COL26A1

COL26A1 (англ. Collagen type XXVI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 45 381.

COL26A1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AU2, 4AU3, 4BJ3
Ідентифікатори
Символи	COL26A1, EMI6, EMID2, EMU2, SH2B, collagen type XXVI alpha 1, collagen type XXVI alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 608927 MGI: 2155345 HomoloGene: 136636 GeneCards: COL26A1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	136227	140709
Ensembl	ENSG00000160963	ENSMUSG00000004415
UniProt	Q96A83	Q91VF6
RefSeq (мРНК)	NM_133457 NM_001278563	NM_024474 NM_001346699
RefSeq (білок)	NP_001265492 NP_597714	NP_001333628 NP_077794
Локус (UCSC)	Хр. 7: 101.36 – 101.56 Mb	Хр. 5: 136.77 – 136.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLALLLPWA		CCCLCGSALA		TGFLYPFSAA		ALQQHGYPEP		GAGSPGSGYA
SRRHWCHHTV		TRTVSCQVQN		GSETVVQRVY		QSCRWPGPCA		NLVSYRTLIR
PTYRVSYRTV		TVLEWRCCPG		FTGSNCDEEC		MNCTRLSDMS		ERLTTLEAKV
LLLEAAERPS		SPDNDLPAPE		STPPTWNEDF		LPDAIPLAHP		VPRQRRPTGP
AGPPGQTGPP		GPAGPPGSKG		DRGQTGEKGP		AGPPGLLGPP		GPRGLPGEMG
RPGPPGPPGP		AGNPGPSPNS		PQGALYSLQP		PTDKDNGDSR		LASAIVDTVL
AGVPGPRGPP		GPPGPPGPRG		PPGPPGTPGS		QGLAGERGTV		GPSGEPGVKG
EEGEKAATAE		GEGVQQLREA		LKILAERVLI		LEHMIGIHDP		LASPEGGSGQ
DAALRANLKM		KRGGAQPDGV		LAALLGPDPG		QKSVDQASSR		K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Leimeister C., Steidl C., Schumacher N., Erhard S., Gessler M. (2002). Developmental expression and biochemical characterization of Emu family members. Dev. Biol. 249: 204—218. PMID 12221002 DOI:10.1006/dbio.2002.0764
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7