilos no
esporulantes, Pseudomonas y Actinomycetes son las bacterias ms frecuentes.
Tambin se encuentran hongos patgenos y simbiticos asociados a la
rizosfera, en concentraciones de alrededor de105 a 106 unidades formadoras
de colonias por gramo de suelo rizosfrico. Especies de Zygomycetes e
Hyphomycetes son las que se establecen con mayor facilidad, dada su
capacidad de metabolizar azcares simples (Sylvia et al. 2005). Los hongos
juegan un papel importante en la rizosfera. Intervienen en numerosos
procesos ecolgicos, el crecimiento y la sanidad vegetal (Hawksworth
Rosmann 1997). La diversidad y la composicin de las comunidades fngicas
permanecen relativamente desconocidas en muchos ecosistemas (Becklin et
al. 2012).
La poblacin microbiana de la rizosfera puede ser estudiada a travs de
tcnicas culturales y bioqumicas. Entre las primeras, las ms utilizadas son
la dilucin seriada y recuento en placas o el anlisis del nmero ms probable;
se pueden utilizar medios selectivos para cuantificar ciertos grupos. Sin
embargo, estas tcnicas pueden llegar a subestimar la poblacin microbiana
hasta un 90% (Bakken 1997). Las bioqumicas pueden ser de utilidad para
detectar y cuantificar alteraciones causadas por las plantas o la microflora.
Diferentes tcnicas como PFLA (phospholipid fatty-acid analysis) (Lynch et al.
34
Interacciones entre fitopatgenos y microorganismos benficos en la rizosfera
35
Marta C. Rivera, Eduardo R. Wright
hospedantes y una gran distribucin en los suelos (Blair 1943). Rhizoctonia solani
es un ejemplo tpico de habitante del suelo (Koike et al 2007). Por el contrario, los
parsitos habitantes de la raz son ms especializados, a menudo especficos
y de una existencia ms transitoria en el suelo, por ello se los considera invasores
del suelo. Sus esporas son normalmente depositadas en el suelo, pero slo
germinan y crecen ante la presencia de alguna planta hospedante cercana. Muchos
son patgenos, dado que son capaces de crecer en forma parastica sobre de la
planta hospedante (White 2003). No pueden sobrevivir en el suelo en forma
saproftica, pero s formar estructuras de resistencia que permanecen all.
Verticillium dahliae es un ejemplo tpico de invasor de suelo (Ogawa English 1991).
Su presencia en ese hbitat es muy dependiente de los tejidos de plantas
hospedantes (Blair 1943). Los parsitos obligados se encuentran ltimos en la
secuencia evolutiva (Lockwood, 1988).
Los fitopatgenos se pueden encontrar en los suelos en general, y en la
rizosfera en particular, en forma latente (clamidosporas, esclerocios,
estructuras de origen sexual, esporas de reposo). En forma activa, se nutren
de la materia orgnica en descomposicin o de las plantas. En general se
comportan ocasionando enfermedades de tipo monocclico, es decir, siguen
un ciclo patognico (sobrevivencia-infeccin-sobrevivencia) por ciclo de cultivo.
Penetran los tejidos vegetales en forma directa mediante accin mecnica y
enzimtica, o a travs de heridas ocasionadas por laboreos o plagas animales
(Agrios 2005). La adhesin a las plantas hospedantes implica la atraccin
especfica de propgulos por las superficies vegetales, y un encaje perfecto
entre los ligantes (adhesinas) y los receptores. El producto de esta interaccin
activa una cascada compleja de transduccin de seales que es movilizada en
el proceso de reconocimiento patgeno-hospedante. La infeccin contina
con la colonizacin de los tejidos vegetales.
36
Interacciones entre fitopatgenos y microorganismos benficos en la rizosfera
37
Marta C. Rivera, Eduardo R. Wright
38
Interacciones entre fitopatgenos y microorganismos benficos en la rizosfera
39
Marta C. Rivera, Eduardo R. Wright
Conclusiones
Es muy importante el avance logrado en el conocimiento de algunos
patosistemas, entendiendo como tales a la interaccin entre un
fitopatgeno y su hospedante sumada a las interacciones que ocurren
entre ambos con el ambiente bitico y abitico de suelo y rizosfera. Sin
embargo, mucho queda por entender. Es de esperar que el desarrollo y
aplicacin de nuevas tecnologas permitan ampliar la comprensin de
estos sistemas tan complejos, con el objetivo ltimo de mejorar la sanidad
de los cultivos.
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Captulo 3
Hongos formadores de micorrizas
arbusculares: Influencia de las prcticas
agronmicas sobre su diversidad y
dinmica de colonizacin
Arbuscular mycorrhizal fungi: Influence of agronomic
practices on diversity and dynamics of colonization
Santiago Schalamuk1, Magdalena Druille2, Marta N. Cabello3,4*
1
Centro de Investigaciones Fitopatolgicas (CIDEFI), (Facultad de Ciencias Agrarias y
Forestales. UNLP) 60 y 119, (CP 1900) La Plata. 2Ctedra de Forrajicultura, (Facultad de
Agronoma; UBA) Av. San Martn 4453 (CP 1417), Capital Federal; 1Instituto Spegazzini, (FCNyM,
UNLP) Av. 53 N 477, (CP1900) La Plata;4CICPBA. E-mail: [email protected]
Introduccin
El suelo es un sistema vivo, dinmico, que constituye un recurso esencial
para la produccin de alimento y fibra y para el balance global y el
funcionamiento de los ecosistemas (Doran et al. 1996). Un vasto nmero de
microorganismos residen en el suelo y llevan a cabo un amplio rango de
funciones. Entre estos microorganismos se encuentran los hongos formadores
de micorrizas arbusculares (HFMA), los cuales forman simbiosis mutualistas
con las races de la mayora de las especies vegetales (Smith, Read 2008). En
estas asociaciones simbiticas se genera un movimiento bidireccional de
nutrientes donde el carbono fluye hacia el hongo y los nutrientes inorgnicos
se mueven hacia la planta. Los hongos que forman estas asociaciones son
bitrofos obligados y se encuentran ubicados dentro del phylum
Glomeromycota (Schbler et al. 2001). Las micorrizas son las asociaciones
ms frecuentes en la naturaleza debido a su rango de hospedantes y su
distribucin cosmopolita (Harley, Smith 1983), y por ello los Glomeromycota
son usualmente considerados generalistas dada su baja especificidad
(Smith, Read 2008). Tambin es importante destacar que los HFMA colonizan
la mayora de las plantas cultivables y presentan un impacto sustancial en la
productividad de muchos cultivos (Johnson 1993).
El efecto positivo ms significativo de las micorrizas arbusculares
consiste en el mejoramiento de la nutricin de las plantas, ya que las hifas de
estos hongos se extienden en el suelo y pueden absorber y transferir macro y
47
Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
48
Hongos formadores de micorrizas arbusculares:
Influencia de las prcticas agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin
49
Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
Cultivos y rotaciones
Las especies y la secuencia de cultivos que se desarrollan en un lote
pueden alterar significativamente la estructura de las comunidades de
Glomeromycota. Como hemos sealado, en Argentina los principales cultivos
que se desarrollan son soja, trigo, maz y girasol. Todas estas especies
cultivables poseen la capacidad de formar asociaciones micorricicas, aunque
difieren en su grado de dependencia. El trigo y la soja son consideradas
medianamente dependientes mientras que maz y girasol son escasamente
dependientes (Jeffries, Dodd 1991). Entre los cultivos extensivos en la regin
pampeana se est difundiendo la colza o canola (Brassica napus L.), con gran
potencialidad de desarrollo para el ambiente edafoclimtico de la zona. Esta
especie pertenece a la familia Brassicaceae y por lo tanto no se asocia a los
Glomeromycota. Gavito, Miller (1998) han hallado retrasos en la colonizacin
de maz sembrado despus de colza, cuando se comparaba con plantas de
maz que se cultivaban en lotes con especies antecesoras micotrficas.
Teniendo en cuenta la significancia de la colonizacin temprana para la
absorcin de P, dicho retraso puede tener consecuencias negativas. Por ello,
en situaciones donde la disponibilidad de P es limitante, las caractersticas
relacionadas con las asociaciones micorrcicas del cultivo antecesor pueden
tener importantes efectos sobre el crecimiento y la absorcin de P del cultivo
siguiente a travs de cambios en el potencial inoculo del suelo y la
consecuente colonizacin (Gavito, Miller 1998; Karasawa et al. 2001). A pesar
de esto, existe la posibilidad de que las comunidades de HFMA puedan
reestablecer del efecto inhibitorio de un cultivo no hospedante a travs de la
inclusin de especies micotrficas (Gavito, Miller 1998).
Asimismo, la secuencia de cultivos que se desarrollan dentro de una
rotacin parece cambiar la composicin de especies de las comunidades
fngicas e impactar en su diversidad, aunque los impactos de esos cambios
no han sido evaluados extensamente (Hendrix et al. 1995). Es importante
destacar que, a pesar de la ausencia de especificidad en las asociaciones
micorrcicas, dado que los principales cultivos en Argentina se desarrollan
en distintas pocas del ao, y que adems poseen diferente estructura, cada
cultivo genera diferentes condiciones en el ambiente suelo que modifican las
comunidades de Glomeromycota.
50
Hongos formadores de micorrizas arbusculares:
Influencia de las prcticas agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin
51
Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
al. 2003, 2004). El hecho que los eventos y procesos necesarios para iniciar
la colonizacin hayan sido ms rpidos en sistemas de siembra directa se
relacion con los mayores niveles registrados de infectividad del suelo. La
expresin grfica de la colonizacin micorrcica en races a travs del tiempo
presenta una curva de tipo sigmoidea, en la cual se reconocen tres etapas:
fase de latencia, fase exponencial y fase de plateau (Sieverding 1991). Una
mayor infectividad micorrcica del suelo debera reducir la longitud de la fase
de latencia, y as por lo tanto acelerar el proceso de colonizacin micorrcica
(Smith, Read 2008).
Mientras que en los primeros estados fenolgicos de los cultivos existe
una gran influencia de la infectividad micorrcica de los suelos, en los estados
fenolgicos ms avanzados, otros factores adquieren mayor importancia.
Luego de la colonizacin primaria, la longitud de raz colonizada se incrementa
durante el crecimiento y desarrollo de los cultivos (Land et al. 1993, Mozafar
et al. 2000), y en momentos cercanos a la madurez se determina el valor
mximo, fase de estabilizacin o plateau, que es resultado de la colonizacin
secundaria, es decir la expansin de las hifas desde los puntos de entrada
primarios hacia otras porciones de la raz. El nivel de plateau es muy variable,
y varios factores que afectan las tasas de crecimiento relativo del hongo y el
hospedante pueden cambiar esta situacin de equilibrio (Sieverding 1991).
Wilson, Tommerup (1992) afirman que la colonizacin secundaria est en gran
medida regulada por el flujo de carbohidratos desde la raz hacia el componente
fngico de la simbiosis. Por todo esto, es posible que en los estados avanzados
del cultivo variaciones en el ambiente fsico-qumico del suelo, el estado
nutricional y crecimiento de las plantas hospedantes, que pueden determinarse
por distintos sistemas de labranza, tengan incidencia en los porcentajes de
colonizacin, arbsculos y vesculas relacionados con la colonizacin
secundaria. Por otra parte, Schalamuk et al. (2003, 2004) en un cultivo de
trigo observaron que las diferencias entre los porcentajes de colonizacin entre
siembra directa y labranza convencional tienden a reducirse a medida que
avanza el desarrollo del cultivo, y se hacen mnimas en las ltimas etapas donde
se determinan los niveles de plateau (i.e. llenado de granos).
Es importante aclarar que, tal como ocurre con la colonizacin, las
diferencias en la abundancia de esporas dependen del momento donde se
efectan los muestreos. En agroecosistemas con cultivos anuales, el nmero
de esporas generalmente se incrementa a lo largo del ciclo del cultivo (Cabello
1987) y por lo tanto la esporulacin est frecuentemente ligada a la fenologa
del hospedante en el campo (i.e. la produccin mxima de esporas ocurre a
mediados o finales del ciclo de cultivo) (Morton et al. 2004). Varios estudios
han hallado mayores densidades de esporas en siembra directa que en labranza
convencional. (Crovetto 1985; Jansa et al. 2002; Schalamuk et al. 2003). Sin
embargo, mientras que en los estados tempranos de los cultivos, generalmente
se encuentran mayores densidades de esporas en los suelos no labrados, en
estados fenolgicos ms avanzados las diferencias entre sistemas de labranza
52
Hongos formadores de micorrizas arbusculares:
Influencia de las prcticas agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin
se reducen (Schalamuk et al. 2003). Es bien conocido que las esporas pueden
sobrevivir varios aos en el suelo (Sieverding 1991). Por lo tanto, el nmero
de esporas refleja tanto la esporulacin como la accin de diferentes factores
que afectan su supervivencia y acumulacin. Consecuentemente, la densidad
de esporas es el resultado de un complejo balance, y mientras la esporulacin
est relacionada con la actividad reciente de los HFMA, el nmero de esporas
incluye estructuras formadas en momentos anteriores. Por otra parte, mientras
que en sistemas naturales el banco de esporas en los suelos puede decrecer
por causas tan variadas como predatorismo, parasitismo, germinacin, entre
otros factores, (ver Schalamuk, Cabello 2008), en sistemas agrcolas otro efecto
que reduce directamente el nmero de esporas en el suelo es la dilucin del
suelo rico en esporas con las partes subsuperficiales ms pobres en estas
estructuras, ocasionada por la accin mecnica de las labranzas. Por estas
razones, la supervivencia y acumulacin tienen una gran influencia en el
nmero de esporas, y las mayores densidades de estas estructuras halladas
en siembra directa en los estados ms tempranos del cultivo pueden ser el
resultado tanto de una mayor o ms rpida esporulacin como de la presencia
de esporas residuales producidas durante el barbecho o el cultivo antecesor.
Teniendo en cuenta que la presencia de esporas no siempre implica la actividad
reciente de los HFMA, y que los disturbios mecnicos pueden cambiar su
distribucin espacial en el perfil del suelo, el nmero de esporas puede ser
considerado como un valioso indicador de utilidad de la presencia de HFMA
in situ, sin embargo debido a que no refleja la actividad reciente de estos
hongos, esta informacin debe ser tenida en cuenta con cautela.
En relacin a la diversidad de Glomeromycota, la cantidad de estudios
realizados sobre la temtica en agroecosistemas de argentina son escasos. En
un ensayo de siembra directa y labranza convencional en la provincia de Buenos
Aires se hallaron 24 taxa de ese phylum, lo que representa un nmero de especies
alto en comparacin con los registrados en otros sistemas agrcolas (Schalamuk
et al. 2006). Asimismo, se observ que los cambios en la composicin del banco
de propgulos de Glomeromycota pueden influir en su diversidad. Como se ha
sealado, los disturbios relacionados con el laboreo pueden afectar a cada uno
de los tipos de propgulos de distinta manera, y por otra parte, se conoce que
las esporas e hifas externas e internas poseen distinta capacidad para producir
nuevas unidades de infeccin (Klironomos, Hart 2002). Se considera que en
muchos hbitats, fundamentalmente los no disturbados, las redes de hifas en el
suelo junto con fragmentos de races son el principal medio por los cuales las
plantas se colonizan, incluso en las situaciones donde existen poblaciones altas
de esporas (Hepper 1981; Tommerup, Abbott 1981; Jasper et al. 1992). En los
experimentos a campo mencionados se registraron contribuciones mayores de
especies pertenecientes a la familia Glomeraceae sobre otras familias de
Glomeromycota (Acaulosporaceae y Gigasporaceae) en suelos manejados con
siembra directa con respecto a otros previamente laboreados (Schalamuk et al.
2006). A partir de material proveniente de esos experimentos, se efectuaron
plantas trampa utilizando diferentes tipos de propgulos para observar las
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Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
Fertilidad y Fertilizacin
En la agricultura argentina, el uso de fertilizantes se ha incrementado
notablemente en los ltimos aos, aunque sigue siendo relativamente bajo
cuando se la compara con el de los pases europeos. Los productos ms
empleados son los que proveen nitrgeno (57%) y fsforo (36%) y se aplican
fundamentalmente en cultivos de trigo y maz (Satorre 2005).
Es ampliamente conocido que en suelos pobres en nutrientes los valores de
colonizacin micorrcica suelen ser altos (Vivekanandan, Fixen 1991; Hayman 1975).
Una de las hiptesis ms aceptadas para explicar este hecho es la que seala que
las plantas invierten y transfieren ms C a los hongos micorrcicos en los suelos
donde nutrientes, como el N o el P, son limitantes (Mosse, Phillips 1971).
Consecuentemente, cuando la disponibilidad de estos nutrientes aumenta, se
esperaran disminuciones en la abundancia de micorrizas relacionadas con la
particin de carbohidratos hacia otros destinos de las plantas que no son las races
y subsiguientes limitaciones en el crecimiento del componente fngico de la
simbiosis, relacionadas con el menor suministro de C (Read 1991). Este
comportamiento ha sido denominado autorregulacin de la colonizacin
(Vierheilig et al. 2000; Vierheilig, Pich 2002; Vierheilig 2004a, b), debido a que
muestra similitud con la autorregulacin de la nodulacin en las interacciones
riozobios-leguminosas. El mecanismo de autorregulacin propone que una vez
que la colonizacin llega a cierto nivel, se suprimen posteriores aumentos en este
parmetro (Vierheilig, Pich 2002; Vierheilig 2004a, b). Si bien los mecanismos de
autorregulacin no han sido completamente dilucidados, se cree que las
strigolactonas, un grupo de apocarotenoides exudados por las races en la rizsfera,
cumplen un rol fundamental en esta regulacin actuando como factores de
ramificacin en las etapas de pre-simbiosis (Garca Garrido et al. 2009).
Diversos estudios en condiciones controladas, con sustratos estriles,
elementos marcados, inhibidores de la nitrificacin, entre otros, han
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Hongos formadores de micorrizas arbusculares:
Influencia de las prcticas agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin
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Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
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Influencia de las prcticas agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin
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Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
Enfermedades y fungicidas
Las enfermedades de los cultivos y su control mediante la utilizacin de
agroqumicos pueden generar mltiples efectos sobre las comunidades de
Glomeromycota. Gran diversidad de organismos patgenos afectan las races
de los cultivos, alteran el transporte, interfieren en los procesos fotosintticos,
producen un uso anormal de carbohidratos, entre otros efectos. Por lo tanto,
reducciones en los niveles de enfermedad a travs de la utilizacin de fungicidas
provocan cambios en la fisiologa de los hospedantes que impactan en su
capacidad para asociarse con HFMA, principalmente teniendo en cuenta que la
colonizacin es dependiente del flujo de carbohidratos desde la raz hacia el
componente fngico de la simbiosis (Wilson, Tommerup 1992). Entre los
plaguicidas que se utilizan para el control de adversidades biticas, los fungicidas
son lgicamente los que deberan presentar mayor efecto directo sobre los
hongos pertenecientes a Glomeromycota. Sin embargo, diversos estudios han
mostrado que los fungicidas pueden afectar a las asociaciones micorrcicas de
manera negativa, neutral o incluso positiva (Samarbakhsh et al. 2009). Los
fungicidas incluyen una enorme variedad de compuestos que difieren en su
efecto sobre la fisiologa de los hospedantes, modo de accin, espectro de
control, mecanismo de accin, mtodos de aplicacin y formulacin.
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Hongos formadores de micorrizas arbusculares:
Influencia de las prcticas agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin
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Santiago Schalamuk, Magdalena Druille, Marta N. Cabello
Rhizoctonia spp., organismos que son controlados por este fungicida (Murillo-
Williams, Pedersen 2008).
Dentro de los fungicidas que se utilizan en aplicaciones foliares, tienen
actualmente gran importancia los pertenecientes a los grupos de los triazoles
y las estrubirulinas. Los triazoles y otros inhibidores de la biosntesis del
ergosterol constituyen un grupo de fungicidas que ha adquirido gran difusin
en los cultivos de grano debido a su eficacia frente a patgenos foliares, y su
efecto sistmico y persistente dentro de la planta. A pesar de su mecanismo
de accin, a menudo se han encontrado efectos negativos de fungicidas
triazoles a altas dosis o en aplicaciones repetidas (West et al. 1993; Kling,
Jakobsen 1997; Schweiger, Jakobsen 1998). Sin embargo, en Argentina se ha
hallado que la aplicacin de triazoles a un cultivo de trigo no afect
negativamente los porcentajes de colonizacin micorrcica (Schalamuk et al.
indito). En la evaluacin de los efectos de los fungicidas foliares sobre los
HFMA debera tenerse en cuenta no slo el efecto del compuesto per se, sino
tambin la reduccin en las enfermedades que genera, incrementando el rea
foliar verde y aumentando el suministro de fotoasimilados hacia las races.
Otro grupo de fungicidas que est difundiendose rpidamente en la regin
agrcola argentina es el de las estrobilurinas, de accin translaminar o
mesostmica. Los fungicidas de este grupo poseen un amplio espectro de
accin al inhibir la respiracin mitocondrial. Diedhiou et al. (2004) hallaron
que las strobilurinas, a pesar de su amplio espectro, no afectan negativamente
la micorrizacin de los cultivos cuando se aplican para el control de patgenos
foliares a las dosis recomendadas. Schalamuk et al. (indito), hallaron
resultados similares en cultivos de trigo. Teniendo en cuenta que los fungicidas
de este grupo se aplican en pulverizacin foliar y no son completamente
sistmicos, es cuestionable que las aplicaciones de este grupo presenten algn
efecto detrimental sobre los HFMA. Dentro de los fungicidas clsicos, que se
reemplazan paulatinamente por los ms modernos, se encuentran los
pertenecientes al grupo de los benzimidazoles, como los fungicidas sistmicos
benomyl y carbendazim. Los benzimidazoles son eficaces en el control de
numerosas enfermedades causadas por una amplia variedad de hongos. El
benomyl y otros benzimidazoles se descomponen a metil benzimidazol
carbamato (carbendazim), y este ltimo compuesto interfiere en la divisin
de los ncleos de los hongos sensibles. El efecto deletereo del benomyl y su
producto de descomposicin, carbendazim, sobre los HFMA es ampliamente
conocido; se sabe que se une especficamente a las beta-tubulinas, inhibiendo
la funcin de las tubulinas, que son cruciales para el crecimiento fngico
(Boatman et al. 1978; Hale, Sanders 1982; Thingstrup, Rosendahl 1994;
Schweiger, Jakobsen 1998; Kjller, Rosendahl 2000). Venedikian et al. (1999)
observaron que la colonizacin puede resultar menos inhibida por aplicaciones
de carbendazim que la germinacin de las esporas y el crecimiento de hifas en
medio agarizado. Esto sugiere que las distintas fases de crecimiento de estos
hongos pueden tolerar diferentes concentraciones de fungicidas (Dodds,
Jeffries 1989; Ocampo 1993; Schreiner, Bethlenfalvay 1997).
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Hongos formadores de micorrizas arbusculares:
Influencia de las prcticas agronmicas sobre su diversidad y dinmica de colonizacin
Insecticidas
Al igual que lo ocurrido con otros pesticidas, el efecto de los insecticidas
sobre los HFMA vara en funcin del principio activo, las dosis utilizadas y las
especies involucradas en la simbiosis.
Menendez et al. (1999) estudiaron el efecto de dimetoato, un insecticida
organofosforado de accin sistmica, sobre el porcentaje de colonizacin
radical en soja. Estos autores hallaron que la colonizacin no se vio afectada
en ninguna de las dosis utilizadas, cuando la planta creci en un suelo inoculado
con Glomus mosseae. Sin embargo, al utilizar la comunidad nativa de HFMA el
porcentaje de colonizacin radical se redujo al aplicarse la dosis recomendada
a campo. Con respecto al porcentaje de germinacin de las esporas, el
dimetoato disminuy este porcentaje en Racocetra castaneae en dosis de 5
ml/L, lo aument en Gigaspora roseae en la dosis de 0,5 ml/L y no lo afect en
G. mosseae. Menendez et al. (1999) atribuyen esta respuesta diferencial a
que algunos cidos orgnicos y azcares inhiben la germinacin de esporas
de algunas especies pero estimula el crecimiento hifal de otras.
La mayor tolerancia de G. mosseae a la aplicacin de un insecticida
organofosforado coincide con los resultados de Burpee, Cole (1978). Pavarthi
et al. (1985) encontraron efectos negativos sobre esta especie fngica al aplicar
un insecticida organoclorado (Endosulfan) sobre la misma leguminosa. El uso
de Carbaryl, correspondiente al grupo de los carbamatos, no afect a la
colonizacin por G. mosseae. Martnez et al. (1998) demostr que la aplicacin
de triflumurn, un insecticida del grupo de las benzoilfenilureas, tuvo un efecto
nulo en la germinacin de esporas de G. mosseae, R. castanea y Gigaspora
rosea en las dos dosis evaluadas. Con respecto al porcentaje de colonizacin
radical, estos autores encontraron una disminucin de este parmetro con
suelo no tindalizado, ya sea que estuvieran o no inoculadas con G. mosseae.
Sin embargo, en suelo tindalizado e inoculado con G. mosseae, no se observ
ningn efecto del Triflumurn sobre la micorrizacin, en ninguna de las
concentraciones ensayadas.
Conclusin
Bajo condiciones naturales la mayora de los cultivos agronmicos estn
colonizados con hongos micorrcico-arbusculares. Sin embargo es difcil
demostrar sus funciones a campo. Las prcticas agronmicas implican cambios
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Captulo 4
Huellas de la simbiosis pasto-endofito
en el agroecosistema
Footprints of grass-endophyte symbiosis in agroecosystems
Marina Omacini, Pedro E. Gundel, Mara Semmartin
Facultad de Agronoma, Universidad Nacional de Buenos Aires, Departamento de Recursos
Naturales. Av San Martn 4453 (C1417DSE), Buenos Aires, Argentina.
E-mail: [email protected]
Introduccin
La mayora de las especies vegetales establecen relaciones simbiticas
con una gran variedad de microorganismos y, si bien estos simbiontes
frecuentemente son inadvertidos, al alojarse en sus tejidos modifican a su
hospedante y su interaccin con el ambiente (Rodrguez et al. 2008, Hartley,
Gange 2009, Douglas 2010). Estos efectos pueden tener un gran impacto en la
estructura y el funcionamiento de las comunidades vegetales y de sus
organismos asociados (Clay, Holah 1999, Omacini et al. 2001, Clay, Schardl
2002). Las interacciones simbiticas ms estudiadas, particularmente en
contextos productivos, son las asociaciones de plantas con microorganismos
edficos que confieren ventajas a la planta hospedante frente a una baja
disponibilidad de nutrientes (van der Heijden, Sanders 2002, Douglas 2010).
Por ejemplo, una recopilacin basada en la base Scopus, de los trabajos
publicados desde la primera descripcin del fenmeno de simbiosis como
dos organismos que viven juntos (De Bary 1879) demuestra que las tres cuartas
partes de los trabajos realizados con plantas que incluyen el trmino
simbiosis en su ttulo, resumen o palabras clave, consideran la asociacin
de plantas con bacterias fijadoras de nitrgeno, principalmente del gnero
Rizobium, o con distintas especies de hongos formadores de micorrizas.
Otros simbiontes que han sido notablemente menos estudiados son
los hongos endofitos asexuales del gnero Neotyphodium (Clavicipitaceae:
Balansieae) (Figura 1). El inters por estos organismos comenz alrededor
de la dcada de los ochenta, cuando se descubri que su presencia en los
pastos estaba asociada a intoxicaciones en el ganado con sntomas
similares a los del ergotismo, ocasionando grandes prdidas econmicas
en los Estados Unidos y Nueva Zelanda (Bove 1970, Bacon, Hill 1997,
Fletcher, Easton 1997, Fletcher 2005). Recin durante los ltimos 10 aos
se gener un volumen de informacin equivalente al que se tena para
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Marina Omacini, Pedro E. Gundel, Mara Semmartin
Desarrollo
La simbiosis pasto-endofito
Muchas especies de pastos de estacin templado-fra forman simbiosis
con hongos asexuales de la familia Clavicipitaceae (Ascomycota) del gnero
Neotyphodium (antes conocido como Acremonium sect. Albolanosa Morgan-
Jones; Glenn et al. 1996). De acuerdo con estudios filogenticos, las
diferentes especies de Neotyphodium surgieron de forma independiente a
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Huellas de la simbiosis pasto-endofito en el agroecosistema
Figura 3: Esquema de los efectos que puede tener la infeccin con hongos
endofitos sobre la estructura y el funcionamiento de los agroecosistemas.
Las flechas en ambas direcciones indican que los efectos tanto en
componentes areos como subterrneos de los ecosistemas pueden
modificar, a su vez, el xito tanto del pasto como del hongo simbionte.
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Marina Omacini, Pedro E. Gundel, Mara Semmartin
Conclusiones
Las evidencias presentadas en este captulo muestran que, si bien ciertas
asociaciones de pastos con hongos endofitos afectan negativamente la
produccin pecuaria, esta simbiosis est ampliamente difundida en otras
especies e impactan de maneras muy diversas, y muchas veces ignoradas,
otros componentes del agroecosistema. En el componente subterrneo del
ecosistema, durante los ltimos aos, se ha identificado la huella del endofito
sobre la composicin y el funcionamiento de la biota edfica, en general, y de
ciertos grupos, en particular, tales como los hongos formadores de micorrizas,
las bacterias fijadoras de nitrgeno y los nematodos herbvoros. Sin embargo,
resulta llamativo que hasta el presente los endofitos hayan sido prcticamente
ignorados por los investigadores en esta red de conexiones entre los
componentes areos y subterrneos de los ecosistemas (Wardle 2002).
El uso creciente de agroqumicos en los planteos productivos y el impacto
ambiental y sobre la salud humana que acarrean, ha estimulado a los
cientficos para encontrar alternativas ms sustentables en el manejo de los
agroecosistemas (Tikhonovich, Provorov 2007). As, se ha generado
conocimiento que permiti el desarrollo de herramientas de control biolgico
de plagas, de fijacin simbitica de nutrientes, de promotores del crecimiento
y otros. En este sentido, la posibilidad de aprovechar los beneficios naturales
de la presencia de los endofitos Neotyphodium parece ser una opcin atractiva
y posible en este mismo camino. En este momento, se estn realizando grandes
esfuerzos por encontrar genotipos, o modificar los preexistentes, para lograr,
mediante el uso de endofitos no txicos, variedades forrajeras ms
persistentes y productivas (Panaccione et al. 2001; Colabelli et al. 2007) De
manera similar, la existencia de variabilidad natural en el perfil de alcaloides
producido por los endofitos segn su genotipo, el del pasto hospedante y/o el
ambiente, ha llevado a considerar la inclusin de este simbionte en los planes
de mejoramiento de gramneas ornamentales y para csped (Easton 2007). Si
duda, se requiere mayor conocimiento de los factores que controlan los
efectos deseables e indeseables de los endofitos y de aquellos que controlan
la persistencia y abundancia de la simbiosis en el sistema.
Agradecimientos
Las ideas presentadas en este trabajo fueron desarrolladas gracias a
nuestra interaccin cotidiana con Claudio Ghersa y con los estudiantes del
82
Huellas de la simbiosis pasto-endofito en el agroecosistema
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Captulo 5
Bacillus thuringiensis y su utilidad en el
control de insectos asociados a la rizosfera
Bacillus thuringiensis and their utility in the control of
insects associated to the rhizosphere
Diego H. Sauka; Rodrigo H. Monella, Graciela B. Benintende
Insumos Bacterianos, Instituto de Microbiologa y Zoologa Agrcola (IMYZA), Instituto
Nacional de Tecnologa Agropecuaria (INTA). De los Reseros y Las Cabaas s/nro. C.C. 25. C.P.
1712. Castelar, Buenos Aires, Argentina. E-mail: [email protected]
Introduccin
Las races de plantas de inters agroalimentario pueden ser vulnerables a la
actividad de una gran variedad de plagas de artrpodos, nemtodos y hongos.
Estas plagas producen prdidas sustanciales en los rendimientos, disminucin
de la longevidad de las plantas y de la calidad de los productos obtenidos. Todas
estas plagas demuestran interactuar en la rizosfera y de esta manera generar
un incremento en el dao a las races. Para poder controlarlas existen medidas
que pueden agruparse formando parte de programas de manejo que mejoran
la salud de las plantas. En gran medida, el control de plagas depende de la
aplicacin de productos qumicos. Su empleo indiscriminado produce problemas
de contaminacin ambiental, efectos no deseados sobre especies benficas y
tambin generando la seleccin de organismos resistentes. Debido a ello, hoy
en da existe una necesidad crtica de contar con herramientas seguras y efectivas.
Un ejemplo que se erige como una importante alternativa, lo constituye la
utilizacin de bacterias dentro del control microbiano de plagas, debido a su
toxicidad selectiva alta e impacto ambiental bajo a nulo. La especie Bacillus
thuringiensis es particularmente un exponente exitoso y el que mantiene un
nivel vigente de desarrollo, que se puede emplear para el control de insectos
plaga que afectan especficamente las races de plantas.
En este captulo se integran conocimientos de la biologa, la gentica y los
bioinsecticidas disponibles que contienen a esta bacteria entomopatgena
como ingrediente activo dentro de un contexto del control microbiano de
insectos que afectan las races de cultivos de inters agronmico.
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Bacillus thuringiensis y su utilidad en el control de insectos asociados a la rizosfera
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Tabla 1.
Caractersticas principales de los bioinsecticidas que poseen B. thuringiensis
como ingrediente activo.
94
Bacillus thuringiensis y su utilidad en el control de insectos asociados a la rizosfera
Tabla 2.
Susceptibilidad de plagas rizfagas a B.thuringiensis.
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Bacillus thuringiensis y su utilidad en el control de insectos asociados a la rizosfera
El caso del control de los gusanos que afectan las races del
maz
El maz posee a nivel mundial una importancia relevante en aspectos que
conciernen tanto a lo econmico como a lo social, y es afectado por diversas
plagas (enfermedades, malezas, artrpodos). De ellas, unas diez especies o
subespecies del gnero Diabrotica (Coleoptera) son reconocidas como plagas
(Krysan, Miller 1986). Las larvas de estos insectos tienen en comn que
presentan hbito subterrneo y se alimentan de las races del maz (Krysan,
Miller 1986, Saini 2005). Aunque no inciden directamente en los rendimientos
en s, causan un impedimento en el crecimiento de la planta (PRMIP 1990).
Diabrotica virgifera, D. barberi y D. undecimpunctata howardi son plagas
principales en Norteamrica que afectan la raz del maz (Krysan, Miller 1986).
D. virgifera no se haba detectado nunca en Europa hasta que fue observada
cerca de Belgrado en 1992, para luego dispersarse por el continente y generar
gran preocupacin entre los productores. Por otro lado, D. speciosa es la
prima Sudamericana de las anteriores. Comnmente se la conoce en nuestro
pas como vaquita de San Antonio. Se distribuye a lo largo de toda el rea
maicera de Argentina, llegando a lograr por ao hasta tres generaciones en el
norte (Defag de Pecchioni et al. 2000, OEPP/EPPO 2005).
El Departamento de Agricultura de los Estados Unidos (USDA) estima que
los daos causados por especies de Diabrotica de esa rea, generan prdidas
de 1 billn de dlares anuales a la renta pblica, los cuales incluyen 800
millones en prdidas por menor rendimiento y 200 millones en tratamiento
por parte de los agricultores (http://www.usda.gov/wps/portal/usdahome).
Si bien en nuestro pas no disponemos de este tipo de estimaciones por ahora,
97
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Bacillus thuringiensis y su utilidad en el control de insectos asociados a la rizosfera
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Consideraciones finales
Se apuesta por un esfuerzo mayor en la investigacin y desarrollo de
herramientas de uso agrcola para el control de insectos plaga asociados a
la rizosfera, con el fin de obtener formulaciones que incluyan B. thuringiensis
como agentes de control microbiano y/o plantas transgnicas que rechacen
los embates de este tipo de plagas que son tan difciles de controlar debido a
los hbitos subterrneos de las larvas. Todo esto es necesario para la
reduccin de la contaminacin debida a una carga excesiva de pesticidas
qumicos que se vierten al ambiente, objetivo ste de gran trascendencia
mundial. Parte de estos objetivos se cumplieron en ciertos pases, en los que
estn disponibles plantas modificadas genticamente que expresan protenas
Cry especficas para el control de diversas especies de Diabrotica.
Un desafo sera llegar a lograr el desarrollo de un bioinsecticida exitoso
para controlar larvas que se alimentan de races de plantas de inters
econmico, que se pueda dispersar en el suelo y que posea a B. thuringiensis
como ingrediente activo. Esto es algo, que a pesar de disponer de cepas con
toxicidad para este tipo de insectos, no se ha logrado hasta hoy.
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106
Bacillus thuringiensis y su utilidad en el control de insectos asociados a la rizosfera
107
108
Captulo 6
Nematodos como indicadores de la
calidad del suelo: Efectos de la fertilizacin
nitrogenada
Nematodes as indicadors of soil quality:
Effects of nitrogen fertilization
Claudia Viviana Azpilicueta1, Mara Cristina Aruani2
1
Laboratorio de Servicios Agrarios y Forestales. Ministerio de Desarrollo Territorial. Santiago
del Estero 426. (8300) Neuqun. 2Facultad de Ciencias Agrarias. Universidad Nacional del
Comahue. Cinco Saltos. Ro Negro.
E-mail: [email protected]
Introduccin
Nematodos como componentes del sistema suelo
El suelo es un sistema integrado por organismos en estrecha relacin e
interaccin con el medio fsico - qumico que sirve de soporte y medio de vida
y es un componente crtico en la estructura y funcin de los agrosistemas.
Los organismos del suelo aportan una serie de servicios fundamentales para
el sustento de todos los ecosistemas ya que son los principales agentes del
reciclado de nutrientes, regulan la dinmica de la materia orgnica del suelo
y la retencin de carbono, modifican la estructura y el contenido de agua del
suelo, mejoran la cantidad y eficacia de captacin de nutrientes de las plantas
(Ferris et al. 2001). Estos servicios no slo son decisivos para el
funcionamiento de los ecosistemas naturales, sino que constituyen un
importante recurso para la gestin sostenible de los sistemas agrcolas
Entre los organismos del suelo podemos citar a los nematodos que son
gusanos cilndricos, aunque en algunos gneros las hembras pierden el aspecto
vermiforme y se vuelven globosas. Son animales pequeos, las especies de la
familia Tylenchidae miden entre 0,2 y 1 mm de longitud, ocasionalmente mayores
de 3 mm, (Luc et al. 1990) y las especies del orden Dorylaimida promedian el
mm, pero hay organismos que pueden medir 0,3 - 0,4 mm o tan largos como 12
mm (Jairajpuri, Ahmad 1992). El cuerpo est revestido por una cutcula de
naturaleza proteica, flexible que permite los movimientos del animal. Esta
cutcula reviste los orificios de la boca, recto, ano, fasmidios, anfidios, vagina
y poro excretor. El ciclo biolgico de los nematodos del suelo se desarrolla
dentro de este o de las plantas, segn la modalidad de alimentacin. Se
diferencian tres estados: huevo, juvenil y adulto (Dropkin, 1989).
109
Claudia Viviana Azpilicueta, Mara Cristina Aruani
Grupos trficos
La morfologa de la cavidad bucal (Fig. 1) y esfago de los nematodos
tiene una estrecha relacin con el hbito trfico. Yeates et al. (1993)
realizaron una revisin bibliogrfica donde resumieron informacin de
los hbitos alimenticios de los nematodos, agrupndolos en ocho grupos
trficos, aunque generalmente son reconocidos cinco: fitfagos,
bacterifagos, fungvoros, omnvoros y depredadores (Yeates 1971) que se
detallan a continuacin.
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Nematodos como indicadores de la calidad del suelo: efectos de la fertilizacin nitrogenada
111
Claudia Viviana Azpilicueta, Mara Cristina Aruani
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Nematodos como indicadores de la calidad del suelo: efectos de la fertilizacin nitrogenada
113
Tabla I.
114
Efecto de la fertilizacin nitrogenada sobre la comunidad de nematodos.
Claudia Viviana Azpilicueta, Mara Cristina Aruani
*Las comparaciones son realizadas con el tratamiento control excepto en ** la comparacin fue con tratamiento estircol
AT=Abundancia Total; B =Bacterifagos; F=Fungvoros; Fi=Fitfagos; O-P=Omnvoros-depredadores; IM=ndice de madurez calculado
con todas las familias de la comunidad de nematodos, MI = ndice de madurez de nematodos de vida libre, PPI = ndice de madurez
de nematodos fitoparsitos.
Nematodos como indicadores de la calidad del suelo: efectos de la fertilizacin nitrogenada
115
Claudia Viviana Azpilicueta, Mara Cristina Aruani
116
Nematodos como indicadores de la calidad del suelo: efectos de la fertilizacin nitrogenada
Experiencias en Argentina
En Balcarce, en un ensayo realizado en pasturas, Mondino (2001) report
que la fertilizacin con urea no afect al nmero total de nematodos ni la
abundancia de los distintos grupos trficos.
En el Alto Valle de Ro Negro, con historia frutcola de 70 aos y sustentada
en suelos con bajo contenido de materia orgnica, la fertilizacin nitrogenada
ha sido empleada con variada intensidad dependiendo de las condiciones
econmicas del sector. Anualmente se aplican entre 100 a 200 kg ha-1 de
nitrgeno, cifras consideradas elevadas para frutales de pepita que tienen
menores requerimientos (Weinbaum et al. 1992). En un ensayo en la zona, en
Malus domestica, con sistema de riego mecanizado con microaspersores y
malezas controladas con glifosato, la fertilizacin nitrogenada ocasion
cambios en algunos grupos trficos (bacterifagos y fungvoros), familias
(Rhabditidae) y gneros de nematodos. La abundancia de nematodos
bacterifagos aument con la aplicacin de nitrato de amonio en dosis de
150 y 75 kg N ha-1, y con la ltima dosis el aumento fue temporal. El ndice de
madurez MI se correlacion negativamente con el contenido de nitrato en el
suelo y la relacin PPI/MI fue afectada con la mayor dosis de nitrgeno
(Azpilicueta et al. 2008).
En otra experiencia, en la misma zona, en dos huertos comerciales de
Pyrus communis (H1 y H2), con agregado de guano y fertilizantes
inorgnicos, los resultados obtenidos del grfico que surge de la relacin
entre los ndices EI y SI (Fig. 2), la mayora de los valores se ubicaron en el
cuadrante B y revelaron que las redes trficas estaban moderadamente
enriquecidas, relativamente estructuradas y estables (Azpilicueta et al.
2010). En el huerto H1, el ndice de estructura SI fue consistentemente ms
alto que en el huerto H2 indicando que las redes trficas ms complejas
pueden coexistir con los nematodos oportunistas de enriquecimiento y
que la presencia de nematodos de niveles trficos ms altos, como
omnvoros y carnvoros, pueden sobrevivir en suelos enriquecidos
(Snchez-Moreno et al. 2006).
117
Claudia Viviana Azpilicueta, Mara Cristina Aruani
Conclusiones
La mayora de los nematodos del suelo aportan una serie de servicios
fundamentales para el sustento de los sistemas agrcolas que contribuyen a
mejorar la productividad del cultivo. En los agrosistemas se utilizan
fertilizantes nitrogenados en cantidades muchas veces excesivas y se ha
demostrado que los fertilizantes impactan en mayor o menor medida en la
diversidad y en la estructura de la comunidad de nematodos en el suelo,
dependiendo de la dosis y tipo de fertilizante. Es preciso que la informacin
generada por las investigaciones sobre los patrones de comportamiento de
la abundancia de los nematodos en repuesta a los fertilizantes, sea
incorporada e implementada en futuros programas de manejo de suelo. Con
esta informacin disponible se debera optimizar el uso de los fertilizantes
tratando de agregar la cantidad necesaria para el cultivo en el momento que
la planta realmente lo necesite, con el fin de evitar prdidas del mismo y
ocasionar efectos negativos en la comunidad de nematodos.
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121
Claudia Viviana Azpilicueta, Mara Cristina Aruani
122
Captulo 7
Perfil Fisiolgico de Comunidades de
Suelo Basado en el Consumo de Oxgeno
Community-Level Physiological Profiling of Soil
Communities Based on Oxygen Consumption
Jay L. Garland1, M. Celina Zabaloy2
1
Dynamac Corporation, Mail Code DYN-3 Kennedy Space Center, Fla. 32899, USA. 2Center of
Renewable Resources of Semiarid Region, National Council for Scientific and Technological
Research (CERZOS-CONICET), San Andrs 800, Baha Blanca (8000), Argentina.
E-mail: [email protected]
Introduction
Characterization and classification of heterotrophic microbial communities
based on rapid assessment of multiple sole carbon sources use, an approach
termed community-level physiological profiling (CLPP) by Lehman et al. (1995),
was developed over 10 years ago (Garland, Mills 1991). The approach commonly
utilizes microtiter plates from Biolog, Inc. in which respiration of 95 separate
sole carbon sources is detected by the reduction of a redox sensitive dye (Bochner,
Savageau 1977, Bochner 1989). The multivariate profile of carbon source use is
a proven tool for rapid assessment of community dynamics in response to
spatial, temporal, or experimental gradients (Garland 1997, Mills, Garland
2001). More recent work has employed the rate of extinction in community
phenotypic characters with dilution as an estimate of relative structural diversity
(Garland, Lehman 1999). While a valuable method for assessing relative change
in microbial communities when properly applied, significant limitations of the
approach are well known (Konopka et al. 1998). In particular, the kinetics of
dye reduction is not a clear indicator of in situ carbon source utilization. The
discrepancy between CLPP response and function may result from the selective
enrichment of the community at the high substrate concentration (i.e., > 100
mM) necessary to achieve tetrazolium reduction in the Biolog plates during the
typical 1-4 day incubation (Smalla et al. 1998; Winding, Hendrickson 1997).
Development of a more functionally relevant CLPP will depend on the
application of new technologies for detection of physiological processes. An
improved detection system would involve lower substrate concentrations and
shorter incubations to minimize bias due to growth and selective enrichment.
In addition, the use of undefined, proprietary reagents should be minimized so
that incubation conditions can be defined and manipulated. The significant
123
Jay L. Garland, M. Celina Zabaloy
effect that changes in the media formulation between GN2 and GN plates from
Biolog Inc. had on CLPP illustrates the need for a defined chemical environment
(OConnell, Garland 2002). Assessment of respiration should involve direct
measurement of substrates (i.e., O2) or products (CO2) rather than indirect
indicators such as tetrazolium dye. A multivariate approach to carbon source
use based on CO2 monitoring has been developed (Degens et al. 2001). While
this approach limits incubation time and the use of unknown reagents, substrate
concentrations are relatively high (i.e, 10-100 mM). 14C-respirometric
approaches allow for testing of environmentally relevant substrate
concentrations, but even simplified assay systems (Reid et al. 2001) still have
the expense associated with disposal of radioactive wastes.
Since the CLPP approach typically involves uniform mixing of various
substrates with the sample, aqueous suspensions (either direct samples of
liquid environments or slurries of solid samples) are tested. Detection of
dissolved O2 (DO) in the test medium may allow for improved sensitivity (i.e.,
testing of lower substrate concentrations) given the low solubility of O2 in
water. Recently, a fluorescence-based, microplate platform has been
developed for assessing DO (Wodnicka et al. 2000), and the objective of the
current work is to review the work completed to date with this approach, with
specific emphasis on soil analyses.
General methodology
BD Microplates
The BD Oxygen Biosensor System (BD Biosciences, Bedford. MA) used in
these studies consists of a 96 well (300 l volume) microtiter plate containing
an O2-sensitive fluorophore, 4,7-diphenyl-1,10-phenathroline ruthenium (II)
chloride, adsorbed onto an O2 permeable silicone matrix in the bottom of
each well. The fluorescence of the ruthenium dye is quenched by the presence
of O2, so the signal from the fluorophore-gel complex loaded on the bottom
of the microplate wells increases in response to respiration in the overlying
sample.
Plates are read continuously (every 15 to 30 min) on a microplate
flourometer at 485 nm excitation and 604 nm emission using the bottom
reading mode, with controlled incubation temperature, given that the
fluorescence is affected by temperature.
Plate inoculation
Previous work (Zabaloy et al. 2008) has shown that the sensitivity of the
assay to detect a response to low levels of substrate can be greatly increased
by increasing the volume of liquid loaded in the wells from 150 to 240 l.
Subsequent experimental work has been conducted using the optimized
124
Perfil Fisiolgico de Comunidades de Suelo Basado en el Consumo de Oxgeno
protocol published by Zabaloy et al. (2008) (Figure 1). Briefly, the 96-well
plate is loaded with the assay substrates to give a final concentration of 50
mg l-1 , taking into account the volume of soil slurry and any other reagent
solution to be loaded in the well (e.g., N, P, or antibiotic), and a final volume
of 240 l. Nitrogen at a rate of 10 mg l-1 has been shown to give an optimum
response. To achieve the desired final concentrations, appropriate stock
solutions must be prepared and filter-sterilized (< 0.2 m). For example, if the
desired final concentration of C source is 50 mg l-1 and that for N is 10 mg l-1
, and the soil slurry will be added in 80 l, then one could prepare stocks of
150 mg l-1 C source and 30 mg l-1 N, loading 80 l of each one. A thick soil
slurry that still allows pipetting is prepared. As a rule of thumb, mineral soils
can be suspended in less water (thicker slurries) than organic soils. In general,
10 g mineral soil (or 5 g of organic soil) is suspended in 25 ml of filter-
sterilized distilled water in a 50 ml centrifuge tube containing glass beads (2
mm ) and shaken for 1 min by hand to disrupt soil aggregates and homogenize
the slurry. The soil slurry is inoculated in the plate (typically, 80 to 160 l)
immediately prior to plate incubation and reading.
125
Jay L. Garland, M. Celina Zabaloy
Data analysis
Fluorescence increases following a lag period ranging from a few minutes
to many hours as the inoculated community consumes O2 (Figure 1). To simplify
interpretation, fluorescent data are converted to normalized relative
fluorescent units (NRFU) by dividing each time reading by the time=1 h
response (to account for temperature stabilization in the platform).
Fluorescence reaches a peak at low substrate concentrations (<100 ppm), but
may be maintained at saturating levels (typically 8-9 NRFU) when high substrate
levels (e.g., 500 ppm) are used. Since low substrates amendments minimize
enrichment effects (see below), a peak in fluorescence is the preferred
response profile. Given the reversible nature of the quenching reaction,
fluorescence begins to decline when O2 diffusion into the gel layer equals the
diminishing rate of respiration rate as substrate is depleted. The rate of O2
diffusion into the gel layer appears to be strongly influenced by settling of the
soil suspension on top of the gel layer. Shaking the plates, even when sealed
with gas impermeable film to prevent O2 diffusion from the atmosphere air,
greatly reduces the fluorescent response (Garland and Zabaloy, unpublished
data). These result suggests that O2 dissolved in the overlying sample can not
readily diffuse into the gel under static conditions, most likely due to the settled
soil layer.
Various parameters may be used to characterize and compare the
response profiles, but the 3 most commonly used to date have been minimum
response time, peak height, and the integrated response, or area. The
minimum response time is defined as the amount of time necessary for a
10% increase in NRFU (i.e., threshold response of 1.1 NRFU) given that
formalin killed control never exceed 1.1 NRFU. The lag in response should
be related to the amount of active biomass able to utilize a given substrate
(see below for further detail). The peak in response corresponds to the
minimal level of O2 in the gel layer during incubation, and should reflect the
rate at which the O2 is consumed. The rate of O2 consumption can be affected
by the same factors affecting lag (i.e., the number and activity of organisms
present in the sample that can utilize the substrate). In addition, the peak
will be influenced by the degree of selected enrichment during the lag phase.
Finally, the degree to which the substrate is respired versus assimilated will
affect the peak response since samples with more cell growth should have
lower O2 consumption. Further work is needed to evaluate the influence of
these various factors on the peak height. The area under the curve can
provide an integrated measure of both the lag and the peak height, but
effective comparison amongst samples requires selection of an appropriate
incubation time. For example, sufficient time is needed to ensure that
responses are observable, but long incubation time will minimize differences
if responses have peak and declined to baseline level. Ideally, area values
should be compared when the fastest responding wells have just reached
their peak.
126
Perfil Fisiolgico de Comunidades de Suelo Basado en el Consumo de Oxgeno
Figure 2: Response of
rhizosphere communities in
the BDOBS plates containing
50 ppm of either A) sodium
laureth sulfate, SLESA, or B)
cocoamidopropyl betaine,
CAPD. Samples obtained from
hydroponic systems exposed to
neither substrate (control
system) or each individually
(SLES or CAPB systems).
127
Jay L. Garland, M. Celina Zabaloy
128
Perfil Fisiolgico de Comunidades de Suelo Basado en el Consumo de Oxgeno
Garland et al. (2002) was the first to demonstrate that N addition to the
wells could increase community response, suggesting that the assay could be
used to assess N limitation of microbial activity. Zabaloy et al. (2008) showed
that fertilization of soil microcosms altered the impact of N addition to the
wells. Unfertilized microcosms showed higher fluorescent peaks with N
addition (compared to without N) at all sampling times while soils from the
fertilized microcosms did not respond to N at the early time point (1 day) but
appeared N limited 5 days after fertilization.
Nutrient limitation of microbial activity in soil has practical consequences
on soil fertility and crop yields, for N is most likely immobilized in the microbial
biomass with amendments with high C:N contents. Garland et al. (2010)
compared the microbial activity between corn (Zea mays L.) and rye (Secale
cereale L.) rotations receiving no organic amendment (all fertilizer from
inorganic sources) versus additions of biosolids or dairy waste solid organic
amendments. They studied microbial respiration with a range of substrates
with and without N addition in the plate, along the crops cycle, in relation
with fertilization timing. This work further showed that Ndiff (i.e., the difference
129
Jay L. Garland, M. Celina Zabaloy
in peak height for a given C source with 10 mg l-1 N source and without N) is an
indication of N limitation on microbial respiration. Ndiff was considerably higher
in all treatments during the rye crop when soil inorganic N was very low (< 10
mg l-1), with the dairy solid treatment showing the highest N limitation. In
contrast, N diff was low along all treatments during the corn crop when
extractable inorganic N was high (Figure 3). The crop yield results showed
good agreement with the N limitation estimate through Ndiff , with lower mid-
season biomass production for rye with dairy solids fertilization and no effect
of organic amendments on corn production. Work is being conducted to
understand the extent and duration of N limitation in soils following different
levels of N fertilization in the field, and the relationship between N limitation
and growth under the assay conditions (Garland et al., in preparation).
Brown et al. (2009) used the BDOBS approach to analyze physiological
responses of bulk soil, rhizosphere and litter microbial communities in a
nutrient-limited scrub-oak forest soil, exposed to varied experimental
conditions (N and/or P additions vs. no nutrients; complex, natural substrates
and glucose, vs. no C). All the communities appeared mainly N-limited with a
secondary P limitation, as observed by the complete lack of response to glucose
in the absence of these nutrients. That effect was greater in bulk and
rhizosphere soils, while the litter community might have less of a P limitation
given that the background C+ N and glucose+N showed significant respiration.
The litter community also showed substrate-specific adaptation, with greater
use of litter extracts as C source. This is a clear demonstration of the ecological
relevance of the assay, which reflects in situ use of substrates by microbial
communities. Moreover, this study showed that factors limiting microbial
respiration in the field can be assessed with this approach, given the flexibility
to add macro and micronutrients in the incubation media.
Overall, the above results showed that the BDOBS approach allows for
rapid and multivariate physiological profiling of soil microbial communities,
as well as the evaluation of their integrated use of C, N and P.
130
Perfil Fisiolgico de Comunidades de Suelo Basado en el Consumo de Oxgeno
plant, showed a faster O2 uptake and greater response to the surfactant and
its metabolites as compared to an unexposed, control consortium. The BDOBS
results suggested that the hydrophobe-hydrophile pathway was the prevalent
metabolic route in this microbial community. At the same time, it allowed the
identification of several metabolites, such as ethylene glycol and diethylene
glycol, that were relatively recalcitrant and may be of environmental concern.
More recent work by Zabaloy et al. (2010) used the BDOBS to examine
aerobic degradation of the herbicide 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D)
in soil microcosms treated with an environmentally-relevant level (ERL, 5 mg
kg-1 soil) and high level (HL, 50 mg kg-1 soil) of 2,4-D after 3 and 14 days of
incubation. Use of 2,4-D as a sole source of C and energy (50 mg l-1) was initially
retarded (> 40 h at day 3) and was maximal 2 weeks after treatment (Figure
4). They argued that a shift in the dominant degrader populations may have
occurred between days 3 and 14 in the HL, as opposed to the ERL microcosms,
and the increase in use of 2,4-D reflected the activity of specific degraders
that were favored by the high dose.
131
Jay L. Garland, M. Celina Zabaloy
132
Perfil Fisiolgico de Comunidades de Suelo Basado en el Consumo de Oxgeno
Conclusions
The BDOBS offers many advantages for physiological testing of microbial
communities. The location of the gel layer on the bottom of the wells allows
for visibly turbid (e.g. heavy soil suspensions) materials to be assayed with
bottom-reading plate readers, eliminating the need for cell extraction steps.
Detection of dissolved O2 (DO) rather than redox dye reduction improves the
sensitivity of CLPP, allowing for more rapid assessment (i.e., several hours
versus 1-4 days) of community respiration either without amendment or with
addition of low levels of substrates (i.e., 1 mM g-1 soil vs. 10-100 mM typically
used in substrate-induced respiration assays). Finally, conditions can be fully
defined and readily manipulated within the assay due to lack of ancillary
proprietary ingredients or physicochemical restrictions on the fluorophore
response. This flexibility allows for testing of the factors which may be limiting
microbial activity, such as the availability of nutrients or the presence of
potential toxicants. The ability to rapidly assess the physiological profile of a
soil microbial community was one of the original intents of the CLPP approach,
but the selective enrichment bias of the original plates severely limited the
ability to interpret such responses. Results to date suggests that the new
platform for the assay may allow for greater realization of the original intent,
providing ecological insight into how soil microbial communities are poised to
process various forms of carbon.
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Perfil Fisiolgico de Comunidades de Suelo Basado en el Consumo de Oxgeno
135
Jay L. Garland, M. Celina Zabaloy
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2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) on indigenous herbicide-
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136
Captulo 8
Bacterias solubilizadoras de fsforo
como biofertilizantes: aislamiento,
caracterizacin, diversidad y promocin
del crecimiento vegetal
Phosphate solubilizing bacteria as biofertilizers: isolation,
characterization, diversity and growth vegetable
promotion
Leticia A. Fernndez1, Marcelo A. Sagardoy2
1
Departamento de Agronoma de la Universidad Nacional del Sur, San Andrs 800 Altos del
Palihue (8000) Baha Blanca. 2 Departamento de Agronoma de la Universidad Nacional del
Sur, San Andrs 800 Altos del Palihue (8000) Baha Blanca.
E-mail: [email protected]
Introduccin
La rizosfera provee un microambiente complejo y dinmico, donde los
organismos forman una comunidad nica y de considerable potencial para
su estudio y aplicacin tecnolgica. El conocimiento integral de la misma,
es fundamental para la comprensin de distintos aspectos que se consideran
pilares de la sustentabilidad agrcola y ambiental (Garca de Salamone,
Cassn 2010). El proceso de solubilizacin de fsforo se presenta como
uno de esos aspectos relevantes.
La habilidad de algunos microorganismos para convertir formas de fsforo
insolubles de tal manera que se vuelvan accesibles por las races de las plantas
y/o cultivos, es una propiedad importante del suelo y de la rizosfera. Esta
capacidad es conocida como solubilizacin de fsforo y el nmero de bacterias
con este potencial es mayor en la rizosfera que en el suelo propiamente dicho
(Nobandegani 2008). Numerosos estudios han demostrado que este proceso
aumenta la fertilidad del suelo proveyendo de fsforo disponible extra para
las plantas y/o cultivos de inters agronmico, adems de que tiene efectos
importantes sobre otros nutrientes en el suelo, como por ejemplo el nitrgeno
en la fijacin biolgica de nitrgeno (Rodrguez, Fraga 1999).
El objetivo de este captulo es hacer una revisin que abarque los trabajos
ms actuales de una temtica tan relevante como es el proceso de solubilizacin
de fsforo inorgnico. De manera tal que, se comenzar con el ciclo de este
137
Leticia A. Fernndez, Marcelo A. Sagardoy
138
Bacterias solubilizadoras de fsforo como biofertilizantes: aislamiento, caracterizacin, diversidad y promocin
del crecimiento vegetal
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Leticia A. Fernndez, Marcelo A. Sagardoy
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Bacterias solubilizadoras de fsforo como biofertilizantes: aislamiento, caracterizacin, diversidad y promocin
del crecimiento vegetal
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Leticia A. Fernndez, Marcelo A. Sagardoy
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Bacterias solubilizadoras de fsforo como biofertilizantes: aislamiento, caracterizacin, diversidad y promocin
del crecimiento vegetal
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Leticia A. Fernndez, Marcelo A. Sagardoy
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Bacterias solubilizadoras de fsforo como biofertilizantes: aislamiento, caracterizacin, diversidad y promocin
del crecimiento vegetal
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Leticia A. Fernndez, Marcelo A. Sagardoy
Conclusiones
La adquisicin de nutrientes como el P desde el suelo, es un proceso
gobernado por el desarrollo de las races y su interaccin con los componentes
abiticos y biticos (Richardson et al. 2009). Dentro de estos ltimos, los
microorganismos y ms precisamente, las bacterias solubilizadoras de P, objeto
de esta revisin, son un componente fundamental de la agricultura sostenible.
146
Bacterias solubilizadoras de fsforo como biofertilizantes: aislamiento, caracterizacin, diversidad y promocin
del crecimiento vegetal
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Leticia A. Fernndez, Marcelo A. Sagardoy
150
Captulo 9
Investigacin aplicada en Azotobacter sp.
dirigida a la promocin de crecimiento en
cultivos de inters econmico en Colombia
Azotobacter sp. applied research aimed to growth
promotion of crops with economics interest in
Colombia
Ruth Rebeca Bonilla1, Ren Novo2, Belisario Roncallo3, Mauricio Camelo1, Paola
Criollo1, Germn Andrs Estrada4, Mara Fernanda Garrido1, Mnica Lpez1, Andrs
Eduardo Moreno1, Melissa Obando1, Lorena Parra1, Diego Mauricio Rivera1, Daniel
Fernando Rojas1, Mario Van Strahlen5, Corina Zambrano6
1
Laboratorio de Microbiologa de Suelos, Corpoica. 2Universidad de la Habana, Cuba.
3
Estacin Experimental Motilonia, Corpoica. 4Embrapa Agrobiologa, Brasil. 5 Instituto
Colombiano Agropecuario, ICA. 6 Instituto Interamericano de Cooperacin para la
Agricultura, IICA. E-mail: [email protected]
Introduccin
El uso excesivo de fertilizantes de sntesis qumica se hace insostenible para
cualquier prctica agrcola tanto a nivel econmico como ecolgico. An as, el uso
de fuentes qumicas ha incrementado la produccin agrcola (Johnson et al. 2001),
pero con costos irrecuperables (Garcia-Agustin et al. 2004). Su aplicacin ha provocado
numerosos efectos negativos sobre el medio ambiente, tales como acumulacin de
nitratos en aguas subterrneas (Johnson, Kross 1990; Smith et al. 1994; Halwani et al.
1999; Suthar et al. 2009), toxicidad en plantas por altos niveles de nitritos (Bancroft
et al. 1979) y en general, alteracin de las interacciones biolgicas y qumicas del
suelo (Mirlean et al. 2008). Por estas razones se considera que la incorporacin de
prcticas sostenibles en la agricultura moderna puede generar beneficios ambientales
importantes y su aplicacin cada vez es ms necesaria.
Diversas estrategias se han planteado como alternativa de enmienda,
dentro de las cuales reviste gran importancia el uso de microorganismos
eficientes en la promocin del crecimiento vegetal como herramienta de
biofertilizacin (Raupach, Kloepper 1998; Adesemoye et al. 2008, 2009). Estos,
son un componente natural del suelo y debido a su rol en el ciclaje de nutrientes
y en la sntesis de ciertos metabolitos, pueden incrementar su fertilidad y
productividad (Adesemoye et al. 2009).
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AC1, mientras que el valor de AC1 es menor a lo reportado para las cepas
PsA4 y Ba32. A pesar que el gnero Azotobacter no ha sido ampliamente
reportado como solubilizador de fosfatos, los valores obtenidos estuvieron
acorde con lo reportado por varios autores (Chen et al. 2005; Rajkumar et al.
2006). Tambin se aplic el mtodo del p-nitrofenilfosfato (Caballero et al.
2007) con el fin de determinar la presencia de la enzima fosfatasa en la cepa
AC1 de A. chroococcum; sin embargo, no hubo evidencia de la presencia de
esta enzima encargada de la mineralizacin de fsforo orgnico.
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5. Identificacin molecular
Inicialmente se aislaron 42 cepas y se identificaron preliminarmente como
del gnero Azotobacter sp. por pruebas fenotpicas (microscpicas,
macroscpicas y bioqumicas) y posteriormente se seleccionaron 8. Los
resultados obtenidos en diferentes especies vegetales permitieron seleccionar
la cepa AC1 por tener un mayor efecto sobre la germinacin de algodn,
sorgo, maz y caup, en relacin con los otros aislamientos obtenidos; en
condiciones de invernadero aument la altura de la planta, la longitud
radicular, el peso seco de la raz y la parte area, con respecto a los testigos.
Dado que la cepa presentaba actividades metablicas de inters, se
caracteriz filogenticamente mediante la amplificacin del gen nifH en el
laboratorio de Microbiologa Molecular del Centro de Biotecnologa y
Bioindustria CORPOICA. Este gen (nifH) codifica para una subunidad de la
enzima dinitrogenasa reductasa y se ha demostrado que contiene informacin
filogentica suficiente para la identificacin de microorganismos diaztrofos
(Hill 1992). Se obtuvo una banda de 370 pb aproximadamente (Figura 4). La
purificacin se llev a cabo mediante una columna de purificacin Microcon
siguiendo la metodologa descrita por la casa comercial. El producto obtenido
de PCR se secuenci, la informacin obtenida fue comparada con la base de
datos curada del GenBank y se confirm el gnero y la especie del
microorganismo con un 99% de similitud.
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Conclusiones
El desarrollo de sistemas agropecuarios sostenibles requiere del
conocimiento de los mecanismos que involucran las interacciones suelo-
microorganismo-planta-ambiente. El uso de fertilizantes biolgicos como
Monibac permite aumentar el rendimiento de diferentes cultivos de inters
econmico en Colombia, disminuyendo el impacto sobre el medio ambiente y
favoreciendo la calidad de vida del productor. La continuidad en la investigacin
pretende proyectar el uso de principios activos de tipo biolgico (Azotobacter
sp.) en biofertilizantes, los cuales contribuyan con la promocin del crecimiento
vegetal de especies promisorias en Colombia.
A partir de varios aislamientos provenientes de la zona Caribe colombiana
se obtuvo la cepa AC1 la cual evidenci en invernadero y campo promover el
crecimiento de diferentes cultivos de inters como el algodn, la lechuga,
tomate, aj o los pastos. Estos resultados fueron corroborados en el laboratorio
donde se evidenci que AC1 fue capaz de fijar nitrgeno, producir indoles y
solubilizar fosfatos. De igual forma, se demostr que la inoculacin con la
cepa AC1 representa una alternativa eficiente y rentable para la promocin
de ciertos cultivos donde la fertilizacin nitrogenada puede ser reducida
hasta en un 50%. Adicionalmente, los trabajos actuales tambin estn
dirigidos hacia la reduccin en los costos de produccin de los inoculantes.
Ciertos avances han sido realizados sobre el proceso tecnolgico, donde se
logr una reduccin del 98% en el proceso de produccin mediante el
desarrollo de un medio de cultivo alternativo para la produccin del
microorganismo. Azotobacter chroococcum es participe en la fijacin biolgica
de nitrgeno en los suelos, es decir, contribuye al ciclaje del nitrgeno en los
sistemas de produccin reduciendo la aplicacin de productos de origen
qumico. Adicionalmente, se le atribuye la capacidad de producir sustancias
promotoras del crecimiento vegetal, contribuyendo al desarrollo de la planta.
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Agradecimientos
Los autores agradecen a los financiadores: Conalgodn, Ministerio de
Agricultura y Desarrollo Rural (MADR), Fedegan y la Gobernacin del Cesar.
Adicionalmente, agradecen a Ever Mauricio Barn y a Edelberto Maestre
por su colaboracin tcnica durante la ejecucin de las actividades
implicadas en el desarrollo del biofertilizante y el apoyo durante el proceso
investigativo.
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Captulo 10
El gnero Pseudomonas en suelos
agrcolas y en rizosfera. De molculas a
comunidades
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere.
From molecules to communities
Betina Agaras, Claudio Valverde
Programa Interacciones Biolgicas, Departamento de Ciencia y Tecnologa, Universidad
Nacional de Quilmes. Roque Senz Pea 352, Bernal, B1876BXD, Argentina. Tel.: +54-
11-4365-7100. Fax: +54-11-4365-7132. Consorcio BIOSPAS (Biologa del Suelo y Produccin
Agraria Sustentable), proyecto PAE 36976, Ministerio de Ciencia, Tecnologa e Innovacin
Productiva, Argentina. E-mail: [email protected]
Introduction
Pseudomonads are Gram-negative, aerobic, non-sporulating, polarly
flagellated rods that are widely distributed in nature (Holt et al. 1994).
Here, the term pseudomonads will refer to members of the genus
Pseudomonas spp., also known as Pseudomonas sensu stricto, i.e., strains
whose 16S ribosomal DNA sequences fall into the rRNA I group defined by
Palleroni (Anzai et al. 2000). Representative members of the
pseudomonads are P. aeruginosa, P. putida, P. fluorescens, P. syringae, P.
chlororaphis and P. stutzeri. These species include strains that are
opportunistic human pathogens (P. aeruginosa, P. putida, P. fluorescens)
and plant pathogens (P. syringae), as well as strains that have plant growth
promoting or plant probiotic effects (P. putida, P. fluorescens, P.
chlororaphis). Despite this simplified categorization, the nature of the
interaction (pathogenic, probiotic or neutral) with a eukaryotic host (plant,
animal or human), can not be associated with a single pseudomonad
species and must be determined for every single isolate. An important
number of isolated pseudomonads produce water soluble pigments that
fluoresce under UV light, particularly under iron limitation; those strains
are referred to as fluorescent pseudomonads (Cornellis 2010).
Pseudomonads are detected in the rhizosphere of many healthy plants, as
important quantitative components of the microbial biota, suggesting that their
presence might be advantageous to the host plant (Haas, Defago 2005; Weller
2007). Moreover, specific lineages have been detected in certain crops associated
173
Betina Agaras, Claudio Valverde
with reduced incidence of root diseases (Weller 2007). For several isolates, it has
been proved that their inoculation results on plant growth promotion under certain
controlled conditions. Such positive effects have been explained by different
mechanisms, some of which have been dissected at the molecular level (Haas,
Defago 2005). This aspect will be first illustrated here for a model P. fluorescens
probiotic strain, with a discussion about the critical role that a genetic regulatory
system has to protect plants against phytopathogenic fungi and, simultaneously, to
protect bacterial cells themselves from predation by bacterivorous eukaryotes. We
will then move from molecular details of a model strain into ecological aspects of
pseudomonads as members of the rhizosphere community, and briefly introduce
current studies on pseudomonads diversity in soil and rhizosphere in no-till farming
plots in Argentina.
174
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere. From molecules to communities
operon (Haas, Keel 2003). The genes encoding proteins and enzymes for these
biocontrol factors are organized into separate operons that are dispersed into
the genome (Paulsen et al. 2005), that is, they are not physically linked so that
the above mentioned regulatory cues affecting transcription of the hcn or phl
operons do not influence expression of the plt, prn or aprA operons, and vice
versa.
However, early in the 90s, a classical genetic screening of a library of random
generated transposon mutants derived from strain CHA0, allowed the identification
of a single gene that when inactivated, it caused multiple phenotypes including loss
of all antibiotic factors and extracellular enzymes, and consequently, loss of tobacco
black root rot suppression (Laville et al. 1992). For this reason, the identified gene
was named gacA, namely, global antibiotic and cyanide regulator A. Amino acid
sequence homology indicated that GacA is a transcriptional regulatory protein,
typical of bacterial two-component systems (TCSs). TCSs are very common in
prokaryotes as sensory-transducing systems that permit bacteria to decode
environmental signals into genetic and cellular responses (Goulian 2010). The first
component is a transmembrane protein with at least three domains, a periplasmic
domain for interaction with the external stimulatory signal, a membrane anchorage
domain, and a cytoplasmic domain that contains a conserved histidine residue
where autophosphorylation occurs upon perception of the inducing signal. The
second component is the response regulator, i.e., a transcriptional regulator that
interacts with the sensor cytoplasmic domain and receives the phosphate in a
conserved aspartate residue, inducing a conformational change that permits binding
of the phosphorylated response regulator to the DNA to execute transcriptional
regulation of target genes and operons (Goulian 2010). In P. fluorescens strain
CHA0, GacA is the response regulator and GacS, is the partner membrane sensor
(Figure 1a; Zuber et al. 2003). One intriguing feature of the gacA mutant was that the
mutation did not affect transcription of all biocontrol operons, but the corresponding
biocontrol products were not synthesized. Thus, GacS/A seemed to have a global
regulatory positive effect on biocontrol gene expression at a post-transcriptional
level (Figure 1a). Two major questions arose: 1) how does the GacS/A executes the
global control on biocontrol gene expression? 2) Which is the signal perceived by
GacS? Significant advances at the molecular level have been achieved regarding
these issues in the last two decades for strain CHA0 (Lapouge et al. 2008; Valverde,
Haas 2008).
A keynote feature of the GacS/A system of strain CHA0 is that its global positive
effect on expression of biocontrol genes is maximal in cultures with high cell
density, with activation factors of 25-50 when cultures transit from exponential to
stationary phase (Lapouge et al. 2008). This behaviour is reminiscent of regulatory
systems of the quorum sensing type, i.e., regulatory circuits that respond to increasing
cell densities (Valverde 2010). In fact, strain CHA0 synthesizes a water soluble low
molecular weight compound that can be extracted from culture supernatants, and
that is able to activate the GacS/A system and advance biocontrol gene expression
to lower cell densities; that is, strain CHA0 produces an autoinducer that is sensed
175
Betina Agaras, Claudio Valverde
by the GacS/A system. The chemical nature of the GacS/A autoinducer is unknown
yet (Dubuis, Haas 2007). So, the GacS/A TCS behaves as a quorum sensing system
with a positive feedback autoregulatory loop and an output branch for activation
of biocontrol gene expression (Figure 1a; Valverde, Haas 2008).
176
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere. From molecules to communities
induces transcription of the three small RNA transcripts RsmX, RsmY and RsmZ,
that are the true effectors of the GacS/A system (Heeb et al. 2002; Valverde et al.
2003; Kay et al. 2005). These small regulatory RNAs have several structural-
sequence motifs that resemble those recognized by RsmA/E proteins in target
mRNAs (Valverde et al. 2004), so when the intracellular concentration of RsmX/Y/
Z small RNAs is increased, the RsmA/E proteins are outcompeted and displaced
from blocked mRNAs to form ribonucleoprotein RsmA/E-RsmX/Y/Z complexes,
thus permitting mRNA translation (Figure 1b; Valverde, Haas 2008). In this way,
the regulatory mechanism that controls biocontrol gene expression in strain CHA0
can be considered a cascade mastered by the GacS/A TCS, which output is executed
by small RNA molecules that act as antagonists of translational repressor proteins
(Figure 1). Which would be the advantages of such a complicated mechanism? On
the one hand, the response is quite fast and economic as it relies on synthesis of
small RNA molecules that must not be translated, and it operates on pre-formed
mRNAs. On the other hand, it allows coordinated expression of operons/genes
whose activation confers a competitive advantage for the cell under certain
environmental condition. So, one can imagine that plant roots profusely colonized
by strain CHA0 will benefit by the activation of the GacS/A system due to the high
cellular densities achieved on the rhizoplane/rhizosphere, resulting on good
expression of biocontrol genes for suppression of root pathogens (Figure 2).
177
Betina Agaras, Claudio Valverde
178
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere. From molecules to communities
techniques, the genetic diversity of the genus was realized. Different genetic
factors, from the genome size to its architecture, show a significant diversity
(Ginard et al. 1997; Schmidt et al. 1996; Rainey, Bailey 1996). Nevertheless,
this is not reflected at the DNA sequence level, supporting that these
microorganisms belong to the same bacterial genus (Spangenberg et al. 1998;
Kiewitz, Tummler 2000). The causes of this great diversity arent clear yet.
Microbiological studies tend to explain diversity at the DNA level, but they
generally forget the ecological factors that are certainly involved in shaping
biological diversity, like ecological opportunity and competition (Darwin 1859).
Ecological studies have been performed to elucidate which factors influence
the patterns of pseudomonads diversity. For instance, in a spatially
heterogeneous environment, the P. fluorescens SBW25 isolate rapidly diverges
into different colony morphologies with a marked niche preference (Rainey,
Travisano 1998). These niche-adapted classes, which bear mutations, had
competitive relationships, so that this diversity is durable.
Despite ecological opportunity and competition are considered the most
significant ecological causes of diversity, others like productivity, disturbance
and parasitism do also have an influence. Studies with strain SBW25 revealed
that the unimodal relationship between diversity and both productivity (Kassen
et al. 2000) and disturbance (Buckling et al. 2000) occurs in heterogeneous
environments, but not in homogeneous ones. Hence, these unimodal
relationships can be caused by selection of specialized types in the
heterogeneous environments, and they modulate the biological diversity. With
regards to parasites, the phage SBW25f2 has an important effect on
diversification of P. fluorescens SBW25 as it causes a reduction in sympatric
diversity but an increase in allopatric diversity (Buckling, Rainey 2002). So, the
exploiters (phages) can drive diversification between populations but may
inhibit diversification within populations by opposing diversifying selection
that arises from resource competition.
Obviously, evolution is not possible without genetic processes that affect
diversification. Mutation and recombination are the principal resources of
variation, and the pseudomonads have an enhanced capacity of evolutionary
divergence, i.e. evolvability. There is no evidence for a single mutational
mechanism or a main strategy for recombination in pseudomonads. However,
strains with elevated mutation rates (mutators) have been isolated (Oliver, Mena
2010), and recombination pathways occur in this genus of bacteria (Kiewitz et
al. 2000). Long-term infections, like those in lungs of cystic fibrosis patients, are
an excellent source of heterogeneous P. aeruginosa mutator isolates that are
defective in the DNA mismatch-repair system (Oliver et al. 2000; Moyano et al.
2007). An interesting related genetic event is phase variation, which occurs in
various Pseudomonas species. Phase variation consists in the diversification of a
single bacterial population into subpopulations with phenotypic and genotypic
differences. This is typical of bacteria occupying heterogeneous environments
such as the soil or rhizosphere. Phase variation often affects cell surface
179
Betina Agaras, Claudio Valverde
180
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere. From molecules to communities
Figure 3: The rhizosphere effect for pseudomonads. The graph shows the average
load of pseudomonads (log CFU/g-1) in top soil (S) and rhizosphere (R) at
different geographical locations (1-4) in the humid Pampa, in agricultural
plots under no till management. BAP, plots selected by their bad
agricultural practices; GAP, plots selected by their good agricultural
practices (AAPRESID). The crops present at time of sampling (summer
2010) were: maize (R1) and soybean (R2, R3, R4) for BAP; soybean (R1, R2,
R4) and maize (R3) for GAP. Error bars indicate SD.
181
Betina Agaras, Claudio Valverde
The ability of inoculated bacteria to reach the root tip during colonization
is considered of primary importance to cope with competition with the
indigenous soil microflora and with propagules of fungal plant pathogens
that can be found at different soil depths. So, the colonization competence is
defined as the ability of seed or seedling inoculated bacteria to reach the
growing root tip. An effective colonization can contribute to: i) cause diseases
(pathogenicity); ii) control disease by production of certain metabolites
(biocontrol); iii) direct plant growth promotion (phytostimulation); iv)
increasing availability of nutrients for plants, like phosphate, nitrogen and
micronutrients (biofertilization); v) phytoremediation, through degradation
of toxic organic compounds (Lugtenberg, Dekkers 1999).
Genetic approaches suggest that the colonization ability of pseudomonads
is a very complex process, implicating various mechanisms and multiple genetic
factors. Either by targeted mutagenesis of genes presumed to be involved in
colonization or by random mutagenesis, several mutants have been isolated
with an altered colonization competence. These mutants with impaired root
colonization suffered mutations in genes associated with motility, chemotaxis,
growth rate, carbon source usage, outer membrane proteins as OprF and efflux
pumps, and production of different cellular compounds, like the LPS O-antigen,
cellulose, thiamine, amino acids, and biotin (Lugtenberg et al. 2001; Haas,
Dfago 2005; Weller 2007). Interestingly, most of these factors involved in
root colonization are also critical for pathogenicity of other Gram negative
bacteria. Conversely, the opportunistic human pathogen P. aeruginosa PAO1
can function like a biocontrol bacterium on cucumber and wheat plants (Walker
et al. 2004). Furthermore, it has been found the type III secretion system (TTSS)
in non-pathogenic P. fluorescens (Lugtenberg et al. 2001; Kimbrel et al. 2010).
TTSS is a specialized protein transport pathway induced in response to contact
with eukaryotic host cells, involved in secretion of effector proteins into the
cytoplasm of eukaryotic cells. The plant pathogen P. syringae pv. tomato
DC3000 employs a TTSS to inject particular proteins into plant cells, and the
bacterium specificity by the host plant is carried out by the effectors protein it
produces and brings into to the cell plant (Fouts et al. 2003). As TTSS have
been previously described only for parasitic bacteria (Alfano, Collmer 1997),
it is still unknown the real function of this pathway in plant probiotic bacteria,
like P. fluorescens; a role in defense against eukaryotic grazers may be
speculated. Thus, similar strategies and mechanisms seem to be used by plant
beneficial as well as plant pathogens to colonize hosts.
182
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere. From molecules to communities
public, the first one seems to be the more acceptable option (Adesemoye et al.
2009). Pseudomonads have several mechanisms for promoting crop growth
and health (Valverde, Ferraris 2010). Several properties make them interesting
candidates as plant growth-promoting rhizospheric (PGPR) or plant probiotic
agents, i.e.: high growth rate, wide carbon source utilization, great rhizosphere
colonization ability, important production of bioactive metabolites, aggressive
competence for niche and a good adaptation to a variety of stresses. However,
the fact that they do not sporulate limits formulation of commercial inoculants
for long term storage (Weller 2007).
Depending on the plant probiotic effect, PGPR microorganisms can be
classified into: 1) biofertilizers, with a direct effect on host plants (this grouping
includes phytostimulators); 2) biocontrol or biopesticide strains, that act
indirectly on plant growth (Haas, Defago 2005). Biofertilizer strains can directly
enhance plant growth by producing phytohormones or the ethylene lowering
enzyme 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase, by synthesizing
siderophores, by supplying biologically fixed nitrogen, or by solubilizing
minerals like phosphorous. Biocontrol strains are able to protect plants from
infection by phytopathogenic organisms (Bloemberg, Lugtenberg 2001; Haas,
Dfago 2005). The great majority of isolated probiotic pseudomonads have
biofertilizer or biopesticide properties, although biological nitrogen fixation
seems to be only restricted to some P. stutzeri strains (Desnoues et al. 2003).
The primary mechanism of biocontrol performed by pseudomonads is the
production of antibiotics, namely DAPG, phenazines, PRN, PLT, HCN (Haas,
Dfago 2005; Weller 2007), and cyclic lipopeptides such as viscosinamide and
tensin (Nielsen et al. 1999). Secreted hydrolytic enzymes like exoproteases,
phospholipase C and chitinases also contribute to antagonism (Chernin et al.
1995; Heeb, Haas 2001). In addition to antibiosis, siderophore production and
induced systemic resistance (ISR) were identified as important traits for fungal
inhibition (Kloepper et al. 1980; Pieterse et al. 2003). Siderophores are small
molecules that can bind the poorly soluble ferric ion and make it available for
its assimilation. As iron is fundamental for life, its sequestration generates a
decrease of iron available for pathogen growth and germination of fungal
spores (Weller 2007), but this strategy is strongly dependent on soil pH (Haas,
Dfago 2005). Siderophores are also implicated in iron acquisition by plants, a
direct effect for their growth promotion (OSullivan, OGara 1992).
Pseudomonads produce various siderophores, mainly fluorescent yellow-green
molecules referred to as pyoverdines or pseudobactins, and other non
fluorescent compounds like pyochelin, pseudomonine, pyridine-2,6-
dithiocarboxylic acid, quinolobactin, corrugatin and nocardamine, which can
also complex metals other than iron, like cobalt, copper, nickel, zinc, vanadium
and molibdenum (Cornelis 2010). Finally, ISR was discovered due to the ability
of some PGPR strains to protect plants from leaf pathogens, as they can react
more quickly and strongly to pathogen attack, though there was not any direct
contact between microorganisms (Haas, Dfago 2005). This effect mimics the
systemic acquired resistance (SAR) mechanism, even though they are regulated
183
Betina Agaras, Claudio Valverde
184
Pseudomonads in agricultural soils and rhizosphere. From molecules to communities
185
Betina Agaras, Claudio Valverde
the Pseudomonas genus, oprF (encoding the major outer membrane porin
OprF; Bodilis et al. 2006) (Figure 4) and gacA (encoding the response regulator
GacA, see above). To confirm the assumption that the S1 medium is strictly
selective for Pseudomonas spp., and that the oprF PCR is genus-specific, we
performed 16S rDNA and oprF sequencing of 50 colonies randomly picked up
from S1 plates from different soil and rhizosphere sources. All 16S rDNA and
oprF sequences confirmed that the picked S1 colonies were members of the
Pseudomonas genus (data not shown), thus supporting the use of S1 platings
and oprF PCR-RFLP as a mean to study the diversity of this bacterial group in
NT soil and rhizosphere samples.
Plate counts of the first two samplings (summer and winter 2010) confirmed
the known rhizosphere effect for pseudomonads, i.e., the total number of
S1 CFU/g-1 of rhizosphere material of different crops is higher by two orders of
magnitude compared to the respective bulk soil (Figure 3). Platings also
suggest a higher bacterial load in the soybean rhizosphere compared to maize,
despite the plot treatment in which plants were sampled (Figure 3). In terms of
diversity, PCR-RFLP analyses also revealed differences on the Pseudomonas
community of soil and rhizosphere from the same plot in all geographical sites,
suggesting that plant roots systems select specific strains from the surrounding
soil. Digital processing and comparative analyses of gacA PCR-RFLP patterns
preferentially grouped samples according to geographic sites but not by
treatments (data not shown). On the other hand, oprF PCR-RFLP results did
not reveal a defined grouping pattern yet. Overall, Shannon index calculations
of soil PCR-RFLP patterns seem to indicate that the population diversity is
higher in GAP plots than in BAP plots. These promising preliminary results
about load and diversity of culturable pseudomonads prompted us to set up
methods to evaluate the load and diversity of total pseudomonads (culturable
plus unculturable) by means of direct DNA extraction from soil and rhizosphere
samples, which are currently under development in our lab.
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Captulo 11
Asociacin entre Azospirillum brasilense
y plantas de frutilla (Fragaria ananassa):
quimiotxis y colonizacin radicular
Association between Azospirillum brasilense and
strawberry plants (Fragaria ananassa): chemotaxis and
root colonization
Ral O. Pedraza1, Mara F. Guerrero-Molina1, Beatriz C. Winik2, Mara L. Tortora1,
Alicia L. Ragout3, Katia R. Teixeira4, Beatriz E. Baca5
1
Facultad de Agronoma y Zootecnia. Universidad Nacional de Tucumn. Av. Roca 1900. (4000)
Tucumn. Argentina. 2Centro Integral de Microscopa Electrnica. Facultad de Bioqumica,
Qumica y Farmacia. UNT. INSIBIO CCT-CONICET Tucumn. Chacabuco 461, (4000) Tucumn,
Argentina. 3PROIMI-CONICET. Av. Belgrano y Pje. Caseros. (4000) Tucumn. Argentina.
4
Laboratrio de Gentica e Bioqumica. EMBRAPA Agrobiologia. Seropdica, Rio de Janeiro.
Brasil. 5Centro de Investigaciones Microbiolgicas, Benemrita Universidad Autnoma de
Puebla, Cdad. Universitaria, Edif. 103. Col. San Manuel, 72570. Puebla, Pue. Mxico.
E-mail: [email protected]
Introduction
The genus Azospirillum belongs to the so called plant growth-promoting
bacteria (PGPB) group. PGPB were defined as free-living soil, rhizosphere,
rhizoplane, and phylosphere bacteria that, under certain conditions, are beneficial
for plants (Bashan, Holguin 1998; Bashan, de-Bashan 2005). They are commonly
used as inoculants to improve crop yields, and besides their agricultural utility,
there are potential benefits in environmental applications (Bashan et al. 2008).
PGPB may promote plant growth in different ways (Bashan, Holguin 1998;
Bashan, de-Bashan 2005): they can directly affect the metabolism of the plants
by providing substances that are usually in short supply. For instance, they
are capable of fixing atmospheric nitrogen, solubilize phosphorus and iron,
and enhance production of plant hormones such as auxins, gibberellins and
cytokinins. In addition, they improve the plant tolerance to stresses, such as
drought, high salinity, metal toxicity, and pesticide load. One or more of these
mechanisms may contribute to the increased plant growth and development,
greater than plants grown under standard cultivation conditions.
In the other side, there is a group of PGPB, referred to as biocontrol-PGPB
(Bashan, Holguin 1998), that indirectly promote plant growth by preventing
195
Ral O. Pedraza, Mara F. Guerrero-Molina, Beatriz C. Winik, Mara L. Tortora, Alicia L. Ragout, Katia R. Teixeira y Beatriz
E. Baca
196
Asociacin entre Azospirillum brasilense y plantas de frutilla (Fragaria ananassa): quimiotxis y colonizacin radicular
chemotaxis, which allows them to move towards the roots to obtain benefits from
root exudates (mainly carbon and nitrogen compounds) (Pedraza et al. 2010).
Azospirillum was found in places where the oxygen concentration is optimal
for biological nitrogen fixation (Barak et al. 1982); some bacterial strains
associated on the root surface and others colonizing the root interior
(Dbereneir, Pedrosa 1987), where there is less competition for available
substrates, which is very important due to the high demand for the energy
required for nitrogen fixation (Falk et al. 1985).
Motility provides a survival advantage under a wide variety of
environments, allowing bacteria to respond to beneficial or negative conditions
and to compete successfully with other microorganisms. Azospirillum
brasilense possesses a polar flagellum in all culture conditions, and synthesizes
lateral flagella when growing on semisolid media (Hall, Krieg 1983). The flagella
of Azospirillum are one of the most complex and effective organelle for
locomotion, capable of propelling the bacterium through liquids (swimming)
and through viscous environments or over surfaces (swarming). Additionally,
these organelles play an important role in adhesion to substrates and biofilm
formation contributing to the interaction with the plant (Croes et al. 1993).
The bacterial colonization of at least part of the root system is required for
the favourable effects of Azospirillum inoculants when applied as biofertilizer
and phyto-stimulators (Okon, Vanderleyeden 1997).
Different varieties of strawberry are cultivated in diverse parts of the world,
including tropical, subtropical, and temperate areas. Besides its commercial
interest, this crop is of great social interest due to the high demand of workers
required for its production and processing at the field, packing, and industry
(Pedraza et al. 2007). The world production of strawberry is around three
million tons per year and it has increased in the last two decades. The annual
world production in 2007 was over 3.8 million metric tons, figure that is still
rising (FAO agricultural data: http://faostat.fao.org/faostat/). Argentina
produces strawberry during the 12 months of the year, being the province of
Tucumn one of the most important producers (Prez, Mazzone 2004).
Although this crop is frequently cultivated in soils with good natural fertility,
chemical fertilizers, mainly nitrogen, are applied at levels greater than 290
kg.ha-1.year-1 to improve fruit yields (Pedraza et al. 2007). The high rate of
application of fertilizers and pesticides have negative and unpredictable effects
in the environment, contributing to the contamination of soils, water, and
natural areas, casting serious risks to human and animal health. An attractive
alternative for the total or partial substitution of nitrogen fertilizers could be
the exploitation of PGPB, such as bacteria of the genus Azospirillum, capable
of affecting growth and yield of many plant species, several of agronomic and
ecological significance.
It was demonstrated the natural occurrence of A. brasilense colonizing
strawberry plants, including inner tissues of roots and stolons (Pedraza et al.
197
Ral O. Pedraza, Mara F. Guerrero-Molina, Beatriz C. Winik, Mara L. Tortora, Alicia L. Ragout, Katia R. Teixeira y Beatriz
E. Baca
Chemotaxis in Azospirillum
It has been demonstrated that A. brasilense polar flagellum rotates in both
clockwise and counterclockwise directions. The last one causes forward
movement of free-swimming cells, while the change in the direction of rotation
to clockwise produce a reversal in swimming direction. When Azospirillum cells
are exposed to malate, a strong attractant, some effects in swimming behaviour
are observed: suppression of direction change, the chemotaxis, and a long
term-increase in swimming speed as chemokinesis (Zhulin, Armitage 1993). In
fact, Azospirillum strains respond chemotactically to temporal gradient of some
effectors such as amino acids, sugars and organic acids, as well as to maize
mucilage. This behaviour is strain dependent, suggesting that a certain degree
of specificity exists in the establishment of plant-bacteria interaction (Reinhold
et al. 1985; Mandimba et al. 1986). The presence of oxidizable substrates
increased the number of attracted bacteria only 1.2 to 3-fold, a rather low ratio,
compared with other bacteria. Further work revealed that the attraction was to
oxygen gradient dissolved in water, and the exposure of the cells to an oxygen
gradient followed by aerotaxis, masked the chemotactic response of the bacteria
(Barak et al. 1982). Consequently, aerotaxis is an important response in A.
brasilense, which guide the bacterium to a preferred low oxygen concentration
for energy generation (3 to 5 M). Indeed, the proton motive force was lower at
oxygen concentrations that were higher or lower than the preferred oxygen
concentration. It was suggested for A. brasilense that reaching the optimal oxygen
concentration is relevant for energy generation and nitrogen fixation in the
rhizosphere (Zhulin et al. 1996). Recently, it was described a quimiotactic
cytoplasmic receptor noted as AerC, that was able to detect the redox status of
cell via the FAD cofactor associated to its PAS domains. The expression of AerC
as well as FAD content in cells were enhanced under nitrogen fixation conditions,
indicating a correlation between quimiotaxis and changes in redox homeostasis
necessary for nitrogen fixation (Xie et al. 2010).
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E. Baca
The higher amount of sugars was detected in root exudates obtained at 7 days
of plant growing of the three varieties (Milsei, Selva, Camarosa), then, a
decrease of them was observed at 14 and 28 days. The amount of total
sugars varied among plant varieties, being Milsei the highest producer at
7, 14 and 28 days as compared with Camarosa and Selva. The maximum
concentration of sugar (0.0806 mg.ml-1) was found in root exudates of the
variety Milsei taken at 7 days of plant growth, followed by exudates from
the variety Selva (0.0629 mg.ml-1), taken in the same period, and finally in
the variety Camarosa (0.0466 mg.ml -1). The minimum value of sugar
concentration (0.0219 mg.ml-1) was determined in root exudates taken at
28 days from variety Camarosa. The variety Selva showed its lowest
concentration (0.0245 mg.ml-1) in exudates obtained at 14 days and in the
variety Milsei the lowest value (0.0358 mg.ml-1) was detected at 28 days of
plant growth. The decrease in total sugar concentration determined in
hydroponic culture after the second week, probably was caused by two
potential mechanisms: the accumulation of high levels of organic substances
in the vicinity of the roots that suppressed the release of additional organic
compounds (Jones, Darrah 1993; Prikryl, Vankura 1980), and the re-
absorption of organic compounds by the plant (Guckert et al. 1991; Jones,
Darrah, 1993).
In contrast, protein concentration of the root exudates was only detected
after 14 and 28 days of plant growth. At 28 days, in Camarosa it was
determined the maximum value (0.030 mg.ml-1), followed by the variety
Milsei (0.024 mg.ml-1) and finally the variety Selva with a concentration of
0.019 mg.ml-1. The minimum detected value was 0.018 mg.ml-1 in the variety
Selva, then Milsei with 0.024 mg.ml-1 and finally Camarosa (0.025 mg.ml-
1
), all determined at 14 days of plant growth.
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Figura 2: (a) Single pure A.brasilense colony grown on NFb solid medium
observed by TEM. (b) Enlargement of framed area in (a) showing the fibrillar-
like material on top of bacterial cells.
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Figura 5: (a) SEM of bacteria colonizing inner structures of strawberry stolon; note
bacterial cells gathered on groups in the stolon vascular zone; (b) stolon of
strawberry plants without bacterial inoculation.
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Conclusions
Root exudates from different varieties of strawberry plants can produce
positive chemotaxis of different strains of A. brasilense. This effect was greater
with endophytic strains than with those that colonize the root surface. Similar
results were observed by Bacilio-Jimnez et al. (2003) about the chemostatic
response of endophytic and rhizosphere bacteria toward root exudates in rice.
In the case of strawberry, the chemotactic behaviour of different strains
of A. brasilense towards strawberry root exudates depends on the plant variety,
where the best chemostactic response was obtained with exudates of the
variety Camarosa. However, differences in responses may be due to the origin
of the bacterial strains (rhizosphere or endophytic). Furthermore, the specificity
of strains probably reflects the adaptation of the bacterium to the nutritional
conditions provided by the plant and can, thus, play an important role in the
establishment of Azospirillum in the rhizosphere of the host, as previously
indicated by Reinhold et al. (1985).
The concentration of strawberry root exudates can affect chemotactic
response, as the best response was observed when using a low concentration.
This agrees with other studies regarding the ability of Azospirillum to detect
potential sources of nutrients at lower concentrations than other soil
microorganisms, favouring its survival in natural environments (Chet, Mitchell
1976; Roszak, Colwell 1987). In addition, the time elapsed in the root exudates
production has effects on chemotaxis as a major chemotactic response was
observed towards the exudates produced within the first two weeks of plant
growth.
Root exudates obtained from strawberry plants cultured in hydroponic
conditions showed a decreased concentration of carbohydrates with the
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Asociacin entre Azospirillum brasilense y plantas de frutilla (Fragaria ananassa): quimiotxis y colonizacin radicular
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214
Captulo 12
Etileno como mediador de los mecanismos
directos e indirectos de la promocin del
crecimiento vegetal ejercido por rizobacterias
Ethylene as a mediator of direct and indirect
mechanisms carried out by plant growth promoting
rhizobacteria
Claudia M. Ribaudo1, Daniela S. Riva1, Jos A. Cur1, Clara Ponds2,
Antonio Granell-Richart2, Mara L. Cantore1
1
Ctedra de Bioqumica, Facultad de Agronoma, UBA. Av San Martn 4453. DSE1417. C.A.B.A.
2
Instituto de Biologa Molecular y Celular de Plantas, CSIC, Valencia, Espaa.
E-mail: [email protected]
Introduccin
Bacterias promotoras del crecimiento vegetal
Las bacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPB) son un grupo de
bacterias que interactan con las plantas favoreciendo su crecimiento y/o
controlando los fitopatgenos que puedan infectarlas aumentando as la
productividad vegetal. El grupo ms estudiado son las rizobacterias promotoras
del crecimiento de plantas (PGPRs). Entre los microorganismos con actividad
PGPR ms conocidos se encuentran especies de los gneros Rhizobium,
Pseudomonas y Azospirillum (Glick 1995). Los mecanismos que utilizan estas
bacterias para promover el crecimiento de las plantas son numerosos y
variados, y no solo difieren de un microorganismo a otro sino que tambin
pueden diferir de una cepa a otra. A diferencia de Rhizobium, donde la principal
contribucin de la bacteria al crecimiento de la planta parece ser la fijacin de
nitrgeno por la bacteria, las PGPRs de vida libre probablemente no cuentan
con un solo mecanismo para promover el crecimiento de la planta. Se postula
que en la mayora de los casos opera ms de un mecanismo, y que los efectos
en las plantas tratadas son aditivos (Bashan, Dubrovsky 1996). Los mecanismos
directos de la promocin del crecimiento son los que se encuentran en juego
cuando los metabolitos producidos por algunas cepas son utilizados como
reguladores de crecimiento o precursores de stos por parte de la planta. Son
ejemplos de estos mecanismos la fijacin biolgica de nitrgeno por Azospirillum
en asociacin con plantas de maz y de trigo (Ribaudo et al. 2001); asimilacin
215
Claudia M. Ribaudo, Daniela S. Riva, Jos A. Cur, Lic.Clara Ponds, Lic.Antonio Granell-Richart y Mara L. Cantore
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Etileno como mediador de los mecanismos directos e indirectos de la promocin
del crecimiento vegetal ejercido por rizobacterias
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Claudia M. Ribaudo, Daniela S. Riva, Jos A. Cur, Lic.Clara Ponds, Lic.Antonio Granell-Richart y Mara L. Cantore
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Etileno como mediador de los mecanismos directos e indirectos de la promocin
del crecimiento vegetal ejercido por rizobacterias
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Claudia M. Ribaudo, Daniela S. Riva, Jos A. Cur, Lic.Clara Ponds, Lic.Antonio Granell-Richart y Mara L. Cantore
Figura 1: Esquema del sendero de transduccin que media la seal del ET.
Modificado de Yoo et al. 2009, Trends in Plant Science 14: 270-279.
220
Etileno como mediador de los mecanismos directos e indirectos de la promocin
del crecimiento vegetal ejercido por rizobacterias
arroz a tres especies bacterianas de las que por las cuales se conoce su
capacidad promotora del crecimiento de plantas de maz y arroz fue asignada
fundamentalmente a la capacidad que las PGPRs poseen de fijar el nitrgeno
atmosfrico (FBN) y hacerlo disponible para los cultivos (Ribaudo et al. 2000;
Ribaudo et al. 2001; Cur et al. 2005; Ribaudo et al. 2006 a, Curzi et al. 2008).
Sin embargo no es el nico mecanismo ejercido por las mismas. El efecto
hormonal ejercido por las bacterias como se describi anteriormente se
debe a la accin de AIA, GAs, ABA, y ET entre otras. Como ya se mencion, el ET
tiene un rol preponderante como mediador y coordinador de las seales
internas y externas que modulan la dinmica del crecimiento y los programas
de desarrollo en las plantas (Santner, Estelle 2009). Tambin juega un papel
importante en la sealizacin que media algunas interacciones planta/bacteria
como la formacin de ndulos en la simbiosis rizobio/leguminosa (Penmetsa,
Cook 1997) y en el modelo de estudio Arabidopsis Pseudomonas sp., o en la
defensa frente a patgenos. Partiendo de la base de que gran parte del control
de los eventos mediados por una hormona ocurre a nivel de su sntesis la
medicin de la cantidad de ET producida por las plantas en respuesta a la
inoculacin es un buen parmetro del efecto ejercido por estas sobre los
cultivos. A. irakense, A. brasilense y Herbaspirillum seropedicae resultan en el
establecimiento de una relacin beneficiosa para las plntulas de arroz. Estas
PGPRs promueven muy tempranamente un aumento en los niveles de ET,
que se hace francamente evidente a las 24 h, se mantiene hasta las 72 h
despus de la inoculacin y luego disminuye (Ribaudo et al.,2000). Como era
esperable esta respuesta no fue igual en las tres asociaciones estudiadas. En
el caso de A. irakense los resultados fueron concluyentes ya que solo las
mediciones de 24 horas indicaron diferencias estadsticamente significativas.
En cambio la inoculacin con A. brasilense result en los mayores incrementos
significativos a las 48 y 72 horas (entre 4 y 5 veces) seguido de H. seropedicae.
Este aumento en el nivel de la hormona coincidi con un aumento en la
actividad y en la expresin de ACS (Curzi et al., 2008). La familia ACS en arroz
comprende a seis miembros OsACS1-6 cuya regulacin transcripcional depende
de varios factores ambientales, tales como la hipoxia o de los niveles de
hormonas, por ejemplo OsACS1 y OsACS3, cuyos mensajeros son inducidos
por hipoxia y por anaerobiosis en tejido areo y en races respectivamente.
OsACS1, OsACS3 y OsACS2 son inducidos por auxinas y este aumento se
acompaa por un aumento en la liberacin de ET. Los aumentos registrados
en la expresin de OsACS en plantas de arroz inoculadas con H. seropedicae y
A. brasilense indican, en ambos casos, un aumento de entre 50 y 60% en la
cantidad de mensajero para OsACS1. La amplificacin con los cebadores para
OsACS3 no indicaron diferencia en la expresin de este gen (Ribaudo,
comunicacin personal).
Tomados en conjunto los resultados de expresin (tanto a nivel de protena
como de mensajero de ACS) los de actividad enzimtica y los de niveles de ET
sugieren fuertemente que la inoculacin con H. seropedicae y A. brasilense
promueve una activacin del sendero biosinttico de la hormona en la planta
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Etileno como mediador de los mecanismos directos e indirectos de la promocin
del crecimiento vegetal ejercido por rizobacterias
defensiva de la planta (Ciardi et al. 2000; Nukui et al. 2004). Por lo tanto, el
aumento especfico del receptor ER1 en la infeccin disminuira la sensibilidad
al ET y por lo tanto la defensa de la planta frente a la colonizacin. De estos
resultados se puede concluir por un lado, que la inoculacin no gatilla una
respuesta general sobre los receptores de ET y por otro que ER1, ERF1 y ERF2
podran participar en cascadas de transduccin alternativas, todas mediadas
por ET, con la capacidad de discriminar entre los dos tipos de asociaciones
(beneficiosas y patgenas). Es importante sealar que de la comparacin de
secuencias de los dos factores de transcripcin con las del banco de datos del
NCBI surge que las secuencias con mayor identidad (98% para ScERF1 y 85%
para ScERF2) corresponden a dos ERFs de arroz.
Los transcriptos de numerosas protenas relacionadas con la patognesis
(PRs) se acumulan rpidamente en muchas especies de plantas despus de
minutos u horas de la infeccin con hongos, bacterias o virus o de ataques por
insectos. Las PRs son de naturaleza muy variada y se han agrupado en 17
familias (PR1 a PR17). Tambin su localizacin celular es variada: se las ha
encontrado en los fluidos xilemticos, lo que sugiere que habra una secrecin
hacia el sistema de transporte, pero otras tienen una localizacin
citoplasmtica. Algunas pueden aparecer solo en el rgano en que se dio la
infeccin. Los senderos de transduccin de seales mediados por SA, JA y ET
regulan la activacin transcripcional de numerosos genes PR. Algunas de estas
protenas son quitinasas (PRs 3, 4, 8 y 11) y glucanasas (PR2) que degradan
polisacridos estructurales de las paredes de los hongos perturbando as su
proliferacin. Algunos miembros de la familia PR8 tienen actividad de lisozima
que limita el crecimiento de las bacterias.
A. brasilense puede limitar el crecimiento de bacterias no patognicas (Romero
et al. 2003). La capacidad de biocontrol estara relacionada con la produccin de
bacteriocinas, de siderforos y la sntesis de cido fenilactico con actividad
antimicrobiana (Somers et al. 2005). Adems hay evidencias que sealan la
induccin de una respuesta sistmica de defensa en plantas de tomate inoculadas
con A. brasilense (Ribaudo et al. 2010). El anlisis transcriptmico de la respuesta
sistmica de tomate a la inoculacin con A. brasilense Cd ponen de manifiesto un
gran nmero de genes que cambian su expresin en forma diferencial debido a la
inoculacin. Tomados en conjunto los resultados indican que la inoculacin de
tomate con A. brasilense modul la expresin de un nmero importante de genes
involucrados en la regulacin de diferentes aspectos fisiolgicos de la planta. Los
ms interesantes para nuestros objetivos son los relacionados con el metabolismo
y la defensa. Entre estos ltimos varias PRs (como PR1, PR2, PR5) algunas de las
cuales responden a ET aparecen tempranamente sobrexpresadas en plantas
inoculadas a los 7 das posteriores a la inoculacin y se mantienen en este estado
hasta los 14 das posteriores a la inoculacin. Esto est en concordancia por lo
sealado por Wang et al., 2005, en plantas de A. thaliana inoculada por la
rizobacteria Pseudomonas fluorescens FPT 9601. Varios factores de transcripcin
como los de la familia WRKY, bZIP o ERF que responden a JA/ET se han encontrado
231
Claudia M. Ribaudo, Daniela S. Riva, Jos A. Cur, Lic.Clara Ponds, Lic.Antonio Granell-Richart y Mara L. Cantore
232
Etileno como mediador de los mecanismos directos e indirectos de la promocin
del crecimiento vegetal ejercido por rizobacterias
Conclusiones
Es muy poco lo que se conoce acerca de los genes que median el
reconocimiento y la asociacin efectiva de A. brasilense con plantas de inters
agronmico. Gran parte de los estudios de expresin gnica global en respuesta
a la inoculacin con PGPRs han sido llevados a cabo utilizando como modelo
A. thaliana debido a que los senderos de defensa en esta planta han sido muy
estudiados. Es importante destacar que nuestros trabajos ms recientes se
llevaron a cabo utilizando plantas de tomate que tienen una importancia
econmica relevante como fuente de alimento y los patgenos utilizados para
evaluar su potencial capacidad de biocontrol son causantes de enfermedades
que, debido a las prcticas habituales de cultivo, tienen una alta incidencia en
el rendimiento econmico. El ET tiene un rol importante en este sistema A.
brasilense-tomate, tanto desde la promocin directa del crecimiento como
desde la induccin de una respuesta defensiva en la planta que en algunos
casos result ser efectiva an despus de 60 das de la inoculacin (Riva, 2009).
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240
Captulo 13
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que
contienen complejas comunidades
microbianas
Beyond seed treatments: evolution of PGPR products
containing complex microbial communities
Joseph W. Kloepper1, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena, Katheryn
S. Lawrence
Department of Entomology and Plant Pathology, 209 Life Science Building, Auburn University,
Auburn AL 36849 USA. 1Corresponding author. E-mail: [email protected]
Introduction
Various groups of microorganisms have been investigated for their capacity to
improve plant growth or reduce plant disease. Plant growth-promoting rhizobacteria
(PGPR) are beneficial root-colonizing bacteria that elicit increased plant growth or
reduced damage due to plant diseases. These benefits that result from inoculation
of seeds or plant parts with PGPR are due both to production of bacterial metabolites
such as plant growth regulators and antibiotics that alter the plant or the native
rhizosphere community. In addition, some PGPR alter the host plants physiology in
a way that induces resistance to diseases (Kloepper et al. 2004b) and stress (Yang
et al. 2009). Several reviews (de Bashan 2010; Kloepper et al. 2004b; Persello-
Cartieaux et al. 2003; Vissey 2003) summarize the theoretical basis of PGPR, their
mechanisms of action, and efficacy in greenhouse and field trials.
Early applications of PGPR focused on their use as biological control
agents more than growth promotion. Recently with the growing global concern
about reducing fertilizer run-off and contamination of surface and ground
waters, there is a renewed interest in growth promotion. The goal is to select
PGPR that increase root growth; because an increased root system will enable
the plant to enhance the uptake of applied fertilizers while reducing
application rates (Adesemoye et al. 2009). This use of PGPR to raise nutrient
uptake is termed integrated nutrient management (Adesemoye et al. 2008)
and is a common current aim in many countries.
Over the past decade, there has been a proliferation in PGPR-based products
in the United States. The majority of these products contain a single purified
241
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena, Katheryn S. Lawrence
strain of PGPR applied as a seed treatment. Seed treatments have been the
preferred delivery system in the U.S. partly due to integration of agricultural
inputs into the seed. Growers tend to prefer purchasing inputs from a single
source, such as the seed supplier, rather than purchasing multiple inputs from
various sources. Hence, companies developing microbial inoculants have
focused on seed treatment. A decision to limit the delivery system to a seed
treatment has profound implications and limitations for which kinds of PGPR
can be developed. For example, many strains of Pseudomonas are active as
PGPR, however, they cannot be formulated as seed treatments. This is because
the sales and distribution network of seeds requires that a bacterial seed
treatment remain viable for 12-18 months and that it be compatible with seed
treatment chemicals such as fungicides and insecticides which are also
stacked onto seeds. This requirement means that for all practical purposes,
only spore-forming PGPR, such as Bacillus spp. or Streptomyces spp. can be
formulated as seed treatments. Examples of such PGPR that have been registered
by the U.S. Environmental Protection Agency and that are sold as seed treatment
products include Bacillus pumilus strain INR-7 (Hu et al. 2003; Kloepper et al.
2004b), Bacillus subtilis strain GB03 (Brannen, Backman 1993 and 1994; Hammon,
Berrada 2001; Koepper et al. 2004a; Turner, Backman 1991), and Bacillus subtilis
strain MBI 600 (Bennett et al. 2003; Kumar et al. 2009; Rossall, McKnight 1991).
Applying PGPR as seed treatments has been a successful approach for the
products that are currently registered. However, as stated above, the PGPR
which can be used as seed treatments are limited. In addition, seed treatments
are obviously only applied once per year, thereby eliminating the potential to
apply additional dosages, commonly referred to as boosters, of PGPR during
the growing season. Also, many research studies demonstrate that a combination
of the living cells of PGPR and their metabolic products produced by fermentation
can have more consistent or stronger beneficial effects on plants than
application of only spores of the PGPR. Hence, there have been many attempts
to produce PGPR products that are not limited to seed treatments.
Our aim in this manuscript is to present the evolution of products containing
a common core consortium of PGPR strains which have recently been blended
into a thixotropic formulation. This is done by presenting results of studies done
at Auburn University over a 10 year period with various previous formulations of
the main bacterial mixture currently used in the evolved thixotropic formulation.
This formulation represents a new advancement in application of PGPR, since it
allows PGPR to be applied multiple times during the growing season.
Methods
Description and origin of PGPR-based products tested
Beginning in 2002, tests at Auburn were conducted with an evolving group
of products, all of which contained a core group of 50 PGPR strains which
242
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
243
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
water. Controls consisted of seeds that received 0.3 ml of water. In the second
bioassay, cucumber cultivar Diva seeds were planted in 128 Speedling trays,
and each seed received 0.5 ml of the same stock suspension of Equity; controls
received 0.5 ml water. After 21 days of growth in the greenhouse, 10 replicate
plants per treatment were removed from trays, washed, blotted dry, and the
fresh weight of the entire plant, roots, and shoots were recorded. Data were
analyzed using ANOVA in JMP (SAS, Cary North Carolina) with comparison of
treatment means using LSD at P < 0.05.
Equity test 2 used the routine tomato bioassay described above to
assess growth promotion potential of Equity at several stages of a
production run. The treatments were Equity sampled at the beginning,
middle, and end of the production as well as a mixture of the final product.
Stock suspensions of each treatment were prepared and applied to seeds
as described above. The control received the same volume of water on
each seed. In addition to the data collected in Equity test 2. the R/S ratio
(root/shoot ratio) was calculated by dividing the mean weight of roots by
the mean weight of shoots for each treatment. R/S ratios are important in
the transplanted vegetable industry as a way of insuring that transplants
have sufficient root systems to minimize transplant shock. Data were
analyzed as in Equity test 1.
Five field trials were also conducted with Equity to determine if increased
root system development that was noted in bioassays with Equity would result
in reduced severity of root-knot nematode (Meloidogyne incognita). Trial 1 in
2001 was at the North Alabama Horticultural Research Center of the Alabama
Agricultural Experiment Station in Cullman, Alabama. Trial 2 in 2002 was at
the Sand Mountain Research and Education Center in Crossville, Alabama.
Each of the selected fields had infestations of root-knot nematodes in the
year prior to the test. Each trial consisted of 6 replicate plots of Equity and a
water control, with each plot containing 10 transplanted tomato plants. At
the time of transplanting, Equity was applied at a rate of 37 L/ha (1 gallon/
acre). Root systems of 36 plants in 2001 and 54 in 2002 were sampled after
harvest from within 6 replicate blocks of each treatment and rated for gall
severity using a 0 10 scale, where 10 is most severe according to the
procedure described by Zeck (1971). Means were analyzed using the paired t- test
with calculation of LSD at P < 0.05 from the calculated t-value. The number of
plants that received each rating (0 10) was recorded to examine frequency
of severe gall ratings.
In 2003, trials 3, 4 and 5 were conducted at the Cullman Research Center.
These trials were part of a sustainable agriculture test, and hence, they differed
in aspects of the cover crop or tillage used. Trials 3 and 4 were in fields that
had a mixture of three cover crops the winter preceding the test; in trial 3,
tomato plants were transplanted using a mechanical no-till transplanter; in
trial 4, tomato plants were transplanted using strip-tillage. Trial 5 was in a
field that had no cover crops and was cultivated with raised beds covered
244
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
with polyethylene tarp. There were 6 replicate plots, each with 10 plants. At
the time of transplanting, Equity was applied at a rate of 2 quarts/acre (18.5
L/ha) half the rate of the initial trials in 2001 and 2002. Plants were sampled
and rated, and data were analyzed as in the initial trials.
245
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
246
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
247
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
were washed and weighed to determine whole seedling and root weights.
Then, using WinRhizo analysis, the mean total root length, surface area, and
number of root tips were determined as measurements of root architecture.
Restore tests 3-5 were biological control assays of the PGPR applications against
three soilborne pathogens: Pythium ultimum (test 3), Pythium aphanirdermatum
(test 4), and Rhizoctonia solani (test 5). Pathogens were applied at the time of planting
by pipetting 5 ml of inoculum over the cucumber seeds before covering. Inoculum
was prepared by growing cultures on corn meal agar (Pythium sp.) or potato dextrose
agar (R. solani for 5 days and then homogenizing agar from 4 plates in 400 ml sterile
water. All of the pathogens can cause both pre- and post-emergence damping off
and stunting of plant growth. Hence, data were collected on emergence at 5 DAP,
final stand of healthy seedlings at 14 DAP, and disease incidence calculated as the
number of missing, dead, or wilted seedlings at 20 DAP.
Results
Tests with Equity
In Equity test 1, both the freshly prepared batch of Equity and the one-
year-old batch increased (P = 0.05) the total plant weight, root weight, and
shoot weight of tomato and cucumber, compared to the control in (Table 1).
On tomato, the one-year-old batch of Equity induced a 45% increase in root
weight, and on cucumber, the corresponding increase in root weight was 48%.
Table 1.
Promotion of tomato and cucumber plant growth with a new and 1-yr old
batch of Equity.a
a
Tomato seeds were planted in a 248 Speedling tray with Promix soilless medium.
Equity was applied by adding to each seed 0.3 ml of a stock suspension of 33 ml Equity
in 1.0 liter of water. Cucumber seeds were planted in a 128 Speedling tray using 0.5 ml
of the same stock suspension of Equity. Ten replicate plants of each treatment were
assessed 21 days after planting.
b
Equity new indicates a fresh batch of Equity from the manufacturer.
c
Equity 1-yr indicates Equity that was stored at room temperature one year after
manufacturing.
* Indicates significant increase relative to the control at P < 0.05.
248
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
Equity test 2 was a typical quality control bioassay testing the growth-
promoting potential of samples of Equity taken at various times during the
production run. Results (Table 2) indicate that all samples of Equity increased
(P < 0.05) total plant weight, root weight, shoot weight, and the R/S ratio,
compared to the water treated control.
Table 2.
Quality control bioassay for growth promotion of tomato with Equity. a
a
Tomato seeds were planted in a 248 Speedling tray with Promix soilless medium.
Equity was applied by adding to each seed 0.3 ml of a stock suspension of 33 ml Equity
in 1.0 liter of water. Ten replicate plants of each treatment were assessed 21 days after
planting.
b
Treatments represent samples taken at various stages of the preparation of the
product. Start of run is at the beginning of the mixing, middle of run is half-way through
the mixing, end of run is near the final mixing, and mixed final product is a sample from
the final mixing.
* Indicates significant increase relative to the control at P = 0.05.
Results of 5 field trials demonstrated that the PGPR mixture in Equity can
reduce damage from root-knot nematodes. In trial 1, the nematode pressure
gall rating of the control was relatively low, and Equity reduced (P < 0.01)
the mean gall rating of the control from 2.2 to 0.7. In trial 2 where nematode
pressure was higher, Equity reduced (P = 0.01) the mean gall rating of the
control from 4.1 to 2.3. In addition to lowering the mean gall rating, treatment
with Equity resulted in a marked change in frequency of gall ratings. In trial 1
(Figure 1), 92% of the plants sampled from the Equity treatment had a gall
rating of 0 or 1, while 69% of the control plants had a gall rating of 2 or 3. In
trial 2 (Figure 2), this same trend was noted; 51% of the plants sampled from
the Equity treatment had a gall rating of 1 or 2, while only 18% of control
plants had a rating of 1 or 2, and 27% of control plants had a rating of 5 8.
Reductions (P = 0.05) in gall ratings also occurred with Equity in all three tests
conducted in 2003 (Table 3). The nematode pressure in trials 3, 4, and 5 was similar to
that in trial 2, with mean gall ratings of the controls ranging from 3.64 to 4.11. In each of
the field trials, the following observation was made: Equity-treated plants produced
new roots after nematode infection while control plants generally did not (Figure 3).
249
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
250
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
Table 3.
Reduction in severity of root-knot nematode galls on tomato treated with
Equity in three field trials in 2003.
a
Root systems of 36 plants sampled from within 6 replicate blocks of each treatment
were dug after harvest and rated for gall severity using a 0 10 scale (Zeck 1971),
where 10 is most severe.
* Indicates significant increase relative to the control at P < 0.05.
251
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
Table 4.
Promotion of tomato and pepper seedling growth with Naturize Potted
Plant Food containing PGPR (experiment Naturize 1).
a
NPPF = Naturize Potted Plant Food
b
R/S is the root/shoot ratio.
c
ND indicates that the value was not determined.
* Indicates significant increase relative to the control at P < 0.05.
252
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
Table 5.
Growth promotion of tomato and pepper transplants with Naturize
Potted Plant Food containing PGPR (experiment Naturize 2).
a
NPPF = Naturize Potted Plant Food.
* Indicates significant increase relative to the control at P < 0.05.
253
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
rates of PGA. This increased plant growth continued through 35 days after planting,
when all three PGPR concentrations also increased total plant, shoot, and root
weights. At 48 days after planting, plants that received all concentrations of PGA
had enhanced (P = 0.05) photosynthetic capacity, as indicated by chlorophyll
content and leaf area (Table 6B). Quality of flowers, as measured by stem length
and flower diameter, were also generally greater with PGA-treated plants.
Table 6A.
Effects of PGA on sunflower seedling growth (experiment PGA-1).
Table 6B.
Effects of PGA on photosynthetic capacity and quality of sunflower 48 days
after planting (experiment PGA-1).
254
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
the subsequent sampling times (10, 14, and 30 days after planting) PGA-treated
plants had higher shoot and root weights than control plants. Significant (P = 0.05)
changes in root architecture on PGA-treated plants were also evident as early as 6
days after planting, when root surface area, root length, length of fine roots (those
with a diameter of 0 0.5 mm), and number of root tips were greater than on
control plants. At 30 days after planting, significant increases existed in all measured
parameters of root architecture on PGA-treated plants except root volume.
Table 7.
Effects of PGA on tomato seedling growth and root architecture (experiment PGA-2).
255
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
Table 8.
Effects of Restore applications on cucumber seedling growth and root
architecture (Restore test 2).
* Indicates significant difference from the control value of the same column at P < 0.05.
256
Ms all del tratamiento a las semillas:
Evolucin de productos basados en PGPRs que contienen complejas comunidades microbianas
Table 9.
Biological control activity of Restore against soilborne pathogens on
cucumber (Restore tests 3-5).
Discussion
The results presented here demonstrating plant growth promotion and
biological control with Restore (the thixotopic formulation of PGPR from
Pathway Holdings) and earlier product formulations of the same core bacterial
consortium (Equity, Naturize Potted Plant Food, and PGA) are in agreement
with results from several published studies with two of the earlier products.
For example, two publications have reported effects of Equity. In the first study,
Equity was reported to increase plant growth and to reduce salt uptake of
squash plants growing under conditions of salinity stress (Yildirim et al.
2006). In another study with root-knot nematode (Meloidogyne incognita) on
tomato, treatment with Equity induced significant reductions in nematode
eggs per gram root, juvenile nematodes in soil, and galls per plant (Burkett-
Cadena et al. 2008).
257
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
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259
Joseph W. Kloepper, Juan David Castillo, Marleny Burkett-Cadena y Katheryn S. Lawrence
260
Captulo 14
Bacterias promotoras de crecimiento vegetal
como componentes en el mejoramiento
ambiental
Plant growth-promoting bacteria as a component for
environmental improvement
Luz E. de-Bashan, Juan-Pablo Hernndez y Yoav Bashan
Grupo de Microbiologa Ambiental, Centro de Investigaciones Biolgicas del Noroeste
(CIBNOR), Mar Bermejo 195, Col. Playa Palo de Santa Rita, La Paz, B.C.S. 23090, Mxico, The
Bashan Foundation, 3740 NW Harrison Blvd., Corvallis, Oregon 97330, USA.
E-mail: [email protected]
Introduccion
Las Bacterias Promotoras de Crecimiento Vegetal [PBPB por sus siglas en
ingles Plant Growth Promoting Bacteria Bashan (Holguin 1998) o PGPR, Plant
Growth Promoting Rhizobacteria (Kloepper et al. 1980) en este capitulo nos
referiremos a estas como PGPB, trmino aceptado internacionalmente], son
bacterias aisladas de diversos ambientes con la habilidad potencial de afectar
de manera positiva el crecimiento de las plantas. La inoculacin con PGPB/
PGPR es una prctica agrcola comn que ha ido en aumento en aos recientes
(Bashan 1998; Diaz-Zorita, Fernandez-Canigia 2009). Las PGPB afectan a las
plantas mediante una multitud de mecanismos diferentes y existen en la
literatura revisiones extensivas que los describen (Lucy et al. 2004; Bashan, de-
Bashan 2005, 2010; Lugtenberg, Kamilova 2009). Probablemente algunos de
ellos son vlidos para las PGPB empleadas en los estudios ambientales, por
tal motivo, este capitulo no se centrara en la discusin de tales mecanismos.
Es bien conocido que existe un continuo descenso en la calidad ambiental
en todo el planeta debido a actividades humanas, principalmente
deforestacin y liberacin desmedida de contaminantes, tales como metales
pesados, y exceso de nutrientes (N y P) al ambiente. La opcin de retirar y
trasladar los contaminantes a rellenos sanitarios es costosa y con frecuencia
poco practica, debido principalmente a la cantidad de suelo involucrado,
como sucede en los desechos mineros, y al aumento constante de los sitios
contaminados. De esta manera, es importante encontrar opciones
biotecnolgicas de remediacin de bajo costo. Una de las estrategias
261
Luz E. de-Bashan, M.C. Juan-Pablo Hernndez, Yoav Bashan
262
Bacterias promotoras de crecimiento vegetal comocomponentesenelmejoramientoambiental
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Bacterias promotoras de crecimiento vegetal comocomponentesenelmejoramientoambiental
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266
Bacterias promotoras de crecimiento vegetal comocomponentesenelmejoramientoambiental
a. Fitodegradacin
La poblacin microbiana de la rizsfera de algunas plantas puede contar
con especies capaces de degradar xenobiticos (Donnelly et al. 1994; Mackov
et al. 2007; Mendez, Maier 2008) y puede servir como promotora de
crecimiento cuando las plantas crecen en estos suelos contaminados. En un
suelo contaminado artificialmente con creosote, la inoculacin con bacterias
degradadoras de hidrocarburos aromticos policclicos (HAP) y PGPB
(Pseudomonas putida, Azospirillum brasilense y Enterobacter cloacae) aument
la velocidad de eliminacin de los HAP en presencia de las PGPB, debido
posiblemente a que estas son capaces de mitigar el estrs en plantas por la
actividad de la ACC-deaminasa, un mecanismo comn en este tipo de bacterias
(Huang et al. 2004). Adicionalmente, las PGPB Pseudomonas spp. mejoraron
el crecimiento de canola en presencia de cobre o HAP (Reed, Glick 2005; Reed
et al. 2005). Las PGPB tambin participaron en la degradacin de cido 2-
clorobenzoico y petrleo en suelos donde crece Vicia faba (Radwan et al.
2005). Un plsmido fue transferido de Burkholderia cepacia a una cepa de
PGPB endfita de esta planta para proteger el nuevo husped contra la
toxicidad de tolueno y reducir su evaporacin (Barac et al. 2004; Glick 2004).
b. Fitoextraccin
En la fitoextraccin (conocida tambin como fitoacumulacin) las plantas
eliminan los contaminantes del ambiente concentrndolos en su biomasa
267
Luz E. de-Bashan, M.C. Juan-Pablo Hernndez, Yoav Bashan
268
Bacterias promotoras de crecimiento vegetal comocomponentesenelmejoramientoambiental
como tal, son fcilmente degradados por accin del viento y la lluvia,
convirtindose en una continua fuente de contaminacin por metales (Pilon-
Smits 2005). De esta manera, se ha propuesto la fitoestabilizacin usando
plantas nativas como una estrategia econmica para reducir estos riesgos
(McCutcheon, Schnoor 2003). Esta aproximacin involucra la creacin de
una cobertura vegetal sobre los desechos mineros que sea suficientemente
densa para prevenir su erosin. Un importante desafo es que algunos de
esos desechos mineros no sirven, en su estado natural, como sustrato para el
crecimiento de la mayora de las plantas, debido a su concentracin de metales
txicos, bajo pH, carencia de minerales esenciales, de arcillas y material
orgnica que pueda retener agua, de cualquier estructura de suelo, de un
banco de semillas de plantas nativas o la combinacin de todos estos
parmetros ambientales (Mendez, Maier 2008). De esta manera, los desechos
mineros pueden permanecer desprovistos de plantas por dcadas o en el mejor
de los casos, solo contar con una ligera cobertura vegetal (Gonzalez-Chavez et
al. 2008). Una solucin parcial puede ser la adicin de gran cantidad de
compost, bioslidos y agua (Ye et al. 2001; Chiu et al. 2006) de manera que se
restituyan las condiciones del suelo. Aunque posible, tales enmiendas son
costosas debido al gran volumen de estos desechos mineros y en algunos
casos a su remota localizacin. Ms aun, en zonas desrticas no existe un
suministro de agua constante y suficiente.
Se ha propuesto la inoculacin con PGPB y con hongos micorrzicos
arbusculares como una forma de ayudar a las plantas a establecerse en los
desechos mineros, y reducir la cantidad de compost necesaria para su
mejoramiento (Petrisor et al. 2004; Zhuang et al. 2007; Mendez, Maier 2008;
Sols-Domnguez et al. 2011). Existen dos aproximaciones en la bsqueda de
PGPB compatibles con los desechos mineros. Una es aislar bacterias nativas,
con capacidad de promover el crecimiento, directamente de los desechos
mineros o de las plantas que crezcan sobre estos, propagarlas y usarlas como
inoculantes. Este procedimiento aunque laborioso, ha sido probado de manera
exitosa (Grandlic et al. 2008, 2009). La premisa en esta aproximacin es que
las PGPB aisladas de los desechos mineros pueden ayudar a la planta a
sobrevivir y crecer a travs de varios mecanismos incluyendo el aumento en
disponibilidad de nutrientes, aumento en la resistencia a la toxicidad por
metales o la disminucin de la biodisponibilidad de metales txicos en la
rizsfera (Burd et al. 1998, 2000; Pishchik et al. 2002; Glick 2003; Belimov et
al. 2004; Reed, Glick, 2005; Reed et al. 2005; Vivas et al. 2006; Wu et al. 2006a;
Li et al. 2007; Rajkumar, Freitas 2008a, b). La aproximacin alternativa es
examinar muchas PGPB utilizadas en agricultura (Bashan, de-Bashan 2005)
que pudieran ayudar a las plantas a establecerse sobre estos desechos. Por
ejemplo, el gnero Bacillus, que se encuentra comnmente en varios tipos de
desechos mineros (Natarajan 1998; Vijayalakshmi, Raichur 2003; Wu et al.
2006b; Tsuruta 2007; Zhang et al. 2007), ejerce un efecto positivo en el
crecimiento de cultivos agrcolas, plantas silvestres, rboles y microalgas, a
travs de de diferentes mecanismos de promocin de crecimiento vegetal
269
Luz E. de-Bashan, M.C. Juan-Pablo Hernndez, Yoav Bashan
(Enebak et al. 1998; Vessey 2003; Kloepper et al. 2004 a,b; Ryu et al. 2005;
Hernandez et al. 2009). Otro gnero potencial es Azospirillum. La estimulacin
del crecimiento de races adventicias por A. brasilense no solo mejora la toma
de nutrientes, sino que tambin, como se expuso anteriormente, alivia el estrs
salino en diferentes plantas agrcolas (Creus et al. 1997; Bacilio et al. 2004;
Dimkpa et al. 2009). Este modo de accin fitoestimulatorio proporciona una
mayor rea superficial para la absorcin de nutrientes, una cualidad vital para
la sobrevivencia de las plantas en ambientes mineros altamente impactados y
con pocos nutrientes. De manera adicional, el aumento en la masa radicular
es deseable para la estabilizacin fsica de los desechos mineros contra la
erosin por viento y agua. Adems de la promocin de crecimiento y el
mejoramiento de la resistencia a estrs abitico, propiedades de que son
relevantes en su uso en desechos mineros, Azospirillum tambin ayuda a las
plantas a crecer en condiciones de bajo pH (Bashan 1999, de-Bashan et al.
2005) y metales pesados (Belimov, Dietz 2000).
Varios estudios han demostrado la factibilidad de utilizar PGPB de diferentes
fuentes en combinacin con compost. Algunos trabajos han mostrado que los
niveles ptimos de compost requeridos para el establecimiento de varias
especies de pastos y plantas en residuos mineros puede ser reducido por la
adicin de PGPB aisladas de residuos mineros adyacentes (Petrisor et al. 2004;
Zhuang et al. 2007; Gradlic et al. 2008). El reemplazar fertilizantes qumicos
por repetidas inoculaciones con Azotobacter chroococcum y Bacillus
megaterium mejor significativamente el crecimiento de plantas nativas y la
actividad microbiana en dos residuos mineros cidos (Petrisor et al. 2004).
Una serie de experimentos utilizando varios arbustos del desierto y rboles
demostr la capacidad de PGPB nativas y de origen agrcola para mejorar su
crecimiento en varios tipos de desechos mineros. Las PGPB aisladas de estos
desechos mineros, con capacidad de sobrevivir a pH cido y en concentraciones
altas de metales pesados (Mendez et al. 2008), junto con una moderada
cantidad de compost (Iverson, Maier 2009) aument significativamente la
biomasa del arbusto Atriplex lentiformis y del pasto Buchloe dactyloides. De
manera similar, como resultado de la inoculacin con la PGPB Bacillus pumilus
-aislada de races de cactus que crecen en rocas en ausencia de suelo (un
ambiente extremo para las plantas)- el crecimiento del arbusto Atriplex
lentiformis aumento significativamente, con un nivel de compost sub-optimo
(10% peso/peso comparado con el 15% normalmente requerido en estos
residuos mineros); adicionalmente, se vio un marcado efecto en la comunidad
bacteriana de desechos mineros tanto de tipo cido con alto contenido de
metales, como en residuos neutros con bajo contenido de metales (de-Bashan
et al. 2010a). La inoculacin con varias cepas de Azospirillum brasilense produjo
un efecto similar en el crecimiento de las plantas y en la comunidad bacteriana
en residuos cidos metalferos (de-Bashan et al. 2010 a,b). De manera similar,
la inoculacin de pasto bfalo con una mezcla de dos Arthrobacter spp. afect
a la comunidad bacteriana de la rizsfera despus de 75 das de crecimiento
(Grandlic et al. 2009). El efecto de la inoculacin sobre la comunidad bacteriana
270
Bacterias promotoras de crecimiento vegetal comocomponentesenelmejoramientoambiental
271
Luz E. de-Bashan, M.C. Juan-Pablo Hernndez, Yoav Bashan
272
Bacterias promotoras de crecimiento vegetal comocomponentesenelmejoramientoambiental
Conclusiones
Las bacterias promotoras de crecimiento vegetal pueden servir como
valiosos componentes en proyectos de biorremediacin de suelos, de agua,
de revegetacin y reforestacin de suelos degradados. Por si mismas, pocas
cepas pueden servir como biorremediadores directos al ser propagados en
grandes poblaciones. Sin embargo, su potencial aumenta al asociarse con
las plantas que son el principal componente en los procesos de remediacin.
273
Luz E. de-Bashan, M.C. Juan-Pablo Hernndez, Yoav Bashan
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Captulo 15
Diversidad funcional de comunidades
microbianas rizosfricas en suelos
expuestos a sustancias contaminantes
Functional diversity of rhizosphere microbial
communities in soils exposed to contaminants
Jhovana S. Escobar Ortega, Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria, Sebastian
M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
Ctedra de Microbiologa Agrcola - Facultad de Agronoma - Universidad de Buenos Aires.
Av. San Martn 4453 (1417) Buenos Aires. E-mail: [email protected]
Introduccin
La degradacin del suelo se produce cuando se acumulan en l sustancias
que alteran negativamente su funcionamiento (Garca, Dorrosoro 2000). La
FAO define la contaminacin como una forma de degradacin qumica que
provoca la prdida parcial o total de la productividad del suelo. Por otra parte,
el diccionario de la Real Academia define a la contaminacin como la alteracin
de la pureza de alimentos, agua, aire, etc. Entonces, se puede considerar
contaminante a cualquier sustancia que altera la pureza de un sistema, ya sea
porque su concentracin es mayor a la usual o porque la misma esta presente
pero no es natural del sistema.
Existen diferentes tipos de sustancias contaminantes que llegan de distintas
maneras al suelo. Entre las mismas se pueden mencionar el fenantreno, el
antraceno y otras sustancias comnmente utilizadas en la agricultura, como el
glifosato. Los dos primeros son hidrocarburos policclicos aromticos (PAHs-
por su sigla en ingles) de bajo peso molecular formados por tres anillos
bencnicos condensados (Corona, Iturbe 2005). La fuente de contaminacin
con PAHs se debe a los derrames o desechos de algunas actividades industriales,
as tambin a la utilizacin de combustibles fsiles y a la quema de bosques
(Dean et al. 2001; Corgi et al. 2004). Adems, se conoce que estos PAHs,
presentan un potencial cancergeno elevado (IARC 1983), una alta toxicidad,
poca solubilidad en agua ya que son liposolubles y son muy persistentes en el
ambiente (Schwartz et al. 2002; Corona, Iturbe 2005). Por su parte, el glifosato
(N-fosfonometilglicina, C3H8NO5P, CAS 1071-83-6) es un herbicida total no
selectivo de amplio espectro absorbido por las hojas y no por las races, utilizado
287
Jhovana S. Escobar Ortega, Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria, Sebastian M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
288
Diversidad funcional de comunidades microbianas rizosfricas en suelos expuestos a sustancias contaminantes
289
Jhovana S. Escobar Ortega, Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria, Sebastian M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
Materiales y metodos
Descripcin de los ensayos
Se realizaron dos ensayos, uno de ellos en condiciones de campo donde se
utiliz glifosato para el secado de cultivos de cobertura (ensayo con glifosato)
y el otro en condiciones controladas donde se contamin el suelo con
antraceno y fenantreno (ensayo con PAHS). El ensayo con glifosato se realiz
en el Establecimiento El Correntino, que est ubicado a 36 8 50.9" Latitud
Sur y 62 21 51.9" Longitud Oeste de la localidad de Treinta de Agosto,
provincia de Buenos Aires. El ensayo con PAHs se realiz en las instalaciones
de la FAUBA. El suelo de ambos ensayos est clasificado como un Hapludol
tpico. El diseo utilizado fue en bloques completos aleatorizados (DBCA),
con tres repeticiones para ambos ensayos.
En el ensayo con glifosato en la parcela principal se establecieron dos
niveles de fertilizacin: 0 y 46 Kg N ha-1 con urea (F) aplicado en el momento
de la siembra de los cultivos de cobertura (CC). En las subparcelas se
establecieron dos CC, centeno (Secale cereale var. Quehu) y avena (Avena
sativa var. Aurora) que fueron sembradas luego de la cosecha de soja, y un
testigo (barbecho invernal). En las sub-subparcelas se asignaron dos
momentos de secado con glifosato, que fueron: julio y septiembre segn
describen Escobar Ortega, et al. (2010).
Las muestras se extrajeron con un barreno con el que se tomaron suelo y
races (suelo rizosfrico). Se realizaron tres muestreos, antes del secado con
glifosato (AG), al mes del secado con glifosato (DG) y a la cosecha de soja (CS)
ya sea para el primer y el segundo momento de secado. La descripcin de los
tratamientos se detalla en la Tabla I.
Para el ensayo con PAHs realizado en condiciones controladas se utilizaron
macetas plsticas con capacidad de 250g. El suelo se homogeneiz mediante
290
Diversidad funcional de comunidades microbianas rizosfricas en suelos expuestos a sustancias contaminantes
Tabla I.
Tratamientos utilizados en el ensayo de glifosato para el primer momento
de secado (Julio) y segundo momento de secado (Septiembre).
Tabla II.
Descripcin de los tratamientos utilizados en el ensayo de PAHs.
291
Jhovana S. Escobar Ortega, Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria, Sebastian M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
292
Diversidad funcional de comunidades microbianas rizosfricas en suelos expuestos a sustancias contaminantes
Resultados
Para el ensayo con glifosato el anlisis de CP indica que la varianza total
explicada por ambos ejes fue del 70% cuando se analiza la interaccin entre el
momento de secado con glifosato y nivel de fertilizacin nitrogenada (Figura
1). El CP1 explic el 55% de la varianza total y el CP2 represent el 15% de la
varianza total.
En la Figura 1 se muestran las medias de los CP para el primer momento de
secado (julio) y el segundo momento de secado (septiembre) con glifosato.
En dicho anlisis se observa que para ambos momentos de secado, tanto el
CP1 como el CP2, no mostraron diferencias significativas entre la fisiologa de
las CMR para la variable fertilizacin. Comparado los dos momentos de secado
se observa que el CP2 mostr diferencias significativas para el perfil de uso de
fuentes carbonadas. Esto nos indica que en alguna medida las CMR fueron
distintas dado que los CC en Julio estaban en un estado ontognico distinto al
de septiembre. Una situacin similar se observ para las CMR en distintos
estadios ontognicos del cultivo de trigo (Naiman et al. 2009).
293
Jhovana S. Escobar Ortega, Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria, Sebastian M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
294
Diversidad funcional de comunidades microbianas rizosfricas en suelos expuestos a sustancias contaminantes
Figura 3. ndice de Shannon-Weaver (H) para los dos momentos de secado con
glifosato y los dos niveles de fertilizacin nitrogenada. Letras distintas indican
diferencias significativas entre tratamientos, mediante test de Tukey
(p<0,05).
295
Jhovana S. Escobar Ortega, Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria, Sebastian M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
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Jhovana S. Escobar Ortega, Luciana P. Di Salvo, Florencia DAuria, Sebastian M. Gatica, Ins E. Garca de Salamone
Sintesis y perspectivas
El presente trabajo present el impacto de dos sustancias diferentes
sobre la diversidad funcional de las comunidades microbianas rizosfricas.
De acuerdo a la definicin sealada en este trabajo se consider que
ambos tipos de compuestos evaluados son contaminantes. Tambin se
tuvo en cuenta que ambas sustancias poseen diferencias no slo en sus
caractersticas moleculares, sino tambin en la probabilidad de ingreso al
sistema suelo, y a la tasa de degradacin una vez presentes en ste. A
pesar de las diferencias que presentan ambos contaminantes, se encontr
que ambos generan diferencias en los PF de las CMR y en la diversidad
funcional de las mismas. En el caso del ensayo a campo donde se utiliz
glifosato para el secado de cultivos de cobertura, las diferencias en los
PF de las CMR fueron temporales. El anlisis de diversidad de Shannon
Weaver mostr que la aplicacin del fertilizante tuvo efecto entre los dos
momentos de secado. El segundo momento de secado mostr un efecto
temporario en el muestreo DG. En el ensayo que se llev a cabo en
condiciones controladas utilizando el Fenantreno y Antraceno para la
contaminacin de suelos, se pudo determinar que la presencia del
contaminante y de la planta genera diferencias en la fisiologa de las
CMR. Similares resultados se determinaron con los anlisis del ndice de
Diversidad de Shannon-Weaver.
El estudio que se realiz es un aporte que nos permite determinar la
medida en que las CMR nativas de los suelos son afectados por estos dos
tipos de contaminantes (fenantreno antraceno y glifosato) y a la vez es un
punto de inicio para seguir con una determinada estrategia de manejo o
remediacin en el caso de ser necesario.
Agradecimientos
A la empresa Sastre Inchauspe del establecimiento El Correntino y a
los Ing. Agr. Maximiliano Eiza, Patricia Carfagno y Roberto Michelena por
la colaboracin brindada en la instalacin y conduccin a campo del ensayo
de glifosato. Este cont con financiacin de la FAUBA (CO 12-64). El ensayo
con PAHs cont con la financiacin del proyecto PICT 08-15014/FONCYT
ANPCyT.
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305
306
Captulo 16
Acumulacin y tolerancia al metal pesado
cadmio en rizobios de vida libre y en
simbiosis con leguminosas
Accumulation and tolerance to heavy metal cadmium
in free-living rhizobia and in symbiosis with legumes
Stella Castro 1, Eliana Bianucci 1, Jsica Rivadeneira 1, Mara del Carmen
Tordable1, Adriana Fabra2, Juan Sobrino-Plata 3, Luis Hernndez3, Ramn
Carpena-Ruiz3
1
Departamento de Ciencias Naturales. Facultad de Ciencias Exactas, Fsico-Qumicas y Naturales.
Universidad Nacional de Ro Cuarto. Ruta 36 Km 601. 5800-Ro Cuarto, Crdoba, Argentina.
2
Departamento de Ciencias Naturales. Facultad de Ciencias Exactas, Fsico-Qumicas y
Naturales. Universidad Nacional de Ro Cuarto. Ruta 36 Km 601. 5800-Ro Cuarto, Crdoba,
Argentina. 3Laboratorio de Fisiologa Vegetal, Departamento de Biologa. Universidad
Autnoma de Madrid. Campus de Cantoblanco, 28049-Madrid, Espaa. 3Departamento de
Qumica Agrcola. Universidad Autnoma de Madrid. Campus de Cantoblanco, 28049-
Madrid, Espaa. E-mail: [email protected]
307
S. Castro, E. Bianucci, J. Rivadeneira, M.C. Tordable, A. Fabra, J. Sobrino-Plata, L. Hernndez, R. Carpena-Ruiz
308
Acumulacin y tolerancia al metal pesado cadmio en rizobios de vida libre y en simbiosis con leguminosas
del metal. Un dato relevante es que en el suelo persiste al menos el 80% del Cd
contenido como impurezas de los fertilizantes fosfatados aplicados
(Kponbleku, Tabatabai 1994).
Numerosos pases poseen legislaciones que regulan la aplicacin de
fertilizantes y su concentracin de Cd, y son muy rigurosos en cuanto a su
cumplimiento. Por ejemplo, en Dinamarca se ha desarrollado un modelo que
explica el ciclo del Cd que cuantifica las entradas y salidas del sistema
agrcola (Hovmand et al. 1983). Australia tiene programas de informacin a
agricultores en los que se tratan diversas estrategias para la disminucin de
las concentraciones de Cd en el ambiente, particularmente en el recurso
suelo (Mc Laughlin 2001). En Estados Unidos y Nueva Zelandia se han
desarrollado numerosas investigaciones para evaluar la concentracin de
este elemento en los fertilizantes y el efecto de su acumulacin en suelos y
plantas. Los estudios realizados indican que la aplicacin reiterada de
fertilizantes fosfatados incrementa las cantidades de Cd en el suelo, afectando
los cultivos (Bonomelli et al. 2003). En Argentina no existen reglamentaciones
que estipulen concentraciones mnimas permitidas de metales pesados en
los fertilizantes, lo cual constituye un grave problema a nivel ambiental y de
salud humana.
Las plantas tienen una tendencia natural a asimilar metales. Sin embargo,
la eficacia de su captacin es dependiente de su disponibilidad, la que a su
vez se relacionan con factores tales como pH, contenido de materia orgnica
en el suelo, entre otros (Greger 2004). Se ha informado que la concentracin
de Cd en plantas de la leguminosa lupino creciendo en suelos australianos
vara entre 0,01-0,08 mg kg-1, con algunas muestras que exceden el mximo
valor permitido de 0,05 mg kg-1 (NHMRC-Australia 1987; Petterson, Harris
1995). Asimismo, para la leguminosa man se encontr alta concentracin
de Cd en el tegumento y en el grano (0,67 mg kg-1; Bell et al. 1997). Es
importante destacar que, teniendo en cuenta que el fruto de la planta de
man es hipogeo la probabilidad de contaminacin con Cd aumenta
considerablemente.
La biorremediacin se comenz a utilizar en las ltimas dcadas para
contrarrestar los efectos de los contaminantes metlicos. Este proceso
ofrece la posibilidad de emplear microorganismos y plantas que posean
la propiedad de acumular o metabolizar metales pesados para la
recuperacin de suelos contaminados. Carpena et al. (2006) proponen
que en suelos contaminados con metales pesados el empleo de ciertas
leguminosas que se asocian simbiticamente con microorganismos
fijadores de nitrgeno es recomendable por su capacidad de acumular en
raz y ndulos gran parte del elemento absorbido y, adems, por ejercer
un efecto beneficioso mejorando la fertilidad del suelo y manteniendo la
poblacin microbiana.
309
S. Castro, E. Bianucci, J. Rivadeneira, M.C. Tordable, A. Fabra, J. Sobrino-Plata, L. Hernndez, R. Carpena-Ruiz
310
Acumulacin y tolerancia al metal pesado cadmio en rizobios de vida libre y en simbiosis con leguminosas
Por otra parte, las plantas han desarrollado distintas estrategias para
protegerse de la toxicidad del Cd. Estos mecanismos involucran a la raz
como primera barrera de defensa mediante la inmovilizacin de dicho metal
por pectinas o carbohidratos extracelulares, tales como el muclago y la
calosa de la pared celular, disminuyendo as el transporte del metal al interior
de la clula (Benavides et al. 2005). Otras estrategias de defensa al Cd son la
reduccin del transporte o el aumento del eflujo del Cd por transportadores
de cationes de la membrana plasmtica (Thomine et al. 2000), y el secuestro
del Cd intracelular, por cidos orgnicos, aminocidos, fitoquelatinas (PCs)
y su posterior compartimentalizacin en la vacuola para prevenir su toxicidad
(Clemens 2006).
Las PCs son polipptidos de composicin (gGlu-Cys)n-Gly, donde n=2-11,
y constituyen uno de los principales mecanismos de defensa frente a metales
pesados en plantas. Su sntesis se induce en presencia de Cd y tiene lugar a
partir del GSH por la enzima fitoquelatina sintasa (PCS). En la Figura 3 se
muestra la sntesis de GSH que ocurre en dos etapas dependientes de ATP: 1)
la cistena y el glutamato son combinados por medio de la enzima g-
glutamilcistena sintetasa para formar g-glutamilcistena (gEC), 2) la reaccin
de sntesis del GSH, catalizada por la enzima GSH sintetasa, combina la gEC
con glicina para generar el tripptido g-glutamilcistenilglicina (GSH).
Finalmente, la PCS cataliza la incorporacin de una unidad de gEC procedente
de una molcula de GSH (unida al sitio donador de la enzima) a otra
molcula de GSH o PC (unida al sitio aceptor de la enzima) en presencia
de Cd.
311
S. Castro, E. Bianucci, J. Rivadeneira, M.C. Tordable, A. Fabra, J. Sobrino-Plata, L. Hernndez, R. Carpena-Ruiz
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Acumulacin y tolerancia al metal pesado cadmio en rizobios de vida libre y en simbiosis con leguminosas
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S. Castro, E. Bianucci, J. Rivadeneira, M.C. Tordable, A. Fabra, J. Sobrino-Plata, L. Hernndez, R. Carpena-Ruiz
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Acumulacin y tolerancia al metal pesado cadmio en rizobios de vida libre y en simbiosis con leguminosas
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S. Castro, E. Bianucci, J. Rivadeneira, M.C. Tordable, A. Fabra, J. Sobrino-Plata, L. Hernndez, R. Carpena-Ruiz
Conclusiones
El incremento de la concentracin de metales en los suelos hasta niveles
txicos, por las actividades antropognicas, constituye actualmente un
importante problema ambiental. En este contexto, las plantas y los
microorganismos pueden ser tiles para desarrollar bioensayos con el objeto
de promover nuevos estndares para la monitorizacin de situaciones de riesgo
ambiental. Es por ello, que el conocimiento de la acumulacin y tolerancia al
Cd por los rizobios en vida libre y en simbiosis con plantas de leguminosas
pueden contribuir a mejorar el rendimiento de los cultivos en condiciones de
campo bajo situaciones de exceso de metal, a la vez que a limitar el paso del
metal a la cadena trfica. Particularmente, en la asociacin simbitica
Bradyrhizobium sp.-man, el rol del sistema antioxidante (glutatin y
fitoquelatinas) parece ser crucial en la estrategia de tolerancia al metal.
318
Acumulacin y tolerancia al metal pesado cadmio en rizobios de vida libre y en simbiosis con leguminosas
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Captulo 17
Micorrizorremediacin como alternativa
para la recuperacin de suelos contaminados
por actividades mineras
Myco-rhizoremediation as alternative for recovering soils
polluted by mining activities
Pablo Cornejo, Sebastin Meier, Csar Arriagada, Fernando Borie
1
Scientific and Technological Bioresource Nucleus, BIOREN-UFRO. Universidad de La
Frontera. Avda. Francisco Salazar 01145, Temuco, Chile. E-mail: [email protected].
Introduccin
Uno de los principales problemas a nivel mundial es la degradacin de
los recursos naturales, en particular la originada por actividades industriales,
en las cuales se genera un elevado volumen de desechos contaminantes.
Algunos de estos desechos resultan muy difciles de manejar, confinndolos
o mitigando su efecto deletreo sobre el medio ambiente, como sucede con
los metales pesados (MP). En general, se denominan as a los elementos cuya
densidad especfica es mayor a 5 g cm-3, y destacan entre otros mercurio (Hg),
cadmio (Cd), arsnico (As), cromo (Cr), talio (Tl) y plomo (Pb), adems de
otros elementos traza con actividad biolgica como lo son el cobre (Cu),
hierro (Fe) y zinc (Zn) (Adriano 2001). No obstante, la principal caracterstica
de estos elementos es su potencial toxicidad sobre los diversos organismos
vivos, y su alta persistencia, debido a que no son biodegradables (Reimann et
al. 2001). Estos MP se encuentran presentes en altas concentraciones en los
residuos mineros, desde donde pueden ser transferidos a ecosistemas
naturales, agrcolas y a la cadena trfica, alterando el funcionamiento de los
diversos organismos, lo cual conlleva una disminucin en la actividad
biolgica de los microorganismos del suelo, y una prdida de diversidad y
cobertura de las plantas que conforman la cubierta vegetal (Giller et al.
1998).
La prdida de la actividad biolgica y la biodiversidad repercuten
negativamente, generando un descenso en la actividad de las distintas
especies asociadas, lo que finalmente desencadena un crculo de efectos
negativos que disminuye la sostenibilidad de los ecosistemas (Kennedy,
Smith 1995). En particular, en los ecosistemas terrestres, el efecto primario
de niveles txicos de MP condicionara una degradacin de la cubierta
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Pablo Cornejo, Sebastin Meier, Csar Arriagada, Fernando Borie
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Micorrizorremediacin como alternativa para la recuperacin de suelos contaminados por actividades mineras
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Micorrizorremediacin como alternativa para la recuperacin de suelos contaminados por actividades mineras
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Micorrizorremediacin como alternativa para la recuperacin de suelos contaminados por actividades mineras
suelo, dada la importancia que esta protena puede representar en este tipo
de suelos, como se detalla a continuacin.
Tabla 1.
Contribucin de la glomalina a la inmovilizacin de metales pesados.
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Pablo Cornejo, Sebastin Meier, Csar Arriagada, Fernando Borie
Por otra parte, los altos rangos en que esta protena ha sido encontrada
en distintos suelos (hasta ms de 60 mg g-1) y su alta recalcitrancia (ms de
40 aos de vida media) la convierten en una fraccin cuantitativamente muy
importante y temporalmente muy estable para inmovilizar MP. Sin duda, estos
aspectos sugieren un rol activo muy importante de la glomalina en la mitigacin
de la toxicidad ocasionada a las plantas que se encuentran creciendo en suelos
contaminados con MP. En particular, el efecto beneficioso de la acumulacin
de glomalina en el suelo, y su subsecuente capacidad de inmovilizacin de
MP, convierten a este compuesto en uno de los principales medios por los
cuales los HMA contribuiran a potenciar procesos de fitoestabilizacin, aspecto
muy importante a tener en consideracin al disear programas de
micorrizorremediacin.
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Micorrizorremediacin como alternativa para la recuperacin de suelos contaminados por actividades mineras
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Micorrizorremediacin como alternativa para la recuperacin de suelos contaminados por actividades mineras
Agradecimientos
A los proyectos Fondecyt N 3070052 y 11080131 de la Comisin Nacional
de Investigacin Cientfica y Tecnolgica (CONICYT-Chile) por el financiamiento
para el desarrollo de esta lnea de investigacin.
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La presente edicin se termin de editar de manera digital en Marzo
de 2013. Todos los derechos reservados.
340
RIZOSFERA, BIODIVERSIDAD Y AGRICULTURA SUSTENTABLE
Ins Eugenia Garca de Salamone, Susana Vzquez, Claudio Penna & Fabricio Cassn
EDITORES
2013
ISBN 978-987-26716-1-7
Asociacin Argentina de Microbiologa
Ciudad Autnoma de Buenos Aires
http://www.aam.org.ar/
La rizosfera es una parte del suelo inmediata a las races en donde se desarrolla una fuerte
y nica interaccin de tres componentes, la planta, el suelo y las micro y macrofauna que
habitan esta fraccin del sistema. En un sentido ms amplio de la denicin, la rizosfera es
la porcin de suelo en la que estn presentes las races de los vegetales y en la que se dan
una serie de complejas relaciones fsicas y qumicas que afectan tanto la estructura del
sistema suelo como los organismos que en l viven. La rizosfera provee un microambiente
complejo y dinmico, donde las bacterias, los hongos y el resto de los organismos rizosfri-
cos forman una comunidad nica en asociacin con las races y de considerable potencial
para su estudio y aplicacin tecnolgica desde los puntos de vista agrcola y ecolgico.
El TIRBAS 2010 tuvo como objetivos fundamentales: (1) Generar un marco interdisciplina-
rio para el intercambio de informacin cientco-tecnolgica sobre el estudio de la rizosfe-
ra en Argentina, (2) Promover el desarrollo de un espacio institucional sobre el estudio,
uso y aplicacin agro-industrial de los conocimientos relacionados con la rizosfera en
nuestro pas, que permita de manera estratgica integrar la investigacin bsica y agrcola
con la demanda tecnolgica del sector industrial, y (3) Compartir la experiencia de investi-
gadores de diferentes pases del mundo que han contribuido de manera decisiva a la
comprensin del modelo bsico de estudio.
ISBN 978-987-26716-1-7
Imagen de Portada
Azospirillum brasilense colonizing stolon inner structures of strawberry plants (Fragaria ananassa Duch).
Micrograph, obtained with a ZEISS SUPRA 55VP scanning electron microscope, shows bacterial cells gathered in groups
(pink) within tissues of the stolon vascular zone (green). Authors: M.F. Guerrero-Molina1, B.C. Winik2, R.O. Pedraza1.
1
Facultad de Agronoma y Zootecnia, Universidad Nacional de Tucumn. Av. Roca 1900. (4000) San Miguel de Tucumn, Argentina. 2Centro Integral
de Microscopa Electrnica. Facultad de Bioqumica, Qumica y Farmacia. UNT. INSIBIO CCT CONICET Tucumn. Chacabuco 461, (4000) San
Miguel de Tucumn, Argentina.