COL24A1

COL24A1 (англ. Collagen type XXIV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 714 амінокислот, а молекулярна маса — 175 496.

COL24A1
Ідентифікатори
Символи	COL24A1, collagen, type XXIV, alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610025 MGI: 1918605 HomoloGene: 65061 GeneCards: COL24A1
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Клітинна компонента • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • hematopoietic progenitor cell differentiation • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	255631	71355
Ensembl	ENSG00000171502	ENSMUSG00000028197
UniProt	Q17RW2	Q30D77
RefSeq (мРНК)	NM_152890	NM_027770 NM_001317733
RefSeq (білок)	NP_690850 NP_001336884	NP_001304662 NP_082046
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 3: 145 – 145.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHLRAHRTRR		GKVSPTAKTK		SLLHFIVLCV		AGVVVHAQEQ		GIDILHQLGL
GGKDVRHSSP		ATAVPSASTP		LPQGVHLTES		GVIFKNDAYI		ETPFVKILPV
NLGQPFTILT		GLQSHRVNNA		FLFSIRNKNR		LQLGVQLLPK		KLVVHIRGKQ
PAVFNYSVHD		EQWHSFAITI		RNQSVSMFVE		CGKKYFSTET		IPEVQTFDSN
SVFTLGSMNN		NSIHFEGIVC		QLDIIPSAEA		SADYCRYVKQ		QCRQADKYQP
ETSIPCTTLI		PTKIPEHSPP		PKLFAEKVLS		EDTFTEGKSI		PNIIKNDSET
VYKRQEHQIS		RSQLSSLQSG		NVSAVDLTNH		GIQAKEMITE		EDTQTNFSLS
VTTHRISEAK		MNTKEKFSSL		LNMSDNITQH		DDRVTGLSLF		KKMPSILPQI
KQDTITNLKK		AITANLHTNE		LMEMQPILNT		SLHRVTNEPS		VDNHLDLRKE
GEFYPDATYP		IENSYETELY		DYYYYEDLNT		MLEMEYLRGP		KGDTGPPGPP
GPAGIPGPSG		KRGPRGIPGP		HGNPGLPGLP		GPKGPKGDPG		FSPGQPVPGE
KGDQGLSGLM		GPPGMQGDKG		LKGHPGLPGL		PGEQGIPGFA		GNIGSPGYPG
RQGLAGPEGN		PGPKGAQGFI		GSPGEAGQLG		PEGERGIPGI		RGKKGFKGRQ
GFPGDFGDRG		PAGLDGSPGL		VGGTGPPGFP		GLRGSVGPVG		PIGPAGIPGP
MGLSGNKGLP		GIKGDKGEQG		TAGELGEPGY		PGDKGAVGLP		GPPGMRGKSG
PSGQTGDPGL		QGPSGPPGPE		GFPGDIGIPG		QNGPEGPKGL		LGNRGPPGPP
GLKGTQGEEG		PIGAFGELGP		RGKPGQKGYA		GEPGPEGLKG		EVGDQGNIGK
IGETGPVGLP		GEVGMTGSIG		EKGERGSPGP		LGPQGEKGVM		GYPGPPGVPG
PIGPLGLPGH		VGARGPPGSQ		GPKGQRGSRG		PDGLLGEQGI		QGAKGEKGDQ
GKRGPHGLIG		KTGNPGERGF		QGKPGLQGLP		GSTGDRGLPG		EPGLRGLQGD
VGPPGEMGME		GPPGTEGESG		LQGEPGAKGD		VGTAGSVGGT		GEPGLRGEPG
APGEEGLQGK		DGLKGVPGGR		GLPGEDGEKG		EMGLPGIIGP		LGRSGQTGLP
GPEGIVGIPG		QRGRPGKKGD		KGQIGPTGEV		GSRGPPGKIG		KSGPKGARGT
RGAVGHLGLM		GPDGEPGIPG		YRGHQGQPGP		SGLPGPKGEK		GYPGEDSTVL
GPPGPRGEPG		PVGDQGERGE		PGAEGYKGHV		GVPGLRGATG		QQGPPGEPGD
QGEQGLKGER		GSEGNKGKKG		APGPSGKPGI		PGLQGLLGPK		GIQGYHGADG
ISGNPGKIGP		PGKQGLPGIR		GGPGRTGLAG		APGPPGVKGS		SGLPGSPGIQ
GPKGEQGLPG		QPGIQGKRGH		RGAQGDQGPC		GDPGLKGQPG		EYGVQGLTGF
QGFPGPKGPE		GDAGIVGISG		PKGPIGHRGN		TGPLGREGII		GPTGRTGPRG
EKGFRGETGP		QGPRGQPGPP		GPPGAPGPRK		QMDINAAIQA		LIESNTALQM
ESYQNTEVTL		IDHSEEIFKT		LNYLSNLLHS		IKNPLGTRDN		PARICKDLLN
CEQKVSDGKY		WIDPNLGCPS		DAIEVFCNFS		AGGQTCLPPV		SVTKLEFGVG
KVQMNFLHLL		SSEATHIITI		HCLNTPRWTS		TQTSGPGLPI		GFKGWNGQIF
KVNTLLEPKV		LSDDCKIQDG		SWHKATFLFH		TQEPNQLPVI		EVQKLPHLKT
ERKYYIDSSS		VCFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1