Arabidopsis thaliana
Arabidopsis thaliana es una especie de planta con flor de la familia de las brasicáceas, a la que también pertenecen la coliflor y la mostaza. Esta pequeña planta herbácea anual es nativa de Europa, Asia y el noroeste de África. Debido a sus características, es el organismo modelo vegetal más utilizado para el estudio de la genética en plantas y la botánica en general. Fue la primera planta cuyo genoma fue completamente secuenciado.[1]
Arabidopsis thaliana | ||
---|---|---|
Arabidopsis thaliana. | ||
Taxonomía | ||
Reino: | Plantae | |
División: | Angiospermae | |
Clase: | Eudicotyledoneae | |
Subclase: | Rosidae | |
Orden: | Brassicales | |
Familia: | Brassicaceae | |
Género: | Arabidopsis | |
Especie: |
Arabidopsis thaliana (L.), Heynh. | |
Distribución | ||
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Sinonimia | ||
El genoma haploide de A. thaliana consta de cinco cromosomas y 125 millones de pares de bases, por lo que es relativamente pequeño en comparación con el de otras especies vegetales, lo cual facilita su estudio. Sin embargo, aunque muchos de sus 26.000 genes aún no tienen función conocida, mucho se ha descubierto sobre el papel de cada uno en la fisiología de la especie, con aportaciones para el conocimiento de la genética de las plantas en general.[2]
Descripción
editarPlanta herbácea con una altura comprendida normalmente entre los 1 y 3 dm. El tallo es erecto con ramificación un poco alejada de la base. Desde la base de la planta está cubierto de pelos ramificados, dispuestos muy densamente y cortos (tomentosos), que van desapareciendo o se reduce su densidad a medida que nos aproximamos a las inflorescencias.
Las hojas son simples de elípticas a ovales con los bordes enteros. Tiene dos tipos de hojas, las basales de hasta 2 × 0,5 cm; arrosetadas (pegadas al suelo y formando una roseta, del centro saldrá el tallo), se aprecia bien en la fotografía de las hojas basales y las caulinares (las que están a lo largo del tallo), éstas son más pequeñas como se aprecia en la fotografía son sésiles, esto es carentes de pecíolo. Las inflorescencias se presentan en racimos, en el extremo de las ramas o el tallo, no demasiados compactos, éstas se van separando unas de otras a medida que el tallo crece, por lo que los pedúnculos de los frutos maduros estarán separados del orden de un centímetro entre ellos.
Las flores hermafroditas (con los atributos de ambos sexos) de unos 5 mm de diámetro, normalmente con cuatro pétalos blancos, espatulados. Se distinguen en ella sin dificultad todos los órganos florales. El fruto es una silicua linear aparece del centro de la flor, alargado, de unos 3 cm de longitud y 1 mm de anchura, cilíndrico, un poco arqueado y sin pelos.[3][4][5][6] Éstos contienen dos cavidades en las que se alojan las semillas ovoideas en hilera, sin tocarse entre ellas, en número elevado; unas 30 por silicua. En la madurez tienen un color anaranjado son lisas y miden medio milímetro aproximadamente.
Es una planta anual, raramente bienal; con un ciclo corto, inferior a cinco meses. En laboratorios se obtiene entre las 8 y 10 semanas.
En el año 1907 el Dr. F. Laibach (1885-1966) descubrió el número de cromosomas de la Arabidopsis thaliana: 2n = 10; sugiriendo el potencial para la experimentación genética, entre otras razones por la brevedad de su ciclo vital.
En el año 1996 más de doscientos científicos que trabajan en 35 instituciones diferentes crean el proyecto de investigación, AGI (Iniciativa para el Genoma de la Arabidopsis). En diciembre del año 2000 se presentó por vez primera el mapa genético de la planta con 25 498 genes identificados que codifican proteínas de 11 000 familias, la Arabidopsis thaliana, se convertía así en la primera planta cuyo genoma ha sido secuenciado.
Su genoma posee un tamaño de aproximadamente 135 Mb, y durante bastante tiempo se pensó que su genoma era el más pequeño de entre las plantas con flores. Hoy día se sabe que las plantas del género Genlisea poseen un tamaño de genoma más pequeño, del orden de 63,5 Mb.
Basónimo
editarEs publicado por vez primera en Species plantarum en 1753 por Carlos Linneo (1707 - 1778) con el nombre de Arabis thaliana L. y en 1842 en Flora von Sachsen como Arabidopsis thaliana Heynh. (1800-1860).
Sinonimia
editar- Arabidopsis thaliana var. apetala O.E.Schulz
- Arabidopsis thaliana var. brachycarpa Andr.
- Arabidopsis thaliana var. burnatii (Briq.) Briq.
- Arabidopsis thaliana var. genuina Briq.
- Arabidopsis thaliana var. pusilla (Hochst. ex A.Rich.) O.E.Schulz
- Arabidopsis thaliana var. thaliana
- Arabis arcuata
- Arabis crantziana
- Arabis pubicalyx Miq.
- Arabis pubicalyx var. soyensis H.Boissieu
- Arabis scabra Gilib.
- Arabis thaliana var. pubicalyx (Miq.) Makino
- Arabis zeyheriana Turcz.
- Cardamine pusilla
- Conringia thaliana (L.) Rchb.
- Crucifera thaliana (L.) E.H.L.Krause
- Erysimum pubicalyx (Miq.) Kuntze
- Erysimum thalianum (L.) Fritsch, 1890
- Hesperis thaliana (L.) Kuntze
- Nasturtium thaliana (L.) Andrz.
- Phryne gesneri Bubani
- Pilosella thaliana (L.) Kostel.
- Sisymbrium bellidifolium Poir.
- Sisymbrium thalianum (L.) Gaudin
- Stenophragma thalianum (L.) Celak.
NOTA: Los nombres que presentan enlaces son sinónimos en otras especies.[7]
Etimología
editarArabis de la primera clasificación que hizo Linneo y del griego opsis que se traduce por parecido o con apariencia.
Thaliana, en honor al médico alemán Johannes Thal (1542 - 1583), quien descubrió la planta en las montañas de Harz, que están situadas en el centro de Alemania, (hoy convertido en el Parque nacional de Harz en Baja Sajonia) llamándola Pisonella siliquosa
Procedencia y distribución
editarPresente en los cinco continentes; escasa en América del Sur, Asia y Canadá. En la península ibérica se encuentra en todas las provincias.
Hábitat
editarEs endémica de Europa, Asia, noroeste de África, islas británicas, sur de Azores y Marruecos, este de Japón, sureste y norte de India.[1] Se encuentra en los bordes de los caminos, terrenos sueltos y secos.
Usos
editarAl conocerse su mapa genético,[8][9][10] esta planta es ampliamente utilizada para la experimentación genética.
En el año 1907 el Dr. F. Laibach (1885-1966) descubrió el número de cromosomas de la Arabidopsis thaliana: 2n = 10; sugiriendo el potencial para la experimentación genética, entre otras razones por la brevedad de su ciclo vital.
En el año 1996 más de doscientos científicos que trabajan en 35 instituciones diferentes crean el proyecto de investigación, AGI (Iniciativa para el Genoma de la Arabidopsis). En diciembre del año 2000 se presentó por vez primera el mapa genético de la planta con 25 498 genes identificados que codifican proteínas de 11 000 familias, la Arabidopsis thaliana, se convirtió así en la primera planta cuyo genoma ha sido secuenciado.
Su genoma posee un tamaño de aproximadamente 135 Mb, y durante bastante tiempo se pensó que su genoma era el más pequeño de las plantas con flores. Hoy día se sabe que las plantas del género Genlisea poseen un tamaño de genoma más pequeño, del orden de 63,5 Mb.[11]
Imágenes
editar-
Inflorescencias.
-
Hojas del tallo diferentes a las basales.
-
Detalle de las hojas basales más grandes.
-
Fruto.
Referencias
editar- ↑ a b Germplasm Resources Information Network: Arabidopsis thaliana
- ↑ Arabidopsis Genome Initiative (14 de diciembre de 2000). «Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana». Nature (en inglés) 6814 (408): 914-930. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692.
- ↑ Flora del Noroeste de Europa: Arabidopsis thaliana Archivado el 8 de diciembre de 2007 en Wayback Machine.
- ↑ Blamey, M. & Grey-Wilson, C. 1989. Flora de Bretaña y Norte de Europa. ISBN 0-340-40170-2
- ↑ Flora de Pakistán: Arabidopsis thaliana
- ↑ Flora de China: Arabidopsis thaliana
- ↑ https://www.gbif.org/species/3052436
- ↑ Rensink WA, Buell CR (June 2004). «Arabidopsis to rice. Applying knowledge from a weed to enhance our understanding of a crop species». Plant Physiology 135 (2): 622-9. PMC 514098. PMID 15208410. doi:10.1104/pp.104.040170.
- ↑ Coelho SM, Peters AF, Charrier B, Roze D, Destombe C, Valero M, Cock JM (December 2007). «Complex life cycles of multicellular eukaryotes: new approaches based on the use of model organisms». Gene 406 (1–2): 152-70. PMID 17870254. doi:10.1016/j.gene.2007.07.025.
- ↑ Platt A, Horton M, Huang YS, Li Y, Anastasio AE, Mulyati NW, Agren J, Bossdorf O, Byers D, Donohue K, Dunning M, Holub EB, Hudson A, Le Corre V, Loudet O, Roux F, Warthmann N, Weigel D, Rivero L, Scholl R, Nordborg M, Bergelson J, Borevitz JO (February 2010). «The scale of population structure in Arabidopsis thaliana». En Novembre, John, ed. PLOS Genetics 6 (2): e1000843. PMC 2820523. PMID 20169178. doi:10.1371/journal.pgen.1000843.
- ↑ Bennett MD, Leitch IJ, Price HJ, Johnston JS (April 2003). «Comparisons with Caenorhabditis (approximately 100 Mb) and Drosophila (approximately 175 Mb) using flow cytometry show genome size in Arabidopsis to be approximately 157 Mb and thus approximately 25% larger than the Arabidopsis genome initiative estimate of approximately 125 Mb». Annals of Botany 91 (5): 547-57. PMC 4242247. PMID 12646499. doi:10.1093/aob/mcg057.