IKZF4

IKZF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MA7
Ідентифікатори
Символи	IKZF4, EOS, ZNFN1A4, IKAROS family zinc finger 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606239 MGI: 1343139 HomoloGene: 69103 GeneCards: IKZF4
Пов'язані генетичні захворювання
вітиліго, цукровий діабет 1-го типу, бронхіальна астма, alopecia areata
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • nucleic acid binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • bHLH transcription factor binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • zinc ion binding • protein domain specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein homooligomerization • protein heterooligomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64375	22781
Ensembl	ENSG00000123411	ENSMUSG00000002578
UniProt	Q9H2S9	Q8C208
RefSeq (мРНК)	NM_022465 NM_001351089 NM_001351090 NM_001351091 NM_001351092	NM_011772 NM_001358536 NM_001358537
RefSeq (білок)	NP_071910 NP_001338018 NP_001338019 NP_001338020 NP_001338021	NP_035902 NP_001345465 NP_001345466
Локус (UCSC)	Хр. 12: 56.01 – 56.04 Mb	Хр. 10: 128.47 – 128.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IKZF4 (англ. IKAROS family zinc finger 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 64 106.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHTPPALPRR		FQGGGRVRTP		GSHRQGKDNL		ERDPSGGCVP		DFLPQAQDSN
HFIMESLFCE		SSGDSSLEKE		FLGAPVGPSV		STPNSQHSSP		SRSLSANSIK
VEMYSDEESS		RLLGPDERLL		EKDDSVIVED		SLSEPLGYCD		GSGPEPHSPG
GIRLPNGKLK		CDVCGMVCIG		PNVLMVHKRS		HTGERPFHCN		QCGASFTQKG
NLLRHIKLHS		GEKPFKCPFC		NYACRRRDAL		TGHLRTHSVS		SPTVGKPYKC
NYCGRSYKQQ		STLEEHKERC		HNYLQSLSTE		AQALAGQPGD		EIRDLEMVPD
SMLHSSSERP		TFIDRLANSL		TKRKRSTPQK		FVGEKQMRFS		LSDLPYDVNS
GGYEKDVELV		AHHSLEPGFG		SSLAFVGAEH		LRPLRLPPTN		CISELTPVIS
SVYTQMQPLP		GRLELPGSRE		AGEGPEDLAD		GGPLLYRPRG		PLTDPGASPS
NGCQDSTDTE		SNHEDRVAGV		VSLPQGPPPQ		PPPTIVVGRH		SPAYAKEDPK
PQEGLLRGTP		GPSKEVLRVV		GESGEPVKAF		KCEHCRILFL		DHVMFTIHMG
CHGFRDPFEC		NICGYHSQDR		YEFSSHIVRG		EHKVG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• Perdomo J., Holmes M., Chong B., Crossley M. (2000). Eos and pegasus, two members of the Ikaros family of proteins with distinct DNA binding activities. J. Biol. Chem. 275: 38347—38354. PMID 10978333 DOI:10.1074/jbc.M005457200
• Koipally J., Georgopoulos K. (2002). A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros. J. Biol. Chem. 277: 27697—27705. PMID 12015313 DOI:10.1074/jbc.M201694200
• Perdomo J., Crossley M. (2002). The Ikaros family protein Eos associates with C-terminal-binding protein corepressors. Eur. J. Biochem. 269: 5885—5892. PMID 12444977 DOI:10.1046/j.1432-1033.2002.03313.x

Див. також

• Хромосома 12