Caroline Perez Camilo
Caroline Perez Camilo
Caroline Perez Camilo
Programa de Psiquiatria
Orientador: Prof. Dr. Homero Pinto Vallada
Filho
Coorientadora: Profa. Dra. Helena Paula
Brentani
São Paulo
2020
Caroline Perez Camilo
Programa de Psiquiatria
Orientador: Prof. Dr. Homero Pinto Vallada
Filho
Coorientadora: Profa. Dra. Helena Paula
Brentani
São Paulo
2020
Dedicatória
Dedico essa tese aos meus pais, Ana Maria e Izilmar.
Por todo seu amor, por todo apoio que me deram desde
o início dessa jornada acadêmica e por toda dedicação
empenhada na minha formação pessoal e profissional.
Essa dedicatória é apenas uma singela homenagem,
pois não seria possível expressar em palavras o quanto
sou grata por ser sua filha. Obrigada.
Agradecimentos
Agradeço primeiramente a Deus, por permitir que eu trilhasse esse caminho até
esse momento e por nunca me abandonar. Por abençoar à mim e à minha família, por
alimentar a minha fé e por me manter firme diante todas as dificuldade que encontrei ao
longo do caminho.
Aos meus pais, Ana Maria e Izilmar. Imagino o quanto foi difícil educar aquela
adolescente rebelde e ter paciência até que ela se tornasse a mulher que é hoje.
Agradeço pelo amor, suporte e apoio incondicional que me deram no momento mais
difícil que passei nessa trajetória, quando fui diagnosticada com depressão. O
encerramente desse ciclo não seria possível sem vocês ao meu lado.
Ao meu irmão, Ronaldo. Obrigada por ser meu amigo, companheiro e a minha
base. Deus me escolheu para ser sua irmã, para você ser parte de mim. E que sorte eu
tenho por ter você. Que sorte eu tenho por ter sido cuidada e amada desde pequena por
esse homem incrível, que até hoje se preocupada comigo e faz de tudo pra me fazer rir o
tempo todo (mesmo eu sendo esse “potinho de ódio”). Obrigada pelos momentos que
vivemos juntos, pelas risadas que compartilhamos e por cuidar de mim hoje e sempre.
À toda a família Perez. É uma honra ser membro dessa grande família. Agradeço
pela felicidade dos nossos encontros, pelas risadas altas, pela bagunça e pelo amor e
carinho que todos temos uns com os outros. Dona Berenice e Sr. Benedicto devem estar
orgulhosos lá de cima, observando a família linda e unida que suas seis filhas
construíram.
Ao orientador Professor Doutor Homero Vallada. Dentre altos e baixos, sou
muito grata por essa trajetória de dez anos que tivemos como orientador e aluna.
Seguirei agora um novo caminho, levando comigo todos os ensinamentos e toda
experiência que me proporcionou. Agradeço por sempre incentivar minha evolução
acadêmica e pessoal. Obrigada por toda essa história e pelo voto de confiança em me
acolher como orientanda.
À co-orientadora Professora Doutora Helena Brentani. Que honra poder ser sua
aluna, fazer parte da sua equipe, ter sua confiança e aprender com você todos os dias.
Obrigada pelos ensinamentos, pelas cobranças e pelos conselhos.
Aos meus amigos. Que sorte eu tenho de ter vocês na minha vida (ou seria o
contrário?). Brincadeiras à parte, vocês são essenciais em todos os momentos, da
tristeza à felicidade, do drama aos momentos sérios. Obrigada por todos os momentos
que vivemos, e por todos que estão por vir.
Aos amigos do “Panelinha”. Obrigada pelas conversas, pelas risadas, pelo ombro
amigo e por todos os nossos encontros mensais para tomar um cafézinho. Agradeço o
apoio de todos. Vocês fizeram os meus dias na Psiquiatria mais felizes.
Aos colegas do Departamento e Instituto de Psiquiatria do HCFMUSP. Em
especial à equipe da pós graduação, Eliza e Isabel, por todo o apoio e ajuda durante
esses anos de trabalho. Aos colegas do Laboratório de Patologia e do Grupo de Genética
e Bioinformática. Agradeço pelo apoio, convívio e aprendizado durante o
desenvolvimento e execução desse trabalho.
À CAPES: O presente trabalho foi realizado com o apoio da Coordenação de
Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – Brasil (CAPES) – Código de
financiamento 001.
À FAPESP – Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (Processo
nº 2013/00659-2) pelo apoio financeiro essencial para realização dessa pesquisa.
À todos aqueles que contribuíram, de alguma forma, para a realização deste
trabalho.
Epígrafe
“Tudo tem o seu tempo determinado, e há tempo para
todo o propósito debaixo do céu. Há tempo de nascer, e
tempo de morrer; tempo de plantar, e tempo de
arrancar o que se plantou; Tempo de matar, e tempo de
curar; tempo de derrubar, e tempo de edificar; Tempo
de chorar, e tempo de rir; tempo de prantear, e tempo
de dançar; Tempo de espalhar pedras, e tempo de
ajuntar pedras; tempo de abraçar, e tempo de afastar-
se de abraçar; Tempo de buscar, e tempo de perder;
tempo de guardar, e tempo de lançar fora; Tempo de
rasgar, e tempo de coser; tempo de estar calado, e
tempo de falar; Tempo de amar, e tempo de odiar;
tempo de guerra, e tempo de paz.” Eclesiastes - 3:1-8.
Esta tese está de acordo com as seguintes normas, em vigor no momento desta
publicação:
Abreviaturas dos títulos dos periódicos de acordo com List of Journals Indexed in
IndexMedicus.
Sumário
Lista de figuras
Lista de tabelas
Lista de abreviaturas, símbolos e siglas
Resumo
Abstract
1. APRESENTAÇÃO ................................................................................................................. 1
2. INTRODUÇÃO ...................................................................................................................... 3
3. JUSTIFICATIVA ............................................................................................................ 19
4. OBJETIVOS .................................................................................................................... 21
6. RESULTADOS ................................................................................................................ 33
7. DISCUSSÃO .................................................................................................................... 62
8. CONCLUSÃO ................................................................................................................. 73
9. ANEXOS .......................................................................................................................... 75
BACKGROUND: DNA methylation has the ability to measure the cumulative work
done by the epigenetic maintenance system, and to determine the impact of
environmental factors on biological aging. DNA methylation has been used as an
important mechanism to better understand the interaction between the genetic and
environment factors involved with crack dependent phenotype. OBJECTIVES:
Investigate DNA methylation differences between crack dependents and healthy
controls and evaluate its association with environmental factors through structural
equation modeling (SEM). METHODS: We studied DNA methylation profiles of 128
crack dependents and 109 control subjects using the Infinium MethylationEPIC
BeadChip arrays (850K). Two SEM models were evaluated: 1) The relationship
between epigenetic age in crack dependents and controls mediated by environment
factors such as sociodemographics, quality of life, religiosity and use of alcohol and
other drugs, and 2) The relationship between epigenetic age in crack dependents
exposed and non-exposed to traumatic/stressor events mediated by psychiatric
disorders. We also searched for differentially methylated sites (DMSs) and regions
(DMRs) between crack/controls and crack exposed/non-exposed groups. RESULTS:
Epigenetic age approach showed that both DNA methylation age and age acceleration
were higher for the dependents group (p-value <0,001), although no mediation effect
regarding environment factors has been observed. Comparison between crack
dependents and controls revealed 597 DMSs (adjP <0,001) and 15 DMRs (FDR <0,05;
∆β ≥ 5%), with differentially methylated genes mainly related to signaling by EGFR,
chromatin organization pathways, gene expression regulation and transcriptional
regulation by TP53. Considering crack dependents exposed and non-exposed to
traumatic/stressor events, we did not observe differences in both DNA methylation age
and age acceleration. Thus, we could not observe a mediation effect by psychiatric
disorders. For differential methylation analysis we did not find DMSs and DMRs
related to the exposure of crack dependents to traumatic/stressor events.
CONCLUSIONS: We found that crack cocaine dependence is related with a positive
age acceleration, which reflects that the use/abuse of this drug makes the individuals´
biological age older compared to healthy controls. Moreover, we identified statistically
significant differences in DNA methylation patterns of crack cocaine dependents,
mainly involved with gene silencing. Our results contribute to a better understanding of
crack cocaine dependence neurobiology, bringing new perspectives about DNA
methylation biological markers that could contribute to more effective solutions for
prevention, diagnosis and drug dependence treatment.
2.1 . CAPÍTULO 1
2.1.1. Epigenética
com substâncias como álcool, cigarro e outras drogas, que por sua vez, também podem
causar alterações na metilação do DNA 20.
Diversos estudos têm sido realizados buscando avaliar como o uso/abuso de drogas
como álcool, cigarro e outras drogas podem causar alterações na metilação do DNA 21.
Para o consumo de álcool e cigarro, por exemplo, estudos demonstram que o uso/abuso
22-24
dessas substâncias pode causar alterações no padrão de metilação do DNA .
25,26
Alterações na metilação também foram observadas para o consumo de cannabis ,
27-29 3
cocaína e crack .
Como visto, mudanças na metilação do DNA podem ser diferentes do início da
vida àquelas observadas mais tarde na vida. Alterações dinâmicas ocorrem desde o
desenvolvimento embrionário até a idade adulta, quando a especificação de tecidos e
30
órgãos são completados e o crescimento estabilizado . Essas alterações dinâmicas
durante a vida servem como um mecanismo importante para os organismos se
adaptarem às mudanças ambientais externas e internas. No entanto, conforme o
envelhecimento, tais alterações podem funcionar como mudanças adaptativas para
4,31
responder, por exemplo, à exposição ao estresse ao longo da vida . Uma medida
promissora utilizada nos últimos anos para investigar a dinâmica entre o impacto de
influências ambientais e estilo de vida nas assinaturas epigenéticas, como a metilação
do DNA, é o biomarcador molecular conhecido como “relógio epigenético” 2,4,18.
2.2. CAPÍTULO 2
Além dos efeitos biológicos do crack, outros componentes contribuem para seu
65
potencial de dependência, como os fatores ambientais . A literatura em torno de
Introdução 11
É importante ressaltar que, apesar dos diversos fatores de risco associados ao uso
de crack, outros fatores ambientais podem reduzir a vulnerabilidade para o consumo da
droga. Fatores como um ambiente familiar saudável, maiores níveis de escolaridade e
religiosidade, por exemplo, são considerados positivos na redução de risco à
65,77
dependência . Estudos têm demonstrado uma relação inversa entre a religiosidade e
o uso/abuso de crack77,78. O envolvimento religioso durante a infância e adolescência foi
correlacionado ao início menos frequente do consumo de drogas antes dos 18 anos 79.
Diversos estudos têm relatado, além das influências ambientais, a influência dos
fatores genéticos na relação com a dependência química, como nos estudos em famílias,
8,80,81
gêmeos e adotados . Nos últimos anos, diversos estudos têm sido realizados
buscando genes candidatos que possam estar envolvidos em diferentes etapas
relacionadas com a dependência de crack, sendo os mais estudados aqueles aqueles que
82-84
integram o sistema de recompensa dopaminérgico. Stolf e colaboradores
observaram alterações em variantes dos genes DAT1 (dopamine transporter gene),
DRD2 (dopamine receptor D2) e DRD4 (dopamine receptor D4) relacionadas com a
dependência de crack. Outros autores observaram associação do gene NR3C1 (nuclear
receptor subfamily 3 group C member 1) e gravidade da depressão em mulheres com
85
dependência de crack e do gene NR3C2 (nuclear receptor subfamily 3 group C
member 2) com o risco de dependência de crack relacionado à negligência física na
72
infância . A interação desses genes foi associada à gravidade dos sintomas de
abstinência de crack 72.
Estudos avaliando a expressão gênica também evidenciaram associações
significativas com o uso de crack, como uma expressão reduzida de mRNA do gene
FosB (FosB proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit) em dependentes de
86
crack comparados a controles e um aumento no perfil de expressão gênica no córtex
pré-frontal dorsolateral de dependentes de crack 87.
Finalmente, em relação à metilação do DNA, Camilo e colaboradores 3 observaram
diferenças no padrão de metilação de DNA de dependentes de cocaína e crack
comparados à controles, identificando genes diferencialmente metilados previamente
associados à dependência de cocaína.
Introdução 13
2.3. CAPÍTULO 3
M afeta Y (efeito indireto „b‟). Para isso, a variável Y é associada tanto à X quanto a M.
88
Baron e Kenny sugerem que a associação entre M e Y não é suficiente para
estabelecer uma relação de mediação, pois M e Y podem estar correlacionados por
ambos serem causados por X. Assim, X deve ser controlada no estabelecimento do
efeito do mediador em Y; 4) O quarto e último passo é derivado do passo anterior pois,
ao avaliar o efeito de M em Y controlado por X, é possível observar se houve efeito de
mediação. Para estabelecer que M faz a mediação entre X e Y, o efeito direto (c ′) deve
ser zero, para uma mediação completa, ou reduzido para uma mediação parcial. No
entanto, para que os efeitos de mediação sejam válidos por esse método, os caminhos a,
b e c ′ devem ser estatisticamente significativos 88.
A abordagem de diferença entre caminhos avalia a diferença entre os efeitos total e
direto (c – c´). Nessa abordagem uma equação matemática por meio da distribuição t
(com n – 1 grau(s) de liberdade) é utilizada para avaliar se existe mediação,
considerando a correlação de M com Y, os erros padrão das relações c e c´, e a
estimativa de mediação dividida pelo erro padrão da equação 92.
O teste de Sobel é um método para determinar se a redução no efeito de Y, após
incluir M no modelo, é uma redução significativa e, portanto, se o efeito da mediação é
estatisticamente significativo. Assim, como na abordagem de análise dos caminhos,
para esse teste todos os caminhos devem ser calculados e, se ambos os caminhos a e b
forem significativos e c‟ for mais próximo de zero do que c, então o mediador M é
considerado significativo. A tabela do teste z e distribuição bicaudal são utilizados como
padrão neste teste, sendo o ponto de corte para que uma mediação seja aceita de α= 0,05
ou z= ± 1,96. Contudo, essa abordagem possui uma importante limitação, com o
93
pressuposto de que a distribuição do produto entre os caminhos a e b seja normal .
O método bootstrapping gera uma representação empírica da distribuição da
amostra por reamostragem com reposição. Com essa abordagem é possível contornar a
limitação do teste Sobel, com o cálculo do intervalo de confiança do produto de a*b.
Assim, utilizando a estimativa de efeito indireto com as reamostragens, é calculado o
intervalo de confiança de 95%. Se os valores dos efeitos diretos e indiretos estiverem
dentro desses 95% a mediação é considerada presente. O método bootstrapping é
indicado para números amostrais entre 20 e 80 91.
Introdução 15
Por fim, para a comparação entre diferentes modelos e seleção do mais plausível,
97
quando for o caso, devemos selecionar os índices de ajuste de parcimônia , sendo os
principais os índices Akaike information criterion (AIC) e Bayesian Information
Criterion (BIC). Ambos utilizam a probabilidade dado o ajuste de máxima
verossimilhança do modelo e avaliam o desempenho do modelo considerando sua
complexidade. AIC é baseado na aproximação assintótica que pode não ser válida para
um determinado conjunto de dados, enquanto BIC é baseado na suposição de que os
erros do modelo são independentes e normalmente distribuídos. Para a seleção do
modelo que melhor se ajusta aos dados, deve-se considerar aquele com o menor valor
de AIC e BIC dentre os modelos testados 103.
Por fim, o modelo conceitual proposto é finalmente avaliado. No entanto, em
muitos casos, o modelo proposto inicialmente não se adequa perfeitamente aos dados da
amostra. Quando isso ocorre, etapas de ajuste e modificação do modelo podem ser
realizadas, sempre considerando a fundamentação teórica utilizada na construção do
94
modelo para realizar essas modificações . Adicionalmente, é possível utilizar os
índices de modificação („modification indices‟), que fornecem uma estimativa
aproximada de como o χ2 poderia melhorar no modelo proposto se um determinado
parâmetro fosse alterado. Para cada índice de modificação observa-se uma alteração de
parâmetros esperada correspondente e, avaliando-as em conjunto, é possível melhorar
os índices de ajuste do modelo 104.
106
fatores ambientais como educação, estado civil, dieta e consumo de álcool e tabaco ,
entre muitos outros.
Em relação ao uso/abuso de drogas, SEM já foi utilizado para examinar os
caminhos entre o uso de substâncias como álcool, maconha e cocaína e sofrimento
107
psicológico de longo prazo , para avaliar caminhos de predição ao uso de
108
psicoestimulantes e prever fatores de risco mediadores da relação entre abuso e
109
negligência na infância e uso de drogas ilícitas na idade adulta . Especificamente em
relação ao uso de crack, dois estudos interessantes foram encontrados, sendo o primeiro
observando que o transtorno de déficit de atenção e hiperatividade (TDAH) pode
predizer o uso de crack em indivíduos com níveis médios e altos de agressão verbal 110,
e o segundo demonstrando que a troca de sexo por crack em mulheres está associada ao
abuso na infância e mediada, em parte, por sofrimento psicológico 111.
3. JUSTIFICATIVA
Justificativa 20
5.1. Amostra
5.1.1. Casos
I
http://www.researchgate.net/publication/283153684
Material e Métodos 25
5.1.2. Controles
genômica, 25,8% CpGs estão localizados em regiões promotoras, sendo 16% nos sítios
de início da transcrição TSS200 e TSS1500, 9,4% em 5' UTR e 0,4% no primeiro éxon.
Por fim, 40% CpGs estão localizados no corpo dos genes, 0,9% em 3' UTR e 33,3% em
regiões intergênicas. A cobertura relacionada às ilhas CpG está dividida em 5,4% CpGs
em ilhas, 16,4% em shores e shelves e 78,2% em regiões „open sea‟ 14.
II
DOI: 10.18129/B9.bioc.IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19
III
www.r-project.org
IV
https://www.bioconductor.org/
Material e Métodos 27
Para compor o banco de dados que seria utilizado para a avaliação deste primeiro
objetivo, selecionamos a partir do questionário estruturado as informações e avaliações
que foram coletadas tanto para o grupo de casos como para o grupo controle, para
garantir que os grupos fossem comparáveis. Assim, selecionamos as variáveis
sociodemográficas idade, etnia, escolaridade, estado civil e uso de outras drogas, e os
seguintes instrumentos de avaliação:
Duke Religion Index (DUREL): Escala composta por cinco itens que avaliam
a religiosidade por meio de três dimensões. O primeiro item avalia a
religiosidade organizacional, referente à frequência que o indivíduo vai à
igreja, templo ou outro encontro religioso. O segundo item avalia a
religiosidade não organizacional, referente à frequência que o indivíduo
dedica o seu tempo a atividades religiosas individuais. Os três últimos itens
avaliam, em conjunto, a religiosidade intrínseca, que refere-se ao grau de
compromisso ou motivação religiosa do indivíduo quanto à sua religiosidade
121
;
Material e Métodos 28
A idade epigenética dos indivíduos foi avaliada a partir dos valores β com o
32
método do relógio epigenético descrito por Horvath , que estima a idade molecular
baseado nos níveis de metilação do DNA. Resumidamente, o método utiliza a média
ponderada de 353 sítios CpGs (chamados de „clock CpGs‟) e transforma esse dado no
que o autor denomina como „idade de metilação‟ (ou idade metilômica) através de uma
função de calibração. Além da idade metilômica, esse método fornece a aceleração da
idade (ou „Age acceleration‟ - AA), que é calculada de duas formas: pela diferença
entre a idade epigenética e cronológica dos indivíduos (conhecida como AA
„Difference‟), que vamos chamar pela sigla AADiff neste trabalho, e estimada a partir
dos resíduos de um modelo de regressão linear da idade epigenética regredida pela
idade cronológica (conhecida como AA „Residuals‟), que vamos chamar pela sigla
AARes.
Material e Métodos 29
Para avaliar a relação dos fatores ambientais como mediador na idade epigenética
de dependentes de crack, fizemos uma análise de mediação utilizando modelagem de
equações estruturais. O modelo conceitual proposto foi definido com a medida de idade
epigenética AADiff como variável dependente e os grupos caso e controle como
variável independente. Para a variável mediadora, incluímos as variáveis
sociodemográficas e os instrumentos de avaliação DUREL e WHOQL-BRIEF como
parte de uma variável latente representando os fatores ambientais (Os modelos
conceituais propostos e os diagramas de caminhos serão descritos detalhadamente na
seção „6. Resultados - 6.1.3. Análise de mediação utilizando modelagem de equações
estruturais‟).
Para avaliação do modelo proposto selecionamos a abordagem descrita por Baron e
88
Kenny de análise dos caminhos. Como estimativa de parâmetro selecionamos a
máxima verossimilhança (ML - maximum-likelihood) por se enquadrar melhor no nosso
123
conjunto de dados . Para os índices de ajuste absoluto, selecionamos o teste qui-
97
quadrado (χ2), razão entre o teste qui-quadrado e graus de liberdade (χ2/df) , Root
98,99
mean square error of approximation (RMSEA) e Standardised root mean square
99
residual (SRMR) . Em relação aos índices de ajuste comparativos, utilizados ambos
99,101 102
Comparative fit index (CFI) e Tucker Lewis index (TLI) . Como índices de
ajuste de parcimônia utilizamos os índices Akaike information criterion (AIC) e
Bayesian Information Criterion (BIC) 103.
A análise de mediação utilizando SEM foi realizada no software R utilizando o
104
pacote lavaan . Os resultados serão apresentados utilizando coeficientes e erros
padronizados.
125
(DMRs) utilizamos o pacote DMRcate , considerando significante FDR (False
discovery rate) <0,05, diferença de metilação entre os grupos (delta beta, ∆β) ≥ 5% e
com, no mínimo, quatro CpGs.
Genes diferencialmente metilados, relacionados aos DMSs e DMRs, foram
126
anotados funcionalmente no ClueGO (v.2.5.7) , um plug-in do software de
visualização de redes de interação molecular Cytoscape (v.3.7.2) 127. O ClueGO integra
termos de ontologia genética (GO – gene ontology) e cria uma rede de termos GO e vias
biológicas funcionalmente organizadas. O enriquecimento dos genes foi realizado
128
usando o banco de dados Reactome com especificidade média de rede (p-valor
<0,05). Para correção do p-valor foi utilizado o método BH (Benjamini-Hochberg),
teste hipergeométrico bilateral e pelo menos cinco genes por categoria. Os termos GO
foram repetidamente comparados, combinados em grupos funcionais e visualizados no
Cytoscape 127.
A idade epigenética dos indivíduos foi avaliada a partir dos valores β com o
32
método do relógio epigenético descrito por Horvath , como descrito anteriormente.
Para cumprir o objetivo proposto também foi utilizada a aceleração da idade com as
métricas AADiff e AARes.
A avaliação da qualidade de vida mostrou que enquanto 54% dos casos avaliou a
própria qualidade de vida como „Muito ruim‟ ou „Ruim‟ (29,7% e 24,6%,
respectivamente) (Figura 3), 66% dos controles avaliou sua qualidade de vida como
„Boa‟ (Figura 4) (χ2: 82,53; p-valor: <0,001). Na avaliação de satisfação com a saúde,
ambos os grupos declararam estar „Satisfeitos‟, sendo 34% dos casos e 54% dos
controles (Figuras 3 e 4) (χ2: 50,28; p-valor: <0,001). Em relação à avaliação dos
domínios de qualidade de vida, o domínio „Físico‟ se destacou com maior média para os
casos (16 ± 2,8) e o domínio „Meio ambiente‟ com menor média para o grupo controle
(14 ± 2,3), mas apenas os domínios „Psicológico‟ e „Relações sociais‟ apresentaram
diferença significante entre os grupos (Tabela 2).
Figura 4. Avaliação de qualidade de vida do grupo controle realizada com o instrumento World
Health Organization Quality of Life-Brief instrument (WHOQL-BRIEF) 122. Os dados são
apresentados em n (%). A: Avaliação de qualidade de vida; B: Satisfação com a saúde.
Casos Controles
p-valor ᵇ
Domínio ±DP Md Min Max ±DP Md Min Max
Físico 16 ± 2,8 17 6 20 16 ± 2,3 16 9 20 0,445
Psicológico 14 ± 2,8 15 6 19 15 ± 1,8 15 8 20 0,019
Relações Sociais 14 ± 3,3 15 4 20 16 ± 2,8 16 7 20 <0,001
Meio Ambiente 14 ± 2,6 14 6 20 14 ± 2,3 13 4 18 0,122
Legenda: – Média; DP – Desvio padrão; Md – Mediana; Min – Valor mínimo; Max – Valor máximo.
ᵃ WHOQL-BRIEF - World Health Organization Quality of Life-Brief instrument
ᵇ Teste U de Mann-Whitney
variável dependente. Para isso, propusemos a variável mediadora como uma variável
latente, englobando os fatores ambientais já relacionados na literatura, e disponíveis na
nossa amostra, com a dependência de crack. Primeiro, criamos variáveis latentes para
cada dimensão de dados da nossa amostra: „Sociodemográfico‟ – incluindo etnia,
escolaridade e estado civil; „Drogas‟ – incluindo o uso de álcool, cigarro e outras drogas
(Solventes e sedativos); „WHOQL-BRIEF‟ – incluindo a avaliação de qualidade de
vida, satisfação com a saúde e os quatro domínios de qualidade de vida (Físico,
psicológico, relações sociais e meio ambiente. Essas três variáveis latentes integraram a
variável latente principal „Fatores ambientais‟. Na escala DUREL é indicado que as
dimensões de religiosidade não sejam avaliadas em conjunto, como um escore total,
121
mas analisadas separadamente . Assim, relacionamos cada dimensão (religiosidade
organizacional, religiosidade não organizacional e religiosidade intrínseca) diretamente
com a variável latente principal „Fatores ambientais‟. A variável latente „Fatores
ambientais‟ foi incluída no modelo conceitual como variável mediadora para avaliarmos
os efeitos indiretos (a - impacto da variável independente na variável mediadora; b -
impacto da variável mediadora na variável dependente) e efeito direto (c´ - efeito causal
direto da variável independente sobre a variável dependente controlado pela variável
mediadora) (Figura 6B).
Um terceiro modelo conceitual foi proposto, também incluindo a variável
mediadora como uma variável latente. Mas, para esse modelo, ao invés de utilizarmos
diferentes variáveis latentes para cada dimensão de dados da nossa amostra,
relacionamos todos os fatores ambientais diretamente com a variável latente principal
„Fatores ambientais‟. Como citado para o segundo modelo, essa variável latente
„Fatores ambientais‟ foi incluída no modelo conceitual como variável mediadora para
avaliarmos seus efeitos direto e indiretos (Figura 6C).
Visto que AADiff é a diferença entre a idade metilômica e a idade cronológica dos
indivíduos, a variável idade não foi incluída no modelo, pois esta estaria sendo medida
duas vezes na análise.
Resultados 40
Figura 7. Avaliação do modelo conceitual 1 com efeito total (c) de 0,31 do uso de crack na
AADiff.
Figura 8. Modelo final apresentado para o modelo conceitual 2. Para cada caminho são apresentados os coeficientes de associação e o p-valor
correspondente (entre parênteses). a: Efeito indireto do uso de crack na variável mediadora latente „Fatores ambientais‟; b: Efeito indireto da variável
mediadora latente „Fatores ambientais‟ na AADiff; c´: Efeito direto do uso de crack na AADiff mediado pela variável latente „Fatores ambientais‟. *:
Baseline na análise de associação.
Resultados 43
Figura 9. Covariâncias entre as variáveis utilizadas na composição do modelo final apresentado para o modelo conceitual 2.
Resultados 44
Índices χ2 (p-valor) df χ2/df RMSEA (ICᵃ) SRMR CFI TLI AIC BIC
112.14 0,06
Modelo final 2 56 2,0 0,08 0,95 0,92 9541.45 9706.84
(<0,001) (0,5 - 0,9)
Nota. Valores de referência: χ2 - p-valor >0,05; χ2/df - entre 0 e 2: bom; RMSEA - entre 0,05 e 0,08:
adequado; SRMR - <0,10: aceitável; CFI - ≥0,95; TLI - ≥0,90.
Legenda: df - graus de liberdade; RMSEA - Root mean square error of approximation; SRMR -
Standardised root mean square residual; CFI - Comparative fit index; TLI - Tucker Lewis index; AIC -
Akaike information criterion; BIC - Bayesian Information Criterion.
ᵃ IC: Intervalo de confiança de 90%
Figura 10. Modelo final apresentado para o modelo conceitual 3. Para cada caminho são apresentados os coeficientes de associação e o p-valor
correspondente (entre parênteses). a: Efeito indireto do uso de crack na variável mediadora latente „Fatores ambientais‟; b: Efeito indireto da variável
mediadora latente „Fatores ambientais‟ na AADiff; c´: Efeito direto do uso de crack na AADiff mediado pela variável latente „Fatores ambientais‟. Setas na
cor „azul‟ indicam a covariância entre as variáveis. *: Baseline na análise de associação.
Resultados 46
54.83 0,02
Modelo final 3 51 1,0 0,05 0,99 0,99 7905.72 8037.36
(0,331) (0 - 0,5)
Nota. Valores de referência: χ2 - p-valor >0,05; χ2/df - entre 0 e 2: bom; RMSEA - ≤0,05: bom; SRMR -
<0,05: bom; CFI - ≥0,95; TLI - ≥0,90.
Legenda: df - graus de liberdade; RMSEA - Root mean square error of approximation; SRMR -
Standardised root mean square residual; CFI - Comparative fit index; TLI - Tucker Lewis index; AIC -
Akaike information criterion; BIC - Bayesian Information Criterion.
ᵃ IC: Intervalo de confiança de 90%
modelo conceitual. Os coeficientes de associação dos efeitos indireto (b) e direto (c´)
foram de -0,48 (p-valor: 0,165) e -0,14 (p-valor: 0,667), respectivamente. Esse resultado
sugere que o uso de variáveis latentes englobando diferentes dimensões de dados, como
utilizado no modelo final 2, pode dimensionar os efeitos de associação entre as variáveis
observadas. Assim, apesar de o modelo final 3 atender a todos os índices de ajuste
adequadamente, resultando em um ajuste exato do modelo proposto aos dados da
amostra, não foi possível estabelecer uma relação dos fatores ambientais como
mediador da dependência de crack na aceleração da idade metilômica. Finalmente, na
comparação final dos dois modelos apresentados, o modelo mais plausível, de acordo
com os índices de parcimônia AIC e BIC, é o modelo final 3.
Figura 11. Manhattan plot mostrando a distribuição dos sítios de metilação entre dependentes
de crack e controles. No eixo Y está representado o –log10 do p-valor e no eixo X os
cromossomos. A linha vermelha representa o p-valor ajustado <0,001 para identificação dos
sítios diferencialmente metilados.
Figura 12. Volcano plot mostrando a distribuição dos sítios de metilação entre dependentes de
crack e controles em relação ao status de metilação - azul: Hipometilado; rosa: Hipermetilado.
No eixo Y está representado o –log10 do p-valor e no eixo X os valores ∆β. A linha vermelha
representa o p-valor ajustado <0,001 para identificação dos sítios diferencialmente metilados.
Resultados 49
Tabela 5. Sítios diferencialmente metilados (DMSs) com maior diferença de metilação entre
dependentes de crack e controles
Relação ao gene e
Probe ID adjP Δβ Coord. genômica (hg19) Gene
ilha CpG
cg03382291 5.34E-04 -0.192 chr5:147580954 SPINK6 TSS1500 - open sea
cg25747320 4.70E-04 -0.183 chr14:31043362 G2E3 5'UTR - open sea
cg08267336 7.24E-04 -0.176 chr1:167298149 POU2F1 TSS200 - open sea
cg23577610 3.73E-04 -0.171 chr1:172078666 DNM3 Corpo do gene - open sea
cg00816480 5.03E-04 -0.167 chr12:70711895 CNOT2 Corpo do gene - open sea
cg05601847 9.95E-04 -0.164 chr4:83826691 THAP9 Corpo do gene - open sea
cg04980099 2.23E-04 -0.157 chr15:63836733 USP3 Corpo do gene - open sea
cg22348755 9.33E-04 -0.151 chr2:191991246 STAT4 Corpo do gene - open sea
cg18929316 5.36E-04 0.150 chr17:46176848 CBX1 5'UTR - shore
cg07703331 6.29E-04 0.155 chr13:21521930 LINC00367 Corpo do gene - shore
cg12839200 2.84E-04 0.156 chr11:71789642 NUMA1 Corpo do gene - shore
cg14818176 8.35E-04 0.159 chr17:73148480 HN1 5'UTR - shore
cg24247939 6.64E-04 0.163 chr2:61292081 KIAA1841 TSS1500 - shore
cg04800864 5.14E-04 0.175 chr22:43541019 IGR IGR - shore
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; Δβ - delta beta; chr -
Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Figura 13. Distribuição genômica dos 597 sítios diferencialmente metilados (DMSs) (adjP
<0,001). Os dados são apresentados em proporção (n) em relação ao status de metilação.
Figura 14. Distribuição dos 597 sítios diferencialmente metilados (DMSs) (adjP <0,001) em
relação à ilhas CpG. Os dados são apresentados em proporção (n) em relação ao status de
metilação.
Resultados 51
Figura 15. Representação gráfica das 15 regiões diferencialmente metiladas (DMRs) (FDR
<0,05; ∆β ≥ 5%) entre dependentes de crack (linha vermelha) e controles (linha preta).
Resultados 52
DMR_4 2.29E-05 -0.052 chr12:1025529-1025772 RAD52 Corpo do gene open sea cg06357748; cg14602222; cg16884061; cg26282236
DMR_5 1.26E-05 -0.050 chr6:15505345-15506085 JARID2 Corpo do gene open sea cg03173502; cg14058851; cg23850913; cg24408769
TMEM85; TSS200; cg05180717; cg12949483; cg14433151; cg14560311;
DMR_6 2.72E-05 0.050 chr15:34516488-34517239 open sea
EMC4 TSS1500 cg14847483; cg22549420; cg25494600
DMR_7 3.19E-03 0.051 chr10:29698368-29698462 LOC387647 TSS200 ilha cg03496709; cg14970695; cg16162391; cg19109608
TSS200; cg08890067; cg10937408; cg14587335; cg16329014;
DMR_8 1.67E-04 0.051 chr17:77478569-77478927 HRNBP3 open sea
TSS1500 cg20214871
cg02962952; cg05501509; cg05609335; cg13214295;
DMR_9 2.49E-03 0.052 chr17:75789279-75789529 IGR - ilha; shore
cg22243109
DMR_10 6.33E-03 0.055 chr18:57566144-57566328 PMAIP1 TSS1500 shore cg11957475; cg14685305; cg22549408; cg23084705
DMR_11 1.74E-03 0.056 chr14:56777451-56777525 IGR - open sea cg04067042; cg08443549; cg20474450; cg21556470
Legenda: FDR - False discovery rate; Δβ - delta beta; chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Resultados 53
Figura 16. Vias biológicas identificadas para os genes relacionados aos sítios diferencialmente metilados (DMSs). A: Vias
biológicas; B: Vias biológicas não redundantes e porcentagem de genes por via.
Resultados 55
Figura 17. Processos biológicos identificados para os genes relacionados aos sítios diferencialmente metilados (DMSs).
Resultados 56
Figura 18. Processos biológicos não redundantes identificados para os genes relacionados aos sítios diferencialmente metilados (DMSs) e porcentagem de
genes por processo.
Resultados 57
Figura 19. Boxplot mostrando a pontuação final da escala ETISR-SF para os subgrupos de
dependentes de crack com e sem “eventos traumáticos”. *: Teste U de Mann-Whitney.
Resultados 58
Figura 20. Avaliação da idade epigenética entre os subgrupos de dependentes de crack com
“eventos traumáticos” e sem “eventos traumáticos”. A: Idade cronológica.; B: Idade
metilômica; C: Age acceleration Difference; D: Age acceleration Residuals.
Figura 21. Modelos conceituais propostos para a análise de mediação utilizando modelagem de
equações estruturais. A: Modelo conceitual 4 - Avaliação do efeito total (c) de eventos
traumáticos e estressores na AADiff; B: Modelo conceitual 5 - Avaliação do efeito total (c) de
eventos traumáticos e estressores na AARes; C: Modelo conceitual 6 - Construção da variável
latente „Transtornos psiquiátricos‟ como mediadora. Avaliação dos efeitos indiretos (a - eventos
traumáticos e estressores na variável mediadora; b - impacto da variável mediadora na AADiff)
e efeito direto (c´ - efeito causal de eventos traumáticos e estressores na AADiff controlado pela
variável mediadora); D: Modelo conceitual 7 - Construção da variável latente „Transtornos
psiquiátricos‟ como mediadora. Avaliação dos efeitos de eventos traumáticos e estressores na
variável mediadora (a), impacto da variável mediadora na AARes (b) e efeito causal de eventos
traumáticos e estressores na AARes controlado pela variável mediadora (c´). ε: Erro padrão.
Figura 22. Modelos finais apresentados para os modelos conceituais 4 e 5. A: Modelo final 4
com efeito total (c) de eventos traumáticos e estressores na AADiff; B: Modelo final 5 com
efeito total (c) de eventos traumáticos e estressores na AARes.
65
associadas como um fator de risco associado ao uso do crack . Outras características,
como a religiosidade, espiritualidade e baixa qualidade de vida dos indivíduos, também
têm sido cada vez mais relatadas como tendo uma forte relação com o uso/abuso de
78,79
crack . Em relação à religiosidade, foi demonstrado que usuários que foram mais
144
frequentemente à serviços religiosos apresentavam menos dias de uso de crack e
usuários com maior grau de compromisso quanto à sua religiosidade (religiosidade
intrínseca) apresentavam desejo menos intenso pelo uso da droga 79.
No presente estudo, os dependentes de crack apresentaram religiosidade intrínseca
mais baixa do que o grupo controle. Quanto à dedicação do seu tempo a atividades
religiosas individuais, a maioria dos casos relatou dedicar-se a essas atividades poucas
vezes por mês. Os dependentes de crack relataram ir mais frequentemente à igreja,
templo ou outro encontro religioso comparados ao grupo controle. No entanto, deve-se
ressaltar que o tratamento em comunidades terapêuticas possui um forte componente
religioso e espiritual, sendo os encontros religiosos parte importante do tratamento, o
79
que pode superestimar esse último dado . Um estudo avaliando a relação entre a
espiritualidade de usuários de drogas e as taxas de remissão e recaída no tratamento para
a dependência demonstrou que, para drogas como cocaína, heroína, álcool e maconha,
usuários com baixa espiritualidade têm maiores taxas de recaída enquanto usuários com
alta espiritualidade têm maiores taxas de remissão. No entanto, esses padrões não foram
observados para o uso de crack 145.
A religiosidade de dependentes de crack também foi relacionada com a qualidade
de vida desses indivíduos. Usuários com maior grau de compromisso quanto à sua
religiosidade apresentaram melhor qualidade de vida nos domínios físico, psicológico,
social e ambiente de vida 79. Por outro lado, estudos tem demonstrado que fatores como
sexo, idade, estado civil, escolaridade e nível socioeconômico podem interferir
negativamente na qualidade de vida dos usuários de crack 146. Assim como para o nosso
estudo, no qual observamos que dependentes de crack relataram sua qualidade de vida
como „ruim‟ através do instrumento WHOQOL-BREF, outros estudos utilizando esse
instrumento observaram o mesmo desfecho, com escores menores da qualidade de vida
para os usuários de crack 141,143,146. O instrumento WHOQOL-BREF avalia a qualidade
de vida geral, com a percepção do indivíduo sobre a sua posição na vida no contexto da
cultura e dos sistemas de valores em que vive e em relação aos seus objetivos,
122
expectativas, padrões e preocupações . Outro instrumento utilizado na literatura para
Discussão 65
2,30
do indivíduo é maior do que o esperado (com base na idade cronológica) . A
diferença entre as idades epigenética e cronológica, conhecida como „Age acceleration
Difference‟ (AADiff), é também denominada na literatura como „aceleração da idade
epigenética extrínseca‟ e está relacionada com o envelhecimento do sistema
149
imunológico . Valores positivos de AADiff denotam um envelhecimento epigenético
acelerado 149 e, de acordo com nossos resultados, podemos observar que dependentes de
crack apresentaram esse envelhecimento epigenético acelerado comparados à indivíduos
controle. Já os resíduos de aceleração da idade, definidos como os resíduos de um
modelo multivariado que faz a regressão da idade de metilação do DNA prevista na
149,150
idade cronológica, chamados de „Age acceleration Residuals‟ (AARes) , são
também denominados na literatura como „aceleração da idade epigenética intrínseca‟.
149
Diferente de AADiff, o cálculo da AARes leva em consideração a contagem celular .
Apesar de AARes não apresentar diferença estatisticamente significativa entre
dependentes de crack e controles no presente estudo, em conjunto com os demais
resultados de maior idade metilômica e AADiff, nossos resultados apresentam
evidências de que dependentes de crack são biologicamente mais velhos.
Utilizando uma análise de mediação em um modelo de equações estruturais,
observamos que, nos dois modelos finais apresentados (modelos 2 e 3), os fatores
ambientais não atuaram como um mediador sobre o impacto da dependência de crack na
aceleração de idade dos indivíduos. Em ambos os modelos, os fatores ambientais
apresentaram associação negativa com os grupos de estudo e com a aceleração da idade,
indicando relações inversas entre essas variáveis. Esse resultado é, no mínimo, curioso,
pois as variáveis que englobam a variável latente “Fatores ambientais” foram
previamente associadas ao uso de crack e à aceleração de idade epigenética, como
citado anteriormente. Assim, era esperado uma associação positiva entre essas variáveis
na nossa amostra, mas esse resultado não foi observado.
.
7.2. Objetivo Específico 2
9.1. ANEXO A
9.2. ANEXO B
Tabela Anexo B. Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg03382291 5.34E-04 0.373 0.181 -0.192 chr5:147580954 SPINK6 TSS1500 - open sea
cg25747320 4.70E-04 0.338 0.155 -0.183 chr14:31043362 G2E3 5'UTR - open sea
cg08267336 7.24E-04 0.381 0.204 -0.176 chr1:167298149 POU2F1 TSS200 - open sea
cg23577610 3.73E-04 0.369 0.199 -0.171 chr1:172078666 DNM3 Corpo do gene - open sea
cg00816480 5.03E-04 0.341 0.174 -0.167 chr12:70711895 CNOT2 Corpo do gene - open sea
cg05601847 9.95E-04 0.365 0.200 -0.164 chr4:83826691 THAP9 Corpo do gene - open sea
cg04980099 2.23E-04 0.306 0.150 -0.157 chr15:63836733 USP3 Corpo do gene - open sea
cg22348755 9.33E-04 0.298 0.147 -0.151 chr2:191991246 STAT4 Corpo do gene - open sea
cg05575921 1.73E-04 0.743 0.594 -0.149 chr5:373378 AHRR Corpo do gene - shore
cg04171753 5.24E-04 0.276 0.128 -0.148 chr18:33045127 IGR IGR - open sea
cg21247889 1.87E-04 0.279 0.132 -0.146 chr16:79485198 IGR IGR - open sea
cg06466659 6.69E-04 0.287 0.141 -0.145 chr2:213990963 IKZF2 Corpo do gene - open sea
cg17243480 3.17E-04 0.376 0.231 -0.145 chr9:108980845 IGR IGR - open sea
cg12689670 9.49E-04 0.290 0.148 -0.142 chr1:183009347 LAMC1 Corpo do gene - open sea
cg14976084 3.95E-04 0.489 0.351 -0.138 chr3:10204012 IGR IGR - shelf
cg12274324 4.53E-04 0.292 0.154 -0.138 chr9:125583959 PDCL Corpo do gene - open sea
cg02316792 5.42E-04 0.261 0.127 -0.134 chr4:10686457 CLNK TSS200 - open sea
cg11246419 9.10E-04 0.277 0.143 -0.134 chr8:91180189 IGR IGR - open sea
cg09654536 5.43E-04 0.420 0.298 -0.122 chr4:160027458 IGR IGR - shelf
cg02575483 6.54E-04 0.274 0.155 -0.119 chr6:117826706 DCBLD1 Corpo do gene - open sea
cg16506300 9.49E-04 0.224 0.107 -0.117 chr16:12444635 SNX29 Corpo do gene - open sea
cg03038869 6.58E-04 0.262 0.149 -0.113 chr15:67286614 IGR IGR - open sea
cg12565636 8.16E-04 0.223 0.111 -0.112 chr8:39797497 IDO2 Corpo do gene - open sea
cg10287032 5.03E-04 0.237 0.125 -0.111 chr2:24552676 ITSN2 5'UTR - open sea
cg17050747 6.56E-04 0.251 0.141 -0.110 chr5:89427766 IGR IGR - open sea
cg10518264 8.70E-04 0.219 0.111 -0.107 chr6:32909440 HLA-DMB TSS1500 - open sea
cg01015401 7.24E-04 0.232 0.126 -0.106 chr4:129630613 IGR IGR - open sea
cg17699374 6.58E-04 0.199 0.097 -0.102 chr22:37403802 C22orf33 5'UTR - open sea
cg18559386 8.16E-04 0.219 0.119 -0.100 chr10:14604648 FAM107B 5'UTR - open sea
cg17405687 9.79E-04 0.193 0.093 -0.100 chr4:124778531 LINC01091 Corpo do gene - open sea
cg26423680 9.49E-04 0.207 0.108 -0.099 chr3:168960390 MECOM 5'UTR - open sea
cg14051805 9.79E-04 0.210 0.112 -0.098 chr15:39917220 FSIP1 Corpo do gene - open sea
cg27200006 8.76E-04 0.269 0.179 -0.090 chr22:25003854 GGT1 5'UTR - open sea
cg24069884 4.53E-04 0.218 0.128 -0.090 chr13:111116765 COL4A2 Corpo do gene - open sea
cg08290733 8.33E-05 0.189 0.101 -0.088 chr6:10519310 IGR IGR - open sea
cg13149979 9.16E-04 0.194 0.107 -0.087 chr16:75139595 ZNRF1 Corpo do gene - open sea
cg13749900 2.36E-04 0.767 0.681 -0.086 chr16:3687835 IGR IGR - open sea
cg15910252 3.73E-04 0.404 0.319 -0.085 chr2:28904192 IGR IGR - open sea
cg23699414 1.73E-04 0.199 0.115 -0.085 chr5:3601762 IGR IGR - island
cg09072199 8.76E-04 0.184 0.101 -0.084 chr1:28507653 PTAFR 5'UTR - open sea
cg24497361 2.12E-04 0.474 0.391 -0.083 chr11:3858493 RHOG 5'UTR - shelf
cg17728974 5.92E-04 0.205 0.124 -0.081 chr6:105403577 LIN28B TSS1500 - shelf
cg09273975 2.34E-04 0.162 0.084 -0.078 chr17:37139595 IGR IGR - open sea
cg19996654 4.82E-04 0.747 0.670 -0.077 chr14:56403510 IGR IGR - open sea
cg10566303 6.69E-04 0.194 0.118 -0.076 chr4:57702948 IGR IGR - open sea
cg12252378 3.55E-04 0.175 0.099 -0.076 chr2:9748413 YWHAQ Corpo do gene - open sea
cg05082708 5.90E-04 0.162 0.086 -0.076 chr4:4765299 IGR IGR - open sea
cg07800265 8.33E-05 0.189 0.114 -0.076 chr15:43219076 IGR IGR - open sea
cg15997130 8.15E-04 0.171 0.096 -0.075 chr1:24165203 IGR IGR - open sea
cg03338962 6.56E-04 0.165 0.091 -0.074 chr14:35673382 KIAA0391 Corpo do gene - open sea
cg03916245 3.73E-04 0.163 0.089 -0.074 chr14:64770272 ESR2 5'UTR - open sea
cg08128168 7.24E-04 0.152 0.079 -0.073 chr12:32575853 IGR IGR - open sea
cg15689991 6.47E-04 0.172 0.098 -0.073 chr12:65019329 RASSF3 Corpo do gene - open sea
cg08810700 8.15E-04 0.889 0.906 0.018 chr14:73453942 ZFYVE1 TSS1500 - open sea
cg01519820 5.72E-04 0.889 0.907 0.018 chr11:107400934 ALKBH8 Corpo do gene - open sea
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 80
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg04750756 3.73E-04 0.194 0.121 -0.073 chr7:65495996 IGR IGR - open sea
cg01103911 5.00E-04 0.163 0.090 -0.073 chr2:29044463 SPDYA Corpo do gene - open sea
cg01303199 8.33E-05 0.187 0.114 -0.072 chr7:129017393 AHCYL2 Corpo do gene - open sea
cg05457768 9.78E-04 0.278 0.206 -0.072 chr6:28751790 IGR IGR - shelf
cg04608991 6.56E-04 0.166 0.095 -0.071 chr8:124469165 IGR IGR - open sea
cg24339570 1.26E-04 0.168 0.097 -0.071 chr17:65685799 PITPNC1 Corpo do gene - open sea
cg21790695 6.83E-04 0.139 0.069 -0.071 chr10:35070092 PARD3 Corpo do gene - open sea
cg17737314 2.55E-06 0.191 0.121 -0.070 chr1:44114355 KDM4A TSS1500 - shore
cg05460226 9.19E-04 0.310 0.240 -0.070 chr17:8804279 PIK3R5 Corpo do gene - open sea
cg22695532 8.98E-04 0.156 0.087 -0.069 chr1:84158538 IGR IGR - open sea
cg08792700 6.56E-04 0.356 0.287 -0.069 chr9:86911279 SLC28A3 Corpo do gene - open sea
cg06134956 8.11E-04 0.160 0.091 -0.069 chr7:91576047 AKAP9 Corpo do gene - open sea
cg06826971 5.03E-04 0.177 0.108 -0.069 chr20:30048464 IGR IGR - open sea
cg22431400 1.51E-04 0.158 0.089 -0.069 chr12:12480953 IGR IGR - open sea
cg07609883 8.70E-04 0.170 0.102 -0.068 chr7:35749209 IGR IGR - open sea
cg16943816 2.22E-04 0.157 0.090 -0.068 chr6:111551664 IGR IGR - open sea
cg04272872 5.03E-04 0.222 0.155 -0.067 chr7:148659845 IGR IGR - open sea
cg16018211 3.73E-04 0.205 0.138 -0.067 chr19:52489829 ZNF350 5'UTR - open sea
cg01991785 6.54E-04 0.192 0.125 -0.067 chr17:78549280 RPTOR Corpo do gene - open sea
cg02048334 1.47E-04 0.133 0.066 -0.066 chr16:28560833 IGR IGR - open sea
cg26875626 6.56E-04 0.129 0.063 -0.065 chr4:153021529 IGR IGR - open sea
cg01373201 9.07E-04 0.138 0.074 -0.065 chr10:81054018 ZMIZ1 Corpo do gene - open sea
cg03437769 8.09E-04 0.156 0.091 -0.065 chr2:28937060 IGR IGR - open sea
cg04657325 9.22E-04 0.197 0.133 -0.065 chr4:185435601 IGR IGR - open sea
cg19188297 2.89E-04 0.158 0.095 -0.063 chr12:51219239 IGR IGR - open sea
cg03107123 3.94E-04 0.143 0.079 -0.063 chr19:19083366 IGR IGR - open sea
cg00622815 8.87E-04 0.148 0.084 -0.063 chr20:46084231 IGR IGR - open sea
cg19572324 4.05E-04 0.141 0.078 -0.063 chr12:100623863 IGR IGR - open sea
cg23497020 1.19E-04 0.175 0.112 -0.063 chr12:50616562 LIMA1 Corpo do gene - open sea
cg21814550 8.70E-04 0.160 0.097 -0.063 chr14:53170147 IGR IGR - shelf
cg02115282 3.95E-04 0.139 0.077 -0.062 chr2:25745241 DTNB Corpo do gene - open sea
cg10296406 2.07E-04 0.127 0.065 -0.062 chr4:40182240 IGR IGR - open sea
cg20988331 8.66E-04 0.126 0.065 -0.061 chr11:60955214 IGR IGR - open sea
cg06037077 6.07E-04 0.748 0.687 -0.061 chr7:75862177 SRRM3 5'UTR - shelf
cg14094256 7.24E-04 0.182 0.121 -0.061 chr6:24767197 IGR IGR - open sea
cg26543959 6.56E-04 0.162 0.101 -0.061 chr21:19051458 IGR IGR - open sea
cg25849916 1.19E-04 0.129 0.068 -0.061 chr8:95825854 IGR IGR - open sea
cg17614826 3.73E-04 0.128 0.067 -0.060 chr16:30461250 IGR IGR - open sea
cg08460732 4.95E-04 0.215 0.154 -0.060 chr2:10256302 IGR IGR - shelf
cg06965839 3.21E-04 0.621 0.561 -0.060 chr17:3303148 OR1E1 TSS1500 - open sea
cg12205358 9.39E-05 0.123 0.063 -0.059 chr1:95221354 LINC01057 Corpo do gene - open sea
cg23314189 5.03E-04 0.149 0.090 -0.059 chr8:41287793 IGR IGR - open sea
cg12028969 5.43E-04 0.142 0.084 -0.058 chr11:34393189 IGR IGR - open sea
cg06894134 4.89E-04 0.243 0.185 -0.057 chr6:85476921 IGR IGR - shelf
cg08412188 3.73E-04 0.127 0.071 -0.056 chr7:74074356 GTF2I 5'UTR - shore
cg09938516 4.48E-04 0.152 0.096 -0.056 chr19:55957628 IGR IGR - shelf
cg13739025 8.99E-04 0.156 0.100 -0.056 chr9:125572818 IGR IGR - open sea
cg10102968 1.73E-04 0.124 0.069 -0.055 chr20:48381842 IGR IGR - open sea
cg06422757 8.99E-04 0.190 0.134 -0.055 chr6:36409495 PXT1 5'UTR - shore
cg13713667 5.53E-04 0.140 0.085 -0.055 chr14:78057532 SPTLC2 Corpo do gene - open sea
cg01067635 8.99E-04 0.130 0.076 -0.054 chr1:45196876 IGR IGR - open sea
cg10087036 8.42E-04 0.143 0.089 -0.054 chr16:19130461 ITPRIPL2 1stExon - shelf
cg18457224 1.78E-04 0.123 0.070 -0.053 chr11:116976910 IGR IGR - open sea
cg19559506 6.35E-04 0.173 0.120 -0.053 chr10:16587199 IGR IGR - open sea
cg05783998 9.34E-04 0.143 0.090 -0.053 chr6:74295921 IGR IGR - open sea
cg18886147 9.48E-04 0.883 0.901 0.018 chr12:1609741 LOC100292680 Corpo do gene - open sea
cg06161948 3.55E-04 0.903 0.921 0.018 chr19:33592011 GPATCH1 Corpo do gene - open sea
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 81
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg12075928 7.36E-04 0.707 0.654 -0.053 chr8:141801307 PTK2 Corpo do gene - open sea
cg13529282 8.76E-04 0.155 0.103 -0.053 chrX:23652439 IGR IGR - open sea
cg12793863 6.32E-04 0.773 0.720 -0.053 chr6:109612628 IGR IGR - shore
cg18036270 2.89E-04 0.142 0.090 -0.052 chr11:125384310 IGR IGR - open sea
cg08400933 7.46E-04 0.202 0.150 -0.052 chr15:65596744 IGR IGR - shelf
cg12229388 6.18E-04 0.127 0.075 -0.052 chr10:70088219 PBLD 5'UTR - shelf
cg16637427 9.43E-04 0.180 0.128 -0.052 chr15:89456971 MFGE8 TSS1500 - shore
cg13156336 7.85E-04 0.123 0.071 -0.051 chr11:61938979 IGR IGR - open sea
cg22763040 4.53E-04 0.162 0.110 -0.051 chr12:50615251 LIMA1 Corpo do gene - open sea
cg16783745 5.43E-04 0.114 0.063 -0.051 chr8:120879530 IGR IGR - open sea
cg01561839 4.48E-04 0.124 0.074 -0.050 chr1:224521239 IGR IGR - shelf
cg22822822 9.79E-04 0.129 0.079 -0.050 chr8:17010106 IGR IGR - shelf
cg01245356 5.81E-04 0.129 0.079 -0.050 chr1:28559620 DNAJC8 TSS200 - shore
cg10597543 8.33E-05 0.842 0.792 -0.050 chr17:62389031 IGR IGR - open sea
cg17605068 8.33E-05 0.113 0.063 -0.050 chr10:70088173 PBLD 5'UTR - shelf
cg02061431 9.03E-04 0.109 0.059 -0.050 chr1:92150549 TGFBR3 Corpo do gene - open sea
cg25082677 5.14E-04 0.150 0.101 -0.050 chr17:67565280 IGR IGR - open sea
cg20630456 3.73E-04 0.117 0.068 -0.049 chr18:43542576 EPG5 Corpo do gene - open sea
cg17078326 9.41E-04 0.684 0.636 -0.048 chr4:4509338 STX18 Corpo do gene - open sea
cg08073979 9.68E-04 0.114 0.066 -0.048 chrX:119632157 IGR IGR - open sea
cg04244170 6.45E-04 0.119 0.071 -0.048 chr3:100116021 TOMM70A Corpo do gene - shelf
cg12478874 9.99E-04 0.113 0.065 -0.047 chr15:80263632 BCL2A1 1stExon - open sea
cg24837911 1.73E-04 0.112 0.065 -0.047 chr12:49595071 IGR IGR - open sea
cg27553372 9.06E-07 0.123 0.076 -0.047 chr12:120731091 IGR IGR - open sea
cg02858642 9.22E-04 0.121 0.074 -0.047 chr1:202312902 IGR IGR - shore
cg19521414 8.49E-04 0.114 0.067 -0.047 chr1:28559596 DNAJC8 TSS200 - island
cg07457402 8.99E-04 0.156 0.109 -0.047 chr2:179279443 MIR548N Corpo do gene - shore
cg18550212 3.73E-04 0.118 0.072 -0.046 chr11:63435428 ATL3 Corpo do gene - shelf
cg05880324 6.47E-04 0.147 0.102 -0.046 chr16:12990586 IGR IGR - shelf
cg01253321 9.49E-04 0.131 0.085 -0.045 chr17:5322267 RPAIN TSS1500 - shore
cg21750785 6.48E-04 0.109 0.064 -0.045 chr6:117819571 DCBLD1 Corpo do gene - open sea
cg19432600 3.73E-04 0.093 0.048 -0.045 chr12:31789697 IGR IGR - open sea
cg17320944 5.03E-04 0.188 0.143 -0.045 chr12:81855113 PPFIA2 5'UTR - open sea
cg08762410 3.73E-04 0.104 0.060 -0.044 chr12:7708497 IGR IGR - open sea
cg24130348 3.53E-04 0.146 0.102 -0.044 chr22:41682824 RANGAP1 TSS1500 - shore
cg26991596 8.35E-04 0.123 0.081 -0.042 chr18:77440820 CTDP1 TSS1500 - shore
cg15241773 4.48E-04 0.121 0.079 -0.042 chr13:85470475 IGR IGR - open sea
cg07394019 9.07E-04 0.092 0.049 -0.042 chr11:61146265 IGR IGR - open sea
cg17882584 6.56E-04 0.101 0.059 -0.042 chr3:42067316 IGR IGR - open sea
cg20428512 2.23E-04 0.095 0.054 -0.042 chr6:29621441 IGR IGR - shelf
cg20525088 8.41E-04 0.087 0.046 -0.041 chr13:112859484 IGR IGR - open sea
cg08152058 7.30E-04 0.095 0.054 -0.041 chr20:33999335 UQCC Corpo do gene - open sea
cg24482496 4.40E-04 0.101 0.060 -0.041 chr17:30228390 UTP6 Corpo do gene - shore
cg27353361 8.02E-04 0.099 0.058 -0.041 chr6:108145420 SCML4 1stExon - open sea
cg12537452 9.79E-04 0.089 0.049 -0.040 chr2:202023279 CFLAR-AS1 TSS1500 - open sea
cg06762477 9.54E-04 0.123 0.083 -0.040 chr2:206951646 INO80D TSS1500 - shore
cg26720491 9.79E-04 0.097 0.057 -0.040 chr1:167517766 CREG1 Corpo do gene - open sea
cg14843013 9.79E-04 0.094 0.054 -0.040 chr18:61111956 IGR IGR - open sea
cg03142458 9.13E-04 0.094 0.055 -0.040 chr1:204476256 IGR IGR - open sea
cg23076476 9.00E-04 0.196 0.157 -0.039 chr11:26353484 ANO3 TSS200 - shore
cg11710314 9.49E-04 0.172 0.134 -0.038 chrX:48980265 GPKOW TSS200 - island
cg07813134 8.15E-04 0.114 0.076 -0.038 chr12:55329199 IGR IGR - open sea
cg15819914 6.75E-04 0.096 0.058 -0.038 chr1:155474162 ASH1L Corpo do gene - open sea
cg21784254 5.43E-04 0.077 0.040 -0.037 chr13:108922428 TNFSF13B 1stExon - open sea
cg02929956 5.03E-04 0.098 0.061 -0.037 chr14:74111258 DNAL1 TSS1500 - shore
cg03519031 5.47E-04 0.908 0.926 0.019 chr2:74980612 IGR IGR - shore
cg06999384 1.98E-04 0.898 0.916 0.019 chr2:62053528 FAM161A 3'UTR - open sea
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 82
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg09366641 6.56E-04 0.098 0.061 -0.036 chr1:153643528 ILF2 TSS200 - island
cg22332884 6.47E-04 0.117 0.081 -0.036 chrX:48980256 GPKOW TSS200 - island
cg04509607 5.09E-04 0.121 0.085 -0.036 chr15:91538344 PRC1 TSS1500 - shore
cg06972810 5.47E-04 0.075 0.039 -0.036 chr8:24272697 LOC101929294 Corpo do gene - open sea
cg05877528 4.65E-04 0.086 0.052 -0.034 chr22:26875552 HPS4 TSS200 - shelf
cg03178820 9.64E-04 0.126 0.092 -0.034 chr2:190627986 OSGEPL1 TSS200 - open sea
cg07488576 6.47E-04 0.072 0.039 -0.033 chr2:192711481 SDPR 1stExon - open sea
cg10337377 6.65E-04 0.131 0.098 -0.033 chr16:55746561 IGR IGR - open sea
cg21010044 9.45E-04 0.093 0.061 -0.033 chr11:46615819 AMBRA1 TSS1500 - shore
cg05134616 8.27E-04 0.094 0.062 -0.032 chr6:30509458 GNL1 3'UTR - open sea
cg16797277 3.78E-04 0.081 0.049 -0.032 chr15:79152920 IGR IGR - open sea
cg08110170 2.07E-04 0.110 0.079 -0.031 chr11:72474129 STARD10 Corpo do gene - open sea
cg18650462 6.70E-04 0.125 0.094 -0.031 chr17:9479287 CFAP52 TSS1500 - shore
cg21691367 3.73E-04 0.089 0.058 -0.031 chr6:151325642 MTHFD1L Corpo do gene - open sea
cg24562746 8.60E-04 0.093 0.062 -0.030 chr19:44598112 ZNF224 TSS1500 - shore
cg21912319 5.04E-04 0.112 0.082 -0.030 chr6:27799567 HIST1H4K TSS1500 - shore
cg07339236 6.07E-04 0.082 0.051 -0.030 chr20:50312490 ATP9A Corpo do gene - open sea
cg14141380 8.37E-04 0.138 0.108 -0.030 chr7:20826721 SP8 TSS1500 - shore
cg12689529 3.73E-04 0.099 0.070 -0.029 chr11:126335883 KIRREL3 Corpo do gene - open sea
cg15200793 5.99E-04 0.121 0.092 -0.029 chr2:42722317 KCNG3 TSS1500 - shore
cg21285431 3.94E-04 0.086 0.058 -0.029 chr10:79789707 POLR3A TSS1500 - shore
cg14530184 3.73E-04 0.876 0.848 -0.028 chr9:117177141 DFNB31 Corpo do gene - open sea
cg00485194 9.07E-04 0.096 0.069 -0.027 chr3:21792684 ZNF385D 1stExon - open sea
cg23501171 3.53E-04 0.081 0.055 -0.026 chr1:11968028 IGR IGR - open sea
cg02018408 8.76E-04 0.103 0.076 -0.026 chr16:25269986 ZKSCAN2 TSS1500 - shore
cg04456219 5.72E-04 0.093 0.067 -0.026 chr7:17274337 IGR IGR - open sea
cg14759064 5.03E-04 0.098 0.073 -0.025 chr5:140026603 NDUFA2 Corpo do gene - shore
cg18153279 3.73E-04 0.064 0.039 -0.025 chr12:112825216 IGR IGR - open sea
cg01593345 2.23E-04 0.067 0.042 -0.025 chr12:12932730 APOLD1 Corpo do gene - open sea
cg19470964 4.48E-04 0.098 0.073 -0.025 chr15:91203934 LINC01585 Corpo do gene - open sea
cg03883941 4.48E-04 0.062 0.037 -0.025 chr11:33384058 IGR IGR - open sea
cg01616228 8.87E-04 0.078 0.053 -0.025 chr6:21857295 CASC15 Corpo do gene - open sea
cg24473500 7.13E-04 0.083 0.058 -0.025 chr7:871436 UNC84A 5'UTR - open sea
cg16593229 8.12E-04 0.074 0.049 -0.025 chr22:18122303 BCL2L13 5'UTR - shore
cg15470936 2.23E-04 0.097 0.072 -0.025 chr16:5666398 LINC01570 TSS200 - open sea
cg17738628 7.36E-04 0.142 0.118 -0.024 chr15:67155520 IGR IGR - open sea
cg06777853 3.94E-04 0.078 0.055 -0.024 chr14:61201602 MNAT1 1stExon - open sea
cg17821168 8.01E-04 0.110 0.086 -0.023 chr3:127175050 IGR IGR - shore
cg10428791 4.48E-04 0.085 0.062 -0.023 chr20:62580620 UCKL1 Corpo do gene - open sea
cg11017057 5.81E-04 0.081 0.058 -0.023 chr3:51706056 TEX264 5'UTR - shore
cg17899718 8.87E-04 0.063 0.040 -0.022 chr22:22171121 MAPK1 Corpo do gene - open sea
cg10391636 6.47E-04 0.065 0.042 -0.022 chr2:225222267 IGR IGR - open sea
cg27294460 9.14E-04 0.866 0.844 -0.022 chr3:29738423 RBMS3 Corpo do gene - open sea
cg01520972 5.03E-04 0.069 0.046 -0.022 chr14:65450614 IGR IGR - shelf
cg23271831 9.79E-04 0.066 0.044 -0.022 chr7:94024254 COL1A2 1stExon - open sea
cg13836518 5.99E-04 0.080 0.058 -0.022 chr9:100883593 CORO2A 3'UTR - shore
cg14788726 3.73E-04 0.073 0.052 -0.021 chr16:27191053 IGR IGR - open sea
cg11592094 6.75E-04 0.898 0.877 -0.021 chr15:74033089 C15orf59 Corpo do gene - open sea
cg07309361 5.99E-04 0.061 0.041 -0.020 chr3:52001477 PCBP4 TSS200 - open sea
cg04856043 4.22E-04 0.078 0.059 -0.020 chr2:20851304 HS1BP3 TSS1500 - shore
cg13179085 3.53E-04 0.063 0.044 -0.019 chr12:93963345 SOCS2 TSS1500 - shore
cg11847459 4.48E-04 0.061 0.042 -0.019 chr14:36789488 MBIP Corpo do gene - open sea
cg13220287 8.28E-04 0.078 0.060 -0.018 chr6:126102072 IGR IGR - open sea
cg07190229 6.83E-04 0.071 0.052 -0.018 chr8:142377361 GPR20 1stExon - open sea
cg25598530 9.01E-04 0.066 0.048 -0.018 chr1:148193376 IGR IGR - open sea
cg18269801 4.48E-04 0.900 0.919 0.019 chr17:35732756 ACACA 5'UTR - open sea
cg01837631 9.06E-04 0.848 0.867 0.019 chr16:68340409 SLC7A6OS Corpo do gene - shelf
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 83
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg06051491 5.01E-04 0.797 0.779 -0.018 chr9:79034422 IGR IGR - open sea
cg22018051 5.81E-04 0.112 0.094 -0.018 chr1:154943349 SHC1 5'UTR - shelf
cg13013965 8.60E-04 0.053 0.036 -0.017 chr14:105557111 IGR IGR - shelf
cg19329408 1.90E-04 0.068 0.051 -0.017 chr3:132379034 UBA5 TSS200 - shore
cg22189357 9.35E-04 0.049 0.032 -0.017 chr1:24136425 HMGCL Corpo do gene - open sea
cg00359181 2.41E-04 0.067 0.051 -0.017 chr2:38893519 GALM Corpo do gene - open sea
cg21238221 8.07E-04 0.064 0.047 -0.016 chr14:68162436 RDH11 1stExon - open sea
cg00407093 7.24E-04 0.060 0.044 -0.016 chr9:23826461 ELAVL2 TSS1500 - shelf
cg23681213 9.06E-04 0.066 0.049 -0.016 chr14:74180391 PNMA1 1stExon - shore
cg13695535 1.26E-04 0.055 0.040 -0.016 chr5:66124603 MAST4 1stExon - open sea
cg05877694 9.45E-04 0.062 0.047 -0.015 chr11:128775743 KCNJ5 5'UTR - open sea
cg18362489 4.48E-04 0.050 0.035 -0.015 chr11:46143434 PHF21A TSS1500 - open sea
cg21161138 9.22E-04 0.637 0.621 -0.015 chr5:399360 AHRR Corpo do gene - open sea
cg21745165 9.49E-04 0.799 0.784 -0.015 chr19:49319447 HSD17B14 Corpo do gene - shelf
cg13826447 5.47E-04 0.062 0.047 -0.015 chr17:46019006 PNPO 5'UTR - open sea
cg10702789 1.01E-04 0.057 0.042 -0.015 chr6:12958127 PHACTR1 Corpo do gene - open sea
cg11271605 9.79E-04 0.040 0.026 -0.015 chr7:87936282 STEAP4 TSS200 - open sea
cg10316474 9.41E-04 0.048 0.034 -0.014 chr22:39410068 APOBEC3C TSS200 - open sea
cg12542281 9.87E-04 0.053 0.039 -0.014 chr13:33113069 N4BP2L2 TSS200 - open sea
cg16252705 5.14E-04 0.046 0.032 -0.014 chr14:23025981 IGR IGR - open sea
cg27143082 5.03E-04 0.058 0.044 -0.014 chr6:31744628 C6orf27 5'UTR - open sea
cg18292999 8.12E-04 0.051 0.038 -0.013 chr20:47893669 ZNFX1 5'UTR - shore
cg17498615 8.09E-04 0.050 0.037 -0.013 chr13:97874551 MBNL2 TSS200 - open sea
cg21262854 9.22E-04 0.043 0.030 -0.013 chr7:92861612 CCDC132 TSS200 - open sea
cg06541188 9.79E-04 0.051 0.038 -0.013 chr1:206643735 IKBKE TSS200 - open sea
cg14471560 5.03E-04 0.049 0.036 -0.013 chr2:99225332 C2orf64 TSS1500 - shore
cg26784596 3.95E-04 0.055 0.042 -0.013 chr3:140769814 SPSB4 TSS1500 - shore
cg07316978 8.70E-04 0.893 0.881 -0.012 chr6:157529107 ARID1B 3'UTR - open sea
cg04982748 4.53E-04 0.041 0.029 -0.012 chr12:66696283 HELB TSS200 - open sea
cg27149567 3.73E-04 0.863 0.851 -0.012 chr21:47314725 PCBP3 Corpo do gene - shelf
cg07211155 3.73E-04 0.857 0.845 -0.012 chr2:144359756 ARHGAP15 Corpo do gene - open sea
cg06948947 9.22E-04 0.050 0.038 -0.011 chr7:72993313 TBL2 TSS1500 - island
cg20031457 8.12E-04 0.047 0.037 -0.010 chr14:21150335 IGR IGR - shore
cg04920574 9.22E-04 0.049 0.039 -0.010 chr6:84569242 CYB5R4 TSS200 - shore
cg12971526 9.01E-04 0.041 0.032 -0.010 chr19:36001401 DMKN 5'UTR - open sea
cg00446722 9.79E-04 0.919 0.910 -0.009 chr8:97620628 SDC2 Corpo do gene - open sea
cg01767202 8.15E-04 0.035 0.026 -0.009 chr14:36789886 MBIP TSS200 - open sea
cg09247880 4.48E-04 0.049 0.041 -0.008 chr6:30028651 ZNRD1 TSS1500 - shore
cg05409276 9.48E-04 0.037 0.029 -0.008 chr17:73400549 GRB2 5'UTR - shore
cg02843856 5.16E-04 0.033 0.025 -0.007 chr4:8581972 GPR78 TSS1500 - shore
cg02044738 7.24E-04 0.035 0.028 -0.007 chr3:119182380 TMEM39A 5'UTR - open sea
cg06746101 4.48E-04 0.037 0.033 -0.004 chr15:79603771 TMED3 Corpo do gene - island
cg07634902 8.36E-04 0.033 0.029 -0.004 chr11:93517282 MED17 TSS200 - shore
cg15980752 6.59E-04 0.029 0.026 -0.004 chr1:155178398 THBS3 TSS1500 - shore
cg27087212 1.73E-04 0.907 0.908 0.000 chr5:56908877 LINCR-0003 Corpo do gene - open sea
cg25499687 8.76E-04 0.027 0.029 0.002 chrX:133507336 PHF6 TSS200 - island
cg23474890 8.44E-04 0.868 0.871 0.002 chr12:122467179 BCL7A Corpo do gene - open sea
cg00334424 8.99E-04 0.810 0.814 0.004 chr2:145559337 TEX41 Corpo do gene - open sea
cg08254771 9.43E-04 0.935 0.940 0.005 chr7:73386116 IGR IGR - open sea
cg07541312 9.79E-04 0.938 0.944 0.006 chr19:47565457 IGR IGR - open sea
cg13629659 8.12E-04 0.905 0.912 0.007 chr1:23664628 HNRNPR 5'UTR - open sea
cg05418331 6.56E-04 0.931 0.938 0.007 chr5:79927572 DHFR Corpo do gene - open sea
cg12172391 7.90E-04 0.927 0.935 0.008 chr1:35643363 IGR IGR - open sea
cg26475594 4.48E-04 0.924 0.931 0.008 chr19:35260608 ZNF599 Corpo do gene - shelf
cg12434848 9.22E-04 0.918 0.926 0.008 chr2:86620618 IGR IGR - open sea
cg02975953 8.07E-04 0.846 0.865 0.018 chr16:88553483 ZFPM1 Corpo do gene - shore
cg19126251 1.73E-04 0.890 0.908 0.018 chr13:31103494 IGR IGR - open sea
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 84
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg05693313 9.79E-04 0.913 0.922 0.009 chr7:148710922 PDIA4 Corpo do gene - open sea
cg26369315 9.48E-04 0.928 0.936 0.009 chr10:134912228 GPR123 Corpo do gene - island
cg02591563 9.71E-04 0.903 0.912 0.009 chr10:65046179 JMJD1C Corpo do gene - open sea
cg19851413 8.37E-04 0.840 0.849 0.009 chr17:9371130 STX8 Corpo do gene - open sea
cg05646066 5.43E-04 0.934 0.944 0.010 chrX:16840741 TXLNG Corpo do gene - open sea
cg00950421 3.73E-04 0.931 0.941 0.010 chr2:208663033 IGR IGR - open sea
cg16228039 9.06E-04 0.874 0.884 0.010 chr15:88535619 NTRK3 Corpo do gene - open sea
cg00548971 9.41E-04 0.900 0.911 0.011 chr7:47754734 IGR IGR - open sea
cg06976209 9.14E-04 0.880 0.891 0.011 chr3:15457528 METTL6 Corpo do gene - open sea
cg06722397 8.85E-04 0.883 0.894 0.011 chr1:7839884 VAMP3 3'UTR - shelf
cg11254527 8.76E-04 0.899 0.911 0.012 chr1:35873695 ZMYM4 Corpo do gene - open sea
cg06142142 6.58E-04 0.895 0.906 0.012 chr10:115938512 TDRD1 TSS1500 - shore
cg20324595 8.15E-04 0.893 0.905 0.012 chr1:62889861 IGR IGR - open sea
cg21037155 9.49E-04 0.905 0.917 0.012 chr17:37616956 CDK12 TSS1500 - shore
cg11664673 8.17E-04 0.928 0.940 0.012 chr10:28824590 WAC Corpo do gene - shore
cg02711904 5.03E-04 0.915 0.928 0.013 chr9:33364624 NFX1 Corpo do gene - open sea
cg06592137 2.07E-04 0.925 0.938 0.013 chr17:56029300 CUEDC1 5'UTR - shelf
cg02331812 5.47E-04 0.918 0.931 0.013 chr11:118842932 FOXR1 Corpo do gene - island
cg09103769 9.66E-04 0.904 0.918 0.013 chr1:5803246 IGR IGR - open sea
cg04345694 8.25E-04 0.900 0.914 0.014 chr8:8439596 IGR IGR - open sea
cg17608456 8.35E-04 0.835 0.849 0.014 chr10:14599023 FAM107B 5'UTR - open sea
cg17943624 8.87E-04 0.911 0.925 0.014 chr8:48424300 SPIDR Corpo do gene - open sea
cg15503706 7.21E-04 0.923 0.937 0.014 chr17:35679212 ACACA Corpo do gene - open sea
cg06452086 5.05E-04 0.913 0.927 0.014 chr3:149686266 PFN2 Corpo do gene - shore
cg12204245 5.03E-04 0.879 0.893 0.014 chr13:114321214 GRK1 TSS1500 - open sea
cg18656644 6.07E-04 0.923 0.937 0.014 chr19:41058885 SPTBN4 Corpo do gene - shore
cg17996603 3.64E-04 0.889 0.903 0.014 chr2:110959266 NPHP1 Corpo do gene - shelf
cg04532381 6.75E-04 0.897 0.911 0.014 chr17:9359598 STX8 Corpo do gene - open sea
cg16612400 9.87E-04 0.913 0.928 0.015 chr17:60231895 IGR IGR - open sea
cg05814257 5.43E-04 0.904 0.919 0.015 chr2:37032869 VIT Corpo do gene - shelf
cg04933384 5.03E-04 0.920 0.935 0.015 chr15:50840217 USP50 TSS1500 - open sea
cg20152459 9.22E-04 0.905 0.920 0.015 chr8:126009481 SQLE TSS1500 - shore
cg26210451 4.48E-04 0.894 0.909 0.015 chr7:70592898 IGR IGR - shelf
cg13878116 9.22E-04 0.906 0.921 0.015 chr15:55881607 PYGO1 TSS1500 - shore
cg27490029 4.48E-04 0.892 0.907 0.015 chr17:35774430 TADA2A Corpo do gene - open sea
cg18287300 2.41E-04 0.913 0.928 0.015 chr5:112249428 REEP5 Corpo do gene - open sea
cg27452844 9.91E-04 0.896 0.912 0.015 chr2:170331892 IGR IGR - shelf
cg16957581 9.99E-04 0.898 0.913 0.016 chr7:128441085 CCDC136 Corpo do gene - open sea
cg13108397 8.15E-04 0.894 0.910 0.016 chr15:91263157 BLM 5'UTR - shelf
cg00166601 9.87E-04 0.864 0.880 0.016 chr3:43407807 IGR IGR - shelf
cg13399299 4.96E-04 0.888 0.904 0.016 chr3:172185412 IGR IGR - open sea
cg18865222 6.75E-04 0.805 0.821 0.016 chr22:46300025 IGR IGR - open sea
cg18981227 1.79E-04 0.894 0.911 0.016 chrX:68072547 IGR IGR - open sea
cg00847238 8.70E-04 0.906 0.922 0.016 chr6:108250709 SEC63 ExonBnd - open sea
cg25238704 9.47E-04 0.901 0.918 0.016 chr11:4168221 IGR IGR - open sea
cg11829458 8.07E-04 0.915 0.931 0.017 chr9:79781863 IGR IGR - open sea
cg14740901 3.73E-04 0.901 0.918 0.017 chr9:102874024 INVS Corpo do gene - open sea
cg06230220 5.14E-04 0.892 0.909 0.017 chr1:54990547 IGR IGR - open sea
cg05038676 9.79E-04 0.897 0.914 0.017 chr2:28712128 IGR IGR - open sea
cg06485000 8.15E-04 0.891 0.908 0.017 chr17:78881721 RPTOR Corpo do gene - shore
cg27106448 7.84E-04 0.884 0.901 0.017 chr22:42869970 IGR IGR - open sea
cg02530753 5.43E-04 0.889 0.906 0.017 chr17:65955867 BPTF Corpo do gene - open sea
cg22489875 4.70E-04 0.899 0.916 0.017 chr20:33343193 NCOA6 Corpo do gene - open sea
cg06609182 5.70E-04 0.926 0.944 0.018 chr4:3235000 HTT Corpo do gene - open sea
cg26069632 2.86E-04 0.889 0.906 0.018 chr7:29739014 IGR IGR - open sea
cg02018930 6.65E-04 0.859 0.878 0.018 chr12:53413966 EIF4B Corpo do gene - open sea
cg04719116 9.66E-04 0.893 0.912 0.018 chr22:41360860 RBX1 Corpo do gene - open sea
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 85
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg16266893 5.26E-04 0.873 0.893 0.020 chr1:39451509 IGR IGR - open sea
cg22925694 6.56E-04 0.864 0.884 0.020 chr2:65340428 RAB1A Corpo do gene - open sea
TVP23C-
cg17557257 8.40E-04 0.867 0.887 0.020 chr17:15425106 Corpo do gene - open sea
CDRT4
cg15885324 9.14E-04 0.661 0.681 0.020 chr17:42982107 IGR IGR - open sea
cg08247297 7.24E-04 0.876 0.897 0.020 chr21:46917541 COL18A1 Corpo do gene - shore
cg03541903 9.77E-04 0.832 0.852 0.020 chr5:130651434 CDC42SE2 5'UTR - open sea
cg26336235 5.43E-04 0.905 0.925 0.020 chr1:199918027 IGR IGR - open sea
cg18394881 7.84E-04 0.882 0.902 0.021 chr1:3512777 MEGF6 Corpo do gene - shore
cg16868941 5.90E-04 0.884 0.904 0.021 chr13:73675742 IGR IGR - open sea
cg12021430 9.22E-04 0.875 0.895 0.021 chr7:156952445 UBE3C Corpo do gene - open sea
cg22664874 9.54E-04 0.897 0.918 0.021 chr4:71599063 RUFY3 TSS1500 - open sea
cg01671333 6.56E-04 0.892 0.913 0.021 chr17:1545307 SCARF1 Corpo do gene - shore
cg12512173 9.61E-04 0.898 0.919 0.021 chr13:111936059 ARHGEF7 Corpo do gene - shore
cg07392941 2.41E-04 0.889 0.910 0.021 chr2:206888934 INO80D Corpo do gene - open sea
cg25367509 6.56E-04 0.893 0.915 0.021 chr12:56702547 IGR IGR - open sea
cg06840801 2.12E-04 0.871 0.893 0.022 chr8:42552719 CHRNB3 1stExon - open sea
cg15039577 4.28E-04 0.880 0.901 0.022 chr3:194389125 LSG1 Corpo do gene - shelf
cg20438509 6.03E-04 0.883 0.905 0.022 chr7:100737189 IGR IGR - open sea
cg14192191 9.49E-04 0.876 0.898 0.022 chr9:15502633 PSIP1 Corpo do gene - open sea
cg24034620 9.79E-04 0.847 0.869 0.022 chr19:37936081 ZNF569 5'UTR - open sea
cg21199772 5.01E-04 0.879 0.902 0.022 chr9:99157100 ZNF367 ExonBnd - open sea
cg07520419 8.76E-04 0.877 0.899 0.022 chr11:71943187 INPPL1 Corpo do gene - open sea
cg07358627 5.14E-04 0.881 0.904 0.022 chr4:170836967 IGR IGR - open sea
cg00379615 5.03E-04 0.840 0.863 0.023 chr8:81895014 PAG1 Corpo do gene - open sea
cg02918879 9.79E-04 0.846 0.869 0.023 chrX:123127175 STAG2 5'UTR - open sea
cg04430866 5.03E-04 0.878 0.902 0.023 chr16:89739680 IGR IGR - open sea
cg22079827 6.07E-04 0.750 0.773 0.023 chr1:114656043 SYT6 Corpo do gene - open sea
cg09548990 3.73E-04 0.868 0.892 0.023 chr4:39747702 UBE2K Corpo do gene - open sea
cg13621463 9.34E-04 0.806 0.830 0.024 chr1:4999436 IGR IGR - open sea
cg12537195 5.01E-04 0.895 0.919 0.024 chr15:70327180 IGR IGR - shore
cg10469481 9.41E-04 0.760 0.785 0.024 chr3:126083942 IGR IGR - open sea
cg17843208 5.01E-04 0.892 0.916 0.024 chr17:61933428 TCAM1 TSS1500 - open sea
cg12102682 9.13E-04 0.887 0.912 0.024 chr17:1123836 IGR IGR - open sea
cg16316054 4.48E-04 0.869 0.894 0.025 chr4:185480838 IGR IGR - open sea
cg13246941 8.37E-04 0.836 0.860 0.025 chr3:41878377 ULK4 Corpo do gene - open sea
cg09534800 3.73E-04 0.884 0.909 0.025 chr16:4522192 NMRAL1 Corpo do gene - shore
cg05411520 5.03E-04 0.888 0.913 0.025 chr1:200640507 DDX59 TSS1500 - shore
cg06773054 4.22E-04 0.859 0.884 0.025 chr15:59563393 MYO1E Corpo do gene - open sea
cg05324787 2.12E-04 0.879 0.905 0.026 chr11:9455809 IPO7 Corpo do gene - open sea
cg13550702 4.48E-04 0.872 0.898 0.026 chr6:123277681 IGR IGR - open sea
cg02075238 1.01E-04 0.850 0.876 0.026 chr11:65494847 IGR IGR - open sea
cg07384147 7.87E-04 0.839 0.866 0.027 chr4:8273940 HTRA3 Corpo do gene - shore
cg06859941 8.15E-04 0.849 0.876 0.027 chr21:43844348 UBASH3A Corpo do gene - open sea
cg27291842 4.22E-04 0.904 0.931 0.027 chr12:123265481 CCDC62 Corpo do gene - open sea
cg08289375 9.14E-04 0.859 0.886 0.027 chr13:114172939 TMCO3 Corpo do gene - open sea
cg15777013 5.43E-04 0.818 0.845 0.027 chr15:65989475 DENND4A Corpo do gene - open sea
cg25423631 4.48E-04 0.842 0.869 0.028 chr5:138551266 IGR IGR - open sea
cg14655858 8.33E-05 0.859 0.886 0.028 chr8:37978472 ASH2L Corpo do gene - open sea
cg10274696 8.17E-04 0.825 0.853 0.028 chr7:40260671 C7orf10 Corpo do gene - open sea
cg08042092 8.99E-04 0.086 0.114 0.028 chr5:175815846 NOP16 TSS200 - island
cg08917022 5.43E-04 0.857 0.885 0.028 chr5:623259 CEP72 Corpo do gene - island
cg08204093 9.22E-04 0.857 0.885 0.028 chr12:123686537 MPHOSPH9 Corpo do gene - open sea
cg13024564 2.23E-04 0.878 0.906 0.028 chr11:126862306 KIRREL3 Corpo do gene - open sea
PHOSPHO2-
cg26646208 8.83E-04 0.868 0.897 0.029 chr2:170583963 5'UTR - open sea
KLHL23
cg11148957 6.64E-04 0.823 0.852 0.029 chr1:7540638 CAMTA1 Corpo do gene - open sea
cg07343707 8.76E-04 0.843 0.872 0.029 chr2:240110301 HDAC4 Corpo do gene - shore
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 86
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg06310844 3.73E-04 0.248 0.277 0.029 chr19:33072506 PDCD5 Corpo do gene - island
cg18089482 6.87E-04 0.877 0.907 0.030 chr20:35580972 SAMHD1 TSS1500 - shore
cg19439285 8.15E-04 0.841 0.871 0.030 chr4:37814459 IGR IGR - open sea
cg23942887 4.16E-04 0.834 0.864 0.030 chr3:10079106 FANCD2 Corpo do gene - open sea
cg04497003 8.94E-04 0.846 0.876 0.030 chr7:99144379 FAM200A Corpo do gene - shelf
cg13426829 5.26E-04 0.269 0.299 0.030 chr6:124124875 NKAIN2 TSS200 - island
cg00360866 7.24E-04 0.806 0.836 0.030 chr15:65627661 IGDCC3 Corpo do gene - open sea
cg02747169 6.04E-04 0.871 0.902 0.030 chr17:72982851 CDR2L TSS1500 - shore
cg15891603 5.99E-04 0.863 0.893 0.031 chr9:96394134 PHF2 Corpo do gene - open sea
cg23476801 6.85E-04 0.874 0.906 0.032 chr4:140037891 ELF2 Corpo do gene - shore
cg05317610 9.07E-04 0.877 0.909 0.032 chr1:29015158 GMEB1 Corpo do gene - open sea
cg10612751 2.67E-04 0.867 0.899 0.032 chr4:169751983 PALLD Corpo do gene - shore
cg16572957 4.62E-04 0.858 0.890 0.032 chr1:2799354 IGR IGR - open sea
cg14779090 8.12E-04 0.716 0.748 0.032 chr19:9083943 MUC16 1stExon - open sea
cg09402329 5.43E-04 0.824 0.857 0.033 chr14:31349788 COCH ExonBnd - open sea
cg26688472 9.14E-04 0.204 0.236 0.033 chr2:203638928 ICA1L 3'UTR - island
cg02156021 3.73E-04 0.836 0.869 0.033 chr17:46142260 IGR IGR - open sea
cg06070346 6.52E-04 0.845 0.878 0.033 chr6:139180683 ECT2L Corpo do gene - open sea
cg13363124 9.49E-04 0.875 0.908 0.033 chr22:45182017 ARHGAP8 5'UTR - island
cg19060612 6.47E-04 0.866 0.899 0.033 chr1:171450804 IGR IGR - shelf
cg13660596 5.04E-04 0.764 0.797 0.033 chr12:74928835 IGR IGR - shelf
cg23587258 7.24E-04 0.871 0.904 0.033 chr12:112506593 NAA25 Corpo do gene - open sea
cg25208258 9.13E-04 0.789 0.822 0.033 chr18:14336385 LOC284233 TSS1500 - open sea
cg05198960 8.94E-04 0.844 0.877 0.033 chr12:133309102 ANKLE2 Corpo do gene - island
cg19144502 9.71E-04 0.853 0.887 0.034 chr14:35777813 PSMA6 5'UTR - open sea
cg13890597 4.12E-04 0.864 0.898 0.034 chr1:161481847 FCGR2A Corpo do gene - open sea
cg19748181 8.70E-04 0.822 0.857 0.035 chr20:58106111 IGR IGR - open sea
cg18839879 5.03E-04 0.811 0.847 0.035 chr6:34635606 C6orf106 Corpo do gene - open sea
cg01678313 9.98E-04 0.868 0.904 0.036 chr3:13083892 IQSEC1 Corpo do gene - open sea
cg17811563 9.49E-04 0.815 0.851 0.036 chr2:58568835 IGR IGR - open sea
cg12288267 5.99E-04 0.864 0.900 0.036 chr3:196318719 IGR IGR - open sea
cg02724203 4.48E-04 0.860 0.897 0.036 chr12:1204071 ERC1 Corpo do gene - open sea
cg14418992 6.56E-04 0.819 0.856 0.037 chr3:169866747 PHC3 Corpo do gene - open sea
cg06667316 8.66E-04 0.851 0.888 0.037 chr19:11550036 PRKCSH Corpo do gene - shelf
cg02687150 6.29E-04 0.832 0.870 0.037 chr11:15932485 IGR IGR - open sea
cg15031162 6.64E-04 0.826 0.863 0.037 chr16:68349632 PRMT7 5'UTR - open sea
cg09391998 8.95E-04 0.839 0.877 0.038 chr11:113688523 USP28 Corpo do gene - open sea
cg15658543 4.48E-04 0.800 0.837 0.038 chr7:3026309 CARD11 5'UTR - open sea
cg14337129 8.82E-04 0.869 0.907 0.038 chr9:131594230 IGR IGR - shore
cg19756470 8.87E-04 0.850 0.888 0.038 chr2:61832623 IGR IGR - open sea
cg27639283 4.48E-04 0.798 0.837 0.038 chr19:9412868 ZNF699 Corpo do gene - open sea
cg03975346 6.58E-04 0.829 0.867 0.038 chr11:9455774 IPO7 Corpo do gene - open sea
cg10032289 4.40E-04 0.850 0.888 0.038 chr11:9455054 IPO7 Corpo do gene - open sea
cg06371374 6.52E-04 0.746 0.785 0.039 chr3:128120212 EEFSEC Corpo do gene - open sea
cg13711144 9.79E-04 0.822 0.862 0.040 chr7:107218933 BCAP29 TSS1500 - shore
cg18016444 6.18E-04 0.828 0.868 0.040 chr4:3093377 HTT Corpo do gene - open sea
cg08677657 4.48E-04 0.803 0.843 0.041 chr6:149885006 IGR IGR - shelf
cg07048375 9.48E-04 0.829 0.870 0.041 chr2:44464956 IGR IGR - open sea
cg14460558 9.79E-04 0.868 0.909 0.041 chr9:90795554 IGR IGR - island
cg07945682 5.03E-04 0.803 0.844 0.041 chr17:65467821 PITPNC1 Corpo do gene - open sea
cg16824024 9.87E-04 0.819 0.860 0.041 chr3:73092158 PPP4R2 Corpo do gene - open sea
cg24102700 7.56E-04 0.810 0.852 0.042 chr17:3721585 C17orf85 Corpo do gene - open sea
cg11340806 8.11E-04 0.831 0.873 0.042 chr11:9291322 IGR IGR - open sea
cg07405570 4.48E-04 0.822 0.864 0.042 chr12:7111582 LPCAT3 Corpo do gene - open sea
cg09427429 5.26E-04 0.772 0.815 0.043 chr2:128450658 IGR IGR - shelf
cg16671570 9.49E-04 0.835 0.878 0.043 chrX:24080372 EIF2S3 Corpo do gene - open sea
cg08707253 5.99E-04 0.808 0.851 0.043 chr12:53979663 ATF7 Corpo do gene - open sea
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 87
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg18647382 5.03E-04 0.821 0.864 0.043 chr3:183298319 IGR IGR - open sea
cg01456626 9.79E-04 0.758 0.802 0.044 chr17:38611497 IGFBP4 Corpo do gene - open sea
cg23736895 7.00E-04 0.768 0.813 0.044 chr6:13848212 IGR IGR - open sea
cg15377630 6.56E-04 0.790 0.835 0.045 chrX:16844007 TXLNG Corpo do gene - open sea
cg07232688 6.64E-04 0.795 0.840 0.045 chr1:100644688 LRRC39 TSS1500 - open sea
cg02341953 2.86E-04 0.798 0.843 0.045 chr8:23045389 IGR IGR - open sea
cg22935319 6.07E-04 0.737 0.782 0.046 chr17:38545021 TOP2A 3'UTR - open sea
cg23072571 5.26E-04 0.828 0.874 0.046 chr19:54291978 MIR373 Corpo do gene - open sea
cg04673882 3.94E-04 0.842 0.888 0.046 chr12:112506752 NAA25 Corpo do gene - open sea
cg08202575 5.36E-04 0.789 0.836 0.047 chr7:82355489 IGR IGR - open sea
cg06031041 7.47E-04 0.797 0.845 0.047 chr7:4810741 FOXK1 3'UTR - shelf
cg06076564 3.73E-04 0.785 0.832 0.048 chr4:77977334 CCNI Corpo do gene - open sea
cg18965086 7.68E-04 0.833 0.881 0.048 chr1:109619546 TAF13 TSS1500 - shore
cg00520305 9.79E-04 0.754 0.805 0.051 chr3:149325760 WWTR1 Corpo do gene - open sea
cg14313797 5.99E-04 0.786 0.837 0.051 chr10:12497957 CAMK1D Corpo do gene - open sea
cg06409490 3.73E-04 0.779 0.831 0.052 chr19:36897639 ZFP82 Corpo do gene - open sea
cg23442804 8.76E-04 0.795 0.849 0.054 chr1:220266433 IARS2 TSS1500 - shore
cg21129401 3.40E-04 0.763 0.817 0.054 chr3:152978761 IGR IGR - open sea
cg17239848 6.95E-05 0.541 0.596 0.055 chr20:58586687 CDH26 Corpo do gene - open sea
cg10878998 3.53E-04 0.170 0.226 0.056 chr18:71959092 CYB5A 1stExon - island
cg03361504 8.94E-04 0.768 0.824 0.056 chr7:150868190 IGR IGR - shore
cg00201819 9.49E-04 0.815 0.871 0.056 chr10:134910421 GPR123 Corpo do gene - shore
cg21194785 5.42E-04 0.792 0.849 0.057 chr22:29105478 CHEK2 Corpo do gene - open sea
cg15363973 4.40E-04 0.847 0.905 0.058 chr7:886836 UNC84A Corpo do gene - island
cg14369333 5.92E-04 0.780 0.839 0.059 chr6:107449782 IGR IGR - open sea
cg00344738 5.81E-04 0.788 0.847 0.059 chr12:101753988 UTP20 Corpo do gene - open sea
cg26189523 9.01E-04 0.808 0.868 0.060 chr9:124310938 IGR IGR - shore
cg23470478 8.70E-04 0.789 0.849 0.060 chr19:9433826 ZNF559 TSS1500 - shore
cg06454983 3.53E-04 0.769 0.829 0.060 chr18:12418005 SLMO1 Corpo do gene - shelf
cg21030160 9.14E-04 0.701 0.762 0.060 chr13:31256790 IGR IGR - open sea
cg23906204 3.87E-04 0.843 0.903 0.061 chr1:161110860 IGR IGR - island
cg07595203 6.39E-04 0.678 0.739 0.061 chr11:2721480 KCNQ1OT1 TSS1500 - island
cg13827444 9.66E-04 0.835 0.895 0.061 chr3:72201951 LINC00870 Corpo do gene - open sea
cg02854791 9.67E-04 0.720 0.782 0.062 chr7:157776477 PTPRN2 Corpo do gene - open sea
cg05383842 3.73E-04 0.750 0.812 0.062 chr12:8072929 SLC2A3 3'UTR - open sea
cg01024878 9.34E-04 0.741 0.805 0.064 chr9:96356546 MIR548AU TSS1500 - open sea
cg10748867 5.03E-04 0.784 0.848 0.064 chr1:19577036 MRTO4 TSS1500 - shore
cg09460500 5.03E-04 0.780 0.845 0.065 chr5:134077921 CAMLG Corpo do gene - shelf
cg06421658 9.55E-04 0.793 0.858 0.066 chr5:68710528 MARVELD2 TSS1500 - shore
cg25219674 9.99E-04 0.721 0.787 0.066 chr3:184972683 EHHADH TSS1500 - shore
cg01805493 9.45E-04 0.722 0.787 0.066 chr17:40979684 IGR IGR - shelf
cg18459342 7.87E-04 0.275 0.342 0.066 chr8:81084056 TPD52 TSS1500 - island
cg10437787 6.83E-04 0.764 0.831 0.067 chr17:7904871 GUCY2D TSS1500 - shore
cg19271013 6.48E-04 0.762 0.829 0.067 chr16:78131862 WWOX TSS1500 - shore
cg19928340 3.26E-04 0.807 0.874 0.067 chr7:1809352 IGR IGR - island
cg12884247 8.41E-04 0.714 0.782 0.068 chrX:70511422 NONO 5'UTR - open sea
cg02911203 6.49E-04 0.780 0.848 0.068 chr5:72236857 IGR IGR - open sea
cg01960413 9.01E-04 0.768 0.838 0.070 chr1:23343542 IGR IGR - shelf
cg20353344 6.75E-04 0.769 0.839 0.070 chr11:65489582 RNASEH2C TSS1500 - shore
cg00968893 9.79E-04 0.713 0.784 0.071 chr12:49655634 IGR IGR - shelf
cg03818793 2.40E-04 0.233 0.304 0.071 chr18:24129558 KCTD1 TSS1500 - island
cg05150224 3.53E-04 0.702 0.774 0.072 chr16:58587227 CNOT1 Corpo do gene - open sea
cg17375381 5.90E-04 0.707 0.779 0.073 chr3:11685729 VGLL4 TSS1500 - shore
cg12598455 7.84E-04 0.720 0.794 0.073 chr16:19077221 LOC102723385 Corpo do gene - shore
cg05586540 2.86E-04 0.764 0.837 0.073 chr6:43046201 PTK7 Corpo do gene - shore
cg02641277 7.84E-04 0.735 0.810 0.075 chr4:186350279 C4orf47 TSS1500 - shelf
cg10965596 4.13E-04 0.780 0.855 0.075 chr2:27348263 ABHD1 Corpo do gene - shore
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 88
Tabela Anexo B (continuação). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg19030737 9.87E-04 0.722 0.798 0.076 chr1:226927988 ITPKB TSS1500 - shore
cg18739791 5.34E-04 0.734 0.810 0.076 chr5:134169007 IGR IGR - open sea
cg07944916 6.75E-04 0.763 0.839 0.077 chr2:9697398 ADAM17 TSS1500 - shore
cg05941652 9.49E-04 0.704 0.781 0.077 chr18:21273909 LAMA3 Corpo do gene - shelf
cg05358095 4.48E-04 0.734 0.812 0.078 chr7:73269115 IGR IGR - shore
cg24421839 5.90E-04 0.722 0.800 0.078 chr15:85111313 UBE2QP1 Corpo do gene - shelf
cg02944903 6.65E-04 0.651 0.730 0.078 chr18:2664728 SMCHD1 Corpo do gene - open sea
cg15096488 8.12E-04 0.683 0.761 0.078 chr2:43848605 IGR IGR - open sea
cg12180316 4.40E-04 0.753 0.833 0.081 chr17:80681317 FN3KRP Corpo do gene - open sea
cg07517688 6.03E-04 0.569 0.650 0.081 chr14:70118078 SUSD6 5'UTR - open sea
cg15802429 5.57E-04 0.770 0.851 0.081 chr17:16291531 IGR IGR - shore
cg17587610 5.47E-04 0.738 0.820 0.082 chr11:61195387 CPSF7 Corpo do gene - shore
cg00837060 8.15E-04 0.769 0.851 0.082 chr14:23234275 OXA1L TSS1500 - shore
cg26421413 6.88E-05 0.745 0.828 0.083 chr1:200640542 DDX59 TSS1500 - shore
cg12417176 4.48E-04 0.782 0.865 0.083 chr15:55788778 DYX1C1 Corpo do gene - shore
cg09676484 9.71E-04 0.720 0.803 0.083 chr17:49232155 NME1 5'UTR - shore
cg19214746 5.03E-04 0.736 0.820 0.083 chr12:122879564 CLIP1-AS1 TSS1500 - open sea
cg17784876 4.53E-04 0.653 0.737 0.084 chr1:39464086 AKIRIN1 Corpo do gene - open sea
cg03105206 5.33E-04 0.733 0.818 0.085 chr10:126315291 FAM53B Corpo do gene - open sea
cg15050328 6.35E-04 0.723 0.810 0.087 chr3:124448651 UMPS TSS1500 - shore
cg15482621 4.48E-04 0.580 0.667 0.087 chr6:86259651 SNX14 Corpo do gene - open sea
cg07646209 7.94E-04 0.711 0.799 0.088 chr19:58240321 ZNF671 TSS1500 - shore
cg00576967 7.24E-04 0.737 0.826 0.089 chr1:200640177 DDX59 TSS1500 - shore
cg18555528 5.03E-04 0.675 0.765 0.089 chr10:103125699 BTRC Corpo do gene - open sea
cg08976738 3.94E-04 0.718 0.808 0.090 chr15:80873380 MIR5572 TSS200 - open sea
cg26419869 4.48E-04 0.683 0.773 0.090 chr1:182923215 C1orf14 TSS1500 - shore
cg06521359 6.75E-04 0.608 0.699 0.090 chr1:203767572 ZC3H11A 5'UTR - shelf
cg00375025 2.34E-04 0.761 0.852 0.091 chr3:155860932 KCNAB1 1stExon - open sea
cg20343599 6.56E-04 0.694 0.784 0.091 chr10:64038483 IGR IGR - open sea
cg01589054 5.03E-04 0.746 0.837 0.091 chr3:11744933 VGLL4 5'UTR - shore
cg02272574 4.48E-04 0.635 0.727 0.092 chr8:39790735 IGR IGR - open sea
cg05624196 8.15E-04 0.695 0.788 0.094 chr3:195310883 APOD 1stExon - open sea
cg09443855 7.83E-04 0.763 0.858 0.095 chr22:41602903 L3MBTL2 Corpo do gene - shore
cg13520531 8.02E-04 0.620 0.715 0.095 chr19:2268580 OAZ1 TSS1500 - shore
cg13160071 5.53E-04 0.658 0.754 0.096 chr8:136202301 IGR IGR - open sea
cg21954085 4.48E-04 0.559 0.656 0.097 chr7:156664673 LMBR1 Corpo do gene - open sea
cg19949673 5.03E-04 0.690 0.787 0.097 chr9:128067348 GAPVD1 ExonBnd - open sea
cg25801499 8.11E-04 0.647 0.745 0.097 chr17:60760293 MRC2 Corpo do gene - shelf
cg22779330 6.56E-04 0.619 0.716 0.098 chr11:69061911 MYEOV 5'UTR - open sea
cg20971133 6.07E-04 0.752 0.850 0.099 chr5:180699332 IGR IGR - shore
cg22457516 1.73E-04 0.697 0.796 0.099 chr11:83393422 DLG2 1stExon - open sea
cg06875255 1.87E-04 0.676 0.776 0.101 chr2:71787827 DYSF Corpo do gene - island
cg22264420 8.99E-04 0.704 0.808 0.103 chr11:8891370 ST5 5'UTR - shore
cg25206992 8.85E-04 0.680 0.783 0.103 chr3:185555472 IGR IGR - open sea
cg22954146 1.87E-04 0.705 0.809 0.104 chr1:20835272 MUL1 TSS1500 - shore
cg18761380 4.96E-04 0.657 0.761 0.104 chr1:245186137 EFCAB2 Corpo do gene - open sea
cg06371658 6.75E-04 0.681 0.788 0.107 chr3:10292843 TATDN2 Corpo do gene - shore
cg26443995 9.49E-04 0.518 0.626 0.108 chr2:187560059 FAM171B Corpo do gene - shore
cg08198430 6.56E-04 0.641 0.749 0.108 chr14:24733757 TGM1 TSS1500 - open sea
cg16797462 3.73E-04 0.709 0.820 0.111 chr19:54269910 IGR IGR - shore
cg09295738 5.36E-04 0.674 0.786 0.112 chr11:113659244 IGR IGR - shore
cg02999029 3.53E-04 0.703 0.816 0.113 chr20:50555339 IGR IGR - open sea
cg06965610 5.43E-04 0.580 0.692 0.113 chr8:28994608 KIF13B Corpo do gene - open sea
cg08269941 7.24E-04 0.703 0.816 0.113 chr21:38337048 HLCS 5'UTR - shore
cg10628634 5.99E-04 0.646 0.760 0.114 chr6:17713043 IGR IGR - open sea
cg21125452 6.64E-04 0.647 0.761 0.114 chr8:120846352 TAF2 TSS1500 - shore
cg07649114 9.48E-04 0.666 0.780 0.114 chr7:150494998 TMEM176B 5'UTR - shore
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; continua
chr - Cromossomo; IGR – Região intergênica.
Anexos 89
Tabela Anexo B (conclusão). Sítios diferencialmente metilados (DMSs) entre dependentes de crack e controles
β β Coord. genômica Relação ao gene_ilha
Probe ID adjP Δβ Gene
Controles Casos (hg19) CpG
cg22585255 6.47E-04 0.659 0.773 0.114 chr11:57519288 BTBD18 TSS200 - shore
cg10088939 9.66E-04 0.708 0.822 0.114 chr7:99101050 ZKSCAN5 TSS1500 - shore
cg06781828 5.93E-04 0.734 0.849 0.115 chr6:169310581 IGR IGR - island
cg25149391 8.76E-04 0.636 0.754 0.118 chr11:68520448 MTL5 TSS1500 - shore
cg02384475 5.56E-04 0.676 0.796 0.121 chr13:23414242 IGR IGR - shore
cg08685564 3.17E-04 0.564 0.685 0.121 chr2:242239656 HDLBP 5'UTR - open sea
cg05837928 8.85E-04 0.658 0.780 0.122 chr18:51744202 MBD2 Corpo do gene - open sea
cg03169087 2.07E-04 0.631 0.754 0.123 chr11:86747930 TMEM135 TSS1500 - shore
cg19226080 3.73E-04 0.605 0.728 0.123 chr4:39480565 LOC401127 TSS1500 - shore
cg14874893 9.22E-04 0.702 0.825 0.123 chr19:50225303 IGR IGR - shore
cg17162808 6.56E-04 0.676 0.801 0.125 chr20:33266296 PIGU TSS1500 - shore
cg09123455 1.73E-04 0.542 0.668 0.126 chr16:69362128 IGR IGR - shore
cg06895885 7.24E-04 0.541 0.669 0.128 chr8:101169464 SPAG1 TSS1500 - shore
cg07375254 9.34E-04 0.644 0.773 0.129 chr5:148941007 IGR IGR - open sea
cg24707290 3.73E-04 0.588 0.722 0.134 chr1:109421497 GPSM2 5'UTR - shore
cg03354414 8.85E-04 0.658 0.795 0.137 chr19:55546118 GP6 Corpo do gene - shore
cg03148503 8.33E-05 0.625 0.763 0.138 chr18:10588980 IGR IGR - shore
cg25902639 3.53E-04 0.562 0.700 0.138 chr19:15312605 NOTCH3 TSS1500 - shore
cg07494499 9.89E-04 0.565 0.703 0.138 chr17:837017 NXN Corpo do gene - open sea
cg18781901 3.42E-04 0.551 0.691 0.140 chr17:80375155 C17orf101 Corpo do gene - shore
cg20978997 3.94E-04 0.551 0.692 0.141 chr10:75253729 PPP3CB 5'UTR - shore
cg00997655 8.33E-05 0.653 0.795 0.142 chr5:125929132 ALDH7A1 Corpo do gene - shore
cg03273574 1.73E-04 0.616 0.759 0.143 chr17:57286182 SMG8 TSS1500 - shore
cg13434525 8.70E-04 0.606 0.752 0.146 chr13:98627196 IPO5 Corpo do gene - shore
cg18929316 5.36E-04 0.599 0.749 0.150 chr17:46176848 CBX1 5'UTR - shore
cg07703331 6.29E-04 0.602 0.757 0.155 chr13:21521930 LINC00367 Corpo do gene - shore
cg12839200 2.84E-04 0.568 0.725 0.156 chr11:71789642 NUMA1 Corpo do gene - shore
cg14818176 8.35E-04 0.580 0.740 0.159 chr17:73148480 HN1 5'UTR - shore
cg24247939 6.64E-04 0.502 0.665 0.163 chr2:61292081 KIAA1841 TSS1500 - shore
cg04800864 5.14E-04 0.579 0.754 0.175 chr22:43541019 IGR IGR - shore
Legenda: Probe ID - Identificação da sonda; adjP - p-valor ajustado; β – valor beta; Δβ - delta beta; chr - Cromossomo; IGR –
Região intergênica.
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