Anexo2010 Problemas de Ingeniería Genética PDF
Anexo2010 Problemas de Ingeniería Genética PDF
Anexo2010 Problemas de Ingeniería Genética PDF
r
e
c
o
m
b
i
n
a
n
t
e
s
c
+
Str
R
a
+
Str
R
b
+
Str
R
4 8 12 16 20 24 t (min)
N
r
e
c
o
m
b
i
n
a
n
t
e
s
c
+
Str
R
a
+
Str
R
b
+
Str
R
Alu I Alu I
P
Amp
R
Amp
R
Vector 1 Vector 2
Alu I Alu I
P
Amp
R
Amp
R
Vector 1 Vector 2
P = promotor del opern
lac
30
-De las bacterias que crecieron en MM+Amp+Val+
Lac, el 50% crecieron en MM+Amp+Lac.
d) Cules son los genotipos de las bacterias que crecen
en cada uno de los 3 medios?
e) Cmo interpreta los resultados de este experimento?
Demuestre que estos resultados son compatibles con la
hiptesis de que a y b estn en el mismo opern.
f) Cul de los genes est ms cerca del promotor: a o
b? Justifique.
g) Cmo hara, utilizando la tcnica de PCR, para de-
mostrar que a y b pertenecen al mismo opern? Indique
los resultados esperados tanto si a y b forman parte de
un opern como si se transcriben independientemente.
Respuesta a) a+ StrR = MM + Str + Val + Ile
b+ StrR = MM + Str + Leu + Ile
c+ StrR = MM + Str + Leu + Val
b) a y b mapean a 12 min del OriT y C mapea a 6 min.
c) i) Se hubieran seleccionado a las bacterias dadoras
por lo que no hubiera habido diferencias entre los dis-
tintos medios ni tampoco entre los distintos tiempos.
ii) Se hubieran obtenido muy pocas recombinantes
(aquellas en las que el plsmido F+ se hubiera incorpo-
rado en la cepa dadora y luego los marcadores a, b o c
se hubieran transferido a la cepa aceptora).
iii) Dependiendo de la orientacin del OriT hay dos po-
sibilidades: -que a y b salgan primero y bastante tiempo
despus salga c -que c salga primero y bastante tiempo
despus salgan a y b.
En el grfico tienen que quedar claro esto, y adems
que la frecuencia de recombinantes para los genes que
salen primero debe ser bastante mayor que la de los ge-
nes que salen al final.
d) MM+Amp+Leu = a- b+ AmpR y a+ b+ AmpR. Es
decir, b+ AmpR
MM+Amp+Val = a+ b- AmpR y a+ b+ AmpR. Es de-
cir, a+ AmpR
MM+Amp = a+ b+ AmpR
La lactosa no importa, slo se usa para inducir la expre-
sin mediada por el promotor lac.
e) De las bacterias transformadas con el vector 1 todas
las bacterias b+ tambin eran a+, pero slo el 60% de
las a+ eran b+.
En cuanto a las bacterias transformadas con el vector 2
el 55% de las bacterias b+ tambin eran a+, y el 50% de
las a+ eran tambin b+.
La diferencia en los resultados obtenidos con ambos
vectores radica en que el vector 1 no contiene un pro-
motor por lo que la expresin de los transgenes se dar
solo si vienen acompaados de su promotor. El hecho
de que todas las bacterias b+ sean tambin a+ nos indi-
ca que b se transcribe utilizando el promotor de a sugi-
riendo que a y b forman parte de un opern.
En el caso del vector 2 dado que aporta un promotor (y
ste est encendido debido a la lactosa) s se obtienen
bacterias a-b+.
f) Dado que, cuando se transform con el vector 1, no
se obtienen bacterias a-b+ pero s a+b- esto nos sugiere
que no se necesita que se transcriba b para que se
transcriba a (pero s al revs). Esto indicara que a se
encuentra ms prximo al promotor que b.
g) RT-PCR usando primers de la regin 5 del gen a y
de la regin 3 del gen b. Si amplifico es porque hay
transcriptos que contienen al gen a y al b. Hay otras
posibilidades que se evaluarn caso por caso
5) Se realiza un experimento de transformacin con una
cepa bacteriana donante resistente a cuatro antibiticos:
A, B, C y D. La cepa receptora es sensible a las cuatro
drogas. La poblacin de clulas receptoras tratada se
divide y se siembra en placas
de medios suplementados con
varias combinaciones de las
drogas. Los resultados fueron:
a) Uno de los genes est cla-
ramente alejado de los otros
tres, los cuales parecen estar
estrechamente ligados. Cul
es el gen distante?
b) Cul es el orden de los
tres marcadores que estn li-
gados?
Rta: a) B es el gen distante;
b) A D C.
6) El Dr. Watson est estu-
diando un fago temperado
descubierto en su laboratorio
(P26) con el objeto de deter-
minar si durante el ciclo li-
sognico ste se inserta en el cromosoma bacteriano, y
si lo hace en qu sitio.
Para ello infecta una cepa Hfr salvaje Amp
S
Str
S
con un
fago deficiente en el cual se ha reemplazado al gen X
(esencial para que el fago entre en ciclo ltico, pero no
para que entre en ciclo lisognico) por un gen de resis-
tencia a ampicilina bajo el control del promotor Lac
(con su regin operadora).
a) En qu medio de cultivo selecciona a las bacterias
Hfr que presentan el fago?
Luego de seleccionar en medio slido 15 clones Hfr
lisognicos y con el objetivo de determinar si el fago
defectivo est integrado en el cromosoma y en qu sito
lo hace, conjuga, por separado, a cada Hfr lisognica
con una cepa F- gal- leu- arg- Amp
S
Str
R
obteniendo, en
todos los casos, el mismo resultado:
b) En qu medios seleccion a cada uno de los geno-
tipos?
c) En base a los resultados obtenidos, cul de las si-
guientes opciones es la correcta?
- el fago no se integra en el cromosoma bacteriano
(queda como episoma)
- el fago se integra al cromosoma en un nico sitio
- el fago puede integrarse en varios sitios del cromoso-
ma bacteriano
Justifique su eleccin y por qu descarta las dems.
Antibiticos N colonias
A 1.156
B 1.148
C 1.161
D 1.139
AB 46
AC 640
AD 942
BC 51
BD 40
CD 786
ABC 30
ABD 42
ACD 630
BCD 36
ABCD 30
Total 7.877
N
d
e
r
e
c
o
m
b
t(min) 10 20 30 40 50 60
Gal+
AmpR
Leu+
arg+
N
d
e
r
e
c
o
m
b
t(min) 10 20 30 40 50 60
Gal+
AmpR
Leu+
arg+
31
Otro investigador, intent reproducir estos experimen-
tos con una cepa Hfr de su laboratorio y el mismo fago
defectivo que solicit al Dr. Watson. Sin embargo, en
este caso el marcador Amp
R
mape a 10 min del origen
de transferencia.
d) Le parece que esto contradice necesariamente los
resultados del Dr. Watson y su respuesta de la pregunta
c?
Nota: Las bacterias gal- no pueden utilizar galactosa
como fuente de carbono y energa, las bacterias leu- y
las arg- no pueden sintetizar los aminocidos leucina y
arginina respectivamente.
R: a) Debe seleccionarlas en medio mnimo, sin gluco-
sa (para que no haya represin catablica) y con IPTG o
lactosa para inducir al opern lac y que se exprese el
gen de resistencia a ampicilina. El medio debe tener
adems ampicilina para matar a todas las bacterias que
no posean el fago.
b) Gal +: MM + gal + arg + leu + Streptomicina
Leu +: MM + glu + arg + Streptomicina
Arg+: MM + glu + leu + Streptomicina
AmpR: MM + lac + leu + arg + Ampicilina + Strepto-
micina (ojo que la fuente de carbono debe ser lactosa y
no glucosa, por un lado para inducir al opern y por el
otro para que no haya represin catablica)
c) Si el fago P26 no se integrara al cromosoma de la Hfr
y quedara como episoma no sera transferido a la cepa
F- en el experimento de conjugacin interrupida y por
ende no se detectara bacterias AmpR (recordar que el
gen de resistencia a ampicilina est dentro del genoma
del fago). Adems podemos decir que el fago se integra
en un nico lugar del genoma porque en los 15 clones
de Hfr lisognicas generadas el marcador AmpR entr
en el mismo tiempo.
d) No contradice los resultados del Dr. Watson ni las
conclusiones sacadas ya que, al ser una cepa Hfr distin-
ta el origen de transferencia puede estar ubicado ms
cerca (o ms lejos) del sitio de integracin del fago. Lo
que s debera ocurrir, es que en todos los clones el gen
de resistencia a ampicilina mapee cerca del gen leu.
7) Halobacterium salinarium es una arquibacteria estu-
diada porque es fototrfica en ausencia casi absoluta de
oxgeno. El gen bop codifica para la protena bacterio-
opsina que cumplira un papel importante en el proceso,
por lo que se lo clon en un plsmido de Escherichia
coli, insertando un gen de resistencia a mevilonina
(Mev
R
) el cual reemplaza la parte central del gen (indi-
cado como bop'-'bop en la figura).
El origen de replicacin de este plsmido (ColE1) per-
mite la replicacin en enterobacterias pero NO en ar-
quibacterias y, salvo por las secuencias del gen bop, no
comparte ninguna homologa de secuencia con arqui-
bacterias. Sin embargo, cuando este plsmido fue intro-
ducido por electroporacin en H.salinarium se resca-
taron bacterias resistentes a mevilonina.
a) Cmo lo explicara? Incluya un esquema explicati-
vo.
Las colonias de bacterias seleccionadas para mevilonina
que pudieron analizarse no mostraron cambios en su
actividad fotosinttica y, al analizrselas se comprob
que el gen bop salvaje se expresaba normalmente.
b) Qu modificaciones introducira al experimento
para conseguir un mutante knock out para el gen bop?
Ms especficamente qu gen incluira donde est la X
en la figura con este objetivo? Explique.
Respuestas a)
b) Requiero que X sea un gen de seleccin letal como
podra ser SacB que est en uno de los problemas del
anexo.
X?
Mev
R
X?
Mev
R
X?
Mev
R
SacB
Mev
R
SacB
Mev
R
32
Transposicin
1) En un estudio sobre mutaciones inestables de maz,
un investigador propuso los siguientes genotipos para
dos plantas distintas de esta especie:
I) C/cd
; Ac
+
/Ac
-
II) C/ca ; Ac
-
/Ac
-
C: alelo silvestre que permite la expresin del color del
grano; cd: es un alelo inestable producto de la insercin
de un elemento mvil no autnomo Ds que inactiva la
expresin del gen. ca: es un alelo inestable producto de
la insercin de un elemento mvil Ac autnomo que
inactiva la expresin del gen. Ac
+
presencia/ Ac
-
ausen-
cia del elemento mvil (atencin que esta nomenclatura
es distinta a la empleada en algunos libros de texto).
Se realizaron los siguientes cruzamientos:
a) plantas con genotipos I y II se cruzaron con plantas
c/c; Ac
-
/Ac
-
, en donde el alelo
c representa una forma
mutante incolora, producto de una sustitucin de bases.
b) planta con genotipo I) se cruz con planta con geno-
tipo II).
Qu fenotipos y en qu proporciones aparecern en la
descendencia de los cruzamientos a) y b)? NOTA:
Asumir que Ac y C no estn ligados, y que la frecuen-
cia de rupturas cromosmicas es despreciable.
Respuesta: a) I) prpuras, blancas, mosaico II)
prpuras, mosaico; b) prpuras, mosaicos
[Todos los genotipos C_, homo- o heterocigotas, son
prpuras; la probabilidad de que un transposn (por ej.
del locus Ac) justo vaya a insertarse en un locus espec-
fico del genoma es extremadamente baja. Todos los
genotipos dobles recesivos (conteniendo c, cd o ca)
son mosaicos si est ca_ o cd_, Ac+_]
4) Se confeccionaron varios mutantes del Tn5 mediante
ingeniera gentica. El mapa y el fenotipo se muestra
ms abajo: grafica una delecin del DNA en-
tre los extremos de la llave. grafica un frag-
mento de 800 pb de DNA forneo que se insert en la
posicin O. Las capacidades del mutante de transponer-
se y de resistir a neomicina (Neo
R
) se indican a la dere-
cha de cada mutante. WT significa wild type (normal o
salvaje). y indican las regiones repe-
tidas invertidas (IR) del Tn5. NOTA: Para su respuesta
suponga que entre los valores de la tabla 90 y 100 o
entre 0 y 0,5 no existen diferencias estadsticamente
significativas.
Qu conclusiones puede sacar acerca de:
a) la(s) region(es) requerida(s) para la transposicin y
region(es) no requeridas?
b) Por qu estos resultados son inesperados y se con-
tradicen con lo que Ud. aprendi en la materia?
c) la(s) regio(es) requeridas para Neo
R
?
Solucin: a) Para la transposicin: completo,
slo el extremo izquierdo (aquella parte afec-
tada en la mutante 135). b) Porque hubiera esperado
que TODO el hubiera sido imprescindible pa-
ra la transposicin. c) El gen Neo
R
(completo o su ex-
tremo 5) est ubicado en algn lugar entre el extremo
derecho de y su regin derecha adyacente (es
decir, parte o todo el fragmento afectado por la delecin
en la mutante 138). [Con los datos suministrados no
puedo afirmar que TODO el gen Neo
R
est en ese seg-
mento. Tampoco puede concluirse, con estos datos, que
haya una superposicin entre parte del gen y el IR iz-
quierdo, pero resulta altamente sospechoso. Para con-
firmarlo, deberan hacerse mutaciones dirigidas usando
deleciones ms pequeas o sustituciones nucleotdicas
puntuales].
5) En un trabajo reciente (Mol Gen Genomics, 2006,
275: 231-241) un grupo japons estudia la coloracin
de las flores en Gentiana scabra, una planta ornamental
muy difundida en Japn. Para ello analizan tres cultiva-
res de G. scabra: cv. Momokorin (flores rosadas), la
lnea mejorada 13-98 (flores rosadas) y el cv. Alta (flo-
res azules); y G. triflora cv. Macyri (flores azules).
Primero, miden la acumulacin de antocianinas median-
te HPLC de extractos obtenidos de los ptalos de las
flores. Los perfiles de HPLC obtenidos fueron los si-
guientes:
a y d) cv. Alta: dos picos, uno mayor correspondiente a
delfinidina y otro menor a cianidina.
cepa
33
b,c y e,f) Lnea 13-98 y cv. Momokorin: un nico pico
correspondiente a cianidina
i) Qu le indican estos resultados en cuanto a la deter-
minacin bioqumica del color de las flores?
La enzima clave en la biosntesis de delfinidina es la
flavonoidil 35-
hidroxilasa
(F35H) que
cataliza la
hidroxilacin en
5 del anillo B
del esqueleto de
la antocianina.
La expresin
gnica de esta
enzima se mues-
tra en la siguien-
te figura:
a) Anlisis de
Northern blot
usando RNA
total de ptalos
de los tres culti-
vares de G. sca-
bra. La mem-
brana fue hibri-
dada con cada
una de las son-
das correspon-
dientes a los genes F35H y F3H (codifica para una
enzima que cataliza la hidroxilacin en 3 del anillo B
de flavonoides). rRNA: control de cantidad de RNA
ribosomal teido con bromuro de etidio.
b) Anlisis de RT-PCR para amplificar el ORF de
F35H usando RNA total extrado de ptalos. Los
nmeros a la derecha indican los tamaos de los frag-
mentos amplificados.
Nota: por 3RACE amplifican transcriptos menores a
1,4 kb en la lnea 13-98
c) Anlisis de PCR para amplificar la secuencia gen-
mica de F35H con los iniciadores empleados para la
RT-PCR. Los nmeros a la derecha indican lo mismo
que en b.
ii) Cul fue el objetivo de los experimentos mostrados
en a y b?
iii) Para qu se realiz la hibridacin con F3H?
iv) Qu explicacin molecular podra dar a los cam-
bios en el perfil de los transcriptos?
A continuacin, a partir de ADN genmico de las plan-
tas amplifican fragmentos conteniendo el ORF F35H
(ver parte c de la figura anterior):
v) Cul fue el objetivo de este experimento?
vi) Qu evidencian estos resultados?
Los fragmentos de 4 kb y 3,3 kb fueron clonados y se-
cuenciados.
El fragmento de 4 kb de la lnea 13-98 presentaba en el
exn 1 una insercin (a la que llamaron dTgs1) cuya
secuencia contena un sitio blanco de duplicacin
(TSD) de 8 pb y repeticiones terminales invertidas
(TIR) de 14 pb. La secuencia TIR presentaba una re-
gin palndromica imperfecta y exhiba similitud par-
cial con un elemento dTph de petunia (el cual se sabe
que es reconocido por la transposasa Ac).
El fragmento de 3,3 kb del cv. Momokorin contena una
insercin en el exn 1, a la que denominaron GsTRIM.
Esta secuencia presentaba repeticiones directas termina-
les (TDR). Esta insercin no contena secuencias que
codificaran para alguna protena. Asimismo, presentaba
similitud con secuencias de Lotus japonicus, designadas
LjTRIM.
vii) Qu le permiten confirmar estos datos de secuen-
cia? Cul es entonces la explicacin para los diferentes
fenotipos observados?
Como los elementos TRIM fueron identificados a partir
de anlisis de bases de datos de secuencias nucleotdi-
cas y mostraron la peculiaridad de estar conservados en
distintas especies de plantas, realizaron un anlisis filo-
gentico empleando las secuencias TDR y usando los
programas CLUSTAL W y TREEVIEW. El rbol obte-
nido se muestra a continuacin:
vii) Qu puede concluir del agrupamiento mostrado en
el rbol?
viii) Sugiera un experimento simple para analizar la
existencia de los elementos dTgs1 y GsTRIM en el ge-
noma de otras especies de Gentiana.
Rta: Aclaracin: Las gentianas rosadas vienen siendo
obtenidas por mejoramiento a partir de mutaciones es-
pontneas a partir de gentianas azules, pero el/los me-
canismo/s involucrado/s eran desconocido/s hasta el
momento.
i) Estos resultados indican que hay diferencias en la
acumulacin de las distintas antocianinas en ambas
plantas (azules y rosadas), en particular, las plantas ro-
sadas carecen de delfinidinas. Pero la acumulacin de
cianidinas es similar para ambas.
ii) Como los autores saben que la F35H es la enzima
clave en la sntesis de delfinidina y viendo los resulta-
dos anteriores, analizan si hay diferencias en cuanto a la
expresin del gen para esta enzima entre los dos tipos
de plantas y analizan si esto podra explicar los fenoti-
pos observados.
iii) La hibridacin con F3H es usada como control.
Tanto en plantas azules como rosas se obtiene el mismo
patrn de expresin. Es otra enzima involucrada en la
sntesis de pigmentos pero que produce otro compuesto
(que no tiene nada que ver con las delfinidinas, si bien
pertenece a la misma ruta biosinttica). Tambin prue-
ban con otros genes relacionados con la sntesis de fla-
vonoides y ven que exhiben los mismos patrones que la
34
F3H pero esto tampoco lo muestran en el trabajo origi-
nal.
iv) Los resultados evidencian que:
No se observa transcripto de F35H para la planta ro-
sada, lnea 13-98 tanto por Northern blot como por RT-
PCR (Aclaracin: los primers para esta RT levantan el
ORF por completo, full length). Adems se aclara que
por 3RACE obtienen fragmentos menores a 1,4 kb.
Para la planta rosada cv. Momokorin, el transcripto de
F35H es de tamao mayor que el observado para la
planta azul cv. Alta (Northern). Por RT-PCR este culti-
var muestra dos fragmentos de 1,3 y 2,1kb que difieren
del de 1,6kb observado para la planta azul.
En conclusin: ninguna de las plantas rosadas acumulan
el transcripto de tamao normal esperado (1,6kb)
v) El objetivo de este experimento fue examinar la es-
tructura del gen para F35H en estas plantas a partir de
amplificacin sobre el ADN genmico de las mismas,
para ver si existen diferencias que puedan explicar los
resultados a nivel de transcriptos.
vi) Se obtienen fragmentos de amplificacin de distinto
tamao para las distintas plantas. Estos resultados
muestran que el cv. Alta (azul) muestra un fragmento
de 2,8kb mientras que para la lnea 13-98 y el cv. Mo-
mokorin (rosadas) las bandas son 1,2 y 0,5kb mas gran-
des, respectivamente (sus tamaos eran 4 y 3,3 kb, res-
pectivamente). Es probable que en el gen de las plantas
rosadas haya alguna insercin.
vii) Estos resultados, dadas las similitudes de las se-
cuencias con elementos transponibles, evidencian que
las inserciones observadas corresponderan a transposo-
nes (dTgs1 y GsTRIM1). La explicacin para los dife-
rentes fenotipos observados es que estos transposones
interrumpen la secuencia del gen, resultando en trans-
criptos anormales (o ausencia de transcripto) que no
permiten la sntesis de la enzima F35H y por lo tanto
no se sintetizan el pigmento que produce la coloracin
azul (delfinidina).
vii) Los resultados claramente muestran que GsTRIM1
y LjTRIM se agrupan juntos y apartados del resto de los
TRIMs reportados previamente, indicando que estos
dos transposones son evolutivamente diferentes de los
otros elementos TRIM de plantas.
vii) Al inicio del problema, en el enunciado, se indica
que tambin disponen de G. triflora cv. Macyri. Por lo
tanto, el experimento sera hacer Southern blot de sta
conjuntamente con las 3 plantas analizadas de G. sca-
bra e hibridar con dTgs1 y GsTRIM1 (Southerns sepa-
rados, obviamente) y observar la aparicin de muchas
bandas (esto mostrara que, como la mayora de este
tipo de transposones, son miembros de una familia de
alto nmero de copias, y que estn distribuidos por todo
el genoma de Gentiana).
6) Se estudiaron los mecanismos de regulacin del
elemento transponible mariner, que est presente en
genomas de invertebrados, hongos y humanos. Ellos
obtuvieron un macho transgnico que tena
reemplazado un fragmento del gen white, localizado en
el cromosoma X, por otro homlogo, pero interrumpido
por un mariner cuya transposasa no era funcional. Esta
variante de transposn con transposasa no funcional se
denomin peach. El gen white codifica para un
pigmento rojo del ojo y cuando est mutado por
insercin, no se expresa y los ojos resultan blancos. Por
sucesivas cruzas, se obtuvo una poblacin de machos y
hembras con todos sus cromosomas X conteniendo el
gen white interrumpido por peach.
Por otro lado, se logr una construccin denominada
hsp, en la que el elemento mariner salvaje se puso bajo
la regulacin del promotor del gen de la protena hsp70
(heat shock protein), que es inducible por calor. Esta
segunda construccin se introdujo en uno de los
cromosomas del par 2 de moscas transgnicas que ya
eran peach, obtenindose moscas hsp/+.
Se realizaron cruzas entre moscas transgnicas peach,
en las que uno de los parentales tena 1 dosis de hsp
(hsp/+) y el otro parental, ninguna (+/+) . Se cont el
porcentaje de la progenie, criada a 25C (actividad basal
de hsp) o a 37C (actividad inducida de hsp), que
exhiba ojos rojos.
Genotipo del
cromosoma 2
de los padres
Temp. % de progenie
con ojos rojos
hsp/+ ; +/+ 25 8
37 17
hsp/+ ; hsp/+ 25 18
37 48
+/+ ; +/+ 25 1
37 2
Preguntas :
a) Interprete los resultados numricos
b) En qu etapa del desarrollo ocurren los eventos que
dan a origen a la progenie con ojos rojos ?
c) En este tipo de cruza tambin aparecen individuos
con ojos blancos con manchas rojas (fenotipo mosaico).
Cmo justifica estos resultados? En qu etapa del
desarrollo ocurrieron los procesos que originaron los
ojos mosaico?
d)Las hembras mosaico presentan un mayor nmero de
manchas rojas que los machos mosaico. Cual es la
causa ?
Solucin:
Super familia mariner Tc1
IR IR
50-28 pb 1000 50-28 pb
trasposasa
D. mauritiana: especie endmica hospedador de mari-
ner: IR tr + IR
mariner (wt)
IR tr - IR
peach
IR tr + IR
hsp
a) hsp/+ ; +/+
25 C, 8%: actividad basal que induce la sntesis de tr,
que acta en trans sobre white interrumpido por peach
37 C, 17%: idem, pero con promotor inducido
25 C: hsp/+; hsp/+
35
A M A M
37 C: 18% y 48%: anlogo a la progenie de los otros
parentales pero con doble dosis de tr y trasposasa.
+/+ ; +/+ : valores basales en ausencia de tr. 1% puede
ser casual, retromutacin debera ser 0%.
b) Durante el desarrollo del embrin, etapas tempranas
c) Desarrollo embrionario, estado multicelular del desa-
rrollo del ojo. La transposicin que elimina a peach de
white ocurri varias veces.
La doble dosis del X en las hembras duplica la probabi-
lidad de la transposicin respecto a los machos, que
tienen una sola dosis del X
7) Un investigador est estudiando el mecanismo de
transposicin del transposn X de ratn. Para ello, par-
tiendo de la secuencia salvaje del transposn, inserta
una construccin entre el gen pol y el LTR de la dere-
cha, que contiene:
- al gen C, cuya expresin le confiere color marrn a los
ratones.
- el promotor del gen C interrumpido por un intrn
hacindolo no funcional
Partiendo de ratones albinos, genera ratones transgni-
cos heterocigotas para dicha construccin (es decir, los
ratones tienen una sola copia del transposn recombi-
nante).
a) Detalle el fenotipo de dichos ratones en cuanto al
color de piel y presencia o ausencia de manchas:
i) si se trata de un retrotransposn, ii) si se trata de un
transposn
Justifique su respuesta.
Los ratones resultaron albinos con algu-
nas manchas marrones. A partir de biop-
sias de piel, se extrajo ADN, se digiri
con EcoRI y se realiz un Southern blot
utilizando como sonda el cDNA de pol.
b) Esquematice los resultados esperados
del Southern si las biopsias se tomaron a partir de por-
ciones albinas de la piel, y si se tomaron a partir de zo-
nas marrones. Justifique.
c) Cmo explica el hecho de que algunas manchas ma-
rrones resultaron grandes y otras pequeas?
R) a) i) En aquellas clulas donde no ocurra transposi-
cin el color de la piel ser albino ya que al estar inte-
rrumpido el promotor de C y no ser funcional el gen C
no se expresar.
En caso de que se trate de un retrotransposn, este
transposn pasar por un intermediario de RNA. En
dicho intermediario podr ocurrir el splicing del intrn
de la construccin y al retrotranscribirse a DNA e inte-
grarse en algn lugar del genoma del ratn se regene-
rar el promotor de C. En aquellas clulas de la piel,
derivadas de aquellas donde ocurri la retrotransposi-
cin, se expresar el gen C dado parches de color
marrn.
ii) En este caso el intrn no se eliminar nunca (ya que
la maquinaria que elimina intrones los elimina del RNA
y no del DNA) por lo que el promotor nunca ser fun-
cional, an cuando haya transposicin. Por lo tanto
los ratones deberan ser ntegramente albinos.
b) En las zonas blancas de la piel no ocurri transposi-
cin por lo que debera ver una sla banda correspon-
diente al tamao del fragmento incluyendo el intrn.
En las zonas marrones de la piel si ocurri retrotranspo-
sicin y se elimin el intrn. Por este motivo debera
ver dos bandas una incluyendo el intrn (el retrotrans-
posn original no se elimina) y otra sin el intrn.
d) Las manchas grandes se deben a eventos de trans-
posicin que ocurrieron temprano en el desarrollo
(y por ende dieron lugar a una porcin grande de la
piel) mientras que las manchas pequeas se deben a
eventos de transposicin que ocurrieron de forma
ms tarda.
pol LTR LTR C
Intron
Promotor
> >
EcoRI EcoRI
LTR LTR C
Intron
Promotor
gag LTR LTR C
Intron
Promotor
> >
EcoRI EcoRI
36
Gentica Extranuclear y Ligada al Sexo
1) La neuropata ptica hereditaria de Leber (NOHL) es
una enfermedad rara en la especie humana que produce
una rpida atrofia del nervio ptico y que genera cegue-
ra en adultos jvenes. Esta enfermedad est caracteriza-
da por una prdida bilateral de la visin central mientras
que se mantiene la visin perifrica. La 1 genealoga
muestra la herencia de esta enfermedad en una familia
bastante amplia:
Cul es el tipo de herencia ms probable para la
NOHL en la especie humana? Explique su razonamien-
to.
Segn su hiptesis complete la 2 genealoga indicando
los individuos afectados.
Respuesta: Observamos que todos los descendientes
independientemente de su sexo, muestran el fenotipo de
la madre. [Esto no podemos explicarlo si el carcter
estuviera en los cromosomas sexuales, ya que el fenoti-
po de la descendencia no depende de si el carcter es
dominante o recesivo, o de la direccin del cruzamien-
to, sino slo del fenotipo de la madre]. Por lo tanto
podramos asegurar que este carcter es un caso de
herencia materna.
En B se sombrean: II 2, 3, 5; III 1, 3, 4, 8,10,11; IV
todos
2) El siguiente rbol muestra una familia que hereda
una forma severa de hidrocefalia causada por una muta-
cin en el gen L1CAM (localizado en el cromosoma X)
y que presenta una herencia recesiva. Utilizando un
marcador intragnico que tiene tres alelos (12, 8 y 7) se
hace el diagnstico del propsito (nombre que reciben
los pacientes por parte de los genetistas mdicos y
que se indica con una flecha).Cul fue el resultado del
diagnstico?
a) La propsito es portadora del alelo mutante
b) La propsito es heterocigota no portadora
c) La propsito es homocigota para el alelo normal
d) El resultado no permite dar un diagnstico preciso
sobre el genotipo.
Respuesta: b)
3) En el antiguo testamento, Dios dispuso que los hijos
de Isaac y su mujer constituiran la nacin juda. Sin
embargo, la esposa de Isaac era bastante mayor y su-
puestamente infecunda. Segn las costumbres locales
de la poca, ella eligi una mujer alternativa con la que
Isaac tuvo un hijo: Esa. Un da, la anciana mujer le
coment a Isaac que estaba encinta y tuvo un hijo: Ja-
cobo. Posteriormente, Jacobo se cas con 5 hermanas
(de otra familia) y tuvo 13 hijos y varias hijas. Supo-
niendo que pudiera acceder a muestras de tejido de Isa-
ac, Esa, Jacobo y de los hijos de Jacobo y, adems,
pudiese extraer DNA y analizarlo:
a) Cuntos haplotipos o secuencias nucleotdicas dife-
rentes en la regin del cromosoma Y en la regin del
gen Sry obtendra? Justifique.
b) Cuntos tipos de secuencias nucleotdicas diferentes
del D-loop de DNA mitocondrial obtendra? Justifique.
Solucin: a) Uno slo: el que proviene de Isaac (heren-
cia ligada al sexo, etc.)
b) 4: el de Isaac (donado por su madre), el que proviene
de la madre de Esa, el que proviene de la madre de
Jacobo y el que proviene de la madre de las 5 hermanas
(herencia materna...)
3) Aproximadamente el 0,3% de la humanidad tiene
una enfermedad gentica leve llamada LHON produci-
da por una mutacin que substituye una Asn por una
Asp en el complejo NADH mitocondrial.
a) Cules son las frecuencias genotpicas para este
carcter? Seran distintas a las frecuencias allicas?
por qu?
b) Si apareciese una corriente eugensica que preconice
mejorar la raza humana que proponga eliminar las
enfermedades genticas por mtodos drsticos deber-
an prohibir tener hijos a todos los individuos con
sntomas de LHON?por qu? Atencin: ignore los da-
tos que se enumeran a continuacin para contestar esta
pregunta.
Gracias a los conocimientos adquiridos en gentica I y
para buscar argumentos cientficos para enfrentar al
movimiento eugensico a Ud se le ocurre hacer 2
estudios: i) diagnstico molecular confirmatorio y ii)
cuantificacin de la frecuencia de aparicin espontnea
de esta mutacin. En el primer caso encontr que,
adems de los enfermos, existen individuos con la mu-
tacin pero asintomticos (debidos a heteroplasmia:
presencia de mitocondrias con genotipo normal y mu-
tante en una nica clula) y en el segundo que la misma
es significativa.
37
c) Argumente por qu estos estudios demostraran la
inutilidad prctica de encarar la seleccin negativa pro-
puesta por los eugensicos.
Respuestas: a) Este es un carcter mitocondrial por lo
que, salvo algn caso raro de heteroplasmia, el alelo
est presente o ausente (como si fuera una especie mo-
noploide)]. Por lo tanto, las frecuencias allicas son
iguales a las genotpicas f(LHON) = 0,3% F(normal) =
0,97%
b) A las mujeres (y no a los varones) porque se trata de
una herencia materna, no hay necesidad de evitar la re-
produccin de los varones dado que no transmiten la
enfermedad
c) Despus de la seleccin negativa la segregacin
somtica de los heteroplsticos y la aparicin constante
de nuevas mutaciones similares llevaran la enfermedad
gentica a las mismas cifras actuales (despus de algu-
nas pocas generaciones)
4) El seor sealado con un crculo rojo tiene una rara
enfermedad gentica y le pregunta: -Vos que hiciste un
curso rpido de gentica me podrs averiguar qu pro-
babilidad tengo de transmitirle esta enfermedad a mis
futuros hijos?
Mi seora
no posee
esta enfer-
medad pero
con la
gentica
nunca se
sabe!. Me
tendr que
hacer un
anlisis yo
o mi seo-
ra?
Le podr contestar sin necesidad de pedirle un anlisis
gentico detallado (pedigr) a la seora? Justifique bre-
vemente.
Rta: La probabilidad es nula porque se trata de un claro
ejemplo de herencia materna. No requiere de ms anli-
sis.
Respuestas alternativas vlidas a esta pregunta (no pe-
didas):
a) Imprinting materno
b) podra ser un gen autonmico recesivo
En el caso b), S debera hacer anlisis genticos.
5) En la siguiente genealoga los smbolos en negro
denotan la condicin patolgica de una enfermedad con
baja incidencia en la poblacin, que afecta mayormente
a hombres. Justifique todas sus respuestas.
a) Cules de los siguientes tipos de herencia puede
descartar: herencia mendeliana, ligada al sexo, liga-
da al cromosoma Y, limitada por el sexo, influencia-
da por el sexo, herencia materna, influencia mater-
na?
b) De las posibilidades que no descart, cul le parece
ms probable?
c) asumiendo como cierta la hiptesis que escogi
en el punto b), cul sera el genotipo de los distin-
tos individuos de la genealoga? Tenga en cuenta
que en algunos casos puede haber ms de una opcin
posible.
d) Si los individuos que poseen el asterisco se ca-
san, cul es la probabilidad que tengan un hijo
que porte el alelo enfermo?
Respuesta:
a) Herencia mendeliana: no la puedo descartar, podra
tratarse de una enfermedad recesiva.
Ligada al sexo: puede ser
Ligada al Y: No puede ser porque sino el hijo varon II
debera ser enfermo y el V no debera serlo.
Limitada por el sexo: no puede ser porque segn el
enunciado en la poblacin tambin hay mujeres enfer-
mas.
Influenciado por el sexo: puede ser
Herencia e influencia materna: no porque las madres de
los enfermos no estn enfermas y el que introdujo el
alelo que da la enfermedad fue el padre de las genera-
cin I
b) Es un gen ligado al cromosoma X. Podra ser un gen
autonmico recesivo, pero eso sera posible si todos los
matrimonios se dieron con personas heterocigotos para
la enfermedad y si sta es rara como dice el enunciado
esta alternativa es muy poco probable. Tambin podra
ser influenciado por el sexo.
c)
d)La probabilidad de que la mujer sea heterocigota es
(dado que recibi X
A
del padre y existe de probabili-
dad que haya recibido X de la madre) y la probabilidad
de que siendo heterocigota transmita el alelo enfermo es
. Por lo tanto la probabilidad de que un hijo varn
porte un alelo enfermo es .
6) El Dr. Visen public hace aos los resultados de la
herencia del color del pelaje de los gatos. Su primera
observacin fue que el pelaje puede ser de color negro o
naranja, entre otros. Posteriormente al cruzar gatos con
estos colores los cruces recprocos dieron resultados
*
?
I
II
V
III
IV
*
?
X
A
X
a
X
A
X
a
X
A
X
a
X
a
Y
X
A
Y X
A
Y X
A
X
a
X
a
Y X
a
Y X
a
Y X
A
Y
X
A
Y
X
a
Y
X
a
Y X
a
Y
X
a
Y
X
A
Y
X
A
Y
X
A
Y X
A
X
a
X
A
X
a
X
A
X
a
X
A
Y X
A
X
--
X
A
X
a
X
A
X
--
X
A
X
--
X
A
X
a
X
A
X
-
-
X
A
X
-
-
X
A
Y
*
I
II
V
III
IV
*
38
diferentes, apareciendo animales con un fenotipo en
mosaico llamado carey, formado por pelos negros y
naranjas distribuidos en forma aleatoria en todo el cuer-
po
Hembras F1 Machos F1
Cruza-
miento
Hem-
bras
Ma-
chos
negro naranja carey negro naranja
1 negro negro 48 46
2 naranja negro 16 20
3 carey naranja 47 43 38 54
4 carey negro 12 21 29 35
a) De qu tipo de herencia se trata?
b) Por qu slo aparecen hembras carey y no as ma-
chos?
c) Cul es la relacin de dominancia entre los genes
que condicionan estos colores?
2) a) Que los dos cruces recprocos den resultados dife-
rentes indica, en principio, herencia en relacin con el
sexo. Fijndonos en los machos de la F
1;
su fenotipo
es igual al de su madre, tpico deherencia cruzada.
Los hijos reciben el cromosoma X de la madre con el
alelo para negro o para
naranja, sin embargo, las hijas presentan el mismo feno-
tipo carey en ambos cruces. De acuerdo con la hip-
tesis de herencia ligada al sexo, las hijas del primer cru-
ce tienen que ser heterozigotas, con un cromosoma X
materno portador del alelo para negro y un cromoso-
ma X paterno con un
alelo para naranja. En las hembras heterozigotas se ex-
presaran los dos alelos, produciendo dicho fenotipo en
mosaico. Esto se debe al fenmeno de inactivacin
aleatoria de uno de los dos cromosomas X de la hem-
bra, que se produce en fases tempranas del desarrollo
(Lionizacin).
b) El resultado de los cruces 3 y 4 nos ayudar a con-
firmar la hiptesis. Una hembra carey, ser hetero-
zigota para negro y naranja (X
ne
X
na
), y tendr hijos
tanto negros (X
ne
Y) como naranjas (X
na
Y), que es lo
que ocurre en los dos cruces. Una hembra carey cruza-
da con un macho naranja tendr hijas tanto carey co-
mo naranja:
X
ne
X
na
x X
na
Y = X
ne
X
na
+ X
na
X
na
+ X
na
Y + X
ne
Y
carey naranja = carey + naranja+ naranja
+negro
En el cruce hembra carey con macho negro la dife-
rencia es que en lugar de hijas naranjas aparecen, lgi-
camente, hijas negras, siendo todo lo dems igual.
Los machos, al ser hemizigotos, sern siempre X
na
Y
(naranjas) o X
ne
Y (negros), pero nunca podrn ser ca-
rey.
c) Aunque negro y naranja son alelos del mismo gen, no
se puede hablar estrictamente o deducir relaciones de
dominancia/recesividad, de herencia intermedia o de
codominancia, ya que en cada clula que produce pelo
se manifiesta uno u otro alelo, en los machos debido a
la hemizigosis y en las hembras heterozigotas debido a
la inactivacin de uno de ellos.
7) En plantas de maz con citoplasma de tipo T se ha
identificado un gen (urf13) cuya expresin induce la
androesterilidad. Asmismo para este tipo de plantas se
han identificado dos genes restauradores nucleares do-
minantes (Rf1 y Rf2) cuya expresin concertada restau-
ra la fertilidad, no habiendo restauracin si slo se
expresa uno de estos genes. El gen Rf1 fue el primer
gen restaurador aislado y caracterizado molecularmente.
Si se dispone de una planta con citoplasma T, homoci-
gota para el gen Rf1 dominante, desconocindose su
constitucin gentica para el locus Rf2,
a) Indique cual/es de las siguientes lneas de maz utili-
zara en sus experimentos para determinar la composi-
cin allica del locus Rf2 en la planta incgnita. Justi-
fique su respuesta, indicando qu planta usara como
padre y como madre en sus experimentos de cruzamien-
to, cmo espera que sea la descendencia en caso de que
la planta a la que se le quiere determinar el genotipo sea
rf2rf2, Rf2rf2 o Rf2Rf2 y por qu descarta las plantasno
elegidas.
i. T rf1 rf1 Rf2 Rf2 iv. N Rf1 Rf1 rf2 rf2
ii. N rf1 rf1 Rf2 Rf2 v. T Rf1 Rf1 Rf2Rf2
iii. T Rf1 Rf1 rf2 rf2 vi. N Rf1 Rf1 Rf2 Rf2
Nota: N corresponde a citoplasma normal, T correspon-
de a citoplasma androestril.
b) Un mejorador recibe una planta con una nueva fuen-
te de androesterilidad citoplasmtica y al cruzarla con
una lnea restauradora para los genes Rf1 Rf2 obtiene
toda la descendencia estril Cmo explica este resulta-
do?
R) a) Utilizara la planta iv como padre que es frtil
(citoplasma normal) y aparte es homocigota dominante
para RF1 (este locus no est en estudio pero es necesa-
rio para restaurar fertilidad) y rf2 doble recesivo para
evaluar la composicin de la descendencia al cruzarlo
por la planta incgnita (T Rf1Rf1 -- --)
Si la descendencia es 100% estril, la planta era T Rf1
Rf1 rf2 rf2 (Rf1 solo no restaura la fertilidad)
Si la descendencia es 100% frtil la planta era T Rf1Rf1
Rf2Rf2
Si la descendencia es 50% esteril, 50% frtil, la planta
era T Rf1Rf1 Rf2rf2
Las otras lneas no daran resultados conclusivos
i), iii): no dan polen viable
ii) , v), vi): toda la descendencia es frtil pero no se
puede establecer que alelos Rf2/rf2 componen el locus
incgnita
b) Es portadora de un gen de androesterilidad distinto
al urf13 para el cual la lnea retauradora no posee el
gen restaurador necesario
7) Un investigador est estudiando una extraa enfer-
medad que afecta a la poblacin de una remota isla del
Pacfico. Analizando la descendencia de los matrimo-
nios en la isla not que:
- Los hijos varones de los matrimonios donde el padre
es enfermo y la madre sana, son todos sanos. En cam-
bio, todas las hijas presentan la enfermedad.
- En la descendencia de los matrimonios donde el pa-
dre es sano y la madre es enferma la proporcin de hijas
enfermas es significativamente mayor a la de hijos en-
fermos.
a) Qu tipos de herencia no son consistentes con estas
observaciones: autosmica dominante, autosmica re-
cesiva, dominante ligada al X, recesiva ligada al X, li-
gada al Y, influenciada por el sexo, limitada por el
sexo, herencia mitocondrial o influencia materna? Justi-
fique cada caso.
39
b) Para aquel/aquellos tipos de herencia que sean con-
sistentes con las observaciones indicar los fenotipos
esperados para cada genotipo y explicar las observacio-
nes del investigador.
Respuesta:
a) autosmica: no es posible pues debera haber igual
frecuencia de hijos que de hijas enfermas.
Dominante ligada al X: Los padres sanos seran X
e
Y y
las madres enfermas X
E
X
e
o X
E
X
E
. De los cruzamien-
tos X
e
Y x X
E
X
e
la mitad de los hijos varones son en-
fermos y la mitad sanos; y la mitad de las hijas son en-
fermas y la mitad sanas. De los cruzamientos X
e
Y x
X
E
X
E
todos los hijos es hijas son enfermos. En conjun-
to, la proporcin de hijos enfermos debera ser igual a la
de hijas enfermas, lo cual no ocurre.
Recesiva ligada al X: no es consistente pues las hijas de
padres sanos y madres enfermas deberan ser todas por-
tadoras sanas mientras que los hijos todos enfermos.
Ligada al Y: no es posible pues hay mujeres enfermas.
Limitada por el sexo: no es posible pues hay enfermos
de ambos sexos.
Herencia mitocondrial o influencia materna: no es posi-
ble pues los padres enfermos no podran pasarle la en-
fermedad a sus hijas.
b) Se trata de una enfermedad influenciada por el sexo,
donde el alelo enfermo (A1) es recesivo en los hombres
y dominante en las mujeres.
Hombres Mujeres
A1A1 Enfermos Enfermas
A1A2 Sanos Enfermas
A2A2 sanos Sanas
- Caso 1: padres enfermos x madres sanas
A1A1 x A2A2
Toda la descendencia es A1A2. Los varones sern sa-
nos y las mujeres presentarn la enfermedad.
- Caso 2: padres sanos x madres enfermas
Los padres sanos pueden ser A1A2 o A2A2; mientras
que las madres enfermas pueden ser A1A1 o A1A2. Al
ser un gen autosmico habr la misma proporcin de
cada genotipo en la descendencia masculina que en la
femenina. Entre estos genotipos aparecen los tres posi-
bles A1A1 (que sern enfermos tantos hijos como
hijas), A2A2 (que sern sanos tanto hijos como hijas) y
A1A2 (que sern sanos si son varones y enfermas si son
mujeres). Es por esto que hay una mayor proporcin de
hijas enfermas que de hijos enfermos.
Gentica Aplicada
1) NNK y NNN son nitrosaminas presentes en el tabaco
y en el humo de cigarrillo, conjuntamente con otros po-
tentes carcingenos y se sospecha que tienen un rol
primario en el cncer de pulmn, boca y otros sitios.
Por otro lado, se cree que el t verde podra funcionar
como quimioprotector, debido a la presencia de anti-
oxidantes fenlicos que actuaran en los pasos depen-
dientes de replicacin que ayudan a fijar las mutaciones
como parte del desarrollo oncognico. Pressentin y col
(2001) estudiaron genotoxicidad de NNK y NNN utili-
zando ratones transgnicos para lacZ (sistema Muta-
mouse) a los cuales suministraron NNN, NNK y/o t
verde en el agua de bebida durante tiempos y condicio-
nes controladas. Despus de los tratamientos, extrajeron
DNA de los rganos de inters, se lo empaquet con un
extracto con cpsides de fago y se infectaron bacte-
rias, las cuales se plaquearon. Se investigaron, adems
de los rganos que desarrollan cncer con mayor fre-
cuencia en fumadores, al hgado y al rin porque se
report que estos compuestos son metabolizados y ex-
cretados por va urinaria en los fumadores (se sabe hace
mucho que la orina de fumadores es mutagnica). En la
figura 1 se cuantifican la cantidad de placas (playas de
lisis) transparentes sobre el total (azules + transparen-
tes).
Fig 1: Promedio de unidades formadoras de placa (pfu)
para NNK, NNN y un control no tratado. Se grafican
los desvos estndar. Un asterisco simple implica P <
0.05 usando el MannWhitney U-test versus el control
correspondiente. El doble asterisco (**) denota P <
0.01. liver, hgado; lung, pulmn; O.T., tejido oral;
esoph., esfago; tongue, lengua; kidney, rin; cont.,
control .
a) Qu ventajas (en trminos temporales) tiene este
mtodo comparado, por ejemplo, con cuantificar el de-
sarrollo de tumores en los ratones, si es esto ltimo es
lo que interesa en ltima instancia?
b) En base a los resultados dira que las nitrosaminas
de tabaco son mutagnicas? Por qu?
c) Dado que la ingestin de agua sin nitrosaminas (con-
trol) resulta en valores significativamente distintos de
cero sospechara que en el experimento hay algn otro
mutgeno que no se est controlando o que es mutag-
nica el agua y que pueda afectar la validez del experi-
mento?
d) A partir de los resultados Considera que existe es-
pecificidad de tejido o no? Se condicen estos resulta-
dos con las evidencias epidemiolgicas previas que in-
dican que pulmn, esfago y boca son los que muestran
mayor incidencia de carcinognesis por efecto del ciga-
rrillo?
e) Una de las ventajas de este sistema de deteccin es
que se puede aislar fcilmente DNA de las placas trans-
parentes y secuenciarlo. Qu informacin aportara
esto ltimo?
Posteriormente, se realizaron experimentos suminis-
trando una infusin de t verde, con los resultados que
se muestran en la Fig 2:
40
Fig. 2. Igual que en la Fig. 1. Las diferencias denota-
das por asteriscos son entre NNK y NNK+T. NNK+T:
NNK + t verde.
f) Indique y justifique si le recomendara tomar t ver-
de a un fumador (aunque no le guste) en vez de aconse-
jarle que deje de fumar.
Respuestas:
a) Porque esperar a que desarrollen tumores lleva, por
lo menos, varias semanas. Este mtodo es ms rpido.
b) S, en todos los casos, salvo la NNK en lengua, por-
que los valores de PFU son significativamente diferen-
tes a los controles.
c) No necesariamente, porque estos valores pueden
estar reflejando las frecuencias de mutacin espontnea
o basal. An en el caso de que hubiera otro mutgeno
adventicio, las diferencias son estadsticamente signifi-
cativas, validando as el experimento.
d) S, porque el rgano ms afectado fue el hgado y los
dems lo hicieron en menor grado. No, por lo antedi-
cho. Podra especularse que existe un efecto diferencial
por la va de entrada. La va de ingreso de las nitrosa-
minas (oral en vez de pulmonar) podra ser un causal de
esta diferencia. Para demostrarlo, habra que suminis-
trar las nitrosaminas por aspiracin en una atmsfera de
humo y comparar los resultados.
e) Aportara informacin sobre el mecanismo molecu-
lar de mutacin (transiciones, transversiones, indels,
etc)
f) Las diferencias significativas indican que el t verde
sera un quimioprotector en todos los tejidos evaluados
salvo en esfago y lengua. Sin embargo, no evita por
completo la genotoxicidad en las condiciones ensaya-
das. Por lo tanto, no reemplaza el efecto benfico de
dejar de fumar.
2) Carol Martinson recibi unas muestras de arndanos
de un productor que aduca que las plantas que haba
comprado en la empresa Truchex (SRL, Sociedad de
responsabilidad MUY limitada) no rendan ni tenan la
calidad prometida. Para genotipificar, Carol compar
los patrones de marcadores moleculares con la muestra
problema (nmero 2, supuestamente perteneciente a la
variedad ONeil) con muestras de material de multipli-
cacin del INTA Concordia de ONeal y de otra varie-
dad muy usada (Misty), tanto de material in vitro como
de las plantas derivadas de micropropagacin puestas
a campo, obteniendo el siguiente electroforetograma:
Fig Patrones de amplificacin de RAPDs. Las diferen-
tes calles representan los productos de amplificacin
obtenidos para las distintas muestras: 1 (ONeal, certifi-
cado, in vitro), 2 (supuesto ONeal), 3 (ONeal de cam-
po), 4 (Misty de campo) y 5 (Misty, certificado, in vi-
tro).
a) Qu significan las bandas marcadas con flechas ne-
gras que Carol dibuj sobre la foto? En qu se diferen-
cian de las bandas marcadas con flechas blancas? Cu-
les de los 2 tipos de bandas fueron tiles para este anli-
sis?
b) Perteneca la muestra 2 a la variedad ONeal o no?
Computando las bandas y armando una base de datos,
Carol calcul la similitud entre las muestras y obtuvo el
siguiente dendrograma:
c) Ubique las muestras 2, 3 y 4 en los casilleros en
blanco del dendrograma.
d) En las comparaciones, Carol incluy material micro-
propagado in vitro y de campo Existe alguna razn por
la cual podran ser diferentes y explicar lo que pas?
Rta: a) Las flechas negras indican las bandas polimrfi-
cas (variables) y las blancas indican bandas mono-
mrficas. Las negras fueron las tiles porque permiten
establecer DIFERENCIAS adems de similitudes.
b) No c) 3, 4 y 2
d) Para los brillantes: podra haber variacin somaclo-
nal (mutacin causada por el hecho de cultivar in vitro).
41
Genmica
1) Mediante el uso de marcadores moleculares se cons-
truy un mapa de ligamiento del ratn, usando como
genotipos parentales de la poblacin de mapeo a dos
lneas endocriadas que presentan una marcada diferen-
cia respecto a su predisposicin a contraer Alzheimer
experimental (enfermedad caracterizada por una acele-
rada desmielinizacin a nivel cerebral). Se localiz en
dicho mapa de ligamiento, adems, un locus (gen de
expresin recesiva) involucrado en dicha predisposi-
cin. El mencionado gen (al que se denomin alz) ma-
pea en el cromosoma 3, flanqueado a 10 cM y 13 cM
por dos marcadores RFLP humanos denominados hs3 y
hs1, respectivamente (Fig. 1) (Nota: fue posible usar
sondas humanas ya que muchas sondas de esta especie
hibridan con DNA de ratn debido a su alto grado de
parentesco). Recientemente, un grupo de investigacin,
clon molecularmente en humanos, un gen (gdm) invo-
lucrado en la regulacin de la produccin de mielina a
nivel cerebral y lo mape en el cromosoma 8, flanquea-
do a 12cM y 15cM, por los mismos marcadores hs3 y
hs1. En la publicacin de dicho trabajo, los autores re-
portaron la localizacin cromosmica del gen y su se-
cuencia completa. Al leer este trabajo, se sospech (y
con fundamento) que el gen de ratn podra ser un
homlogo del gen humano. Lamentablemente ambos
grupos nunca colaboraron para que esto se pudiera de-
mostrar.
a) Cules fueron los fundamentos de la sospecha?
b) Qu estrategia utilizara usted para clonar, al menos
parcialmente, al gen supuestamente homlogo de ratn
(recuerde que el gen de ratn est mapeado pero no est
secuenciado y no se sabe si la similitud de secuencia es
alta, ni tampoco si hibridan entre s)?
c) Cmo verificara, funcionalmente, si el gen de
humanos cumple la misma funcin que su homlogo en
ratones? Disee un experimento recordando que los
genes y las protenas humanas son funcionales en rato-
nes y viceversa.
Respuesta: a) La sintenia evolutiva (conservacin filo-
gentica de mapas genticos entre especies emparenta-
das) y, tal vez, las caractersticas de los genes en cuanto
a su rol fisiolgico.
b) Clonado posicional (cualquiera de sus variantes es
correcta). Otras alternativas de clonado ingeniosas pue-
den llegar a aceptarse.
c) Hacer estudios de complementacin en ratones trans-
gnicos (alz/alz, es decir homocigotas recesivos) usan-
do el gen humano como transgn. Espero que a ninguno
se le ocurra hacer humanos transgnicos para Alzhei-
mer..
2) El clonado molecular de genes de resistencia (R) a
enfermedades en plantas es un viejo objetivo de los fi-
topatlogos que trabajan en interaccin husped-
patgeno. A fines de los 90 se clonaron los primeros
genes R por estrategias de clonado posicional (ver figu-
ra) y en la actualidad ya hay decenas de estos genes en
el GeneBank y otras bases de datos. Ud se involucra en
un proyecto de este tipo para su tesis y tiene que resol-
ver un nmero de cuestiones:
En el paso O se identificaron marcadores moleculares
ligados al locus a distancias genticas del orden de los
10 cM. En el paso O se obtuvieron marcadores ms
cercanos de forma tal de disminuir las distancias fsicas
para que en el paso O poder trabajar con un nmero no
muy grande de clones.
a) Con qu tipo de colecciones (libraries) de clones se
trabaja para hacer esto?
i) genmicos
ii) o de cDNA
y por qu?
b) Qu tipo de vectores se utilizan (plsmidos, fagos,
csmidos, BAC o YAC) y porqu?
c) Suponiendo que los marcadores moleculares emplea-
dos (M1, M2, M3 y M4) son RFLPs Cmo se hace
(metodolgicamente) para identificar los clones 1, 2, 3
y 4 de la figura y su ordenamiento posicional (mapa
fisico)?
d) Cul es el tamao fsico aproximado (en kilo-pares
de bases) de 1 unidad de mapa gentico (1 cM) en el
ejemplo de la figura?
Humano
hs3
hs1
gdm
Fig. 1
15
12
cM
hs3
alz
hs1
13
10
cM
Ratn
42
Por qu esta diferencia de unidades? Cmo se mide
cada una de ellas?
Una vez identificados los clones correspondientes a esta
regin cromosmica, sus insertos se subdividen en ta-
maos ms chicos (paso O) para su subclonado y trans-
ferencia a plantas (paso O) para evaluar a estas ltimas
fenotpicamente como R (resistentes) o S (sensibles) a
la enfermedad.
e) Para introducir los segmentos de ADN en plantas se
requiere de algn paso de subclonado en vectores espe-
ciales? Se requiere, dentro de lo anterior, modificar el
promotor y el terminador? Por qu? Se debe tener
alguna consideracin acerca del genotipo que se va a
transformar? Es decir se puede usar un clon de la
misma planta que se us para clonar el gen de resisten-
cia?
En el ltimo paso (el O) se secuencian los insertos, se
identifican las ORF (secuencias abiertas de lectura) pre-
sentes, las que se constituyen en candidatos a genes R.
f) Cmo se identifica una secuencia ORF en un inser-
to?
g) y si hay ms de una, cmo me doy cuenta de la co-
rrecta?
h) Bioinformticamente de qu manera puedo asignar-
le una posible funcin al gen?
Rta: a) Genmicos porque tengo representada una co-
pia exacta del segmento cromosmico que estoy identi-
ficando, incluyendo regiones no codificantes que me
van a servir para empalmar (identificar solapamientos
entre clones) las secuencias con las que se arma el mapa
fsico de la regin. Si usara clones de cDNA, no podra
empalmar un clon con otro porque no habra secuencias
comunes entre ellos.
b) BACs o YACs porque son los que me permiten con-
tener insertos ms grandes y as poder tener reprensada
la regin cromosmica en el menor nmero de clones
posible.
c) Las sondas utilizadas para RFLP pueden utilizarse
como sondas para inspeccionar (screenear) la genote-
ca y as identificar los clones que se corresponden al
segmento cromosmico en estudio. El ordenamiento de
los insertos lo puedo deducir de estas hibridaciones. S
que el orden deducido del mapa gentico es M1-M3-
M4-M2. El mapa fsico, en cambio, slo me permite
ubicar M3 y M4 porque no tengo clones que abarquen
a M1 y M2 (+ el gen que quiero clonar) y sean conti-
guos a M3 y M4. Por lo tanto, el inserto del clon 1 (que
slo hibrida con M3) tiene que estar ubicado en un ex-
tremo y as sucesivamente. La ocurrencia de insertos
que hibridan un marcador y al gen (clones 3 y 4) facili-
tan este ordenamiento.
d) 600-700 kpb / 0,2 cM = 2000 3500 kpb
Porque uma proviene del mapeo gentico que se realiza
mediante cruzamiento y recuento de recombinantes
(unidades de recombinacin o cM) y la otra por mapeo
de restriccin donde se comparan los tamaos de los
insertos com estndares de tamao molecular en kilo
pare de bases.
e) Si se decide utilizar transformacin mediada por
Agrobacterium tumefaciens, se requiere subclonarlo en
un vector Ti. En el caso de usar biolstica (can gni-
co), no hara falta subclonar en ningn vector especial.
No se requiere cambiar secuencias regulatorias por-
que estamos trabajando con genes y secuencias nativas
y el experimento no requiere cambiar la regulacin de
su expresin. No se puede elegir un clon de la planta de
la cual se clon el gen porque sera resistente indepen-
dientemente del inserto que se le introduzca. Debera
elegirse un genotipo susceptible a la enfermedad.
f, g y h) Identificando codones de iniciacin (ATG) y
terminacin (alguno de los 3 codones STOP) con pro-
gramas informticos. Esto se podra complementar me-
diante la identificacin de secuencias consenso de pro-
motores, terminadores, splicing, etc.Mediante el uso de
BLAST y comparacin con otras secuencias ya publi-
cadas.
3) Dos variedades puras de maz (A y B) pueden ser
distinguidas por una serie de RFLPs, los cuales dan los
siguientes patrones:
Un consorcio internacional de secuenciacin del geno-
ma del maz de otra variedad, le pide que usted le enve
sondas para poder anclar una coleccin de BACs al
mapa gentico. Usted conoce la localizacin en el mapa
gentico de los 7 RFLPs de la figura y sabe, adems,
que las enzimas utilizadas no cortan dentro de los frag-
mentos utilizados como sonda. Cules sondas enviara
y por qu?
Rta: Enviara las sondas correspondientes a los RFLPs
213, 48 y la 1112 dado que parecen ser de copia nica.
Evitara las dems porque parecen hibridizar con ms
de una regin del genoma y por lo tanto podran inducir
al error al hibridizar con BACs que no son contiguos.
4) El Dr. Lirn estudi la duracin de la fase alfa en el
sueo de ratones y encontr un mutante, al que llam
sleepy, cuya fase alfa duraba 2 horas, mientras que en
los ratones salvajes la misma es de 4 horas. Al cruzar
un sleepy con otro ratn salvaje, la mitad de los descen-
dientes result mutante y la mitad salvaje.
a) El ratn analizado era homocigota o heterocigota
para el gen sleepy? Se trata de un alelo dominante, re-
cesivo, codominante o semidominante? Justifique su
respuesta.
Al concurrir a un congreso internacional de sonambu-
lismo, Lirn se encuentra con un colega que encontr
otro mutante similar. El investigador decide verificar si
el gen involucrado es el mismo que l encontr. Para
ello, utiliza una lnea homocigota para el gen sleepy y la
cruza con los ratones, tambin homocigota para el gen
en cuestin, del colega. Todos los ratones de la F1 tu-
vieron sueo alfa reducido. Luego cruz la F1 con rato-
nes salvajes. De los 200 descendientes que obtuvo, 180
presentaron sueo alfa reducido mientras que 20 pre-
sentaban sueo normal.
b) Los alelos mutantes encontrados pertenecan ambos
al mismo gen? Justifique su respuesta. En caso que los
genes fueran distintos estaran ligados? a qu distan-
cia?
El siguiente objetivo del Dr. Lirn decidi mapear el
gen mutado. Para ello, utilizando 200 marcadores mole-
culares, logr ubicarla entre dos marcadores M1 y M2
separados entre s por 0,3 cM (aproximadamente
600.000 pb). Despus, el Dr. Lirn construy una geno-
teca de BAC y encontr 4 BACs solapantes (A-D) que
43
abarcaban toda la regin entre los marcadores M1 y
M2:
Con estos BACs (que haban sido obtenidos utilizando
DNA genmico de un ratn sleepy homocigota) el Dr.
Lirn gener 4 lneas transgnicas (una para cada BAC:
LA, LB, LC y LD respectivamente) transfectando clu-
las de un ratn salvaje. Los ratones de las lneas LB y
LC tuvieron un sueo reducido de 2 horas, igual a la de
sleepy mientras que los ratones de las lneas LA y LD
presentaban duraciones de sueo similares a los norma-
les.
c) Qu caractersticas deberan tener los marcadores
moleculares utilizados por el Dr Lirn para realizar este
mapeo? De qu tipo de marcadores se tratara, proba-
blemente? Cmo explica los resultados obtenidos? En
qu regin del mapa que se presenta se encuentra el gen
mutado?
d) Hubiera obtenido los mismos resultados transfec-
tando ratones sleepy con BACs procedentes de ratones
salvajes? Por qu?
Durante el tiempo que le tom realizar todos estos ex-
perimentos, sali publicado el borrador del genoma de
ratn (salvaje) por lo que, basado en la secuencia de la
regin en la que determin que estaba su gen mutante,
encontr 3 posibles genes.
MM_213: secuencia homloga a un gen de Danio rerio
(pez cebra) pero careciendo promotor.
MM_437: gen constitutivo involucrado en la gluclisis.
MM_854: gen de funcin desconocida que presenta
enhancers propios de genes que se expresan en el siste-
ma nervioso central.
e) Cmo se hizo, bioinformticamente hablando, para
adjudicar estas funciones hipotticas a estos 3 genes?
Explique, si resulta pertinente, si debe emplear tcnicas
moleculares adicionales y programas informticos.
f) Cul o cules elegira como genes candidatos a estar
relacionados con el sueo?
Respuestas esperadas:
a) Heterocigota. Si estas mutaciones se pueden detectar
fenotpicamente es porque son dominantes.
b) Si se tratara del mismo gen la F1 tendra ambos ale-
los del mismo gen mutantes (homocigota). Al realizar la
cruza de la F1 con una cepa salvaje, todos los ratones
(salvo que haya recombinacin intragnica que es muy
poco probable) resultarn heterocigotos:
-la mitad para la mutacin de la lnea sleepy
-la otra mitad para la mutacin de la lnea del colega
Dado que ambas mutaciones son dominantes, todos los
ratones de la descendencia deberan tener sueo reduci-
do. Dado que ste no es el caso (hay un 10% de ratones
salvajes) podemos descartar que se trate del mismo gen.
Si el gen mutado es el C/c y el mutado en la otra lnea
es el R/r entonces la F1 de la cruza ser CcRr. Al cruzar
con ratones salvajes (ccrr), si los genes no estn ligados
tendremos CcRr, Ccrr, ccRr y ccrr donde to-
dos los genotipos salvo el ccrr (que tiene memoria nor-
mal) tienen memoria reducida (algunos genotipos ms
que otros). Es decir que si los genes no estn ligados
esperaramos tener de ratones con memoria normal,
lo cual no es el caso. Por lo tanto, los genes estn liga-
dos.
CCrr x ccRR
C r x c r
c R c r
Las gametas parentales del cruzamiento prueba son Cr
y cR mientras que las recombinantes son CR y cr. Dado
que en la descendencia del cruzamiento prueba 20 indi-
viduos son ccrr, entonces un 10% de las gametas pro-
ducidas por la F1 son cr. Un porcentaje equivalente de-
be ser CR que es el producto complementario de re-
combinacin. Es decir que el 20% de las gametas son
recombinantes con lo que la distancia entre los genes es
de 20 u.m.
c) Debi utilizar marcadores STS, es decir marcadores
de localizacin nica.
Si un BAC porta el alelo mutante al generar la lnea
transgnica, sta tendr insertado en algn lugar del
genoma. Como el alelo mutante es dominante se va a
poder expresar an en presencia de uno (suponiendo
reemplazo allico) o dos (suponiendo integracin ect-
pica) copias del alelo salvaje.
Dado que los BACs B y C presentan el fenotipo mutan-
te ambos BACs contienen al gen completo. Por este
motivo podemos localizar al gen en la zona de solapa-
miento de los BACs B y C (de aproximadamente 100
kpb).
d) No, si hubiese usado BACs procedentes de ratones
salvajes para transfectar ratones sleepy, los ratones
transfectados hubiesen sido todos con fenotipo sleepy
ya que este alelo es dominante sobre el alelo normal.
e) Se secuenci la regin de solapamiento de los clones
BAC B y C, subclonados en vectores plasmdico, se
realiz un ensamblado de los mismos y los contigs ob-
tenidos fueron analizados para la deteccin de marcos
de lectura abiertos y se compararon los mismos con se-
cuencias en bases de datos, utilizando programas de
comparacin local como BLASTX y BLASTN pudien-
do predecir en base a la similitud de las secuencias con-
tenidas en esa regin con secuencias de funcin conoci-
da disponibles en bases de datos
f) El MM_213 no es un buen candidato porque como le
faltan secuencias presentes en los promotores, posible-
mente no se transcriba (y sea un pseudogen).
El MM_437 tampoco es un buen candidato porque es
un gen constitutivo y fundamental para la gluclisis. Su
mutacin debera afectar ms cosas que el sueo y de
hecho posiblemente dicha mutacin sea letal en homo-
cigosis.
El MM_854 es un buen candidato porque es un gen que
posiblemente se exprese diferencialmente en sistema
nervioso central.
M1 M2
A
B
C
D
100 kpb
M1 M2
A
B
C
D
M1 M2
A
B
C
D
100 kpb
44
Desarrollo, epigentica, Determinacin del Sexo,
etc.
1) Las etapas ms tempranas del desarrollo en moscas
se explican, en parte, por la distribucin subcelular de
los transcriptos de genes maternos como el bicoid (bcd)
y el nanos (nos), dado que los mismos estn adheridos
al citoesqueleto. Con el objeto de estudiar por donde se
une un ARN mensajero al citoesqueleto, se realizaron
una serie de construcciones quimricas:
1 Promotor nos 5UTR nos Codif.
nos
3UTR
bcd
2 Promotor nos 5UTR nos Codif.
bcd
3UTR
nos
3 Promotor nos 5UTR bcd Codif.
nos
3UTR
nos
UTR (untranslated regin) simboliza el DNA que espe-
cifica los extremos 5 y 3 no codificantes del mRNA.
Como puede observarse, se reemplazaron 3 segmentos
de nos (de a uno por vez) por los respectivos segmentos
de bcd.
Con los mismos, se transformaron genticamente mos-
cas silvestres y se analizaron los embriones tempranos
por hibridacin in situ de mRNAs en el embrin utili-
zando como sonda un cDNA de nos (segunda fila) o
bcd (tercera fila). En la primera fila, se observa el as-
pecto del embrin en una etapa ms avanzada. La figura
siguiente muestra el resultado que se obtuvo con la
construccin 1 en moscas silvestres (primera columna)
y moscas transgnicas (segunda columna).
a) Describa brevemente las diferencias observadas entre
transgnicas y normales.
b) Cmo interpreta que, en la transgnica, la sonda
detecta mRNA de nos en la parte anterior (izquierda)
del embrin (adems de en la parte posterior)?
c)Por qu el transgnico con la construccin 1 presenta
el fenotipo mutante bicoid?
d) Brevemente qu resultados esperara con la cons-
truccin 3?
e) Eesperara resultados diferentes si, en la construc-
cin 1, se reemplaza el promotor nos por el promotor
bcd? Por qu?
3) a) fenotipos: normal y bicoid. Hibridacin in situ con
sonda nos: hibrida en la parte posterior en el normal,
anterior y posterior en el transgnico. Con la sonda bcd,
no se detectan diferencias.
b) Porque la secuencia 3UTR es la responsable de la
unin a protenas del citoesqueleto. La secuencia
3UTR bcd es diferente a la nos y pega el mRNA del
transgn nos a la parte anterior. Debe recordarse que el
transgn se adiciona y no reemplaza a los genes nor-
males presentes en la mosca. Por eso se detecta, como
era de esperar, mRNA de nos en la parte posterior igual
que en el normal.
c) Es consecuencia de la expresin, en la parte anterior,
del relocalizado producto del transgn nos, que interfie-
re con la del bcd y el resultado es un embrin con 2 co-
las (bicoid)
d) Todo dara igual que en el normal porque la regin 5
no codificante, no tiene funcin en la localizacin sub-
celular.
e) No, porque ambos genes son del mismo tipo (mater-
no) y se expresan en forma relativamente sincronizada
y similar.
2) Muchos tipos de cncer humano tienen su causa en la
hipometilacin del ADN. Para estudiar este fenmeno
se generaron ratones transgnicos conteniendo alguna
de estas construcciones:
i) Vector conteniendo un promotor de SV40 (constituti-
vo, proveniente de un adenovirus) controlando la expre-
sin de la secuencia estructural de la metiltransferasa
1
(Dnmt1) en orientacin antisentido
ii) Vector conteniendo un promotor de SV40 (constitu-
tivo, proveniente e un adenovirus) controlando la ex-
presin de la secuencia de la metiltransferasa
1 (Dnmt1)
en orientacin sentido
iii) Vector conteniendo el promotor constitutivo prove-
niente del fago controlando la expresin de la secuen-
cia estructural de la metiltransferasa
1 (Dnmt1) en
orientacin sentido.
iv) Vector conteniendo el promotor constitutivo prove-
niente del fago controlando la expresin de la secuen-
cia estructural de la metiltransferasa
1 (Dnmt1) en
orientacin antisentido
Se sabe que la enzima Dnmt1 controla la metilacin del
ADN en ratones y que su sobre-expresin permite me-
tilar exhaustivamente todo potencial ADN metilable y
que su disminucin causa una sustancial hipometilacin
del ADN en todos los tejidos.
a) Cul de los 4 vectores usara? Por qu?
b) En base al vector elegido, cmo espera que sea el
grado de metilacin general del ratn transgnico? Ex-
plique el mecanismo
c) Con cul de las siguientes tcnicas corroborara que
el ADN est hipometilado? Justifique:
i) digestin con sendas ER que reconocen sitios metila-
dos y no metilados, respectivamente, seguido de Sout-
hern Blot con la sonda Dnmt1
ii) ensayo de proteccin a la digestin por ADNasaI
iii) preparacin de ARN de ratn salvaje y ratn trans-
gnico, seguida de Northern Blot con la sonda Dnmt1
iv) digestin con ER que reconocen sitios metilados,
seguido de Southern Blot con la sonda de igf2 (insulin-
like growth factor-2, conocido gen que sufre impronta
gnica)
v) secuenciacin bisulftica genmica directa de
Dnmt1y/o igf2
vi) secuenciacin bisulftica del cDNA de Dnmt1y/o
igf2
Para la/s tcnica/s elegida/s indique los controles que
hara.
45
El ratn transgnico desarroll tumores en varios teji-
dos. Se determin que el gen Tm, candidato a causar
tumores en hgado, se encontraba hipometilado en estos
ratones. Ud. sabe que Tm presenta dos alelos, Tm1: sin
sitio para EcoRI y Tm2 con sitio para EcoRI.
d) Cmo hara para probar que Tm sufre impronta (im-
printing) en ratones salvajes? Ud cuenta tanto con rato-
nes homocigotas como con heterocigotas.
e) Suponiendo que realmente existe impronta de Tm en
el macho cmo sera la proporcin de Tm1 y Tm2 me-
tilados y no metilados en la F2, es decir los nietos de un
cruzamiento entre ratones homocigotas para Tm1 y
Tm2?
Respuesta a) El i) porque es el nico que tiene un pro-
motor que se expresa en clulas eucariticas y tiene po-
tencialidad de reducir la actividad de mutilacin blo-
queando la traduccin del gen que codifica la enzima
Dmnt 1. Contestacin no necesaria: Podra venir bien
usar al vector ii) pero slo como CONTROL contras-
tante del experimento. Las construcciones de los vecto-
res iii) y iv) no se expresaran en clulas eucariticas
porque slo funciona en bacterias.
b) Altamente reducida. El RNA antisentido (comple-
mentario) de Dmnt 1 formar una doble cadena de RNA
con el mensajero nativo dificultando su traducibilidad.
Al reducirse la cantidad de enzima, se reduce tambin el
efecto de la misma.
c) La v) dado que este tipo de secuenciacin permite
detectar nucletidos metilados. Se debe secuenciar un
gen ya caracterizado como metilado. No sabemos si
ste es el caso del gen Dmnt1 y lo ms probable es que
no lo sea. En todo caso, Dmnt1 puede servir como con-
trol (no metilado). En realidad, el control ms importan-
te es comparar con la secuenciacin comn (que es in-
sensible a la metilacin) y (como se indica despus)
ratones transgnicos vs no transgnicos. La iv) sirve si
se compara el patrn de restriccin de ratn transgnico
vs no transgnico. Tambin podra ser aceptada como
vlida si se explica que se usa ER que NO reconocen
sitios metilados, adems de los metilados para as com-
parar ambos patrones, dado que usar slo una enzima
que s reconoce sitios metilados, no es capaz de dife-
renciarlos de los no metilados. Una complicacin (que
no es necesario explicitar en la respuesta correcta) es
que los genes metilados por imprinting tienen una copia
(epialelo) metilado y otro no metilado.
d) Cruzara 2 homocigotas: por ej. homocigotas para
Tm1 y Tm2. Despus, analizara en la F1 la corres-
pondencia entre metilacin (por ej. por secuenciacin
bisulftica que, adems, me revelar la presen-
cia/ausencia del sitio EcoRI en el epialelo metilado).
(La otra alternativa es una doble digestin con ER sen-
sible/insensibles a metilacin + EcoRI seguido de
Southern). En base a cual alelo aparezca metilado de-
terminar si el imprinting es paterno o materno. La con-
firmacin del imprinting se puede hacer realizando un
cruzamiento prueba con el parental que no metila sus
gametas. Debera ver un 50% de la progenie con me-
tilacin para cada alelo.
e) 25% de individuos Tm1 homocigotas con una copia
de las 2 metiladas (Tm1
m
/Tm1), 25% Tm2 homocigotas
dem (Tm2
m
/Tm2), 25% de heterocigotas con metilacin
en Tm1 (Tm1
m
/Tm2) y 25% de heterocigotas con me-
tilacin en Tm2 (Tm2
m
/Tm1).
3) Los genes fushi-tarazu (ftz) y engrailed (en) codifi-
can factores de transcripcin con homeodominio y pue-
den producir la expresin de otros genes. Ambos genes
actan aproximadamente en el mismo momento durante
el desarrollo y en la misma regin para especificar des-
tinos celulares en los segmentos corporales. Estudios
experimentales de mutantes evidenciaron que en em-
briones ftz (-), no hay protena engrailed mientras que
en embriones en (-) la expresin de ftz es normal.
i) Regula engrailed la expresin de fushi-tarazu o su-
cede lo contrario?
ii) Indique cuando se expresan estos genes y cual es la
funcin principal de cada uno de ellos.
iii) Se expresan estos genes durante toda la vida del
organismo? En caso afirmativo justifique.
Rta:
4) Durante el desarrollo de la mosca Drosophila mela-
nogaster participan varias molculas conocidas como
morfgenos, siendo en las primeras etapas, de origen
materno (los mRNAs que codifican para dichos morf-
genos se traducen en el huevo, pero provienen de las
clulas nutricias maternas). Ejemplo de esto y respon-
sables del establecimiento del eje antero-posterior son:
-en la parte anterior del embrin, BICOID (bcd) y
ms tardamente HUNCHBACK (hb), productos de los
respectivos mRNA maternos.
-en la parte posterior del embrin, NANOS (nos) y
ms tardamente CAUDAL (cd), productos de los res-
pectivosmRNA maternos. Se demostr tambin que:
-la protena bcd reconoce el 3UTR del mRNA de cd
y enla regin promotora del gen hb
-la protena nos reconoce el 3UTR del mRNA de hb.
I) Qu tipo de accin presentan bcd y nos segn lo
comentado anteriormente? Para contestar complete el
siguiente esquema con flechas de unin: (convencio-
nes: activacin, ---| inhibicin).
II) Con toda la informacin que tiene acerca de bcd,
complete los fenotipos que espera observar en los expe-
rimentos de la Fig asignando en cada caso, alguna de
las 4 opciones que se muestran debajo de la figura, en
donde se ha ensayado el agregado de mRNA bcd en
embriones con diferentes fondos genticos En la Figu-
ra siguiente, complete (con flechas) el esquema de los
resultados de inyeccin de mRNA de bcd.
46
Rta I)
Explicacin: bcd y nos son los morfgenos de la parte anterior y posterior: bcd actua como factor de trans-
cripcin para hb regulando positivamente su transcripcin, pero tambin es un inhibidor de la traduccin del
morfgeno cd, que es ms tardo. Anlogamente, nos es un inhibidor del morfgeno ms tardio de la parte ante-
rior, hb.
II) Explicacin: bcd es el morfgeno principal anterior, ya que donde se coloca, se generan zonas que darn
lugar a estructuras anteriores (cabeza y torax). El esquema del primer experimento sera anlogo a una comple-
mentacin (mutante bcd-, con fenotipo WT por agregado del morfgeno anterior en la zona correspondiente).
5) Usted est estudiando el gen HSP23 de la Rana
de las Pampas ya que se sospecha que est involu-
crado en la determinacin del sexo. Para abordar este
problema en primer lugar realiz el siguiente experi-
mento. Transfect oocitos de rana con las siguientes
construcciones:
Luego de transfectar, cultiv los oocitos a 25
0
C o bien
a 37
0
C durante 24 hs y midi la fluorescencia verde.
Los resultados fueron los siguientes:
Temperatura a la que cre-
ci los oocitos
Construccin
transfectada
25
0
C 37
0
C
nada 2 U.F. 2 U.F.
A 50 U.F. 100 U.F.
B 100 U.F. 100 U.F.
C 100 U.F. 200 U.F.
D 200 U.F. 200 U.F.
Nota: U.F. significa Unidades de fluorescencia
Desarrollo normal Desarrollo en mutante bcd- inyectado adelante inyectado al medio iny. atrs en salvaje
Las 4 opciones para los 3
casos incgnita
? ? ?
bcd nos
hb cd mRNA
hb
mRNA cd gen
HB
47
Nota: Suponga que entr la misma cantidad de DNA
de cada construccin en cada transfeccin.
a) i- Cree usted que la expresion de HSP23 se ve
afectada por la temperatura? Cmo? ii- Cmo com-
probara su hiptesis usando alguna tcnica de biolog-
a molecular (no hace falta describir en detalle) (nota:
usted dispone de anticuerpos anti HSP23 y tambin
conoce la secuencia de HSP23)?
Rta a) esperada: i-Al comparar los niveles de expre-
sin de la protena de fusin Hsp23-GFP en la cons-
truccin A se ve que a 25
0
C hay la mitad de protena
que a 37
0
C.
La expresin de HSP23 no parece estar afectada a
nivel transcripcional como se deduce al comparar los
niveles de GFP en la transfeccin con B, ya que la
abundancia de GFP es igual a ambas temperaturas.
Al observar los resultados de la tranfeccin con C
tambin se observa que la expresin es la mitad a 25
grados. En este caso se uso un promotor constitutivo
que no debera cambiar su transcripcin a distintas
temperaturas como se comprueba del control con la
construccin D.
De todo lo anterior se deduce que el ORF de Hsp23
hace que disminuyan los niveles de protena a la mi-
tad. Esto podra deberse a que: A- la protena Hsp23
tiene una tasa de degradacin un 50% mayor a 25
0
C.
B- Tambin podra ser que la tasa de traduccin del
mensajero sea un 50% menor a 25 grados. C- O que la
tasa de degradacin del mensajero sea un 50% mayor
a 25 grados. Las tres alternativas son correctas.
ii- Para comprobar todas estas alternativas podra
comparar los niveles de mRNA.
En el caso de la hipotesis A y B los niveles de mRNA
no cambian.
En el caso de la hipotesis C habra mas mensajero a
37
0
C.
Pueden elegir la tecnica de RT (Retrotranscripcion) y
luego Q-PCR (Real time PCR). Tambien se puede
aceptar Northern.
Posteriormente llev a cabo cruzamientos de ranas de
distintos genotipos y analiz la descendencia. A con-
tinuacin se muestran los cruzamientos.
b) Cree usted que hay algn efecto de influencia ma-
terna en la determinacin del sexo de los descendien-
tes de las F1?
Rta b) esperada: No, ya que los cruzamientos recpro-
cos dan la misma frecuencia en la descendencia. (La
hiptesis de que la presencia de la protena HSP23
provenga solo de la madre se descarta por este expe-
rimento. Ambos parentales aportan para la dosis de
protena HSP23).
c) Explique los resultados de los cruzamientos.
Proponga una hiptesis para explicar las frecuencias
de las F1.
Rta c) esperada: La dosis de la protena HSP23 podra
determinar el sexo. Si hay una dosis de 100% de
HSP23 o ms los individuos sern hembras y si hay
menos sern machos. En el caso del genotipo
HSP23
+
/HSP23
+
a 37
0
C habra 200% de HSP23 (ca-
da alelo aporta 100 unidades de HSP23) y serian
hembras. A 25
0
C 100% de HSP23 (cada alelo aporta
50 unidades de HSP23) y tambin serian hembras.
Genotipo HSP23
+
/hsp23
-
a 37
0
C hay 100% de HSP23,
y son hembras. A 25
0
C habra 50% de HSP23 y se-
rian machos.
Genotipo hsp23
-
/hsp23
-
hay 0% de HSP23 tanto a 37
como a 25
0
C y serian machos.
6) Las situaciones de estrs en etapas tempranas del
desarrollo neurolgico influyen fuertemente en la sa-
lud mental. Se desarroll un modelo experimental de
estrs consistente en separar peridicamente a las ma-
dres de las cras en edades tempranas de roedores
(estrs temprano), que tiene como consecuencia un
aumento perdurable de la secrecin de glucocorticoi-
des y otros disturbios de tipo hormonal, que estn aso-
ciados a los desrdenes cognitivos y de comporta-
miento que se observan como resultado del tratamien-
to experimental.
La metilacin del DNA es un mecanismo epigentico
de regulacin sospechado de influir en el desarrollo de
enfermedades psiquitricas. En un trabajo, se evalu
el efecto del estrs temprano en el epigenoma (sepa-
rando a las cras de sus madres por determinados per-
odos de tiempo) estudiando la metilacin comparati-
va de distintos genes que contienen regiones ricas en
CGs (islas CG) en ratones estresados y no estresados.
a) Con qu tcnica se puede hacer esta compara-
cin?
Mediante esta tcnica, Murgatroyd y col. (2009) ana-
lizaron el grado de metilacin del DNA de 4 islas CG,
una de las cuales (CGI3) coincide con un enhancer
importante para la expresin del gen de la vasopresi-
na (hormona que estimula la liberacin de glucocorti-
coides).
b) Por qu cree que incluyeron en el anlisis una isla
CG que coincide con el enhancer del gen de vasopre-
sina? qu consecuencias podra traer una alteracin
en la metilacin de esta regin?
Como resultado, se observaron diferencias en la meti-
lacin de las islas CG especficamente en algunos te-
jidos y no en otros.
c) Qu importancia puede tener esto desde el punto
de vista psiquitrico-cognitivo?
Posteriormente, se estudi la unin de la protena
MeCP2 a las 4 islas CG. Esta protena, adems de
unirse a secuencias CG metiladas, es capaz de mediar
el proceso de silenciamiento transcripcional.
d) Traera esto aparejado alguna consecuencia adi-
cional o diferente a lo que contest en b)?
48
Figura: Cuantificacin de la asociacin de MeCP2 a
las distintas regiones analizadas (1 a 7) a los 10 das y
6 semanas de edad en ratones controles (barras blan-
cas) y ratones estresados (barras negras). Los rectn-
gulos blancos de la izquierda representan los exones
del gen de vasopresina (AVT) y el rectngulo gris re-
presenta el enhancer que regula la expresin de este
gen. La cuantificacin se realiz con la tcnica de
ChIP vista en tericas pero no es esencial conocerla
para resolver este problema.
e) Todas las islas de CG mostraron idntico compor-
tamiento respecto a la unin de la protena MeCP2?
Explique.
f) En base a estos resultados el estrs temprano au-
mentara o disminuira el nivel de expresin de la va-
sopresina?
g) Considera que la metilacin ejerce un efecto tem-
poral (reversible con el tiempo) o permanente sobre la
determinacin psicolgica de los ratones? Justifique.
Rtas: a) Secuenciacin bisulftica (tratamiento pre-
vio del ADN con bisulfito para convertir las cito-
sinas no metiladas a uracilos y luego tratar de de-
terminar el nivel de metilacion por PCR utilizan-
do primers especficos o secuenciacin). Otra al-
ternativa: restriccin con enzimas sensibles e insensi-
bles a la metilacin del sitio de reconocimiento segui-
do por PCR o Southern.
b) Porque es una regin particularmente importante
para la regulacin de un gen (el de la vasopresina en
este caso), porque all se unen factores de transcrip-
cin que regulan su expresin. Una regin rica en GCs
ubicada en una regin no codificante o en secuencias
que no tienen funcionalidad reconocida tendrn una
menor probabilidad de tener roles especficos de regu-
lacin de un gen en particular.
Cambios en la afinidad por los factores de transcrip-
cin e histonas.
c) Tiene particular importancia en los tejidos en los
que se produce la hormona porque no es lo mismo un
efecto local o generalizado o en un tejido de secrecin
a sangre que en uno sin esta caracterstica. Una modi-
ficacin en el tejido que se especializa en la produc-
cin de una hormona tiene significacin funcional en
los efectos que esta tenga. En cambio, una modifica-
cin que altere la expresin de una hormona en un
tejido como el pulmn, por ejemplo, slo tendra un
efecto local en el caso que pase de estar reprimido a
expresarse
d) El silenciamiento transcripcional reprime mucho
ms fuertemente la transcripcin.
e) No, solamente la CGI3 muestra afinidad por la
protena y diferencias significativas en su unin entre
tratamiento y testigo.
f) Aumenta porque se produce desmetilacin y, con-
secuentemente, falta de silenciamiento.
g) Permanente porque las diferencias se mantienen
en el tiempo.