2003/04 ging die neu gegründete A-Junioren-Bundesliga in ihre erste Saison. Sie wurde in drei Staffeln gespielt.

Am Saisonende spielten die drei Staffelsieger sowie der Vizemeister der Staffel Süd/Südwest um die deutsche Meisterschaft. Die Halbfinals wurden in Hin- und Rückspiel, das Finale in einem Spiel ausgetragen.

Die drei letztplatzierten Mannschaften der drei Staffeln stiegen in die Regionalligen ab.

Deutscher A-Juniorenmeister wurde der FC Bayern München, der sich im Finale gegen den VfL Bochum mit 3:0 durchsetzen konnte.

Nord/Nordost

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Pl. Verein Sp. Tore Punkte
01. Hannover 96 26 73:029 59
02. Hertha BSC 26 60:029 56
03. Werder Bremen 26 65:037 51
04. FC Carl Zeiss Jena 26 62:035 51
05. Hansa Rostock 26 49:043 43
06. VfL Wolfsburg 26 57:035 42
07. Hamburger SV 26 39:047 40
08. Tennis Borussia Berlin 26 62:042 38
09. FC St. Pauli 26 42:056 31
10. Tasmania Gropiusstadt 26 40:056 31
11. FV Dresden-Nord 26 31:036 28
12. VfB Leipzig 26 31:043 27
13. VfL Osnabrück 26 26:059 20
14. FC Union 60 Bremen 26 21:111 01
  • Teilnehmer an der Endrunde um die deutsche Meisterschaft
  • Absteiger
  • Torschützenliste

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    Spieler Verein Tore
    1. Albanien  Besart Berisha Tennis Borussia Berlin 20
    2. Turkei  Sezai Demircan Hannover 96 18
    Deutschland  Sascha Schrödter Hertha BSC 18
    4. Deutschland  Fabian Montabell Hannover 96 16
    5. Deutschland  Aaron Hunt Werder Bremen 15
    Pl. Verein Sp. Tore Punkte
    01. VfL Bochum 26 76:16 64
    02. 1. FC Köln 26 77:25 62
    03. Borussia Dortmund 26 77:31 53
    04. FC Schalke 04 26 47:23 46
    05. Bayer 04 Leverkusen 26 76:46 44
    06. SG Wattenscheid 09 26 44:35 41
    07. Borussia Mönchengladbach 26 62:60 39
    08. Rot-Weiss Essen 26 43:54 33
    09. Fortuna Düsseldorf 26 37:60 33
    10. Arminia Bielefeld 26 48:61 27
    11. Alemannia Aachen 26 40:57 27
    12. SCB Viktoria Köln 26 40:82 20
    13. KFC Uerdingen 05 26 27:96 12
    14. SC Paderborn 07 26 25:73 11
  • Teilnehmer an der Endrunde um die deutsche Meisterschaft
  • Absteiger
  • Torschützenliste

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    Spieler Verein Tore
    1. Deutschland  Mustafa Kučuković VfL Bochum 25
    2. Deutschland  René Schnitzler Borussia Mönchengladbach 17
    3. Italien  Massimo Ornatelli Borussia Dortmund 15
    4. Tunesien  Sami Allagui Alemannia Aachen 14
    Deutschland  Marcel Reichwein Bayer 04 Leverkusen 14

    Süd/Südwest

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    Pl. Verein Sp. S U N Tore Diff. Punkte
     1. FC Bayern München  26  22  1  3 084:300 +54 67
     2. SpVgg Greuther Fürth  26  18  4  4 055:240 +31 58
     3. TSV 1860 München  26  14  7  5 051:260 +25 49
     4. VfB Stuttgart  26  14  4  8 064:320 +32 46
     5. SC Freiburg  26  13  5  8 065:310 +34 44
     6. Eintracht Frankfurt  26  14  2  10 042:410  +1 44
     7. 1. FC Kaiserslautern  26  12  6  8 046:290 +17 42
     8. 1. FSV Mainz 05  26  11  3  12 044:440  ±0 36
     9. 1. FC Nürnberg  26  10  4  12 048:420  +6 34
    10. Stuttgarter Kickers  26  10  4  12 039:410  −2 34
    11. SSV Ulm 1846  26  6  4  16 037:450  −8 22
    12. 1. FC Saarbrücken  26  7  1  18 032:780 −46 22
    13. Kickers Offenbach  26  4  4  18 021:830 −62 16
    14. KSV Baunatal  26  2  1  23 019:101 −82 07
  • Teilnehmer an der Endrunde um die deutsche Meisterschaft
  • Absteiger
  • Torschützenliste

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    Spieler Verein Tore
    1. Slowenien  Borut Semler FC Bayern München 30
    2. Deutschland  Marc Hiemer 1. FSV Mainz 05 15
    3. Deutschland  Mario Gómez VfB Stuttgart 14
    Deutschland  Markus Karl SpVgg Greuther Fürth 14
    4. Deutschland  Tobias Rees SC Freiburg 13
    Deutschland  Tobias Weis VfB Stuttgart 13

    Endrunde um die Deutsche A-Junioren-Meisterschaft 2004

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    Halbfinale

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    Gesamt Hinspiel Rückspiel
    VfL Bochum 7:3 SpVgg Greuther Fürth 3:0 (0:0) 4:3 (1:2)
    Bayern München 3:1 Hannover 96 1:0 (0:0) 2:1 (1:0)

    Das Finale fand am 27. Juni 2004 in Unterhaching statt.

    Paarung   FC Bayern München  VfL Bochum
    Ergebnis 3:0 (2:0)
    Datum 27. Juni 2004
    Stadion Sportpark Unterhaching, Unterhaching
    Zuschauer 3.500
    Schiedsrichter Uwe Kemmling (Burgwedel)
    Tore 1:0 Ottl (19.)
    2:0 Semler (29.)
    3:0 Thomik (59.)
    FC Bayern München Johannes Höcker – Philipp Rehm, Jan Mauersberger, Georg Niedermeier, Michael StegmayerPaul Thomik, Andreas Ottl (90. Rainer Storhas), Timo Heinze, José Luis Ortiz (60. Fabian Müller) – Borut Semler (75. Sebastian Heidinger), Markus Steinhöfer (83. Marijan Holjevac)
    Cheftrainer: Kurt Niedermayer
    VfL Bochum Polat Keser – Norman Bär, Thorsten Barg (62. Dennis Yılmaz), Marvin Matip, Hendrik Könemann – Dilaver Güçlü (85. Volkan Moğultay), Daniel Gordon, Suri Uçar (62. Fatlum Zaskoku), Dennis GroteErsan Tekkan (75. Haluk Türkeri) – Mustafa Kučuković
    Cheftrainer: Sascha Lewandowski