Oxidoreduktáza
Oxidoreduktáza je enzým, ktorý katalyzuje prenos elektrónov z jednej molekuly, zvanej oxidant alebo donor elektrónov, na druhú molekulu, zvanú reduktant alebo akceptor elektrónov. Táto skupina enzýmov zvyčajne využíva NAD+ alebo NADP+ ako kofaktory.[1][2] Transmembránové oxidoreduktázy vytvárajú elektrón-transportné reťazce v baktériách, chloroplastoch alebo mitochondriách a zahŕňajú napríklad respiračné komplexy I, II a III. Iné sa môžu asociovať s biologickými membránami ako periférne membránové proteíny alebo môžu byť v membráne ukotvené pomocou transmembárnového helixu.[3]
Reakcie
upraviťOxidoreduktáza katalyzujú napríklad reakciu:
- A– + B → A + B–
V tomto prípade je A donor a B akceptor elektrónov.
V biochemických procesoch môže byť náročnejšie rozpoznať redoxné reakcie, ako napríklad u tejto reakcie z glykolýzy:
- Pi + glyceraldehyd-3-fosfát + NAD+ → NADH + H+ + 1,3-bisfosfoglycerát
V tejto reakcii je akceptorom elektrónov NAD+ a glyceraldehyd-3-fosfát je donorom elektrónov.
Názvoslovie
upraviťSprávne meno pre reduktázy je podľa IUPAC „donor:akceptor oxidoreduktáza“, ale bežne sa používajú iné názvy. Jedným z bežných názvov je „donordehydrogenáza“, ktorý naznačuje, že molekula prichádza o dva vodíkové atómy. Príkladom môže byť glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenáza, ktorá katalyzuje druhú reakciu uvedenú vyššie. Iné bežné názvy sú „akceptorreduktáza“, napríklad NAD+ reduktáza. Názov „donoroxidáza“, napríklad xantínoxidáza, naznačuje, že akceptorom elektrónov je kyslík.
Klasifikácia
upraviťOxidoreduktázam je priradené EC číslo EC 1. Ďalej môžu byť rozdelené na 21 podskupín:
- EC 1.1 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na CH-OH skupinu donoru (alkoholoxidoreduktázy)
- EC 1.2 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na karbonylovú skupinu donoru (aldehyd alebo ketón)
- EC 1.3 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na CH-CH skupinu donoru (CH-CH oxidoreduktázy)
- EC 1.4 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na CH-NH2 skupinu donoru (oxidoreduktázy aminokyselín, monoamínoxidázy)
- EC 1.5 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na CH-NH skupinu donoru
- EC 1.6 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na NADH alebo NADPH
- EC 1.7 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na iné dusíkaté zlúčeniny ako donory
- EC 1.8 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na sírovú skupinu donoru
- EC 1.9 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na hem donoru
- EC 1.10 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na difenoly a príbuzné látky ako donory
- EC 1.11 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na peroxid ako akceptor (peroxidázy)
- EC 1.12 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na vodík ako donor (hydrogenázy)
- EC 1.13 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na jediný donor s naviazaním molekulárneho kyslíka (oxygenázy)
- EC 1.14 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na dvojicu donorov s naviazaním molekulárneho kyslíka
- EC 1.15 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na superoxidový radikál ako akceptor
- EC 1.16 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré oxidujú atómy kovov
- EC 1.17 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na CH alebo CH2 skupiny
- EC 1.18 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na železo-sírne proteíny ako donory
- EC 1.19 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na redukovaný flavodoxín ako donor
- EC 1.20 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na fosfor alebo arzén ako donor
- EC 1.21 obsahuje oxidoreduktázy, ktoré pôsobia na X-H a Y-H väzby za vzniku X-Y väzby
Referencie
upraviť- ↑ Eric J. Toone. Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution. Volume 75. vyd. [s.l.] : Wiley-Interscience, 2006. Dostupné online. ISBN 0471205036.
- ↑ Nicholas C. Price; Lewis Stevens. Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins. Third. vyd. USA : Oxford University Press, 1999. Dostupné online. ISBN 019850229X.
- ↑ Superfamilies of single-pass transmembrane oxidoreductases in Membranome database
Pozri aj
upraviťExterné odkazy
upraviť- EC 1 Introduction from the Department of Chemistry at Queen Mary, University of London
Zdroj
upraviťTento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Oxidoreductase na anglickej Wikipédii.