COL4A2 (англ. Collagen type IV alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 712 амінокислот, а молекулярна маса — 167 553[6].

COL4A2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL4A2, ICH, POREN2, collagen type IV alpha 2, collagen type IV alpha 2 chain, BSVD2
Зовнішні ІД OMIM: 120090 MGI: 88455 HomoloGene: 1390 GeneCards: COL4A2
Пов'язані генетичні захворювання
porencephaly[1]
Реагує на сполуку
ocriplasmin[2]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001846
NM_009932
RefSeq (білок)
NP_001837
NP_034062
Локус (UCSC) Хр. 13: 110.31 – 110.51 Mb Хр. 8: 11.36 – 11.5 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MGRDQRAVAGPALRRWLLLGTVTVGFLAQSVLAGVKKFDVPCGGRDCSGG
CQCYPEKGGRGQPGPVGPQGYNGPPGLQGFPGLQGRKGDKGERGAPGVTG
PKGDVGARGVSGFPGADGIPGHPGQGGPRGRPGYDGCNGTQGDSGPQGPP
GSEGFTGPPGPQGPKGQKGEPYALPKEERDRYRGEPGEPGLVGFQGPPGR
PGHVGQMGPVGAPGRPGPPGPPGPKGQQGNRGLGFYGVKGEKGDVGQPGP
NGIPSDTLHPIIAPTGVTFHPDQYKGEKGSEGEPGIRGISLKGEEGIMGF
PGLRGYPGLSGEKGSPGQKGSRGLDGYQGPDGPRGPKGEAGDPGPPGLPA
YSPHPSLAKGARGDPGFPGAQGEPGSQGEPGDPGLPGPPGLSIGDGDQRR
GLPGEMGPKGFIGDPGIPALYGGPPGPDGKRGPPGPPGLPGPPGPDGFLF
GLKGAKGRAGFPGLPGSPGARGPKGWKGDAGECRCTEGDEAIKGLPGLPG
PKGFAGINGEPGRKGDRGDPGQHGLPGFPGLKGVPGNIGAPGPKGAKGDS
RTITTKGERGQPGVPGVPGMKGDDGSPGRDGLDGFPGLPGPPGDGIKGPP
GDPGYPGIPGTKGTPGEMGPPGLGLPGLKGQRGFPGDAGLPGPPGFLGPP
GPAGTPGQIDCDTDVKRAVGGDRQEAIQPGCIGGPKGLPGLPGPPGPTGA
KGLRGIPGFAGADGGPGPRGLPGDAGREGFPGPPGFIGPRGSKGAVGLPG
PDGSPGPIGLPGPDGPPGERGLPGEVLGAQPGPRGDAGVPGQPGLKGLPG
DRGPPGFRGSQGMPGMPGLKGQPGLPGPSGQPGLYGPPGLHGFPGAPGQE
GPLGLPGIPGREGLPGDRGDPGDTGAPGPVGMKGLSGDRGDAGFTGEQGH
PGSPGFKGIDGMPGTPGLKGDRGSPGMDGFQGMPGLKGRPGFPGSKGEAG
FFGIPGLKGLAGEPGFKGSRGDPGPPGPPPVILPGMKDIKGEKGDEGPMG
LKGYLGAKGIQGMPGIPGLSGIPGLPGRPGHIKGVKGDIGVPGIPGLPGF
PGVAGPPGITGFPGFIGSRGDKGAPGRAGLYGEIGATGDFGDIGDTINLP
GRPGLKGERGTTGIPGLKGFFGEKGTEGDIGFPGITGVTGVQGPPGLKGQ
TGFPGLTGPPGSQGELGRIGLPGGKGDDGWPGAPGLPGFPGLRGIRGLHG
LPGTKGFPGSPGSDIHGDPGFPGPPGERGDPGEANTLPGPVGVPGQKGDQ
GAPGERGPPGSPGLQGFPGITPPSNISGAPGDKGAPGIFGLKGYRGPPGP
PGSAALPGSKGDTGNPGAPGTPGTKGWAGDSGPQGRPGVFGLPGEKGPRG
EQGFMGNTGPTGAVGDRGPKGPKGDPGFPGAPGTVGAPGIAGIPQKIAVQ
PGTVGPQGRRGPPGAPGEMGPQGPPGEPGFRGAPGKAGPQGRGGVSAVPG
FRGDEGPIGHQGPIGQEGAPGRPGSPGLPGMPGRSVSIGYLLVKHSQTDQ
EPMCPVGMNKLWSGYSLLYFEGQEKAHNQDLGLAGSCLARFSTMPFLYCN
PGDVCYYASRNDKSYWLSTTAPLPMMPVAEDEIKPYISRCSVCEAPAIAI
AVHSQDVSIPHCPAGWRSLWIGYSFLMHTAAGDEGGGQSLVSPGSCLEDF
RATPFIECNGGRGTCHYYANKYSFWLTTIPEQSFQGSPSADTLKAGLIRT
HISRCQVCMKNL

Задіяний у такому біологічному процесі, як ангіогенез. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

ред.
  • Brazel D., Pollner R., Oberbaeumer I., Kuehn K. (1988). Human basement membrane collagen (type IV). The amino acid sequence of the alpha 2(IV) chain and its comparison with the alpha 1(IV) chain reveals deletions in the alpha 1(IV) chain. Eur. J. Biochem. 172: 35—42. PMID 3345760 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb13852.x
  • Killen P.D., Francomano C.A., Yamada Y., Modi W.S., O'Brien S.J. (1987). Partial structure of the human alpha 2(IV) collagen chain and chromosomal localization of the gene (COL4A2). Hum. Genet. 77: 318—324. PMID 3692475 DOI:10.1007/BF00291418
  • Hostikka S.L., Kurkinen M., Tryggvason K. (1987). Nucleotide sequence coding for the human type IV collagen alpha 2 chain cDNA reveals extensive homology with the NC-1 domain of alpha 1 (IV) but not with the collagenous domain or 3'-untranslated region. FEBS Lett. 216: 281—286. PMID 3582677 DOI:10.1016/0014-5793(87)80706-8
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Griffin C.A., Emanuel B.S., Hansen J.R., Cavenee W.K., Myers J.C. (1987). Human collagen genes encoding basement membrane alpha 1 (IV) and alpha 2 (IV) chains map to the distal long arm of chromosome 13. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 512—516. PMID 3025878 DOI:10.1073/pnas.84.2.512
  • Siebold B., Deutzmann R., Kuehn K. (1988). The arrangement of intra- and intermolecular disulfide bonds in the carboxyterminal, non-collagenous aggregation and cross-linking domain of basement-membrane type IV collagen. Eur. J. Biochem. 176: 617—624. PMID 2844531 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14321.x

Примітки

ред.

Див. також

ред.