COL4A2
білок людини
COL4A2 (англ. Collagen type IV alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 712 амінокислот, а молекулярна маса — 167 553[6].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGRDQRAVAG | PALRRWLLLG | TVTVGFLAQS | VLAGVKKFDV | PCGGRDCSGG | ||||
CQCYPEKGGR | GQPGPVGPQG | YNGPPGLQGF | PGLQGRKGDK | GERGAPGVTG | ||||
PKGDVGARGV | SGFPGADGIP | GHPGQGGPRG | RPGYDGCNGT | QGDSGPQGPP | ||||
GSEGFTGPPG | PQGPKGQKGE | PYALPKEERD | RYRGEPGEPG | LVGFQGPPGR | ||||
PGHVGQMGPV | GAPGRPGPPG | PPGPKGQQGN | RGLGFYGVKG | EKGDVGQPGP | ||||
NGIPSDTLHP | IIAPTGVTFH | PDQYKGEKGS | EGEPGIRGIS | LKGEEGIMGF | ||||
PGLRGYPGLS | GEKGSPGQKG | SRGLDGYQGP | DGPRGPKGEA | GDPGPPGLPA | ||||
YSPHPSLAKG | ARGDPGFPGA | QGEPGSQGEP | GDPGLPGPPG | LSIGDGDQRR | ||||
GLPGEMGPKG | FIGDPGIPAL | YGGPPGPDGK | RGPPGPPGLP | GPPGPDGFLF | ||||
GLKGAKGRAG | FPGLPGSPGA | RGPKGWKGDA | GECRCTEGDE | AIKGLPGLPG | ||||
PKGFAGINGE | PGRKGDRGDP | GQHGLPGFPG | LKGVPGNIGA | PGPKGAKGDS | ||||
RTITTKGERG | QPGVPGVPGM | KGDDGSPGRD | GLDGFPGLPG | PPGDGIKGPP | ||||
GDPGYPGIPG | TKGTPGEMGP | PGLGLPGLKG | QRGFPGDAGL | PGPPGFLGPP | ||||
GPAGTPGQID | CDTDVKRAVG | GDRQEAIQPG | CIGGPKGLPG | LPGPPGPTGA | ||||
KGLRGIPGFA | GADGGPGPRG | LPGDAGREGF | PGPPGFIGPR | GSKGAVGLPG | ||||
PDGSPGPIGL | PGPDGPPGER | GLPGEVLGAQ | PGPRGDAGVP | GQPGLKGLPG | ||||
DRGPPGFRGS | QGMPGMPGLK | GQPGLPGPSG | QPGLYGPPGL | HGFPGAPGQE | ||||
GPLGLPGIPG | REGLPGDRGD | PGDTGAPGPV | GMKGLSGDRG | DAGFTGEQGH | ||||
PGSPGFKGID | GMPGTPGLKG | DRGSPGMDGF | QGMPGLKGRP | GFPGSKGEAG | ||||
FFGIPGLKGL | AGEPGFKGSR | GDPGPPGPPP | VILPGMKDIK | GEKGDEGPMG | ||||
LKGYLGAKGI | QGMPGIPGLS | GIPGLPGRPG | HIKGVKGDIG | VPGIPGLPGF | ||||
PGVAGPPGIT | GFPGFIGSRG | DKGAPGRAGL | YGEIGATGDF | GDIGDTINLP | ||||
GRPGLKGERG | TTGIPGLKGF | FGEKGTEGDI | GFPGITGVTG | VQGPPGLKGQ | ||||
TGFPGLTGPP | GSQGELGRIG | LPGGKGDDGW | PGAPGLPGFP | GLRGIRGLHG | ||||
LPGTKGFPGS | PGSDIHGDPG | FPGPPGERGD | PGEANTLPGP | VGVPGQKGDQ | ||||
GAPGERGPPG | SPGLQGFPGI | TPPSNISGAP | GDKGAPGIFG | LKGYRGPPGP | ||||
PGSAALPGSK | GDTGNPGAPG | TPGTKGWAGD | SGPQGRPGVF | GLPGEKGPRG | ||||
EQGFMGNTGP | TGAVGDRGPK | GPKGDPGFPG | APGTVGAPGI | AGIPQKIAVQ | ||||
PGTVGPQGRR | GPPGAPGEMG | PQGPPGEPGF | RGAPGKAGPQ | GRGGVSAVPG | ||||
FRGDEGPIGH | QGPIGQEGAP | GRPGSPGLPG | MPGRSVSIGY | LLVKHSQTDQ | ||||
EPMCPVGMNK | LWSGYSLLYF | EGQEKAHNQD | LGLAGSCLAR | FSTMPFLYCN | ||||
PGDVCYYASR | NDKSYWLSTT | APLPMMPVAE | DEIKPYISRC | SVCEAPAIAI | ||||
AVHSQDVSIP | HCPAGWRSLW | IGYSFLMHTA | AGDEGGGQSL | VSPGSCLEDF | ||||
RATPFIECNG | GRGTCHYYAN | KYSFWLTTIP | EQSFQGSPSA | DTLKAGLIRT | ||||
HISRCQVCMK | NL |
Задіяний у такому біологічному процесі, як ангіогенез. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
ред.- Brazel D., Pollner R., Oberbaeumer I., Kuehn K. (1988). Human basement membrane collagen (type IV). The amino acid sequence of the alpha 2(IV) chain and its comparison with the alpha 1(IV) chain reveals deletions in the alpha 1(IV) chain. Eur. J. Biochem. 172: 35—42. PMID 3345760 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb13852.x
- Killen P.D., Francomano C.A., Yamada Y., Modi W.S., O'Brien S.J. (1987). Partial structure of the human alpha 2(IV) collagen chain and chromosomal localization of the gene (COL4A2). Hum. Genet. 77: 318—324. PMID 3692475 DOI:10.1007/BF00291418
- Hostikka S.L., Kurkinen M., Tryggvason K. (1987). Nucleotide sequence coding for the human type IV collagen alpha 2 chain cDNA reveals extensive homology with the NC-1 domain of alpha 1 (IV) but not with the collagenous domain or 3'-untranslated region. FEBS Lett. 216: 281—286. PMID 3582677 DOI:10.1016/0014-5793(87)80706-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Griffin C.A., Emanuel B.S., Hansen J.R., Cavenee W.K., Myers J.C. (1987). Human collagen genes encoding basement membrane alpha 1 (IV) and alpha 2 (IV) chains map to the distal long arm of chromosome 13. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 512—516. PMID 3025878 DOI:10.1073/pnas.84.2.512
- Siebold B., Deutzmann R., Kuehn K. (1988). The arrangement of intra- and intermolecular disulfide bonds in the carboxyterminal, non-collagenous aggregation and cross-linking domain of basement-membrane type IV collagen. Eur. J. Biochem. 176: 617—624. PMID 2844531 DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14321.x
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL4A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL4A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2203 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-14 у Wayback Machine.]
- ↑ UniProt, P08572 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
ред.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |